5IPGA

Xanthomonas campestris peroxiredoxin q - structure fft-butyl (hyperoxodized by t-butyl hydroperoxide)
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
156
structure length
154
Chain Sequence
DAVLELPAATFDLPLSLSGGTQTTLRAHAGHWLVIYFYPKDSTPGTTEGLDFNALLPEFDKAGAKILGVSRDSVKSHDNFAKQGFAFPLVSDGDEALCRAFDVIKEKNMYGKQVLGIERSTFLLSPEGQVVQAWRKVKVAGHADAVLAALKAHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
publication title Peroxiredoxin Catalysis at Atomic Resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Xanthomonas campestris pv. campestris (strain atcc 33913 / dsm 3586 / ncppb 528
total genus 43
structure length 154
sequence length 156
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5ipgA00
1QQ2A 4ECJA 3C8EA 3LGCA 1GTBA 1GSDA 4I6XA 2HYXA 4WF5A 4ZL9A 4Q5QA 1H75A 3GL5A 3LSZA 3DIEA 1YDKA 3HJPA 5ECSA 4AF2A 1URMA 4L8EA 2WZ9A 1FOVA 3F4TA 3VI5A 3GSTA 2P0GA 3H93A 3TDGA 4HJMA 4GLTA 2P5RA 1SKRB 2L4QA 2OE0A 2R5GA 3D4MA 4K1FA 5ECMB 2DJ1A 2X64A 1OYJA 2HE3A 2A2SA 4TR4A 2RUEA 4GSTA 5D9TA 3QAWA 1GTAA 5J9BA 1SYRA 2OJLA 3HDCA 1ERWA 1HQOA 2H01A 1JZWA 3M3MA 2GVPA 3ZFLA 1ZZYA 2LJRA 2LRCA 1EP8A 5IMDA 2PN8A 4V1Ap 4WXTA 2CVBA 4FYCA 4XCSA 5CNWA 4K0GA 2HRNA 1V57A 2H1AA 2IFQA 2KOKA 3DVXA 4QQ7A 4XS4A 3WYWA 3CMIA 2GSSA 4X1UA 5FWGA 3ZRDA 2VO4A 5E59A 1ZMAA 2C3TA 3KP9A 1K0DA 4XIHA 5CRHA 4IQ1A 2XBQA 3QCPA 1JZDA 1O85A 4I97A 4ZIJA 2ZUPA 1HNAA 1F2EA 3BD2A 14GSA 2H1DA 3UIWA 2H66A 4KSOA 1V40A 1Z3EA 2BMXA 5ECPB 4FYUA 5IOWA 5J4UA 5IMVA 3O3TA 3D4TA 3BOAA 2LQQA 9GSSA 4GF0A 4NMUA 4J56E 3GX0A 3LYPA 5KN3A 4BA7A 4GXZA 1DSBA 4GCIA 4JU5A 2OKAA 3M8NA 3KEBA 4XTSA 1YJ6A 5EVOA 1K0OA 1K0MA 4MA9A 2WDUA 5IMZA 1PD21 2YWIA 1WIKA 3TJJA 2KHPA 1R4WA 