The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
33
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sequence length |
132
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structure length |
132
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Chain Sequence |
AQSLEVGQKARLSKRFGAAEVAAFAALSEDFNPLHLDPAFAATTAFERPIVHGMLLASLFSGLLGQQLPGKGSIYLGQSLSFKLPVFVGDEVTAEVEVTALREDKPIATLTTRIFTQGGALAVTGEAVVKLP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Lyase
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| molecule keywords |
(R)-SPECIFIC ENOYL-COA HYDRATASE
|
| publication title |
Crystal structure of the (R)-specific enoyl-CoA hydratase from Aeromonas caviae involved in polyhydroxyalkanoate
biosynthesis
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Aeromonas punctata
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| total genus |
33
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| structure length |
132
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| sequence length |
132
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.119: Enoyl-CoA hydratase 2. |
| pdb deposition date | 2001-06-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01575 | MaoC_dehydratas | MaoC like domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Thiol Ester Dehydrase; Chain A | Hotdog Thioesterase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2GLL A; 4RLJ A; 3KG8 A; 1BVQ A; 2CWZ A; 2F3X A; 3ESI A; 3D04 A; 4XY5 A; 2O6B A; 2OV9 A; 1VH5 A; 1Q4U A; 2FUJ A; 3DOY A; 4RLT A; 4RLW A; 4RLU B; 3DP2 A; 5BUX A; 3LMB A; 4I83 A; 4B0C A; 3F1T A; 4QD9 A; 4A0Z A; 3ED0 A; 4K4B A; 3P2R A; 4WNB B; 3KVU A; 5HMC A; 1VPM A; 4B0B A; 3DOZ A; 1PSU A; 1Y7U A; 1ZHG A; 1NJK A; 2OWN A; 4K4C A; 2B3M A; 3KX7 A; 3KX8 A; 4M20 A; 2OKI A; 5HZ4 A; 3B7J A; 2AV9 A; 3R37 A; 3CF9 A; 3AZ9 A; 4RLU A; 4B0J A; 3P2Q A; 1MKB A; 1T82 A; 2QQ2 A; 2O6T A; 4WNB A; 5EGK A; 5F6R A; 4AE7 A; 4QDA A; 3BJK A; 4GAK A; 1Z54 A; 5SZY A; 5T07 A; 4ORD A; 3R87 A; 2BI0 A; 2W3X A; 1PN4 A; 1SC0 A; 4K02 A; 3K67 A; 1Z6B A; 3WEW A; 1C8U A; 5KL9 A; 4NCP A; 1SH8 A; 3GEK A; 4ZV3 A; 