5J41A

Glutathione s-transferase bound with hydrolyzed piperlongumine
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
209
structure length
209
Chain Sequence
PPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glutathione S-transferase P
publication title Structural and Biochemical Analyses Reveal the Mechanism of Glutathione S-Transferase Pi 1 Inhibition by the Anti-cancer Compound Piperlongumine.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 209
sequence length 209
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2016-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5j41A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j41A01
3LYPA 1JFUA 1YEPA 2HZFA 2VLTA 1U3AA 2VL2C 5E59A 1VF3A 3S9FA 1XWGA 3UAPA 3Q19A 1X9SB 3F4SA 1K3OA 4F0BA 1SJIA 3Q6OA 1J08A 3O76A 4WF5A 2DLXA 3QAGA 1OAZA 2WZ9A 5HFKA 4IN0A 2WCIA 1W4VA 1NW2A 5H5RA 5ECSA 5EL8A 2KUCA 1FO5A 5IMZA 2E2GA 4TVEA 2PGTA 4N0ZA 4OCFA 2PMTA 1BJXA 2FD3A 1YF1A 4NHZA 2B5EA 1SJ6A 2TRCP 4GSNA 2H75A 3GX0A 3GURA 3A2VA 3LXZA 1XCCA 1ZZYA 3P7XA 1VF2A 4MK3A 3FHKA 3FW2A 1RW1A 1RQMA 1QFNA 5ECPB 4PXOA 2X8CA 3M3MA 1R26A 4KGIA 2VLVA 2P5QA 4KDXA 8GSSA 1I5GA 4HJMA 4RUVA 2H73A 4KDUA 4ZL9A 2CQ9A 3FZ9A 4IP1A 3RPPA 3TKRA 2IIYA 1XPVA 4N11A 3SWLA 4PURA 2HZEB 3KMOA 1NM3A 2ON7A 2X64A 1TK0B 1PQNA 3A3TA 2L4CA 3GV1A 2YANA 5ECNB 3TJGA 5ECHB 4IELA 1ZGNA 1GH2A 1Y25A 1URMA 1H75A 3W8SA 1X0RA 4L5OA 5B6NA 4EO3A 4HI7A 1Z7PA 3M9KA 2VO4A 3KTLA 4MA9A 3F6FA 4GTUA 1OE7A 1SYXA 3VI7A 2H1DA 2FHEA 2PU9C 4PUAA 3DEXA 5CNWA 2LEGA 4KX4A 1MDIA 3I6AA 4F03A 2H0GA 4HJ2A 3DGQA 2F3MA 1XVWA 1O8XA 3C7MA 3GTUB 4GQFA 1UC7A 4I97A 2J9HA 2IFQA 4PNGA 2YCDA 5ECQB 2QSIA 3BOAA 4USSA 1WE0A 3BJ5A 2P0GA 5G5FA 1HD2A 5GZZB 2GGTA 1YEXA 3HJPA 2CZ3A 2NBSA 4BVYA 2LV3A 2GQMA 5C04A 2KP1A 1HNAA 4OMVA 4TRXA 3KEBA 4K0NA 2VOCA 2R37A 1K0OA 3ZTLA 6GSXA 2XHFA 3LYKA 2L4QA 1MD3A 3HA9A 3FZ5A 5HFIA 5AGYA 2V41A 1ML6A 2HNLA 3VWWA 3LEFA 1GL8A 1XWKA 1CQGA 2YJHA 4K7IA 3CTFA 5IMVA 5HR1A 2V6KA 3F4TA 4WETA 5DCHA 3EVIA 2KOKA 4XS1A 5DBQA 4EDZA 