5LXWA

Atomic resolution x-ray crystal structure of cisplatin bound to hen egg white lysozyme stored for 5 years on the shelf
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Atomic resolution X-ray crystal structure of cisplatin bound to hen egg white lysozyme stored for 5 years 'on the shelf'
doi rcsb
total genus 43
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2016-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 5lxwA00
4ZEEA 1QDRA 1QDTA 4WM4A 4H9FA 5IELA 1LSNA 4A7DA 3LYOA 4B4IA 1IWWA 1ZMYL 5A3ZA 1WQRA 1LZSA 4PJ2C 2D4JA 4NHQA 1HSXA 5KXRA 5AMYA 4M4OA 4UWVA 5JENB 1IOQA 1C46A 4WOAA 1BVKC 4KPMA 1WTMA 2MEGA 4G4CA 1UACY 2MEAA 1JJ3A 1GAYA 1UCOA 5HQ1A 2XTHA 3B6LA 4OWAA 4YF2A 1ZVYB 4RW1A 3A91A 5L3HA 1IWZA 1JPOA 1GE2A 1RCMA 1GBYA 1YAOA 3LYZA 4UWUA 3E3DA 2G4QA 1JJ1A 1LSDA 1UA6Y 4HV2A 4NSIA 1LZ6A 4LFPA 1IEEA 3AW7A 1XGPC 1SQ2L 3A6BY 3GXKA 1OUFA 1LSZA 3HFMY 2Y8PA 1VAUA 1GB0A 3AZ5A 1DI3A 1B7RA 1LJIA 2YBJA 4YEOA 5B06A 1OUAA 2MEHA 5FEKA 5HNCA 3LYTA 1XGRC 5I54A 4RLMA 3WULA 4GCCA 1UICA 4XJFA 2PC2A 4J7VA 3G3BB 5T3FA 1EQ5A 1JHLA 4G9SA 4NEBA 5KXKA 1LMNA 3A3RX 3FI7A 1O23A 2HUBA 193LA 1UC0A 1UIFA 4WL6A 5KXPA 1WQQA 4NHIA 1KXWA 5FCPA 3TXEA 1ALCA 4OWEA 2XBSA 5FELA 3W6EA 1I56A 1LHJA 1G7IC 1GF0A 3T6UA 4DD2A 9LYZA 2BQMA 2B5ZA 1DPWA 2BQEA 4NGZA 4WLTA 1GXXA 3WUAA 2XJWA 4BAPA 4EOFA 5KXMA 4UWNA 4NSJA 2ZNXY 4II8A 1NBZC 1B7OA 2DQAA 5I4XA 1OUBA 5LAFA 4OOTA 3RW8A 1F6SA 3WXTA 1BB4A 2C8PA 4J1AA 3W6CA 3K3TA 3B0IA 4H93A 2F4GA 4DYGA 5LVKA 2DQIY 1NF5A 1JSEA 1XGUC 5E4PA 2I6ZA 1DPXA 1GFVA 1JKCA 3A93A 4GCFA 5KXYA 1FKQA 1Z55A 2F2NA 5HLLA 4HJYA 4PHIA 1BB7A 1HFZA 1XEKA 5DN5A 4H91A 3B0KA 1IP1A 3ATOA 1V7SA 2CGIA 1GFJA 4B4EA 3TXGA 3CQLA 1BWHA 1IWVA 2LZ2A 4MR1A 1LHHA 2CDSA 5KKJA 2IFFY 2BQLA 5KJ9A 2HECA 1IY4A 4PPOA 4YOPA 1CJ8A 1LHIA 4GCBA 4M6DA 1NDMC 3KAMA 4LZTA 4NIJA 1AZFA 1GE4A 4WO9A 134LA 1GPQC 4G4BA 1GBOA 1LSFA 2GV0A 4FDYA 1LZRA 1CKGA 1DI5A 3WYHA 4DT3A 1HMKA 2Z37A 3ZVQB 4B0DA 1HMLA 1DI4A 1B7PA 3ULRA 3W6DA 1F6RA 1J1PY 1UIAA 1LZAA 4ETBA 5II3A 5KKIA 2Q0MX 1HENA 1MELL 1BB5A 1JIYA 1LSEA 4ZFPA 