5ISJA

Endothiapepsin in complex with chiral chlorinated primary amine fragment
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Crystallographic Fragment Screening of an Entire Library
rcsb
total genus 84
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2016-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5isjA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 5isjA01
5P62A 4BFDA 2V11C 1MEUA 4GJ6A 5P4AA 5P3SA 5P7VA 3Q6YA 3EKPA 5DR0A 5P1DA 1ODWA 1AIDA 4IVTA 5P1HA 5OZAA 4OD9A 2AOGA 5P65A 4ZSPA 4LL3A 5HU0A 3VG1A 3VSWA 2UPJA 5P5IA 2FMBA 1HIIA 5OZSA 5P07A 5COOA 2J9JB 4D85A 1G2KA 2VJ9A 2FDPA 2AOEA 5OYSA 1G6LA 5T4SA 2B7ZA 1BXQA 2Q63A 5P52A 5P70A 1SMEA 5DGUA 4B1EA 1HVKA 3HLOA 3HZCA 2PQZA 1M43A 4WY1A 3UFNA 2OHNA 3ER5E 1HXBA 2NPHA 1GKTA 2QI5A 2QHCA 5OZHA 5P3QA 5IS4A 5OYXA 3K5FA 5P3HA 3ZL7A 4Y54A 2VIZA 4EPJA 4BFBA 5P0QA 4PHVA 3D1YA 1DW6C 1B5FA 5SXNA 2VIJA 3NXNA 4H3JA 2JE4A 3OHFA 2R3TA 4RROA 5P6SA 4CKUA 3BUGA 1AM5A 4Y43A 3CKRA 4RCFA 4GMIA 4L6BA 2I4UA 1ZSFA 1HBVA 5C9DA 1TCXA 4HA5A 3L5BA 4Y56A 1Z1HA 5P0SA 1FMXA 5BS4A 4QLHA 2VJ7A 5P1PA 4J1CA 3LIVA 2AZCA 5HE7A 1BWAA 5FIVA 1PFZA 1XS7D 5P7PA 4R95A 2H6TA 5HVPA 2FXDA 4RYCA 2IS0A 1G35A 4ER4E 1HTFA 1T6GA 3OGQA 3URJA 2OHMA 2QZXA 3CIBA 3UQWA 1SP5A 5P6YA 5P55A 2NXDA 3SLZA 1E82E 2QD8A 3QBHA 3PEPA 2ZDZA 1A94A 3HD8A 1HEFE 2FDDA 2V12C 5P6WA 1D4SA 3O9CA 5P2EA 5UPJA 2NMYA 1MRXA 3OXXA 2AZ9A 4GJDA 5P36A 1MTBA 3VLBA 3ST5A 3BHEA 3SAAA 3OQKA 3VLAA 4CPUA 2R3WA 3NU9A 1A30A 1LF2A 4IVSA 5P28A 3S54A 1ZTZA 3GGXA 4Y3QA 5KQXA 2G21A 3RSVA 5P3RA 4Y5BA 3ER3E 6UPJA 2AQUA 5P2DA 1JLDA 3RSXA 1SBGA 5P5UA 3UQUA 4TRYA 2I4XA 2RKGA 4A6CA 4MC2A 3H5BA 4AA8A 5P1CA 5P8DA 1DPJA 5P3DA 4YCTA 1HVJA 5OYZA 3I2LA 3ZOVA 3DJKA 5HTZA 5P6QA 3VYEA 2G26A 4FRSA 2G24A 5P82A 4DJWA 5P60A 1FF0C 5DR7A 3FV3A 2VJ6A 3OU1A 3PI5A 3QROA 5P6BA 4Y57A 5IVSA 9HVPA 2Q3KA 1KJGA 3IVIA 1SDTA 2J9JA 3HAUA 5P46A 2OHLA 4RVXA 1NPAA 3D1XA 3UDHA 3O9FA 3D3TA 2NNPA 3LZVA 4KE0A 1DP5A 3VF3A 2Q55A 5BWYA 2QI1A 