7LZMA

Comparison of the crystal structure of bacteriophage t4 lysozyme at low, medium, and high ionic strengths
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Comparison of the crystal structure of bacteriophage T4 lysozyme at low, medium, and high ionic strengths.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1991-01-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 7lzmA00
1QTDA 3DN0A 2B6TA 3HDEA 4LDOA 242LA 1CTWA 1C6NA 1L39A 1C64A 1L46A 2B6XA 213LA 219LA 119LA 1L74A 104LA 1KS3A 2O79A 180LA 1L69A 102LA 1L04A 2RBOA 4YXCA 1C6IA 1C6DA 3NY8A 1KNIA 1CX7A 233LA 1G0MA 3SB9A 188LA 1L22A 1QTHA 231LA 251LA 254LA 3HTDA 3SB8A 1QS5A 122LA 1PQJA 2F2QA 2B74A 1L50A 1QT5A 7LZMA 2RBNA 1C6LA 1QUGA 1C66A 2B72A 1L24A 1JTMA 1QUOA 4ARMA 3HUAA 3F8VA 174LA 236LA 4DJHA 3HUQA 1L13A 1SSWA 1L27A 110LA 3DN3A 2OU9A 1C6HA 2RH1A 3C7YA 247LA 1L53A 4GRVA 4EXMA 1L52A 159LA 1LGWA 1L05A 175LA 1L20A 1PQKA 3HU9A 4I7JA 3C83A 4AQNA 4PK0A 1T8AA 1CVKA 1L45A 220LA 227LA 3G3VA 1C6MA 1L30A 1LGXA 1L77A 1DYGA 1P6YA 1P36A 4W56A 1C6FA 1KY0A 1G06A 1C60A 1L60A 1LYJA 205LA 1L40A 1LYEA 4ZPUA 1L64A 166LA 1L43A 1KY1A 3ODUA 1L21A 1L72A 252LA 4I7QA 226LA 4K5YA 1XJTA 1L87A 237LA 2RBPA 147LA 1L19A 1L12A 257LA 1OWYA 249LA 1QSQA 211LA 3HWLA 1QTVA 172LA 107LA 3OE6A 215LA 3SB7A 3GUOA 190LA 3HTBA 146LA 199LA 1CV3A 2RBQA 3CDOA 138LA 222LA 1G1VA 1L97A 245LA 3GUMA 243LA 2L78A 1CV1A 2F47A 1QTZA 2B73A 1D3MA 218LA 1L29A 2QB0B 1PQIA 4I7OA 2B70A 1C6KA 4EKRA 256LA 120LA 1D3FA 4LDEA 4ARJA 1L41A 1L02A 178LA 3DN2A 1KW5A 4W51A 192LA 3HH6A 1QUHA 234LA 1QT4A 229LA 2RB2X 2RB0X 250LA 4DAJA 2RAZX 1L07A 1L14A 3DMVA 3OE0A 1CUQA 173LA 1LYIA 1L83A 6LZMA 4EPFA 225LA 1EPYA 2LCBA 3DMXA 3OE9A 3SBAA 3HH3A 3SB6A 3QAKA 1CU2A 3SBBC 1LYHA 1TLAA 5I14A 1C6JA 4S0WA 1L48A 1L70A 1L73A 3GUIA 206LA 1C65A 1PQOA 1L88A 1PQDA 2OU0X 127LA 216LA 163LA 3FADA 1C61A 1QTBA 2OTZX 2O7AA 1LI6A 4I7SA 155LA 3CDQA 3D4SA 1P64A 2HUKA 4EJ4A 3HT9A 3L64A 1JTNA 1CU0A 1L11A 241LA 1L96A 1P2RA 1PQMA 3C8RA 1L38A 2A4TA 1C69A 1CU6A 1L59A 4I7TA 1L91A 262LA 1L54A 3HUKA 1L81A 1L75A 1L00A 1C6EA 2Q9EA 3C8QA 1L68A 2B75A 108LA 2IGCA 1DYDA 1WTHA 1P46A 156LA 1D3NA 1L18A 4W54A 1SWZA 3PBLA 1XJUA 212LA 1L58A 1L23A 4EPIA 1L92A 4W59A 4YX7C 1L61A 1I6SA 4I7KA 261LA 1L09A 1L49A 1QUDA 4EKSA 3DNAA 1L67A 1L08A 