2FS2 A; 3HM0 A; 3LWG A; 3QY3 A; 4RMM A; 1TBU A; 3IR3 A; 2F41 A; 2GLP A; 5SZV A; 2HLJ A; 3D6L A; 3P2S A; 4MOB A; 4MOC A; 1Q4S A; 4OOB A; 3AZB A; 5DIO A; 3AZ8 A; 4HZN A; 4YBV A; 1MKA A; 2OAF A; 3KH8 A; 4H4G A; 5DM5 A; 4B8U A; 2EIS A; 4W78 B; 4QD7 A; 1WLV A; 1SBK A; 3DKZ A; 4MTU A; 2EGI A; 2F0X A; 2GLM A; 5HWF A; 3R3B A; 2VKZ G; 1IQ6 A; 3AZA A; 3R32 A; 1U1Z A; 4ZRF A; 2DSL A; 3P3I A; 1Q6W A; 2CY9 A; 2HBO A; 3DP1 A; 1S9C A; 2O5U A; 3R3F A; 3KVI A; 1WN3 A; 2CYE A; 4ZW0 A; 3E29 A; 1IXL A; 5EO2 A; 2NUJ A; 3KV7 A; 1Q4T A; 3HDU A; 4HZP A; 4I4J A; 5EO4 A; 1PN2 A; 3DP3 A; 3KV8 A; 3R36 A; 3TEA A; 3P3F A; 2EGR A; 3LW3 A; 4HZO A; 5SZZ A; 3KUW A; 2O6U A; 5T06 A; 1VI8 A; 3KVZ A; 4I82 A; 4K00 A; 4QDB A; 3NWZ A; 4A0X A; 5SZU A; 5EP5 A; 1ZKI A; 2UV8 G; 3KHP A; 4MZQ A; 1WM6 A; 1LO8 A; 2OIW A; 4RLT B; 5BYU A; 3LBB A; 3DP0 A; 2GVH A; 3E1E A; 2GF6 A; 3B7K A; 4I45 A; 4K4A A; 1YLI A; 2EGJ A; 2V1O A; 3SPS A; 2PIM A; 2XEM A; 3KUV A; 3S4K A; 3R35 A; 2B6E A; 5BUW A; 4GAH A; 4RV2 B; 1VH9 A; 3QOO A; 4QD8 A; 4W78 A; 4FFU A; 5EGJ A; 3CK1 A; 3F5O A; 2GLV A; 1WLU A; 3CF8 A; 2PZH A; 3LZ7 A; 4IEN A; 3EXZ A; 3HMJ G; 1LO9 A; 5HMB A; 5HD6 A; 4CL6 A; 2C2I A; 3KW1 A; 3R3D A; 1S5U A; 2XFL A; 3D6X A; 3R3C A; 4ZRB A; 4E3E A; 2Q78 A; 4RV2 A; 4K4D A; 1J1Y A; 4KEH A; 3LBE A; 5CPG A; 5T02 A; 4ZJB A; 4RLJ B; 2PRX A; 1LO7 A; 4FQ9 A; 4B0I A; 3OML A; 3Q62 A; 2Q2B A; 2QWZ A; 4A12 A; 3R3A A; 4RLW B; 4XY6 A; 5EGL A; 2HX5 A; 3E8P A; 4A0Y A; 1YOC A; 2H4U A; 3R34 A; 3BNV A; 4AE8 A; 2ESS A; 5BUY A; 4K49 A; 2OKH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GLL A; 4RLJ A; 3HRQ A; 3KG8 A; 1BVQ A; 2CWZ A; 2F3X A; 3ESI A; 3D04 A; 4XY5 A; 2O6B A; 2OV9 A; 1VH5 A; 1Q4U A; 2FUJ A; 3DOY A; 4RLT A; 4RLW A; 4RLU B; 3DP2 A; 4U3V A; 3LMB A; 4I83 A; 4B0C A; 3F1T A; 4QD9 A; 4A0Z A; 3ED0 A; 4K4B A; 3P2R A; 4WNB B; 3KVU A; 5HMC A; 1VPM A; 4B0B A; 3DOZ A; 1PSU A; 4R4U A; 1Y7U A; 1ZHG A; 1NJK A; 2OWN A; 4K4C A; 2B3M A; 3KX7 A; 3KX8 A; 4M20 A; 4OOC A; 3FRN A; 2OKI A; 5HZ4 A; 3B7J A; 2AV9 A; 3R37 A; 3CF9 A; 3AZ9 A; 4RLU A; 3EL6 A; 4B0J A; 3P2Q A; 3U0A A; 1MKB A; 1T82 A; 2QQ2 A; 2O6T A; 4WNB A; 5EGK A; 5F6R A; 