5JTYA

Glutamate- and dcka-bound glun1/glun2a agonist binding domains with mpx-007
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
283
structure length
262
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQEKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 66
structure length 262
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5jtyA02
3E3KA 3QK6A 2O7UA 4F19A 3MPLA 1YAEA 1JETA 1XC1A 4PQJA 3I5OA 4EDPA 3LSLA 3SESA 5CC2A 1MDP1 1PBPA 4OQOA 2PYYA 1URSA 1NKXA 4DE8A 3K2DA 3OO8A 2DXYA 1I69A 3TAJA 3E4RA 3GZGA 1GVCA 2XD2A 2DWHA 4I1DA 2DE4A 4NE4A 4RJZA 1JVXA 3VV5A 2RCAA 5KZTA 1B9JA 3OO7A 1QVSA 1QUKA 4QFLA 4ELOA 4HTGA 3TQWA 5IKBA 1JVYA 1N04A 3VLWA 3T93B 3Q27A 1EU8A 3SDFA 5F7VA 3T22A 1LBCA 4FECA 2V84A 3CFZA 2OBGA 4ZE9A 4LZ7A 5I2KB 3KGCA 3PD8A 4ECFA 4F3SA 1QKAA 1B7ZA 4FATA 1SW1A 4IO6A 1FTOA 1SVXB 1PBQA 1FQCA 2RC9A 4IY5A 4U4XA 1Y9UA 2DE2A 1MH3A 1DMBA 4UA8A 5ISUA 4ZS9A 3TQLA 1POY1 1D3KA 3R26A 1FTLA 2KLFA 4EQ9A 1UTBB 3OSQA 2Q8JA 1LB8A 1SI0A 2D5WA 2YPNA 3KSXA 5ICTA 1Y1MA 4KCCA 4POXA 3S9MC 5AA2A 2ZYKA 1MY0A 1ZIUA 5FTHA 4I62A 1IXCA 3Q28A 1MM7A 4RPOA 2I4CA 4ND9A 4FORA 3HV1A 4NF6B 3PD9A 4JWYA 1DTGA 3PMWA 2ANJA 3VXCA 1I6AA 2BJJX 3BBRA 4YAHX 4YZZA 1B3HA 3K1PA 3TKDA 3VLUA 1YCJA 3S9EA 4F39A 3HSTA 4JDFA 3CSBA 3SEUA 5CBRA 4HCYA 3QAXA 3IOUA 5HM4B 3FV2A 2RC7A 4OYVA 4OXVA 4K3FA 4FAJA 4OERA 3PU5A 3QXMA 3OO9A 5HBCA 3FUZA 1EZPA 4FEBA 4N6PA 1ATGA 5TPAA 3N26A 4M1VA 4QFOA 4LVQA 1YPNA 3L6HA 3MZBA 4DCYA 4ZZAA 1B58A 1SW4A 4GVOA 1B0HA 3TEPA 1IXGA 3FVNA 4YMAA 2GRVA 2HAUA 5IAIA 3N6TA 3ECRA 1MXWA 4H8JA 5FTIA 2ZYMA 4F3PA 1F9BA 1ZLQA 2ZXTA 3LSXA 1PB8A 5I56A 3SEVA 1LFIA 4G8MA 3C34A 1KWHA 1LGBC 1MY4A 3CFXA 2FNCA 4QSCA 3U8QA 3HHGA 