5JEIA

Crystal structure of the glua2 lbd in complex with fw
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIACFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Mechanism of partial agonism in AMPA-type glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-04-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jeiA02
2DXYA 5CM6A 4H6DA 3G3JA 2DYXA 3PPNA 1POTA 4ELQA 1QUKA 5A5XA 2DXRA 3C34A 3A09A 3RT6B 4DCXA 4AB6A 4TQUQ 1JW5A 4IO4A 4QFNA 4Z7EA 1A7LA 3VLWA 3E4RA 5CMKA 3IB2A 2FA7A 2HFBA 2F78A 5F7VA 3QSLA 3HSTA 1R9LA 1DOTA 1NNPA 3SEUA 2ANJA 3CI8A 4H5FA 2DS9A 4GRKA 1LSTA 5H8SA 3CR9A 4BDQA 2GRVA 3P7IA 2XXYA 3RN8A 2NUVA 4XIGQ 1UTHB 3L6GA 4NWDA 4F18A 2G93A 2CMOA 3MPLA 1B58A 2V3TA 2DOJA 4LZ7A 3MP6A 3V5AA 1B7UA 4MBPA 1B51A 3PV0E 1Y4CA 4QRZA 3VXBA 3FVKA 3K6XA 3K2DA 4C1TA 4I9DA 4OEVA 1DPPA 1N7WA 4GIZA 1SD3A 1URGA 3T93B 5L9OA 3KSJA 3TTNA 1Y9UA 4FE8A 4TLMB 1LFHA 1RYXA 2YPNA 1B1XA 3B6TA 1HSJA 1UTBB 3B7DA 3MVXA 2ZYNA 3HHFA 3KJ7A 2P2AA 1VSOA 4RK9A 1OVTA 2PYYA 4BLAA 2ZYMA 1P99A 2UVJA 3CFLA 3TCGA 1R1NA 2GHBA 2UVGA 3VV5A 4G8HA 4R2FA 1PBQA 3L6HA 1Z7NE 3T96B 2X26A 5CC2A 1N3WA 4OVJA 4F19A 4YB6A 1MPDA 3MVYA 3RT8A 1ZBMA 1PDAA 3CFXA 4LQ2A 4JSOA 2R9JA 4TLLB 2D3IA 3JV9A 5EHSA 1MM6A 2DSFA 1MH3A 4YMAA 4MFIA 5DVJA 2H99A 3OO9A 2ESNA 4P0GA 1L5TA 4JBZA 3PPPA 1R9QA 4O3CA 5I57A 4NF8A 3LSWA 4EF2A 2H9BA 4R9GA 3RQTA 4EUOA 1FQDA 3HCQA 5ITOA 2I4CA 1LAHE 4NWCA 5IAIA 1P1NA 2O1MA 5H8FA 4EXKA 2V93A 2HZKA 5B70A 3LSFB 1ZLQA 1SQYA 3LR1A 4ECFA 3UIFA 1A55A 1IXGA 4F2OA 3USDA 2RC8A 2REJA 3H6TA 3MW0A 4I1DA 1LFGA 3Q25A 3C4MA 2V3UA 3CG1A 4C1UA 2FYIA 2RC9A 4KFQA 4MH5A 4YZZA 3R26A 3BBRA 1TXFA 3EQ1A 1TFAA 1FQEA 1MY3A 4OFJA 3PD9A 4FEDA 2HXWA 2O6AA 