5G6PA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase i218v in complex with 7-((4-(dimethylamino)methyl)phenoxy)methyl)quinolin-2- amine
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIVSDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 120
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g6pA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g6pA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g6pA03
3JT3A 1K2UA 5G69A 1M9RA 3JX5A 5G6DA 4FW0A 3EBFA 3RQPA 1DMKA 4KCNA 4UGLA 3FC5A 4D1OA 8NSEA 4CFTB 3NLIA 2AN2A 3UFSA 1M9KA 4JSGA 3JWXA 3NLXA 3HSNA 3NLMA 4UGRA 3NLEA 5G65A 3JX2A 4CWYA 4D2ZA 2ORPA 4CX4A 3TYOA 3NLUA 4UGTA 4UGMA 1P6IA 1MJTA 2ORSA 5ADKA 4K5JA 5G6IA 3RQOA 4D32A 5ADFA 4UGNA 4UPMA 4CU0A 4C3AA 4CWWA 1LZXA 9NSEA 1P6KA 4CX0A 2G6JA 1FOLA 3HSPA 5ADDA 4D2YA 1D0CA 3PNEA 3RQNA 4CAQA 4UGXA 1ZVLA 5G6FA 3UFTA 4KCKA 5ADGA 4UGJA 3E6OA 3B3MA 4UGDA 5ADCA 4CWXA 3E7IA 5ADMA 4UH8A 5FVOA 5FVRA 2G6IA 3E7SA 1DMJA 3N6DA 5FVVA 4KCMA 1DWXA 1ED4A 4JSHA 3NLVA 2Y37A 1D0OA 3PNHA 4UH4A 5G6NA 3EJ8A 4K5KA 1M9TA 2FC2A 4KCHA 4UGPA 3JX3A 3JX0A 5FJ2A 4CTVA 4UPSA 1FOJA 1NODA 4IMTA 5G6GA 4CTZA 4D37A 3NNZA 1I83A 3N5VA 4UH6A 1DD7A 3Q99A 1FOOA 3JT4A 3PNGA 1D1WA 1LZZA 4D39A 3Q9AA 5ADJA 4K5FA 1MMVA 3N5YA 4LWBA 3SVPA 3E7GA 4V3XA 4K5HA 4K5DA 2NSEA 3JX4A 3NLRA 3N2RA 5G0NA 1P6JA 2HX3A 1ZZQA 4V3YA 3E6NA 3E7SB 4UG9A 3NLJA 3B3NA 5G67A 4LUWA 4D34A 4UH5A 4JSJA 4UGFA 3UFQA 5ADBA 3DQTA 4K5EA 1OM5A 3N5QA 5AD4A 1DMIA 3E68A 4KCQA 4D3AA 5AD6A 3N5WA 2ORRA 4D3MA 1ZZTA 4UGBA 4UH7A 4D1PA 3N61A 4UGUA 1P6LA 3NLDA 5FVUA 3JT7A 4D3JA 3N6BA 3JTAA 1M8HA 1R35A 1K2RA 1ZZSA 5ADLA 4IMWA 2AN0A 1M7VA 4CAOA 3DWJA 3N68A 4D38A 4D3BA 4FVYA 4UQRA 4CTPA 4UGIA 1Q2OA 3N6GA 3JWVA 4V3ZA 4CX6A 4KCRA 3JWZA 3RQLA 2HX2A 4UGWA 5FVYA 4JSEA 3RQJA 3NOSA 3UFWA 3UFOA 5ADIA 3N60A 1JWJA 3N65A 1M7ZA 4JS9A 5G6CA 1DM7A 1M8EA 5FVTA 5FVQA 4UGKA 4IMUA 2FBZX 5FVZA 4CTWA 4CX5A 4V3WA 4UG6A 5FVWA 3NLFA 4UGOA 3JWUA 4K5IA 4FVWA 5FVXA 3NLPA 3N6CA 1RS6A 3N5SA 3N64A 5FVSA 1M9MA 