2AIXA 3H03A 5DVFA 3B7DA 1OQGA 2DWJA 1A7LA 1FQFA 1B3EA 3V8XB 2RCBA 2VHAA 3O9PA 1JEVA 1H43A 5DTBA 1Z7ME 5ELVA 2RINA 2H4IA 3A3UA 1ZU0A 2HZLA 2IA4A 4OZ9A 3RTWB 3JV9A 4NWCA 2VD3A 3PUVE 1IQ7A 1MY2A 5BUUA 1DOTA 3PPPA 2XX9A 4FJPA 4MLVA 5H8FB 1FW0A 1MG1A 5CMKA 2ZYOA 2G93A 3GLBA 4OVJA 4H6DA 5DVJA 4KYSA 4HS7A 5JEIA 1LB9A 2H98A 1ZTYA 5I56B 4H0WA 4ELPA 3A3CA 4AQ4A 1R9QA 3MAMA 4G68A 4O3CA 3RNNA 3PUXE 4R2FA 4DXCA 2A5SA 4XIGQ 3I6VA 1OQHA 1WDNA 2P1SA 3IAZA 4OFOA 2RF1A 2WKYA 3TPAA 1Y1ZA 3U1OA 4ELQA 1JW5A 5AA4A 1MQJA 2XXTA 3ZKLA 1LLSA 4KFQA 4YB5A 2I3VA 1AL3A 1Q35A 1Y3QA 2PT2A 3K6WA 2PVUA 4HCWA 1BIYA 1FTJA 2GHAA 2O51A 3O97A 2I0CA 4AB6A 5HPQA 3G3GA 4NF8B 5TU0A 3JYRA 3CG1A 3TTNA 4OETA 2O68A 2H9BA 3IK6B 3FXRA 4MH5A 2Y84A 4UACA 4F18A 1EZ9A 3FVKA 5ICQA 4FE8A 1A54A 1D9YA 3LBSA 1ZMGA 3EHTA 1FQEA 1I6BA 3PMVA 2XXQA 1B1XA 3O6GA 4QFNA 3THIA 3O66A 1VFEA 3IORA 2O84X 3BFTA 4NEDA 1LFHA 2IEEA 2ZMBA 4GOTA 4OESA 4KPTA 4DIGA 4BLAA 3MZ1A 2GHBA 1O7TA 2Z8DA 4GFRA 1US5A 5BWJA 1XHYA 4R9FA 3DM0A 1NH7A 2F97A 4G8HA 2XX8A 4MFIA 5EHSA 5AA4B 2DS9A 2DE3A 4IY6A 1B7HA 1USYH 1FQDA 2OK2A 1H76A 3RY3A 1VFDA 1M5BA 1NFTA 4AB5A 2OWTA 4EQ7A 5TP9B 1NH8A 1ELJA 3FXQA 4MLQA 4DCXA 3HCQA 3QSLA 3H4ZA 4IO7A 3C32A 3KG2A 5KCJA 1P1UA 4TOZA 3S9NC 1MQDA 2V25A 2A5TB 4PFYA 3U72A 4QF9A 1MY3A 3QIMA 5L9MA 4DZ1A 2B3FA 2ZNTA 1SW5A 3TCGA 3PMXA 3ILUB 1S9TA 2DYXA 4F29A 3C31A 4OWDA 3GBAA 3EHUA 1M5CA 5LOMA 1MQGA 3G3FA 1OVBA 1QKBA 2RKMA 1TFDA 4KCDA 3C4MA 1R6ZA 3O6HA 5I84A 5B70A 4THIA 3K0VA 3AXFA 3G3HA 4NWDA 1B40A 2Q2CA 1NNTA 3CG3A 2DVZA 3TFLA 1ANFA 3TYHA 3C36A 4PP0A 2V3UA 4R74A 3IOWA 5JTYA 4EF2A 2FYIA 4IGRA 4LQ2A 4F2OA 4ZZEA 4ZDMA 4TLMB 4RXLA 4ZE8A 3OOAA 3MZ9A 2B65A 3KEIA 5DEXB 4OHNA 5K2YA 