3CCVO

Structure of anisomycin resistant 50s ribosomal subunit: 23s rrna mutation g2616a
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SKTNPRLSSLIADLKSAARSSGGAVWGDVAERLEKPRRTHAEVNLGRIERYAQEDETVVVPGKVLGSGVLQKDVTVAAVDFSGTAETKIDQVGEAVSLEQAIENNPEGSHVRVIR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S ribosomal protein L2P
publication title Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb
total genus 32
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00828 Ribosomal_L27A Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.100.10.10 Alpha Beta Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 Ribosomal Protein L15; Chain: K; domain 2 3ccvO00
3CC2L 1YHQL 1W2BK 1VQ8L 1VQ6L 1VQOL 2OTLL 3CXCN 1M90M 1M1KM 1QVFN 1YHQO 3CCSL 3CMAO 2OTJO 3I55O 1YJWL 3I56L 1K73P 1VQLO 1Q7YP 3CCEO 1VQNL 1VQPL 3CCSO 3I56O 1KC8P 3CCUL 1K9MP 3G4SO 1JJ2N 1Q82M 3CD6O 1M90P 1M1KP 3CMAL 2OTJL 3I55L 3CCUO 1VQLL 1KD1P 3CXCK 3CCLL 3CCEL 1QVFK 3CC7O 3CCRO 2QA4O 3CCVL 3CCLO 1VQ7O 3G4SL 3CPWN 1NJIM 1Q82P 3CD6L 3CCVO 1VQ9O 1N8RM 2QEXL 1JJ2K 1S72O 3CCJL 3CC7L 3CCRL 2QEXO 2QA4L 1K8AM 3OW2N 1VQMO 1KQSN 3CCJO 3CCQO 1VQ7L 1VQKO 1NJIP 1VQ9L 3G71O 1N8RP 1YITO 1Q86M 3CC4O 3CPWK 3G6EO 1YJ9O 1S72L 1VQ5O 1YIJO 1QVGN 1KC8M 3CMEO 1YJNO 1K8AP 1Q81M 1VQML 1K9MM 1W2BN 1VQ4O 3CCMO 3CCQL 3CC2O 1YI2L 1VQKL 3OW2K 3G71L 1VQ8O 1VQ6O 1KQSK 1VQOO 1YITL 1Q86P 1KD1M 2OTLO 3CC4L 1YI2O 3G6EL 1YJ9L 1VQ5L 1YIJL 1YJWO 1K73M 3CMEL 1YJNL 1Q7YM 1Q81P 1VQNO 1VQPO 1VQ4L 3CCML 1QVGK
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CC2L 1YHQL 4W8KA 1W2BK 1VQ8L 1VQ6L 1VQOL 2OTLL 3CXCN 1M90M 1M1KM 1QVFN 1YHQO 3CCSL 3CMAO 2OTJO 3I55O 1YJWL 3I56L 1K73P 1VQLO 1Q7YP 3CCEO 5DS6A 1VQNL 1VQPL 3CCSO 3I56O 1KC8P 3CCUL 1K9MP 3G4SO 1JJ2N 1Q82M 3CD6O 1M90P 1M1KP 3CMAL 2OTJL 5FCLA 3I55L 3CCUO 1VQLL 1KD1P 3CXCK 3CCLL 3CCEL 1QVFK 3CC7O 3CCRO 2QA4O 3CCVL 5DS5A 3CCLO 1VQ7O 3G4SL 3NKDA 3CPWN 1NJIM 1Q82P 3CD6L 5DQZA 3CCVO 3GODA 1VQ9O 1N8RM 2QEXL 1JJ2K 1S72O 3CCJL 3CC7L 3CCRL 2QEXO 2QA4L 1K8AM 3OW2N 1VQMO 5DLJA 1KQSN 4N06A 3CCJO 3CCQO 1VQ7L 1VQKO 1NJIP 4XTKA 1VQ9L 3G71O 1N8RP 1YITO 1Q86M 5DQTA 3CC4O 3CPWK 3G6EO 1YJ9O 1S72L 1VQ5O 1YIJO 1QVGN 1KC8M 3CMEO 1YJNO 4WJ0A 1K8AP 1Q81M 1VQML 1K9MM 1W2BN 1VQ4O 3CCMO 3CCQL 3CC2O 1YI2L 1VQKL 3OW2K 3G71L 1VQ8O 1VQ6O 1KQSK 1VQOO 4QDLA 1YITL 1Q86P 1KD1M 2OTLO 4P6IC 3CC4L 1YI2O 5DS4A 3G6EL 1YJ9L 1VQ5L 1YIJL 1YJWO 2YZSA 1K73M 3CMEL 1YJNL 1Q7YM 1Q81P 1VQNO 1VQPO 1VQ4L 3CCML 1QVGK
chains in the Genus database with same CATH topology
