5IO2A

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - c48s mutant
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
TDAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGSTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFCAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 50
structure length 158
sequence length 158
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5io2A00
3N9JA 3GNJA 3VWUA 4KUNA 2IL3A 5ECPB 4NHZA 2H72A 2F8FA 1WPIA 2F8AA 3J7Yk 3M8NA 3ERFA 2TIRA 3TJJA 4FH8A 2C0EA 2PWJA 2L5OA 2GQLA 1ABAA 3LJRA 3M9KA 4DSSA 1O8XA 3E9JB 4OFNA 3GFKA 4NWYA 5EL8A 3VFIA 2HE3A 2LRCA 3UJ1A 3K8NA 1X9MB 4N10A 2VIMA 1XWKA 1A8LA 1LBKA 3HZ4A 2LV3A 1UA5A 2QC7A 2EC4A 2QSIA 3LXTA 5DJMA 5G31A 5IMFA 1F37A 3GURA 3I9V2 1Z7PA 5IMZA 1AAZA 3TGZA 2VCZA 5C04A 3CRTA 2VD1A 3L9SA 3QDNA 2WJUA 3LGCA 4V2LA 1GSFA 2O85A 2I9HA 4K0GA 4K7NA 4ILFA 1GTUA 1I5GA 3RHCA 5JCUA 1QUWA 1LU4A 2YCDA 1T4YA 1E6BA 3Q6OA 3IAS2 3SWLA 3TCOA 3HJPA 2ON7A 2DBCA 2LKUA 4DSQA 1SJZA 1QFNA 2BMXA 1Z5YE 1FAAA 3GX8A 3HXSA 2YNXA 5DDLA 3KXOA 2YWMA 2XPEA 4OCFA 1Z9HA 4EXJA 5ECQB 2L6DA 4HI7A 2H19A 4IKHA 4J2FA 3NZNA 5CP1A 3I6AA 4MZWA 1X0RA 3GMFA 3A3TA 2P0GA 1F3BA 4OO5A 4ML1A 2KOKA 4V1Ap 1GSSA 3HVXA 3IR4A 4AGSA 5DALA 4HZ4A 4LA1A 5IIZA 4POLA 1FO5A 2C80A 3DYRA 4ZL8A 3MNGA 3GKKA 2DIZA 1V40A 1GULA 3HY2A 1ZCPA 1YY7A 3QCPA 1AQXA 5G1LA 4WF5A 4K2DA 5EVOA 2IMFA 4PNGA 3HA9A 5JWQB 1KBNA 1USBA 1A23A 1WRYA 1M99A 2VUPA 2CZ3A 4KX4A 3PR8A 2VLTA 4MP4A 4N11A 4XS1A 1OC8A 2VOCA 4ZILA 1K3OA 2GZYA 2GSTA 2YWIA 2CQ9A 2EIRA 3KEBA 4PUFC 2O89A 5ECNB 4WR4A 5HFKA 3ZVJA 4KGIA 2OE0A 1V58A 2GZPA 5IMAA 1CQHA 1GSDA 2DJ2A 3RDWA 3QAWA 2C0GA 2GTUA 2WZ9A 4PGTA 2DJKA 3IPZA 4GSNA 2DJJA 4F03A 1EGRA 2WGRA 3F63A 1GUKA 3GHAA 6GSTA 3I43A 3IHQA 3M1GA 3GV1A 2H1AA 2H30A 4LL4B 4GRFA 1V98A 2FWHA 3F3QA 1M7TA 3CRUA 2XC2A 2WRTA 1TOFA 2VCVA 2P5QA 2TRCP 9GSSA 4TXVA 2N5BA 5CO3A 19GSA 10GSA 3EMPA 1TU7A 1OKTA 2IWTA 4I2TA 3HJOA 3G7IA 3I69A 4LLRA 5ECIB 4YQUA 1THOA 3WGXA 