3CR9A 3H6TA 4JSOA 1LFGA 4QFPA 3W9VA 5KCJB 1PC3A 3SEYA 3K1NA 3ZKKA 3W9WA 2HXWA 4KQPA 4R73A 4DXBA 3VVFA 5I58A 2THIA 1P1OA 4MBPA 4RA1A 2QS2A 2PX1A 4OEUA 2QL3A 4EUOA 3S9LC 3FVOA 5I59B 1SD3A 4YMBA 5H8SA 1N84A 2Q89A 2REJA 4ELRA 1B0LA 5ITOA 1LCFA 2ZNUA 3G7WA 1N3XA 2REGA 5L9OA 1VSOA 3B6WA 3OSRA 3ZSFA 1NMUA 1B5IA 1FQAA 3DP6A 1IUDA 1POTA 3SKPA 4IO4A 2AYSA 3MW0A 3FGSA 4GD5A 2O6AA 5CMMA 2XXHA 4ZEFA 4OFLA 1BP5A 1SQYA 3UGWA 1P1WA 3K00A 1IZ1A 4GF8A 4KD5A 4RYAA 1BKAA 3VE1B 2ZYNA 2D21A 1R1NA 4YKIA 4FIMA 3KN8A 3FJ7A 1WODA 1IIWA 4G4PA 3OENA 3MP6A 3MVXA 4R6KA 3LSFB 3CRBA 3M3LA 1LAXA 2UYFA 3MC2A 2DSFA 1MH4A 3H06B 2DP8A 5CMCA 5L9SA 1FTKA 3IOVA 1DSNA 2I48A 3UK4A 1JNFA 2Q88A 1BLFA 4FEDA 3G3IA 3R7XA 3RQTA 3FASA 4GXAA 1L5TA 4Q8RA 3GXAA 5AA1A 1IXIA 1XVXA 3KSJA 4RK2A 2NVUB 1SYHA 4IGTA 5AE4A 4H1XA 1JQFA 1UIVA 2QJEA 3VVDA 4JXIA 1B7UA 1LSTA 4R2BA 3MPKA 3KN7A 3W15C 2E1SA 2XXUA 1O64A 3D4GA 2H25A 5M2VA 1IITA 1II5A 4F22A 2I4BA 3CVGA 1R9LA 5AA2B 3VFJA 3FIRA 3IJOB 2VP1A 1IXHA 4JWOA 2ONRA 5H8QA 4OMBA 2NWJA 3PV0E 5B7DA 4WKMA 3OEKA 4QSDA 2E0SA 1OLAA 4Z7EA 4F1VA 3MP1A 1DPEA 1URDA 4WEPA 4G77A 3ILTB 5A5XA 4YKJA 3FZVA 1OIBA 4LZ8A 3U94A 3CIJA 4F3GA 3IOTA 3RGYA 4NMYA 2GH9A 5I57A 3HO7A 2UVGA 3H6UA 1LCTA 1RYOA 1MDQA 4YKKA 1B46A 2UXAA 5TPAB 3MQ9A 1UTHA 5DVIA 1B6HA 4R9GA 2R71A 2GFEA 1MPDA 5AA3A 1LAGE 1TT1A 3ZS6A 1FCKA 2VOZA 1Y3PA 3UIFA 4E0XA 4QRZA 4U4SA 3OMBA 3OO6A 1B2HA 3SETA 2R9JA 5CMBA 1H45A 5FHMA 4Z0IA 2ONKE 2F8DA 1A40A 1PB7A 1AOVA 4XKRA 3Q29A 3K01A 3KBRA 2F7BA 5I2NA 1NNKA 1MXUA 1D4NA 3WAEA 3MBPA 1T0KA 1IEJA 5H8NA 3S2VA 1FQBA 4BDLA 2UVJA 1Q1KA 1MXZA 3KOTA 4I8CA 1S50A 1N7WA 3PPOA 3KN3A 4Q30B 1NNPA 2QSXA 1VE4A 1D9VA 3KJ7A 2OJTA 2X7QA 4GQOA 3D4CA 2HZKA 