2OTYX 4ARLA 4ARMB 246LA 3L2XA 1LI2A 248LA 223LA 1L17A 228LA 3GUJA 4I7LA 183LA 1JQUA 3FI5A 1QSBA 3C82A 1OVKA 118LA 1L03A 1C6BA 1SX7A 113LA 1DYCA 4I7MA 114LA 2OE9X 4ARPA 3FA0A 1L34A 238LA 2B6ZA 4I7RA 1L62A 158LA 1L79A 2ANXA 2RBRA 2NTGA 1K28A 131LA 143LA 1OYUA 3JR6A 253LA 1CV5A 1OV7A 115LA 3DN1A 2LC9A 189LA 1L44A 1NHBA 3HT8A 149LA 230LA 258LA 240LA 1L63A 2OEAX 1L94A 169LA 235LA 1G0QA 112LA 3C7ZA 176LA 1QTCA 1L84A 1LW9A 1L89A 1C63A 1P7SA 1SSYA 1L57A 142LA 3C7WA 1DYFA 1L33A 3HTGA 1ZYTA 232LA 3C81A 1P2LA 239LA 2B6WA 3DKEX 2Z6BA 1C6PA 3EMLA 1L85A 2RAYX 1XEPA 4E97A 217LA 181LA 1L66A 126LA 2OE4X 1OVJA 1CV4A 1L55A 3SN6R 1G0GA 1L15A 198LA 191LA 1OVHA 1B6IA 3DN8A 1C62A 1CUPA 1P37A 1L80A 3HU8A 1C6TA 197LA 164LA 4W58A 151LA 170LA 3HT6A 3GUKA 129LA 109LA 186LA 5LZMA 1C6GA 4EKQA 161LA 4ARQA 3C80A 1P3NA 3CDRA 2HULA 137LA 144LA 167LA 184LA 1T8GA 3GUNA 1L32A 1L99A 1LWKA 1C68A 4EKPA 1DYEA 3PDSA 1C67A 255LA 1CV0A 1CU3A 224LA 2RB1X 3DN6A 150LA 3SB5A 1L71A 2B6YA 1SX2A 1L37A 1LGUA 1D9WA 3G3WA 260LA 1LLHA 1L25A 200LA 187LA 4LZMA 1L35A 4GBRB 1G0JA 128LA 1L01A 214LA 4YXAC 2NTHA 1L31A 139LA 4ARQB 168LA 1C6CA 1L76A 3K2RA 3G3XA 2Q9DA 3V2WA 1C6QA 1CV6A 210LA 1LYFA 1L51A 1OWZA 3DMZA 1DYAA 1D2WA 185LA 4W53A 4I7PA 1QS9A 3NY9A 1G0KA 209LA 2OE7X 1G0LA 3RUNA 3LZMA 1L56A 152LA 182LA 160LA 1LWGA 1KW7A 165LA 259LA 1SWYA 3DN4A 1D2YA 1L82A 244LA 3HTFA 201LA 3OE8A 1CX6A 111LA 3GUPA 1T8FA 4LDLA 4DKLA 1L42A 4W55A 3GULA 1L0KA 1LYDA 3NYAA 1L10A 1DYBA 1L28A 2F32A 1ZWNA 1T97A 2OU8A 1L65A 2RBSA 141LA 1P5CA 1L95A 3F9LA 195LA 1L06A 2QARC 4PJZA 157LA 4I7NA 1G07A 1QT8A 1LPYA 1OV5A 3HH4A 2O4WA 4OO9A 3UONA 1G1WA 1T6HA 1QT7A 130LA 1QT3A 1L0JA 123LA 3CDTA 177LA 148LE 1L98A 1G0PA 1L36A 171LA 3HT7A 4IAPA 2B7XA 1D3JA 1P56A 162LA 3VW7A 2ANVA 1C6AA 1L16A 221LA 3HDFA 3HH5A 1L93A 1L26A 1ZURA 1L86A 3C8SA 1QT6A 145LA 3CDVA 140LA 125LA 2CUUA 196LA 2HUMA 1CU5A 1LYGA 103LA 1L90A 1L47A 1LI3A 3RZEA 4W57A 4W52A 3V2YA 2LZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2B6TA 242LA 1L39A 5LVJA 4B1AA 3BKVA 104LA 1IX0A 2O79A 2D4KA 102LA 1L04A 1IP4A 3ZEKA 2D4IA 1KNIA 2W1YA 1YIKA 3SB9A 135LA 1WQMA 2I25L 1O23A 4FJRA 1PQJA 2EPEA 2B72A 1L24A 1YAMA 3A90A 4ARMA 3HUAA 3F8VA 4DJHA 236LA 4H8ZA 1SSWA 3DN3A 2GV0A 4H9BA 1L52A 1LGWA 1L05A 175LA 1JEFA 1GEVA 3HU9A 