5ISUA

2.2 angstrom crystal structure of abc transporter substrate binding protein ctap (lmo0135) from listeria monocytogenes.
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
488
structure length
488
Chain Sequence
KDGGSLIIGVTGDPEVINPNYASDRVTLTIQQAVYAPLFWEVDGKPALAKSLDISDDNLTYTVKLKDGLTWHDGKPLTADDVVFTVNSILDTKQNSPNRGNFVFDDKPVKVEAVDDTTVKFTLPTVAPAFENTIKTFFPIPKHIFEGVENIEKSDKNKNPIGSGPYKFVEYKTGEYVSLERFNDYFDGKPKLDKVTFRITKDQNAANLALQNGEINLKSIQPSDRNKVEKASAVNIITYPENRLSYATFNENQPALKSKELRQALSYALDREEIIDAAYGSDEYAKPASSFLTENTKYFTDKVETYDQDIAKAKKLVKESGFDTSQKLTVYYLNNSKSQESIALYLQQQYKEIGVTLDLKPTDPNALSNITLDRKNADYSIALNGYIMGNDPDAYKSLYLSDAPYNYSNYHNKDLDALWEKGAVTADDKERQEIYEKIQNTIADDAVIYPISYDNAVLALDSRYGGQKAATPQPVTMFRDLSKLYLTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transport protein
molecule keywords Lmo0135 protein
publication title 2.2 Angstrom Crystal Structure of ABC Transporter Substrate Binding Protein CtaP (Lmo0135) from Listeria monocytogenes.
rcsb
source organism Listeria monocytogenes egd-e
total genus 169
structure length 488
sequence length 488
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00496 SBP_bac_5 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 5 Middle
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 5isuA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5isuA01
3.90.76.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Dipeptide-binding Protein; domain 1 Dipeptide-binding Protein; Domain 1 5isuA02
3CSGA 1M5CA 3DRKA 2O68A 3OELA 3HHFA 2DVZA 4OQOA 2DWHA 1MQHA 3TTMA 1PB8A 4YKKA 3T66A 3JV9A 5BUUA 1N04A 5I59B 3KSJA 1URSA 3TODA 3V83A 1PBPA 3C32A 1B7ZA 2HCAA 4DLDA 1LAHE 3IJXB 3T9VA 2ESNA 2XXWA 2D5WA 3LVUA 2AYSA 3BKIB 1M5FA 3E13X 3RYBA 1NNPA 1SBPA 3TYHA 3C34A 3QXMA 3BFUA 3EN3A 3CI8A 