The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
217
|
sequence length |
714
|
structure length |
681
|
Chain Sequence |
PIATPYPVKEWLQPKRYKAHLMGTTYVYDFPELFRQASSSQWKNFSADVKLTDDFFISNELIEDENGELTEVEREPGANAIGMVAFKITVKTPEYPRGRQFVVVANDITFKIGSFGPQEDEFFNKVTEYARKRGIPRIYLAANSGARIGMAEEIVPLFQVAWNDAANPDKGFQYLYLTSEGMETLKKFDKENSVLTERTVINGEERFVIKTIIGSEDGLGVECLRGSGLIAGATSRAYHDIFTITLVTCRSVGIGAYLVRLGQRAIQVEGQPIILTGAPAINKMLGREVYTSNLQLGGTQIMYNNGVSHLTAVDDLAGVEKIVEWMSYVPAKRNMPVPILETKDTWDRPVDFTPTNDETYDVRWMIEGRETESGFEYGLFDKGSFFETLSGWAKGVVVGRARLGGIPLGVIGVETRTVENLIPADPANPNSAETLIQEPGQVWHPNSAFKTAQAINDFNNGEQLPMMILANWRGFSGGQRDMFNEVLKYGSFIVDALVDYKQPIIIYIPPTGELRGGSWVVVDPTINADQMEMYADVNARAGVLEPQGMVGIKFRREKLLDTMNRLELLPIYGQISLQFADLHDRSSRMVAKGVISKELEWTEARRFFFWRLRRRLNEEYLIKRLSHQVGEASRLEKIARIRSWYPASVDHEDDRQVATWIEENYKTLDDKLKGLKLESFA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Ligase
|
| molecule keywords |
Acetyl-CoA carboxylase
|
| publication title |
Discovery of small molecule isozyme non-specific inhibitors of mammalian acetyl-CoA carboxylase 1 and 2.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
217
|
| structure length |
681
|
| sequence length |
714
|
| chains with identical sequence |
B, C
|
| ec nomenclature |
ec
6.3.4.14: Biotin carboxylase. |
| pdb deposition date | 2009-04-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01039 | Carboxyl_trans | Carboxyl transferase domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | ClpP/crotonase fold | Biotin dependent carboxylase carboxyltransferase | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2C8T A; 4FN8 A; 3HP0 A; 1TG6 A; 3ZW9 A; 2ZL0 A; 4FZW A; 4ZDB A; 3GKB A; 3H0Q A; 3PEA A; 3H0U A; 2HW5 A; 2F6Q A; 2F6I A; 4OG1 A; 4JCQ A; 3FDU A; 4FN7 A; 3HIN A; 3TZ3 A; 3TT7 A; 4JSB A; 4IZB A; 2A7S A; 1WDM A; 1UYT A; 3TLF A; 5KJP A; 4ZDD A; 5DZK H; 3M6M A; 1K32 A; 4FJW D; 3T3W A; 1O8U A; 1N6E A; 3RRV A; 4KPK A; 4EMP A; 1W2X A; 1PIX A; 4WCZ A; 1RJN A; 2VRE A; 4WYO B; 1XO6 A; 4RCN A; 4Q1I A; 4FNB A; 4L8K A; 4B3H A; 4U1A A; 3SLL A; 4JYL A; 3QK8 A; 3T89 A; 2F9Y A; 3NJB A; 3Q7H A; 5E0S H; 1JXZ A; 4U0G A; 5CTB A; 1HZD A; 3PGQ A; 1K39 A; 2NP9 A; 3R6H A; 1SZO A; 3KTK A; 4I4Z A; 4RYF A; 1UYS A; 1OD4 A; 5DU6 A; 4FZW C; 3OME A; 1FCF A; 4B3J A; 4JCR A; 3QWD A; 2FW2 A; 