3CC2L 1YHQL 4W8KA 1W2BK 1VQ8L 1VQ6L 1VQOL 2OTLL 3CXCN 1M90M 1M1KM 1QVFN 1YHQO 3CCSL 3CMAO 2OTJO 3I55O 1YJWL 3I56L 1K73P 1VQLO 1Q7YP 3CCEO 5DS6A 1VQNL 1VQPL 3CCSO 3I56O 1KC8P 3CCUL 1K9MP 3G4SO 1JJ2N 1Q82M 3CD6O 1M90P 1M1KP 3CMAL 2OTJL 5FCLA 3I55L 3CCUO 1VQLL 1KD1P 3CXCK 3CCLL 3CCEL 1QVFK 3CC7O 3CCRO 2QA4O 3CCVL 5DS5A 3CCLO 1VQ7O 3G4SL 3NKDA 3CPWN 1NJIM 1Q82P 3CD6L 5DQZA 3CCVO 3GODA 1VQ9O 1N8RM 2QEXL 1JJ2K 1S72O 3CCJL 3CC7L 3CCRL 2QEXO 2QA4L 1K8AM 3OW2N 1VQMO 5DLJA 1KQSN 4N06A 3CCJO 3CCQO 1VQ7L 1VQKO 1NJIP 4XTKA 1VQ9L 3G71O 1N8RP 1YITO 1Q86M 5DQTA 3CC4O 3CPWK 3G6EO 1YJ9O 1S72L 1VQ5O 1YIJO 1QVGN 1KC8M 3CMEO 1YJNO 4WJ0A 1K8AP 1Q81M 1VQML 1K9MM 1W2BN 1VQ4O 3CCMO 3CCQL 3CC2O 1YI2L 1VQKL 3OW2K 3G71L 1VQ8O 1VQ6O 1KQSK 1VQOO 4QDLA 1YITL 1Q86P 1KD1M 2OTLO 4P6IC 3CC4L 1YI2O 5DS4A 3G6EL 1YJ9L 1VQ5L 1YIJL 1YJWO 2YZSA 1K73M 3CMEL 1YJNL 1Q7YM 1Q81P 1VQNO 1VQPO 1VQ4L 3CCML 1QVGK
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3CC2 L;  1YHQ L;  1W2B K;  1VQ8 L;  1VQ6 L;  1VQO L;  2OTL L;  3CXC N;  1M90 M;  1M1K M;  1QVF N;  1YHQ O;  3CCS L;  3CMA O;  2OTJ O;  3I55 O;  1YJW L;  3I56 L;  1K73 P;  1VQL O;  1Q7Y P;  3CCE O;  1VQN L;  1VQP L;  3CCS O;  3I56 O;  1KC8 P;  3CCU L;  1K9M P;  3G4S O;  1JJ2 N;  1Q82 M;  3CD6 O;  1M90 P;  1M1K P;  3CMA L;  2OTJ L;  3I55 L;  3CCU O;  1VQL L;  1KD1 P;  3CXC K;  3CCL L;  3CCE L;  1QVF K;  3CC7 O;  3CCR O;  2QA4 O;  3CCV L;  3CCL O;  1VQ7 O;  3G4S L;  3CPW N;  1NJI M;  1Q82 P;  3CD6 L;  3CCV O;  1VQ9 O;  1N8R M;  2QEX L;  1JJ2 K;  1S72 O;  3CCJ L;  3CC7 L;  3CCR L;  2QEX O;  2QA4 L;  1K8A M;  3OW2 N;  1VQM O;  1KQS N;  3CCJ O;  3CCQ O;  1VQ7 L;  1VQK O;  1NJI P;  1VQ9 L;  3G71 O;  1N8R P;  1YIT O;  1Q86 M;  3CC4 O;  3CPW K;  3G6E O;  1YJ9 O;  1S72 L;  1VQ5 O;  1YIJ O;  1QVG N;  1KC8 M;  3CME O;  1YJN O;  1K8A P;  1Q81 M;  1VQM L;  1K9M M;  1W2B N;  1VQ4 O;  3CCM O;  3CCQ L;  3CC2 O;  1YI2 L;  1VQK L;  3OW2 K;  3G71 L;  1VQ8 O;  1VQ6 O;  1KQS K;  1VQO O;  1YIT L;  1Q86 P;  1KD1 M;  2OTL O;  3CC4 L;  1YI2 O;  3G6E L;  1YJ9 L;  1VQ5 L;  1YIJ L;  1YJW O;  1K73 M;  3CME L;  1YJN L;  1Q7Y M;  1Q81 P;  1VQN O;  1VQP O;  1VQ4 L;  3CCM L;  1QVG K; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CC2 L;  1YHQ L;  4W8K A;  1W2B K;  1VQ8 L;  1VQ6 L;  1VQO L;  2OTL L;  3CXC N;  1M90 M;  1M1K M;  1QVF N;  1YHQ O;  3CCS L;  3CMA O;  2OTJ O;  3I55 O;  1YJW L;  3I56 L;  1K73 P;  1VQL O;  1Q7Y P;  3CCE O;  5DS6 A;  1VQN L;  1VQP L;  3CCS O;  3I56 O;  1KC8 P;  3CCU L;  1K9M P;  3G4S O;  1JJ2 