5JK4A

Phosphate-binding protein from stenotrophomonas maltophilia.
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
373
structure length
373
Chain Sequence
ETAVTGGGASLPADLYKGSADSILPANFSYAVTGSGTGKKAFLENNSALFSTTGTVHFAGSDSVLSSTELNTYNSTYNVSGDANRYGALVQIPSVATSVTIPFNKAGSAVDLSVTQICGIFSGKINNWSQLAGLGRTGAIQVVYRGESSGTSELLTRFLTSACQPADVSGTNLKLANGVPAFSVQSTFANLFTTVPSNFVAAPATGGSALYNAVYAVDGRVGYVGPDVIPSLTDATKVAKVKSFSPDEVSVQATLETAAPPTGAAAENPANWVPVFGNPSAGYPIAGYTNFVFGQCYKNATVGANVRGFLTRHYGSTVVNGVEQGPNDDAIRAHKFIPLTKAWRDAVRARFATATNAGAVNNPSTCSGIGRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Alkaline phosphatase
publication title The 1.1 angstrom resolution structure of a periplasmic phosphate-binding protein from Stenotrophomonas maltophilia: a crystallization contaminant identified by molecular replacement using the entire Protein Data Bank.
pubmed doi rcsb
total genus 116
structure length 373
sequence length 373
ec nomenclature ec 3.1.3.1: Alkaline phosphatase.
pdb deposition date 2016-04-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jk4A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 5jk4A01
3O2AA 3KN8A 1N84A 1JW4A 1N7WA 1S7YA 4MLVA 2PBWA 4OFOA 3PUVE 1QUKA 4IO6A 2UYFA 1GTKA 3V89B 1GR2A 4OQOA 2ZYOA 1LB8A 4ZEKA 3OOAA 3FXQA 1LGBC 3O6HA 4UACA 4DLDA 5H8FA 3CFZA 3IO6A 5BWJA 3CSGA 4EQ7A 3VXCA 3H6UA 4OETA 2VHAA 3D4GA 2D21A 2DE3A 3MUQA 3C31A 2DP8A 2H98A 2QS3A 2XX8A 4IO7A 4M1VA 3FVGA 4WXJA 1Y3QA 1NH7A 3H03A 1OLCA 3CR9A 1I6BA 4Q0CA 1LAHE 5B70A 3FJGA 4IB2A 1SYHA 2IA4A 4PP0A 1NH8A 3SEWA 5ITOA 4G68C 1DSNA 4NF8B 3RT8A 3BKIB 3F11A 4PFWA 4ESXA 1LBBA 4NWDA 1AL3A 1A7LA 1IXCA 3FV1A 3K0VA 1JEVA 3G7WA 2W7YA 2PT1A 2Q2AA 2QS4A 2UVJA 1B7HA 3RTFB 1B9JA 1B0LA 1D3KA 3MP8A 4X1DA 4I1DA 1B3EA 4OZ9A 5IKBA 4JXIA 3T9UA 1RKMA 2PVUA 2YPNA 3IJXB 3MPLA 2DE2A 2F35A 2DWIA 2O6AA 4AB5A 