The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
76
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sequence length |
287
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structure length |
284
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Chain Sequence |
MSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
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| publication title |
Discovery of GluN2A-Selective NMDA Receptor Positive Allosteric Modulators (PAMs): Tuning Deactivation Kinetics via Structure-Based Design.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
76
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| structure length |
284
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| sequence length |
287
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-06-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 | Periplasmic binding protein-like II | ||
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 | Periplasmic binding protein-like II |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3S9L C; 3PD8 A; 4I8C A; 4OET A; 4PFY A; 2CZL A; 1ZIU A; 1MXV A; 3SET A; 1LAG E; 3G3I A; 5I2K B; 1MH4 A; 2D5W A; 1MQG A; 2NOO A; 3N94 A; 4OYV A; 4QSE A; 2V25 A; 3TKD A; 2Z23 A; 2DXY A; 2DQV A; 1M5E A; 4IY6 A; 3MPL A; 4OFJ A; 4G68 B; 3CG1 A; 4FIM A; 1ANF A; 3V5A A; 2F8D A; 1Y4C A; 2ZYO A; 4XKQ A; 3KN3 A; 3HCQ A; 2OK2 A; 4H0W A; 1B3G A; 3KZG A; 1D9V A; 4LA9 A; 4GL0 A; 1LAH E; 3DP4 A; 3G3F A; 1NMU A; 2DXR A; 3R26 A; 2XD2 A; 1EH3 A; 3BBR A; 5M2V A; 4WED A; 2OWT A; 4ND9 A; 4WXJ A; 3O66 A; 4OEN A; 4Q30 B; 2R71 A; 4U1Z A; 1FCK A; 5JTY B; 5H8N A; 2RCB A; 4KQP A; 4H8J A; 2RC8 A; 4DZ1 A; 3R6U A; 3U93 A; 3CR9 A; 3TZA A; 4TLM B; 1US5 A; 2P1S A; 4ZED A; 2F34 A; 4JSD A; 2H99 A; 4F22 A; 3MZ1 A; 3TEL A; 1Q35 A; 3LC8 A; 3FJG A; 1UTB A; 4PP0 A; 4BDN A; 4EUO A; 2Z22 A; 5CMK A; 3D4C A; 3T9X B; 4LVQ A; 4BDL A; 1SYH A; 5L9M A; 1N7X A; 4THI A; 3SEX A; 2REJ A; 2DP8 A; 1MY1 A; 2LAO A; 1B46 A; 2UYF A; 2DVC A; 1FQE A; 3KJ7 A; 1QUL A; 3WAE A; 5JEI A; 3IR1 A; 5DVJ A; 