2Y7WA 3MJNA 3PMXA 1XVYA 4Q30B 4ZZAA 5I57A 2GHBA 1FQDA 1B3FA 5ICQA 4OFJA 4G8HA 1XS5A 4ESWA 2OJTA 1QKAA 1B58A 5CM6A 1H3DA 2GH9A 3PPQA 1SVXB 4NF4A 1LFHA 2O69A 3THIA 2OCUA 3VLVA 2Y7KA 1MM6A 1P1UA 2XHDA 4F2OA 1B5IA 3ZKKA 4PFWA 4IO6A 2GRVA 3TCGA 2Y7IA 2I3WA 3RY3A 3H3GA 4TLLB 3HHGA 4YB5A 3IAZA 1FQAA 3SEYA 1H45A 1JW1A 2DS9A 1XT8A 1MY3A 3B6TA 1ZIUA 1Y4TA 4NF5B 3T93B 4OZ9A 4QFPA 4R73A 3U93A 4P11A 4G8MA 2QMWA 4F1YA 5B70A 1LCTA 1NNFA 2VD2A 3OO6A 3RLFE 3VVFA 4FATA 5CMMA 4GL8A 2F7CA 4JWXA 4LUBA 2XX7A 3OO9A 4MH5A 4GOTA 4U4XA 3TZAA 1RYOA 1USYH 2XXIA 3IOUA 3E3KA 1UTHA 4BDMA 2ONKE 3K1PA 3T9HB 3KN3A 5FHNA 2CMOA 4JSDA 5AE4A 2WOPA 2CZLA 4OHNA 1OIBA 3UGWA 3PV0E 1NNTA 1H44A 1S50A 5JK4A 1I6BA 1MXVA 5IKBA 3TAJA 5TP9A 3N26A 5CC2A 3IOTA 3UIFA 4RA1A 3GBAA 2FNCA 1B5HA 5F7VA 5EHSA 5I57B 2HAVA 1ZU0A 1P1WA 1AH5A 1RKMA 3S9NC 4KR5A 4NF4B 3V89B 5LOMA 4P0GA 3Q28A 4ECFA 3FATA 3ECRA 2D21A 4LP2B 3CVGA 1B2HA 4EQ9A 5B7DA 3H6WA 3PMVA 1DOTA 2QS2A 3N6UA 3P7IA 3H03A 2Z8DA 5I58A 3PPPA 4DIGA 2D3IA 4THIA 1MQIA 3M3KA 4R2FA 3MPLA 4F18A 3H06B 3U72A 2E0SA 3A3UA 1VFDA 1FQCA 3IB2A 4C1TA 5BWJA 5DYHA 3IK6B 5A5XA 2P1SA 5AA1A 4H8JA 1Y1MA 3DRFA 4TQUQ 3PUZE 4NWCA 2NWJA 1AIVA 3N94A 3B6WA 1N3WA 3HSTA 1LSTA 1NKXA 1TFDA 1N3XA 1MG1A 3IR1A 3H6VA 1MY0A 5CRYA 4F1VA 1BKAA 1QULA 2I0BA 4H8IA 4R9FA 3K6UA 2GHAA 2REJA 3T9XB 3K6XA 4ZE8A 2F34A 1FQBA 1QVSA 1UTHB 3K1MA 3PAMA 3G3HA 1LCFA 3O6PA 1A7LA 1P1QA 1MDP1 3C35A 5KDTA 1VE4A 3FJMA 3UA8A 1SQYA 1PDAA 3UN6A 1D4NA 4ZDMA 3TQWA 4MF3A 3O6GA 4R6KA 5AA2D 1S9TA 3MBPA 1LLSA 4KCCA 2F5XA 3CFXA 5TP9B 4YB7A 3DRIA 4LZ7A 1SW1A 2QS4A 1II5A 1PB7A 1L5TA 2XXUA 4RPNA 3M8UA 2DVCA 4F2QA 2E1SA 1O64A 4IB2A 1MXUA 3SESA 3FV1A 4P0IA 4O3BA 5AA4A 2Z8FA 3KEIA 4PE5B 1B32A 2OZZA 2YPNA 4RYAA 4E0XA 3OMBA 4YMBA 1PB9A 2ZYOA 4GWOA 5I58B 5CBSA 2HXWA 1MY2A 2UYEA 1B51A 