3N6EA 1FOPA 3NODA 4CTQA 4UH1A 4JSLA 2BHJA 5AD5A 1ED5A 3N67A 1DM8A 4V3VA 4D7JA 4GQEA 3RQKA 3NLZA 5G6QA 4D7IA 2HX4A 3B3OA 1P6NA 5FW0A 5AGPA 3E6LA 1QWCA 1N2NA 4CULA 3E65A 5AD9A 3N69A 1FOIA 1M8IA 5G6MA 1M9JA 3NQSA 5G68A 4CARA 4D7OA 3N6FA 1QW5A 4IMXA 2NOSA 3PNFA 4CU1A 1P6MA 4CTYA 5G6PA 3TYMA 4CTXA 3UFVA 4UGYA 1M8DA 2ORTA 1NSEA 5G6OA 3TYNA 1JWKA 4CVGA 5ADNA 1K2TA 1MMWA 4CX3A 4UGSA 3EBDA 5G0OA 5AGOA 4IMSA 4CX2A 7NSEA 1DM6A 3SVQA 4FVXA 4D3IA 5G66A 4D3TA 4JSMA 2NSIA 2NODA 3JT6A 3NLKA 1NOCA 4FVZA 4UH2A 1M9QA 4CTTA 4LWAA 4D3UA 4JSFA 4UPRA 2G6MA 3HSOA 3JWSA 4CU1B 4UPPA 4UPOA 3DQSA 2FLQA 3NLHA 1DWVA 1DWWA 4UGHA 1K2SA 3N66A 4D30A 4KCLA 3E67A 5FJ3A 3NM0A 4D1NA 3E6TA 3UFRA 3UFPA 3NLTA 4D3NA 4UH3A 4CX1A 4UGQA 5G6BA 5G6KA 1RS9A 4V3UA 1ZVIA 4CDTA 3N5TA 3JWWA 4UQSA 4D7HA 3JWTA 4UPQA 3E7TA 4EUXA 4UPTA 1P6HA 4D3KA 4CTUA 4D31A 5AD7A 1ED6A 1VAGA 4KCOA 1QOMA 4UGVA 3JT8A 4CAPA 3NLNA 3EAIA 2G6HA 4UG5A 4JSKA 4C39A 3JT5A 3NLQA 5G6EA 4JSIA 3N5XA 1VAFA 2FC1A 4KCJA 3JX1A 1DF1A 4CANA 6NSEA 4UGCA 3RQMA 5AGKA 5G6AA 1RS8A 4D3OA 4CWVA 2G6OA 3NLWA 3N63A 3E7MA 3TYLA 2AMOA 4UH0A 3UFUA 3NLOA 3N5ZA 3NNYA 5FVPA 3N6AA 4UGEA 3B3PA 5NSEA 4CUNA 3N5PA 1NOSA 3N5RA 4UG8A 5AGLA 5G6JA 1NSIA 4UH9A 3DQRA 3JX6A 3NLYA 5ADEA 3NW2A 4CX7A 3NLGA 4CUMA 1D1XA 2ORQA 1QW4A 4K5GA 1ZZUA 4UGAA 2OROA 4CAMA 4D35A 2G6LA 4UCHA 5AD8A 1RS7A 4NSEA 4NOSA 5ADAA 3JT9A 3JWYA 4CFTA 4D3VA 4KCPA 5AGNA 4UGZA 5G0PA 1D1YA 3EAHA 1ZZRA 4UPNA 1OM4A 4CTRA 4UGGA 4UHAA 2G6KA 4D36A 1M00A 1QW6A 1D1VA 5G6LA 5AGMA 5G6HA 4UG7A 4CWZA 4D33A 4LUXA 4KCSA 2G6NA 3N62A 4KCIA 3NSEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JT3A 1K2UA 5G69A 1M9RA 3JX5A 5G6DA 4FW0A 3EBFA 3RQPA 1DMKA 4KCNA 4UGLA 3FC5A 4D1OA 8NSEA 4CFTB 3NLIA 2AN2A 3UFSA 1M9KA 4JSGA 3JWXA 3NLXA 3HSNA 3NLMA 4UGRA 3NLEA 5G65A 3JX2A 4CWYA 4D2ZA 2ORPA 4CX4A 3TYOA 3NLUA 4UGTA 4UGMA 1P6IA 1MJTA 2ORSA 5ADKA 4K5JA 5G6IA 3RQOA 4D32A 5ADFA 4UGNA 4UPMA 4CU0A 4C3AA 4CWWA 1LZXA 9NSEA 1P6KA 4CX0A 2G6JA 1FOLA 3HSPA 5ADDA 4D2YA 1D0CA 3PNEA 