5J5TA

Glk co-crystal structure with aminopyrrolopyrimidine inhibitor
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
303
structure length
297
Chain Sequence
SQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLDNGHVKLADFGVSAQITATIAAFIGTPYWMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPSTYHDFDDDDPEPLVAVPHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Germinal-center kinase-like kinase co-crystal structure reveals a swapped activation loop and C-terminal extension.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3
total genus 79
structure length 297
sequence length 303
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5j5tA00
2ZM4A 3CTQA 3LFQA 4FT5A 4IANA 3EZVA 4EHZA 5I9VA 2G2FA 4CTBA 3E62A 4BHNA 3S1HA 3GC7A 4M15A 4PPAA 1CKJA 4FSRA 1JAMA 3BWJA 4EK6A 1GIHA 3IW5A 4OBPA 2C69A 3CE3A 5CT0A 3IW8A 1OKZA 3IDBA 5DFPA 3FXXA 4ZSLA 5TF9A 3E8DA 3FZPA 4I93A 3PSDA 3OBJA 5EOBA 1H1QA 4OTDA 4TWCA 4BTMA 4V0GB 5FM3A 4A9UA 4AT5A 5TO8A 4IDVA 5KBQA 2XK7A 2BIKB 3QTXA 3BEGA 4O2ZA 2V55A 5DWRA 3WOWA 3SXSA 2WMXA 4ZY5A 4U8ZA 1MRVA 5CNOA 4I5PA 2OFVA 4L6QA 3ELJA 3HVCA 3HA8A 3MJ2A 3UC4A 4F08A 1H0VA 5HCZA 2BHEA 3KGAA 5L2TA 5LVMA 2OSCA 2OBJA 2HZ4A 3VJOA 1Q8YA 5E7RA 2YCFA 5KMIA 5ICPA 2BR1A 4X2GA 2W4JA 3MPAA 2V7OA 3TKIA 4BWPA 5FWKK 2OU7A 3C7QA 4I1ZA 2QO7A 3WYXA 5CXZA 4U0IA 4F63A 1J1BA 3PWYA 2X4FA 4C4FA 5BVDA 3AOXA 1RW8A 5AUTA 4GH2A 4E4XA 4I0SA 5C01A 4YZ9A 3JS2A 4FKGA 4QQ5A 1UNGA 3UE4A 3VO3A 4EH8A 5JFSA 5IUIA 4IWQA 4FK3A 4USFA 1REKA 3O0GA 1XH6A 4KIOA 3VUDA 1IA8A 2X8DA 4O0TA 4EH2A 3W8QA 3ZRKA 1UA2A 2XCHA 4YU2A 3QUDA 5I3RA 3F3VA 2EU9A 5DT0A 4BGQA 3PUPA 3MDYA 1ZWSA 4IH8A 3C50A 4Q2AA 4QP6A 4IAFA 4GK2A 1WBWA 5M4UA 3MI9A 4H1MA 3I4BA 3W1FA 3ZBFA 3DK3A 4AT4A 4JOAA 3VUIA 4CCBA 5HLPA 5LVOA 4FEQA 4CV8A 2WQMA 2PVHA 4JBPA 2CGWA 4QMWA 3R8PA 3QC9A 2ZJWA 4CEGA 5J9YA 5HG7A 4PNIA 5M56A 4QRCA 3HUCA 4YJSA 4BKZA 4EH3A 2YM5A 5IPJA 1PY5A 4I23A 4L3PA 1ZYJA 4BBEA 3QTUA 1Q24A 5T3QA 1PKDA 1WBOA 2ZB1A 2GFCA 3UYSA 3VS2A 4D2TA 1L3RE 3BGPA 