5P3OA 1VIJA 5AHCA 1FLHA 4ACUA 1Z1RA 3EL4A 5P0BA 5P8UA 1HVLA 1RNEA 2V16C 5P8QA 5OZ7A 4BELA 3OAGB 4TRWA 5P8CA 4Y5KA 4Y5GA 1IZEA 4Y4DA 4Y3MA 3L59A 5OZUA 5P5MA 3L5EA 3BUFA 4I8WA 5P6ZA 1KJ4A 4I0HA 5OZZA 4GZFA 5OYVA 5P78A 3I7EA 5KOSA 3OU3A 3UHLA 5P81A 4H1EA 1FEJC 3INHA 5COPA 3Q4BA 4KE1A 5OZEA 5AHBA 1ZJ7A 4HLAA 5DQ1A 5P2YA 3S8IA 3OQDA 1XL5A 4LXAA 4Y5CA 2ZJKA 3SA3A 3UDPA 4Y39A 5P1EA 5P2RA 3DV1A 5ISKA 3UDNA 4I12A 5E5JA 3LIZA 4FSLA 1AJVA 3O9LB 2QI7A 3EL0A 4J1IA 4LXMA 1FG6C 5P2JA 3T7XA 3U6AA 2AVOA 3S7LA 4ZSMA 4K8SA 1LYWA 4WTUA 1IVQA 2F81A 5P87A 3LITA 4UPJA 2PSUA 5P3TA 2OHTA 2A1EA 1B6MA 3T6IA 3NUJA 5P33A 2OHPA 1YTJA 5ER2E 3VV8A 5OZVA 4Y50A 3D1ZA 4Y4ZA 2Q11A 5P7KA 3HVGA 5AHAA 4Y4AA 5P74A 1SGUA 3PI0A 4DPIA 5P6GA 4COEA 5P89A 4B1CA 5P2ZA 5P4BA 3TKWA 3CICA 4GJ5A 2BPVA 3MSJA 5P71A 3ZKQA 3LINA 5AH6A 5TOLA 3UDKA 5PEPA 1KJ7A 2WEZA 5P2TA 2ZE1A 4HEGA 5P2SA 5I3WA 3NDUA 4OC6B 1OEWA 1WBMA 4Y4EA 2P3BB 2ZJIA 1ZAPA 3OADB 4YD3A 3PSGA 3LPIA 4FRJA 2FGVA 2OHSA 5OZCA 1CZIE 5P5QA 4Y44A 4QJ6A 5P7XA 4PZWA 4YDFA 1YG9A 5P7BA 5P2BA 1PPKE 3EM4A 4DPFA 3I6OA 1PROA 5OZJA 2OHUA 4H3IA 4EHCA 4B78A 4LXKA 4HE9A 5P5YA 1QS8A 3G72A 3UCBA 4APRE 3I25A 2WEDA 4Y51A 5P06A 2ZHSA 4NKKA 5I3XA 5P02A 4JECA 5DQ4A 4ZPFA 5P3FA 5P1XA 1F7AA 5P0PA 3ZPUA 1B6LA 1BDQA 3DCKA 1APUE 5P66A 1XN3A 5P8IA 3L38A 1APWE 1MT9A 4EQJA 5DGWA 3IN4A 5P7WA 5SZ9A 3UQXA 4YOBA 5OZFA 1D4KA 4OBZB 4K4QA 3INFA 1PSOE 2QZLA 3SA6A 2ER0E 5JODA 2ZHUA 5P30A 4JPEA 4Y36A 3OXVA 5P13A 2QD6A 1APVE 3KFSA 1TSQA 4Y3AA 4DQGA 3VV7A 4DJPA 5P1KA 5P5BA 5P34A 5P7HA 5P6TA 4FIVA 1EC3A 2OF0A 3SKGA 4B1DA 2Q64A 5P29A 2ZYEA 5ENKA 3U7SA 1E80E 1KJHA 1VIKA 4X2LA 2PYNA 1C6YA 2R8NA 5P86A 2BPYA 5CLMA 1XDHA 5P1RA 5P1NA 5P1FA 3R2FA 1W5WA 4H3GA 5P0UA 4Q1WA 5P0WA 1T7KA 3OOZA 3OU4A 3PRSA 1A8GA 1HHPA 1QRPE 2WEAA 3QRSA 1EPPE 2HPEA 1TCWA 4D89A 1WBKA 1EPME 2B60A 1SIPA 1NPWA 2QZWA 1XE5A 4GJ8A 3O9LA 2HPFA 4FAEA 3L3AA 2QMPA 4YD6A 2XYEA 3Q70A 4GJBA 5P4PA 1RPIA 4DJUA 1IZIA 3S43B 1AXAA 5OZ9A 5P6DA 3PSYA 3K1WA 5P09A 