1JNF A; 3G7W A; 4RNS A; 4R9F A; 4FOR A; 1POT A; 2XXI A; 4IGT A; 2I4C A; 1PEB A; 1IZ1 A; 3MZB A; 4MFI A; 2DS9 A; 2HFB A; 2UVH A; 3MPK A; 1D4N A; 2F7A A; 4KI0 E; 1B4H A; 4QSC A; 4KYD A; 4G68 C; 2YLN A; 1P1N A; 1WVJ A; 3N6U A; 3D4G A; 4IO4 A; 5B7D A; 3CI8 A; 2G93 A; 4HS7 A; 1ZMG A; 4P0I A; 4C0R A; 1IXG A; 5L9O A; 4HW8 A; 3PPP A; 1II5 A; 5HM4 B; 2A5T B; 3QXM A; 2QS4 A; 4AB6 A; 5H8F A; 5LOM A; 3TTL A; 2O6A A; 4H67 A; 3C9H A; 3U1O A; 5DVF A; 3PUZ E; 1N0T A; 1B1X A; 1IXI A; 3O97 A; 1Y4T A; 4YKP A; 3JV9 A; 5F7V A; 5ITO A; 1QVS A; 4MBP A; 2BJJ X; 1BTJ A; 3MWB A; 4NF8 A; 3TTR A; 3VXB A; 1ZLQ A; 3RGY A; 3TEP A; 5EHM A; 3V89 B; 1MXZ A; 4H5F A; 3Q25 A; 4HCY A; 3VE1 B; 1IEJ A; 3UA8 A; 3O9P A; 1A55 A; 4KHZ E; 2Y7I A; 4DCX A; 3M3F A; 3FJ7 A; 3ZKK A; 1B3E A; 2Y7R A; 2UVG A; 4R2F A; 4NF5 B; 4EXL A; 4EF2 A; 1JW5 A; 4NWD A; 3VLU A; 3M3K A; 4R73 A; 1NKX A; 2I3V A; 3C32 A; 4LZ8 A; 3HN0 A; 1R9L A; 3MVZ A; 3N26 A; 3IOT A; 3H03 A; 2UXA A; 3K6X A; 4ESW A; 1UTH B; 4QRZ A; 3OEM A; 5BUU A; 1EZ9 A; 2ZNS A; 4EQB A; 4R6H A; 3RY3 A; 5AA2 D; 4N13 A; 1HSJ A; 3VXC A; 3THI A; 4XKR A; 1LBC A; 3DEL B; 2XX7 A; 4XTC Q; 1BP5 A; 1SBP A; 1VE4 A; 1MXY A; 4PQJ A; 1MPB A; 3PPN A; 2DWA A; 1FTM A; 2QS3 A; 1QJM A; 2XXH A; 4R6Y A; 1NH7 A; 4I1D A; 3DLN A; 2M8C A; 3MZ9 A; 3L6G A; 1ATG A; 1B5H A; 4F3S A; 2XX8 A; 3T9U A; 5CI5 A; 3T22 A; 3U72 A; 1SW5 A; 3U94 A; 4R9G A; 2E0S A; 4F2Q A; 2ESN A; 3SER A; 4ONY A; 1Y3N A; 3MVX A; 2H25 A; 1B3F A; 2O69 A; 4YKK A; 3OEK A; 1B7U A; 1A8F A; 4ZEK A; 1FQB A; 4E0X A; 3HPI A; 2GHA A; 4LUB A; 4Z0I A; 1LST A; 4JWY A; 1IXC A; 3FZV A; 3U92 A; 1GV8 A; 3HO7 A; 1NNK A; 4NF6 B; 2THI A; 4GLI A; 1EU8 A; 1QUK A; 2ZNU A; 3GZG A; 4HTG A; 3FAS A; 5ISU A; 4ESX A; 5I59 A; 3MAM A; 1VFD A; 2KLF A; 3FXR A; 1B52 A; 4H6D A; 4K3F A; 4ZEI A; 1IIW A; 5L8D A; 1URD A; 3RLF E; 2RIN A; 3OMB A; 2I49 A; 4GOT A; 3OO8 A; 4F18 A; 4RJZ A; 4U1O A; 1WDN A; 3FUZ A; 2VP1 A; 3K1P A; 2I48 A; 5CRY A; 3CFL A; 2E1S A; 1IUD A; 4OTE A; 3RT6 B; 3PMV A; 1MQD A; 2QS1 A; 1B5I A; 5I2K A; 3O2A A; 1B6H A; 3E9X A; 4NTL A; 2DE2 A; 4OHN A; 3CIJ A; 3PUY E; 