3BIZA 4DH7A 3VNTA 4XMOA 4IWDA 5EKNA 4JS8A 3I0QA 3RPVA 2OH4A 4YC3A 2IN6A 3GQLA 4S31A 2GQGA 5HHWA 3LPBA 1HOWA 4R3PA 3UP2A 3PE2A 2O3PA 2OXDA 4NH1A 3EJ1A 1FVRA 1ZOHA 3E8NA 4CRLA 1XH5A 2GHGA 3RI1A 3A7HA 5B0XA 3DDQA 4CQGA 3TUBA 4I0TA 4YURA 3BHTA 4C7TA 5HLNA 4RX9A 1DI9A 4YTHA 2VWZA 3DBDA 3SOAA 5IEVA 4MQ2A 3FY2A 3C4FA 4NZWB 4XV2A 3RAIA 4ID7A 4DEBA 5JFVA 3ZO4A 2J9MA 1CM8A 3HGKA 3OG7A 5EFQA 4U81A 2PL0A 5TOZA 3FHRA 5EYDA 3DK6A 4I22A 4C4JA 3TL8A 5HORA 1B38A 2I0YA 4NCTA 2IVVA 4O91A 3SXRA 4D28A 1QPJA 5KHXA 3OHTA 2R3QA 4TNBA 2PZPA 4O96A 4BN1A 2FA2A 4FKUA 4NT4A 3DU8A 3LFCA 4BDHA 3CY3A 3EHAA 4M8TA 3BKBA 5D9HA 1FMOE 5CTPA 4ACMA 4C4GA 3DV3A 4DFZE 5IU2A 2JDSA 2I0EA 2YCSA 4IJ9A 2F49A 2FSMX 4I5HA 3P9JA 2QU6A 4ZY4A 3DNEA 3GCUA 2P2HA 4JQ7A 3VVHA 2OJFE 3VUGA 3FJQE 3MWUA 4G16A 4G6NA 4DH1A 4L00A 2WU6A 3DGKA 2W1CA 4C34A 3GOPA 3PJ2A 3ZLYA 1OVEA 5I9ZA 1P4FA 4JVGA 3NIEA 4FTJA 2WEIA 1QPCA 4OT6A 3TV6A 2RG6A 4C4IA 2VTRA 2IZUA 3PG3A 3NUUA 3WZDA 1KE9A 2XNNA 2PVLA 3CQUA 4EOOA 4APPA 3UYTA 2XK3A 3RMFA 4FTIA 4U40A 2I1MA 4E6AA 2IW9A 2YA9A 4BBFA 5DR2A 2VX0A 3UP7A 2YM8A 5IEXA 3F5PA 3MIYA 4NM3A 4XOYA 2W5HA 1LP4A 4AG8A 2PZRA 1KE7A 2HW7A 4FYOA 5AADA 2BTSA 3HV7A 5HTCA 3DOGA 3PSCA 5M4FA 4YJRA 2X9FA 5CU4A 5C8MA 3LFAA 2A19B 4ENXA 4F6UA 4UN0C 5HLWA 3GBZA 4JAIA 1H24A 4JIAA 3G90X 2W06A 3U6HA 3KRWA 2YLFA 3MPTA 5AP6A 2W1EA 4ZTSA 3TUDA 4ASDA 1ZZ2A 1PJKA 4GFOA 2WGJA 4EC9A 5DRBA 2E9PA 2BIYA 3D15A 3D4QA 3N51A 4PF4A 3ZSIA 5CZHA 2ZM3A 2ESMA 3ORNA 3PLSA 3IKAA 1HCLA 2I0VA 1PHKA 3B2TA 3Q6WA 4L68A 3PWDA 5ETIA 3OWJA 5EYMA 4RVKA 5HO6A 4CFNA 4DG2E 4XBUA 4FV2A 2PK9A 2UZNA 3QQJA 5D41A 1JKKA 3LFFA 4MD7E 5BVEA 5JGDA 4QTBA 2VTTA 2YHVA 4LGHA 4LYNA 4RC3A 3TCPA 4B99A 4YZNA 4EONA 2WHBA 1I44A 4TYIA 1P2AA 4EHVA 4KRCA 1H08A 2C5YA 2X6DA 3EFWA 4RFZA 4FKIA 4LUDA 5LARA 4R5SA 3RCDA 3W2RA 5I9WA 1Q99A 5DT3A 3OBGA 1H26A 4MCVA 4D58A 2WKMA 4AA0A 4GIHA 4MH7A 3DCVA 4I6FA 3RPOA 5IF1A 3C4CA 4ALVA 2QOKA 2Y0AA 3F88A 5AUWA 4DH3A 1O6YA 4HGTA 2R3RA 3NYXA 4RJ8A 3GU5A 4QMTA 4H58A 1OL7A 1Y8YA 3IOKA 