3ZW8 A; 4QII A; 2QQ3 A; 1N6D A; 4ZU2 A; 2J5S A; 4JWV A; 3IBB A; 2X24 A; 1X0U A; 3H02 A; 1SG4 A; 3U9R B; 3T88 A; 5DUC A; 3GF3 A; 4U19 A; 5DUF A; 2VSU E; 4G2R A; 4JCS A; 2A7K A; 3BF0 A; 3SWX A; 1EY3 A; 1TYF A; 4U0H A; 4WZ8 B; 3PZK A; 3TVU A; 2F9I B; 5DL1 A; 4I42 A; 3QXZ A; 1EF9 A; 1J7X A; 2Q2X A; 1DUB A; 2F9Y B; 3RSI A; 1Q52 A; 4ELX A; 3TDC A; 1XNW A; 4MXI A; 2ZQQ A; 1MJ3 A; 1FC9 A; 2VSS E; 4QIJ A; 4DI1 A; 4JOT A; 3GMA A; 4HC8 A; 4FND A; 3KQF A; 5ING A; 3U9T B; 4Z0M A; 4F47 A; 3K8X A; 5C9G A; 4MOU A; 3QYR A; 1FC6 A; 1N6F A; 2ZL4 A; 1WDK A; 3P5M A; 3TV5 A; 3Q0J A; 3WG5 A; 3TVW A; 5DU8 A; 4U0G H; 3GLM A; 2FBM A; 4KWB A; 2PPY A; 3QMJ A; 3PE8 A; 4KNP A; 2F9I A; 5E0N X; 4RYF H; 4KD6 A; 5JBX A; 2Q35 A; 3P2L A; 5IKL B; 3T8B A; 5INF A; 3K50 A; 4NNQ A; 3U9S B; 2GTR A; 5FIF A; 2CE3 A; 2DEO A; 3BPP A; 3ZWB A; 4GM2 A; 4EMM A; 3FF6 A; 3Q0G A; 3RST A; 3KTI A; 3TT6 A; 2VSU A; 2D3T A; 3ZWC A; 4ZDE A; 4ASI A; 4JYJ A; 3R0O A; 1XX4 A; 4U18 A; 1ON3 A; 3R9Q A; 3QKA A; 2J5G D; 3M6N A; 4YLH A; 3VIV A; 2VSS A; 5MGB A; 4K29 A; 3MYB A; 3NJD A; 3MOY A; 4MI2 A; 1YG6 A; 3BEZ A; 4JCT A; 1UYV A; 2W3P A; 3IB9 A; 4JJT A; 3OT6 A; 4OMR A; 1EF8 A; 3R9T A; 2WTB A; 2J5I B; 4FB8 A; 5C90 A; 1FC7 A; 5JBW A; 1YG8 A; 4K3W A; 2Q34 A; 2ZL2 A; 2J5G A; 3KTG A; 4ZDF A; 3DJA A; 4I52 A; 4L6W A; 1NZY B; 4LK5 A; 4NEK A; 1Q51 A; 5FUS A; 2X58 A; 3TRR A; 1WZ8 A; 1RJM A; 3KTH A; 3HLN 1; 4ELS A; 1XNY A; 2IEX A; 1HNU A; 2VSU C; 3V5I A; 3KTJ A; 4JFC A; 2CBY A; 2ZL3 A; 3QXI A; 4QFE A; 2EJ5 A; 4Q0G A; 4ELW A; 3GF7 A; 3OC7 A; 2DUB A; 5DTW A; 2J5I I; 2ZQR A; 1XNV A; 3MFM A; 5INI A; 3H0J A; 3STA A; 1VRG A; 2UZF A; 4HNK A; 3LAO A; 3ZWA A; 2VSU F; 3ST9 A; 5G1S A; 2PG8 A; 3MT6 A; 3IAV A; 5DU4 A; 5DZK A; 4EML A; 2J5I A; 3ISA A; 5DKP A; 5KDR A; 3LKE A; 2A81 A; 1DCI A; 4JVT A; 1UYR A; 3QRE A; 5G1R A; 3Q1T A; 3H81 A; 3G64 A; 1PJH A; 1NZY A; 5CTC A; 1OD2 A; 4K2N A; 1WDL A; 2PBP A; 3R9S A; 3V5E A; 3DOR A; 4OLQ A; 3H0S A; 2VSS F; 4IZD A; 3HE2 A; 3T8A A; 1UIY A; 5G1Q A; 2BZR A; 2VX2 A; 4ZDC A; 5E0S A; 3L3S A; 2FZS A; 3I47 A; 5DTP A; 1HNO A; 4GHN A; 3P85 A; 3HRX A; 3JU1 A; 3N6R B; 1ON9 A; 5KDR B; 4B3I A; 1Y7O A; 4IZC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2C8T A; 4FN8 A; 3HP0 A; 1TG6 A; 3ZW9 A; 2ZL0 A; 4FZW A; 4ZDB A; 3GKB A; 3H0Q A; 3PEA A; 3H0U A; 2HW5 