5LNKe

Entire ovine respiratory complex i
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
LGLREIRIHLCQRSPGSQGVRDFIEKRYVELKKANPDLPILIRECSDVQPKLWARYAFGQEKNVSLNNFSADQVTRALENVLSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Mitochondrial complex I, 51 kDa subunit
publication title Atomic structure of the entire mammalian mitochondrial complex I.
pubmed doi rcsb
total genus 19
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
e PF05047 L51_S25_CI-B8 Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5lnke00
3IV4A 3UEMA 3A3TA 4MCUA 3D4MA 2I4AA 2VO4A 2YWNA 5B7CA 2VCXA 5ECSA 1XFLA 10GSA 5DVBA 4YQMA 1VF2A 5F8BA 4ZB6A 2TIRA 2YNXA 4HJ2A 5J3RA 2VL2C 1BAYA 3MWHA 3VURA 13GSA 1TI3A 2A2RA 3UARA 3ERWA 1NW2A 8GSSA 1IYHA 1SYRA 4TVEA 3ZRDA 1A0FA 1XWBA 3ME8A 3E3EA 3KZQA 3N5OA 4XTSA 5JCWA 3GN3A 4HZ2A 5E4WA 5HR3A 5J9BA 2CX4A 3TJKA 2R2JA 2LTKA 3IK9A 4GCIA 1PX7A 5ECOB 2H0IA 4FYUA 4FYCA 1EP7A 2X99A 4G19A 2OA7A 1SJIA 1J9BA 4IBPA 2EIOA 3GHAA 1U88A 5ECRB 4NAXA 3D22A 3ZZXA 3NIVA 3KXOA 4WBJA 3IDVA 4XHMA 5DCHA 4GWRA 2VOCA 1Z3EA 5G30A 2FD3A 3CXGA 3GTUA 3DRNA 4XS1A 5D9XA 2VL3A 3QFBC 1XBSA 9GSSA 1WPIA 5JCUA 2OKAA 4MK3A 4JR6A 5ECQB 3CSHA 3GTUB 4IW9A 3WD6A 1R4WA 1Z7RA 4KW6A 1TRVA 4MZWA 4JRRA 1PMTA 1FOVA 3P90A 4EF0A 1AC1A 1KBNA 4H86A 2OE3A 3BOAA 1THXA 2FGXA 4OWYA 3EC3A 1ERVA 2PUKC 4N0ZA 2GGTA 4F2IA 4MF5A 4PUFC 5IMAA 2LV3A 3HJOA 1A24A 1OYJA 2HZEB 2L4QA 3VPTA 1XCCA 2HE3A 2AYTA 1EEJA 3KJYA 4Q5QA 3S9FA 5B6MA 4FH8A 1MTCA 1TDIA 2LNTA 3MDKA 5B8BA 3GH9A 1QMVA 1T4YA 2VD1A 17GSA 4MH3A 2YV9A 3RDWA 4MPGA 2F8AA 3HD5A 4GLTA 3WGXA 1SKWB 2L57A 2MZCA 1T00A 2NPBA 3F4TA 3ZTLA 1JZRA 1MD4A 3TOUA 3LORA 3C1SA 4E8EA 2FUG2 3LEFA 4HEA2 2YOIA 3KD0A 3UBKA 3FRCA 3GSTA 3P8WA 3CTFA 3F4SA 2R37A 3HJMA 4GSNA 4ECBA 1ERTA 2FA4A 5IMDA 3QAGA 2IMEA 3WYWA 4G2EA 2CT6A 2YJHA 1V58A 5ECKB 3RHBA 1B4PA 5AGYA 4MP4A 2GSRA 4GQFA 1EOGA 3KH9A 3GMFA 1JZWA 5A4WA 2MMZA 2VCTA 2CVBA 4OCFA 3TRXA 4TXVA 2LS5A 5DBQA 2VCZA 3DYRA 3IXRA 2ES7A 5HFKA 1FAAA 3F4RA 4HQSA 1B4QA 3KP9A 1PL1A 