5KCJA

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
279
structure length
279
Chain Sequence
DNHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 279
sequence length 279
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjA02
5I56A 4PFYA 4KD5A 1SI0A 2NOOA 4RK2A 3ZSFA 1H76A 1NL5A 2Q89A 4GRKA 4RA1A 2ZYOA 2H98A 2ESNA 5I58A 4FE8A 2DQVA 1Y3QA 3ZS6A 5JTYA 5ICTA 4JWOA 2F36A 5KCJB 4DLDA 2ZXTA 3HHFA 1B1XA 4DCXA 1SW4A 3H06B 3KN7A 3VXBA 4WKMA 1BP5A 4PE5B 2O69A 2YPNA 1A54A 1NNKA 2I49A 5L9SA 3IR1A 4DXBA 2M8CA 4OQOA 5H8HB 1MDP1 2F7BA 3RT8A 3E4RA 5I56B 1N7XA 1DMBA 1ANFA 1N0TA 2DS9A 2Q2CA 3K6XA 4NF8A 1QKAA 4BDQA 4ELPA 3CFLA 4G68A 1N84A 4YICA 4FATA 2DWJA 5FHNA 5K2YA 4NF6A 1LB8A 4DCYA 1ZU0A 2QS2A 5I58B 3S9EA 3SKPA 4NF5A 5JTYB 4GFRA 4UA8A 3F11A 2E1SA 3UGWA 4R6HA 3FVGA 1M5BA 1O63A 3G3GA 3EHUA 4F31B 3S2VA 1HSLA 4EXLA 2O51A 2PYYA 4Z7EA 3CFZA 3VVDA 2O1LA 1NNFA 3OO7A 5IKBA 4Q30B 2BJJX 1F9BA 4EQ7A 2Q9TA 1WVJA 3D4GA 1S9TA 2QPQA 4NF8B 3RLFE 3HCQA 5TU0A 4G68B 1AIVA 2ZYKA 4IO5A 4LZ7A 3UORA 1IUDA 4EXKA 4NF6B 1B5JA 3LR1A 3MVZA 2QS4A 4ZDMA 3FVKA 4NE4A 4NF5B 1N76A 3O9PA 1P1UA 1IQ7A 4R73A 1IEJA 2OCUA 3BKIB 1M5EA 1P1QA 3MVXA 4POWA 3UN6A 3PPPA 1TWYA 1VR5A 3KGCA 4U1OA 3M3KA 1NFTA 2HZKA 2ONSA 5F7VA 2THIA 1QULA 2I48A 2VP1A 2O68A 4DZ1A 3K01A 2H25A 3FJ7A 1EZPA 4O3CA 4ZE8A 1GV8A 1FTMA 3EN3A 1LAFE 3RN8A 1Q35A 1NKXA 3TEPA 2A5TA 3QIMA 2UVGA 4KPTA 4FEBA 1SBPA 3WAFA 1VFEA 3CSGA 1N3XA 3CR9A 3T93B 3SERA 3T66A 1JNFA 2UYFA 3ECRA 2OK2A 1US5A 3OXNA 4RXLA 1LAXA 3PMWA 2IEEA 4F1VA 3S9NC 3FV2A 4H6DA 4HTGA 1MQGA 3CG3A 1B4HA 4ELOA 2B3BA 3IORA 3T9UA 2V3QA 5ISUA 3KSJA 1QJMA 2I0BA 2RKMA 2DXYA 3M3LA 2XD3A 3E3KA 2GHBA 1IIWA 4HCYA 2XXTA 4YMAA 3KEIA 5AE4A 1ZMGA 2A5TB 1LCFA 2ZNTA 4NWCA 1L5TA 1A8EA 4YAHX 1EH3A 3TKDA 1JEUA 4OFLA 1AH5A 3AXFA 2AYSA 3O6GA 4PFTA 4RYAA 2I4CA 2F78A 4U1ZA 3TTNA 3TELA 3K4UA 5HPQA 5IAIA 2Y7KA 2B65A 4PFWA 1ZLQA 1LSTA 4JB7A 4KYSA 3EHSA 3IAZA 2XXQA 2B3FA 3OEKA 3PGFA 3KBRA 5FHMA 4WXJA 1TT1A 3VLUA 2ZYNA 1XVXA 3TQLA 2ONRA 2ABHA 2DE2A 1B6HA 3EHTA 5CRYA 3IK6B 4I62A 4F1UA 4IO2A 3T9VA 3FXUA 2YLNA 5H8SA 4HW8A 1OMPA 