The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
104
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sequence length |
313
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structure length |
301
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Chain Sequence |
LDFEKPLFEIRNKIESQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVAQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit a
|
| publication title |
Crystal Structure of Carboxyltransferase from Staphylococcus aureus Bound to the Antibacterial Agent Moiramide B.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Staphylococcus aureus (strain usa300)
|
| total genus |
104
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| structure length |
301
|
| sequence length |
313
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| ec nomenclature |
ec
2.1.3.15: Acetyl-CoA carboxytransferase. |
| pdb deposition date | 2016-06-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03255 | ACCA | Acetyl co-enzyme A carboxylase carboxyltransferase alpha subunit |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ZDE A; 1XNW A; 1N6F A; 3M6M A; 3HIN A; 5E0N X; 1XNY A; 2J5I B; 4EML A; 2WTB A; 4Q1I A; 3QMJ A; 5KJP A; 1WZ8 A; 3MFM A; 4ELX A; 4YLH A; 2ZQQ A; 3N6R B; 4IZC A; 4K29 A; 2ZL4 A; 4WZ8 B; 5DTP A; 3Q0G A; 3VIV A; 3IB9 A; 4JCT A; 1XNV A; 4JCS A; 4JYJ A; 4FZW C; 2A7S A; 4WCZ A; 4EMM A; 1J7X A; 1YG6 A; 3QKA A; 1PIX A; 3Q1T A; 3NJB A; 1JXZ A; 1UYT A; 1X0U A; 4QFE A; 3WG5 A; 1FC9 A; 5INF A; 2D3T A; 2GTR A; 1EY3 A; 3L3S A; 3QK8 A; 1Q52 A; 3V5E A; 3T3W A; 2ZL3 A; 4FND A; 1O8U A; 5E0S A; 4FZW A; 1ON9 A; 2F6Q A; 3HP0 A; 4NEK A; 2F6I A; 4JSB A; 2ZL2 A; 1WDM A; 5CTC A; 3KTI A; 1NZY B; 4U18 A; 2BZR A; 4JYL A; 3T89 A; 2VSS A; 3NJD A; 3ZWA A; 4L8K A; 4OG1 A; 3STA A; 4WYO B; 3SLL A; 5FIF A; 2PG8 A; 4L6W A; 3U9T B; 2ZL0 A; 3TVU A; 1OD4 A; 2VSU F; 4G2R A; 4B3H A; 3KTH A; 3BF0 A; 1VRG A; 1K39 A; 4KWB A; 4B3I A; 3MOY A; 3GLM A; 1UYR A; 5DZK A; 3ZWB A; 3KTK A; 2J5S A; 3T8B A; 1N6E A; 3K8X A; 4K3W A; 4FNB A; 4RYF H; 4LK5 A; 4OLQ A; 3HLN 1; 1N6D