2P4JA 5P45A 3OHHA 3FKTA 4K4PA 2QNPA 3SFCA 5OZPA 5P2KA 3OQ7A 2ZHRA 3QVIA 5OZTA 2RSPA 3WSJA 4DQCA 2WL0A 5P2NA 2I0DA 1B6PA 1IVPA 1HRNA 2IEOA 2P8HA 5P25A 2WKZA 4ZEAA 3GI6A 5OZWA 1QDMA 3T3CA 4Y53A 3VEUA 5P27A 3B7VA 3QRMA 3QVCA 1CPIA 3LIYA 2SAMA 5C9BA 2VNNA 5P3NA 3VF5A 1NPVA 5P0YA 4MC9A 4XKXA 3BXSA 2JXRA 5P7YA 5P51A 3MXDA 5P1BA 5P6NA 1EPQE 4PZXA 2G1YA 3QI1A 5P8KA 3OUDA 3OUAA 4WY6A 1T7JA 2G20A 3FNSA 4Y4JA 5OZGA 4Z4XA 5P3GA 2VA5A 5P6AA 3QRVA 1YX9A 4CPQA 4U7VA 1KZKA 2QD7A 2FXEA 5P3XA 3ZKSA 2ZJLA 2QAKA 5P0AA 3LPKA 5P0JA 5P4MA 5P42A 2F80A 3NWQA 3SM2A 5KR1A 2ER7E 3SKFA 4L7GA 3GI4A 3CIDA 5P7FA 1HPXA 5P4UA 4R8YA 5P8GA 3DM6A 1YT9A 5IVQA 5ISJA 5P63A 1AVFA 2AVVA 1CMSA 4CPSA 5P4GA 5P72A 5P5PA 2Q15A 1A8KA 4OBZA 5P00A 4Y6MA 4QJ7A 5P01A 1SH9A 3SABA 5AH9A 3VFAA 1MTRA 3PLDA 5P4FA 5P79A 2F3EA 5P43A 4U7QA 4RCDA 4J1FA 5P4DA 2O4KA 4GYEA 1DMPA 3IXKA 5P2FA 2B8LA 2G1NA 2IRZA 5DPZA 1AAQA 4Y5EA 3RTHA 2V10C 5P2IA 4LHHA 5APRE 4J5JA 3QBFA 5KOQA 2IL2A 5HCTA 4RGHA 4YOAA 4EXHA 3UDMA 4F76A 3UDJA 3S45A 1FG8C 5P53A 3KM4A 3I8WA 3WZ7A 3LIQA 4K9HA 5P0EA 4RLDA 2OAHA 4Y37A 5P7AA 1G0VA 5P68A 3HDKA 5P3CA 4Y3WA 3GI5A 2V0ZC 5P39A 4Y4UA 5P17A 1EBKC 4EWOA 5DR3A 4FRIA 3VYDA 3H0BA 5P5LA 4APEA 2WF4A 4J0VA 4Y3DA 2NR6A 4Q1XA 1UH8A 4EXGA 2ZJNA 1GNMA 4FS4A 3TL9A 4D8CA 1EBYA 4YE3A 3O9EA 4HVPA 1HTEA 2G22A 1FB7A 5JG1A 5P1OA 5P6CA 3TKGA 5P4LA 4OBDA 4TVGA 4EP2A 1HIHA 4EJLA 3UQRA 1W50A 5HCOA 4GJAA 5P38A 4B77A 1EPLE 4NJVA 5P0OA 4RRNA 4FM7A 5P4WA 4EQ0A 5OYUA 5EZXA 5P6OA 2IGXA 1SDVA 1UH7A 5DR8A 5P7NA 1HSIA 3BGBA 3NLSA 5P0FA 5P2QA 1HOSA 3UF3A 5P1VA 5P1SA 5JFPA 3MSKA 3HW1A 2UXZA 5P22A 4OBHA 2VIYA 5P8MA 1BDLA 1IZDA 2R38A 4JP9A 4LAPA 1BIMA 1HTGA 2FDEA 4FL8A 2VNMA 3APPA 2PSGA 3JW2A 5DR4A 5SY2A 2FS4A 5P5JA 5P6EA 4YD4A 5P3ZA 5P03A 1HVSA 5KQYA 2FNTA 1LZQA 5OZRA 4DJQA 2JJIA 5P04A 3ZKGA 5P19A 5P77A 4Y3LA 2P83A 5F01A 5P7TA 3FSMA 1TZSA 1QBTA 4Y3JA 4I10A 2ASIA 3PBDA 5P0VA 3PJ6A 2IDWA 2ZHTA 5P59A 3BGCA 1K6VA 4AUCA 2I4DA 1K6PA 5P5VA 4NPUA 4GJCA 3NUOA 