A; 2F6Q A; 2F6I A; 4OG1 A; 4JCQ A; 3FDU A; 4FN7 A; 3HIN A; 3TZ3 A; 3TT7 A; 4JSB A; 4IZB A; 2A7S A; 1WDM A; 2YJG A; 1UYT A; 3TLF A; 5KJP A; 4ZDD A; 5DZK H; 3M6M A; 1K32 A; 4FJW D; 3T3W A; 1O8U A; 1N6E A; 3RRV A; 4KPK A; 4EMP A; 1W2X A; 1PIX A; 4WCZ A; 1RJN A; 2VRE A; 4WYO B; 1XO6 A; 4RCN A; 4Q1I A; 4FNB A; 4L8K A; 4B3H A; 4U1A A; 3SLL A; 4JYL A; 3QK8 A; 3T89 A; 2F9Y A; 3NJB A; 3Q7H A; 5E0S H; 1JXZ A; 4U0G A; 5CTB A; 1HZD A; 3PGQ A; 1K39 A; 2NP9 A; 3R6H A; 1SZO A; 3KTK A; 4I4Z A; 4RYF A; 1UYS A; 1OD4 A; 5DU6 A; 4FZW C; 3OME A; 1FCF A; 4B3J A; 4JCR A; 3BPT A; 3QWD A; 2FW2 A; 3ZW8 A; 4QII A; 2QQ3 A; 1N6D A; 4ZU2 A; 2J5S A; 4JWV A; 3IBB A; 2X24 A; 1X0U A; 3H02 A; 4NAR A; 1SG4 A; 3U9R B; 3T88 A; 5DUC A; 3GF3 A; 4U19 A; 5DUF A; 2VSU E; 4G2R A; 4JCS A; 2A7K A; 5HUQ A; 3BF0 A; 3SWX A; 1EY3 A; 1TYF A; 4U0H A; 4WZ8 B; 3PZK A; 3TVU A; 2F9I B; 5DL1 A; 4I42 A; 3QXZ A; 1EF9 A; 1J7X A; 2Q2X A; 1DUB A; 2F9Y B; 3RSI A; 1Q52 A; 4ELX A; 3TDC A; 1XNW A; 4MXI A; 2ZQQ A; 1MJ3 A; 1FC9 A; 2VSS E; 4QIJ A; 4DI1 A; 4JOT A; 3GMA A; 4HC8 A; 4FND A; 3KQF A; 5ING A; 3U9T B; 4Z0M A; 4F47 A; 3K8X A; 5C9G A; 4MOU A; 3QYR A; 1FC6 A; 1N6F A; 2ZL4 A; 1WDK A; 3P5M A; 3TV5 A; 3Q0J A; 3WG5 A; 3TVW A; 5DU8 A; 4U0G H; 3GLM A; 2FBM A; 4KWB A; 2PPY A; 3QMJ A; 3PE8 A; 4KNP A; 2F9I A; 5E0N X; 4RYF H; 4KD6 A; 5JBX A; 2Q35 A; 3P2L A; 5IKL B; 3T8B A; 5INF A; 3K50 A; 4NNQ A; 3U9S B; 2GTR A; 5FIF A; 2CE3 A; 2DEO A; 3BPP A; 3ZWB A; 4GM2 A; 4EMM A; 3FF6 A; 3Q0G A; 3RST A; 3KTI A; 3TT6 A; 2VSU A; 2D3T A; 3ZWC A; 4ZDE A; 4ASI A; 4JYJ A; 3R0O A; 1XX4 A; 4U18 A; 1ON3 A; 3R9Q A; 3QKA A; 2J5G D; 3M6N A; 4YLH A; 3VIV A; 2VSS A; 5MGB A; 4K29 A; 3MYB A; 3NJD A; 3MOY A; 4MI2 A; 1YG6 A; 3BEZ A; 4HDT A; 4JCT A; 1UYV A; 2W3P A; 3IB9 A; 4JJT A; 3OT6 A; 4OMR A; 1EF8 A; 3R9T A; 2WTB A; 2J5I B; 4FB8 A; 5C90 A; 1FC7 A; 5JBW A; 1YG8 A; 4K3W A; 2Q34 A; 2ZL2 A; 2J5G A; 3KTG A; 4ZDF A; 3DJA A; 4I52 A; 4J2U A; 4L6W A; 1NZY B; 4LK5 A; 4NEK A; 1Q51 A; 5FUS A; 2X58 A; 3TRR A; 1WZ8 A; 1RJM A; 3KTH A; 3HLN 1; 4ELS A; 1XNY A; 2IEX A; 1HNU A; 2VSU C; 3V5I A; 3KTJ A; 4JFC A; 2CBY A; 2ZL3 A; 3QXI A; 4QFE A; 2EJ5 A; 4Q0G A; 4ELW A; 3GF7 A; 3OC7 A; 2DUB A; 5DTW A; 2J5I I; 2ZQR A; 1XNV A; 3MFM A; 5INI A; 3H0J A; 3STA A; 1VRG A; 2UZF A; 4HNK A; 3LAO A; 3ZWA A; 2VSU F; 3ST9 A; 5G1S