4ZB6A 1A2MA 1SU9A 4EDYA 2MMNA 2CZ2A 3CMIA 1SL1B 2CAQA 3KZQA 4GRFA 2HQTA 3UEMA 1QUWA 1BYEA 1TRVA 2D2ZA 2FA8A 4MZBA 5IO2A 3R3EA 3M8NA 3PGTA 3KMNA 2E7PA 1WWJA 2NVLA 4I8BA 5KN0A 3IK9A 1G7EA 3IPZA 1TK8B 5B8BA 1OC8A 5HQPA 3FR9A 1VF4A 2OACA 2VLUA 3RPNA 4DEJA 4XHMA 1ERWA 3QD9A 3IAM2 2VCWA 3DVXA 1AW9A 2GQKA 1DBYA 1GWCA 3ERWA 3GL5A 1HNCA 2DJKA 1QK8A 3H1NA 5IQYA 1ST9A 6GSVA 5JWRB 3EU3A 3ZREA 3L9VA 2TRXA 2VCQA 3FZ4A 2YWOA 4POLA 3GFKA 3TKSA 1T4ZA 1SKSB 5AISA 2H71A 3MNGA 4MLYA 6GSSA 2YZHA 1F9MA 1PL2A 4GF0A 3GKNA 2RUFA 3ME7A 3M0FA 3US3A 3M9JA 4TXOA 4F9ZA 1OC9A 1ABAA 1AC1A 1IYHA 1O81A 3CSHA 4Z7XA 9GSSA 5GAPD 1GSDA 3HVXA 3WGDA 4JR6A 2LSTA 2VL9A 5EVOA 4I5QA 2ZCTA 3EC3A 4EC0A 5ID2B 3QAWA 2DSAA 1OYJA 2GSRA 3IRAA 2VCZA 2DMMA 3D21A 2EIOA 2H0HA 2VUPA 5ELAA 4NWYA 3TKQA 3F8UA 4TOPA 1TW9A 1PMTA 4ECIA 1N8JA 3QR6A 7GSSA 5GSSA 4J2FA 3C1RA 4QQ7A 5EPFA 2OADA 2RM6A 1GTUA 2LRTA 2NPBA 3IC8A 1JHBA 1LBKA 2I81A 4HU7A 1E6BA 1B4PA 1K0DA 4OFMA 2A2RA 2NDOA 3ME8A 4MJCA 1HYUA 4QL7A 2GLRA 1TTZA 3H79A 2C0FA 5FWGA 2MMZA 4EKZA 3KP9A 3H8QA 5CO3A 1SENA 5DALA 4RI6A 4XRDA 2YWNA 3HZ8A 5EY6A 3MDKA 1X5EA 3G9BA 1GTBA 4OD7A 5IPHA 3EYTA 4K7NA 2B6MA 5DJLA 3I69A 2F8FA 5CREA 2B1KA 1G7OA 2GQLA 1A0RP 1SJZA 3LWAA 3W6GA 4TR1A 2M72A 2JSYA 1QGVA 1K0NA 1K0AA 1U87A 1WIKA 2WULA 2PVQA 3KXOA 4TR4A 2XC2A 20GSA 3R2QA 1SK1A 1SL0B 5CP1A 1BAYA 1JZDA 3KGKA 1UVZA 4IHUA 1ZMAA 16GSA 5JWQB 4AJ6A 1ZYQB 2DBCA 3OR5A 2XBIA 3HYPA 2UZ8A 3L4NA 4V1Ag 3GHAA 1O7UA 4EVMA 5H5QA 3MAKA 2AJQB 3HVSA 4ILFA 4DSSB 1AXDA 2C3TA 3TRPA 1Q98A 2I1UA 1EEJA 3ZIJA 4ACSA 2J23A 3G7YA 2C80A 5D9XA 2KHPA 4MDCA 4MF7A 3DRNA 1A8LA 3ZZXA 3ZMKA 1WMJA 3A2XA 1K0BA 4FYUA 4MZCA 4F0CA 1PX7A 2HSMB 1ZCPA 4ECBA 4L5LA 2YP6A 3C8EA 5IMDA 1QQ2A 3KIJA 4KE3A 4ML6A 4MPGA 1R4WA 2OKAA 1VGLA 3TJKA 4ZB8A 1DE1A 3GMFA 3UVTA 3GN3A 5GSTA 4POKA 1TOFA 3VWXA 3D22A 1TRSA 2IMEA 3IA1A 2OE0A 4LMVA 3LGCA 5E4WA 3O3TA 3FR6A 1SD8A 1GSFA 3TRXA 3GUSA 1NHOA 2FWEA 3AY8A 4PNFA 1TRWA 4GSTA 4MH2A 2H6YA 2HZEA 3CXGA 4G9HA 4AJ7A 4JR4A 1U3IA 1XW5A 2P5RA 2R4VA 1PKWA 3WT1A 