5BUX A; 3HRR A; 4QDA A; 3BJK A; 4AE7 A; 4GAK A; 1Z54 A; 5SZY A; 5T07 A; 4ORD A; 3R87 A; 2BI0 A; 2W3X A; 1PN4 A; 1SC0 A; 4K02 A; 3K67 A; 1Z6B A; 3WEW A; 1C8U A; 5KL9 A; 4NCP A; 1SH8 A; 3GEK A; 3B18 A; 4ZV3 A; 2FS2 A; 3HM0 A; 3LWG A; 3QY3 A; 4RMM A; 1TBU A; 3IR3 A; 2F41 A; 2GLP A; 5SZV A; 2HLJ A; 3D6L A; 3P2S A; 4MOB A; 4MOC A; 1Q4S A; 4OOB A; 3AZB A; 5DIO A; 3AZ8 A; 1OHF A; 4HZN A; 4YBV A; 1MKA A; 2OAF A; 3KG7 A; 3KH8 A; 4H4G A; 5DM5 A; 4B8U A; 2EIS A; 4W78 B; 3S6P A; 4QD7 A; 1WLV A; 1SBK A; 3DKZ A; 4MTU A; 2VZ8 A; 2EGI A; 2F0X A; 2GLM A; 5HWF A; 3R3B A; 2VKZ G; 2VZ9 A; 1IQ6 A; 3AZA A; 3R32 A; 1U1Z A; 3ZH5 A; 4ZRF A; 2DSL A; 3P3I A; 1Q6W A; 2CY9 A; 2HBO A; 3DP1 A; 1S9C A; 2O5U A; 3R3F A; 3KVI A; 1WN3 A; 2CYE A; 4ZW0 A; 5BP3 A; 3E29 A; 1IXL A; 5EO2 A; 2NUJ A; 3KV7 A; 1Q4T A; 3HDU A; 4HZP A; 4I4J A; 5EO4 A; 1PN2 A; 3DP3 A; 3RD7 A; 3KV8 A; 3R36 A; 3TEA A; 2PFC A; 3P3F A; 2EGR A; 3LW3 A; 4HZO A; 5SZZ A; 3KUW A; 2O6U A; 3KG9 A; 5T06 A; 1VI8 A; 3KVZ A; 4I82 A; 4K00 A; 4QDB A; 3NWZ A; 4A0X A; 4QFW A; 5SZU A; 5EP5 A; 3BBJ A; 1ZKI A; 3KG6 A; 2UV8 G; 3KHP A; 5E1V A; 4MZQ A; 1WM6 A; 1LO8 A; 2OIW A; 4RLT B; 5BYU A; 3LBB A; 3DP0 A; 2GVH A; 3E1E A; 2GF6 A; 3B7K A; 4I45 A; 3ZH7 B; 4K4A A; 1YLI A; 2EGJ A; 2V1O A; 3SPS A; 2PIM A; 2XEM A; 3KUV A; 3S4K A; 3R35 A; 2B6E A; 5BUW A; 4GAH A; 5KKU A; 4RV2 B; 1VH9 A; 3QOO A; 4QD8 A; 4W78 A; 4FFU A; 5EGJ A; 3CK1 A; 3F5O A; 3ZH6 A; 2GLV A; 4LN9 A; 1WLU A; 3RQB A; 3CF8 A; 3ZH7 A; 2PZH A; 3LZ7 A; 4IEN A; 3EXZ A; 3HMJ G; 4R9Z A; 1LO9 A; 2QQP A; 5HMB A; 5HD6 A; 4CL6 A; 2C2I A; 3KW1 A; 3R3D A; 1S5U A; 2XFL A; 3D6X A; 3R3C A; 4ZRB A; 4E3E A; 2Q78 A; 4RV2 A; 4K4D A; 1J1Y A; 4KEH A; 3LBE A; 5CPG A; 5T02 A; 4ZJB A; 4KC5 A; 5BP2 A; 4RLJ B; 2PRX A; 1LO7 A; 4FQ9 A; 4B0I A; 3OML A; 3Q62 A; 2Q2B A; 2QWZ A; 4A12 A; 3R3A A; 4RLW B; 4XY6 A; 5EGL A; 2HX5 A; 3E8P A; 3CJY A; 4A0Y A; 1YOC A; 2H4U A; 3R34 A; 3BNV A; 4AE8 A; 2ESS A; 5BUY A; 4K49 A; 2OKH A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2GLL A; 4RLJ A; 3KG8 A; 1BVQ A; 2CWZ A; 2F3X A; 3ESI A; 3D04 A; 4XY5 A; 2O6B A; 2OV9 A; 1VH5 A; 1Q4U A; 2FUJ A; 3DOY A; 4RLT A; 4RLW A; 