1Z9HA 4K7NA 1YKAA 2YCDA 3QD9A 3CBUA 3DKSA 3QCPA 2H76A 3IHQA 3P7XA 2CAQA 2PGTA 2LKUA 3QAVA 5D8IA 2GT6A 3I9V2 4WF5A 4WF4A 2BJXA 1PKWA 4RUVA 2C80A 2FY6A 1SK2A 1T8EB 4WR4A 2JZSA 4PNGA 1GH2A 1JZDA 1J0FA 1GLQA 4HZ4A 2OADA 1PKZA 3GKNA 2C4JA 1TK0B 1ZYEA 3E9JB 1O81A 3I69A 4IJ3A 1U87A 3EYTA 2GSTA 1FB6A 1K0MA 3FY7A 3GKMA 1XXUA 4K0GA 4POLA 4JEDA 2H71A 2OACA 1M9BA 3LQ7A 3U5RE 14GSA 1HNAA 4KDUA 3HVSA 1AUCA 4CW9A 2HNLA 1SKSB 2CX3A 4KE3A 3DIEA 4WR5A 3EURA 4HUAA 3EINA 3VLNA 1B9YC 2JSYA 3TRQA 5AIXA 1E2YA 2H66A 1JFUA 2G0FA 4TOPA 2WS2A 1HYUA 1Z6MA 1GSSA 5IPGA 2M72A 1U6TA 1O85A 3D5JA 2HZFA 2X64A 3WGEA 5JWOB 2NBSA 1MEKA 3TKSE 1K0NA 4ZB9A 1DUGA 2AB6A 4JZQA 1A2LA 2LQOA 2C1YA 3KMOA 1XWAA 4ZL8A 1NM3A 5CAXA 2A4VA 4ZL9A 2LJAA 2GT5A 4AJ8A 2C8UA 2FWHA 2M46A 1SK0A 6GSTA 4IELA 2XC2A 5F06A 1GNEA 4TR0A 3ISOA 2XBIA 1EGOA 3D4TA 3H1NA 5DAKB 2R6KA 4LMVA 1FVKA 4WXTA 1YF1A 4ZL7A 3TB2A 4BWQA 3FYGA 2CV4A 4BA7A 3WT2A 1FW1A 5EVOA 1M2DA 1M9AA 2BTOT 2H8LA 2N5BA 3L0HA 3ZMKA 2F3MA 3BJ5A 2HRNA 2B5XA 4K7OA 4TW5A 1FO5A 2CAIA 3O6TA 2KUCA 1OE8A 5INYA 5ID2A 4MPFA 2IJYA 3VWWA 4MF6A 5ELGA 1ZMAA 3P2AA 1N8JA 4GRFA 1YF0A 1QUWA 1XW9A 2RM6A 5ID2B 1O8XA 1ML6A 2OBIA 5IIZA 2FNOA 2B5EA 4QL7A 4ACSA 2PU9C 1V98A 4J2FA 5KN1A 3SBCA 1NHOA 5IMCA 4EL1A 2ON7A 4ZBAA 2JZRA 2B1KA 1XW5A 4GSSA 1Q4JA 1XWKA 1TRWA 1I5GA 4NMUA 4ILFA 2G2QA 5FWGA 1M2BA 1WE0A 1TOFA 3PINA 4MDCA 5G1LA 2IMDA 1YEXA 3HCZA 1K0OA 5B6NA 3AY8A 1GNWA 3HKRA 3ZREA 2L4CA 2B7JA 2YZUA 2GVPA 3DMLA 4OO5A 3D0ZA 3Q19A 2H0HA 3QAWA 4KH7A 1NSWA 4AJ6A 2DJKA 3W6GA 3UVHA 3L9UA 5F07A 3N9JA 5H5QA 4QQ7A 22GSA 5E59A 2WFCA 1SJZA 3TKPA 3TUEA 2CZ2A 4XCSA 3UIWA 2H1GA 3FK8A 1U3IA 3R2QA 4L0WA 2A2SA 1LU4A 1ACVA 4V1Ap 1AIUA 1JHBA 5A4VA 1WRYA 3HVVA 3HVXA 4TR3A 3L4NA 1XVQA 6GSYA 16GSA 3DD3A 5CO3A 5J5NA 4N11A 2AJQB 2J9HA 4MMMA 3KTLA 2L6DA 2O8VB 4I8BA 2X8CA 3HZ8A 1T7PB 2X8HA 3ERFA 1X5EA 3LXZA 2GS3A 4EVMA 2DMLA 4JE1A 2P5RA 1GL8A 3W8JA 4F9ZA 5EY6A 3CSIA 1MD3A 2P5QA 4BVXA 5KEJA 1F6MC 1K3LA 1EV4A 4J56E 3UOMA 1RK4A 5J4UA 3IRAA 4HS1A 6GSWA 2GDRA 