5G6LA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 7-((4-chloro-3-((methylamino)methyl)phenoxy)methyl) quinolin-2-amine
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 120
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g6lA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g6lA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g6lA03
4IMUA 1DF1A 2OROA 5G6GA 1D0CA 1ED6A 2BHJA 4JSJA 4CTYA 4D1PA 3NLPA 1K2RA 5G6HA 3JWXA 3UFQA 3JT9A 3RQPA 1DM6A 4D33A 4CAMA 5FVXA 4KCPA 1ZVLA 3N6EA 3RQMA 4CARA 4UGNA 4UH6A 4UGSA 4D3UA 3JX0A 1QWCA 4JSIA 3RQKA 1M7VA 2G6MA 3NLJA 4JSFA 5G6QA 4CUNA 1D1YA 4FVWA 1DD7A 4UGEA 5FVOA 5G6FA 4CWZA 3E7IA 3JT5A 1NOSA 2NSEA 3JT3A 4CU0A 4UH0A 4UGKA 4UG9A 4CWYA 4UPTA 1RS8A 4UH1A 3UFOA 3N60A 4D36A 4JS9A 5AD7A 1NOCA 3NM0A 4KCHA 2G6KA 4KCIA 4D3NA 4UPNA 3N5YA 1DM8A 3Q99A 3E7SB 1R35A 4CX4A 4CTTA 4D3MA 1P6HA 4CTRA 4KCMA 3RQLA 3DQSA 1M9RA 4LUWA 4UHAA 3NSEA 4CAPA 1D1XA 5G69A 3N6GA 3N69A 4K5FA 4KCLA 2ORTA 2Y37A 3E7MA 4CX3A 4K5JA 1OM5A 4UPPA 4CTVA 2NSIA 3E6LA 4UGOA 3JX3A 2ORSA 4IMSA 3NLNA 4CTXA 1MMVA 4D32A 1ZZTA 1K2UA 3NLWA 1JWKA 4UGRA 5G6AA 5ADLA 4IMTA 1M9QA 1QW6A 3E6NA 4UH2A 3JX1A 3EJ8A 4CANA 3JX5A 3N5XA 4UGDA 5ADKA 3E65A 3FC5A 3JWTA 3NQSA 3NLVA 4V3UA 1P6IA 4UPOA 5G6NA 4UGUA 5AGMA 4CWVA 3NLGA 1QOMA 1DWWA 7NSEA 4UH5A 4UGWA 5G6EA 3DWJA 4CX1A 5FJ3A 4UGTA 1LZZA 1M9TA 3NLQA 1FOLA 4UG8A 5AGLA 3N5TA 5AD5A 4NSEA 4UH9A 2FC1A 5ADGA 3HSPA 3N6AA 5G0PA 4CTZA 4UQRA 5G65A 3EAHA 5G6LA 4KCQA 1ZZQA 1DM7A 4CTQA 4JSEA 2G6OA 3N5VA 5FVYA 1K2TA 5FW0A 5ADNA 3N6FA 3NLXA 4D34A 4LWAA 1M00A 3NLYA 5AD6A 4UG6A 4UGZA 4D1NA 4UG7A 2NOSA 3N5WA 1ZZRA 4FVZA 1M9MA 5NSEA 4D3AA 1P6JA 1JWJA 4UGVA 5G6KA 3PNFA 4UGBA 4D7JA 3UFPA 4D3JA 4K5KA 1RS9A 4LUXA 3PNEA 3N64A 1ZVIA 4V3WA 1VAGA 3E6TA 1D1VA 3JT8A 3E6OA 3E7GA 5FVRA 4D7OA 4D30A 3NNYA 4UGPA 3B3NA 5ADIA 2G6NA 5G6IA 4EUXA 3JWYA 4CUMA 4D3BA 2FLQA 1FOJA 3N2RA 3NLUA 4KCRA 4D2YA 1K2SA 4CULA 4KCOA 4UH7A 4FW0A 3NLDA 4KCJA 6NSEA 2AN2A 3UFTA 2HX2A 4UCHA 4CFTA 4IMWA 