5JZJA

Crystal structure of dclk1-kd in complex with amppn
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
275
structure length
271
Chain Sequence
EVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAVVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYLVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRGSEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLEHPWVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Biochemical and Structural Insights into Doublecortin-like Kinase Domain 1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase DCLK1
total genus 78
structure length 271
sequence length 275
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jzjA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jzjA01
1Q97A 3JVRA 3I0OA 5BVOA 4ZY6A 1YQJA 4XLVA 3B8QA 3R8VA 3MH2A 3POZA 1DS5A 4NFMA 5H8EA 3F88A 2UZNA 4OTRA 4OTPA 2OJGA 2PE2A 4FIHA 4QT1A 5IMEA 4U3ZA 5DWRA 1JKLA 3SRVB 4HVIA 1OPLA 3M2WA 5L8LA 2YLEA 1OBGA 3B8RA 4IAKA 4EH9A 2BAKA 1PMNA 4RQKA 3RHKA 5I9YA 1J7IA 2GSFA 4E93A 4Y72A 3CQUA 2YFXA 4O7SA 2GFSA 1XJDA 3FMEA 4LRJA 3BQCA 3ZRMA 4RZWA 4ACDA 1XH7A 2H96A 4PWNA 2Z02A 1NY3A 5J79A 2BKKA 3R04A 1RE8A 2BDJA 2ERZE 3DB8A 4RVKA 5M4UA 5HTIA 3BELA 4WSYA 2C1BA 1X8BA 5IA5A 1B38A 2OICA 4FMQA 5AM7A 4AZSA 2J0IA 3MFTA 4IB3A 4J97A 3EYGA 3BWFA 5JQ8A 3PIXA 4KNBA 3I6UA 3V6RA 4BWPA 4CFMA 4B4LA 4N57A 2PULA 4K11A 2ZOQA 1J3HA 1PXKA 3DDPA 5B2LA 1IR3A 1CMKE 4H3BA 3D94A 4Z7GA 3MB6A 3TUCA 4OTWA 4F4PA 4FKRA 2ZMDA 4DCEA 4ZMFA 4M67A 4PMSA 2H6DA 2C6IA 4C4HA 3NPCA 2ONLC 1ZY5A 2V7AA 3ZU7A 3N51A 5T68A 3EB0A 2KTYA 2ITYA 3CIKA 4CTCA 5GZ9A 3KULB 2I1MA 2WAJA 3FBVA 2QHMA 3QRUA 4OTIA 5CS6A 3AG9A 3IKAA 3MW1A 4GVAA 4OT5A 1PW2A 1OL1A 2C6DA 4JBQA 5HE3A 3R63A 2JIVA 4YJUA 3E8EA 3U87A 3AQVA 4PMTA 3CGFA 1BKXA 4J7BA 4GIHA 4C62A 2B4SB 2VWWA 5EOLA 2EWAA 5CY3A 3TUDA 4D2SA 3C5IA 2ERKA 3UDBA 1OL7A 5AAFA 4QMSA 3VNTA 3EOCA 3BHTA 3TCPA 4R8QA 4C4FA 3R02A 2YM8A 2PVFA 2BZIB 3TV7A 4ALUA 1NT2A 2QOHA 2IVUA 2WHBA 2NO3A 3C4XA 4I23A 3QUEA 3OW3A 3Q6UA 2GTMA 4U5JA 4J8MA 