2BQMA 4AQNA 1T8AA 220LA 4ET9A 4NG8A 1C6MA 1LGXA 1L77A 1DYGA 4ML7A 1P36A 4W56A 1C6FA 1GF3A 7LYZA 1IIZA 3G3BB 1HEPA 1LYJA 205LA 1L64A 3QE8A 1KY1A 4NG1A 4LZTA 1IOSA 252LA 4I7QA 1LJGA 1IP2A 237LA 2RBPA 1L12A 211LA 172LA 3TXGA 4OWBA 245LA 243LA 2L78A 1WVVA 1CV1A 4WLDA 1QTZA 1H87A 4XN6A 1D3MA 1IP5A 1QTKA 3B72A 1LMPA 4KT3A 256LA 2DQDY 4QY9A 4N5RA 1L02A 1LJFA 2EIZC 4WOAA 1GB8A 1LZAA 4WM5A 192LA 229LA 4WM4A 250LA 1AZFA 2RAZX 5FEKA 1UIDA 1BWJA 4NIJA 4H9AA 1CUQA 1OUBA 5KXZA 6LZMA 1VFBC 5LYTA 3SBAA 1RE2A 4WMGA 4RW1A 4GCCA 1LZ1A 1C6JA 5LVHA 1OUAA 206LA 1GF5A 1C43A 1B7RA 3WUNA 1IWWA 1PQOA 1L88A 4NGZA 127LA 5KXPA 1OUCA 4LYTA 2I26L 1C61A 2OTZX 2O7AA 155LA 1UUZC 1P64A 4EJ4A 1EQ5A 3HT9A 1JTNA 3LZ2A 1XFPL 2FYCA 241LA 4LFXA 4YENA 2A4TA 4NGKA 1GB0A 3RNXA 1N4FA 3WVXA 1GFUA 5KJ9A 1VDQA 1FLUA 2DQEY 1IVMA 1L54A 1L81A 5HNLA 1L00A 1L68A 108LA 4H8YA 4NGWA 1HNLA 1T6VL 1GFVA 1SWZA 1L23A 3A8ZA 3HBHA 1L92A 1EQ4A 3AGIA 1L61A 1CNSA 4ET8A 2YSSC 1B7NA 4L41A 261LA 3TMUA 4EKSA 1JSFA 2MEGA 2Z2EA 1XGPC 4ARMB 2HEEA 1LI2A 1OUHA 1YKZX 183LA 2Z37A 4MR1A 3EXDA 4H90A 1L03A 1C6BA 1NDMC 1SX7A 5E9RA 4BAPA 1C7PA 1DYCA 4G49A 4ARPA 5KXWA 1GFRA 2W1LA 4PHIA 3W6CA 4DQ7A 2ANXA 158LA 5T3FA 2BQLA 5IHGA 1LJHA 1TCYA 5A3ZA 2NTGA 143LA 1OYUA 6LYZA 253LA 1UICA 4G4HA 4ETDA 115LA 1NHBA 208LA 5APEA 1D0LA 2I6ZA 2OEAX 1IC5Y 169LA 1KIQC 2DQAA 1L84A 1L89A 5B05A 3LYMA 1LZYA 1LAAA 3CSRA 1JJ0A 1HEMA 3HTGA 2BQHA 5B1GA 1IOTA 1P2LA 2HTXA 3W6DA 239LA 1LHJA 1SQ2L 4UWVA 4NSIA 4H92A 1ZV5L 1OVJA 3E3DA 3SN6R 4FDYA 3DN8A 1C62A 1L80A 1T3PA 1B9OA 151LA 170LA 4NEBA 1C6GA 4EKQA 3C80A 144LA 4EOFA 1L99A 2BQIA 1LWKA 3WMKA 1IWUA 1GE1A 1LMOA 4GN3A 224LA 3DN6A 3QY4A 4KPMA 1GBZA 1JTOL 4NSJA 1WQRA 4WG1A 1D9WA 5KXRA 3W6AA 200LA 1L25A 4LZMA 187LA 4GCFA 4GBRB 1I56A 5KXKA 1JHLA 2NTHA 2BQAA 5DL9A 3N9AA 168LA 1LHKA 1C6CA 3TXEA 1L76A 1SLYA 2HEBA 3M3UA 2Q9DA 4XJIA 1C6QA 210LA 3IJUA 3ATNA 1DYAA 1JTTL 5LA8A 1C10A 1LCNA 185LA 3CQLA 4W53A 1BWIA 4I7PA 2MEHA 1GFTA 1TEWA 5LAGA 4WLYA 1UA6Y 152LA 160LA 1KW7A 165LA 259LA 3WXUA 3DN4A 1DI4A 1WTNA 2F4AA 1HFYA 1HFZA 4RLNA 4PRUA 4LDLA 1L42A 4WM6A 1IOQA 1L10A 5FCPA 1NBZC 141LA 1OP9B 1B5WA 5I4XA 1LSEA 4NFVA 4H9EA 4H9FA 1LMAA 4CHXA 2O4WA 1UCOA 4OO9A 4ZIXA 4HJZA 1IWVA 3CDTA 177LA 2D6BA 1YL1X 4DD1A 2B7XA 1F0WA 3VW7A 4X3BA 1C6AA 221LA 4II8A 1ZURA 3A34A 