The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
86
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sequence length |
249
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structure length |
249
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Chain Sequence |
LATPFQEYSQKYENIRLERDGGVLLVTVHTEGKSLVWTSTAHDELAYCFHDIACDRENKVVILTGTGPSFCNEIDFTSFNLGTPHDWDEIIFEGQRLLNNLLSIEVPVIAAVNGPVTNAPEIPVMSDIVLAAESATFQDGPHFPSGIVPGDGAHVVWPHVLGSNRGRYFLLTGQELDARTALDYGAVNEVLSEQELLPRAWELARGIAEKPLLARRYARKVLTRQLRRVMEADLSLGLAHEALAAIDLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| molecule keywords |
6-oxocamphor hydrolase
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| publication title |
Structure of 6-oxo camphor hydrolase H122A mutant bound to its natural product, (2S,4S)-alpha-campholinic acid: mutant structure suggests an atypical mode of transition state binding for a crotonase homolog.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Rhodococcus sp. ncimb 9784
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| total genus |
86
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| structure length |
249
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| sequence length |
249
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L
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| ec nomenclature |
ec
3.7.1.18: 6-oxocamphor hydrolase. |
| pdb deposition date | 2004-04-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00378 | ECH_1 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VIV A; 1YG8 A; 3H0S A; 3T8A A; 3IBB A; 4JCR A; 5DTP A; 4I42 A; 4B3H A; 3PEA A; 3LAO A; 2J5I A; 2PPY A; 3GF7 A; 1DCI A; 4DI1 A; 5JBW A; 4YLH A; 3R9T A; 1XNW A; 4RYF A; 5IKL B; 1N6D A; 2EJ5 A; 3BEZ A; 3HIN A; 2VSU C; 1Y7O A; 3TLF A; 4I52 A; 4JYJ A; 3BF0 A; 4K29 A; 1ON9 A; 4QFE A; 2F6Q A; 1VRG A; 1UYT A; 3U9S B; 4JCQ A; 4F47 A; 3QXZ A; 1W2X A; 5C90 A; 3P85 A; 3K8X A; 4KWB A; 3N6R B; 1TYF A; 1N6E A; 1YG6 A; 4RYF H; 3T88 A; 4JOT A; 3M6N A; 3PZK A; 3T89 A; 2PBP A; 3P2L A; 2F9Y A; 1NZY A; 2VSU F; 1SG4 A; 2VSS A; 4FJW D; 1J7X A; 3HLN 1; 2FW2 A; 5DUC A; 3TVW A; 1UYV A; 3HRX A; 3BPP A; 4QII A; 2F9Y B; 5G1S A; 3TRR A; 4NNQ A; 3RST A; 1ON3 A; 1WDM A; 3Q0J A; 3TVU A; 3GLM A; 4L8K A; 3QK8 A; 3TDC A; 1Q51 A; 4JYL A; 3K50 A; 3R9Q A; 3G64 A; 2F6I A; 3QRE A; 4FND A; 1PIX A; 4I4Z A; 5DU6 A; 3RSI A; 1WDL A; 3KQF A; 4JFC A; 5DU4 A; 4ASI A; 2VSU A; 3GF3 A; 3TZ3 A; 4EML A; 2ZQQ A; 1DUB A; 3OME A; 1HNU A; 4ELW A; 4IZC A; 2X24 A; 2J5S A; 3U9R B; 3IB9 A; 4ZU2 A; 2QQ3 A; 4KNP A; 2FZS A; 3JU1 A; 1XX4 A; 