2VO3A 4OLIA 1OGUA 3IQ7A 4NT4A 3VIDA 4F9CA 2VWIA 3PP1A 3DB6A 3LFCA 2WU6A 3ZC5A 3VW8A 3TWJA 2BPMA 3PA3A 2RG5A 4MCVA 4JAJA 4TNDA 4H36A 1MP8A 1WBVA 3R7IA 2W1ZA 2GQSA 4WT6A 5G6VA 2PZPA 2X2LA 3JPVA 1R0EA 5EK7A 3QD0A 3FZOA 5HX6A 1R1WA 5J1VA 5DT3A 4Z55A 1ZYLA 4G6OA 2VWVA 5EQEA 2CJMA 2ONLA 4DG2E 3FLNC 3KN6A 4NFNA 4JIKA 5AP0A 2B7AA 4AW2A 4O7LA 3BRBA 1OIRA 1REJA 1UV5A 4BDCA 2J0LA 1WBNA 2XNNA 2XIZA 3R7EA 1YI6A 2GFCA 4ZTNA 4ZTSA 4RJ3A 4M66A 4DBNA 5JEBA 5M44A 3A7HA 3PSBA 5JT2A 5E8TA 3FZTA 3FLYA 4G2FA 5HIDA 4ANSA 2C4GA 2PVJA 5JQ5A 1PMEA 2VNWA 4H3QA 4YU2A 3RTPA 3HUBA 4LV5A 4U45A 3UC3A 4BDIA 4FG8A 2J51A 3DJ7A 5JGAA 3RWPA 1UU7A 3ZEPA 3TIZA 1YWNA 4BDFA 1WFCA 4MAOA 4JXFA 2QOKA 4GH2A 4LQMA 3U8WA 4YZCA 2PMOX 2BTSA 2P2IA 4NKAA 5K0XA 1PXPA 4QD6A 2HY0A 3H4JA 3CPBA 3SGCA 3P9JA 2JIIA 4O0XA 1ZOHA 1J1BA 3C4ZA 5FEQA 3ZZEA 4BI1A 5D10A 2ETMA 4RC2A 3QF9A 4AFEA 3S2PA 4QQ5A 4BIBA 4OAVB 2FH9A 4ZK5A 4BCGA 4YZNA 4EOPA 4FI1A 5EFQA 4RBLA 3QTUA 5AUVA 3Q9ZA 1FQ1B 3PJ8A 1GIJA 5E1SA 2W5AA 4XNEA 4ZLZA 2YIXA 1ZMWA 3MTLA 4FKJA 1R78A 3HV3A 4GV1A 1STCE 4IWOA 4JG7A 4JX3A 4MTAA 3ZUUA 5CAQA 5DRBA 4EHZA 5EHOA 3FHIA 3MY5A 3DS6A 3FSKA 2Z7QA 2XK6A 5B7VA 3SHEA 4B99A 4R77A 1L8TA 3RAKA 3IG7A 1OUKA 4GL9A 4MX9A 5EI6A 3PZEA 3WZDA 5AR4A 4AA5A 4EOSA 4BN1A 3O51A 3G0FA 3FMJA 4IB0A 5M08A 1OIYA 5HCZA 2XZSA 3P08A 5HTCA 4FNWA 3HMPA 4EYJA 2I0VA 3H0YA 3NUPA 1BUHA 3ROCA 4BHNA 4WNOA 3NUXA 5CEQA 5C8KA 4GCJA 4O7YA 4EQMA 1XWSA 3PE2A 4E6DA 5C8MA 4OBQA 2WMVA 3BYUA 4FT0A 4KBKA 4QP7A 4RIYA 4C0TA 2XMYA 3COMA 2W7XA 3EQHA 1VYWA 2GDOA 4MNEB 4RFYA 3RM7A 5HG8A 4YPDA 2W9ZB 2VX0A 3EKNA 3G15A 2PL0A 3MVJA 2R3OA 2XBAA 1OL2A 5EQPA 4P5QA 4EH5A 2WOUA 3W2CA 3W32A 2YAAA 3DPKA 5DH3A 2VWXA 4LOPA 1W7HA 3FLSA 4QO9A 4GT4A 3LFAA 5FXRA 4DTBA 4F9AA 3F7WA 4Q5EA 2BRMA 3RI1A 4GFMA 1Q8WA 3FJQE 4HPUE 3A2CA 3O2MA 4J96A 4PQNA 3S3IA 3W1FA 5AUUA 5M4CA 3ZFMA 4RFZA 3T9TA 3O17A 1JWHA 3K3IA 4YHJA 4M69A 5J9LA 3LMIA 5GJFA 4AA0A 5IA4A 3LJ2A 3OWKA 2FSMX 2ITNA 2OU7A 3ZFXA 4FTRA 2YM7A 5CU4A 4DGLC 4QP3A 2BZHB 2IW9A 3W33A 3LCTA 4L01A 5CXHA 