2RCA A; 2VD2 A; 1XVY A; 2XHD A; 3KEI A; 4AQ4 A; 2R6G E; 1QKA A; 4G68 A; 1MY2 A; 3S2V A; 2NXO A; 1ZJL A; 4O3C A; 4ELO A; 1AMF A; 1A99 A; 1B58 A; 1MXU A; 1SW4 A; 4PFU A; 1EZO A; 5ELV A; 1FQC A; 5H8H B; 4X1B A; 3IOR A; 3G3J A; 3DM0 A; 2FYI A; 1VFE A; 2RC7 A; 3K6V A; 1MPC A; 2GH9 A; 3H6V A; 2H9B A; 1FQA A; 3IOW A; 3SDF A; 1XVX A; 2Q89 A; 4XIG Q; 4DLD A; 4OMB A; 5JTY A; 3CRB A; 1AOV A; 3IO6 A; 4NED A; 4BDO A; 2ABH A; 1SI1 A; 4GFR A; 2ZYM A; 2QS2 A; 4U21 A; 4QFK A; 4M4G A; 5CC2 A; 2O84 X; 3K1N A; 4QHQ A; 4WEP A; 1HSL A; 3S9N C; 3PGF A; 3T93 B; 2REG A; 3PMW A; 4F31 B; 4IGR A; 3GXA A; 4FE8 A; 4RY1 A; 1LAX A; 3GLB A; 2OCU A; 5EYF A; 3VV5 A; 1A40 A; 3M3L A; 3H6T A; 5H8S A; 3H6W A; 2QMX A; 4JWO A; 2I0B A; 3IB2 A; 3SEY A; 2Q8J A; 5DVI A; 3OD7 A; 1TT1 A; 3EF7 A; 3TTM A; 4OWD A; 4R75 A; 2V84 A; 1FTL A; 2HCA A; 1B0H A; 2QL3 A; 3VLV A; 4LON B; 3ECR A; 1I6A A; 3OEL A; 4YIC A; 3QUJ A; 4OFL A; 2AYS A; 3FJM A; 3QAX A; 3O6H A; 1TFD A; 3E4R A; 2ALU A; 4LAT A; 1MXW A; 1UIU A; 5AA3 A; 1AIV A; 3FV1 A; 5FHM A; 2NVU B; 4TLL B; 2D3I A; 1QKB A; 4JB7 A; 5I84 A; 3O29 A; 2UVI A; 2A5T A; 4PFW A; 2NWJ A; 1JW1 A; 1XOC A; 2F36 A; 2A5S A; 3ODB A; 1PB8 A; 3EPE A; 2DWI A; 1POY 1; 4ECF A; 3PMX A; 3IOU A; 4OXV A; 3UN6 A; 2GHB A; 3H3G A; 3ZSF A; 4G2Z A; 5CM6 A; 3KG2 A; 5AA1 A; 4PET A; 3PPR A; 3HST A; 2VGQ A; 4U23 A; 2I6E A; 2F6G A; 3OEN A; 3E13 X; 1LCT A; 4F1V A; 1PC3 A; 2HXW A; 3JZJ A; 1MY0 A; 1A8E A; 2XXQ A; 4OES A; 4F1Y A; 4GIZ A; 2QSX A; 2OZZ A; 4GXA A; 4O3B A; 4NE4 A; 1UIV A; 1TFA A; 4RK2 A; 3VLW A; 5FHO A; 1LB8 A; 3OO7 A; 3LSL A; 1GGG A; 4NF5 A; 1N04 A; 4DXU A; 2V93 A; 4OQO A; 2OWS A; 3ILT B; 3G3K A; 5TU0 A; 2DSF A; 1XC1 A; 2XXX A; 5FTH A; 1OMP A; 3HV1 A; 4LZ5 A; 3C33 A; 5HPQ A; 1DTG A; 3K2D A; 1LFG A; 3A09 A; 4U22 A; 4EQ9 A; 3E3K A; 1KWH A; 2X7P A; 1FTJ A; 4OFO A; 4UAC A; 1JEU A; 5IAI A; 1MQH A; 1UTH A; 3BFU A; 4H8I A; 3C35 A; 1M5B A; 2QRY A; 5I58 B; 2ONS A; 2GFE A; 1PBP A; 2B3F A; 3QSL A; 4QFO A; 3ILU B; 2I3W A; 3SEV A; 3PUW E; 1OIB A; 1B5J A; 3V8X B; 5K2X A; 4KR5 A; 4YZZ A; 1SI0 A; 2F78 A; 4TOZ A; 2XD3 A; 3LSW