5L99A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with 3-amino-2-methylpyridine derivative 6
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Derivatives of 3-Amino-2-methylpyridine as BAZ2B Bromodomain Ligands: In Silico Discovery and in Crystallo Validation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5l99A00
4NR5A 5A5PA 3P5OA 5EWVA 4O7EA 4QEVA 5FE0A 5DYCA 3U5PA 3I3JA 5CTLA 3DAIA 4HBYA 5CRZA 5DYUA 4OGJA 5EPRA 5F1LA 5E3GA 5IIDA 4A9HA 5CU8A 5A85A 5EWWA 4QR5A 5KTWA 3LQIA 4QEWA 4IR6A 5LVRA 4MEPA 5FBXA 2YELA 5F61A 5LJ1A 5EK9A 5F2PA 5AD2A 3FKMX 4ALGA 2I8NA 4YYKA 3JVMA 5FE2A 4RVRA 4HXPA 4QC1A 2FSAA 4UYFA 5CQ7A 5LJ2A 4XYAA 5A82A 5LKXA 5D24A 5K29A 5E7DA 3O36A 2RS9B 4QSWA 5F36A 4TTEA 5EM3A 2LSPB 4YK0A 5A5NA 5HRWA 1JSPB 5EV9A 4YATA 3JVJA 5ENBA 5HFQA 5LKUA 5ENHA 4O7BA 4UIWA 3LQJA 2WP2A 4A9MA 4BW3A 2YDWA 4QUUA 5I89A 3UVYA 4LDFA 4YYNA 3SVGA 4TU6A 5L98A 4HBVA 5EQ1A 4J1PA 5TCMA 5CUCA 2WP1A 4UIZA 4Z1QA 5J0DA 2DVQA 4MEOA 5E9KA 4HXMA 4WHWA 3K2JA 4CUPA 4YBSA 5HM0A 4QYDA 3ZYUA 5IGNA 5CFWA 5F60A 4TS8A 4IOQA 4YH3A 1EQFA 4J3IA 4Z6HA 5DYXA 1F68A 2I7KA 5CQTA 5KU3A 3MQMA 4UITA 5EA1A 5IBNA 5FB1A 1X0JA 5EWHA 5FE1A 3JVKA 4J0RA 4O70A 4MR4A 3UV2A 4CL9A 4QBMA 2DWWA 4NUCA 4A9FA 2DATA 4O76A 4PCEA 4ZW1A 4Z93A 2RNXA 3UV4A 4KCXA 5E9MA 2H60A 5H1TA 5D3HA 3O33A 4HXRA 5A81A 5E9IA 4NR9A 5AMEA 3LJWA 5A5QA 4YYIA 4NXJA 4O72A 1ZS5A 4CLBA 5I40A 2R0SA 5FH7A 3U5OA 5IGLA 4QSXA 5CQ6A 5EICA 5I7YA 4LYSA 3LXJA 5DY7A 3U5JA 5L96A 5FB0A 3QZTA 3Q2EA 3SVFA 2G4AA 4YY6A 4N3WA 3SVHA 4NUEA 4UYFB 5HFRA 5G4SA 2R10A 5FE3A 4NRBA 5CUGA 5DKDA 2RNYA 4CURA 4WHUA 4OGIA 5ENFA 4IR4A 5E9YA 5D26A 5L97A 5A83A 4YAXA 2F6NA 5HQ6A 4QSSA 5ACYA 4TQNA 4KV4A 4XY9A 4YBMA 4QUTA 5L8TA 2YYNA 4NS5A 5F1HA 5EWDA 5KTXA 5ENGA 4E96A 5IGMA 2E3KA 2R0VA 5C89A 3UVXA 3QZSA 4AKNA 4LYWA 4PTBA 4MR3A 5FFVA 2OSSA 4CFKA 4NR8A 3QZVA 1N72A 4Q0NA 4YADA 3UVWA 4BW2A 4NQNA 5IG6A 5II2A 4WIVA 3U5KA 4O7AA 4QSUA 5DFBA 4N4IA 