2LRNA 3A2WA 1X9WB 1XOAA 1JLWA 5ECOB 3GL3A 1U88A 2FLSA 3P8WA 1O6JA 2CX4A 2HXKA 1WP0A 4XS6A 1HQOA 3RHBA 10GSA 3N9JA 2GTUA 2RUEA 2B5YA 4N0VA 3GNJA 1SK0A 1EWXA 1EV9A 2H74A 4X43A 2MMOA 1TKDB 4ZXGA 2QKEA 4XCSA 2JL4A 3GTUA 2LS5A 2ZNMA 4F2IA 4K1FA 3PINA 1PKZA 2PPTA 1R5PA 4ECCA 3PR8A 3HKRA 5J9BA 3GKMA 3QOUA 3KCMA 3TKSE 1B8XA 2O89A 4K2DA 2HRKB 1EEMA 3HZ4A 1FVKA 2B7KA 1EZKA 5INYA 1OKTA 2H6XA 4WEYA 1YKCA 2AAWA 1TXXA 4WR4A 3FEUA 2DJ2A 2B7JA 4JE1A 2AB6A 3HHVA 3HD5A 4FO5A 4LA1A 5IO0A 5H5SA 4HQSA 1OE8A 3KM6A 4DSRA 2O8VB 1EV4A 1FHEA 1GP1A 22GSA 4XIHA 1THXA 5AN1A 5C00A 4EF0A 3D4TA 2BMXA 4N30A 5CRDA 2EIQA 1PL1A 5JCGA 3GRXA 3QPMA 1TI3A 4V1Ap 3GKXA 2FY6A 2IFQB 2H70A 3EE2A 5G31A 1T4YA 4HZ4A 18GSA 3D4MA 5KN3A 2R6KA 1PA3A 3D5JA 3UARA 1DE2A 4BVYB 2CAIA 2YOIA 4X1UA 3APQA 1T00A 2E0QA 3IV4A 4MJBA 5KN2A 4MF5A 3FZAA 1YQ1A 4J56E 2L5OA 3TOTA 2LKUA 1K0CA 1XXUA 3ED3A 4BWQA 2GS3A 1LJRA 2VD0A 3CTGA 3IDVA 1J9BA 2BJXA 1B48A 4RQXA 4PQ1A 2Z9SA 4MMMA 1YZXA 1PSQA 4IJIA 4XTSA 1ACVA 3KP8A 1G0TA 3GSTA 4HU9A 2DMLA 4ML1A 5ABRA 4KCAA 5J4UA 1GSSA 5D93A 4OCEA 3TJJA 1T3BA 1WOUA 3ZFBA 3ZRDA 2B5XA 1GSUA 3TB2A 5B8AA 2OA7A 1QXHA 2K8VA 3VWUA 2WS2A 4BL7A 4V2NA 1TRUA 4BVXA 1KEBA 1NSWA 2DIZA 2GSSA 4K0GA 3PPUA 3A5WA 5DAKB 3C71A 3BCKA 2WB9A 1MD4A 2I3YA 4FH8A 3J7Yb 3IAS2 3W8JA 3TCOA 1GSYA 2H72A 3FRCA 1MDKA 1M2DA 1XWAA 4GSSA 5ID2A 4KF9A 2OE1A 2JU5A 1F3BA 3TOUA 3UOMA 2VCTA 4MJEA 3QCPA 2OJLA 1DSBA 1T8EB 1E2YA 1DUGA 1V2AA 4F82A 3E3EA 1FVJA 4V2LA 3HDCA 4HZ2A 1S3AA 4Q5QA 4EUYA 5HR2A 3WT2A 2YPMA 2HRAA 2H66A 1GLQA 1RK4A 4G0LA 3U6VA 2H76A 4TKYA 3HCZA 4G0IA 3EMXA 5A4UA 1X5DA 2K9FA 3HJMA 4PQIA 4TXVA 3LXTA 3F63A 4YQUA 4OFTA 5ECMB 3E9JB 4O7HA 2A2SA 4KCEA 2JADA 2WJUA 3UBLA 4ZL7A 3IXRA 1R5AA 3L78A 3EURA 3BBYA 1JZRA 3DXBA 5B6MA 4TR3A 3ZFLA 1KBNA 2N5FA 5IMAA 3RBTA 2VL2A 1GLPA 4BPYA 1ERTA 2V1MA 4MF6A 3IR4A 2AV4A 3E0UA 4YH2A 3CRUA 2HSHA 4ECJA 2KP2A 4K8MA 2WGRA 1M7TA 2FNOA 1K0MA 2MYGA 3ZIVA 2YWMA 5CYYA 5A4VA 1A24A 5J41A 3QMXA 5ECKB 4WXTA 3IBHA 1GNEA 19GSA 4PX1A 4POBA 1V57A 3RHCA 1XW6A 2CA8A 4ZBBA 