2H73A 4NPBA 1DE2A 2B5YA 4RQRA 1VF4A 5ECPB 4POKA 5ENUA 4KA0A 2HFDA 6GSVA 3KTBA 2IWTA 4ZBDA 2DSAA 1O73A 1ERUA 3GYKA 1A8LA 4G10A 3EU3A 5HFGA 2CZ3A 1ZYQB 2VD0A 5HR1A 1DBYA 3FZAA 1TI1A 2IMFA 1TRSA 3UJ1A 4OFMA 2H19A 4O5RA 4IP6A 1URMA 2J23A 3ZVJA 2GQLA 4EUYA 2GTUA 1Z5YE 4RQXA 2VM2A 4MLYA 2KP1A 2ON5A 3RAZA 1THOA 3Q74A 4D73A 1J08A 1DE1A 4IVFA 2VLTA 3EVIA 3PGTA 4K6XA 5JWRB 2O87A 3U6VA 2HSHA 3W8SA 1H4OA 2D2ZA 2PVOC 1X9MB 3VPQA 4D73B 4DSQA 1UC7A 1G7OA 5DJMA 1GSUA 3CMIA 1TW9A 4KSOA 19GSA 1ZZYA 5D96A 3CRUA 2IPAA 5IO2A 1YEPA 2TRXA 1K0CA 2YPMA 1AAZA 4IJIA 1Z7PA 2FLSA 2RUFA 3JCML 1PQNA 3APOA 5IO0A 1M7TA 1QFNA 1UVZA 1SD8A 3ME7A 1GSYA 2V2GA 2ZNMA 2IL3A 4HDEA 1TU8A 1LJRA 3DWVA 3UBLA 2DC5A 1EV9A 2LNSA 1JLVA 1GUHA 1GSFA 4V2LA 2H1DA 3FZ5A 1XWCA 4NXIA 2LRCA 5F0GA 3ED3A 4WETA 4DEJA 5G5FA 1FG4A 2L59A 3GURA 2AV4A 2F8FA 3A2WA 5LCZA 2ZUPA 4Q5RA 1W4VA 2V6OA 12GSA 2DJJA 4KX4A 2EIRA 2GQKA 4TRXA 4WEYA 3VWUA 4ECJA 3IBHA 3H93A 4RI7A 4LLRA 5ECHB 2KHPA 1BX9A 2YJ7A 2H1BA 1SENA 4POMA 2GLRA 2KLXA 1OKDA 4O32A 2HRFA 5GSTA 1OVNA 4HU7A 1BG5A 3FKFA 1OE7A 1Y6EA 4PNFA 4FIWA 2CVDA 4CDOA 1GRXA 4YH2A 5GSSA 1K0BA 5A4UA 4PURA 3C1RA 4ZILA 4PGTA 2H30A 1LBKA 2DJ1A 4HQZA 2WULA 4WKWA 3LWAA 1ZL9A 2QC7A 1BJXA 4HU9A 2MBSA 5COHA 2H75A 1GSDA 3EMXA 4EKZA 4HJMA 2FHEA 1A2MA 2K9FA 4GF0A 2WRTA 3BD2A 3J7Yk 3KH7A 2OE1A 2RIIA 1SL0B 1GTIA 1GTAA 2JU5A 3G7IA 1PL2A 2YZHA 5HQPA 5IMVA 2E2MA 4BWSA 2B7KA 2L5LA 4XRAA 2K8SA 5EPFA 5D9VA 3KEBA 2JL4A 1HQOA 3TGZA 3FR6A 2LRTA 4XIHA 1OC3A 2C3TA 3C8EA 5CNWA 3GKKA 4I97A 4KSMA 2AAWA 1XPVA 1EZKA 2RUEA 2IFQA 4KUNA 3M8NA 1CQGA 2PBJA 1TXXA 4ID0A 1Z6NA 1A2JA 4IQ1A 4X0XA 5JCGA 2IFQB 4KCEA 2GZPA 3L9VA 1HD2A 1GSEA 3M9JA 4AGSA 3BBYA 3H79A 1OAZA 3LYKA 4N30A 2PWJA 1X9WB 4YAPA 3DVWA 5ECIB 3UVTA 2H6ZA 1AQVA 2QGVA 4N0VA 4K7IA 1VF3A 2V41A 2VCQA 3TKRA 4NHWA 1SYXA 3UAPA 4TXOA 3ZFBA 1FHEA 1M2AA 2LRNA 4OFTA 11GSA 20GSA 2HLSA 3A5WA 2H70A 3GL3A 2M80A 3C71A 4TXOB 6GSXA 3TCOA 4ISDA 3D6IA 4OO4A 1G0TA 2HSYA 1XVWA 2JADA 3FW2A 4I2TA 2MBTA 1B9XC 1ST9A 2PVQA 1CQHA 1DSBA 