4CGEA 3F6ZA 1D6PA 3CSQA 1BVXA 2D4IA 5L9JA 1GDWA 1ZVHL 1GFUA 1WVVA 1GAZA 2DQDY 2HU3A 2MEFA 4LGKA 1JUGA 4NGLA 4B1AA 3N9EA 1FKVA 4NGKA 2ZILA 4XYYA 4R6CA 1LYZA 3QY4A 3B72A 1HELA 1JEFA 5F16A 1GEZA 2VB1A 5F9UA 1UBZA 2DQEY 1GFGA 2FBDA 3P66A 1OUCA 2HU1A 1LZ4A 4NGWA 2YDGA 5APFA 5IHGA 1LYSA 4O34A 4ET8A 3HBDA 1LHMA 3TMWA 4RDSA 1IC5Y 1B7SA 1HEPA 4HTKA 2H9KA 2Z2FA 1LMPA 4NSHA 2C8OA 4J0LA 1YROA 1KIRC 4LYCA 1UIDA 2HEDA 1CKCA 5FHWA 2MEIA 4DDCA 1KIQC 4J1BA 1VEDA 4LT2A 1F0WA 4BS7A 1FLQA 1GF4A 1HF4A 4CHXA 1LZYA 1A2YC 3A34A 3A92A 3D3DA 4H8YA 1KXXA 4I8SA 3SP3A 4DD9A 2HEAA 4N1EI 133LA 1UIGA 4Z98A 3A95A 4QDNA 1GB9A 1CJ7A 1B5ZA 1B2KA 1RJCB 5FDJA 2BAAA 4R0FA 1H87A 1NWGA 2DQCY 1XGQC 3AGGG 208LA 2Z19A 4L41A 1IP6A 4YENA 2D6BA 5DM9A 3WMKA 3BKHA 5ILCA 1QUSA 4TX7A 5LAGA 2W1MA 1G7MC 3EXDA 3GXRA 2X0AA 4TTDA 4XJIA 2CWIA 1IOSA 1F10A 1XEJA 4XN6A 3W6AA 4OWCA 1LZGA 1BB3A 4NWEA 1P2CC 4QY9A 1JTPL 1IR7A 1LMOA 1LPIA 3M3UA 4H8ZA 2FBBA 3LZTA 4LYOA 1OQMA 1YAMA 1HFYA 5KXSA 1CKDA 3TXDA 4YM8A 4NFVA 5KY1A 2ZQ3A 1GFEA 1NDGC 4NGVA 2BQFA 1LSYA 1IO5A 1GFKA 1LZ9A 1LJHA 1HEMA 1YKZX 5HMJA 1H6MA 1REYA 4ANRA 1VDSA 4BAFA 1LZEA 4C3WA 1WQMA 4ZIXA 1GBSA 1TDYA 1IWXA 5FSTA 4DDBA 4DD3A 1ZV5L 4TSBA 5M1YA 1GB3A 1LCNA 2ZIKA 2Z39A 1QQYA 1EQ4A 2FYDA 4ETCA 1YKYX 1QIOA 1BWJA 1C10A 1AKIA 2Z2EA 3AZ6A 4WL7A 4X3BA 1LSBA 1OUDA 2YBLA 1W08A 1PZYA 2WARA 132LA 1HNLA 1LKRA 3W3EA 1IWTA 1LJ4A 3WPKA 2W1LA 4WM2A 1B7LA 5F14A 2CJLA 2F30A 4EMNA 4Z46A 4NGIA 1LJNA 5HNLA 1LTMA 4KXIA 3ZVQA 1B5WA 3WU8A 4MCKA 3WH1A 2G4PA 1IP3A 3BKVA 1NQIA 1WQPA 3LHMA 4H90A 4U3XB 5LA8A 1IVMA 1DKJA 4LFXA 3IJUA 1JKDA 1LSAA 4XJBA 2H5ZA 1J1XY 3RT5X 1GB7A 1GB5A 1YKXX 1XEIA 4NGYA 5B07A 1GXV2 1LSPA 153LA 1MLCE 4AGAA 1LMAA 1RFPA 1GHLA 1LMQA 1NBYC 2G4NA 4WM3A 1IORA 4HPIA 3WXUA 1HFXA 2LYMA 2YBHA 5DN4A 1FDLY 1OUGA 2F4AA 1WQOA 3M18B 1JJ0A 5I5QA 5LXWA 1UIHA 1TCYA 4DWXA 1CJ9A 1G7HC 3W6BA 1LHKA 3AZ7A 1GFAA 5KXXA 4IJ4A 1HEWA 2ZQ4A 4HPEA 1CKFA 1YQVY 2BQJA 5LYTA 1N4FA 3LYMA 1GFTA 4HJZA 5D5FA 3TXJA 2IHLA 1NKHA 5KXZA 5APCA 4PRQA 4WM1A 3OK0A 1LKSA 1HSWA 4H9HA 5HMVA 2YBMA 3WU9A 1TEWA 5EBHA 1IOTA 