1N7WA 1FTMA 4ZECA 4RJZA 4G4PA 3F11A 3ZS6A 2RC8A 4QF9A 4XKNA 5A5XB 3OXNA 4NF6A 4H0WA 3PUYE 3TQLA 3N5LA 4ONYA 2VP1A 1IXGA 4U23A 4IY5A 4LQ5A 1MRPA 4GLIA 5JTYA 1MDQA 4C1UA 3LR1A 1N7XA 1B0LA 1GTKA 1JW4A 3HN0A 4GFRA 5TPAB 3IOVA 3VXBA 1SYIA 4LVQA 2ZYNA 1OQGA 2R71A 3VXCA 5M2VA 4U1ZA 4MLVA 1BLFA 1LBCA 4GXAA 3DELB 3VFJA 3S9MC 1KWHA 3IJOB 4K3FA 1WVJA 1HSJA 5KDTB 1IUDA 2B65A 5AA3A 3SKPA 5I2NA 4R6HA 5K2YA 2DYXA 2R6GE 1A8FA 3V5AA 4R2BA 4RK9A 3BFTA 1Y4CA 4O3AA 1MPBA 1MM7A 3L6HA 1DPEA 1A40A 1MY1A 2QPQA 2UYFA 2IEEA 5EYFA 1B3GA 4U4SA 2RCAA 3MWBA 4LA9A 1QUIA 4XKQA 4QSCA 1B1XA 1S7YA 4BDNA 4TLMB 4I8CA 1MH4A 1NH7A 1TWYA 1Y1ZA 3ILUB 1MPDA 3TFLA 2F35A 3A3CA 3PPNA 1B3LA 1MQDA 5AA4B 1EZ9A 1JETA 4IO5A 3EHTA 4NWDA 3Q26A 5EHMA 4JWYA 3HCQA 1EZPA 1QUKA 1ZLQA 3K00A 2A5TA 1VSOA 1Y20A 4X1BA 3MC2A 3T96B 1AMFA 4ZE9A 2BJJX 4KI0E 3U1OA 3MQ9A 4MLQA 4UACA 4YZZA 4PQJA 1MQGA 1PBQA 4OEVA 2F6PA 4NF6B 1LB9A 3CIJA 4F3SA 3ONMA 1N76A 2VHAA 3HO7A 1FTJA 2XD3A 3QSLA 5H8FA 2NUVA 4JXIA 3W15C 2ALUA 3LSFB 4ELQA 1A54A 5ELVA 4Z0IA 1SD3A 1CE2A 5JTYB 3UORA 4LONB 2RINA 4NF8A 2X26A 3WAFA 3C36A 1OLCA 3TPAA 2X7PA 3DLNA 3FGSA 4FAJA 1M5EA 2G93A 1YPNA 3FXRA 4QFKA 3USDA 3MUQA 2QSXA 3VV5A 4RXLA 1P1NA 1GGGA 4YB6A 4LZ5A 3JYRA 3G3GA 4IO3A 2DSFA 2XXRA 5I2NB 3CRBA 4G68C 2PT2A 3GBBA 3MPKA 3MP6A 1B0HA 5DVFA 3LUYA 3IB1A 3C4MA 3PUWE 3CG3A 3MVZA 4YKPA 2NOOA 2Z23A 1IXIA 3PU5A 2H4IA 3Q27A 3FJGA 1UQWA 2ZYMA 3UK4A 2ONRA 1NL5A 1I69A 4XXUA 4H67A 3QAXA 3SEUA 1B40A 2F36A 5JEIA 2H5YA 5FHOA 3TKDA 1O63A 3RQTA 3LSWA 1MPCA 1ATGA 4GF8A 1D9VA 4Q8RA 3N6TA 4ND9A 1WODA 2I3VA 1LAGE 1R9LA 4EXLA 2A5TB 3TTRA 3LSXA 3OD7A 2THIA 3O66A 1QKBA 1B7HA 1ZTYA 4F19A 2REGA 2Y7PA 2XX9A 4NTLA 2VD3A 3FZVA 3O6HA 4XIGQ 1XOCA 2XXXA 2DXRA 1ZMGA 2Q89A 2RF1A 3PGFA 2OK2A 1QJMA 3C31A 1YAEA 1VFEA 5H8FB 5KCJA 3IL1B 4U1OA 3TEPA 