3A6CY 1C45A 1BVKC 1FKVA 3CDVA 3WH1A 2CUUA 4OWEA 1LYGA 1RJCB 4DKLA 1LI3A 3B0KA 1QTDA 2DQFC 2BQDA 3HDEA 4LDOA 1C6NA 1HEOA 2XBRA 1ALCA 1REYA 3EBAB 4KXIA 1L46A 4TSBA 4PJ2C 1UBZA 1L74A 1KS3A 180LA 9LYZA 4J0LA 2LHMA 1BB3A 1C6DA 1LHLA 1CX7A 233LA 1G0MA 3A96A 4GN5C 1GFGA 4LYMA 1CJ8A 4LGKA 1LJNA 2MEIA 2DQHY 3HTDA 2Z12A 3KAMA 1QS5A 1QSWA 1LZ4A 1C6LA 1C66A 1JTMA 4J7VA 3TMXA 3RW8A 1UC0A 4EXMA 159LA 2D4JA 2DQCY 1PQKA 4WM3A 1UIFA 4PK0A 5F9XA 1GFEA 1LSYA 1L45A 1LYYA 2Z38A 4OWCA 1L30A 1P6YA 5ILCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1QT8 A;  1LPY A;  1OV5 A;  3HH4 A;  2O4W A;  4OO9 A;  3UON A;  1G1W A;  1T6H A;  1QT7 A;  130L A;  1QT3 A;  1L0J A;  123L A;  3CDT A;  177L A;  148L E;  1L98 A;  1G0P A;  1L36 A;  171L A;  3HT7 A;  4IAP A;  2B7X A;  1D3J A;  1P56 A;  162L A;  3VW7 A;  2ANV A;  1C6A A;  1L16 A;  221L A;  3HDF A;  3HH5 A;  1L93 A;  1L26 A;  1ZUR A;  1L86 A;  3C8S A;  1QT6 A;  145L A;  3CDV A;  140L A;  125L A;  2CUU A;  196L A;  2HUM A;  1CU5 A;  1LYG A;  103L A;  1L90 A;  1L47 A;  1LI3 A;  3RZE A;  4W57 A;  4W52 A;  3V2Y A;  2LZM A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2B6T A;  242L A;  1L39 A;  5LVJ A;  4B1A A;  3BKV A;  104L A;  1IX0 A;  2O79 A;  2D4K A;  102L A;  1L04 A;  1IP4 A;  3ZEK A;  2D4I A;  1KNI A;  2W1Y A;  1YIK A;  3SB9 A;  135L A;  1WQM A;  2I25 L;  1O23 A;  4FJR A;  1PQJ A;  2EPE A;  2B72 A;  1L24 A;  1YAM A;  3A90 A;  4ARM A;  3HUA A;  3F8V A;  4DJH A;  236L A;  4H8Z A;  1SSW A;  3DN3 A;  2GV0 A;  4H9B A;  1L52 A;  1LGW A;  1L05 A;  175L A;  1JEF A;  1GEV A;  3HU9 A;  2BQM A;  4AQN A;  1T8A A;  220L A;  4ET9 A;  4NG8 A;  1C6M A;  1LGX A;  1L77 A;  1DYG A;  4ML7 A;  1P36 A;  4W56 A;  1C6F A;  1GF3 A;  7LYZ A;  1IIZ A;  3G3B B;  1HEP A;  1LYJ A;  205L A;  1L64 A;  3QE8 A;  1KY1 A;  4NG1 A;  4LZT A;  1IOS A;  252L A;  4I7Q A;  1LJG A;  1IP2 A;  237L A;  2RBP A;  1L12 A;  211L A;  172L A;  3TXG A;  4OWB A;  245L A;  243L A;  2L78 A;  1WVV A;  1CV1 A;  4WLD A;  1QTZ A;  1H87 A;  4XN6 A;  1D3M A;  1IP5 A;  1QTK A;  3B72 A;  1LMP A;  4KT3 A;  256L A;  2DQD Y;  4QY9 A;  4N5R A;  1L02 A;  1LJF A;  2EIZ C;  4WOA A;  1GB8 A;  1LZA A;  4WM5 A;  192L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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