3B0OA 1LJFA 1J1OY 1VDQA 1XSFA 4LYBA 4Z41A 3N9AA 3OJPA 3FE0A 4XADA 3RNXA 3WUNA 2LZTA 5DL9A 2BQAA 5I4YA 4XJDA 3EBAB 207LA 1W6ZA 2EPEA 4C5FA 7LYZA 5ILFA 1HEOA 1SLYA 1D0MA 1GF5A 4LYTA 4TSCA 4DD7A 1G7LC 1B9OA 1WQNA 4H92A 4NGOA 3TXFA 2MEDA 1LZTA 1LHLA 3TXHA 1LJJA 2I25L 5LYMA 2DKVA 1GWDA 4CJ2A 5KXTA 3RZ4A 6LYTA 2MEEA 1GF7A 1YAQA 1B5YA 1D0LA 4H8XA 1GE3A 4HSFA 1GF8A 4NSGA 3EMSA 2DQFC 4WLYA 5LIOA 3ZEKA 3CT5A 2Z38A 1LJ3A 4WO6A 3WVYA 4OW1A 4NGJA 1WTNA 2A7FA 4NHSA 4OWBA 1INUA 5F81A 3RU5A 3IWRA 4HV1A 4TWSA 1E8LA 1IP7A 2LYOA 4NWHA 3P64A 1D6QA 1LZDA 4LYZA 1QTEA 2AUBA 1V7TA 4DD0A 2DQJY 4NG1A 5LINA 3TMUA 3LN2A 1LMCA 5A3EA 1GB6A 4G4HA 3P68A 1LSGA 1PS5A 4N5RA 1GBXA 4N8ZA 3G3AB 4QGZA 5LVGA 5C6IA 3WW6A 2YSSC 4GLAA 1C08C 2NWDX 4G49A 4NHTA 4CFPA 4WG7A 4H94A 4B4JA 1OP9B 4CFOA 135LA 5B1FA 1B7QA 3WVXA 4D9ZA 3TXBA 1AM7A 1FLUA 3HBHA 4NHPA 3IJVA 4RLNA 5C6JA 4GN5C 3CB7A 4P2EA 5APDA 5L3IA 3LZ2A 3MGWA 4H9AA 1IY3A 1UIBA 2H9JA 4Z3MA 6LYZA 8LYZA 1GFHA 154LA 1QSWA 1QSAA 1IR8A 2EKSC 2Z18A 4N9RA 4LT0A 1IP2A 1IWUA 1BGIA 2BQIA 1UIEA 2HEFA 1I1ZA 4H9BA 3QNGA 5I4WA 5KXWA 1IP5A 1IWYA 1REMA 4H9EA 1FLYA 1GF9A 3A6CY 4ET9A 2MEBA 1QUTA 2EIZC 1G7JC 2DQHY 5KXLA 2BQHA 3A8ZA 3WPJA 1GDXA 1LZ1A 1DKKA 4GCDA 1JITA 1XGTC 1HHLA 3CSRA 3WL2A 1YAPA 3AJNA 5K7OA 1C7PA 1B7NA 4N0JA 4MSTA 1LJKA 1TAYA 2FYCA 1D9UA 3TMXA 3ATNA 4H9IA 2ZYCA 3AW6A 1VDPA 2HTXA 1LSCA 1HERA 1KIPC 2XBRA 3AZ4A 2LYZA 1IR9A 1FLWA 1GE0A 1LJGA 1JTTL 4KL7A 1VFBC 3WW5A 5KXOA 1D0KA 3AB6A 5LA5A 1EQEA 2BQBA 1BHZA 1VATA 1HC0A 1JWRA 4YEMA 3D9AC 1RE2A 2EQLA 4IATA 4NY5A 1AT6A 3CSZA 1WVUA 1XFPL 2BQCA 4ML7A 4OWHA 3VWOA 1GEVA 4HTQA 5LVHA 4WM5A 2N5ZA 1B5XA 4AXTA 1OUEA 2ZNWY 2DBTA 4ETDA 2W1YA 4GN3A 1JISA 4N1CC 2ZIJA 3WPLA 3AGHA 1B5VA 1LJEA 1LSMA 4PRUA 1BB6A 1KXYA 2LHMA 2ZYPA 4QEQA 4WLXA 5I53A 5LYZA 3J6KA 4XENA 1B0DA 1BWIA 1T3PA 5LVIA 4W94A 3EO5A 1C45A 1DZBX 1NHEA 3AYQA 1EL1A 2BLXA 3N9CA 2YBNA 1LAAA 1QTKA 1IP4A 1YL1X 3CT0A 1GFRA 4NG8A 4RW2A 1BQLY 1OUHA 1IC7Y 3P65A 1GB2A 3TMVA 4LT3A 4I0CA 3W6FA 5B59A 3TXIA 4HJVA 4GCEA 4TUNA 1TBYA 5B1GA 1LZ8A 4ETAA 2HEEA 3QE8A 4GLVA 4DC4A 