2KTBB 2GRCA 5FFWA 4TT6A 5DX4A 5DW1A 2N9GA 4UIVA 4O77A 3S91A 4FLPA 3S92A 4NYVA 4QSRA 5IGKA 4O7FA 2MJVB 5L8UA 5LKZA 4HXLA 4MR6A 5D3JA 5I86A 5CQ4A 5DBMA 4HXKA 4KV1A 5HRVA 2RI7A 5D3NA 4YC9A 5I7XA 3P1EA 4LYIA 3RCWA 4NRCA 5CUBA 4BJXA 3U5MA 4NRAA 2E7OA 5FDZA 4YY4A 4QSVA 4YYGA 3IU5A 2DVRA 4UIYA 4LZSA 5HQ5A 4QC3A 3U5LA 5F25A 5KTUA 4BW4A 5A5SA 3AQAA 4QSPA 3UVDA 5I80A 5HRXA 3Q2FA 2D9EA 5EPBA 5HCLA 5A5RA 1WUGA 3NXBA 5E3DA 4YYJA 4CUTA 4O78A 4XUAA 5EU1A 4C67A 4A9IA 3G0JA 5LUUA 5CQAA 5BT4A 4HBXA 5EP7A 3MB3A 4LZRA 4YBTA 4HXSA 3MB4A 5CUDA 3GG3A 3HMHA 5DFCA 5DKCA 4CUUA 5DFDA 5KO4A 4ALHA 5LKTA 3O37A 3DWYA 4PY6A 4BHWA 4QY4A 5I1QA 5EGUA 4F3IA 4QB3A 3UW9A 4CUSA 3P1CA 2OO1A 2RNWA 5D7XA 3HMEA 5C8GA 4IR5A 5D3TA 5FE8A 3ONIA 4YH4A 5CRMA 5EISA 4LC2A 5KHMA 2L84A 4CFLA 2NXBA 2E7NA 4QNSA 4HXOA 4UYGA 5CS8A 5E74A 4MR5A 4N4FA 4QYLA 5D3PA 2YEKA 4ZC9A 5FH6A 3AADA 4HXNA 4QZSA 3UV5A 4A9LA 2RO1A 4UIUA 5FH8A 5LVQA 3MUKA 3P1FA 5F63A 5CQ8A 2DVVA 5D3RA 3LQHA 5A5OA 5CZGA 4N4HA 4YYHA 5F3AA 4X2IA 2R0YA 4A9JA 5ENJA 4A9NA 5FFYA 5BT3A 4IOOA 4QEUA 5DLZA 5EPSA 5HELA 5I83A 2OUOA 5D3SA 5E9LA 4QSQA 2L5EA 5E73A 4BW1A 5CGPA 3O35A 5CPEA 3MULA 4O7CA 2DVSA 5E0RA 5FE5A 5I29A 4A9EA 3G0LA 5HQ7A 4ZQLA 4PKLA 4QSTA 5D0CA 4CUQA 1JM4B 4LRGA 4O75A 5H1UA 4J0SA 5D3LA 5DYAA 4DONA 5G4RA 5BT5A 5CUAA 4MENA 4TU4A 2L85A 4IR3A 4Y03A 5C4QA 5FE7A 5CP5A 4Q0OA 4TT2A 3P1DA 5JWMA 3JVLA 5FE9A 4NYWA 5DKHA 4A9OA 5F62A 4MEQA 5EVAA 5FG6A 4UYEA 4TZ8A 5FG4A 2DKWA 4OUFA 4YYDA 5D25A 5ETDA 2YW5A 4Z6IA 5L99A 5CY9A 5C85A 4C66A 4O74A 5ENCA 4UYHA 2YQDA 2F6JA 4O71A 5A7CA 5CQ5A 5H85A 4GPJA 5ENEA 5FE6A 4UIXA 1E6IA 3D7CA 4UYDA 4N4GA 5DLXA 4YABA 4TT4A 4NYXA 5DW2A 4PS5A 4YYMA 2RFJA 5HJCA 5II1A 5CUEA 5HEMA 4TZ2A 4TYLA 3HMFA 5C7NA 5EI4A 4PCIA 4NR6A 4IORA 4NR7A 5I88A 3U5NA 4QR4A 5FE4A 3MXFA 5H1VA 4A9KA 4Z1SA 4QR3A 5HLSA 5E9VA 2D82A 5COIA 4XY8A 5AMFA 5ETBA 1WUMA 5EWCA 5TB6A 3TLPA 5JI8A 5AD3A 4XUBA 3O34A 5HENA 4NR4A 4NUDA 5C87A 4HBWA 5CQ3A 