A; 3ZW9 A; 3GF3 A; 3U9S B; 3MYB A; 4Q0G A; 5FUS A; 3H0U A; 4FN8 A; 2FW2 A; 3V5I A; 2QQ3 A; 2X58 A; 5C90 A; 5DU6 A; 4JVT A; 3ISA A; 2DUB A; 2VSU E; 3TVW A; 1EF8 A; 4MXI A; 4JJT A; 4KD6 A; 3PZK A; 4ZDC A; 3TT7 A; 2NP9 A; 1FC7 A; 3PGQ A; 5DU8 A; 3QXZ A; 2FBM A; 3OME A; 1NZY A; 1OD2 A; 4JCQ A; 1DUB A; 2VRE A; 2W3P A; 2UZF A; 5INI A; 4ZDD A; 3LAO A; 3JU1 A; 4DI1 A; 3U9R B; 2A7K A; 3T88 A; 5E0S H; 5DL1 A; 2PPY A; 5IKL B; 2ZQR A; 5CTB A; 3R9T A; 3GKB A; 3R9Q A; 3RSI A; 5DUC A; 4FB8 A; 4U0G A; 5DU4 A; 3SWX A; 3H0J A; 1UYV A; 4U1A A; 4I42 A; 3M6N A; 4U0G H; 3G64 A; 1UYS A; 3TT6 A; 3H81 A; 5JBW A; 3KTG A; 4IZB A; 3R6H A; 3BPP A; 3P5M A; 3PEA A; 5DZK H; 5MGB A; 1RJN A; 1HNO A; 3GMA A; 4JFC A; 1WDK A; 5G1S A; 4ZDF A; 4GM2 A; 5DKP A; 4JOT A; 4QIJ A; 1XX4 A; 3IBB A; 2IEX A; 1MJ3 A; 1UIY A; 2Q34 A; 3GF7 A; 3RST A; 2J5G D; 4GHN A; 4NNQ A; 1TG6 A; 3TZ3 A; 4OMR A; 3I47 A; 3ZW8 A; 4EMP A; 5KDR A; 4ZDB A; 3OT6 A; 1HZD A; 4K2N A; 3P2L A; 3R0O A; 2VSS F; 4QII A; 2VSU A; 3R9S A; 1HNU A; 4U0H A; 4RCN A; 3IAV A; 2DEO A; 4Z0M A; 2CBY A; 2F9I A; 4U19 A; 3TLF A; 3ST9 A; 3LKE A; 1FCF A; 4ASI A; 3PE8 A; 5ING A; 4F47 A; 5KDR B; 2HW5 A; 2A81 A; 4IZD A; 1EF9 A; 2Q35 A; 3QYR A; 3Q7H A; 4MI2 A; 4I4Z A; 3DOR A; 3Q0J A; 3ZWC A; 4FJW D; 2F9Y A; 2EJ5 A; 3FDU A; 4JCR A; 1SG4 A; 2VSS E; 3TDC A; 1RJM A; 5DUF A; 1Q51 A; 3QXI A; 4JWV A; 3TV5 A; 2X24 A; 3P85 A; 5G1R A; 3H0Q A; 1YG8 A; 4HNK A; 2F9I B; 3FF6 A; 4MOU A; 1WDL A; 4HC8 A; 3H0S A; 1TYF A; 3TRR A; 2Q2X A; 4B3J A; 1PJH A; 1W2X A; 1K32 A; 4KNP A; 5G1Q A; 1XO6 A; 5C9G A; 2PBP A; 3HRX A; 4KPK A; 4I52 A; 3RRV A; 3KTJ A; 2FZS A; 3K50 A; 2J5I A; 2VX2 A; 1SZO A; 4FN7 A; 4ELW A; 3KQF A; 2F9Y B; 3OC7 A; 3QWD A; 3MT6 A; 4ZU2 A; 3T8A A; 3BEZ A; 3DJA A; 5JBX A; 2C8T A; 3HE2 A; 4ELS A; 2J5G A; 4RYF A; 2VSU C; 3H02 A; 1ON3 A; 1DCI A; 2CE3 A; 2J5I I; 1FC6 A; 3QRE A; 5DTW A; 1Y7O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ZDE A; 1XNW A; 1N6F A; 3M6M A; 3HIN A; 5E0N X; 1XNY A; 2J5I B; 4EML A; 2WTB A; 4Q1I A; 3QMJ A; 5KJP A; 1WZ8 A; 3MFM A; 4ELX A; 4YLH A; 2ZQQ A; 3N6R B; 4IZC A; 4K29 A; 2ZL4 A; 4WZ8 