5F7VA 1NNKA 2H5YA 4OHNA 4PFYA 3K02A 4YKIA 5J1DA 4QHQA 2I4CA 4YKPA 4RNSA 2P2AA 4G8HA 2PX1A 3H7MA 1FW0A 1LLSA 2HXWA 2F5XA 4GXSB 5H8NB 3TKDA 2GRVA 1TT1A 2ZNUA 1KWHA 1GV8A 4HCWA 3K1MA 1OVBA 3RLFE 2P1SA 3V8XB 4AQ4A 3U92A 3P7IA 5HBCA 4F3BA 1A8EA 3E3KA 1R9LA 2O68A 1MY1A 3U72A 1A99A 4AB6A 2PMSA 4IO5A 1EZ9A 3OENA 1YTVA 5H8NA 4RPNA 3T9XB 5DYHA 4OESA 3ILTB 2QS2A 3B7DA 4BDLA 5AA3A 5KZTA 5JEIA 1MY0A 4XTCQ 3QXMA 1PBQA 3CG1A 2Z23A 1PDAA 1JEUA 1FQAA 3G3HA 4R6KA 4Q5TA 1S50A 5CMCA 1II5A 3VFJA 1POY1 2RC7A 3O28A 3FVKA 1ZU0A 3GZGA 1IIWA 4F39A 3IJOB 1H45A 2GH9A 4EF1A 2NUVA 1I6QA 2ZXTA 2X7QA 4IO2A 2DS9A 2D5WA 3ZSFA 4YB7A 4LQ5A 3ZKLA 1VFDA 1JETA 1H43A 4KFQA 3VXBA 3K01A 4NMYA 1N3WA 3UORA 4KHZE 1B40A 1YCJA 4FIMA 1ZKBA 3MVZA 3CIJA 2Z22A 4DE8A 5FTIA 3VDFA 2RKMA 2I3WA 4O3BA 3JV9A 3PPQA 2FYIA 4RA1A 1YPNA 4NF6A 1SD3A 2KLFA 4EXKA 3MPKA 4QFPA 5AA2D 2RC9A 1BTJA 1IXIA 2I3VA 1OLAA 2R6GE 2ZNTA 2QMXA 2XXTA 3KN7A 1R1NA 2O1MA 5I84A 1MH4A 4PFUA 1US4A 4LVQA 5DVJA 2HQ0A 4DXCA 3SEVA 3E9XA 3TCFA 5CMMA 3OO8A 4HTGA 2O84X 5H8HB 1L5TA 5EHSA 4BDRA 1BLFA 1MY4A 1URGA 1ANFA 3WAFA 1SBPA 1LCFA 3IOVA 2F7CA 1MPDA 2VD3A 4GIZA 2E0SA 1FQBA 4R2FA 4RK2A 2LAOA 3G3IA 2Q88A 2Q9TA 3IO4A 1R6ZA 3OO7A 3TELA 1WDNA 4WKMA 3LBSA 4EQ9A 1LSTA 2XXPA 3FV2A 5H8HA 2CZLA 4DCXA 1N7XA 1HSLA 3O29A 1BIYA 4XXUA 2VP1A 3S9MC 3KJ7A 4N6PA 3EHTA 4GRKA 1NNPA 3IB2A 5CBSA 4KCCA 3E13X 1MQGA 1AMFA 1J1NA 3FXUA 2V93A 2GHBA 2R9JA 4JDFA 3Q28A 4F3PA 2F6GA 3OEKA 4ZE8A 4QFLA 4Q8RA 2VD2A 4E0XA 1B32A 2HZLA 4GLIA 4XKNA 4R9GA 4KCDA 3N6UA 5JK4A 5TP9B 1MXYA 1DPPA 1AIVA 1Y3NA 2YLNA 2B3FA 4OFJA 3MWBA 1TFDA 2OCUA 4F2OA 2AL5A 2H4IA 2I6EA 1TXFA 4GVOA 1USYH 3JZJA 3TTNA 3SKPA 1N3XA 2UXAA 3PPNA 3HO7A 3TQLA 3HPIA 3CG3A 2O69A 1JVYA 5TP9A 1GVCA 4I8CA 4TQUQ 4F3GA 5ICQA 4JSOA 1XT8A 2ALUA 1QUIA 2XXUA 2Y7IA 5FTHA 4LATA 5KCJA 3ODBA 4KR5A 4H1XA 3R26A 2HAVA 1QULA 4QSDA 2H99A 