4RLU B; 3DP2 A; 5BUX A; 3LMB A; 4I83 A; 4B0C A; 3F1T A; 4QD9 A; 4A0Z A; 3ED0 A; 4K4B A; 3P2R A; 4WNB B; 3KVU A; 5HMC A; 1VPM A; 4B0B A; 3DOZ A; 1PSU A; 1Y7U A; 1ZHG A; 1NJK A; 2OWN A; 4K4C A; 2B3M A; 3KX7 A; 3KX8 A; 4M20 A; 2OKI A; 5HZ4 A; 3B7J A; 2AV9 A; 3R37 A; 3CF9 A; 3AZ9 A; 4RLU A; 4B0J A; 3P2Q A; 1MKB A; 1T82 A; 2QQ2 A; 2O6T A; 4WNB A; 5EGK A; 5F6R A; 4AE7 A; 4QDA A; 3BJK A; 4GAK A; 1Z54 A; 5SZY A; 5T07 A; 4ORD A; 3R87 A; 2BI0 A; 2W3X A; 1PN4 A; 1SC0 A; 4K02 A; 3K67 A; 1Z6B A; 3WEW A; 1C8U A; 5KL9 A; 4NCP A; 1SH8 A; 3GEK A; 4ZV3 A; 2FS2 A; 3HM0 A; 3LWG A; 3QY3 A; 4RMM A; 1TBU A; 3IR3 A; 2F41 A; 2GLP A; 5SZV A; 2HLJ A; 3D6L A; 3P2S A; 4MOB A; 4MOC A; 1Q4S A; 4OOB A; 3AZB A; 5DIO A; 3AZ8 A; 4HZN A; 4YBV A; 1MKA A; 2OAF A; 3KH8 A; 4H4G A; 5DM5 A; 4B8U A; 2EIS A; 4W78 B; 4QD7 A; 1WLV A; 1SBK A; 3DKZ A; 4MTU A; 2EGI A; 2F0X A; 2GLM A; 5HWF A; 3R3B A; 2VKZ G; 1IQ6 A; 3AZA A; 3R32 A; 1U1Z A; 4ZRF A; 2DSL A; 3P3I A; 1Q6W A; 2CY9 A; 2HBO A; 3DP1 A; 1S9C A; 2O5U A; 3R3F A; 3KVI A; 1WN3 A; 2CYE A; 4ZW0 A; 3E29 A; 1IXL A; 5EO2 A; 2NUJ A; 3KV7 A; 1Q4T A; 3HDU A; 4HZP A; 4I4J A; 5EO4 A; 1PN2 A; 3DP3 A; 3KV8 A; 3R36 A; 3TEA A; 3P3F A; 2EGR A; 3LW3 A; 4HZO A; 5SZZ A; 3KUW A; 2O6U A; 5T06 A; 1VI8 A; 3KVZ A; 4I82 A; 4K00 A; 4QDB A; 3NWZ A; 4A0X A; 5SZU A; 5EP5 A; 1ZKI A; 2UV8 G; 3KHP A; 4MZQ A; 1WM6 A; 1LO8 A; 2OIW A; 4RLT B; 5BYU A; 3LBB A; 3DP0 A; 2GVH A; 3E1E A; 2GF6 A; 3B7K A; 4I45 A; 4K4A A; 1YLI A; 2EGJ A; 2V1O A; 3SPS A; 2PIM A; 2XEM A; 3KUV A; 3S4K A; 3R35 A; 2B6E A; 5BUW A; 4GAH A; 4RV2 B; 1VH9 A; 3QOO A; 4QD8 A; 4W78 A; 4FFU A; 5EGJ A; 3CK1 A; 3F5O A; 2GLV A; 1WLU A; 3CF8 A; 2PZH A; 3LZ7 A; 4IEN A; 3EXZ A; 3HMJ G; 1LO9 A; 5HMB A; 5HD6 A; 4CL6 A; 2C2I A; 3KW1 A; 3R3D A; 1S5U A; 2XFL A; 3D6X A; 3R3C A; 4ZRB A; 4E3E A; 2Q78 A; 4RV2 A; 4K4D A; 1J1Y A; 4KEH A; 3LBE A; 5CPG A; 5T02 A; 4ZJB A; 4RLJ B; 2PRX A; 1LO7 A; 4FQ9 A; 4B0I A; 3OML A; 3Q62 A; 2Q2B A; 2QWZ A; 4A12 A; 3R3A A; 4RLW B; 4XY6 A; 5EGL A; 2HX5 A; 3E8P A; 4A0Y A; 1YOC A; 2H4U A; 3R34 A; 3BNV A; 4AE8 A; 2ESS A; 5BUY A; 4K49 A; 2OKH A;
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