3RQNA 4CAQA 4UGXA 1ZVLA 5G6FA 3UFTA 4KCKA 5ADGA 4UGJA 3E6OA 3B3MA 4UGDA 5ADCA 4CWXA 3E7IA 5ADMA 4UH8A 5FVOA 5FVRA 2G6IA 3E7SA 1DMJA 3N6DA 5FVVA 4KCMA 1DWXA 1ED4A 4JSHA 3NLVA 2Y37A 1D0OA 3PNHA 4UH4A 5G6NA 3EJ8A 4K5KA 1M9TA 2FC2A 4KCHA 4UGPA 3JX3A 3JX0A 5FJ2A 4CTVA 4UPSA 1FOJA 1NODA 4IMTA 5G6GA 4CTZA 4D37A 3NNZA 1I83A 3N5VA 4UH6A 1DD7A 3Q99A 1FOOA 3JT4A 3PNGA 1D1WA 1LZZA 4D39A 3Q9AA 5ADJA 4K5FA 1MMVA 3N5YA 4LWBA 3SVPA 3E7GA 4V3XA 4K5HA 4K5DA 2NSEA 3JX4A 3NLRA 3N2RA 5G0NA 1P6JA 2HX3A 1ZZQA 4V3YA 3E6NA 3E7SB 4UG9A 3NLJA 3B3NA 5G67A 4LUWA 4D34A 4UH5A 4JSJA 4UGFA 3UFQA 5ADBA 3DQTA 4K5EA 1OM5A 3N5QA 5AD4A 1DMIA 3E68A 4KCQA 4D3AA 5AD6A 3N5WA 2ORRA 4D3MA 1ZZTA 4UGBA 4UH7A 4D1PA 3N61A 4UGUA 1P6LA 3NLDA 5FVUA 3JT7A 4D3JA 3N6BA 3JTAA 1M8HA 1R35A 1K2RA 1ZZSA 5ADLA 4IMWA 2AN0A 1M7VA 4CAOA 3DWJA 3N68A 4D38A 4D3BA 4FVYA 4UQRA 4CTPA 4UGIA 1Q2OA 3N6GA 3JWVA 4V3ZA 4CX6A 4KCRA 3JWZA 3RQLA 2HX2A 4UGWA 5FVYA 4JSEA 3RQJA 3NOSA 3UFWA 3UFOA 5ADIA 3N60A 1JWJA 3N65A 1M7ZA 4JS9A 5G6CA 1DM7A 1M8EA 5FVTA 5FVQA 4UGKA 4IMUA 2FBZX 5FVZA 4CTWA 4CX5A 4V3WA 4UG6A 5FVWA 3NLFA 4UGOA 3JWUA 4K5IA 4FVWA 5FVXA 3NLPA 3N6CA 1RS6A 3N5SA 3N64A 5FVSA 1M9MA 3N6EA 1FOPA 3NODA 4CTQA 4UH1A 4JSLA 2BHJA 5AD5A 1ED5A 3N67A 1DM8A 4V3VA 4D7JA 4GQEA 3RQKA 3NLZA 5G6QA 4D7IA 2HX4A 3B3OA 1P6NA 5FW0A 5AGPA 3E6LA 1QWCA 1N2NA 4CULA 3E65A 5AD9A 3N69A 1FOIA 1M8IA 5G6MA 1M9JA 3NQSA 5G68A 4CARA 4D7OA 3N6FA 1QW5A 4IMXA 2NOSA 3PNFA 4CU1A 1P6MA 4CTYA 5G6PA 3TYMA 4CTXA 3UFVA 4UGYA 1M8DA 2ORTA 1NSEA 5G6OA 3TYNA 1JWKA 4CVGA 5ADNA 1K2TA 1MMWA 4CX3A 4UGSA 3EBDA 5G0OA 5AGOA 4IMSA 4CX2A 7NSEA 1DM6A 3SVQA 4FVXA 4D3IA 5G66A 4D3TA 4JSMA 2NSIA 2NODA 3JT6A 3NLKA 1NOCA 4FVZA 4UH2A 1M9QA 4CTTA 4LWAA 4D3UA 4JSFA 4UPRA 2G6MA 3HSOA 3JWSA 4CU1B 4UPPA 4UPOA 3DQSA 2FLQA 3NLHA 1DWVA 1DWWA 4UGHA 1K2SA 3N66A 4D30A 4KCLA 3E67A 5FJ3A 3NM0A 4D1NA 3E6TA 3UFRA 3UFPA 3NLTA 4D3NA 4UH3A 4CX1A 4UGQA 5G6BA 5G6KA 1RS9A 4V3UA 1ZVIA 4CDTA 3N5TA 3JWWA 4UQSA 4D7HA 3JWTA 4UPQA 3E7TA 4EUXA 4UPTA 1P6HA 4D3KA 