3HYPA 3IPZA 3D21A 5EPFA 4KUNA 4ML1A 4O7HA 4I8BA 1QUWA 4EDZA 2WCIA 3C71A 5DJLA 1MDIA 1UA5A 3E9JB 2VCXA 3UL3A 1QFNA 3ZLPA 3A3TA 3GKNA 3G9BA 4TW5A 1AAZA 3ERWA 4KCEA 4IBPA 3ZMKA 5ELGA 4QL9A 5ELAA 1G7EA 1TRVA 4KB3A 5D73A 3F8UA 5DAKA 1T00A 2LTKA 1GSUA 4DSSA 5F0GA 2C0DA 3HD5A 3GTUB 3CYNA 2JZSA 2B5EA 4L0WA 6GSSA 3VFIA 4O32A 4KCAA 4IELA 4O92A 3L78A 2HLSA 3ERGA 1WRYA 2O7KA 3SBCA 3KD0A 1J9BA 3GV1A 2XPEA 1Q4JA 1EEJA 1TDIA 2DIZA 4QL7A 4LMWA 4OWYA 2NTOA 1LJRA 2B1KA 2H73A 5J9CA 2F8FA 1XOBA 1S3AA 1I9DA 2RM5A 4NHZA 4GRFA 3TOTA 4MZBA 1XZOA 2EIQA 3ED3A 4HS1A 3ERFA 3NIVA 1SJIA 2H71A 17GSA 3APQA 1V58A 4KDUA 1A24A 3GKKA 4K6XA 4F2IA 3R2QA 1FHEA 2DJJA 4ZL7A 4KDXA 1UN2A 4WF4A 1F3BA 2VM1A 2MMZA 3HKRA 1RQMA 4MCUA 1JLVA 2K6VA 2YJ7A 1VRSD 1B9XC 4K8MA 3KCMA 3NZNA 1EEMA 4LMVA 4YQUA 2JSZA 3UAPA 1PQNA 5E4WA 3EMXA 3G7YA 3VLNA 3TRXA 2GQKA 5D93A 5ECHB 1TK0B 5GAPD 1KEBA 3W6GA 2B6MA 1YKAA 4OMVA 1SKWB 1A8YA 1TI3A 2VLVA 2M72A 5IIZA 2HXKA 5DJMA 2H72A 3RAZA 3F0IA 2AAWA 4LL1B 2P31A 1F9MA 2X8GA 1DE1A 1T4ZA 5AN1A 3QR6A 1M2BA 4NV2A 4OFTA 1Q98A 4HUAA 1TU7A 4ZL8A 1Z5YE 2KUCA 4F03A 1XIYA 2CA8A 4ECIA 4JRRA 2FA4A 2RIIA 4FO5A 3IA1A 1AQVA 4K7IA 1FG4A 4IHUA 2AV4A 2DJ0A 1LBKA 2WFCA 2WJUA 4EVMA 2K18A 1GLPA 6GSVA 3L9VA 3A2XA 5COHA 1EV4A 3BCIA 1BQ7A 2H1GA 4G9HA 4FH8A 3CSHA 3S9FA 3TJKA 4IJ3A 2MBTA 2A4VA 3M0FA 3VWWA 3TGZA 1PRXA 1A0RP 4N0ZA 2GSRA 3H8QA 2ZNMA 2PU9C 4WR4A 2VM2A 3M1GA 1G7OA 1XCCA 1X9SB 4WKWA 1O73A 2GQMA 3FRCA 3IK9A 2EC4A 2NDOA 1N2AA 1K0BA 1GTUA 2YNXA 4Q5FA 4ECCA 1KBNA 5DCGA 2GTUA 2LKUA 4LLRA 4PURA 5JCUA 2AUVA 2KP1A 2O85A 2VCZA 1IYHA 3ZVJA 3N5OA 1GRXA 1YKCA 1OE7A 5DDLA 2YZHA 1SL1B 3TJGA 5AIVA 6GSXA 3A5WA 2VCQA 3FR9A 3IHQA 5J3RA 4MABA 1X5EA 1TRUA 