4TKYA 1O6JA 2E7PA 3NOFA 1USBA 1ZGNA 1TP9A 2I1UA 2HYXA 5G31A 1IYIA 3TJJA 4MA9A 1PA3A 3E0UA 5IMFA 3CSJA 2NVLA 3MSZA 1A23A 4NHZA 2AHEA 4OCEA 3FZ9A 4LA1A 5JWQB 2WCIA 2PPTA 1YZXA 2CQ9A 5ELAA 1F37A 4LL1B 2WJUA 1YJ6A 2VAFA 3EE2A 1BQ7A 4ZB8A 3ZLPA 4GTUA 1Y25A 1HNBA 4GSTA 1AW9A 3VI5A 3J7Yb 1WMJA 3TKQA 5DCGA 3G9BA 2C0GA 2HT9A 1WWJA 1AQWA 4PQ1A 1Q98A 3HHVA 4PUAA 3BCKA 2DIYA 2FA8A 4ULXA 4BPYA 2FWFA 3KIJA 5G1KA 1JZOA 1SD9A 3EWLA 5CREA 1R5PA 1EP8A 2YWIA 4WBRD 4KDYA 2WGRA 4MJAA 1OC9A 4DVCA 1OKTA 2XPDA 1BEDA 4KCAA 4KDXA 2KOKA 2DIZA 1V40A 1A8YA 2MMOA 5DALA 2EC4A 1OC9B 3WT1A 3IOSA 3LFLA 4MZBA 4E8HA 3LJRA 1KEBA 1B8XA 2OBKA 3HDCA 3TOTA 4LL4B 2VM1A 3KP8A 2LEGA 1QXHA 3F9UA 4V1Ag 4PQHA 3HY2A 4TR1A 3Q6OA 1S3CA 2YWMA 4K1FA 5ECLB 3EMPA 7GSSA 4G9HA 4TR1B 2H72A 3LG6A 4YAVA 4F82A 5J9CA 4MH2A 4ZIJA 5D73A 2C0DA 4NV2A 6GSUA 1C72A 2WZ9A 1EOHA 2O85A 3M0FA 4L0UA 2N5FA 1WOUA 3DVXA 2GSQA 1MDIA 4JU5A 4POBA 1M0UA 3HZ4A 5KN0A 3KCMA 3VWVA 1MDKA 1JLWA 1FVJA 4KB3A 5H5SA 5KN2A 5DQSA 2P0GA 2ALBA 3ERGA 5GZZB 3O3TA 3F3QA 3QMXA 4F0CA 4FYBA 2K8VA 4BVYA 3GH6A 3TKSA 1TJDA 3I43A 4YQVA 5IOXA 4K8MA 2IIYA 3APQA 1VGLA 3C73A 4MJCA 5C00A 3RPNA 6GSSA 3VI7A 5HFIA 5IMZA 3MNGA 1R26A 2KP2A 2VIMA 4Q5NA 4V2NA 4IKHA 3LYPA 2HI7A 2LUSA 2BMXA 3CYNA 2K18A 3ZVJD 2H0GA 1K3OA 2R5GA 4ML1A 2QSIA 2NDOA 5B8AA 1F2EA 1XWGA 1U3AA 3M1GA 2H6YA 4JBBA 2DJ3A 2NTOA 3FZ4A 2AUVA 2C3QA 4KNDA 5D9WA 2PMTA 5D9TA 1PRXA 4EC0A 4P3YB 3EU4A 3US3A 2FCHA 1V9WA 5J41A 1R5AA 2H1AA 3TDGA 5KN3A 5CRGA 1KTEA 2H74A 4PQIA 2DBCA 5CP1A 3GSSA 1SL1B 3M3MA 3LSZA 1EGRA 2HZEA 3HYPA 4MZCA 3V1WA 2O7KA 3CTGA 5G5EA 4J57E 3PR8A 2CA8A 1FB0A 2GQMA 5EL8A 4IS0A 3FHKA 4OMVA 5D93A 4EO3A 5H5RA 3FR9A 4MJEA 1T3BA 1GP1A 3KGKA 3F6FA 2R4VA 1AQXA 4K2DA 3ZIVA 1K0DA 1T4ZA 3F8UA 2CVKA 2H01A 1I9DA 2YN1A 4HI7A 1F9MA 2LQQA 2GZZA 2F51A 2XPEA 1UA5A 3UL3A 1GTUA 1N2AA 2DMMA 1BYEA 2C3NA 2IMKA 2O89A 4KGIA 3KM6A 5G2ZA 1RQMA 4HOJA 1YKCA 2MYGA 2V6KA 3LXTA 1XZOA 3L78A 4OFNA 3GX0A 4XS4A 1V2AA 3IPZA 4L5OA 4K9ZA 2VUPA 4IP1A 3DEXA 4GXZA 2MMNA 5GAND 1TKDB 