5INYA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure f8
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
158
structure length
157
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 48
structure length 157
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5inyA00
3VLNA 2LTKA 3EE2A 3VI5A 4KB3A 2FA8A 2LSTA 2RUEA 4MJEA 3TKSA 2N5AA 1I5GA 4OFMA 4K2DA 1Q4JA 2B3SA 2LJKA 2JADA 3N5OA 5E4WA 1FW1A 2DIZA 4HU7A 2OBKA 1IYHA 3TB2A 2YN1A 3DMLA 5LNKe 1AW9A 2ZCTA 3WT2A 1UVZA 2B5EA 5AIXA 4WXTA 4ZIJA 3FHKA 1GUHA 3P90A 2WS2A 2K8SA 2WDUA 3LJRA 1M2AA 2WFCA 5D96A 2E2MA 1TXXA 3J7Yk 1FG4A 3EU4A 18GSA 5FHIA 2DMLA 3P2AA 1W89A 4MA9A 5INYA 3LORA 5A5KA 1OAZA 3KEBA 5F8BA 4NWYA 2NTOA 2GSQA 4ISDA 1GSSA 4GSTA 1SL1B 5IMVA 4KW6A 4KNDA 1EV4A 2EIRA 5IMFA 2LRCA 4ECBA 5JWQB 3FR3A 3IDVA 2CVDA 3H8QA 3C73A 2PN8A 5H5SA 2YJHA 1M0UA 3DVXA 3GX0A 4MF5A 2GT5A 1K0AA 1G6YA 1H75A 3GHAA 1EOHA 1WP0A 2TRCP 2WGRA 6GSYA 3D22A 3MDKA 2ZNMA 2IJYA 5KEJA 2L5LA 2FUG2 4EC0A 2YWOA 1A0FA 4IHUA 4HJ2A 4FYCA 4NXIA 2JZTA 2VO4A 1G7OA 1LBKA 2X99A 3DYRA 3M8NA 3O76A 1GSUA 2C3NA 1F37A 3GSSA 2XC2A 3ZVJA 1Z3EA 2HSHA 2F9SA 3CSHA 5J3RA 5DJLA 3W8SA 3GH6A 2CVBA 3D0ZA 1BEDA 4RQRA 3C8EA 3GV1A 1ML6A 1WPIA 4BPYA 2JZSA 4FIWA 1SD8A 1T4YA 4YQMA 5A4VA 5B7CA 2BMXA 3K8NA 1SKSB 3BJ5A 2N5BA 1F2EA 4DSSA 2CV4A 3APSA 4LL4B 4EO3A 4PNFA 2K8VA 4JEDA 3IV4A 1JLVA 3TJBA 1XWAA 4DVCA 5HFGA 4O7HA 3I6AA 3N9JA 1NW2A 4G10A 2MBTA 1TOFA 1JFUA 1XFLA 3L9SA 4G2EA 2H1AA 4LA1A 2GGTA 4ILFA 4OCEA 5H5QA 2G0FA 2YV7A 4NMUA 4PNGA 1PD21 2H1BA 3RDWA 4MP4A 4JZQA 3BOAA 1URMA 5J9CA 4MABA 2PMTA 2IMKA 4KX4A 2AAWA 2V6KA 1XXUA 5GSTA 2MBSA 3M3MA 2LEGA 1GSFA 2LJAA 3CMIA 3UBKA 4F0CA 4IGJA 2WCIA 3WD6A 1F3BA 2GQKA 3D5JA 4LLRA 2GSTA 3QAVA 4ML1A 5D9VA 3CTFA 3G7IA 1EEJA 3PH9A 1A0RP 3IK7A 2E0QA 3FZ9A 5ECRB 4DSRA 1PKZA 2H19A 1J0FA 3KMNA 3V1WA 2H8LA 4OO5A 3C1RA 2EC4A 1AQVA 4IBPA 13GSA 3UVHA 2H74A 4AJ7A 3US3A 2PGTA 5CREA 2VCWA 1S3DA 4ZB9A 5AISA 2GZYA 3L9VA 1YEPA 