2NOOA 3HV1A 3LUYA 3O6GA 4KR5A 5CI5A 3U8QA 4PQJA 1R6ZA 1B5IA 5TP9B 2A5TB 3TZAA 3O6HA 1N0TA 5DVFA 4IY5A 2ONSA 3WAEA 4YU0A 3QK6A 4OEUA 1Q1KA 3FXQA 2PT1A 1OQGA 4ND9A 2RKMA 3UN6A 4F3BA 3IK6B 4ELPA 3DLNA 2F34A 2D5WA 3TTLA 1DPEA 2PBWA 4F22A 3U1OA 4GOTA 3M3FA 1FCKA 2Y7WA 4DLDA 3H6VA 2I58A 5I58B 1B4HA 2XXWA 1RKMA 4NF4A 4QFKA 5EHMA 1PB7A 1SDXA 3G3IA 3W15C 3E9XA 1M5FA 1I6BA 4GFRA 3TQWA 4H5GA 1ZJLA 2PVUA 3PUXE 1AOVA 4P11A 4JB7A 4N07A 1EZ9A 4BDLA 4O3AA 3PUWE 4NTLA 5DVIA 4F3SA 3ZS6A 3S9EA 2RCAA 3K01A 1N84A 5AA4B 3S9MC 4R9FA 5I2NB 3FD3A 4GLIA 5I84A 2XXVA 1UTBA 2M8CA 3ILTB 3MUQA 1LBBA 1MY1A 3PUZE 4X1BA 4DZ1A 4ONYA 3C31A 4KYSA 3V8XB 1Y3PA 3UK4A 3IOVA 4F39A 4XKRA 4H0WA 1UIUA 4LQ5A 1BP5A 4QSDA 1NKXA 3QUJA 2QS4A 2XXTA 3VVDA 1B5HA 4P0IA 3KFMA 4G68B 1QJMA 2Q8JA 1MRPA 4ELOA 2Z22A 1P1QA 3D4CA 2YLNA 4PFYA 3T22A 2I3VA 2QS1A 2O51A 3KN8A 4IGRA 2VD3A 1JW4A 3TDJA 4HS7A 3UP9A 1LAFE 2XX8A 3PPOA 2O7IA 2VOZA 5B7DA 3KSXA 1Y3NA 2OK2A 3H3GA 4YKIA 3DM0A 2Z8DA 3KGCA 3FASA 4F1VA 2Z8FA 4NEDA 5ISUA 3H06B 2O69A 5I56B 2ZMBA 4H8IA 4U22A 3O9PA 4MLQA 5CRYA 4TOZA 1FQCA 2DWHA 1IZ1A 4OESA 2LAOA 1XT8A 3O29A 2IA4A 3E13X 3IJOB 1MXZA 1PC3A 1MDP1 5I59B 5L8DA 5JK4A 1B5JA 3G3FA 3B6WA 2H25A 1EU8A 1N3XA 2WKYA 3O6IA 4KYEA 4ESWA 2ZNSA 5HM4B 4Q30B 1MQDA 2F5XA 1PEBA 1ELJA 5AA3A 3IL1B 1MY4A 4G4PA 1ZKBA 4IY6A 3QAXA 4YB5A 3TEPA 1URSA 3RGYA 5TPAA 1LCFA 2O84X 3N94A 5TP9A 4PFTA 2ZYKA 2A5TA 1VFEA 2OZZA 4G68C 4RJZA 5H8HB 3Q26A 1MPCA 2DE4A 1LB9A 4BDOA 3VDFA 2OJTA 1GTKA 3KN7A 2Q2CA 2AL5A 2DVZA 3VE1B 4YB7A 2X7QA 3ILUB 4WKMA 4JDFA 1IQ7A 4KPTA 3RNNA 4OWDA 5I2KB 2XXXA 4WXJA 3N26A 4GL8A 3IB0A 1OIBA 4ESXA 4ZEKA 1D9YA 3VVEA 3K6WA 4WEDA 4ZEFA 5I58A 1IUDA 3QXMA 3RY3A 3VVFA 1POY1 