4Y4GA 1GNNA 4CPXA 2NXMA 3R0WA 4HDBA 2QK5A 5P5XA 2FNSA 2JJJA 3EM3A 2Z54A 4ZE6A 4NJTA 7UPJA 4Y35A 5P2GA 2XFKA 5P6LA 3O9AA 4FE6A 2RMPA 3L58A 5P3MA 1DIFA 5OZOA 4DQFA 4FRKA 3K5CA 5IVTA 4JPCA 3LZSA 3SA8A 4GJ7A 5P8FA 3O9GA 2VIEA 3GGAA 3SPKA 5OZ1A 5P57A 3VF7A 5P6HA 2P3DA 2AOFA 3OOTA 1HXWA 2QNQA 4J55A 5P80A 1APTE 5P3VA 3L5DA 2NXLA 2AOHA 2O40A 3FNTA 2G69A 3R4BA 3D91A 4L7JA 1IBQA 5KAOA 1LF4A 5P6VA 3VV6A 4J54A 2G27A 1QBUA 5COKA 1E81E 1TQFA 3TOHA 1HEGE 1HVCA 5P37A 3TNEA 1MSNA 4KUPA 3IAWA 4ZLSA 3T7PA 4QJ8A 5OZIA 5P20A 5P7IA 1LYBB 2ZJHA 3AIDA 3Q3TA 5P31A 5P26A 3GGVA 5P4KA 1U8GA 2I4QA 3KDCA 3SO9A 3KFNA 5P5GA 5P1LA 2AODA 2O4PA 1MESA 4KB9A 4OBGA 4YD7A 3OY4A 5P5KA 5ER1E 2O4NA 3NU3A 1K6CA 4QGIA 3ZPTA 2HB4A 4L1AB 5P83A 5OZ0A 2FGUA 2O4LA 5P8AA 3PMYA 2PH8A 1T7IA 3EKYA 5P3LA 2V13A 5P5FA 1EEDP 2VA7A 5P12A 5P4CA 3WB5A 5DQ2A 5P1IA 1NSOA 3O9DA 1M0BA 1BV9A 4TRZA 5P76A 3UDRA 1MVPA 1YTIA 3QPJA 3EMYA 4YA8A 5P4HA 1T6EX 4B0QA 4Y3NA 5HDVA 5P1GA 3EKWA 4RYGA 5P6XA 3RTMA 3NU6A 4Y45A 4QJ2A 4EJDA 5P50A 5P64A 3SA4A 3GW5A 4OD9B 3HVPA 5P69A 4J0YA 2JYSA 2HM1A 2NMZA 1RL8A 1UPJA 1HPVA 1OD1A 3WZ6A 4I0JA 1LV1A 4X7IA 2RKFA 5I3YA 5P3EA 4F75A 3DCRA 5P5HA 3EBZA 3ZKMA 5OZNA 5P11A 5P3YA 4MC6A 5P7GA 5P3IA 3EXOA 3VFBA 2H6SA 2PSVA 3PCWA 4Y4TA 2QI0A 2OHQA 4I1CA 3UQPA 3PWMA 1EPOE 3LZUA 5P24A 2Z4OA 1YM4A 4Y4BA 3BRAA 1EC2A 4B05A 4Z22A 3KF0A 4Q1NA 2I0AA 5OZYA 3LNKA 3PMUA 5P48A 1ZLFA 4F74A 3EKVA 2IKUA 4AMTA 1OHRA 1QBRA 1XN2A 3OAGA 1HSGA 3CKPA 5P5WA 3NDTA 2B42A 2HB2A 2HS2A 2BKTA 1MPPA 5P2AA 1K2CA 3KN0A 1B5FB 5P7QA 5P4NA 4B72A 1FKNA 4OBFA 1GVTA 3IXJA 5P5OA 3T11A 4ZIPA 5P8RA 2PC0A 3OUBA 1W6IA 1EPRE 1GVWA 3NWXA 4I0GA 2BQVA 3PBZA 5P6IA 3MXEA 2QMDA 4YCKA 1GVVA 5P2CA 5P5TA 2P3CA 2IENA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P62 A;  4BFD A;  2V11 C;  1MEU A;  4GJ6 A;  5P4A A;  5P3S A;  5P7V A;  3Q6Y A;  3EKP A;  5DR0 A;  5P1D A;  1ODW A;  1AID A;  4IVT A;  5P1H A;  5OZA A;  4OD9 A;  2AOG A;  5P65 A;  4ZSP A;  4LL3 A;  5HU0 A;  3VG1 