1SU9A 3CRTA 2VL9A 1X5DA 3GL5A 4XS4B 2L6CA 1PGTA 3K8NA 1EWXA 1ON4A 3I6AA 4N10A 1NHYA 4L8EA 1ZCPA 1XW6A 5IPHA 2LSTA 2WB9A 4FO5A 5IQYA 2R3XA 5CRDA 4KAEA 4X1UA 5ABRA 3WGDA 3FR3A 1SKRB 1X9SB 1TK8B 2REMA 2B1LA 4EDYA 1ILOA 1XIYA 2MMAA 1TU7A 4Q5FA 1GSQA 2VLUA 4MF7A 3F63A 3VK9A 3ZFLA 1PD21 4BL7A 4EXJA 2PERA 4MABA 1TRUA 3IC4A 4F03A 3F6DA 3SWLA 3TKSC 2JZTA 3IE3A 1O8WA 2I81A 1B48A 2K6VA 4NWYA 4AF2A 4GQCA 1SL2B 4LMWA 3O76A 4YQUA 2RLIA 3DXBA 1EEMA 2Z9SA 3ZL5A 2TRCP 3ZIJA 2X8GA 3TJFA 1E6BA 5DQYA 3GA4A 3C7MA 4O92A 4NV5A 5AIVA 1QGVA 4ECCA 4IN0A 1G7EA 2F9SA 2WDUA 3IAS2 1S3DA 3ZMLA 3MAKA 3G7JA 2YANA 1PX6A 3F0IA 3G7YA 3IAM2 2XBQA 2C0FA 3HA9A 2VCWA 2N5AA 4RI6A 3LGCA 3UMAA 3GV1A 1WP0A 5AN1A 1WIKA 2GSSA 2V1MA 1V57A 1RW1A 4TN8A 3D21A 2IMIA 2DJ0A 4IHUA 2V32A 3QR6A 4I2UA 3RHCA 1A0RP 2I3YA 2IN3A 2YWOA 5ECNB 1G6WA 2VL2A 4IQAA 2VLVA 4IGJA 2VCVA 4DSRA 1PSQA 3VFIA 5CRWA 3TRPA 2FWGA 4V2MA 1UN2A 5IOWA 3VWXA 2LJRA 1W89A 4AJ7A 1GLPA 2GZYA 4QL9A 3RBTA 3A2XA 1K0AA 3DGQA 2EIQA 1XOAA 3IA1A 5A5KA 1PN9A 5DJLA 1MDJA 1M99A 4OD7A 3ZITA 3IK7A 3TJGA 5FT3A 3GFKA 5DAKA 1YDKA 1ZOFA 18GSA 2QKEA 1OC8A 4X43A 3RPPA 3ZYWA 2YV7A 3APSA 4XRDA 4EE0A 3KMNA 5ECMB 2P31A 2ZCTA 3NZNA 3IR4A 4DSSA 2RM5A 2DLXA 5LD0A 5HR0A 1O7UA 3GKXA 1X0RA 4ZBBA 3GNJA 3H4KA 4ECIA 2PN8A 5CRHA 1H75A 1SJ6A 3L9SA 1T1VA 4DSSB 1VF1A 3Q18A 4Z7XA 3GUSA 3QOUA 2C0EA 3M9KA 2LJKA 3GX8A 3A2VA 3TJBA 1GUKA 3HJPA 5DDLA 1GUMA 5L71A 5F05A 4ML6A 1TK5B 4K0NA 2B3SA 2I9HA 5FHIA 4JR4A 3PH9A 4MJBA 5AISA 2FWEA 1AXDA 1KNGA 2E2GA 1GWCA 3OR5A 1TTZA 2XHFA 1HNCA 2YP6A 2OJLA 2HXKA 4I6XA 2B6MA 4TR4A 3HXSA 3QFAC 5GAPD 1G6YA 1XOBA 2JSZA 5CYYA 3FEUA 4PX1A 3BCIA 1F3AA 1X5CA 5IM9A 4CHSA 5LNKe 2JACA 1R7HA 3F3RA 4PXOA 2OE0A 4F0BA 1SK1A 4I5QA 3GRXA 1GTBA 1VRSD 3GIXA 1S3AA 4O7HA 1ERWA 4L5LA 5HR2A 5DALB 1K3YA 4XS6A 1ABAA 1YY7A 1WJKA 1GULA 5C04A 1YQ1A 4EDZA 2L5OA 2E0QA 4ZXGA 3H8QA 2DJ2A 1QK8A 3QDNA 2H6XA 1F3BA 3QPMA 1QQ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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