5AP2A 1UKHA 4CYJA 3V5WA 5HG9A 3WIGA 3DXPA 3OY3A 5EHLA 4C4IA 3GU6A 3MGYA 5CAUA 4ACGA 3U6HA 3BHUA 1ZOEA 3DXNA 4FIJA 1ZWSA 1BMKA 4RLLA 3FZPA 3IS5A 4XEYA 4EBWA 2WTIA 5FTQA 2UW6A 5CANA 4PDOA 3NDMA 2CSNA 3FXWA 5GIPE 4W8EA 2X39A 2B53A 4O96A 1I09A 3BE2A 3QFVA 4OBPA 4X21A 4BVUA 3MH0A 3VS3A 2YWVA 2YM4A 3PJCA 5J8IA 4DHFA 4JQ8A 4TY1A 4FKGA 3CKXA 3KCKA 4PP9A 2XRWA 4NTTA 3VW6A 3DAJA 4FGRA 5TO8A 1Z5MA 4K8AA 2R3RA 3R83A 3O7LD 2JDOA 3AC1A 2RFDA 3U9CA 1O6KA 3PY1A 3AMYA 3EWHA 4ERWA 4WBOA 5HNGA 4QMZA 4MQ2A 5DVRA 4FZAB 4USDA 1JSTA 2VTTA 3DY7A 4V04A 3RKBA 3D5UA 2GNGA 2XJ1A 2V55A 4TZRA 4XV1A 1SNUA 4F9YA 3KXMA 4DLIA 4EKLA 3BU5A 2X8DA 5L6PA 3ORLA 4E8AA 1IRKA 3BHYA 3NRMA 4YJRA 2WMXA 2BTRA 3HP2A 4FKVA 1J1CA 1UNHA 1OZ1A 3EQCA 4K18A 2XUUA 5M4FA 4K2RA 2CMWA 2JFLA 3BU6A 2VAGA 3Q4ZA 5EYDA 3LVPA 3PJ2A 4L3LA 2IO6A 4JQ7A 5DEWA 4DG3E 3UQCA 2YIYA 4QMOA 5HHWA 3U6JA 4BICA 2FA2A 2YDKA 4YTIA 3VBWA 2E9VA 2R7BA 4FVRA 4R1YA 3ATTA 5IH4A 1Q3WA 3IW7A 5HVJA 5C1QB 4I0TA 5CEPA 4PV0A 3R1NA 4N0SA 5EW3A 5AP1A 4KKGA 2DS1A 4BCJA 3KY2A 4XG2A 4IVDA 4D58A 4R3PA 4EK3A 2XNMA 3MYGA 4LYNA 5TT7A 4NIFA 5JRSA 2ZVAA 4ACMA 3TNQB 2RIOA 5A4LA 4CNHA 1XKKA 4A4XA 4CKRA 4KIKB 3HMOA 4JR3A 4ZOGA 3LFQA 2W1EA 5DA3A 1LR4A 4S34A 2B9JA 2DUVA 2CGWA 4F70A 5CSXA 5JFSA 3QQHA 4KUJA 4G31A 4IAIA 2YCRA 3LJ0A 4MD9E 1XR1A 2A2AA 2XB7A 3GFWA 4MVFA 5HQ0A 4O7WA 4D2TA 5AM6A 2WMRA 3WF6A 2OKRA 3VBQA 4TYIA 1PY5A 4RJ4A 5G1XA 5F9EA 4CT1A 1BLXA 3D2KA 5AP7A 2X2KA 5EM6A 5CTPA 1U59A 3RK7A 4IJPA 3DQWA 4XRLA 5BNJA 3T3UA 1ZARA 4FSWA 3Q5IA 3MPAA 5HO8A 5DT4A 4IWQA 4W4XA 3VC4A 3HMNA 3G0EA 5CU3A 1HCLA 3ORZA 4FKLA 4DH1A 1SM2A 2E9UA 2JFMA 1S9IA 2GNFA 3DJ6A 3GUBA 5FTOA 2O8YA 5KE0A 3C1XA 3TXOA 3FHRA 4AE6A 3GI3A 2C6MA 3CD8A 2H34A 2VD5A 4ZIMA 3F3ZA 3GC0A 4DEDA 2OF2A 4BCOA 3DKOA 3QBNA 2J7TA 4L00A 5BMSA 3ANQA 3GVUA 1UU9A 3COKA 3L8XA 3EN5A 5TE0A 5CU6A 3KRXA 3HAMA 4FGBA 3UNZA 3NR9A 1Q8YA 4DT9A 3TACA 2UZVA 3BLRA 1VR2A 3F2NA 4G17A 2CGUA 4FKUA 2B9FA 3PVBA 1FGIA 3MIYA 4GMYA 3LXLA 4IWPA 3VF9A 5LARA 3F82A 1FVTA 3OBJA 3V5JA 1DM2A 5L2QA 3G2FA 5JKGA 