2YEMA 4LZ2A 5FG5A 4LR6A 5LJ0A 3IU6A 5F5ZA 4NQMA 5ENIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NR5A 5A5PA 3P5OA 5EWVA 4O7EA 4QEVA 5FE0A 5DYCA 3U5PA 3I3JA 5CTLA 3DAIA 4HBYA 5CRZA 5DYUA 4OGJA 5EPRA 5F1LA 5E3GA 5IIDA 4A9HA 5CU8A 5A85A 5EWWA 4QR5A 5KTWA 3LQIA 4QEWA 4IR6A 5LVRA 4MEPA 5FBXA 2YELA 5F61A 5LJ1A 5EK9A 5F2PA 5AD2A 3FKMX 4ALGA 2I8NA 4YYKA 3JVMA 2EJNA 5FE2A 4RVRA 4HXPA 4QC1A 2FSAA 4UYFA 5CQ7A 5LJ2A 4XYAA 5A82A 5LKXA 5D24A 5K29A 5E7DA 3O36A 2RS9B 4QSWA 5F36A 4TTEA 5EM3A 2LSPB 4YK0A 5A5NA 5HRWA 1JSPB 5EV9A 4YATA 3JVJA 5ENBA 5HFQA 5LKUA 3VKGA 5ENHA 4AKIA 4O7BA 4UIWA 3LQJA 2WP2A 4A9MA 4BW3A 2YDWA 4QUUA 5I89A 3UVYA 4LDFA 4YYNA 3SVGA 4TU6A 4AKHA 5L98A 4HBVA 5EQ1A 4J1PA 5TCMA 5CUCA 2WP1A 4UIZA 4Z1QA 5J0DA 2DVQA 4MEOA 5E9KA 4HXMA 4WHWA 3K2JA 4CUPA 4YBSA 5HM0A 4QYDA 3ZYUA 5IGNA 3ERRA 5CFWA 5F60A 4TS8A 4IOQA 1ZKRA 1EQFA 4J3IA 4YH3A 4Z6HA 5DYXA 1F68A 2I7KA 5CQTA 5KU3A 3MQMA 4UITA 5EA1A 5IBNA 5FB1A 1X0JA 5EWHA 5FE1A 3JVKA 4J0RA 4O70A 4MR4A 3UV2A 4CL9A 4QBMA 2DWWA 4NUCA 4A9FA 2DATA 4O76A 4PCEA 4ZW1A 4Z93A 2RNXA 3UV4A 4KCXA 5E9MA 2H60A 5H1TA 5D3HA 3O33A 4HXRA 5A81A 5E9IA 4NR9A 5AMEA 3VKHA 3LJWA 5A5QA 4YYIA 4NXJA 4O72A 1ZS5A 4CLBA 5I40A 2R0SA 5FH7A 3U5OA 5IGLA 4QSXA 5CQ6A 5EICA 5I7YA 4LYSA 3LXJA 5DY7A 3U5JA 5L96A 5FB0A 3QZTA 3Q2EA 3SVFA 2G4AA 4YY6A 4N3WA 3SVHA 4NUEA 4UYFB 5HFRA 5G4SA 2R10A 5FE3A 4NRBA 5CUGA 5DKDA 2RNYA 4CURA 4WHUA 4OGIA 5ENFA 4IR4A 5E9YA 5D26A 5L97A 5A83A 4YAXA 2F6NA 5HQ6A 4QSSA 5ACYA 4TQNA 4KV4A 4XY9A 4YBMA 4QUTA 5L8TA 2YYNA 4NS5A 5F1HA 5EWDA 5KTXA 5ENGA 4E96A 5IGMA 2E3KA 2R0VA 5C89A 3UVXA 3QZSA 4AKNA 4LYWA 4PTBA 4MR3A 5FFVA 2OSSA 4CFKA 4NR8A 3QZVA 1N72A 4Q0NA 4YADA 3UVWA 4BW2A 4NQNA 5IG6A 5II2A 4WIVA 3U5KA 4O7AA 4QSUA 5DFBA 4N4IA 2KTBB 2GRCA 5FFWA 4TT6A 5DX4A 5DW1A 2N9GA 4UIVA 4O77A 3S91A 4FLPA 3S92A 4NYVA 4QSRA 5IGKA 4O7FA 2MJVB 5L8UA 5LKZA 4HXLA 4MR6A 5D3JA 5I86A 5CQ4A 5DBMA 4HXKA 4KV1A 5HRVA 2RI7A 5D3NA 4YC9A 5I7XA 