1X0U A; 1HNO A; 5C9G A; 4U0G A; 3R6H A; 2W3P A; 2J5I B; 4ZDB A; 1RJN A; 3QWD A; 4EMM A; 1OD2 A; 1SZO A; 4KPK A; 4IZD A; 3R0O A; 1RJM A; 2VSS F; 5FUS A; 2C8T A; 2J5I I; 1WZ8 A; 3STA A; 3LKE A; 4Q0G A; 3ZWC A; 2DEO A; 3KTI A; 2HW5 A; 4U0H A; 3SWX A; 5INF A; 1UYS A; 1K32 A; 2VX2 A; 2VSS E; 4U0G H; 4MOU A; 1XO6 A; 3KTJ A; 1HZD A; 1K39 A; 4JCT A; 4RCN A; 2GTR A; 1FC7 A; 3TT6 A; 4G2R A; 5KJP A; 1PJH A; 2WTB A; 1NZY B; 5DL1 A; 3QXI A; 3OT6 A; 3SLL A; 3V5E A; 3ZW9 A; 3TV5 A; 4Q1I A; 2NP9 A; 3MOY A; 2ZL2 A; 4L6W A; 3OC7 A; 1EY3 A; 4LK5 A; 4K2N A; 2VSU E; 4GM2 A; 3NJB A; 3ZWA A; 4JJT A; 2A7K A; 4WZ8 B; 3ISA A; 2PG8 A; 3Q7H A; 3Q1T A; 4IZB A; 3MYB A; 4Z0M A; 4ZDF A; 4JWV A; 2Q35 A; 3ZW8 A; 4WYO B; 1UYR A; 3RRV A; 3KTG A; 3H0U A; 3H0Q A; 3DJA A; 4U1A A; 3QYR A; 3H02 A; 2D3T A; 4GHN A; 5E0N X; 4JSB A; 4WCZ A; 3MFM A; 3Q0G A; 4HC8 A; 4B3I A; 3T3W A; 4FZW C; 5MGB A; 3QKA A; 5KDR A; 3H0J A; 5DTW A; 3H81 A; 3DOR A; 5KDR B; 4ELX A; 1FCF A; 2X58 A; 4ZDE A; 3T8B A; 2VRE A; 5INI A; 4ELS A; 4MI2 A; 3GKB A; 5CTC A; 5G1Q A; 4FN7 A; 4U19 A; 2J5G D; 1Q52 A; 1MJ3 A; 2UZF A; 3U9T B; 4OLQ A; 5E0S A; 2CBY A; 2ZL3 A; 1N6F A; 4HNK A; 3KTK A; 3HE2 A; 3P5M A; 1O8U A; 1OD4 A; 4B3J A; 3KTH A; 4JVT A; 4JCS A; 1FC6 A; 5JBX A; 3FDU A; 4K3W A; 3L3S A; 4QIJ A; 4KD6 A; 4OMR A; 3ZWB A; 2A7S A; 3GMA A; 2DUB A; 2F9I A; 3V5I A; 4EMP A; 2BZR A; 5DUF A; 5DU8 A; 5CTB A; 3PGQ A; 2F9I B; 2A81 A; 3WG5 A; 1XNY A; 5DZK A; 4MXI A; 3R9S A; 4U18 A; 4ZDD A; 1WDK A; 1EF9 A; 5E0S H; 3PE8 A; 2Q34 A; 4OG1 A; 3NJD A; 2ZL0 A; 1TG6 A; 4FZW A; 5DKP A; 1JXZ A; 3QMJ A; 4ZDC A; 3M6M A; 2CE3 A; 2ZQR A; 1XNV A; 2IEX A; 3I47 A; 1FC9 A; 2Q2X A; 3TT7 A; 5G1R A; 3ST9 A; 1UIY A; 3FF6 A; 3MT6 A; 4NEK A; 5FIF A; 2ZL4 A; 4FB8 A; 4FN8 A; 2J5G A; 2FBM A; 5DZK H; 5ING A; 1EF8 A; 3IAV A; 4FNB A; 3HP0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VIV A; 1YG8 A; 3H0S A; 3T8A A; 3IBB A; 4JCR A; 5DTP A; 4I42 A; 4B3H A; 3PEA A; 3LAO A; 2J5I A; 2PPY A; 3GF7 A; 1DCI A; 4DI1 A; 5JBW A; 4YLH A; 3R9T A; 1XNW A; 4RYF A; 5IKL B; 1N6D A; 2EJ5 A; 3BEZ A; 3HIN A; 2VSU C; 1Y7O A; 3TLF A; 4I52 A; 4JYJ A; 3BF0 A; 4K29 A; 1ON9 A; 4QFE A; 2F6Q A; 1VRG A; 1UYT A; 3U9S B; 4JCQ A; 4F47 A; 3QXZ A; 1W2X A; 5C90 A; 3P85 A; 3K8X A; 4KWB A; 3N6R B; 1TYF A; 1N6E A; 1YG6 A; 4RYF H; 3T88 A; 4JOT A; 3M6N A; 3PZK A; 3T89 A; 2PBP A; 3P2L A; 2F9Y A; 1NZY A; 2VSU F; 1SG4 A; 2VSS A; 4FJW D; 1J7X A; 3HLN 1; 2FW2 A; 4HDT A; 5DUC A; 3TVW A; 1UYV A; 3HRX A; 3BPP A; 4QII A; 2F9Y B; 5G1S A; 3TRR A; 4NNQ A; 3RST A; 1ON3 A; 1WDM A; 3Q0J A; 3TVU A; 3GLM A; 4L8K A; 3QK8 A; 3TDC A; 1Q51 A; 4JYL A; 3K50 A; 