4CTUA 4D31A 5AD7A 1ED6A 1VAGA 4KCOA 1QOMA 4UGVA 3JT8A 4CAPA 3NLNA 3EAIA 2G6HA 4UG5A 4JSKA 4C39A 3JT5A 3NLQA 5G6EA 4JSIA 3N5XA 1VAFA 2FC1A 4KCJA 3JX1A 1DF1A 4CANA 6NSEA 4UGCA 3RQMA 5AGKA 5G6AA 1RS8A 4D3OA 4CWVA 2G6OA 3NLWA 3N63A 3E7MA 3TYLA 2AMOA 4UH0A 3UFUA 3NLOA 3N5ZA 3NNYA 5FVPA 3N6AA 4UGEA 3B3PA 5NSEA 4CUNA 3N5PA 1NOSA 3N5RA 4UG8A 5AGLA 5G6JA 1NSIA 4UH9A 3DQRA 3JX6A 3NLYA 5ADEA 3NW2A 4CX7A 3NLGA 4CUMA 1D1XA 2ORQA 1QW4A 4K5GA 1ZZUA 4UGAA 2OROA 4CAMA 4D35A 2G6LA 4UCHA 5AD8A 1RS7A 4NSEA 4NOSA 5ADAA 3JT9A 3JWYA 4CFTA 4D3VA 4KCPA 5AGNA 4UGZA 5G0PA 1D1YA 3EAHA 1ZZRA 4UPNA 1OM4A 4CTRA 4UGGA 4UHAA 2G6KA 4D36A 1M00A 1QW6A 1D1VA 5G6LA 5AGMA 5G6HA 4UG7A 4CWZA 4D33A 4LUXA 4KCSA 2G6NA 3N62A 4KCIA 3NSEA
chains in the Genus database with same CATH topology
3JT3A 1K2UA 5G69A 1M9RA 3JX5A 5G6DA 4FW0A 3EBFA 3RQPA 1DMKA 4KCNA 4UGLA 3FC5A 4D1OA 8NSEA 4CFTB 3NLIA 2AN2A 3UFSA 1M9KA 4JSGA 3JWXA 3NLXA 3HSNA 3NLMA 4UGRA 3NLEA 5G65A 3JX2A 4CWYA 4D2ZA 2ORPA 4CX4A 3TYOA 3NLUA 4UGTA 4UGMA 1P6IA 1MJTA 2ORSA 5ADKA 4K5JA 5G6IA 3RQOA 4D32A 5ADFA 4UGNA 4UPMA 4CU0A 4C3AA 4CWWA 1LZXA 9NSEA 1P6KA 4CX0A 2G6JA 1FOLA 3HSPA 5ADDA 4D2YA 1D0CA 3PNEA 3RQNA 4CAQA 4UGXA 1ZVLA 5G6FA 3UFTA 4KCKA 5ADGA 4UGJA 3E6OA 3B3MA 4UGDA 5ADCA 4CWXA 3E7IA 5ADMA 4UH8A 5FVOA 5FVRA 2G6IA 3E7SA 1DMJA 3N6DA 5FVVA 4KCMA 1DWXA 1ED4A 4JSHA 3NLVA 2Y37A 1D0OA 3PNHA 4UH4A 5G6NA 3EJ8A 4K5KA 1M9TA 2FC2A 4KCHA 4UGPA 3JX3A 3JX0A 5FJ2A 4CTVA 4UPSA 1FOJA 1NODA 4IMTA 5G6GA 4CTZA 4D37A 3NNZA 1I83A 3N5VA 4UH6A 1DD7A 3Q99A 1FOOA 3JT4A 3PNGA 1D1WA 1LZZA 4D39A 3Q9AA 5ADJA 4K5FA 1MMVA 3N5YA 4LWBA 3SVPA 3E7GA 4V3XA 4K5HA 4K5DA 2NSEA 3JX4A 3NLRA 3N2RA 5G0NA 1P6JA 2HX3A 1ZZQA 4V3YA 3E6NA 3E7SB 4UG9A 3NLJA 3B3NA 5G67A 4LUWA 4D34A 4UH5A 4JSJA 4UGFA 3UFQA 5ADBA 3DQTA 4K5EA 1OM5A 3N5QA 5AD4A 1DMIA 3E68A 4KCQA 4D3AA 5AD6A 3N5WA 2ORRA 4D3MA 1ZZTA 4UGBA 4UH7A 4D1PA 3N61A 4UGUA 1P6LA 3NLDA 5FVUA 3JT7A 4D3JA 3N6BA 3JTAA 1M8HA 1R35A 1K2RA 1ZZSA 5ADLA 4IMWA 2AN0A 1M7VA 4CAOA 3DWJA 3N68A 4D38A 