3W9VA 3MZ9A 4EQ9A 4GXSB 4YMBA 1MY0A 2RF1A 1URDA 1XVYA 2H98A 1GR2A 5EYFA 3ZKLA 1GGGA 1DTGA 2Y7PA 4OZ9A 5J1DA 3FJ7A 1QKBA 2XXHA 1SI0A 3M8UA 3W9WA 5AA4A 3GBBA 3GXAA 5I2NA 3CRBA 2R6GE 4OMBA 4HTGA 1S50A 2B3FA 4XKPA 5ICQA 3U94A 1OQHA 2I49A 3QIMA 1I6QA 4M1VA 1H44A 1B6HA 4FAJA 1ANFA 2AYSA 2RINA 3O2AA 1MQGA 1OLAA 3KZGA 3EHUA 4ZE8A 1Y4TA 3OEKA 2V25A 5HBCA 3O28A 1JVXA 1N76A 4NF6B 2REGA 1B52A 1O63A 3EPEA 5KZTA 3SDFA 4ZEDA 1JNFA 1VR5A 2OWTA 1MDQA 3PMVA 2H4IA 2F6GA 1OMPA 3IAZA 3H03A 2Y7IA 4IB2A 5JTYA 4LA9A 3D4GA 4LUBA 4K3FA 5IKBA 2DWIA 1LAXA 4O3BA 1Y1ZA 2RCBA 3LSXA 2AIXA 3MP8A 1PB9A 2Z23A 3S2VA 4Z0IA 4ISUA 1B7HA 2DWJA 1TT1A 4R6HA 3GLBA 3RUMA 3G3KA 4RNSA 2THIA 4H1XA 5KDTB 2I0CA 1FTOA 3OD7A 1B2HA 3FXRA 2PT2A 3MWBA 5I56A 2HZLA 4U1OA 1M5DA 3CSBA 3RPWA 3K1NA 4ZDMA 4U21A 3C36A 3M3LA 5I59A 1JEUA 2OCUA 2UYEA 2Y84A 1CB6A 2F97A 2OWSA 1VE4A 3C9HA 1MXVA 2VGQA 1AMFA 1H45A 3MP1A 3TCFA 5CBSA 2QL3A 5A5XB 4ZS9A 2XXRA 3IO6A 1ATGA 3MVWA 1BTJA 1M5BA 3MJNA 4ZZAA 1I69A 1WVJA 3SESA 3G7WA 4PE5B 2Q88A 1IXHA 2F36A 2G29A 3PU5A 3B6QA 5AA2D 2OBGA 1LBCA 3H6UA 1SW4A 1MPBA 2I0BA 1VFDA 3EF7A 1F9BA 3HO7A 1AH5A 1B3HA 3IB1A 1JW1A 1S9TA 1ZMGA 3F11A 2AL4A 1Y20A 4X9TA 5H8HA 3OSRA 3KEIA 3K1MA 4Q8RA 1ZU0A 3MVZA 3S9NC 4YKJA 3OENA 1FQBA 3OELA 5FTHA 1JETA 3RTWB 4LP2B 2VP1A 3DP6A 1IITA 1BKAA 1UTHA 2XXIA 1KWHA 3FJGA 3VLVA 3TCHA 2ZNTA 2GH9A 4JWYA 5HPQA 4GQOA 4G77A 1NFTA 3M3KA 4YICA 2NWJA 3ZKKA 3IR1A 4BDNA 1B0LA 4H65A 4OENA 3VFJA 4NE4A 3OEMA 1WODA 1I6AA 3O66A 1SW5A 4U4XA 4OHNA 3FZVA 1II5A 4GVOA 1HSEA 1YTVA 4U23A 2X7PA 1NL5A 4RPNA 4FATA 3S4UA 3T66A 3SERA 4F3GA 1Q35A 3OMBA 1XC1A 1QKAA 4R75A 1SW1A 5CMMA 3N5LA 1MM7A 1LAGE 1NH8A 3IO4A 3LBSA 2E1SA 5ELVA 2QMXA 