N;  1Q82 M;  3CD6 O;  1M90 P;  1M1K P;  3CMA L;  2OTJ L;  5FCL A;  3I55 L;  3CCU O;  1VQL L;  1KD1 P;  3CXC K;  3CCL L;  3CCE L;  1QVF K;  3CC7 O;  3CCR O;  2QA4 O;  3CCV L;  5DS5 A;  3CCL O;  1VQ7 O;  3G4S L;  3NKD A;  3CPW N;  1NJI M;  1Q82 P;  3CD6 L;  5DQZ A;  3CCV O;  3GOD A;  1VQ9 O;  1N8R M;  2QEX L;  1JJ2 K;  1S72 O;  3CCJ L;  3CC7 L;  3CCR L;  2QEX O;  2QA4 L;  1K8A M;  3OW2 N;  1VQM O;  5DLJ A;  1KQS N;  4N06 A;  3CCJ O;  3CCQ O;  1VQ7 L;  1VQK O;  1NJI P;  4XTK A;  1VQ9 L;  3G71 O;  1N8R P;  1YIT O;  1Q86 M;  5DQT A;  3CC4 O;  3CPW K;  3G6E O;  1YJ9 O;  1S72 L;  1VQ5 O;  1YIJ O;  1QVG N;  1KC8 M;  3CME O;  1YJN O;  4WJ0 A;  1K8A P;  1Q81 M;  1VQM L;  1K9M M;  1W2B N;  1VQ4 O;  3CCM O;  3CCQ L;  3CC2 O;  1YI2 L;  1VQK L;  3OW2 K;  3G71 L;  1VQ8 O;  1VQ6 O;  1KQS K;  1VQO O;  4QDL A;  1YIT L;  1Q86 P;  1KD1 M;  2OTL O;  4P6I C;  3CC4 L;  1YI2 O;  5DS4 A;  3G6E L;  1YJ9 L;  1VQ5 L;  1YIJ L;  1YJW O;  2YZS A;  1K73 M;  3CME L;  1YJN L;  1Q7Y M;  1Q81 P;  1VQN O;  1VQP O;  1VQ4 L;  3CCM L;  1QVG K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 3CC2 L;  1YHQ L;  4W8K A;  1W2B K;  1VQ8 L;  1VQ6 L;  1VQO L;  2OTL L;  3CXC N;  1M90 M;  1M1K M;  1QVF N;  1YHQ O;  3CCS L;  3CMA O;  2OTJ O;  3I55 O;  1YJW L;  3I56 L;  1K73 P;  1VQL O;  1Q7Y P;  3CCE O;  5DS6 A;  1VQN L;  1VQP L;  3CCS O;  3I56 O;  1KC8 P;  3CCU L;  1K9M P;  3G4S O;  1JJ2 N;  1Q82 M;  3CD6 O;  1M90 P;  1M1K P;  3CMA L;  2OTJ L;  5FCL A;  3I55 L;  3CCU O;  1VQL L;  1KD1 P;  3CXC K;  3CCL L;  3CCE L;  1QVF K;  3CC7 O;  3CCR O;  2QA4 O;  3CCV L;  5DS5 A;  3CCL O;  1VQ7 O;  3G4S L;  3NKD A;  3CPW N;  1NJI M;  1Q82 P;  3CD6 L;  5DQZ A;  3CCV O;  3GOD A;  1VQ9 O;  1N8R M;  2QEX L;  1JJ2 K;  1S72 O;  3CCJ L;  3CC7 L;  3CCR L;  2QEX O;  2QA4 L;  1K8A M;  3OW2 N;  1VQM O;  5DLJ A;  1KQS N;  4N06 A;  3CCJ O;  3CCQ O;  1VQ7 L;  1VQK O;  1NJI P;  4XTK A;  1VQ9 L;  3G71 O;  1N8R P;  1YIT O;  1Q86 M;  5DQT A;  3CC4 O;  3CPW K;  3G6E O;  1YJ9 O;  1S72 L;  1VQ5 O;  1YIJ O;  1QVG N;  1KC8 M;  3CME O;  1YJN O;  4WJ0 A;  1K8A P;  1Q81 M;  1VQM L;  1K9M M;  1W2B N;  1VQ4 O;  3CCM O;  3CCQ L;  3CC2 O;  1YI2 L;  1VQK L;  3OW2 K;  3G71 L;  1VQ8 O;  1VQ6 O;  1KQS K;  1VQO O;  4QDL A;  1YIT L;  1Q86 P;  1KD1 M;  2OTL O;  4P6I C;  3CC4 L;  1YI2 O;  5DS4 A;  3G6E L;  1YJ9 L;  1VQ5 L;  1YIJ L;  1YJW O;  2YZS A;  1K73 M;  3CME L;  1YJN L;  1Q7Y M;  1Q81 P;  1VQN O;  1VQP O;  1VQ4 L;  3CCM L;  1QVG K; 
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