1B32A 3Q25A 2H4IA 2REGA 5CBRA 4U22A 2OZZA 5CM6A 4KCDA 1ELJA 4OVJA 2I58A 1H3DA 3I5OA 3O66A 1LFGA 4ZECA 1SW5A 3K2DA 4P11A 3OELA 3RGYA 3M3FA 5KDTA 4RJZA 4I8CA 3LSWA 3U94A 1B3HA 5TPAA 4I9DA 2UYEA 3HSTA 1IXGA 3DM0A 1P99A 1MH3A 1MXUA 4K3FA 1MPCA 3C34A 4C1TA 1A7LA 3L6GA 2ANJA 3V83A 5FTIA 2OWSA 3Q26A 3DELB 4E0XA 4Q5TA 2QRYA 1POTA 3PPNA 2XXIA 3U92A 1OQHA 3FVNA 4NF4A 1NNPA 1B7ZA 3VLWA 5ITOA 1MY0A 1B46A 1MPDA 3DLNA 3MQ9A 2Z8DA 1TXFA 4OTEA 3SESA 1A8FA 3KJ7A 1Y9UA 3QAXA 2XX9A 4GIZA 1P1NA 5B70A 3D4CA 3FASA 5CC2A 1USYH 4PETA 5KDTB 3PUZE 4OERA 3SEYA 1SW2A 3OSRA 4U23A 3IO4A 5TPAB 3MPLA 3RUMA 1LFHA 1B52A 4PQJA 3C36A 4EQBA 1LAHE 2RINA 1MY1A 3DP8A 1Y3NA 4RPNA 3UIFA 2F8DA 3TODA 1I6BA 4R6YA 2I3WA 1I6AA 2VD3A 3G3FA 2UVIA 2CMOA 4NF4B 3DP6A 2GFEA 2P2AA 3IJXB 1B4ZA 2XXPA 3FXRA 4O3BA 3RY3A 1POY1 5J1DA 4RY1A 3ZKLA 4IY5A 1R1NA 3IO6A 2QSXA 4QFOA 2GHAA 2FA7A 3VE1B 4ZEFA 2Z22A 4N6PA 1Z7NE 1PBQA 4LZ8A 4ZE9A 3B6QA 4QFLA 2XXYA 4MH5A 4R75A 5FHOA 3G3KA 4KCCA 1XS5A 3IOWA 1VFDA 3R7XA 1PBPA 3TQWA 4ZEKA 1URGA 3BFUA 5CMBA 3CI8A 5KZTA 5L8DA 2H99A 5CMMA 4YKJA 1AOVA 3O2AA 4HCWA 4XKNA 2QS3A 4MF3A 3H6TA 1MQIA 4U2RA 3W9VA 1D9VA 4YMBA 5I59A 3Q28A 4WEDA 4JSDA 1CB6A 4ND9A 3MAMA 5AA2D 3LUYA 3FATA 3H03A 3PPRA 4LUBA 3CVGA 1AL3A 1JVXA 2ZNUA 3VLVA 3E9XA 1Y1MA 1JW5A 5AA1A 2O84X 3OOAA 4AQ4A 3V8XB 3RQTA 4RK9A 5DVJA 1IZ1A 4OFOA 3ONMA 3KJTA 1MRPA 4P0GA 5M2VA 5H8FA 1PB9A 4FIMA 2HCAA 3SETA 1BTJA 1GTKA 2F6GA 4FAJA 1MQJA 2RCAA 5LOMA 3QUFA 3G3IA 5I59B 1MM7A 3T9XB 2QMXA 1OVTA 4XIGQ 3N6TA 4R74A 2DWHA 4DXUA 4JSOA 4NEDA 5I2NA 2PVUA 2P0SA 5EYFA 1MS7A 3IB1A 4TOZA 1VSOA 3B6TA 4H1XA 3OO6A 3B7DA 3OD7A 3PUWE 3M8UA 3QYTA 1JW1A 1ZBMA 1YPNA 1OQGA 3TMGA 2AL4A 2DE4A 3ILTB 2IA4A 1LAGE 5H8FB 4IY6A 3G3HA 4ONYA 3ODBA 3THIA 1A99A 2OLBA 2ZMBA 3C9HA 2F7CA 3IOVA 3O28A 4GXAA 1FTOA 3V89B 2DE3A 1QW0A 2RC9A 4THIA 2NXOA 3E13X 1NH7A 5I2NB 2VGQA 3QSLA 4JWXA 1JQFA 1MY3A 5CMKA 4QFNA 1FQDA 4NTLA 4BLAA 3LSFB 5BWJA 3K6UA 4EUOA 2F7AA 5I2KA 2D21A 1MH4A 2VHAA 3FGSA 1P1WA 1US4A 1IXHA 1YTVA 4KHZE 1LFIA 4ESWA 1UTHA 4ZEDA 2W7YA 1B2HA 3TTKA 4KYEA 2HFBA 5EHSA 2GRVA 3TCHA 4NMYA 4YKPA 