2ZUPA 1SK2A 1TI1A 2IJYA 3APOA 1AQVA 2GSQA 2N5BA 5J3RA 5D9VA 4WBRD 2AHEA 3NOFA 4D73B 4HDEA 4FQUA 5CRHA 4IGJA 2AUVA 3F0IA 3GH6A 4IP6A 2C1YA 3C1SA 3LG6A 3KH9A 5CRWA 1GTAA 1WPIA 2HSNB 1J0FA 3G7JA 5LCZA 3LQ7A 3L9UA 5JWOB 1T7PB 3APSA 5KEJA 4JRRA 1SL2B 3GH9A 4XS4A 2G0FA 2XPEA 1Z7RA 1Z9HA 5DQSA 2M46A 4PGTA 1YKAA 3HJOA 4RI7A 1SD9A 4DSSA 5IPGA 1M2AA 2I9HA 3EINA 2C3QA 2E2MA 1TP9A 1A8YA 1XVQA 2FGXA 2XBQA 4RQRA 4G10A 3P90A 2VIMA 3VPTA 2HYXA 1Y6EA 2CVDA 2LJKA 2GT5A 4GQCA 4V2MA 4EL1A 3LFLA 4MABA 1EP8A 4PUFC 2L5LA 2VCXA 4P3YB 3J7Yk 1B4QA 4ULXA 1PD21 4ISDA 4HQZA 1JZOA 5A4WA 3QFBC 1GSEA 1GRXA 4NV5A 1EP7A 3TKSC 4TR1B 1EOHA 1GTIA 1FAAA 5DCGA 1EGRA 2X99A 1O8WA 4H86A 4HS1A 3FKFA 1ZL9A 1V9WA 3LSZA 4KSMA 4NPBA 2HRFA 3P2AA 5AIVA 4AGSA 3IC4A 1PX6A 5CRGA 4NMUA 5HR0A 2K18A 1M9BA 3PH9A 2OBIA 3ZITA 1A0FA 3VWVA 3DWVA 2LRCA 2RM5A 5F07A 1G6WA 2B1LA 3ZVJD 2H1AA 2WDUA 2IN3A 1Z5YE 5DVBA 4KB3A 2MBSA 4KNDA 1U6TA 3DVWA 4MZWA 2EC4A 3WD6A 4L8EA 3TRQA 5COHA 1PGTA 3TJFA 1LU4A 4AJ8A 3TKPA 4IJ3A 4MH3A 3VI5A 1Z3EA 5DQYA 2TIRA 5LNKe 2C8UA 4AF2A 5G1KA 5J5NA 1F6MC 1GSQA 3V1WA 2FA4A 1B9XC 1MTCA 3IE3A 1XIYA 2GZYA 4TR0A 1FG4A 3O6TA 5J9CA 4HUAA 4OO4A 5F05A 4WKWA 2HI7A 1VF1A 4EXJA 3EU4A 2LTKA 1XOBA 2F9SA 2YWIA 1GULA 1ERUA 3LORA 12GSA 1XBSA 1W89A 2YV9A 2C0GA 2FWGA 2QC7A 1JLVA 2YV7A 2VAFA 2QGVA 3CRTA 2R5GA 2O87A 4GXZA 4QL9A 2I4AA 3TGZA 2BTOT 2L6DA 5BMUA 3IHQA 4E8HA 4IW9A 6GSWA 4J57E 3ERFA 1Q4JA 2FUG2 3QFAC 4ZIJA 3D0ZA 4Q5RA 11GSA 3Q74A 3UMAA 3GA4A 1UA5A 1K3LA 2OBKA 6GSUA 1BQ7A 1ZYEA 5D96A 2HRKA 1OKDA 2YNXA 3CSIA 5L71A 3KTBA 2JZTA 4WF4A 1OVNA 2XPDA 4IKHA 2B3SA 4OFNA 4KSOA 4TW5A 1GUKA 6GSYA 2PBJA 5D8IA 2O7KA 2GZPA 4EE0A 3VPQA 4KUNA 6GSTA 1R7HA 2ON5A 2IMKA 4GLTA 1N2AA 5KN1A 2CVKA 5G2ZA 3C73A 3G7IA 5F8BA 1AIUA 4N10A 5IIZA 3M1GA 5F0GA 14GSA 2DIYA 1EOGA 5IM9A 2A4VA 1TU8A 2FCHA 1F2EA 4G19A 1AQWA 3KJYA 2CVBA 3ZLPA 2O85A 2IMIA 5FT3A 1USBA 1UN2A 1M99A 4JBBA 3H4KA 2JZRA 3FYGA 4GCIA 2G2QA 4WR5A 1Z6MA 3FY7A 1PRXA 5DDLA 2GZZA 4O5RA 4KAEA 3UL3A 1CQHA 2PN8A 4KH7A 3BCIA 4ZL8A 4NAXA 