4V2MA 3BCKA 3RHCA 3UOMA 1ZCPA 3Q6OA 5JWQB 3QDNA 2VL3A 2WB9A 2O87A 1A2LA 4IQAA 4RQRA 5A4WA 3N9JA 2JU5A 2CZ3A 3P90A 2VIMA 2MMOA 4YAVA 1DUGA 3HCZA 1FB6A 2HZFA 2FWFA 5ECQB 4TRXA 1I5GA 1EOHA 1K3YA 2GDRA 6GSYA 3FZ5A 4EE0A 3TOUA 1O81A 4IP6A 3KMOA 4AGSA 5DCHA 3MAKA 1GP1A 2YWMA 2VL9A 3SWLA 5IO0A 4GSNA 3HXSA 4N30A 3ZFBA 2LNSA 3FKFA 3TKRA 4D73A 3CRUA 4V2LA 5KN0A 3L0HA 4XS6A 4TKYA 1YY7A 1XFLA 3ME8A 5IQYA 1JFUA 3KH7A 5DQYA 3RPPA 2M46A 2YP6A 4FIWA 2FWGA 1K3OA 4BVXA 2R6KA 4ZILA 1W89A 1F3AA 3F4SA 4X43A 3ZITA 2OE1A 1PX7A 5CAXA 4DVCA 2RM6A 1TTZA 2H74A 6GSWA 4N0VA 4ZBDA 1TRWA 1R26A 2GZPA 4OCEA 3BBYA 5ECOB 3UJ1A 3CRTA 1XOAA 1MTCA 4G2EA 4EUYA 1LU4A 2YV7A 4FYBA 4KSMA 4PXOA 1O6JA 5CYYA 4V2NA 1ON4A 3ZIJA 1WP0A 2QC7A 5F07A 2FWEA 4JZQA 3GNJA 2L5OA 4MDCA 5KN2A 2GT6A 2IMDA 3L4NA 3LXTA 2CZ2A 2HRFA 3FHKA 3MDKA 5GZZB 2L59A 4HI7A 4I2TA 5J5NA 3QOUA 3FY7A 1Z7RA 5LNKe 5F06A 2PUKC 3ZVJD 2YCDA 5A4VA 5H5SA 4CDOA 8GSSA 3KM6A 2FA8A 2C4JA 3GKMA 1XVQA 1WOUA 4MJCA 2G0FA 2HZEB 2A2RA 5CO3A 4NXIA 1PGTA 2ALBA 3QPMA 1T1VA 2IIYA 3KGKA 2FHEA 3FW2A 3FYGA 2CAQA 2TIRA 2IMFA 1X5CA 2WRTA 1K0AA 4YQMA 4RUVA 1XPVA 2OADA 4ZB9A 1TRSA 4XS1A 3P2AA 1TXXA 3DEXA 1WE0A 2ZCTA 5ECIB 3PR8A 3P8WA 2CVDA 2YPMA 3CSIA 2QSIA 4JR6A 2XC2A 4ZBAA 3WGXA 1NM3A 1V2AA 5F8BA 2LRNA 5G1LA 1AUCA 3GYKA 3QD9A 1AXDA 3VI7A 3C1SA 3DMLA 3GN3A 4P3YB 1V9WA 4EO3A 2LSTA 2ON7A 1AC1A 2IMKA 1U88A 2G2QA 4JE1A 4TR0A 4XRAA 4PUAA 4TR1B 1A2MA 4IS0A 4WEYA 2PGTA 1WJKA 1DE2A 2F9SA 1K0NA 1ML6A 4L0UA 1GUKA 3F6FA 5G5EA 1FAAA 1YEXA 2MMNA 4PX1A 4WBJA 1ACVA 2C0GA 2FY6A 3UARA 5D96A 1GNEA 3DKSA 4MK3A 3ZREA 4EC0A 4BL7A 4YQVA 2B5YA 3LYKA 1M7TA 4POMA 2GQLA 5ID2B 1M9BA 4ULXA 2ES7A 5IM9A 1FO5A 4MPFA 3GH9A 4ZBBA 1SJ6A 1GWCA 