2AL4A 2ZYKA 4IY5A 3OO6A 3MVXA 3S9NC 3TPAA 3CFLA 3TQWA 2F78A 1MM6A 4FATA 3MP6A 1VR5A 4G8NA 1PC3A 2ZMBA 3FXRA 4G68B 2Q89A 4F3SA 4WEDA 3RN8A 1B46A 2AIXA 5EHMA 3UGWA 1NKXA 3VLUA 3K4UA 3PGFA 3CFXA 3MW0A 5AA2B 1LB9A 3TYHA 1MRPA 5KDTA 5CI5A 1SW4A 1P99A 1O7TA 1H44A 1MQHA 3TTMA 3U94A 4G68A 2XD3A 1UTHB 3W15C 2R71A 2X7PA 2I4BA 4EQBA 4ZEFA 3RUMA 2B65A 4F22A 2RCAA 1ZLQA 2QMWA 3IORA 1A8FA 5LOMA 1XC1A 2DWJA 2O51A 4FJPA 1MDQA 5AA2A 1I6AA 4ZECA 3VV5A 2Y7KA 3M3KA 1VSOA 1B5JA 4QRZA 1SI0A 3IOTA 4ZEDA 2F34A 1UTHA 1Y1MA 4JBZA 1LAFE 3EQ1A 4U4SA 1IITA 3O9PA 4KPTA 1ATGA 3SEXA 4KYDA 4N13A 5DVFA 3H06B 4OTEA 1A40A 4OXVA 2THIA 3K00A 3OXNA 1IQ7A 4OEUA 5AE4A 3QK6A 4ZZAA 4ZEBA 3IB0A 3OEMA 3M3LA 4OEVA 1MPCA 5AA1A 1MXZA 1B7ZA 4H67A 1OVTA 3TTRA 2Z8EA 3KSJA 5M2VA 1P1WA 2FA7A 2XXXA 2HZKA 1JW5A 3EHSA 2ZYNA 3MVYA 4YB6A 1M5CA 4NF8A 4IGRA 3CSBA 4ELPA 1FTJA 3MAMA 3PD8A 3K6VA 3EN3A 4NE4A 3HSTA 4P11A 2Y84A 2XHDA 5I58B 4JWYA 4NF5B 2QPQA 4ZZEA 1B51A 4H8IA 3LR1A 3KSXA 1P1QA 4F31B 3FVNA 4IO3A 3T96B 1FTMA 1UIUA 5DVIA 3FJ7A 3DLNA 2RF1A 3H6WA 4P0GA 4U2RA 1XHYA 5DEXB 3TZAA 3KOTA 2I48A 1B7UA 2E1SA 3SETA 1NMUA 4BDNA 3SESA 1Y9UA 3VLWA 5I58A 3LSXA 1EH3A 1SW1A 4NF5A 1EZOA 3IK6B 3FZVA 3RQTA 2XXRA 1B6HA 4TLLB 4G8MA 2UVGA 3BFUA 3B6WA 2QJEA 1B3FA 5DEXA 3W9VA 3PPRA 4DIGA 4E0WA 1MXXA 1SYIA 3PUZE 3TAJA 3VVEA 5CMKA 1PB9A 3KN3A 3LC8A 3CI8A 1SDXA 4LA9A 2Z8DA 2XXHA 5ITPA 2BJJX 1NL5A 2DVZA 1PBPA 5H8SA 4F19A 1A55A 3MP1A 5FHMA 3K1PA 1EZPA 1MY3A 4F1VA 5AA4B 4ZEIA 4R72A 4C0RA 2QS1A 2HFBA 3UK4A 3GBBA 1MXUA 1URSA 3QUJA 1UIVA 2A5SA 3VLVA 4ZDMA 5CMBA 2V3TA 5DTBA 4ZS9A 4H5FA 3T93B 3RGYA 3MJNA 1PB8A 4ND9A 3VE1B 3I3VA 1RYXA 1Y20A 2DYXA 4RYAA 4RJZA 2ABHA 5AA4A 3QIMA 4YICA 4Z0IA 1MH3A 3SEYA 4MFIA 1S9TA 1MY2A 2IEEA 4GQOA 4EF2A 3OELA 3K6XA 4C1TA 1RYOA 2OWTA 3KZGA 4QSEA 3KBRA 2D3IA 2DSFA 1URDA 3G3KA 4H8JA 1USYE 5K2XA 4OERA 5TPAB 4GL0A 