2BQDA 4IASA 5B05A 5D5CA 5E9RA 1HEQA 4XJHA 1C43A 1LZBA 2BPUA 1B5UA 4WMGA 5APEA 1IC4Y 1JKBA 1NMMA 4GN4A 4LT1A 3A96A 194LA 3HBEX 4BADA 2A7DA 2BQNA 2YBIA 3WU7A 1A4VA 1REZA 3A94A 1CNSA 2RSCA 2BQOA 1DQJC 1OUIA 4W96A 2BQGA 4H9CA 5C6LA 2I26L 4PGJB 2YVBA 5J7CA 1GF6A 1IX0A 1LYYA 4HTNA 4WG1A 1LZNA 2BQKA 1DXJA 1GBWA 2D91A 3J4GA 5KXNA 1YANA 1B7MA 2BLYA 2D4KA 5F9XA 1CKHA 3A90A 1OUJA 3T36A 1IOCA 2ZWBA 4DD1A 1CJ6A 1T6VL 4FJRA 4B49A 1RI8B 1LYOA 3P4ZA 1YILA 4LYMA 4WLDA 2Z12A 5DLAA 1JSFA 4OOOA 1LOZA 1YIKA 1UUZC 1LMTA 1GB8A 4KT3A 3WUMA 3AGIA 2MECA 1VDTA 1JTOL 4WM6A 1JKAA 1GD6A 4XJGA 3A67Y 5IDDA 2HEBA 3TXKA 4ETEA 5LVJA 1GF3A 1REXA 1YL0X 3CT1A 4DDAA 1FN5A 4E3UA 1I20A 2DQGY 1IIZA 1FBIX 1LZCA 1LZ5A 1AT5A 4HP0A 3A3QA 1GBZA 4H1PA 2W1XA 1GE1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ZEEA 198LA 1QDTA 3LYOA 3C83A 1L70A 4M4OA 5AMYA 5JENB 4WOAA 214LA 145LA 2F47A 1JJ3A 1GAYA 3B6LA 4OWAA 4YF2A 1T8FA 1OYUA 5L3HA 2Z6BA 218LA 3LYZA 4UWUA 3E3DA 1JJ1A 3GXKA 3HFMY 2Y8PA 1LWKA 1GB0A 1LJIA 4YEOA 3V2YA 3LYTA 4ARQB 4RLMA 1L17A 2PC2A 3G3BB 4G9SA 242LA 5KXKA 150LA 3HTBA 1KXWA 4DQJA 1WTHA 2XBSA 3G3WA 246LA 2B5ZA 243LA 1DPWA 2BQEA 1L66A 4WLTA 3WUAA 1ZYTA 3RW8A 1F6SA 3WXTA 2C8PA 3B0IA 1G0GA 4DYGA 1C6EA 1GFVA 5KXYA 1FKQA 1HFZA 1V7SA 4MR1A 2IFFY 251LA 4PPOA 1LHIA 1NDMC 3KAMA 4NIJA 1AZFA 1ZWNA 4WO9A 134LA 3WYHA 2GV0A 1LZRA 180LA 1C68A 1L57A 1B7PA 4ETBA 5KKIA 1LZAA 1DYCA 1SSYA 253LA 1LSEA 5L9JA 1KW5A 1GDWA 1ZVHL 4YXCA 102LA 2MEFA 4LGKA 1JUGA 3N9EA 4NGKA 1LYZA 5F16A 1JEFA 3GUKA 3GUOA 1GFGA 1L03A 1LZ4A 1L74A 2YDGA 3GUIA 1XJTA 1B6IA 1L05A 1QTVA 3OE8A 181LA 1L56A 1LMPA 4ARJA 2HEDA 1KY1A 1F0WA 1FLQA 1LZYA 3A34A 3A92A 1KXXA 1L31A 3A95A 1B5ZA 1B2KA 1RJCB 2DQCY 4YENA 3AGGG 1XGQC 5DM9A 254LA 1QUSA 4TX7A 2CUUA 3EXDA 1DYEA 1F10A 1LZGA 1P2CC 4QY9A 1LMOA 3M3UA 4H8ZA 2FBBA 1YAMA 5KXSA 7LZMA 177LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4ZEE A;  1QDR A;  1QDT A;  4WM4 A;  4H9F A;  5IEL A;  1LSN A;  4A7D A;  3LYO A;  4B4I A;  1IWW A;  1ZMY L;  5A3Z A;  1WQR A;  1LZS A;  4PJ2 C;  2D4J A;  4NHQ A;  1HSX A;  5KXR