4HQSA 1S3CA 2C3NA 4WKWA 3QOUA 3ZL5A 4XCSA 5DALB 1HNAA 3F9UA 2LQOA 1A2MA 4LMVA 1G6WA 3UVHA 4PXOA 1RQMA 5G30A 4Q5NA 2IIYA 2LJRA 2XPDA 1ZGNA 2H73A 2C1YA 3KD0A 1YZXA 2YN1A 2PVQA 3ERWA 5LNKe 2I1UA 4MPFA 3P7XA 2MBTA 1U3AA 2H1BA 2H71A 3R2QA 1VRSD 1H75A 4G19A 1NW2A 3GH9A 2MMAA 4V1Ag 4BWQA 13GSA 1XWBA 4P3YB 1T1VA 2PU9C 2HRFA 3GKMA 3GH6A 2OBKA 3KCMA 1WOUA 5F07A 4MLYA 4IJ3A 3RAZA 2YV9A 5J3RA 4ECBA 1OC3A 1BQ7A 3MDKA 4ZB9A 3VLNA 4YAPA 1PSQA 3BOAA 2V6KA 1TXXA 1X5DA 3ZMLA 5GSSA 2O87A 3RBTA 1N8JA 1ZMAA 1QMVA 1NSWA 3CYNA 3FR9A 3MAKA 4I97A 2PVOC 1EGOA 2ZUPA 1T00A 2JACA 3QR6A 4K7OA 2VL2C 5DCGA 2R3XA 2DJ1A 2F3MA 3LYPA 5J9CA 1G6YA 3U5RE 4MH3A 3DVWA 5ECLB 2YJHA 1S3AA 5JWRB 1Z6MA 3ZIJA 1GH2A 3GX0A 1DUGA 4POMA 4KW6A 2MMZA 2GLRA 3RHBA 2YANA 4EUYA 1QK8A 2JADA 1TU8A 3UVTA 1BX9A 2CV4A 1ST9A 4PURA 4YQVA 2B5YA 1I9DA 3IDVA 2NDOA 3KP8A 5L71A 1MDJA 2H74A 2HI7A 2R5GA 1AQVA 4TXOB 3M3MA 2C0FA 3EWLA 16GSA 2H66A 3IRAA 3HCZA 1SKWB 1SL0B 1TI3A 1TK5B 1TW9A 2ZNMA 4J57E 4K9ZA 1XWCA 2CZ2A 3DEXA 4EL1A 2VLUA 5A4WA 1WWJA 1K0CA 2GSSA 3QFAC 2LTKA 2FA4A 4NXIA 3EINA 2VLVA 3BCKA 3TKPA 4KAEA 2VCWA 4RI7A 3G7YA 1M2AA 1V9WA 4IQ1A 1PQNA 1T3BA 4HOJA 3UMAA 5ID2A 5CNWA 5D96A 2R6KA 2NTOA 5HR1A 2RLIA 1V2AA 4MJEA 2IPAA 3RPNA 4D73A 2AUVA 3TUEA 1GP1A 2OE1A 1OC9A 4TR1A 1AW9A 4O5RA 5B6NA 2O8VB 22GSA 1JZWA 4ZB8A 3BBYA 5IO0A 2OJLA 2FWGA 1N2AA 1KEBA 1FVJA 1SENA 2NPBA 3A2VA 4MF6A 4WF4A 5G2ZA 5FT3A 2VO4A 5G5FA 1IYIA 3F4RA 4ECCA 1VF1A 1XIYA 5GAPD 2PUKC 4H86A 1SK2A 1NHOA 4ACSA 2OACA 3ISOA 5F0GA 1ACVA 1Q4JA 5CRHA 2KLXA 3ZRDA 1ML6A 3HHVA 1NHYA 1UC7A 2QGVA 1TRVA 1XXUA 1FW1A 2IMDA 2DMLA 3GTUA 1YEXA 4GCIA 3W8SA 1DBYA 2JU5A 5CRGA 2A2RA 1J08A 2VCQA 3DKSA 1EWXA 4ULXA 1KNGA 5AIXA 1VGLA 2H1GA 4L8EA 4LMWA 1RW1A 2CVDA 4HDEA 3MSZA 3L4NA 2WFCA 2J23A 2JSYA 4MJBA 2Z9SA 1MEKA 5FHIA 3FHKA 1O6JA 4ZBDA 4E8EA 2H76A 5JCGA 5G1KA 4F82A 4KCAA 4HZ2A 2I81A 4JRRA 3FEUA 4RQXA 5ID2B 3D4MA 3Q19A 4WETA 5IO2A 3TOUA 5B6MA 1YKAA 4K6XA 2PMTA 5H5SA 1MD3A 2REMA 2FHEA 