4OWDA 2HCAA 1WODA 3HHFA 3M8UA 4JWXA 5L9SA 3HN0A 1B3LA 3S4UA 1TFAA 2VOZA 2XXYA 1B3HA 4BDQA 4DXUA 4OFLA 1B4ZA 3I5OA 1NNFA 5CBRA 3OMBA 3B6TA 3H6VA 4FAJA 3PPPA 3DP4A 4OVJA 1MPBA 5TPAA 1QVSA 1MQIA 1QUJA 4XIGQ 4GL8A 1VFEA 5FHNA 1SW2A 4FORA 1LCTA 1ELJA 2OZZA 5L9OA 3FATA 1P1OA 4GD5A 3GBAA 3VVDA 3FASA 3N94A 2Z8FA 3G3JA 1M5FA 3OO9A 4ONYA 1M5BA 3O6GA 4TOZA 3K1NA 4R2BA 3PU5A 1ZBMA 3S9EA 4THIA 3UP9A 1PEBA 3OSRA 5EYFA 1P1NA 3DP8A 2DWAA 4EXLA 1R9QA 1UQWA 1B3GA 3TMGA 3Q29A 3GXAA 5ISUA 3RT6B 3MC2A 2O7IA 2DE4A 4ZE9A 4U1OA 3G3FA 3U93A 4LUBA 4GXAA 5I56B 2UVIA 4K3FA 3TODA 3ZKKA 1GGGA 3VVFA 1MXWA 3Q27A 2ANJA 4LZ5A 2ONRA 4YKKA 2M8CA 3K6WA 4QSCA 3FVOA 3SEUA 1Z7NE 3TTKA 1M5DA 1B2HA 1FTKA 4ELOA 3C32A 4F18A 5I56A 5I59B 1VE4A 3T66A 2V25A 4R9FA 3RY3A 2XXVA 3JYRA 5BUUA 4L17A 5F1QA 4GF8A 3MZBA 4MH5A 1XVXA 4IO4A 4R6HA 3V83A 2XD2A 1FCKA 4U21A 3N6TA 2XX9A 1B1XA 3BFTA 1O63A 1QW0A 3DM0A 1MQJA 3S2VA 4R6YA 1B58A 3BBRA 3C33A 5CC2A 5A5XB 4BLAA 2G93A 5I59A 4KYSA 3T9VA 2NVUB 3IAZA 2GHAA 4C1UA 4DXBA 5L9MA 3SDFA 4RY1A 1BP5A 2RINA 4GWOA 2Y7WA 3LUYA 1FQFA 3A3UA 3Q26A 1MG1A 3W9WA 3OSQA 1ZIUA 3TCHA 2Y7RA 3PUWE 5A5XA 3PD9A 1AH5A 1A54A 3C35A 1HSJA 1DTZA 4LQ2A 2F36A 1POTA 3QSLA 1ZJLA 5K2YA 4NTLA 4H65A 1Z7ME 4Z7EA 2F7AA 1Y3PA 3FD3A 3TDJA 3EF7A 2DVCA 4MBPA 1IXHA 4NF4B 2A5TB 4G4PA 4LZ8A 3PUXE 3TEPA 1Y1ZA 2H25A 4UA8A 2VGQA 1IEJA 4O3AA 1FQEA 4EDPA 2PYYA 1BKAA 2Q2CA 4GOTA 4RK9A 3HHGA 4U22A 2DOJA 4M4GA 2B3BA 1DMBA 4KYEA 4F2QA 2I58A 1SI1A 4H6DA 4NF4A 1OQGA 2V3UA 1Y4CA 2A5TA 3IR1A 1QJMA 1B5HA 4I62A 4BDMA 2F6PA 3UIFA 3FJMA 1FQCA 3T9HB 4NWCA 4BDOA 3U1OA 4U23A 4HS7A 2F8DA 3S9LC 2G29A 3EHUA 4EUOA 4YZZA 4QFKA 2OJTA 3TCGA 3LSFB 2HEUA 3IX1A 5HPQA 1N76A 4F1UA 4JWOA 1SVXB 1WVJA 1H3DA 2OWSA 4DZ1A 3PMVA 2GFEA 4YU0A 5CM6A 3LSWA 3ILUB 4FEBA 2OBGA 1YAEA 4JB7A 4N07A 3EPEA 3ZS6A 2QSXA 3K6UA 5ICTA 3K2DA 1HSEA 4QFOA 1XOCA 1FTLA 