2XXTA 2Q2CA 3M3FA 3K6WA 5AA2A 4QFLA 5KZTA 3K4UA 5I2KB 4OESA 4I62A 4F1UA 1JW5A 1H43A 2O6AA 4NF8B 2QL3A 4RNSA 1HSEA 4XTCQ 4DCXA 3MP1A 5IAIA 4N6PA 3OSQA 1US4A 2NXOA 2DWIA 4YKJA 5DVJA 4F29A 2WOLA 3FVOA 3EHUA 1NMUA 3QUJA 4F39A 4PFTA 4HCYA 5FTHA 4O3CA 1YCJA 4H5FA 2DP8A 4DCYA 5TPAA 1DPPA 3LC8A 3G3KA 2HFBA 3IO4A 1POTA 3PUVE 3DP6A 3ODBA 4DE8A 4GIZA 4R72A 4KYSA 3C9HA 3K6VA 3SDFA 4JSOA 4F3GA 3TUSA 4HW8A 2HQ0A 4OERA 3MZBA 1ANFA 1B46A 3CFZA 1J1NA 4X1DA 3K2DA 4ZZEA 3SETA 4U2RA 5DVIA 2F6GA 1TT1A 1IXCA 3G3IA 3Q29A 2F7BA 1Y3NA 4H5GA 1B7UA 4RY1A 4ESXA 3H6UA 2ANJA 2DE3A 3CG1A 5K2XA 1JNFA 4GVOA 3G3JA 3OOAA 2ABHA 5H8SA 4R74A 5H8HA 3KJ7A 4R6YA 4MFIA 3RYAA 2W7YA 3PUXE 4H1XA 4KFQA 3MVWA 3RTWB 1XHYA 3D4GA 4FEDA 5TU0A 2RC7A 5KCJB 1N84A 2UVIA 4QSDA 2QMXA 3CFLA 5AA2B 1Q1KA 1Z7ME 4PFYA 4PETA 2XD2A 4QFNA 3OEKA 4I1DA 1NNKA 2YLNA 4GQOA 3TCHA 4RK2A 3KOSA 3KOTA 4KQPA 2PVUA 3O2AA 5L8DA 2Z8EA 4IY6A 1PEBA 1RYXA 3CHGA 4F31B 1POY1 1FTLA 2DOJA 1Y3PA 3QYTA 1URGA 4JB7A 3I3VA 3KZGA 2UVJA 2UVHA 3VVEA 1US5A 4ZS9A 5ISUA 3FVKA 2Z22A 4EF2A 1BTJA 2FYIA 3O6IA 4KD5A 3MZ9A 3TMGA 2XXQA 2ONSA 4U21A 3VLWA 1B1HA 1ZJLA 4KCDA 1SI1A 1OVBA 3S2VA 1YTVA 2B4MA 5HBCA 4OVJA 3T9UA 2O1MA 3G3FA 3R7XA 2Y7RA 1B4ZA 2Q2AA 2F7AA 3IOWA 3OO7A 4DXBA 2G29A 3WAEA 2DWJA 3KJTA 2ZNUA 2F8DA 1Q35A 4OTEA 1AOVA 1FTKA 2RC9A 4AB5A 3FTOA 3FUZA 4M1VA 1B05A 1B6HA 1GV8A 5H8QA 1DMBA 1Z7NE 3FVNA 1LAFE 1SDXA 4UA8A 5H8HB 4ELOA 1N0TA 2DE4A 4FIMA 1B52A 1NH8A 4WXJA 3B6QA 3S4UA 1B3HA 1T0KA 4OETA 2V3QA 1OLAA 4ISUA 4JDFA 2I6EA 4BLAA 4EQBA 4OENA 3TELA 3E9XA 5HM4B 2HZKA 3EF7A 4FORA 1JVYA 3MZ1A 1H76A 1O7TA 4NEDA 1MH3A 3MW0A 3R6UA 2V3TA 1QUJA 1SYHA 4HTGA 4KHZE 4ZEBA 4X48A 3KG2A 3ZSFA 2XXHA 1B4HA 1SI0A 2P2AA 4G68A 1LB8A 1GR2A 1M5DA 4DZ1A 5L9SA 3G7WA 1FCKA 2F97A 4ZEIA 1USYE 3RGYA 2OWSA 3CSBA 5I2KA 4H65A 4BDQA 