3JWSA 4JSGA 4UGFA 1DMIA 2FBZX 3N68A 4UGIA 4D37A 5ADEA 1ED4A 4D7HA 5ADCA 1FOIA 3N6BA 4NOSA 4UGJA 4D3TA 3NNZA 4UGLA 4D3IA 4CU1A 4CWXA 3N5ZA 4D3OA 3N61A 5G6BA 5FVPA 4D1OA 1P6LA 3NOSA 4CX2A 1VAFA 3RQOA 1DMJA 3UFVA 3NODA 2G6HA 3EBDA 1QW5A 5G6DA 4UPMA 1M8HA 4UH8A 1P6MA 3NLFA 3JX6A 4UGQA 3TYOA 3DQTA 3DQRA 3NLKA 5ADBA 3E7TA 1M8EA 4K5IA 2G6IA 5AGPA 5AD9A 5FVWA 5ADFA 1ZZUA 1MJTA 9NSEA 5AD4A 4D38A 3JT4A 4JSKA 5G66A 5G6MA 3N6DA 3JWUA 4UGYA 1NODA 5FJ2A 3SVQA 4CX0A 1N2NA 3NLZA 1QW4A 1I83A 4KCSA 1D1WA 4UPQA 4C3AA 4UH3A 2ORPA 1NSIA 1M9JA 4K5HA 4CTUA 5G68A 3N5SA 3JWVA 4D2ZA 3N5RA 2HX3A 3NLOA 1M9KA 3UFWA 3NLTA 4D3VA 3E67A 3NLMA 4UGHA 4FVXA 1FOOA 1DMKA 5ADDA 3UFUA 4FVYA 1P6NA 1M8IA 5G67A 3NLRA 1D0OA 3B3OA 5FVSA 1M7ZA 5G6PA 5AD8A 4CX5A 4GQEA 3HSNA 4UGMA 1DWVA 3N67A 4CAQA 1DWXA 4K5EA 3N63A 3N6CA 5ADMA 2HX4A 3UFRA 4CTWA 4UGAA 4V3YA 3JWWA 3JT6A 4LWBA 4D39A 4UPSA 4K5GA 4CDTA 5G0NA 4V3VA 4JSMA 4UQSA 5FVZA 3E68A 4UGXA 5G6OA 1LZXA 3PNGA 2ORRA 4JSHA 4CFTB 5AGOA 4UG5A 3B3MA 4KCKA 1FOPA 4V3ZA 2FC2A 4D3KA 2G6JA 3N65A 3NLIA 4V3XA 3B3PA 3UFSA 3JTAA 3Q9AA 4D7IA 1NSEA 3JT7A 1OM4A 4CU1B 5G6CA 2AMOA 1M8DA 1RS7A 5FVVA 2ORQA 3E7SA 4C39A 4CWWA 5AGKA 3HSOA 1ED5A 4KCNA 3JX4A 4D31A 4UH4A 5ADAA 2AN0A 4D35A 4CVGA 3NLHA 5G6JA 5FVUA 3TYNA 5FVQA 3NLEA 3JX2A 3N5PA 3TYLA 4K5DA 2G6LA 3N5QA 1P6KA 3N66A 3EAIA 1ZZSA 1RS6A 3RQJA 4CAOA 3N62A 5ADJA 8NSEA 4CX6A 4CX7A 3TYMA 4UPRA 5FVTA 3PNHA 5G0OA 4UGCA 3NW2A 4CTPA 3RQNA 1Q2OA 4JSLA 2NODA 5AGNA 4IMXA 4UGGA 3EBFA 1MMWA 3SVPA 3JWZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IMUA 1DF1A 2OROA 5G6GA 1D0CA 1ED6A 2BHJA 4JSJA 4CTYA 4D1PA 3NLPA 1K2RA 5G6HA 3JWXA 3UFQA 3JT9A 3RQPA 1DM6A 4D33A 4CAMA 5FVXA 4KCPA 1ZVLA 3N6EA 3RQMA 4CARA 4UGNA 4UH6A 4UGSA 4D3UA 3JX0A 1QWCA 4JSIA 3RQKA 1M7VA 2G6MA 3NLJA 4JSFA 5G6QA 4CUNA 1D1YA 4FVWA 1DD7A 4UGEA 5FVOA 5G6FA 4CWZA 3E7IA 3JT5A 1NOSA 2NSEA 3JT3A 4CU0A 4UH0A 4UGKA 4UG9A 4CWYA 4UPTA 1RS8A 4UH1A 3UFOA 3N60A 4D36A 4JS9A 5AD7A 1NOCA 3NM0A 4KCHA 2G6KA 4KCIA 