3C71A 3QR6A 1F9MA 5IPGA 2I9HA 1GTAA 1VGLA 5DCHA 3LGCA 3UJ1A 2HXKA 4TOPA 2J9HA 3ISOA 2RM5A 3DEXA 2V32A 3FR6A 1AXDA 3BBYA 1M2BA 1X5EA 2HRFA 2MMNA 2FWHA 6GSWA 2MZCA 2VCQA 5GAND 4AF2A 3TKSE 2PWJA 2WRTA 1GNWA 5AGYA 5CRWA 2NPBA 1XCCA 4JE1A 2CA8A 3IR4A 3TJGA 2HNLA 1DSBA 3CYNA 2VCTA 4RUVA 1X5DA 4FO5A 3I43A 3HKRA 5COHA 3GIXA 1U87A 2JZRA 3DKSA 2F3MA 3RPNA 1FHEA 3IPZA 2OACA 2WB9A 4KDXA 5ABRA 1GH2A 3IBHA 3QPMA 2FNOA 3HHVA 1XWKA 1ZL9A 1Z7RA 4P3YB 4MH2A 1A2LA 3IAM2 4POKA 2HZEA 1SL0B 2IL3A 4I2UA 1X0RA 4TR0A 2GS3A 4JRRA 2R6KA 1PQNA 3EINA 4HDEA 1R26A 5J4UA 1XVQA 5LCZA 1GTBA 1TU8A 3ERGA 3MWHA 1RQMA 1VF4A 2TRXA 3MAKA 4L0WA 3GA4A 3EU3A 4ECIA 2BTOT 4IW9A 3IRAA 1T8EB 2P31A 4NV5A 3QOUA 2JL4A 3EWLA 5JWOB 4AJ6A 4KDUA 2QGVA 2YWMA 4V1Ap 4MPGA 1WWJA 1GP1A 1Z6MA 4XRDA 1JZWA 2ES7A 1TU7A 1YF0A 3LSZA 1F6MC 4HQSA 4KCAA 1GULA 2F8FA 2IMEA 4TRXA 5IOXA 3H79A 4IVFA 2VCZA 4KUNA 3IK9A 3ED3A 3W6GA 1T4ZA 1BX9A 2GTUA 2CAQA 1USBA 3KH7A 3GNJA 4I97A 3GKXA 2YP6A 3ME7A 4ZB6A 1GSQA 5IMAA 2H6ZA 3ZMLA 3ZFLA 2B7KA 1LU4A 2HLSA 4K1FA 1SENA 3LYPA 3Q19A 2A4VA 3IHQA 3QMXA 1GNEA 1CQHA 4PX1A 3RAZA 16GSA 3J7Yb 1K3YA 2H70A 1ERTA 1YJ6A 1SKWB 3G7YA 5CNWA 4ID0A 4Q5FA 1MDIA 4PQHA 1ERVA 4PGTA 2C3QA 3KTLA 2O8VB 5ECMB 1XIYA 1B4PA 4MCUA 3E0UA 1FOVA 2LS5A 3IE3A 4GQCA 1DE2A 3EVIA 5CAXA 2NBSA 1PA3A 1EP8A 2B1LA 1ZZYA 5HR1A 1GSEA 5ECQB 2EIQA 5DQYA 1O81A 3F63A 4EF0A 3U5RE 1QK8A 3VURA 2FD3A 3F6FA 3TKPA 4X1UA 1X9WB 1GWCA 1JZDA 2HZFA 2GVPA 4GTUA 4TXOB 3QCPA 4K6XA 1EZKA 1WMJA 4YAVA 2DSAA 1ERWA 3I69A 5D73A 1R7HA 2VL2A 4ZL7A 2ZUPA 3ZIJA 2JACA 5KN2A 2IWTA 1SKRB 4K8MA 2P0GA 5G1LA 1T00A 1U88A 2IPAA 5DALA 4OMVA 4FH8A 1MTCA 2LRTA 1M9AA 3D4MA 2VAFA 1FAAA 1K0BA 2H66A 2LUSA 3EMPA 5B8BA 4L0UA 1M7TA 4G19A 1PKWA 1ZYEA 4FYUA 3FKFA 3IA1A 3ZRDA 1BJXA 3QFAC 1PL2A 3FZAA 3ERFA 1QGVA 5L71A 5ECNB 12GSA 5A4WA 3DD3A 4LL1B 4JR6A 4MJCA 5B8AA 2C0GA 4WEYA 2C0FA 1FVKA 22GSA 3VWWA 1TRUA 4OFNA 5CO3A 2H73A 1TKDB 3A5WA 2DJ1A 3ME8A 1Z7PA 1SYRA 