4ZXGA 3F3RA 4MCUA 1OC9B 3RPPA 3GL5A 3M0FA 1O81A 3FZ5A 2AJQB 5D9WA 2CAIA 5AGYA 3H4KA 4JR4A 1G7EA 2P31A 5HFIA 1SKRB 2A4VA 1F6MC 1B8XA 1H4OA 4MF7A 2WDUA 4TKYA 2WB9A 1ERTA 2CVKA 3DIEA 1EV9A 3DRNA 3N5OA 2GSRA 3EC3A 2RM5A 2LQQA 1HNCA 1GLQA 5C00A 3IOSA 3APQA 3GTUB 1XWAA 4Q5FA 14GSA 1PX7A 1DSBA 2GT5A 4PUAA 3QFBC 4HJ2A 3W6GA 5CRDA 4ECIA 3D22A 2X64A 5J4UA 1E2YA 1TRWA 4KE3A 3C71A 5KN0A 4EVMA 2IFQA 2HZFA 1M0UA 1EP8A 5DQSA 1DE2A 4OD7A 4POBA 4JZQA 4Z7XA 2H0IA 1GSQA 2YWNA 2PBJA 4POKA 4DSSB 3HJMA 1XPVA 1A2LA 3IXRA 1BAYA 1R26A 4JBBA 2H0HA 4I2UA 4MZCA 3FKFA 3J7Yb 2FNOA 4BA7A 5DAKA 4IJIA 3LWAA 3KTLA 3LSZA 4KSMA 1T8EB 1O85A 1SU9A 3IC4A 2FLSA 3C1RA 3UEMA 1LJRA 1MDIA 2IJYA 2BTOT 4IW9A 4V2MA 2A2SA 2L57A 1WP0A 4HQZA 1GRXA 3D0ZA 4OO4A 2J9HA 4IN0A 2CA8A 4DEJA 3IBHA 2LNSA 1HQOA 8GSSA 3F4SA 2KUCA 5EPFA 3KZQA 2FWEA 1NM3A 3GSSA 4WBJA 3F8UA 3TKSC 2DIYA 1SJ6A 4K1FA 1YDKA 4MA9A 2VD0A 2L4CA 1A24A 1XBSA 2R37A 1K3LA 7GSSA 5CRWA 3M9JA 3FY7A 3UIWA 2D2ZA 3GA4A 3A2WA 2FY6A 3ZVJD 2C0DA 4HS1A 4KH7A 4HJMA 2RUEA 1MDKA 1JZDA 1QGVA 3TKQA 4FYCA 2FCHA 2OA7A 2L6CA 5A4UA 3HYPA 1PD21 5COHA 1PX6A 3F6DA 1PMTA 1FHEA 3LORA 4N0VA 3TJBA 1WE0A 1MD4A 2IFQB 1M9BA 1YEPA 5B8AA 3FR6A 4MH2A 3TOTA 4I6XA 5IM9A 3KIJA 2WCIA 2GZZA 3A2XA 2N5FA 4G2EA 4AJ7A 2OKAA 3VI7A 3IA1A 1TRSA 6GSXA 4QQ7A 4GXZA 2LEGA 4E8HA 2VL2A 3BCIA 1XW6A 1VF4A 3E0UA 1TDIA 5DAKB 2GT6A 4F2IA 4MDCA 5F06A 1GTIA 1AUCA 2HSYA 5AISA 5G5EA 4KB3A 2R4VA 5DCHA 5A5KA 2OADA 1Y25A 1AC1A 1U87A 5ABRA 4IP6A 4RI6A 2OBIA 2MMNA 2ALBA 4Q5RA 2FD3A 3ZYWA 1W4VA 3Q18A 4HU9A 1O73A 1V57A 2FUG2 5F8BA 3ZLPA 3G7JA 3VWVA 3L0HA 2KP1A 1Y6EA 5IMVA 3C73A 4NV5A 1B9YC 2L5LA 4JU5A 3HVSA 3GUSA 1X9WB 2V41A 1U3IA 4TVEA 1YJ6A 3DXBA 1U6TA 2YOIA 2B7JA 1JFUA 1Z7RA 4K7IA 3L9UA 3LG6A 1PGTA 5KN3A 5DQYA 1EEJA 4MK3A 2MBSA 5H5QA 2BJXA 3DWVA 3ZFBA 2DSAA 2OE3A 3PH9A 4FIWA 1XZOA 4TR0A 1M9AA 1FVKA 2YP6A 4IGJA 1BEDA 2JL4A 5INYA 4NAXA 1HNBA 5B8BA 3JCML 2GQMA 1XVWA 4EF0A 1GTBA 1GUMA 4GSSA 1GNWA 12GSA 2E2MA 3C8EA 5KEJA 