1M5DA 2X26A 3L6GA 5KDTA 4F1UA 4X1DA 3IB1A 1B52A 3EPEA 4H8IA 3K6VA 4YB6A 1OVTA 1SI1A 3B6QA 3VVEA 5CRYA 4EQBA 4WXJA 1A99A 2HFBA 4IB2A 4Q0CA 1AMFA 2DQVA 3KOSA 1DPPA 4BDMA 1N76A 2QRYA 1I6QA 3UP9A 3LUYA 3JZJA 4G68B 3EN3A 1B51A 4L17A 3O28A 3TODA 3EQ1A 2O69A 2B3BA 3C35A 2PMSA 4YICA 2XXYA 3O6IA 4IO2A 4X48A 1M5FA 5H8NB 1URGA 3RPWA 3P7IA 2DWIA 1P1NA 5AA2D 2LAOA 1MXXA 2V3QA 4GRKA 2I0BA 3MVWA 4C0RA 2XD3A 4U1OA 2R6GE 2HAVA 3C9HA 1A8FA 1Y4CA 2F34A 3V89B 4POWA 4JB7A 1B5HA 4R6HA 2AL4A 3TTLA 3F11A 4JWXA 1B3FA 4IO5A 3QUFA 2P2AA 3EHSA 4E0WA 4BDRA 4ZEIA 3TCHA 4DDDA 1B3LA 2I6EA 4YB7A 1RYXA 2HEUA 3K1MA 1TXFA 1HSJA 3G3JA 3TCFA 1N3WA 4OFJA 1OLCA 2DXRA 2Z8EA 4EXLA 2DOJA 2Y7WA 2RC8A 3N5LA 1B1HA 4U2RA 1USYE 4QHQA 1JW4A 1AIVA 1Y20A 4M4GA 1GV8A 1AH5A 1GGGA 3BFUA 2Q2AA 2QMXA 2HCAA 3FD3A 4ZEDA 1GTKA 4KR5A 1P99A 1XS5A 4EF1A 3MJNA 1JEUA 2Y7RA 1Y3NA 4KYEA 2Z22A 1LAFE 3IR1A 3VDFA 2W7YA 4YKPA 2F5XA 3FJGA 3DELB 4ISUA 1H3DA 4P11A 2V3TA 3HN0A 4GL0A 4F3BA 1VR5A 4NF6A 3OEMA 5K2XA 4LATA 1ZBMA 4U21A 5DYHA 4NF5A 2UVIA 4H67A 1PB9A 2YLNA 3V5AA 3OD7A 3DP8A 4I9DA 3UN6A 1A8EA 4GL8A 4H65A 5EHMA 4KYDA 4PFUA 4XKQA 1QUJA 3DP4A 3SERA 3U93A 4GLIA 3LSWA 1LBBA 3KFMA 1MY1A 3CFLA 3BKIB 1QULA 2F7AA 3RT6B 2Y7PA 5J1DA 3U92A 1N0TA 4X1BA 1B05A 2OZZA 4N07A 5JTYB 2HQ0A 1MRPA 4RY1A 5CBSA 1MXYA 4C1TA 4XKNA 4C1UA 2O1LA 4ZEKA 2ZNSA 1HSEA 1MQIA 2CZLA 1SDXA 1MM6A 2XXPA 3MP8A 3S4UA 3T9HB 3IX1A 4GXSB 1MQHA 1N7XA 4H5GA 4BDQA 2OLBA 4X9TA 1XOCA 3OELA 4G2ZA 1JW1A 3PPQA 3PUYE 4G8NA 4U22A 3Q26A 4NF5B 3T9UA 5I58B 4F2QA 2Z8FA 1B4ZA 4WEDA 5H8HA 2FA7A 4XKPA 4EXKA 4H5FA 1B32A 3VXBA 4LA9A 4O3BA 3PUZE 2UYEA 3H7MA 1PEBA 1PDAA 3IJXB 2O1MA 2H5YA 2F35A 1O63A 1UQWA 4KI0E 4HW8A 5DT6A 1J1NA 3QYTA 