A; 5I56 B; 3B6T A; 2ZMB A; 4X1D A; 1EZP A; 4P0G A; 2XXY A; 1QW0 A; 4G8N A; 4RPN A; 4P11 A; 5DT6 A; 3W9V A; 4U4S A; 4YB6 A; 1NNT A; 4GRK A; 5H8Q B; 3KBR A; 3KGC A; 3FVN A; 5BWJ A; 4OEV A; 1S9T A; 4PFT A; 1USY E; 3TDJ A; 2XXT A; 3FVG A; 1D9Y A; 5AA4 B; 4I9D A; 5FHN A; 1M5F A; 5AA2 B; 1OQH A; 2QPQ A; 4N07 A; 4HCW A; 4BDR A; 1AH5 A; 4MLV A; 5I57 B; 1S50 A; 3V83 A; 1IXH A; 3LUY A; 4H65 A; 2FA7 A; 3Q26 A; 1MXX A; 4NF6 A; 4OVJ A; 1N76 A; 1A7L A; 5J1D A; 4QFN A; 1FW0 A; 1SQY A; 4GXS B; 1MQJ A; 2V3Q A; 3RPW A; 3DP6 A; 1LB9 A; 1MM7 A; 3RUM A; 2HAV A; 2GRV A; 4N6P A; 3TQW A; 3G3H A; 3PV0 E; 5KCJ B; 4R2B A; 4I62 A; 1B40 A; 1YCJ A; 2F97 A; 4KYE A; 4G77 A; 3T9H B; 3OO6 A; 5ICQ A; 4F29 A; 1SW1 A; 1WOD A; 1N3X A; 1XHY A; 5KDT B; 1O64 A; 1LAF E; 1CE2 A; 2AL5 A; 2O7I A; 1YAE A; 3USD A; 4EDP A; 2Y7W A; 3H6U A; 3FGS A; 3ZKL A; 1LFH A; 2DWH A; 2AIX A; 4KCC A; 2O68 A; 1P1Q A; 2PVU A; 1H44 A; 1URS A; 3FIR A; 2WKY A; 2D21 A; 2P0S A; 4BLA A; 3MBP A; 1B51 A; 2B3B A; 1HSE A; 1H76 A; 2DE3 A; 2ANJ A; 2NUV A; 4DE8 A; 1LGB C; 3MC2 A; 4JWX A; 4OEU A; 2W7Y A; 4FEC A; 2B65 A; 1NNF A; 1GR2 A; 4LQ5 A; 3WAF A; 3TQL A; 1BLF A; 4RK9 A; 3TCG A; 4G4P A; 1DMB A; 5H8H A; 5EHS A; 4ZZE A; 1NH8 A; 1P99 A; 1T0K A; 1LCF A; 1B7Z A; 3Q28 A; 4ZEF A; 1S7Y A; 3K02 A; 4DXB A; 1PB7 A; 2DE4 A; 3K4U A; 4XXU A; 3UOR A; 4U2R A; 5DEX B; 1DPP A; 3N6T A; 1R6Z A; 3BFT A; 5TP9 B; 1Y1Z A; 1FTO A; 1D3K A; 4G8H A; 4YAH X; 4F2O A; 4ZDM A; 3VVD A; 3C31 A; 3T96 B; 1TXF A; 5AE4 A; 1PB9 A; 3S9E A; 1I69 A; 3Q29 A; 2O1M A; 3K1M A; 3KOT A; 3K01 A; 4R72 A; 3MW0 A; 4WKM A; 1R1N A; 3K00 A; 1ZBM A; 3Q27 A; 1USY H; 3HHG A; 3SKP A; 2I58 A; 4RA1 A; 3RN8 A; 3PUX E; 4ZE8 A; 3IJX B; 2XX9 A; 4X48 A; 4IO2 A; 4ZZA A; 5CMM A; 1GVC A; 3EHT A; 3IL1 B; 2VOZ A; 4KCD A; 4QFL A; 2R9J A; 4YKJ A; 3OO9 A; 1CB6 A; 3VVF A; 2DWJ A; 3RTW B; 2QMW A; 3EN3 A; 5CBS A; 2ONK E; 4Z7E A; 3G3G A; 3LR1 A; 1ZTY A; 3R7X A; 2HZL A; 3KJT A; 4EXK A; 4R74 A; 4C1T A; 5TPA B; 3AXF A; 4F3P A; 4F3B A; 3O6G A; 4OER A; 3K0V A; 4F3G A; 2HQ0 A; 4NF4 B; 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