3RHBA 2VLTA 4KE3A 2DLXA 2YV9A 4GQCA 4XHMA 3IRAA 2TRXA 4POKA 1GUHA 3DGQA 3GRXA 1A23A 5G2ZA 5ECKB 1YF0A 4X0XA 3UEMA 3FEUA 1ERVA 1TP9A 3F3QA 2I81A 3KP8A 5DQSA 2J9HA 1BJXA 4ECBA 4PGTA 4MH2A 1KTEA 1XVWA 1MDKA 5H5RA 2YJHA 3TRPA 3LQ7A 1T8EB 3KIJA 1PKWA 2H8LA 3LWAA 3FZAA 4XRDA 4CW9A 4MF7A 2IMEA 1GUMA 1HD2A 1J08A 1TJDA 1ZYQB 2B1LA 1YEPA 5CREA 3KH9A 5CP1A 3PH9A 2DMLA 1XXUA 1HYUA 16GSA 2B5XA 3QFBC 1HNCA 3WGDA 5B8BA 2ON5A 2VCWA 4HEA2 4PQIA 2PPTA 4PUFC 3VK9A 3IOSA 4KW6A 4CHSA 1ERUA 2OBKA 2PVOC 2NPBA 3TKPA 4LL4B 7GSSA 2HI7A 1X9MB 3H4KA 4MJBA 5A4UA 5KN1A 4F0BA 2H0IA 2OACA 3APSA 5EL8A 4O5RA 5HR2A 1MD4A 1Z9HA 2HT9A 4LA1A 2GZYA 3PINA 2V41A 2JL4A 4RI6A 4AJ7A 3IC4A 1RW1A 2N5AA 4G10A 3GFKA 2H6ZA 3NOFA 3Q19A 1PKZA 2DSAA 2L6DA 1BX9A 3GL3A 1DBYA 2AJQB 4DEJA 4F82A 1B9YC 5D9XA 2WS2A 3BJ5A 5GSSA 1HNBA 1EV9A 2L4CA 2IJYA 2GS3A 3UVTA 3HVVA 1VGLA 3EVIA 1PN9A 1ILOA 1UVZA 3V1WA 2VD0A 3FK8A 1GSSA 4ZXGA 3GSSA 2B7JA 2M80A 2TRCP 2GSQA 4NAXA 4HOJA 1USBA 3LJRA 4N11A 1TK5B 4OCFA 1NHYA 5JCWA 2FCHA 1R5AA 3IV4A 3K8NA 1B8XA 1X5DA 3F63A 4KH7A 5DALB 3MNGA 1ZOFA 3EWLA 1MD3A 4ISDA 4K7NA 3CXGA 5AGYA 3HZ4A 4PQ1A 1W4VA 3LG6A 1G0TA 4TR1A 1G6WA 2CV4A 2PVQA 5HFGA 5L71A 1FVJA 1BAYA 1GTIA 3KMNA 2IWTA 4KDYA 2DJ2A 4K9ZA 4OD7A 2BJXA 4F0CA 10GSA 1Z6MA 1SU9A 2DJ3A 5G30A 2V6OA 1OVNA 2V6KA 4EKZA 3QMXA 5D9VA 3VURA 3CSJA 1XWCA 5IMAA 1B48A 2BTOT 4K7OA 3VWVA 5C04A 2NVLA 3ZL5A 3GTUA 1H4OA 2FLSA 1SKSB 2CVKA 2YN1A 3VPQA 1ST9A 2O8VB 4POBA 1YZXA 4MF6A 2N5BA 1FW1A 3D0ZA 5HR3A 4BWQA 3IXRA 4DSSB 2MZCA 5F05A 2P5QA 2LV3A 2VCTA 3F9UA 3GA4A 2RUFA 5FT3A 2R3XA 3O6TA 4GWRA 2C3NA 5D9WA 3DYRA 1FB0A 3ZZXA 3FR3A 3AY8A 4IVFA 4IP1A 2LNTA 1E6BA 2PERA 3D6IA 5DVBA 1GSQA 4E8EA 3WT2A 3U5RE 2HFDA 