4FG9A 3H9RA 5D7VA 5HNIX 4RWKA 3FZRA 1YHWA 2R3HA 2UZEA 5FM2A 5GHVA 4AW0A 4DAWA 2YLFA 1VYZA 4GFGA 4ZZOA 4YJSA 1SZMA 3UYSA 2JLDA 1XHAA 3KC3A 1YOJA 3KN5A 3DLSA 4LFIA 1MQ4A 3OS3A 4JRVA 4PPAA 2PYWA 2XNGA 3GXLA 4RQVA 3EYHA 2QC6A 3UVRA 1LP4A 3F3TA 5CWZA 5F4NA 5I5ZA 5EM8A 3ZO2A 4E5WA 1SVHA 2IZRA 3PY3A 4E4LA 2BKZA 2ZM3A 3A61A 5HVYA 4EC9A 1J91A 2W0JA 5J7HA 2WTKB 4PTGA 4CMUA 4GEOA 4RJ8A 2CKQA 3BEGA 4ZTQA 4C35A 4QMNA 2UV2A 4MQ1A 3B2WA 5C27A 3BE9A 4AUAA 1FPUA 5AMNA 4G5PA 4FTIA 3RPRA 4DLJA 3KCFA 4QOXA 4S31A 4ZMEA 3R7OA 1MRYA 2FB8A 4JRNA 3UQGA 3G33A 4O2ZA 3TJCA 3DDQA 2EUFB 4XG4A 3T8OA 1PXJA 4FV5A 5KNJA 3MVLA 5HIBA 3NUSA 1WVXA 3LQ5A 3QXOA 1KOAA 3E7VA 3M1SA 1SYKA 2VO0A 3CE3A 1U5QA 2ZB0A 3R01A 4D0WA 4W9XA 4DEHA 1HOWA 3PXKA 2BROA 3P7BA 4C38A 4CEGA 2WMQA 2QLUA 3GOKA 4G16A 4XP0A 5AR7A 2WQNA 2A4LA 4BBEA 3R8UA 4E4XA 3L8VA 1DI9A 2JITA 3D7ZA 3U9NA 4FZ6A 2BFXA 5H3QA 2OLCA 2PUPA 2AC5A 2OIDA 1VZOA 2C3IB 3QQJA 3WYYA 4BGGA 5E91A 4RIXB 2DQ7X 3QCYA 2HELA 3PJ1A 4LI5A 4HGTA 3MB7A 3WIKA 4OTHA 4LRKA 2RL5A 5F1ZA 4EJNA 4X2JA 4X7QA 3UOKA 3FEGA 2X6DA 5BX0A 5HTBA 4D2WA 3TEIA 4AWIA 3IO7A 4BZNA 3TNWA 5H9BA 3AC3A 2NRUA 3Q32A 2QG5A 4O0VA 1KSWA 5DRDA 2IG7A 5JK3A 2UUEA 1U4DA 5IQBA 4H1JA 2HZ4A 3W8QA 2VX1A 3A60A 2HOGA 2C3LA 4LGGA 3OW4A 3SDJA 4O81A 3G6HA 3OD6X 5IZFA 3LLAA 3ODZX 3EJ1A 4X3JA 3CQEA 3KRJA 5HEZA 3H9FA 4GRBA 2Y4IC 4KIPA 4QNYA 2ZV8A 3ZDIA 5AIRA 4RX9A 5B0XA 5IEVA 5DYJA 2EB3A 3G6GA 4Y5QA 5DFPA 1GOLA 1DI8A 3R9DA 1Q8ZA 4IAAA 2CLQA 4L45A 2W1HA 4UEUA 3LXNA 5GJGA 4C3RA 4QQTA 3R7GA 4EJ7A 3EQGA 4AW5A 3DK3A 3LCDA 5AA8A 2BAQA 3I5NA 1NVRA 1ZYSA 3NNWA 3WOWA 4CG9A 1P2AA 4EOMA 4IC8A 2QNJA 5DMZA 2IJMA 4Y8DA 4HYIA 3GU5A 4DGOA 4N70A 3LPBA 2GS6A 3RM6A 2C0IA 5IUIA 5HORA 4D5HA 3EHAA 3ANRA 3MJ2A 4BTKA 4MWIA 3JUHA 3LQ3A 2OBJA 4G34A 2X0GA 3UGCA 2IZUA 4FUYA 4DTKA 3O23A 3QZFA 4LMUA 3WARA 4FIEA 1LPUA 2Q83A 3V5QA 1JQHA 3DA6A 4N6ZA 3VUIA 5L3AA 3O50A 5BVEA 3JS2A 3S0OA 4L7SA 1JKTA 1RJBA 3QTRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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