3RTFB 3OXNA 4YKKA 3JYRA 3MQ9A 4OQOA 2R71A 3MZ1A 3TTKA 2UXAA 3KOSA 1SVXB 3CSGA 1MH4A 1Z7ME 3V89B 4U4SA 1XS5A 3UA8A 1SI1A 1YAEA 1SW2A 1M5EA 2PMSA 3BKIB 2RC7A 5BWJA 2P1SA 4OTEA 3PUYE 4NF6A 5H8NB 3S9LC 3A3CA 1IXIA 2NVUB 2XX9A 4KCDA 2DVCA 2Z8EA 3MAMA 4YKPA 2XXPA 3SEVA 3ONMA 3GZGA 3THIA 1SBPA 4XTCQ 4U2RA 4DXCA 2ONRA 3EHTA 3I5OA 1EZOA 3H4ZA 2O1LA 4IO7A 3KJTA 1MQIA 5FTIA 1JVYA 5FHOA 1B32A 3N6UA 4L17A 5L9MA 3FV1A 4KCCA 1MQJA 4QFPA 4IO5A 2HAUA 3PD8A 4DDDA 4LONB 4R74A 2IEEA 3FIRA 3KG2A 2F6PA 1A99A 1IXCA 3TMGA 5AA2B 3A3UA 3GBAA 4UA8A 4OXVA 2V3QA 1LB8A 4N6PA 3MPKA 1H43A 3IOTA 3VXCA 1DTZA 3ECRA 1Y1MA 3IOWA 1B3LA 1P1OA 2VD2A 3CFZA 2QPQA 4EQ7A 3SKPA 1AL3A 4YAHX 2D21A 1QVSA 3H6WA 3G3GA 4GWOA 2P0SA 1QUJA 4F29A 3TKDA 5LOMA 1USYE 1A54A 2F7AA 4I62A 1LCTA 4OFLA 1IEJA 2Y7RA 2F7CA 1XOCA 4LVQA 3SEWA 2W7YA 3K00A 5CBRA 4DXUA 2DP8A 3IORA 5L9SA 4BDRA 3TFLA 4LZ5A 3H7MA 1GV8A 4JWXA 4R6KA 3PMXA 1MS7A 4NF4B 1WDNA 4G8NA 1MXYA 4QHQA 2HEUA 4R73A 2DE3A 5ITPA 5H8QB 4ZZEA 4QSCA 3BFTA 4RYAA 1US4A 3I3VA 4H67A 1FW0A 1B40A 5DTBA 1CE2A 3OOAA 3T9HB 4MF3A 4U1ZA 5KCJB 2H5YA 3PPQA 4XKNA 2UYFA 4E0XA 2I6EA 3I6VA 4F2QA 3KBRA 3DP4A 3CVGA 1FTLA 4ZEIA 1PB8A 3T9VA 2QRYA 3UGWA 2DE2A 5TU0A 3LSLA 1IIWA 3FGSA 1JEVA 2ZXTA 3T9UA 4R6YA 4WEPA 5DYHA 4OFOA 4XKQA 1NH7A 2QMWA 2ALUA 3O97A 2Q9TA 4DXBA 4GF8A 1EZPA 3KOTA 4GD5A 1ZTYA 1FTJA 3PUVE 2XD3A 4ZECA 2CZLA 1B3EA 2HQ0A 2ABHA 5DT6A 1A8FA 3TUSA 1Y3QA 3SETA 4EF1A 2A5SA 4FJPA 2F35A 4XXUA 4ZEBA 2DQVA 1FTMA 5F1QA 1FQAA 4FORA 4G68A 1B3FA 3HPIA 3LC8A 1LGBC 1XVXA 4LZ8A 3TYHA 3BFUA 1P1WA 4Q5TA 3U92A 2QSXA 3C35A 4RK2A 3U72A 5CMBA 1N7XA 4IO3A 3ODBA 4EQBA 1QULA 3SEXA 4M4GA 1FQFA 3K6UA 1SYIA 4Q0CA 5H8NA 1USYH 2OLBA 4HW8A 4QFLA 