5FTHA 3JYRA 1B5HA 5H8NA 4ELQA 4YZZA 3K00A 4EDPA 1SYHA 4QSDA 1M5DA 2QMWA 1QUKA 2D5WA 5ICQA 3VVFA 4ELRA 4IO6A 1SW1A 2Y7IA 3PD9A 4F3GA 1B0LA 3MUQA 3O6IA 4X1DA 1LB9A 4RPOA 4ZZEA 3TDJA 3PPQA 5I2KB 3N26A 3RT6B 1LBBA 1XC1A 2AL5A 4OESA 2DP8A 3RNNA 1UTHB 1H43A 3MP8A 1UIUA 3C4MA 3K1NA 1XT8A 1D3KA 1JEVA 4GLIA 3T96B 2Q2AA 3EQ1A 4QFPA 1XHYA 5H8NB 1XOCA 1YAEA 4GL0A 1PDAA 3IL1B 4F29A 3SDFA 5AA4A 2Z23A 4EF1A 1CE2A 2PT1A 2HXWA 4X48A 2UXAA 3PUXE 2RF1A 4OHNA 4TLMB 4ZEIA 1P1OA 1MXXA 5DT6A 1RYXA 1FW0A 1MXWA 2RC7A 3BBRA 3S9LC 1SD3A 1B7UA 4LQ5A 4AB6A 2H9BA 4AB5A 4F1YA 1Z7ME 3KN8A 4DDDA 2YJPA 4U4SA 4LATA 1SDXA 2XD2A 3OSQA 4QSCA 5JEIA 1S7YA 3KG2A 4QHQA 4BDMA 2QJEA 1FTJA 2Z8EA 2V3TA 1AMFA 1SYIA 4OFJA 3U72A 1GGGA 3PMXA 3LSXA 3T22A 1USYE 4KFQA 1PB7A 5AA4B 3O6HA 1XVYA 3CG1A 4TQUQ 2O7IA 3LC8A 5AA3A 4QFKA 5DYHA 3MP1A 1LGBC 4XKRA 4ISUA 2X7PA 3KSXA 1FQAA 1MM6A 1N7WA 3OO9A 1Q1KA 3TCGA 3A3UA 1I69A 3R26A 3IB0A 3HN0A 3L6HA 4R9FA 4EF2A 4GVOA 1Y4TA 2RC8A 2DVZA 1NNTA 3Q29A 1BIYA 2XXWA 1HSJA 3KN3A 2F97A 2XX7A 2OWTA 3C32A 3K1MA 4GXSB 4OMBA 4LA9A 5DTBA 1B5IA 1MQHA 2HZLA 4QRZA 2VOZA 4BDRA 4IO4A 3PUVE 4R72A 1PEBA 1H45A 1UTBA 1H44A 1ZTYA 4XKQA 4H8IA 3P7IA 3MP6A 1FTKA 3MZBA 1UQWA 1S50A 3OEMA 5TP9A 3TTMA 1FQCA 5HM4B 2P1SA 2Y7RA 2DYXA 5I57A 1MY2A 5HBCA 4XKPA 3MWBA 1MY4A 4LZ5A 2FNCA 3W9WA 4PP0A 1EZOA 5ITPA 2DVCA 4H5GA 3TTLA 4YB7A 3H6WA 3K6VA 2RCBA 3H3GA 2I3VA 1B3EA 3N6UA 3PMVA 3VV5A 1ATGA 4RNSA 3S9MC 1KWHA 3FD3A 1UTBB 3G7WA 3EPEA 5CBSA 3H7MA 5BUUA 1WODA 3I6VA 1MG1A 4H65A 4EQ9A 2A5SA 2PT2A 5TP9B 5I84A 1Y20A 3TUSA 3MVYA 4OETA 4HS7A 5I57B 3N94A 2X26A 3PU5A 1B1HA 3PV0E 3HHGA 1DSNA 4P0IA 2PBWA 3K02A 4C1UA 1JETA 4DIGA 1MXVA 4ECFA 3HPIA 4F19A 4G77A 4ESXA 1OLAA 5A5XA 1QUIA 1OIBA 4OZ9A 1LCTA 2R71A 2V25A 2HAUA 4GWOA 1A55A 3USDA 2R6GE 4XXUA 5DEXA 3C35A 4KYDA 1WDNA 1QUJA 2V93A 3MC2A 4GQOA 4FORA 2F5XA 3MJNA 4L17A 3A3CA 1D4NA 2F35A 3MW0A 2Q8JA 4O3AA 4LP2B 4POXA 3GZGA 1QKBA 4N07A 2X7QA 1A40A 4IGRA 3DP4A 3IOUA 1YCJA 3KFMA 2DSFA 2D3IA 3R6UA 3IJOB 2HQ0A 4YKIA 2REJA 1RYOA 1M5CA 2QL3A 4F22A 4F3BA 3KOSA 3RTWB 3MZ9A 5A5XB 3H6VA 1J1NA 3MBPA 