B; 5DTP A; 3Q0G A; 3VIV A; 3IB9 A; 4JCT A; 1XNV A; 4JCS A; 4JYJ A; 4FZW C; 2A7S A; 4WCZ A; 4EMM A; 1J7X A; 1YG6 A; 3QKA A; 1PIX A; 3Q1T A; 3NJB A; 1JXZ A; 1UYT A; 1X0U A; 4QFE A; 3WG5 A; 1FC9 A; 5INF A; 2D3T A; 2GTR A; 1EY3 A; 3L3S A; 3QK8 A; 1Q52 A; 3V5E A; 3T3W A; 2ZL3 A; 4FND A; 1O8U A; 5E0S A; 4FZW A; 1ON9 A; 2F6Q A; 3HP0 A; 4NEK A; 2F6I A; 4JSB A; 2ZL2 A; 1WDM A; 5CTC A; 3KTI A; 1NZY B; 4U18 A; 2BZR A; 4JYL A; 3T89 A; 2VSS A; 3NJD A; 3ZWA A; 4L8K A; 4OG1 A; 3STA A; 4WYO B; 3SLL A; 5FIF A; 2PG8 A; 4L6W A; 3U9T B; 2ZL0 A; 3TVU A; 1OD4 A; 2VSU F; 4G2R A; 4B3H A; 3KTH A; 3BF0 A; 1VRG A; 1K39 A; 4KWB A; 4B3I A; 3MOY A; 3GLM A; 1UYR A; 5DZK A; 3ZWB A; 3KTK A; 2J5S A; 3T8B A; 1N6E A; 3K8X A; 4K3W A; 4FNB A; 4RYF H; 4LK5 A; 4OLQ A; 3HLN 1; 1N6D A; 3ZW9 A; 3GF3 A; 3U9S B; 3MYB A; 4Q0G A; 5FUS A; 3H0U A; 4FN8 A; 2FW2 A; 3V5I A; 2QQ3 A; 2X58 A; 5C90 A; 5DU6 A; 4JVT A; 3ISA A; 2DUB A; 2VSU E; 3TVW A; 1EF8 A; 4MXI A; 4JJT A; 4KD6 A; 3PZK A; 4ZDC A; 3TT7 A; 2NP9 A; 4NAR A; 1FC7 A; 3PGQ A; 5DU8 A; 3QXZ A; 2FBM A; 3OME A; 1NZY A; 1OD2 A; 4JCQ A; 1DUB A; 2VRE A; 2W3P A; 2UZF A; 5INI A; 4ZDD A; 3LAO A; 4J2U A; 3JU1 A; 4DI1 A; 3U9R B; 2A7K A; 3T88 A; 5E0S H; 5DL1 A; 2PPY A; 5IKL B; 2ZQR A; 5CTB A; 3R9T A; 3GKB A; 3R9Q A; 3RSI A; 5DUC A; 4FB8 A; 4U0G A; 5DU4 A; 3SWX A; 3H0J A; 1UYV A; 4U1A A; 4I42 A; 3M6N A; 4U0G H; 3G64 A; 1UYS A; 3TT6 A; 3H81 A; 5JBW A; 3KTG A; 4IZB A; 3R6H A; 3BPP A; 3P5M A; 3PEA A; 5DZK H; 5MGB A; 1RJN A; 1HNO A; 3GMA A; 4JFC A; 5HUQ A; 1WDK A; 5G1S A; 4ZDF A; 4GM2 A; 5DKP A; 4JOT A; 4QIJ A; 1XX4 A; 3IBB A; 2IEX A; 1MJ3 A; 1UIY A; 2Q34 A; 3GF7 A; 3RST A; 4HDT A; 2J5G D; 4GHN A; 4NNQ A; 1TG6 A; 3TZ3 A; 4OMR A; 3I47 A; 3ZW8 A; 4EMP A; 5KDR A; 4ZDB A; 3OT6 A; 1HZD A; 4K2N A; 3P2L A; 3R0O A; 2VSS F; 4QII A; 2VSU A; 3R9S A; 2YJG A; 1HNU A; 4U0H A; 4RCN A; 3IAV A; 2DEO A; 4Z0M A; 2CBY A; 2F9I A; 4U19 A; 3TLF A; 3ST9 A; 3LKE A; 1FCF A; 4ASI A; 3PE8 A; 5ING A; 4F47 A; 5KDR B; 2HW5 A; 2A81 A; 4IZD A; 1EF9 A; 2Q35 A; 3QYR A; 3Q7H A; 4MI2 A; 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3Q1T A; 3NJB