2JU5A 5G5EA 1QQ2A 1PN9A 4QL9A 1Q98A 4ACSA 1PL1A 1X9SB 4WBRD 5EY6A 4YH2A 1Y6EA 5DVBA 4EL1A 1TTZA 3APQA 5D93A 4PUFC 4TN8A 1SJZA 3CTGA 3GH9A 4IP6A 3VPTA 5ECHB 5G1KA 5IPHA 4DEJA 4TR1B 1WJKA 2KP1A 3HVXA 5B6NA 1XWGA 5HQPA 2WJUA 2VCVA 4TKYA 1TK0B 3CRUA 4PXOA 5ECPB 5CYYA 1AQWA 1OKTA 4WETA 2H0HA 5J9BA 4JBBA 1KBNA 5DJMA 2VL3A 2O85A 3FY7A 1PX6A 2IMDA 2OKAA 1JHBA 3F4SA 3MSZA 1K3OA 3GUSA 4N11A 4QL7A 3AY8A 3BCKA 1QXHA 1K0MA 3KM6A 4K7OA 3HJOA 2FCHA 3KH9A 4XS1A 4K7NA 3APOA 5IIZA 3ERWA 5IO2A 4MZCA 3FR9A 4DSSB 4GSNA 1T3BA 3HJPA 1NSWA 2LQQA 2RLIA 3PR8A 5ELAA 3A2WA 3HJMA 2IN3A 1EGOA 2F8AA 5DDLA 2XPEA 2L4CA 2B5YA 2H6YA 1J9BA 1OC9B 2OBIA 1RK4A 4EDZA 3LYKA 2GDRA 2YOIA 4NPBA 3DIEA 1XW9A 3M9KA 4J56E 2E7PA 4HEA2 1QFNA 1HD2A 5G2ZA 2FWGA 2IMFA 3F3QA 3C1SA 3DWVA 2LJRA 1EV9A 3UARA 1K0NA 2OE3A 2DC5A 3MNGA 2CVKA 3VWXA 3HXSA 3UEMA 2MMZA 2AHEA 2C4JA 4XIHA 4YQUA 5CRDA 2M80A 5F0GA 1DBYA 2WULA 5ID2B 2H01A 1U6TA 1O7UA 2CQ9A 4XRAA 5D9TA 1ACVA 2DJKA 1S3AA 4JU5A 4TR4A 4NAXA 3LXTA 5IOWA 4E8EA 4MZWA 5EVOA 4MK3A 5J41A 1V40A 5LD0A 3WT1A 2O89A 3ZIVA 2V2GA 4I6XA 2MMOA 5IQYA 5G5FA 5HFIA 3RHCA 2GZPA 5DCGA 2OJLA 3FYGA 4D73B 3HZ8A 1TP9A 2AB6A 4NHWA 4TW5A 3DGQA 4XTSA 1UA5A 3F6DA 5EPFA 5IM9A 2K18A 1OYJA 2P5RA 3GFKA 4OCFA 4KAEA 4POLA 4ML6A 3CRTA 2HYXA 4DSQA 1ZGNA 2ALBA 2MMAA 4O92A 3VPQA 4OFTA 2WZ9A 4HJMA 2OA7A 4Q5QA 1O6JA 2XBIA 4XS6A 4GWRA 3LWAA 6GSXA 2X8GA 1EP7A 2VIMA 1TDIA 5FT3A 3TOTA 2M72A 3OR5A 4E8HA 1O73A 3NZNA 3VK9A 2H1GA 2KHPA 3D6IA 1AIUA 2H1DA 3UVTA 5HR3A 1N2AA 4K7IA 2B6MA 1AQXA 4MF6A 4L5LA 2IMIA 2VL9A 11GSA 2HSYA 2ON7A 3QD9A 3GURA 3WGDA 2H6XA 5G30A 3EURA 3TJFA 4XS4A 2HZEB 2VOCA 1YKAA 1VRSD 1YEXA 3E9JB 3GTUB 3F3RA 4WF4A 1TI1A 2IFQB 2R2JA 3WGEA 3EC3A 3LG6A 4L5OA 4CW9A 3M9JA 4Z7XA 3SBCA 1V58A 4TR3A 1KNGA 3CXGA 2O87A 4GLTA 1ABAA 4N0VA 1BAYA 3LXZA 3FK8A 2K9FA 2Z9SA 3NOFA 4V2NA 4MF7A 3TRXA 5CRHA 1TJDA 2DJ2A 3CBUA 2A2SA 1OE7A 4IQ1A 1HNCA 3F9UA 2LNTA 5ECOB 4HS1A 4K0NA 4NV2A 1AUCA 4BA7A 4MJBA 