4D3NA 4UPNA 3N5YA 1DM8A 3Q99A 3E7SB 1R35A 4CX4A 4CTTA 4D3MA 1P6HA 4CTRA 4KCMA 3RQLA 3DQSA 1M9RA 4LUWA 4UHAA 3NSEA 4CAPA 1D1XA 5G69A 3N6GA 3N69A 4K5FA 4KCLA 2ORTA 2Y37A 3E7MA 4CX3A 4K5JA 1OM5A 4UPPA 4CTVA 2NSIA 3E6LA 4UGOA 3JX3A 2ORSA 4IMSA 3NLNA 4CTXA 1MMVA 4D32A 1ZZTA 1K2UA 3NLWA 1JWKA 4UGRA 5G6AA 5ADLA 4IMTA 1M9QA 1QW6A 3E6NA 4UH2A 3JX1A 3EJ8A 4CANA 3JX5A 3N5XA 4UGDA 5ADKA 3E65A 3FC5A 3JWTA 3NQSA 3NLVA 4V3UA 1P6IA 4UPOA 5G6NA 4UGUA 5AGMA 4CWVA 3NLGA 1QOMA 1DWWA 7NSEA 4UH5A 4UGWA 5G6EA 3DWJA 4CX1A 5FJ3A 4UGTA 1LZZA 1M9TA 3NLQA 1FOLA 4UG8A 5AGLA 3N5TA 5AD5A 4NSEA 4UH9A 2FC1A 5ADGA 3HSPA 3N6AA 5G0PA 4CTZA 4UQRA 5G65A 3EAHA 5G6LA 4KCQA 1ZZQA 1DM7A 4CTQA 4JSEA 2G6OA 3N5VA 5FVYA 1K2TA 5FW0A 5ADNA 3N6FA 3NLXA 4D34A 4LWAA 1M00A 3NLYA 5AD6A 4UG6A 4UGZA 4D1NA 4UG7A 2NOSA 3N5WA 1ZZRA 4FVZA 1M9MA 5NSEA 4D3AA 1P6JA 1JWJA 4UGVA 5G6KA 3PNFA 4UGBA 4D7JA 3UFPA 4D3JA 4K5KA 1RS9A 4LUXA 3PNEA 3N64A 1ZVIA 4V3WA 1VAGA 3E6TA 1D1VA 3JT8A 3E6OA 3E7GA 5FVRA 4D7OA 4D30A 3NNYA 4UGPA 3B3NA 5ADIA 2G6NA 5G6IA 4EUXA 3JWYA 4CUMA 4D3BA 2FLQA 1FOJA 3N2RA 3NLUA 4KCRA 4D2YA 1K2SA 4CULA 4KCOA 4UH7A 4FW0A 3NLDA 4KCJA 6NSEA 2AN2A 3UFTA 2HX2A 4UCHA 4CFTA 4IMWA 3JWSA 4JSGA 4UGFA 1DMIA 2FBZX 3N68A 4UGIA 4D37A 5ADEA 1ED4A 4D7HA 5ADCA 1FOIA 3N6BA 4NOSA 4UGJA 4D3TA 3NNZA 4UGLA 4D3IA 4CU1A 4CWXA 3N5ZA 4D3OA 3N61A 5G6BA 5FVPA 4D1OA 1P6LA 3NOSA 4CX2A 1VAFA 3RQOA 1DMJA 3UFVA 3NODA 2G6HA 3EBDA 1QW5A 5G6DA 4UPMA 1M8HA 4UH8A 1P6MA 3NLFA 3JX6A 4UGQA 3TYOA 3DQTA 3DQRA 3NLKA 5ADBA 3E7TA 1M8EA 4K5IA 2G6IA 5AGPA 5AD9A 5FVWA 5ADFA 1ZZUA 1MJTA 9NSEA 5AD4A 4D38A 3JT4A 4JSKA 5G66A 5G6MA 3N6DA 3JWUA 4UGYA 1NODA 5FJ2A 3SVQA 4CX0A 1N2NA 3NLZA 1QW4A 1I83A 4KCSA 1D1WA 4UPQA 4C3AA 4UH3A 2ORPA 1NSIA 1M9JA 4K5HA 4CTUA 5G68A 3N5SA 3JWVA 4D2ZA 3N5RA 2HX3A 3NLOA 1M9KA 3UFWA 3NLTA 4D3VA 3E67A 3NLMA 4UGHA 4FVXA 1FOOA 1DMKA 5ADDA 3UFUA 4FVYA 1P6NA 1M8IA 5G67A 3NLRA 1D0OA 3B3OA 5FVSA 1M7ZA 5G6PA 5AD8A 4CX5A 4GQEA 3HSNA 4UGMA 1DWVA 3N67A 4CAQA 1DWXA 4K5EA 