4QSEA 1H44A 3T96B 5H8FA 3G3KA 2QS1A 1NNFA 3PUWE 4JSDA 4P0GA 4R75A 1P1QA 3PPRA 3N94A 3IO6A 1HSLA 2XXWA 2NUVA 2NOOA 3DLNA 3FXUA 5F1QA 3PGFA 4LQ5A 3RN8A 2Z23A 1ZJLA 3CI8A 4DLDA 4TQUQ 2YJPA 3TTMA 1A55A 3H3GA 1UIUA 5CM6A 1ZKBA 4G68C 3M3FA 4LONB 4DXUA 3ODBA 1SBPA 3K4UA 3MWBA 5JK4A 3E13X 3SEXA 4KHZE 1SW2A 2DVCA 2F6GA 5H8HB 2ALUA 3EF7A 1BTJA 4GIZA 3TZAA 3O2AA 3T66A 4IO3A 2F6PA 2OCUA 2Y7KA 3LR1A 3UA8A 4NF8A 2NXOA 1GR2A 3KZGA 2QMWA 1US4A 3K02A 3PPNA 3M3KA 3V83A 4ONYA 3A09A 3LC8A 3Q25A 3HPIA 4RPNA 3RLFE 3N6UA 2VD2A 2V93A 3E9XA 1XVYA 1WVJA 4U1ZA 5H8QB 1EH3A 1Z7NE 3TDJA 3FATA 3FV1A 4U23A 2D3IA 2QS4A 2I3WA 2ESNA 4O3AA 4ZEBA 2ONSA 3ONMA 3TUSA 2XHDA 4ZECA 4LUBA 5A5XB 4GWOA 4ESXA 2P0SA 4F1YA 4NTLA 3CSGA 4LZ5A 5ITPA 2XXIA 1M5EA 1B5JA 1MS7A 4OTEA 4PE5B 4BDNA 2I49A 1TWYA 4R6YA 4RNSA 5I57B 1MPBA 5FHNA 3H6WA 1QJMA 3TELA 3MUQA 3TMGA 2PT1A 1S7YA 3MVYA 4YU0A 1TFAA 3OXNA 4LP2B 4TLLB 2AL5A 1UTHB 4XTCQ 5TP9A 5L8DA 3RT8A 4PFWA 4N13A 3T9XB 1CB6A 3RUMA 3TTKA 2A5TA 2X7PA 1DTZA 1XT8A 2QS3A 3IB2A 2CMOA 3IO4A 2XXRA 4PFTA 4Q5TA 1OMPA 2ABHA 3FJMA 3O29A 4NF4A 1EZOA 3VLVA 3USDA 4P0IA 1CE2A 5I2NB 1RKMA 4QFKA 1MXVA 3UORA 4PETA 3K6UA 3QUJA 5CI5A 5EYFA 1FTMA 1LAHE 2DWAA 3C33A 2G29A 3IB0A 2VGQA 2XXXA 4OENA 2F7CA 1B3GA 1B4HA 3TTRA 3IL1B 3KJTA 4XXUA 5FHOA 2Y7IA 3HHFA 2QPQA 3MVZA 3M8UA 1QW0A 3GBBA 2XXVA 1YTVA 2UVHA 4MF3A 2PBWA 5KDTB 2Q9TA 4OEVA 4RK9A 5DEXA 2F36A 4F31B 3FVGA 2F78A 3R6UA 3SEWA 1MPCA 5I2KA 2I58A 1QUIA 2O7IA 3T9VA 3RTFB 3WAFA 2XX7A 3I3VA 1NL5A 4BDOA 2H99A 5I59A 3H6VA 1UTBA 1Y4TA 4R72A 1SYIA 4NF4B 3K6XA 3B6TA 2OWSA 4ESWA 2M8CA 4JBZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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