3P1EA 4LYIA 3RCWA 4NRCA 5CUBA 4BJXA 3U5MA 4NRAA 2E7OA 5FDZA 4YY4A 4QSVA 4YYGA 3IU5A 2DVRA 4UIYA 4LZSA 5HQ5A 4QC3A 3U5LA 5F25A 5KTUA 4BW4A 5A5SA 3AQAA 4QSPA 3UVDA 5I80A 5HRXA 3Q2FA 2D9EA 5EPBA 5HCLA 5A5RA 1WUGA 3NXBA 5E3DA 4YYJA 4CUTA 4O78A 4XUAA 5EU1A 4C67A 4A9IA 3G0JA 5LUUA 5CQAA 5BT4A 4HBXA 5EP7A 3MB3A 4LZRA 4YBTA 4HXSA 3MB4A 5CUDA 3GG3A 3HMHA 5DFCA 5DKCA 4CUUA 5DFDA 5KO4A 4ALHA 5LKTA 3O37A 3DWYA 4PY6A 4BHWA 4QY4A 5I1QA 5EGUA 4F3IA 4AKGA 4QB3A 3UW9A 4CUSA 3P1CA 2OO1A 2RNWA 5D7XA 3HMEA 5C8GA 4IR5A 5D3TA 5FE8A 3ONIA 4AI6A 4YH4A 5CRMA 5EISA 4LC2A 5KHMA 2L84A 4CFLA 2NXBA 2E7NA 4QNSA 4HXOA 4UYGA 5CS8A 5E74A 4MR5A 4N4FA 4QYLA 5D3PA 2YEKA 4ZC9A 5FH6A 3AADA 4HXNA 4QZSA 3UV5A 4A9LA 2RO1A 4UIUA 5FH8A 5LVQA 3MUKA 3P1FA 5F63A 5CQ8A 2DVVA 5D3RA 3LQHA 5A5OA 5CZGA 4N4HA 4YYHA 5F3AA 4X2IA 3D1DA 2R0YA 4A9JA 5ENJA 4A9NA 5FFYA 5BT3A 4IOOA 4QEUA 5DLZA 5EPSA 5HELA 5I83A 2OUOA 5D3SA 5E9LA 4QSQA 2L5EA 5E73A 4BW1A 5CGPA 3O35A 5CPEA 3MULA 4O7CA 2DVSA 5E0RA 5FE5A 5I29A 4A9EA 3G0LA 5HQ7A 4ZQLA 4PKLA 4QSTA 5D0CA 4CUQA 1JM4B 4LRGA 4O75A 5H1UA 4J0SA 5D3LA 5DYAA 4DONA 5G4RA 5BT5A 5CUAA 4MENA 4TU4A 2L85A 4IR3A 4Y03A 5C4QA 5FE7A 5CP5A 4Q0OA 4TT2A 3P1DA 5JWMA 3JVLA 5FE9A 4NYWA 5DKHA 4A9OA 5F62A 3D1BA 4MEQA 5EVAA 5FG6A 4UYEA 4TZ8A 5FG4A 2DKWA 4OUFA 4YYDA 5D25A 5ETDA 1PUOA 2YW5A 4Z6IA 5L99A 5CY9A 5C85A 4C66A 4O74A 5ENCA 4UYHA 2YQDA 2F6JA 4O71A 5A7CA 5CQ5A 5H85A 4GPJA 5ENEA 5FE6A 4UIXA 1E6IA 3D7CA 4UYDA 4N4GA 5DLXA 4YABA 4TT4A 4NYXA 5DW2A 4PS5A 4YYMA 2RFJA 5HJCA 5II1A 5CUEA 5HEMA 4TZ2A 4TYLA 3HMFA 5C7NA 5EI4A 4PCIA 4NR6A 4IORA 4NR7A 5I88A 3U5NA 4QR4A 5FE4A 3MXFA 5H1VA 4A9KA 4Z1SA 4QR3A 5HLSA 5E9VA 2D82A 5COIA 4XY8A 5AMFA 5ETBA 1WUMA 5EWCA 5TB6A 3TLPA 5JI8A 5AD3A 4XUBA 3O34A 5HENA 4NR4A 4NUDA 5C87A 4HBWA 5CQ3A 2YEMA 4LZ2A 5FG5A 4LR6A 5LJ0A 3IU6A 5F5ZA 4NQMA 5ENIA
chains in the Genus database with same CATH topology
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