2LJAA 3WT1A 4HDEA 5G5FA 2VOCA 1WWJA 2H0HA 4GQFA 1O8WA 18GSA 4AJ8A 4MH3A 3J7Yb 4ML6A 4IJIA 2YZUA 5GSTA 4I5QA 4IGJA 3C73A 1NSWA 2L6CA 3EU4A 2K8VA 2JSYA 1GH2A 5GAND 2MBSA 3A2VA 4BPYA 3L9UA 3JCML 3KZQA 5CRGA 5KEJA 3ME7A 1S3DA 5INYA 1SL0B 5ECNB 3HY2A 2V2GA 3ZMLA 3DD3A 3GMFA 2VD1A 2YWOA 2H76A 2PBJA 3IR4A 2VL2A 2FD3A 2KP2A 1TW9A 3HZ8A 1NW2A 2GZZA 5B6MA 1A8LA 2IL3A 1FVKA 2C3QA 1WPIA 12GSA 3EU3A 2VLUA 3EMPA 2WGRA 3UBKA 3EURA 2K9FA 4BWSA 2V32A 3QFAC 4ZB6A 2DIYA 1X9WB 1OC3A 4TR3A 2AHEA 3VWUA 3C7MA 4Z7XA 2IPAA 2K8SA 4GSSA 2E2MA 1C72A 1CQHA 1B4QA 1A0FA 1MDJA 3ZIVA 4OO5A 2FUG2 5IPHA 4F9ZA 2H6YA 3D22A 4E8HA 1EGOA 1E2YA 1EWXA 5HR1A 4PNGA 5HR0A 1VF2A 3TB2A 5IPGA 1M9AA 1KNGA 2WULA 2H75A 4PQHA 1CQGA 3C1RA 3RBTA 4GTUA 4K0NA 1K3LA 4NV5A 4YH2A 1XW5A 2JZRA 4IKHA 4DSRA 1GLQA 1Z6NA 2PWJA 4WR5A 2NBSA 1U6TA 5HFKA 2CT6A 1OE8A 4PNFA 2J23A 2C0FA 4MLYA 2EIRA 3TKSA 5DALA 4KX4A 4OFNA 4RI7A 1NHOA 3FZ9A 3GX8A 2D2ZA 2LEGA 2H0GA 1JZRA 2FNOA 1O7UA 5B6NA 4L5LA 5AISA 4V1Ag 1Y25A 1GL8A 3VPTA 4TOPA 1ABAA 1MEKA 1SD8A 1EZKA 2XHFA 1ZL9A 1BEDA 5ENUA 3G7JA 1M99A 3FZ4A 2H70A 5IOXA 1GULA 5HFIA 2AYTA 1F6MC 1EP7A 5CRDA 3TKQA 5CRWA 2PMTA 3M9KA 5IMCA 1BG5A 2GSTA 1Y6EA 1OC9B 5H5QA 1VF3A 4J57E 1SK0A 1XW6A 4WBRD 1YF1A 4HZ4A 3KJYA 3H79A 4MJEA 1AQXA 1OC8A 1XWGA 2JZTA 1T7PB 2OA7A 4Q5RA 3U6VA 1PX6A 5LCZA 1R5PA 1GSEA 4MZCA 2I3YA 5JWOB 3F6DA 1A2JA 4HZ2A 5B7CA 1B4PA 3US3A 1SJZA 2LS5A 3LFLA 2H30A 2C0EA 4JBBA 4L5OA 3HJOA 4I2UA 3I9V2 3HHVA 3GH6A 5IO2A 1N8JA 3H1NA 4TN8A 1IYIA 2GT5A 4Q5NA 3VWXA 3CTFA 5LD0A 3IE3A 4EL1A 3GURA 5DBQA 1M2AA 3EC3A 3MWHA 3I43A 5ABRA 2XPDA 2DMMA 1Z7PA 1G6YA 2R2JA 3PGTA 5D8IA 1QGVA 5C00A 2X8HA 4TXOB 4ILFA 1PL1A 3W8SA 3F3RA 4ID0A 4YAPA 1T3BA 2O89A 