4D3BA 4FVYA 4UQRA 4CTPA 4UGIA 1Q2OA 3N6GA 3JWVA 4V3ZA 4CX6A 4KCRA 3JWZA 3RQLA 2HX2A 4UGWA 5FVYA 4JSEA 3RQJA 3NOSA 3UFWA 3UFOA 5ADIA 3N60A 1JWJA 3N65A 1M7ZA 4JS9A 5G6CA 1DM7A 1M8EA 5FVTA 5FVQA 4UGKA 4IMUA 2FBZX 5FVZA 4CTWA 4CX5A 4V3WA 4UG6A 5FVWA 3NLFA 4UGOA 3JWUA 4K5IA 4FVWA 5FVXA 3NLPA 3N6CA 1RS6A 3N5SA 3N64A 5FVSA 1M9MA 3N6EA 1FOPA 3NODA 4CTQA 4UH1A 4JSLA 2BHJA 5AD5A 1ED5A 3N67A 1DM8A 4V3VA 4D7JA 4GQEA 3RQKA 3NLZA 5G6QA 4D7IA 2HX4A 3B3OA 1P6NA 5FW0A 5AGPA 3E6LA 1QWCA 1N2NA 4CULA 3E65A 5AD9A 3N69A 1FOIA 1M8IA 5G6MA 1M9JA 3NQSA 5G68A 4CARA 4D7OA 3N6FA 1QW5A 4IMXA 2NOSA 3PNFA 4CU1A 1P6MA 4CTYA 5G6PA 3TYMA 4CTXA 3UFVA 4UGYA 1M8DA 2ORTA 1NSEA 5G6OA 3TYNA 1JWKA 4CVGA 5ADNA 1K2TA 1MMWA 4CX3A 4UGSA 3EBDA 5G0OA 5AGOA 4IMSA 4CX2A 7NSEA 1DM6A 3SVQA 4FVXA 4D3IA 5G66A 4D3TA 4JSMA 2NSIA 2NODA 3JT6A 3NLKA 1NOCA 4FVZA 4UH2A 1M9QA 4CTTA 4LWAA 4D3UA 4JSFA 4UPRA 2G6MA 3HSOA 3JWSA 4CU1B 4UPPA 4UPOA 3DQSA 2FLQA 3NLHA 1DWVA 1DWWA 4UGHA 1K2SA 3N66A 4D30A 4KCLA 3E67A 5FJ3A 3NM0A 4D1NA 3E6TA 3UFRA 3UFPA 3NLTA 4D3NA 4UH3A 4CX1A 4UGQA 5G6BA 5G6KA 1RS9A 4V3UA 1ZVIA 4CDTA 3N5TA 3JWWA 4UQSA 4D7HA 3JWTA 4UPQA 3E7TA 4EUXA 4UPTA 1P6HA 4D3KA 4CTUA 4D31A 5AD7A 1ED6A 1VAGA 4KCOA 1QOMA 4UGVA 3JT8A 4CAPA 3NLNA 3EAIA 2G6HA 4UG5A 4JSKA 4C39A 3JT5A 3NLQA 5G6EA 4JSIA 3N5XA 1VAFA 2FC1A 4KCJA 3JX1A 1DF1A 4CANA 6NSEA 4UGCA 3RQMA 5AGKA 5G6AA 1RS8A 4D3OA 4CWVA 2G6OA 3NLWA 3N63A 3E7MA 3TYLA 2AMOA 4UH0A 3UFUA 3NLOA 3N5ZA 3NNYA 5FVPA 3N6AA 4UGEA 3B3PA 5NSEA 4CUNA 3N5PA 1NOSA 3N5RA 4UG8A 5AGLA 5G6JA 1NSIA 4UH9A 3DQRA 3JX6A 3NLYA 5ADEA 3NW2A 4CX7A 3NLGA 4CUMA 1D1XA 2ORQA 1QW4A 4K5GA 1ZZUA 4UGAA 2OROA 4CAMA 4D35A 2G6LA 4UCHA 5AD8A 1RS7A 4NSEA 4NOSA 5ADAA 3JT9A 3JWYA 4CFTA 4D3VA 4KCPA 5AGNA 4UGZA 5G0PA 1D1YA 3EAHA 1ZZRA 4UPNA 1OM4A 4CTRA 4UGGA 4UHAA 2G6KA 4D36A 1M00A 1QW6A 1D1VA 5G6LA 5AGMA 5G6HA 4UG7A 4CWZA 4D33A 4LUXA 4KCSA 2G6NA 3N62A 4KCIA 3NSEA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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