3N63A 3N6CA 5ADMA 2HX4A 3UFRA 4CTWA 4UGAA 4V3YA 3JWWA 3JT6A 4LWBA 4D39A 4UPSA 4K5GA 4CDTA 5G0NA 4V3VA 4JSMA 4UQSA 5FVZA 3E68A 4UGXA 5G6OA 1LZXA 3PNGA 2ORRA 4JSHA 4CFTB 5AGOA 4UG5A 3B3MA 4KCKA 1FOPA 4V3ZA 2FC2A 4D3KA 2G6JA 3N65A 3NLIA 4V3XA 3B3PA 3UFSA 3JTAA 3Q9AA 4D7IA 1NSEA 3JT7A 1OM4A 4CU1B 5G6CA 2AMOA 1M8DA 1RS7A 5FVVA 2ORQA 3E7SA 4C39A 4CWWA 5AGKA 3HSOA 1ED5A 4KCNA 3JX4A 4D31A 4UH4A 5ADAA 2AN0A 4D35A 4CVGA 3NLHA 5G6JA 5FVUA 3TYNA 5FVQA 3NLEA 3JX2A 3N5PA 3TYLA 4K5DA 2G6LA 3N5QA 1P6KA 3N66A 3EAIA 1ZZSA 1RS6A 3RQJA 4CAOA 3N62A 5ADJA 8NSEA 4CX6A 4CX7A 3TYMA 4UPRA 5FVTA 3PNHA 5G0OA 4UGCA 3NW2A 4CTPA 3RQNA 1Q2OA 4JSLA 2NODA 5AGNA 4IMXA 4UGGA 3EBFA 1MMWA 3SVPA 3JWZA
chains in the Genus database with same CATH topology
4IMUA 1DF1A 2OROA 5G6GA 1D0CA 1ED6A 2BHJA 4JSJA 4CTYA 4D1PA 3NLPA 1K2RA 5G6HA 3JWXA 3UFQA 3JT9A 3RQPA 1DM6A 4D33A 4CAMA 5FVXA 4KCPA 1ZVLA 3N6EA 3RQMA 4CARA 4UGNA 4UH6A 4UGSA 4D3UA 3JX0A 1QWCA 4JSIA 3RQKA 1M7VA 2G6MA 3NLJA 4JSFA 5G6QA 4CUNA 1D1YA 4FVWA 1DD7A 4UGEA 5FVOA 5G6FA 4CWZA 3E7IA 3JT5A 1NOSA 2NSEA 3JT3A 4CU0A 4UH0A 4UGKA 4UG9A 4CWYA 4UPTA 1RS8A 4UH1A 3UFOA 3N60A 4D36A 4JS9A 5AD7A 1NOCA 3NM0A 4KCHA 2G6KA 4KCIA 4D3NA 4UPNA 3N5YA 1DM8A 3Q99A 3E7SB 1R35A 4CX4A 4CTTA 4D3MA 1P6HA 4CTRA 4KCMA 3RQLA 3DQSA 1M9RA 4LUWA 4UHAA 3NSEA 4CAPA 1D1XA 5G69A 3N6GA 3N69A 4K5FA 4KCLA 2ORTA 2Y37A 3E7MA 4CX3A 4K5JA 1OM5A 4UPPA 4CTVA 2NSIA 3E6LA 4UGOA 3JX3A 2ORSA 4IMSA 3NLNA 4CTXA 1MMVA 4D32A 1ZZTA 1K2UA 3NLWA 1JWKA 4UGRA 5G6AA 5ADLA 4IMTA 1M9QA 1QW6A 3E6NA 4UH2A 3JX1A 3EJ8A 4CANA 3JX5A 3N5XA 4UGDA 5ADKA 3E65A 3FC5A 3JWTA 3NQSA 3NLVA 4V3UA 1P6IA 4UPOA 5G6NA 4UGUA 5AGMA 4CWVA 3NLGA 1QOMA 1DWWA 7NSEA 4UH5A 4UGWA 5G6EA 3DWJA 4CX1A 5FJ3A 4UGTA 1LZZA 1M9TA 3NLQA 1FOLA 4UG8A 5AGLA 3N5TA 5AD5A 4NSEA 4UH9A 2FC1A 5ADGA 3HSPA 3N6AA 5G0PA 4CTZA 4UQRA 5G65A 3EAHA 5G6LA 4KCQA 1ZZQA 1DM7A 4CTQA 4JSEA 2G6OA 3N5VA 5FVYA 1K2TA 5FW0A 5ADNA 3N6FA 3NLXA 4D34A 4LWAA 1M00A 3NLYA 5AD6A 4UG6A 4UGZA 4D1NA 4UG7A 2NOSA 