1B9XC 1SYXA 3ZVJD 1MDKA 3DRNA 4IP1A 3DXBA 2VUPA 2VD0A 2VLVA 3Q6OA 2RIIA 3L78A 3O6TA 2H75A 5GAPD 1PSQA 1B8XA 2PBJA 4ZBAA 3VI7A 3ZTLA 1NM3A 1AAZA 1THXA 1V57A 1RW1A 1HNBA 3GX8A 1R5AA 5IMCA 1V9WA 5DAKA 3EMXA 2H0GA 1EOGA 1JZOA 2K6VA 2YNXA 3KD0A 1O8WA 4ULXA 3UAPA 2N5FA 1XOBA 1HNAA 3CSJA 1G6WA 2YWNA 3IOSA 5JCGA 3TUEA 1H4OA 2PVOC 1GRXA 5ENUA 1QUWA 4WKWA 4HI7A 4ZB8A 3BCIA 3FRCA 3BD2A 2QC7A 3SWLA 1GTUA 1ZCPA 3L4NA 5HR0A 1SJ6A 2GSSA 2XHFA 5D8IA 2A2RA 4WR4A 4EXJA 1R4WA 1WIKA 3KZQA 3ZLPA 5J5NA 1XOAA 4WBJA 1ZOFA 2KLXA 2IIYA 4IS0A 4ZILA 3HVSA 4X0XA 2LRNA 4N0ZA 4AGSA 1SU9A 1B4QA 3TOUA 3L0HA 5C04A 2HFDA 4AJ8A 3KCMA 4GCIA 3H93A 1ILOA 3P7XA 1KTEA 1GL8A 5AN1A 1EWXA 4XCSA 3FZ4A 1XBSA 1LJRA 2NVLA 3VWVA 2LQOA 2R37A 2VCXA 2J23A 2C0DA 2PVQA 2L4QA 3HD5A 1BYEA 3UMAA 2ON5A 1MD3A 1GLPA 1XW6A 3E3EA 4TXOA 7GSSA 2DJ0A 2CX4A 2HE3A 1QMVA 4HZ4A 5FWGA 1JLWA 3TDGA 3VFIA 2GLRA 1OVNA 2GSRA 4CHSA 2L6DA 2GT6A 5GZZB 2GZZA 1ZYQB 1M9BA 1YY7A 1PX7A 5ECKB 4TVEA 4ZBDA 1A24A 4J2FA 2KOKA 4QQ7A 2E2GA 3F0IA 1UN2A 1BQ7A 4KDYA 4IQAA 2I1UA 4MJAA 5DQSA 4FYBA 1V98A 2L57A 4PURA 4V2LA 6GSTA 3PINA 1X9MB 3U6VA 4N10A 1GUMA 1XWBA 2YZHA 4F9ZA 3F4TA 1VF3A 4POBA 3QAGA 1GTIA 1U3IA 3GYKA 4HU9A 5D9XA 4ZBBA 1PMTA 10GSA 2X8CA 2VL2C 4KSMA 4F2IA 4NHZA 4HUAA 1M2DA 5JCUA 1GSYA 2R3XA 5HFKA 3TKSC 3GKKA 2CAIA 3A2XA 2FWFA 4ECJA 5EL8A 1ON4A 4L8EA 2QKEA 3QAWA 1E6BA 1N8JA 1MDJA 3ZMKA 5IMZA 1Z6NA 1TK5B 3GKMA 4KCEA 3LFLA 3LEFA 4IJIA 4EE0A 2YPMA 2FY6A 2V1MA 1VF1A 2C0EA 2H30A 4RQXA 1G0TA 3GMFA 3TGZA 2DJJA 2R5GA 4MZBA 1AC1A 4BVYA 1B48A 2KP2A 1WOUA 3S9FA 4TR1A 1I9DA 1TRVA 2DBCA 3D21A 1F3AA 2LKUA 4OD7A 5GSSA 1PGTA 2FA4A 5KN1A 1XPVA 5G31A 2AYTA 1EGRA 2FWEA 4OO4A 3WYWA 1KEBA 4ZL8A 3NIVA 2OE0A 1B9YC 5IO0A 19GSA 2VM2A 2C80A 2X64A 1K0DA 2LNSA 2HT9A 4KE3A 4JR4A 2V6OA 4I8BA 3HVVA 1V2AA 1K3LA 3IC4A 1O85A 4O32A 9GSSA 1ST9A 1DUGA 2D2ZA 4F0BA 4YAPA 4IJ3A 3UIWA 1A8YA 2PPTA 3VWUA 3TJKA 1PRXA 1XVWA 2CT6A 3HZ4A 4IELA 3L9UA 4EUYA 2C3TA 3IAS2 