3R9Q A; 3G64 A; 2F6I A; 3QRE A; 4FND A; 1PIX A; 4I4Z A; 5DU6 A; 3RSI A; 1WDL A; 3KQF A; 4JFC A; 5DU4 A; 4ASI A; 2VSU A; 3GF3 A; 3TZ3 A; 4EML A; 2ZQQ A; 1DUB A; 3OME A; 1HNU A; 4ELW A; 4IZC A; 2X24 A; 2J5S A; 3U9R B; 3IB9 A; 4ZU2 A; 2QQ3 A; 4KNP A; 2FZS A; 3JU1 A; 1XX4 A; 1X0U A; 1HNO A; 5C9G A; 2YJG A; 4U0G A; 3R6H A; 2W3P A; 2J5I B; 4ZDB A; 1RJN A; 3QWD A; 4EMM A; 1OD2 A; 1SZO A; 4KPK A; 4IZD A; 3R0O A; 1RJM A; 2VSS F; 5FUS A; 2C8T A; 2J5I I; 1WZ8 A; 3STA A; 3LKE A; 4Q0G A; 3ZWC A; 2DEO A; 3KTI A; 2HW5 A; 4U0H A; 3SWX A; 5INF A; 1UYS A; 1K32 A; 2VX2 A; 2VSS E; 4U0G H; 4MOU A; 1XO6 A; 3KTJ A; 1HZD A; 1K39 A; 4JCT A; 4RCN A; 2GTR A; 1FC7 A; 3TT6 A; 4G2R A; 5KJP A; 1PJH A; 2WTB A; 1NZY B; 5DL1 A; 3QXI A; 3OT6 A; 3SLL A; 3V5E A; 3ZW9 A; 3TV5 A; 4Q1I A; 2NP9 A; 3MOY A; 2ZL2 A; 4L6W A; 3OC7 A; 1EY3 A; 4LK5 A; 4K2N A; 2VSU E; 4GM2 A; 3NJB A; 3ZWA A; 4JJT A; 2A7K A; 4WZ8 B; 3ISA A; 2PG8 A; 3Q7H A; 3Q1T A; 4IZB A; 3MYB A; 4Z0M A; 4ZDF A; 4JWV A; 2Q35 A; 3ZW8 A; 4WYO B; 1UYR A; 3RRV A; 3KTG A; 3H0U A; 3H0Q A; 3DJA A; 4U1A A; 3QYR A; 3H02 A; 2D3T A; 4GHN A; 5E0N X; 4JSB A; 4WCZ A; 3MFM A; 3Q0G A; 4HC8 A; 4B3I A; 3T3W A; 4FZW C; 5MGB A; 3QKA A; 5KDR A; 3H0J A; 5DTW A; 3H81 A; 3DOR A; 5KDR B; 4ELX A; 1FCF A; 2X58 A; 4ZDE A; 3T8B A; 2VRE A; 5INI A; 4ELS A; 4MI2 A; 3GKB A; 5CTC A; 5G1Q A; 4FN7 A; 4U19 A; 2J5G D; 1Q52 A; 1MJ3 A; 2UZF A; 3U9T B; 4OLQ A; 5E0S A; 2CBY A; 2ZL3 A; 1N6F A; 4HNK A; 3KTK A; 3HE2 A; 3P5M A; 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1XO6 A; 3KTJ A; 1HZD A; 1K39 A; 4JCT A; 4RCN A; 2GTR A; 1FC7 A; 3TT6 A; 4G2R A; 5KJP A; 1PJH A; 2WTB A; 1NZY B; 5DL1 A; 3QXI A; 3OT6 A; 3SLL A; 3V5E A; 3ZW9 A; 3TV5 A; 4Q1I A; 2NP9 A; 3MOY A; 2ZL2 A; 4L6W A; 3OC7 A; 1EY3 A; 4LK5 A; 4K2N A; 2VSU E; 4GM2 A; 3NJB A; 3ZWA A; 4JJT A; 2A7K A; 4WZ8 B; 3ISA A; 2PG8 A; 3Q7H A; 3Q1T A; 4IZB A; 3MYB A; 4Z0M A; 4ZDF A; 4JWV A; 2Q35 A; 3ZW8 A; 4WYO B; 1UYR A; 3RRV A; 3KTG A; 3H0U A; 3H0Q A; 3DJA A; 4U1A A; 3QYR A; 3H02 A; 2D3T A; 4GHN A; 5E0N X; 4JSB A; 4WCZ A; 3MFM A; 3Q0G A; 4HC8 A; 4B3I A; 3T3W A; 4FZW C; 5MGB A; 3QKA A; 5KDR A; 3H0J A; 5DTW A; 3H81 A; 3DOR A; 5KDR B; 4ELX A; 1FCF A; 2X58 A; 4ZDE A; 3T8B A; 2VRE A; 5INI A; 4ELS A; 4MI2 A; 3GKB A; 5CTC A; 5G1Q A; 4FN7 A; 4U19 A; 2J5G D; 1Q52 A; 1MJ3 A; 2UZF A; 3U9T B; 4OLQ A; 5E0S A; 2CBY A; 2ZL3 A; 1N6F A; 4HNK A; 3KTK A; 3HE2 A; 3P5M A; 1O8U A; 1OD4 A; 4B3J A; 4J2U A; 4NAR A; 3KTH A; 4JVT A; 4JCS A; 1FC6 A; 5JBX A; 3FDU A; 4K3W A; 3L3S A; 4QIJ A; 4KD6 A; 4OMR A; 3ZWB A; 2A7S A; 3GMA A; 2DUB A; 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