2NXOA 4F1UA 3DELB 4HCYA 1A40A 4FEBA 1NNKA 3HN0A 4F31B 1J1NA 2O7UA 3Q27A 5JEIA 1OVBA 2XX7A 2BJJX 4G8MA 5AA1A 3FVOA 4F1YA 5DEXB 4DCYA 1SYHA 4JWOA 3EN3A 1NMUA 4OYVA 4DE8A 4NF5B 4X48A 1TWYA 3EHSA 4F3PA 1US5A 2XXQA 1P1UA 1DSNA 3UORA 2B3BA 1D4NA 2PX1A 1LLSA 3MBPA 5AA2A 3JZJA 4PFWA 4ELRA 4KQPA 5TPAB 3TAJA 4DIGA 3TODA 3C32A 4FIMA 4AB5A 4AQ4A 2UVIA 2ONKE 4HCWA 1B3GA 3G3HA 2I4BA 3ZSFA 4LATA 2Q89A 2QS3A 1EH3A 3CIJA 4G2ZA 3C33A 2F7BA 4IO2A 4QFOA 3TELA 1B0HA 4RPOA 1RYOA 1B9JA 1PBPA 1ZIUA 4ZE9A 4KI0E 1O64A 5FHNA 1B7ZA 2HAVA 4IGTA 3U93A 2VHAA 2E0SA 4EXLA 3V83A 5I2KA 3OO6A 3TQLA 2XXUA 1MQHA 1TFDA 2ZNUA 3PGFA 4JSDA 2I48A 2XD2A 3FUZA 1D3KA 4THIA 3Q29A 4R2BA 2Y7KA 1MY2A 5H8QA 4KYDA 3IX1A 3MC2A 4JXIA 5CMCA 1MXWA 3KN3A 3K1PA 3OSQA 3FJMA 3K4UA 3QYTA 1MXUA 3N6TA 5KCJA 4RY1A 2Q2AA 3DP8A 3OO8A 4IO6A 1S7YA 4QSEA 1H76A 4OERA 4MLVA 1FTKA 2ZYOA 4POXA 3FVGA 1DMBA 3FATA 3K02A 1UIVA 4I8CA 2F8DA 1A8EA 4R72A 3R6UA 3AXFA 2QJEA 3PMWA 1MG1A 3K0VA 4GL0A 4E0WA 1JQFA 2UVHA 3RLFE 2I3WA 4PP0A 1B1HA 3T9XB 4RA1A 4KD5A 1B46A 2V84A 1H3DA 3FVNA 5I57B 4NF8B 4KHZE 3QUFA 2FNCA 4PETA 3FXUA 1NNFA 2O68A 2XHDA 3Q28A 1B4ZA 4FECA 3OO7A 3FV2A 5JTYB 1N04A 1LFIA 3PPRA 1BLFA 5H8FB 1O7TA 3IJXB 1YCJA 1GVCA 5FHMA 4X1DA 1OLCA 3IOUA 3SEYA 2GFEA 1D9VA 2B65A 4UACA 1YPNA 3TTMA 1AIVA 5BUUA 5M2VA 4QF9A 4N13A 1MXXA 4NMYA 4OETA 2KLFA 3MZBA 4PFUA 5AE4A 2GHAA 5KDTA 3TTRA 1QW0A 3HHGA 1B05A 1XHYA 5ICTA 1UQWA 1BIYA 3TPAA 4H8JA 3CG3A 4C0RA 4BDMA 3K6VA 2QS2A 1HSLA 1NNTA 2HCAA 1M5CA 3VLUA 5DEXA 2YJPA 5K2XA 1QUIA 4GXAA 4EDPA 1T0KA 3E3KA 4NF5A 3WAFA 3R7XA 2DWAA 4POWA 5K2YA 4RXLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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