4PQIA 2AUVA 2I81A 3KMOA 2FHEA 2QSIA 3HA9A 2FGXA 2FLSA 4KSOA 1UC7A 2H72A 3FZ5A 3GKNA 1TK8B 4HZ2A 1XW5A 1OC9A 1X5CA 2L5OA 20GSA 4BWQA 5KN0A 3IXRA 1R5PA 2YJ7A 5ECLB 4EDYA 1YQ1A 5D9WA 5C00A 2AJQB 1GLQA 3TRQA 2RUFA 3JCML 2HRNA 4HOJA 6GSSA 4F03A 2X8HA 4I5QA 1SK1A 3HDCA 4X43A 4GRFA 3H1NA 2DIYA 1T7PB 1S3CA 2C1YA 2XPDA 3Q74A 3KGKA 1E2YA 3UL3A 3TJJA 1XWCA 3F4RA 3ZL5A 8GSSA 1C72A 4GQFA 5B6MA 3GN3A 4RI7A 4N30A 4MLYA 2DLXA 5ID2A 4ZL9A 3DVWA 5E59A 2R4VA 4H86A 3RPPA 14GSA 4MH3A 3RHBA 3M1GA 1A2JA 4XHMA 1DE1A 3UBLA 4Q5NA 1TW9A 4KA0A 4CDOA 3WGXA 2TIRA 2PERA 1TI3A 1G7EA 1WRYA 4G9HA 1M99A 1MEKA 3KP8A 4D73A 1A23A 3ZZXA 1W4VA 1WE0A 3CSIA 3FW2A 3P8WA 3Q18A 4I2TA 5ELGA 5JWRB 5F05A 1SJIA 2B1KA 2L6CA 2OADA 2VM1A 2LV3A 3GRXA 3KP9A 1FVJA 4MPFA 1SD9A 3KTBA 5KN3A 2JSYA 1YF1A 3F8UA 2YZUA 4KGIA 4XS4B 2YWIA 5IMDA 1SL2B 4TXVA 4BWSA 2HI7A 5ECSA 3TCOA 5H5RA 3KXOA 4K0GA 2CX3A 1K0CA 3D4TA 3LQ7A 2DJ3A 5HR2A 1ZMAA 1IYIA 4POMA 4ECCA 2XBQA 3ZFBA 2VLUA 2YV9A 4Q5RA 4WR5A 1OKDA 2M46A 2REMA 1JZRA 3HYPA 1FB0A 4V1Ag 3GTUA 2GQLA 5DBQA 2IFQA 5F06A 5CRGA 4F82A 3O3TA 3EYTA 1ERUA 1SK2A 2PU9C 1MD4A 2NDOA 4EKZA 5ECIB 4WF5A 1NHYA 2YCDA 1THOA 1OE8A 2G2QA 4PUAA 2B7JA 2H76A 1XZOA 2L59A 1HQOA 3G7JA 4HQZA 4GF0A 3RBTA 2EIOA 2DMMA 4GXZA 2JSZA 3TRPA 6GSUA 4ZXGA 5A4UA 1O8XA 1HYUA 1CQGA 1VF2A 1J08A 3I9V2 5DAKB 4IN0A 2BJXA 1A8LA 3QDNA 3HY2A 3PGTA 2H71A 1YKCA 2AV4A 4O5RA 2I4AA 2KUCA 2MYGA 2O7KA 3W8JA 6GSVA 2I3YA 1FO5A 1OC8A 3M0FA 4LMVA 1FB6A 4EVMA 2V41A 1TRSA 2VD1A 1U3AA 3UOMA 4YQVA 1SK0A 2CZ3A 3H4KA 2B5XA 3HCZA 4BL7A 2RM6A 3TKRA 3ZREA 1OC3A 5CP1A 4GSSA 4K9ZA 4LMWA 3R2QA 1TRWA 2H0IA 2P5QA 2CZ2A 3ZYWA 5AIVA 1BG5A 3GL5A 3A3TA 2F51A 3FEUA 4RI6A 4MMMA 1NHOA 4V2MA 1T1VA 4J57E 1Y25A 1GUKA 5JCWA 1YZXA 2C8UA 2VLTA 2YANA 3C7MA 2OE1A 1K0OA 2PUKC 4OWYA 3KJYA 4KH7A 3ZITA 4PQ1A 3TKQA 1Z9HA 1EEMA 1Z5YE 3GL3A 3GSTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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