4EDPA 3DRGA 3OO8A 1ZKBA 4HCWA 4Q5TA 3KN8A 2PMSA 2VOZA 4DXCA 1F9BA 2OWTA 4YU0A 2OLBA 3IB0A 2O7IA 4NMYA 3A09A 1SW4A 3RN8A 3BBRA 1LFGA 3FIRA 2HAUA 5CI5A 3O29A 3TTLA 4BDRA 1A55A 5F1QA 1QW0A 4R75A 4G2ZA 4OXVA 4QRZA 1SW5A 3RNNA 2XXVA 2ZMBA 1ZBMA 4RPOA 2V93A 3D4CA 2I49A 2M8CA 2R9JA 3KFMA 4GXSB 3ZKLA 1B3EA 3HPIA 3RT8A 2UVGA 3QUFA 4I9DA 4WEPA 1R6ZA 3EPEA 4DXUA 3VE1B 5I56A 4C0RA 4YMAA 3U94A 1UIVA 2HZLA 1LGBC 5H8QB 3T22A 3PPRA 3DP4A 3KGCA 4XKPA 4FEBA 3RTFB 4OWDA 3RUMA 3GXAA 3RPWA 2DXYA 3GZGA 2RCBA 3PD9A 4JBZA 3FXUA 1FQEA 1GVCA 4DDDA 4GRKA 1JEVA 3TCFA 4R9GA 5HPQA 3IO6A 2RKMA 1P99A 1OMPA 4PFUA 3H6TA 3O97A 1R9QA 4LZ8A 3VDFA 1I6QA 1LAXA 4YAHX 4TOZA 3FD3A 2H25A 2H98A 5H8NA 4POWA 2UXAA 3M3LA 5L9MA 3O28A 4FE8A 5FTIA 3SERA 2PBWA 2ZXTA 2Q9TA 1Y3QA 3ILTB 2O51A 3S9LC 2O7UA 1LFIA 1VR5A 3EHSA 4AB6A 2AL4A 4G68B 4ELRA 3OENA 4QHQA 2YJPA 4FECA 1P1OA 4F22A 4E0WA 1A8EA 2B4LA 2A5SA 1M5BA 5L9OA 1TXFA 5DTBA 2I48A 1MS7A 3GLBA 3I6VA 5DT6A 4YKIA 1UTBA 3FJ7A 4KYDA 4U22A 1IXHA 1MXWA 1IZ1A 1A99A 2AIXA 1EZOA 4Z7EA 1DTZA 4IO4A 4OFOA 1ELJA 2PT1A 5ITOA 4OMBA 2O84X 1IEJA 4OYVA 1MXZA 3K01A 1JEUA 3K0VA 4N07A 2B3FA 2ZNTA 4X9TA 2V3UA 3TDJA 4N13A 2XXPA 1AL3A 2DQVA 1Y9UA 2PYYA 1OQHA 1MY4A 1BIYA 2WOKA 2I4BA 3E4RA 4OEUA 2H9BA 2V25A 3UP9A 2XXYA 3DRHA 3VVDA 3PMWA 4WKMA 3V8XB 4BDOA 1NFTA 4G8NA 5I56B 1XC1A 3HV1A 1MXYA 1SW2A 3DP8A 3KBRA 4ZEKA 4WEDA 4EUOA 1HSLA 1D9YA 4GD5A 1DTGA 4NE4A 4IGTA 2QS1A 3EQ1A 4KYEA 3R26A 2OBGA 2IA4A 2ZYKA 3H7MA 1FQFA 4L17A 5DEXA 2X7QA 4BDLA 4EF1A 3FVGA 3MVXA 4AQ4A 3SEXA 3AXFA 3W9VA 4JWOA 5H8NB 5ICTA 3MVYA 1MQJA 4ELPA 1CB6A 3Q25A 4F3BA 3O9PA 2DWAA 3L6GA 5J1DA 2WKYA 5CMKA 1R1NA 3C33A 4ZEDA 2V84A 4QSEA 3I5OA 4HS7A 4XKRA 5I59A 1IITA 1IQ7A 4FJPA 3PD8A 3PPOA 3TTKA 1WDNA 4MBPA 3CR9A 4POXA 5FHMA 4LATA 3RT6B 5CMBA 4EQ7A 3U92A 3OSRA 3JZJA 2VGQA 