A;  3VSW A;  2UPJ A;  5P5I A;  2FMB A;  1HII A;  5OZS A;  5P07 A;  5COO A;  2J9J B;  4D85 A;  1G2K A;  2VJ9 A;  2FDP A;  2AOE A;  5OYS A;  1G6L A;  5T4S A;  2B7Z A;  1BXQ A;  2Q63 A;  5P52 A;  5P70 A;  1SME A;  5DGU A;  4B1E A;  1HVK A;  3HLO A;  3HZC A;  2PQZ A;  1M43 A;  4WY1 A;  3UFN A;  2OHN A;  3ER5 E;  1HXB A;  2NPH A;  1GKT A;  2QI5 A;  2QHC A;  5OZH A;  5P3Q A;  5IS4 A;  5OYX A;  3K5F A;  5P3H A;  3ZL7 A;  4Y54 A;  2VIZ A;  4EPJ A;  4BFB A;  5P0Q A;  4PHV A;  3D1Y A;  1DW6 C;  1B5F A;  5SXN A;  2VIJ A;  3NXN A;  4H3J A;  2JE4 A;  3OHF A;  2R3T A;  4RRO A;  5P6S A;  4CKU A;  3BUG A;  1AM5 A;  4Y43 A;  3CKR A;  4RCF A;  4GMI A;  4L6B A;  2I4U A;  1ZSF A;  1HBV A;  5C9D A;  1TCX A;  4HA5 A;  3L5B A;  4Y56 A;  1Z1H A;  5P0S A;  1FMX A;  5BS4 A;  4QLH A;  2VJ7 A;  5P1P A;  4J1C A;  3LIV A;  2AZC A;  5HE7 A;  1BWA A;  5FIV A;  1PFZ A;  1XS7 D;  5P7P A;  4R95 A;  2H6T A;  5HVP A;  2FXD A;  4RYC A;  2IS0 A;  1G35 A;  4ER4 E;  1HTF A;  1T6G A;  3OGQ A;  3URJ A;  2OHM A;  2QZX A;  3CIB A;  3UQW A;  1SP5 A;  5P6Y A;  5P55 A;  2NXD A;  3SLZ A;  1E82 E;  2QD8 A;  3QBH A;  3PEP A;  2ZDZ A;  1A94 A;  3HD8 A;  1HEF E;  2FDD A;  2V12 C;  5P6W A;  1D4S A;  3O9C A;  5P2E A;  5UPJ A;  2NMY A;  1MRX A;  3OXX A;  2AZ9 A;  4GJD A;  5P36 A;  1MTB A;  3VLB A;  3ST5 A;  3BHE A;  3SAA A;  3OQK A;  3VLA A;  4CPU A;  2R3W A;  3NU9 A;  1A30 A;  1LF2 A;  4IVS A;  5P28 A;  3S54 A;  1ZTZ A;  3GGX A;  4Y3Q A;  5KQX A;  2G21 A;  3RSV A;  5P3R A;  4Y5B A;  3ER3 E;  6UPJ A;  2AQU A;  5P2D A;  1JLD A;  3RSX A;  1SBG A;  5P5U A;  3UQU A;  4TRY A;  2I4X A;  2RKG A;  4A6C A;  4MC2 A;  3H5B A;  4AA8 A;  5P1C A;  5P8D A;  1DPJ A;  5P3D A;  4YCT A;  1HVJ A;  5OYZ A;  3I2L A;  3ZOV A;  3DJK A;  5HTZ A;  5P6Q A;  3VYE A;  2G26 A;  4FRS A;  2G24 A;  5P82 A;  4DJW A;  5P60 A;  1FF0 C;  5DR7 A;  3FV3 A;  2VJ6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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