A;  5AMY A;  4M4O A;  4UWV A;  5JEN B;  1IOQ A;  1C46 A;  4WOA A;  1BVK C;  4KPM A;  1WTM A;  2MEG A;  4G4C A;  1UAC Y;  2MEA A;  1JJ3 A;  1GAY A;  1UCO A;  5HQ1 A;  2XTH A;  3B6L A;  4OWA A;  4YF2 A;  1ZVY B;  4RW1 A;  3A91 A;  5L3H A;  1IWZ A;  1JPO A;  1GE2 A;  1RCM A;  1GBY A;  1YAO A;  3LYZ A;  4UWU A;  3E3D A;  2G4Q A;  1JJ1 A;  1LSD A;  1UA6 Y;  4HV2 A;  4NSI A;  1LZ6 A;  4LFP A;  1IEE A;  3AW7 A;  1XGP C;  1SQ2 L;  3A6B Y;  3GXK A;  1OUF A;  1LSZ A;  3HFM Y;  2Y8P A;  1VAU A;  1GB0 A;  3AZ5 A;  1DI3 A;  1B7R A;  1LJI A;  2YBJ A;  4YEO A;  5B06 A;  1OUA A;  2MEH A;  5FEK A;  5HNC A;  3LYT A;  1XGR C;  5I54 A;  4RLM A;  3WUL A;  4GCC A;  1UIC A;  4XJF A;  2PC2 A;  4J7V A;  3G3B B;  5T3F A;  1EQ5 A;  1JHL A;  4G9S A;  4NEB A;  5KXK A;  1LMN A;  3A3R X;  3FI7 A;  1O23 A;  2HUB A;  193L A;  1UC0 A;  1UIF A;  4WL6 A; 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 1YL1 X;  3CT0 A;  1GFR A;  4NG8 A;  4RW2 A;  1BQL Y;  1OUH A;  1IC7 Y;  3P65 A;  1GB2 A;  3TMV A;  4LT3 A;  4I0C A;  3W6F A;  5B59 A;  3TXI A;  4HJV A;  4GCE A;  4TUN A;  1TBY A;  5B1G A;  1LZ8 A;  4ETA A;  2HEE A;  3QE8 A;  4GLV A;  4DC4 A;  2BQD A;  4IAS A;  5B05 A;  5D5C A;  5E9R A;  1HEQ A;  4XJH A;  1C43 A;  1LZB A;  2BPU A;  1B5U A;  4WMG A;  5APE A;  1IC4 Y;  1JKB A;  1NMM A;  4GN4 A;  4LT1 A;  3A96 A;  194L A;  3HBE X;  4BAD A;  2A7D A;  2BQN A;  2YBI A;  3WU7 A;  1A4V A;  1REZ A;  3A94 A;  1CNS A;  2RSC A;  2BQO A;  1DQJ C;  1OUI A;  4W96 A;  2BQG A;  4H9C A;  5C6L A;  2I26 L;  4PGJ B;  2YVB A;  5J7C A;  1GF6 A;  1IX0 A;  1LYY A;  4HTN A;  4WG1 A;  1LZN A;  2BQK A;  1DXJ A;  1GBW A;  2D91 A;  3J4G A;  5KXN A;  1YAN A;  1B7M A;  2BLY A;  2D4K A;  5F9X A;  1CKH A;  3A90 A;  1OUJ A;  3T36 A;  1IOC A;  2ZWB A;  4DD1 A;  1CJ6 A;  1T6V L;  4FJR A;  4B49 A;  1RI8 B;  1LYO A;  3P4Z A;  1YIL A;  4LYM A;  4WLD A;  2Z12 A;  5DLA A;  1JSF A;  4OOO A;  1LOZ A;  1YIK A;  1UUZ C;  1LMT A;  1GB8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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