4G77A 1UTBB 2P0SA 4IO7A 3S9EA 2F78A 1B5JA 4M4GA 3VLUA 4F3PA 1UIUA 1LBBA 3U8QA 3K02A 3QK6A 3QIMA 2XX8A 3IORA 4IO2A 2QJEA 2ZNSA 4YICA 3DM0A 4OFLA 2I58A 1DSNA 3B7DA 1FTOA 2O1LA 4QFOA 1JVXA 3MAMA 1B9JA 1I6AA 1FW0A 3SEVA 3FV2A 3SEWA 3W9WA 2HEUA 3K1NA 5ITPA 2PX1A 1EH3A 1EU8A 4ZEFA 1PC3A 1OVTA 2Q88A 3DRJA 4PP0A 5CMCA 5I84A 3OEMA 3FASA 4NF5A 4Q0CA 2GFEA 2I0CA 1TFAA 4EXKA 1XVXA 3TTNA 2QS3A 2KLFA 1MXXA 2Q8JA 2FA7A 4KPTA 3KN7A 5CBRA 2H99A 3IX1A 3LBSA 3H4ZA 2AL5A 1D3KA 2B3BA 2LAOA 2Y84A 1URDA 3KSXA 4IGRA 5DEXB 4H6DA 2I4CA 4GL0A 1BP5A 3LSLA 1IIWA 2DE2A 4LQ2A 3FXQA 1JQFA 2QRYA 2NVUB 3MP8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HHMA 3CSGA 3T0JA 1M5CA 3DRKA 2O68A 3OELA 3HHFA 2DVZA 2GQ1A 2WYKA 4OQOA 3ISPA 2DWHA 1MQHA 3TTMA 1PB8A 2ZZVA 4YKKA 3T66A 4JVDA 3JV9A 4G61A 5BUUA 1N04A 5I59B 3KSJA 1URSA 3TODA 3V83A 1PBPA 3C32A 1B7ZA 2HCAA 4DLDA 1LAHE 2QVVA 1NV2A 3IJXB 3T9VA 2ESNA 1AWBA 2XXWA 2D5WA 3LVUA 2AYSA 3BKIB 1M5FA 3E13X 3RYBA 1NNPA 1SBPA 3TYHA 2DDKA 3C34A 3QXMA 4P9KA 1KZ8A 3BFUA 3EN3A 3CI8A 2Y7WA 3MJNA 4I40A 3PMXA 1XVYA 4Q30B 4ZZAA 5I57A 2GHBA 1FQDA 1B3FA 5ICQA 4OFJA 4G8HA 1XS5A 4ESWA 2OJTA 1QKAA 1B58A 5CM6A 4PAIA 4MEVA 1H3DA 3FXBA 2GH9A 3PPQA 1SVXB 4NF4A 1LFHA 2O69A 3THIA 2OCUA 3VLVA 2Y7KA 1MM6A 1P1UA 2XHDA 4F2OA 1B5IA 3ZKKA 4PFWA 4IO6A 1G0IA 2GRVA 3TCGA 2Y7IA 2I3WA 3RY3A 3H3GA 4TLLB 3HHGA 4YB5A 4XFEA 2F3BA 4P1EA 3IAZA 1FQAA 3SEYA 1H45A 1JW1A 4N8GA 2DS9A 1XT8A 1MY3A 3B6TA 1ZIUA 1Y4TA 1FBHA 4NF5B 3T93B 4OZ9A 4QFPA 4R73A 3U93A 4P11A 4OANA 4G8MA 2QMWA 4F1YA 2L5VA 5B70A 1LCTA 1NNFA 2VD2A 3OO6A 1NUYA 3RLFE 1FPJA 1IMFA 3VVFA 4GWWA 3RPLA 4PF6A 1XI6A 4FATA 5CMMA 4GL8A 2F7CA 4JWXA 4LUBA 5ESYA 2XX7A 5F24A 1INPA 3OO9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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