3V5WA 1YOLA 1QPDA 4FV0A 2CPKE 1G3NA 3DLZA 5H8GA 3CJFA 1I09A 1TVOA 3CD8A 3K5VA 3L1SA 3P7BA 4CFMA 5AAEA 3AC3A 5CU6A 5E8ZA 3AC5A 2NP8A 2FYSA 2WOUA 5JGAA 3R2YA 4FOCA 4RC4A 5KUPA 4C59A 4AUAA 4FT7A 4FSZA 4FIIA 3I5NA 4F7JA 2QR7A 3VAPA 1OI9A 2OFUA 4QPAA 3BPRA 4M7IA 4MBIA 3ZU7A 5BUJA 2J0KA 3MVJA 4B7TA 2DUVA 4CMTA 3H30A 4F9BA 5IMXA 5J87A 4ZJIA 4M13A 1WVWA 4FL2A 3ETAA 5A6NA 5A4LA 2C5OA 3L8VA 3VRYA 4ALUA 4PX6A 3EOCA 3FMMA 3DAJA 3ZLWA 5JH6A 4F7SA 3FXWA 3HKOA 2Z7LA 3BHHA 4IZ7A 4YTCA 5AIRA 4C38A 3MW1A 4D55A 5IA0A 3SQQA 2WMAA 3HYHA 3SD0A 4RGJA 4RG0A 4CSVA 2W1GA 3RWPA 3FSKA 3SLSA 4C3RA 3UZTA 5CSPA 2CGUA 5FDXA 2W9FB 5EDQA 3EYHA 5M4CA 5I4NA 4YC6A 3IGOA 3JUHA 2UW4A 3DJ5A 5CWZA 3V8SA 4OTIA 3TNIA 4K33A 1ZYLA 3QTSA 3KY2A 1VJYA 2YCRA 1U5RA 3FMNA 1JSUA 4P7EA 2R3OA 2WTWA 3OEZA 3UOJA 2ZDTA 1YWRA 2PZYA 3GU7A 2RIOA 3TJCA 1UKHA 4M0ZA 5CSXA 5E1EA 2W1IA 3T3UA 3EKNA 5JK3A 1H1WA 1OECA 1XKKA 2ETMA 3K2LA 1UWHA 3PP1A 4GV1A 2JITA 2EXCX 2YFXA 3QL8A 4GJ3A 4OLIA 3KC3A 2WD1A 3LFSA 4TRLA 5ETAA 5AV2A 3FMLA 3QTZA 4KSPA 3WI6A 2PE0A 4BYIA 2VZ6A 5CI7A 5JQ8A 2JBPA 4KB8A 2OW3A 1UU3A 1E1VA 1T45A 4LRJA 4EH4A 3F3UA 4FT3A 3ZC5A 5C8NA 1H0WA 3KXXA 4B8LA 2DYLA 3GU4A 4GVAA 3KMWA 4O1OA 5HE3A 3EH9A 2UW5A 3FXZA 4BB4A 4BCGA 4WHZA 3GT8A 3CTJA 1RE8A 2A1AB 1GJOA 4GG7A 4CT1A 4D9TA 3CTHA 4ZTRA 4E4MA 3CD3A 4HGSA 4RVTA 4AXAA 4J1RA 5HG9A 4FL3A 4KBKA 4NU1A 5BVWA 2PMNX 4QMNA 5BPYA 4RWJA 5EHYA 2OXXA 3K3JA 4OR5A 3WF5A 1YI6A 4AW1A 4DGNA 4BDAA 2E9VA 3AG9A 5ANOA 4IJPA 1XH9A 4BIDA 2C6IA 4RJ3A 3UBDA 2DWBA 2P0CA 2W5BA 3P86A 5JSMA 4EORA 4HVIA 2X7GA 5L4QA 4CFFA 5DR6A 3TWJA 1ZZLA 4ASZA 4F4PA 4JRVA 4HNFA 5TKDA 4RQVA 4R8QA 2BRHA 4YTIA 2JGZA 1PXIA 3UOKA 2JKQA 4PDSA 4XS2A 2VTQA 3Q5IA 4YZCA 4BCMA 4RLKA 5AA8A 5J1WA 3C4WA 1PMEA 3BYUA 2EVAA 2F7EE 2JFMA 4MAOA 1SNXA 3L8PA 4I92A 3R1SA 2Z8CA 5HE0A 4WG3A 5CLPA 2GSFA 3D83A 1M17A 3OCSA 3QLFA 1M2PA 3JVRA 4L45A 2BHHA 4F7LA 3G9NA 5C1QB 2W99B 5HICA 4DGLC 4FSNA 4FT9A 3NW5A 4HGEA 5I9YA 3A62A 1YHVA 1TQPA 1ZAOA 3I6UA 5KBRA 2PMLX 4CZTA 5EM6A 4K0YA 2Y4IC 2C6OA 