1U3AA 1QMVA 3UMAA 3LXZA 1R7HA 3EYTA 3KTLA 1T4YA 4J2FA 5J41A 4D73B 2H19A 2GLRA 1TI1A 2B3SA 3UBLA 1GSFA 1XWBA 1UC7A 2KLXA 2QGVA 1PA3A 2FWHA 5G1KA 3TJFA 4NWYA 2RLIA 1JZOA 4TVEA 4MJAA 1O8XA 2OE3A 4IN0A 4MPGA 1SL2B 4JEDA 1THOA 2L57A 2LRTA 1SENA 2CQ9A 2VL2C 1ZGNA 1AQWA 3E0UA 3FR6A 4RQXA 3CBUA 4WETA 2QKEA 3TKSE 3RDWA 3M9JA 1M2DA 2JADA 1OKDA 3D5JA 3J7Yk 4NHWA 1V98A 5HQPA 4EF0A 3GIXA 4ZB8A 1PL2A 1TK8B 1QK8A 2I4AA 6GSUA 3IAM2 5A5KA 3ZTLA 2E7PA 4ACSA 3LORA 1TOFA 2DC5A 2R37A 2V1MA 2HZEA 3E3EA 4HU9A 3KXOA 1S3CA 1GNWA 1TU8A 3IAS2 3Q18A 2HSYA 3IBHA 3P7XA 3ZYWA 5ECLB 2CAIA 4MZWA 1SD9A 1EOGA 1K0CA 1SYXA 2MYGA 3I6AA 4MP4A 2IFQB 4POLA 4XS4B 4KAEA 1X0RA 4MF5A 2OBIA 2F3MA 3APOA 4JR4A 3CTGA 3TKSC 22GSA 5G31A 5IMFA 1PMTA 1AIUA 4EXJA 2E0QA 5FHIA 3TJBA 2I9HA 2REMA 4IW9A 4N10A 2X99A 1OKTA 3O76A 4KGIA 4HU7A 3OR5A 4HQZA 1XBSA 2R4VA 1TKDB 3MSZA 2F8AA 4DSQA 5JWRB 5EY6A 2CX3A 2H1BA 1THXA 2H6XA 1RK4A 3LEFA 4NPBA 5ECRB 4OFMA 2JACA 1OAZA 2HSHA 2EIOA 1VF4A 1OC9A 2LQOA 3GKXA 3TUEA 1GSYA 3I69A 3DWVA 4K2DA 5ID2A 2I1UA 2F51A 2GGTA 1QXHA 1JHBA 3DVWA 19GSA 5B8AA 1BYEA 3DRNA 1XWAA 3QAGA 2YANA 3G7IA 1AW9A 2DBCA 3RPNA 3W8JA 4EDYA 2LJKA 3GUSA 1VF1A 3L9SA 2N5FA 2YWNA 20GSA 1YQ1A 3F4RA 1U87A 2MMAA 3KTBA 3HVSA 1JLWA 3HJMA 2X8CA 2E2GA 5DAKB 3IK7A 3A2WA 1XW9A 1F37A 4KNDA 2C8UA 1EGRA 2FGXA 3WD6A 1U3IA 2C80A 3HA9A 2VCVA 11GSA 5JCGA 1WMJA 2XBIA 3EE2A 3ISOA 4HJ2A 2AB6A 2IN3A 2IMIA 2LUSA 4BVYA 4G19A 4KA0A 13GSA 3TRQA 5AIXA 1M0UA 3QAVA 2B7KA 1J0FA 3EINA 1ZYEA 2Z9SA 4TXVA 3Q74A 4TXOA 3DXBA 3HVXA 1SK2A 2L5LA 4MMMA 3IDVA 2VUPA 1ERTA 4H86A 4OO4A 2YOIA 2VAFA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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