2AB6A 2DC5A 4O7HA 4KSOA 3A5WA 2V6OA 2G2QA 2M46A 3KMOA 5ECSA 2V1MA 3HVVA 1XOBA 3MWHA 2LNTA 1OE8A 2HSHA 3CTGA 1XCCA 1FB6A 4FYUA 1X9SB 3DGQA 3F0IA 1B4PA 2B5XA 4L5OA 2YZHA 5D73A 4CHSA 1B9XC 3O3TA 2HLSA 3VPTA 1PN9A 5IPHA 2VAFA 3VI5A 1X5EA 2PPTA 1SD8A 3GN3A 4GF0A 11GSA 4PX1A 2L59A 4V2NA 4XTSA 1TJDA 5FWGA 1JLVA 1TTZA 3KTBA 4PQHA 2B1KA 3D5JA 1YQ1A 2FWFA 2ON5A 5DVBA 2MMOA 4I8BA 3ZFLA 4BVYA 2VM2A 2CX3A 4L5LA 3SBCA 3CSHA 2X8HA 4BL7A 3CTFA 2I4AA 1TK8B 3LEFA 3VWWA 3ERGA 1FOVA 4MABA 1K0MA 5ENUA 1SYRA 4K8MA 2XHFA 1VF3A 5HR0A 1SK0A 4MZBA 1EP7A 2C3QA 2RIIA 4QL9A 3FYGA 3TRXA 1WJKA 2GDRA 2LUSA 2AHEA 2GS3A 1K0OA 3FW2A 3QAVA 1XFLA 2YWOA 1T7PB 3WT1A 4OWYA 3V1WA 4GSTA 3EMXA 1JZOA 4BPYA 5D9XA 4PQIA 1K3YA 2ES7A 3E3EA 4K0NA 3HZ8A 4ZBBA 4G10A 1PKWA 2X99A 4XS6A 3FR3A 2E7PA 1Q98A 2CVBA 2PERA 1SK1A 5DJLA 1CQGA 4EC0A 3PINA 5IMDA 2B1LA 2JZRA 4IP1A 1GLPA 2LRTA 4NMUA 5B7CA 2GQKA 4MPGA 1DE1A 2K18A 3P8WA 1RK4A 2YV7A 5J41A 2F51A 2HZEA 1TI1A 1ZZYA 2K8VA 2E2GA 3LYKA 4HEA2 4OCEA 1R5AA 2R2JA 4N30A 2HRNA 4D73B 4KNDA 3HDCA 4GLTA 5LCZA 4KCEA 1AIUA 4TOPA 1THXA 2TRXA 4TR1B 4TR4A 1KTEA 2YPMA 4OFTA 4WBRD 3UBKA 1PA3A 3WYWA 2LS5A 1HD2A 1SYXA 2CAQA 2DJ0A 5J9BA 1FB0A 3DMLA 4PQ1A 4L0WA 1GSYA 3QAGA 2V2GA 3GL3A 3TRQA 2ZCTA 2GSQA 1A8YA 5H5RA 1ZYEA 3GKXA 4XHMA 3KGKA 5J5NA 1M2BA 3QD9A 4AJ6A 2JSZA 3CBUA 1GUHA 4F0CA 3L78A 3WT2A 4EKZA 5GZZB 4MF5A 1JHBA 2HFDA 3LQ7A 3H1NA 4ID0A 4OFMA 3GIXA 6GSYA 4KDUA 3KM6A 4PNFA 1XW5A 3IK7A 1K0NA 3P90A 4TN8A 5ELAA 3FZAA 1A0FA 2B5EA 4RQRA 2EIOA 6GSWA 4HU7A 3UOMA 2B3SA 3TKSA 4BWSA 2I3YA 3QMXA 2M80A 4Q5QA 5DBQA 2KP2A 3EVIA 3QPMA 4BVXA 1ZYQB 4GTUA 1J9BA 2LSTA 2VL9A 2FGXA 5A4VA 4FO5A 4L0UA 1EZKA 2JZTA 4F0BA 1F9MA 2HZEB 1TKDB 1SL2B 1XW9A 4IVFA 3KH9A 1AQWA 1X5CA 3VWXA 3APSA 3NIVA 2CX4A 1ILOA 1S3DA 1GWCA 2DJ3A 1BYEA 2AYTA 2H70A 3US3A 3EE2A 4EDYA 5CAXA 3WGDA 2X8GA 4XIHA 4YAVA 1GNEA 1U88A 1G0TA 2MYGA 1ERVA 1GSUA 3FK8A 2VCXA 5AIVA 1OE7A 2CT6A 2DLXA 2M72A 4CDOA 3KJYA 1Z6NA 5GSTA 2K9FA 3VK9A 1GL8A 3WGEA 