3N5WA 1ZZRA 4FVZA 1M9MA 5NSEA 4D3AA 1P6JA 1JWJA 4UGVA 5G6KA 3PNFA 4UGBA 4D7JA 3UFPA 4D3JA 4K5KA 1RS9A 4LUXA 3PNEA 3N64A 1ZVIA 4V3WA 1VAGA 3E6TA 1D1VA 3JT8A 3E6OA 3E7GA 5FVRA 4D7OA 4D30A 3NNYA 4UGPA 3B3NA 5ADIA 2G6NA 5G6IA 4EUXA 3JWYA 4CUMA 4D3BA 2FLQA 1FOJA 3N2RA 3NLUA 4KCRA 4D2YA 1K2SA 4CULA 4KCOA 4UH7A 4FW0A 3NLDA 4KCJA 6NSEA 2AN2A 3UFTA 2HX2A 4UCHA 4CFTA 4IMWA 3JWSA 4JSGA 4UGFA 1DMIA 2FBZX 3N68A 4UGIA 4D37A 5ADEA 1ED4A 4D7HA 5ADCA 1FOIA 3N6BA 4NOSA 4UGJA 4D3TA 3NNZA 4UGLA 4D3IA 4CU1A 4CWXA 3N5ZA 4D3OA 3N61A 5G6BA 5FVPA 4D1OA 1P6LA 3NOSA 4CX2A 1VAFA 3RQOA 1DMJA 3UFVA 3NODA 2G6HA 3EBDA 1QW5A 5G6DA 4UPMA 1M8HA 4UH8A 1P6MA 3NLFA 3JX6A 4UGQA 3TYOA 3DQTA 3DQRA 3NLKA 5ADBA 3E7TA 1M8EA 4K5IA 2G6IA 5AGPA 5AD9A 5FVWA 5ADFA 1ZZUA 1MJTA 9NSEA 5AD4A 4D38A 3JT4A 4JSKA 5G66A 5G6MA 3N6DA 3JWUA 4UGYA 1NODA 5FJ2A 3SVQA 4CX0A 1N2NA 3NLZA 1QW4A 1I83A 4KCSA 1D1WA 4UPQA 4C3AA 4UH3A 2ORPA 1NSIA 1M9JA 4K5HA 4CTUA 5G68A 3N5SA 3JWVA 4D2ZA 3N5RA 2HX3A 3NLOA 1M9KA 3UFWA 3NLTA 4D3VA 3E67A 3NLMA 4UGHA 4FVXA 1FOOA 1DMKA 5ADDA 3UFUA 4FVYA 1P6NA 1M8IA 5G67A 3NLRA 1D0OA 3B3OA 5FVSA 1M7ZA 5G6PA 5AD8A 4CX5A 4GQEA 3HSNA 4UGMA 1DWVA 3N67A 4CAQA 1DWXA 4K5EA 3N63A 3N6CA 5ADMA 2HX4A 3UFRA 4CTWA 4UGAA 4V3YA 3JWWA 3JT6A 4LWBA 4D39A 4UPSA 4K5GA 4CDTA 5G0NA 4V3VA 4JSMA 4UQSA 5FVZA 3E68A 4UGXA 5G6OA 1LZXA 3PNGA 2ORRA 4JSHA 4CFTB 5AGOA 4UG5A 3B3MA 4KCKA 1FOPA 4V3ZA 2FC2A 4D3KA 2G6JA 3N65A 3NLIA 4V3XA 3B3PA 3UFSA 3JTAA 3Q9AA 4D7IA 1NSEA 3JT7A 1OM4A 4CU1B 5G6CA 2AMOA 1M8DA 1RS7A 5FVVA 2ORQA 3E7SA 4C39A 4CWWA 5AGKA 3HSOA 1ED5A 4KCNA 3JX4A 4D31A 4UH4A 5ADAA 2AN0A 4D35A 4CVGA 3NLHA 5G6JA 5FVUA 3TYNA 5FVQA 3NLEA 3JX2A 3N5PA 3TYLA 4K5DA 2G6LA 3N5QA 1P6KA 3N66A 3EAIA 1ZZSA 1RS6A 3RQJA 4CAOA 3N62A 5ADJA 8NSEA 4CX6A 4CX7A 3TYMA 4UPRA 5FVTA 3PNHA 5G0OA 4UGCA 3NW2A 4CTPA 3RQNA 1Q2OA 4JSLA 2NODA 5AGNA 4IMXA 4UGGA 3EBFA 1MMWA 3SVPA 3JWZA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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