2UVHA 5DEXB 3KOTA 3U8QA 4LVQA 3A09A 1B05A 1B9JA 5CMCA 4G4PA 1ZIUA 2AIXA 1IXCA 1TFAA 3HV1A 2XXXA 5EHMA 4OXVA 1ZKBA 4I1DA 1MPBA 1FQEA 3SEUA 3QUJA 1UIVA 4FEDA 4C0RA 3FVOA 3I3VA 3K0VA 2CZLA 4F2QA 4Q0CA 1EZ9A 1R6ZA 4JDFA 4PFUA 2KLFA 5CI5A 4U4XA 2ALUA 2HEUA 1SI1A 4G8NA 3O97A 3W15C 3CFXA 3SEWA 4IB2A 4F2OA 3UP9A 2ZYMA 3MPKA 5JK4A 1NH8A 2Q88A 4F3SA 1JVYA 2OBGA 3PPOA 2XHDA 3B6WA 3G3JA 4BDOA 2GH9A 2I0CA 3GBAA 3CRBA 1OVBA 3TCFA 2XXRA 4KQPA 4ZZAA 2I4BA 3UK4A 2ZNSA 2OJTA 1VE4A 3K6WA 4MBPA 4OWDA 2VD2A 1HSEA 3GBBA 1D9YA 3CIJA 4LQ2A 2NUVA 2O1MA 4DXCA 2O7UA 3LBSA 4MLVA 1SVXB 3GXAA 4G8MA 1B51A 3FXQA 3RTFB 4Z0IA 5L9MA 4H5FA 2Y84A 4GOTA 1B40A 5H8QA 4FECA 1O64A 3GLBA 1DPEA 4IGTA 3IOTA 2H5YA 2Z8FA 4X9TA 3EF7A 3FV1A 2ONKE 4F39A 4JBZA 3OMBA 2XXUA 4MFIA 3TTRA 3VXCA 4G68C 1QVSA 4R2FA 4X1BA 2NVUB 1GR2A 3OENA 1B0HA 3C31A 3ZKKA 3PD8A 3Q27A 3TAJA 4E0WA 3WAEA 1O7TA 2O6AA 3U1OA 1DTZA 5DVIA 4G2ZA 2PMSA 1MXYA 2V3UA 3TFLA 4YU0A 1B3LA 3S4UA 1MXZA 4BDNA 4M4GA 5AA2A 4KR5A 1BLFA 2DXRA 1GVCA 1B3FA 5F1QA 1IITA 1BKAA 3T9HB 4XTCQ 2QS1A 3HO7A 5H8QB 2G93A 3V5AA 1MDQA 1M5FA 4R6KA 2XX8A 3SEVA 1URDA 3FUZA 2Y7WA 3FJGA 4YKKA 2UVJA 4BDLA 2Y7PA 2NWJA 3SEXA 3VVEA 4R9GA 4GD5A 4F18A 1OLCA 4M1VA 1LLSA 3IB2A 4NWDA 1FQBA 4JWYA 4MLQA 4F3PA 3QK6A 4ZS9A 3TZAA 3FJMA 4G8HA 1R9LA 1T0KA 4KI0E 5ELVA 3TPAA 4ZEBA 3H4ZA 1TFDA 2LAOA 4N13A 1B7HA 5B7DA 3FIRA 4OEUA 2XXHA 4Q8RA 2E0SA 5AA2B 4WEPA 1SQYA 2F6PA 3N5LA 4OENA 4GL8A 4TLLB 4H0WA 1EU8A 1RKMA 4YB6A 3JZJA 3OO8A 5DVFA 1FCKA 1JW4A 3VFJA 1LBCA 2V84A 2HAVA 1DTGA 1URSA 1PB8A 1PC3A 4DE8A 4YB5A 3RPWA 2XXVA 3CSBA 1Y1ZA 4U21A 4QF9A 3C33A 3IX1A 1B58A 1R9QA 3LSLA 4UACA 3O29A 4GF8A 4H67A 4QSEA 3MVWA 1IXIA 1DPPA 2F34A 1FQFA 4R2BA 2WKYA 3K1PA 1N3WA 3H6UA 2DWAA 5K2XA 3TYHA 3FZVA 3U93A 2I6EA 5L9OA 2DOJA 3UA8A 2R9JA 1DOTA 1Y4CA 2G29A 1B3GA 3ILUB 2FYIA 4IO3A 5KCJA 1Y3PA 3BFTA 4OYVA 4IO7A 3JV9A 1MQDA 1N04A 1NMUA 3QXMA 1II5A 3VDFA 1ZJLA 1I6QA 1FTLA 3KZGA 4JXIA 2PX1A 4LONB 4OEVA 3MZ1A 4H8JA 2DWIA 3PUYE 4FJPA 5H8HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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