1XWGA 1F3AA 3CXGA 4KA0A 3NOFA 1TP9A 1PL2A 1YF0A 1K0BA 3HKRA 4CW9A 2H0GA 3OR5A 4I5QA 4HUAA 2B7KA 4KDYA 2B6MA 1K0DA 3H8QA 4O92A 2L4QA 3CSIA 1ERWA 4TW5A 2IN3A 6GSSA 3H93A 6GSVA 1PRXA 1A0RP 2H6ZA 1IYHA 4QL7A 5ECRB 2HT9A 5ELGA 3AY8A 4IQAA 3IAM2 3VURA 4ZIJA 18GSA 4FYBA 3F4TA 3P2AA 1SD9A 4ML6A 1Z3EA 4EDZA 3W8JA 3CSJA 2NVLA 4NV2A 2P5RA 1JLWA 4F9ZA 1JZRA 1MTCA 1R4WA 5HR2A 3TDGA 2WS2A 3GSTA 1BG5A 1B48A 1OVNA 3TJKA 2C3TA 4O32A 4TXOA 2H6YA 3LXZA 3CMIA 5AN1A 1R7HA 4MJAA 3WD6A 4JR6A 3UARA 5D8IA 1B4QA 3EU4A 1WIKA 4OMVA 1W89A 5E59A 4WR5A 2HNLA 3ZITA 3BJ5A 1J0FA 4J56E 4XRAA 2IMIA 5CREA 1VF2A 1FG4A 3TKSE 4ZL9A 1UN2A 4LL1B 4ZBAA 3GYKA 2DMMA 3LFLA 3UAPA 5ECOB 2RM6A 3GKNA 3Q74A 2K6VA 1G7OA 1ZOFA 3H79A 2O7KA 3L9VA 4WEYA 4X1UA 1EOGA 2F9SA 4YQMA 1ERUA 2PGTA 5GAND 20GSA 3TJGA 3UBLA 4DVCA 2K8SA 4TRXA 1SJIA 3ED3A 5D9TA 3TKRA 4AJ8A 2RUFA 4ZL7A 1TRUA 3VPQA 4EO3A 1PKZA 5ECKB 3EYTA 1YF1A 4GWRA 1BJXA 2IMEA 2EIQA 5F05A 2AAWA 1EOHA 4XRDA 4ZB6A 1R5PA 3S9FA 5CYYA 3APOA 2VM1A 5KN2A 1O8WA 1QQ2A 2AV4A 2LJKA 4GQCA 3G9BA 3DVXA 2MZCA 1QXHA 1K0AA 3BD2A 2H75A 3KMNA 4AF2A 4DSRA 1HYUA 4XS4A 4X0XA 4IELA 3EU3A 4NPBA 4GQFA 1M2DA 3HD5A 2NBSA 5LD0A 1YKCA 2VCTA 3UL3A 5HFGA 2VL3A 4TR3A 5D9VA 1A2JA 2IMKA 4ECJA 3D4TA 5ECHB 3FRCA 3TB2A 2H6XA 3O6TA 4EE0A 2YZUA 1OKDA 2GVPA 4ISDA 3ZIVA 4MMMA 5HR3A 4MJCA 2H8LA 1OAZA 5KN1A 2H1DA 5IOWA 5JCWA 3ME7A 3TJFA 3ZZXA 2HYXA 1O7UA 3DD3A 4IBPA 2LJAA 3KH7A 17GSA 2YJ7A 3GRXA 4IHUA 2WULA 2C4JA 4JE1A 1ON4A 3U6VA 3TRPA 5IMCA 1XOAA 2H01A 2N5AA 2V32A 1OYJA 2XBQA 4WXTA 1GTAA 1WMJA 5IQYA 3EURA 1SL1B 2X8CA 1C72A 5IPGA 2LRNA 2PN8A 4X43A 4NHWA 5E4WA 3IK9A 2C8UA 4YH2A 2JZSA 4RUVA 3ZMKA 3D6IA 3ZTLA 2QKEA 1EV4A 1URMA 2XBIA 3D21A 2E0QA 3IE3A 3KP9A 1AXDA 5IOXA 6GSUA 5ECMB 3O76A 3IV4A 4IS0A 5D93A 5HQPA 3ME8A 2HXKA 4KDXA 1PL1A 4N0ZA 1XVQA 1EEMA 2KHPA 5EY6A 1ZL9A 1T4ZA 3FZ4A 2GGTA 1UVZA 2FA8A 1GSEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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