2PERA 3I43A 2C0DA 3GSSA 2CX3A 1BG5A 4OO5A 4IBPA 1TU7A 3CSJA 1X5CA 1V58A 3VFIA 4ZBDA 4PQHA 3RDWA 2LJRA 5JCWA 1BX9A 5ELGA 1V40A 4IVFA 1V98A 3GYKA 4BWSA 4L0UA 2C3NA 2HFDA 2RIIA 1XW9A 1YY7A 2MZCA 3MWHA 4DSQA 2OE3A 4YAPA 5A5KA 3UIWA 4ZILA 3NZNA 2C0EA 1C72A 2F51A 4LL1B 1HNBA 2JSZA 5ENUA 4HEA2 3GX8A 3DMLA 4YQVA 2YJ7A 5G1LA 3FK8A 5AIXA 4YQMA 2JACA 5IMCA 4LLRA 5DAKA 3MSZA 5IOWA 3QAVA 5ECIB 3ISOA 3EWLA 2VCVA 3N5OA 4NHWA 3F4RA 2DJJA 4BA7A 1JZWA 2VL3A 4E8EA 5HR3A 2PWJA 2LQQA 5B7CA 4IQ1A 2CT6A 3TDGA 2DC5A 3F3RA 4MJAA 1M9AA 1AQXA 4FYCA 3HY2A 4K9ZA 2DJ1A 1S3CA 2X8HA 4IS0A 3I9V2 1VRSD 4I2TA 2V32A 1GNWA 2PUKC 2L57A 1TDIA 1YF0A 3KD0A 2LQOA 3TJBA 1AUCA 4OWYA 5IOXA 2DJ3A 4NXIA 5D9TA 1FW1A 2WFCA 3F9UA 2HLSA 2RLIA 4JZQA 2KLXA 3H93A 5FHIA 4KDYA 3QDNA 2GT6A 2X8GA 4G0KA 5GAND 1SKWB 5ECRB 1AAZA 4PTSA 2IL3A 2N5AA 3VK9A 1FB6A 2V6OA 3JCML 1YJ6A 4I6XA 3UBKA 1KNGA 3EMPA 2PVOC 2H19A 4BL7B 2YN1A 3UJ1A 4BVXB 3F6DA 4K7OA 5D9WA 3WGXA 2H01A 1K3YA 2MBTA 3TUEA 4JEDA 2WRTA 5G5EA 1A2LA 4K6XA 4NV2A 1F37A 2H8LA 1ZOFA 4YAVA 1X9MB 2F8AA 2H1GA 2FWHA 1BEDA 17GSA 1MDJA 2IMDA 3SBCA 4TXOB 4D73A 4XRAA 1O85A 4ID0A 1OC9B 1GUMA 3CYNA 4HOJA 4FIWA 3IOSA 1XWCA 1EGOA 3DIEA 2MMAA 2VD1A 2LNTA 1ILOA 3DD3A 2H30A 3L0HA 4KA0A 3HXSA 1PN9A 2IPAA 3WGEA 5LD0A 2HSYA 3VURA 5DJMA 3ZYWA 1XWBA 3GKKA 1NHYA 4JU5A 5JCUA 2V2GA 1FOVA 2K8SA 1XFLA 2VM2A 2K6VA 4MPFA 1A2JA 1THOA 2EIRA 5F06A 3KH7A 2HE3A 4TN8A 4CDOA 4IQAA 1GUHA 2JZSA 4POMA 3HVVA 1S3DA 3ZL5A 3F3QA 2CV4A 4I2UA 1M0UA 4G2EA 1IYIA 3IK7A 4KW6A 2L6CA 4DVCA 1SYRA 5G30A 1XZOA 1B9YC 4X0XA 2GDRA 4FYBA 2R3XA 1Z6NA 1TJDA 2HT9A 3U5RE 2GVPA 3NIVA 4GWRA 5D73A 2REMA 5ECLB 3GIXA 1KTEA 13GSA 1A23A 5DALB 2DJ0A 3FR3A 1ERVA 4LL4B 2ALBA 3CBUA 4ZBAA 5HFGA 4WBJA 5IMFA 1O73A 3BD2A 4MCUA 2ES7A 4CW9A 1FB0A 3ZMLA 4Q5NA 1I9DA 4O32A 2H1BA 2HSMA 3DYRA 2HRNA 4L0WA 2P31A 1TK5B 3ZVJA 2LJAA 3D6IA 3ERGA 3Q18A 1WJKA 4ZB9A 1H4OA 4XS4B 4O92A 2FWFA 1MEKA 1F3AA 2YZUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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