1PMUA 2AYPA 4BDBA 2WTDA 3GC8A 3O50A 4L46A 4MTAA 4TW9A 3K5UA 4N6YA 4ZOGA 2RF9A 4Q9ZA 3FYKX 4EHGA 4RWKA 3OCGA 4NTTA 5FEQA 1KV1A 5ANJA 5DHJA 3ZLSA 4EL9A 1O6KA 2H9VA 3MVMA 3NGAA 4EYJA 2PE2A 1R0PA 3THBA 5FD2A 4ALWA 3Q4UA 1GIIA 4E8AA 3KN6A 5C26A 3ENMA 5LVPA 4ZP5A 4GVJA 2JDRA 3BHYA 5A9UA 4AF3A 2ITYA 4AW5A 2R3FA 2OIDA 3QRTA 4TXCA 1R39A 2WEVA 3GFEA 4I4EA 4O0VA 4OTHA 4IE9A 5C03A 2QO9A 3VBWA 2FVDA 4B6LA 3FZ1A 3MFSA 3QRJA 2FB8A 4UZHA 1H4LA 2HOGA 3DTCA 1YXSA 3OS3A 3WF8A 3PXZA 2YJRA 2ZV9A 2V22A 5FXSA 3UG1A 3BI6A 4G3CA 3R7GA 2QOIA 3SA0A 3RCJA 4KKGA 4GK4A 3QRUA 3R9HA 3ULIA 4H3PA 3VJNA 4D4RA 4KKHA 4FNYA 2UV2A 3ERKA 4P2KA 1FPUA 2KULA 4YZDA 3CPBA 5DLSA 4NJDA 2RFSA 4PMMA 2JDVA 4WKQA 3EFKA 3C5UA 4BGGA 5FEEA 2VWBA 3C1XA 2J50A 3LJ1A 4GL9A 4IDTA 4JIKA 3V8WA 3KL8A 2XS0A 4QT1A 3LXLA 3NEWA 5HIBA 5K9IA 4JDIA 3PVWA 1O6LA 3A60A 2ITTA 4HOKA 1BKXA 4FV9A 3UG2A 4K1BA 3KVWA 4QMUA 4E93A 4OAUC 2PVMA 4RLLA 1BMKA 2H8HA 3ALNA 3R63A 4YZBA 3MFRA 4O6LA 5BMMA 4AFJA 5BQ0A 4ZK5A 3R8ZA 4D5KA 4TPTA 4D2WA 3UC3A 2XEYA 3QHWA 5J7BA 4ONAA 4U9AA 3RZFA 1YDSE 3ZZEA 2CCIA 5IH5A 5F20A 2XM8A 3QXPA 4QMMA 4IAZA 5HQ0A 3ORTA 3FV8A 3H4JA 4Y5HA 2XIYA 1Y57A 4WT6A 4Q5EA 3UTOA 3FPQA 2YDJA 3KK9A 4BFMA 1VZOA 4ANQA 1Q5KA 4X7QA 2G9XA 3ORZA 4FVPA 4JBQA 4QYGA 2R3PA 3DFCB 4ZJJA 3D5XA 5AUZA 5HVYA 3PPJA 1MQ4A 3L9LA 2R7BA 3KXMA 4RQKA 3A4PA 3MA3A 3MH1A 4F9CA 3RAWA 4IM0A 2C0OA 1FOTA 4LGDA 4YBJA 1J1CA 4XP2A 3IW7A 3QQKA 2CGXA 4IACA 3TV7A 3Q9XA 4F64A 5H2UA 3MY5A 4G1WA 4FK6A 4TL0A 4QMQA 2VO3A 5EM7A 5AM7A 3EQRA 3MA6A 5D10A 4BKJA 3PG1A 4NM7A 2OJIA 3R30A 4DFXE 4I41A 5BUEA 2YIWA 3FL4A 3C4EA 2J7TA 4XG3A 1XHAA 3QQLA 3MH3A 4FNXA 2JIVA 2JFLA 4F9WA 3DB8A 3PVGA 3QQFA 3CKXA 4EH6A 2GHMA 3F7ZA 5AV3A 3RPRA 4NKAA 4Y5QA 3MFUA 2ZOQA 2Z7RA 3OVVA 4LRMA 5E8TA 1QMZA 4EK4A 2IVUA 2IJMA 2PMIA 3QZHA 2FH9A 2PHKA 3WZKA 3ZRMA 4ERWA 3HRCA 4HCVA 3G51A 2QOLA 3IOPA 1OPKA 4OUCA 4WBOA 4Y72A 1KOBA 2HENA 5KO1A 2WQEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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