2Y7PA 1N04A 3B6QA 4ECFA 2I49A 1D9YA 4YMAA 4Q30B 4R75A 2NOOA 3MZ1A 5I2NB 3IOWA 3QUFA 4HCYA 1XS5A 4KD5A 1B52A 1B4HA 2OLBA 3O66A 5L8DA 3TFLA 3FIRA 3CVGA 3KEIA 3CRBA 3MBPA 4U1ZA 2X26A 1M5EA 3AXFA 4KI0E 3H6TA 2REJA 1JVXA 5I2NA 3ECRA 4XKRA 1N0TA 4ESWA 2RC8A 4H5GA 2ONKE 2F97A 3ONMA 2V84A 2Q8JA 1B5IA 3I6VA 2I0CA 4H0WA 4PETA 3UN6A 1SQYA 3TUSA 3U8QA 1NFTA 3R7XA 2UVHA 1DPEA 1JQFA 2XXQA 4ISUA 4NF6B 1OIBA 1DOTA 4DCYA 4DDDA 1LFHA 3MZ9A 1TWYA 3N5LA 4LONB 2UYEA 3FGSA 4FE8A 3N26A 2V3QA 4G2ZA 4OMBA 3V5AA 1Q35A 4ELRA 2CMOA 2XXWA 2I0BA 4NEDA 1XVYA 4P0IA 1UTBB 5TU0A 1ZMGA 3WAEA 4R73A 4I9DA 4LP2B 5HM4B 3TTLA 3PPOA 4PQJA 2YJPA 3IL1B 4G77A 3L6GA 5IAIA 3D4CA 1MXVA 5ELVA 4YAHX 3RTWB 3M3FA 1B0HA 4FEDA 1FTOA 3UA8A 1T0KA 4YB5A 2O1LA 2WKYA 4POXA 4X9TA 2H9BA 3PMXA 3A3CA 4JSDA 1EU8A 1CE2A 3MVWA 4F29A 1UTBA 3USDA 2REGA 4F1YA 4MLQA 5H8QB 3C4MA 3HCQA 2OK2A 4OYVA 4OENA 4XKPA 2DXYA 1NNTA 3IOUA 2XXIA 4POWA 3Q25A 4R74A 1CB6A 3C36A 2QL3A 1MQDA 4MF3A 3RNNA 1OQHA 2HAUA 5H8QA 4YMBA 1MDP1 5B7DA 1AOVA 4WEPA 3E4RA 2NWJA 2F7BA 1P1UA 1MS7A 1IZ1A 3QAXA 1Q1KA 1D9VA 3C34A 1QKBA 4XKQA 1JNFA 2ONSA 5CRYA 2AYSA 3O97A 1F9BA 3O6IA 3KOSA 3H4ZA 1LFGA 4LZ7A 1IUDA 3MQ9A 3KGCA 4FECA 4GFRA 3FUZA 1LBCA 1I69A 3DELB 4HW8A 2ZNSA 2QRYA 1LFIA 4QFNA 3GLBA 3G3GA 2ZYMA 4ELQA 1SW5A 4PE5B 3THIA 4KQPA 3T22A 3HV1A 5JTYB 5KCJB 1LAGE 4RXLA 3PMWA 3C9HA 4IGTA 4O3CA 4X48A 5DT6A 3A09A 3H3GA 2NXOA 1JW1A 3R6UA 3IB1A 1DTGA 1O64A 1H76A 5I57B 1D4NA 1ZTYA 2DQVA 4U4XA 4TLMB 5I2KB 1LAXA 3QYTA 3PV0E 2P0SA 3PUYE 2O7UA 3KJTA 5JTYA 4QF9A 3L6HA 3KG2A 1FQDA 2XX7A 3KFMA 2ESNA 1IXGA 2DXRA 1PB7A 2PT2A 3OD7A 1B05A 4PFTA 4YKJA 1OMPA 1Y4TA 3RPWA 2DWHA 3DP6A 4RPOA 5I57A 5FHOA 2RCBA 5KDTB 1QKAA 2FNCA 1US5A 5I2KA 1B1HA 3LSLA 3SERA 4IY6A 4X1BA 5H8FB 1MM7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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