A; 1JXZ A; 1UYT A; 1X0U A; 4QFE A; 3WG5 A; 1FC9 A; 5INF A; 2D3T A; 2GTR A; 1EY3 A; 3L3S A; 3QK8 A; 1Q52 A; 3V5E A; 3T3W A; 2ZL3 A; 4FND A; 1O8U A; 5E0S A; 4FZW A; 1ON9 A; 2F6Q A; 3HP0 A; 4NEK A; 2F6I A; 4JSB A; 2ZL2 A; 1WDM A; 5CTC A; 3KTI A; 1NZY B; 4U18 A; 2BZR A; 4JYL A; 3T89 A; 2VSS A; 3NJD A; 3ZWA A; 4L8K A; 4OG1 A; 3STA A; 4WYO B; 3SLL A; 5FIF A; 2PG8 A; 4L6W A; 3U9T B; 2ZL0 A; 3TVU A; 1OD4 A; 2VSU F; 4G2R A; 4B3H A; 3KTH A; 3BF0 A; 1VRG A; 1K39 A; 4KWB A; 4B3I A; 3MOY A; 3GLM A; 1UYR A; 5DZK A; 3ZWB A; 3KTK A; 2J5S A; 3T8B A; 1N6E A; 3K8X A; 4K3W A; 4FNB A; 4RYF H; 4LK5 A; 4OLQ A; 3HLN 1; 1N6D A; 3ZW9 A; 3GF3 A; 3U9S B; 3MYB A; 4Q0G A; 5FUS A; 3H0U A; 4FN8 A; 2FW2 A; 3V5I A; 2QQ3 A; 2X58 A; 5C90 A; 5DU6 A; 4JVT A; 3ISA A; 2DUB A; 2VSU E; 3TVW A; 1EF8 A; 4MXI A; 4JJT A; 4KD6 A; 3PZK A; 4ZDC A; 3TT7 A; 2NP9 A; 4NAR A; 1FC7 A; 3PGQ A; 5DU8 A; 3QXZ A; 2FBM A; 3OME A; 1NZY A; 1OD2 A; 4JCQ A; 1DUB A; 2VRE A; 2W3P A; 2UZF A; 5INI A; 4ZDD A; 3LAO A; 4J2U A; 3JU1 A; 4DI1 A; 3U9R B; 2A7K A; 3T88 A; 5E0S H; 5DL1 A; 2PPY A; 5IKL B; 2ZQR A; 5CTB A; 3R9T A; 3GKB A; 3R9Q A; 3RSI A; 5DUC A; 4FB8 A; 4U0G A; 5DU4 A; 3SWX A; 3H0J A; 1UYV A; 4U1A A; 4I42 A; 3M6N A; 4U0G H; 3G64 A; 1UYS A; 3TT6 A; 3H81 A; 5JBW A; 3KTG A; 4IZB A; 3R6H A; 3BPP A; 3P5M A; 3PEA A; 5DZK H; 5MGB A; 1RJN A; 1HNO A; 3GMA A; 4JFC A; 5HUQ A; 1WDK A; 5G1S A; 4ZDF A; 4GM2 A; 5DKP A; 4JOT A; 4QIJ A; 1XX4 A; 3IBB A; 2IEX A; 1MJ3 A; 1UIY A; 2Q34 A; 3GF7 A; 3RST A; 4HDT A; 2J5G D; 4GHN A; 4NNQ A; 1TG6 A; 3TZ3 A; 4OMR A; 3I47 A; 3ZW8 A; 4EMP A; 5KDR A; 4ZDB A; 3OT6 A; 1HZD A; 4K2N A; 3P2L A; 3R0O A; 2VSS F; 4QII A; 2VSU A; 3R9S A; 2YJG A; 1HNU A; 4U0H A; 4RCN A; 3IAV A; 2DEO A; 4Z0M A; 2CBY A; 2F9I A; 4U19 A; 3TLF A; 3ST9 A; 3LKE A; 1FCF A; 4ASI A; 3PE8 A; 5ING A; 4F47 A; 5KDR B; 2HW5 A; 2A81 A; 4IZD A; 1EF9 A; 2Q35 A; 3QYR A; 3Q7H A; 4MI2 A; 4I4Z A; 3DOR A; 3Q0J A; 3ZWC A; 4FJW D; 2F9Y A; 2EJ5 A; 3FDU A; 4JCR A; 1SG4 A; 2VSS E; 3TDC A; 1RJM A; 5DUF A; 1Q51 A; 3QXI A; 4JWV A; 3TV5 A; 2X24 A; 3P85 A; 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