A; 2PG8 A; 3MT6 A; 3IAV A; 5DU4 A; 5DZK A; 4EML A; 2J5I A; 3ISA A; 5DKP A; 5KDR A; 3LKE A; 2A81 A; 1DCI A; 4JVT A; 1UYR A; 3QRE A; 5G1R A; 3Q1T A; 3H81 A; 3G64 A; 1PJH A; 1NZY A; 5CTC A; 1OD2 A; 4K2N A; 1WDL A; 2PBP A; 3R9S A; 3V5E A; 3DOR A; 4OLQ A; 3H0S A; 2VSS F; 4IZD A; 3HE2 A; 3T8A A; 1UIY A; 5G1Q A; 2BZR A; 2VX2 A; 4ZDC A; 5E0S A; 3L3S A; 2FZS A; 3I47 A; 5DTP A; 1HNO A; 4GHN A; 3P85 A; 3HRX A; 3JU1 A; 3N6R B; 1ON9 A; 5KDR B; 4B3I A; 1Y7O A; 4IZC A; #chains in the Genus database with same CATH homology 2C8T A; 4FN8 A; 3HP0 A; 1TG6 A; 3ZW9 A; 2ZL0 A; 4FZW A; 4ZDB A; 3GKB A; 3H0Q A; 3PEA A; 3H0U A; 2HW5 A; 2F6Q A; 2F6I A; 4OG1 A; 4JCQ A; 3FDU A; 4FN7 A; 3HIN A; 3TZ3 A; 3TT7 A; 4JSB A; 4IZB A; 2A7S A; 1WDM A; 2YJG A; 1UYT A; 3TLF A; 5KJP A; 4ZDD A; 5DZK H; 3M6M A; 1K32 A; 4FJW D; 3T3W A; 1O8U A; 1N6E A; 3RRV A; 4KPK A; 4EMP A; 1W2X A; 1PIX A; 4WCZ A; 1RJN A; 2VRE A; 4WYO B; 1XO6 A; 4RCN A; 4Q1I A; 4FNB A; 4L8K A; 4B3H A; 4U1A A; 3SLL A; 4JYL A; 3QK8 A; 3T89 A; 2F9Y A; 3NJB A; 3Q7H A; 5E0S H; 1JXZ A; 4U0G A; 5CTB A; 1HZD A; 3PGQ A; 1K39 A; 2NP9 A; 3R6H A; 1SZO A; 3KTK A; 4I4Z A; 4RYF A; 1UYS A; 1OD4 A; 5DU6 A; 4FZW C; 3OME A; 1FCF A; 4B3J A; 4JCR A; 3BPT A; 3QWD A; 2FW2 A; 3ZW8 A; 4QII A; 2QQ3 A; 1N6D A; 4ZU2 A; 2J5S A; 4JWV A; 3IBB A; 2X24 A; 1X0U A; 3H02 A; 4NAR A; 1SG4 A; 3U9R B; 3T88 A; 5DUC A; 3GF3 A; 4U19 A; 5DUF A; 2VSU E; 4G2R A; 4JCS A; 2A7K A; 5HUQ A; 3BF0 A; 3SWX A; 1EY3 A; 1TYF A; 4U0H A; 4WZ8 B; 3PZK A; 3TVU A; 2F9I B; 5DL1 A; 4I42 A; 3QXZ A; 1EF9 A; 1J7X A; 2Q2X A; 1DUB A; 2F9Y B; 3RSI A; 1Q52 A; 4ELX A; 3TDC A; 1XNW A; 4MXI A; 2ZQQ A; 1MJ3 A; 1FC9 A; 2VSS E; 4QIJ A; 4DI1 A; 4JOT A; 3GMA A; 4HC8 A; 4FND A; 3KQF A; 5ING A; 3U9T B; 4Z0M A; 4F47 A; 3K8X A; 5C9G A; 4MOU A; 3QYR A; 1FC6 A; 1N6F A; 2ZL4 A; 1WDK A; 3P5M A; 3TV5 A; 3Q0J A; 3WG5 A; 3TVW A; 5DU8 A; 4U0G H; 3GLM A; 2FBM A; 4KWB A; 2PPY A; 3QMJ A; 3PE8 A; 4KNP A; 2F9I A; 5E0N X; 4RYF H; 4KD6 A; 5JBX A; 2Q35 A; 3P2L A; 5IKL B; 3T8B A; 5INF A; 3K50 A; 4NNQ A; 3U9S B; 2GTR A; 5FIF A; 2CE3 A; 2DEO A; 3BPP A; 3ZWB A; 4GM2 A; 4EMM A; 3FF6 A; 3Q0G A; 3RST A; 3KTI A; 3TT6 A; 2VSU A; 2D3T A; 3ZWC A; 4ZDE A; 4ASI A; 4JYJ A; 3R0O A; 1XX4 A; 4U18 A; 1ON3 A; 3R9Q A; 3QKA A; 2J5G D; 3M6N A; 4YLH A; 3VIV A; 2VSS A; 5MGB A; 4K29 A; 3MYB A; 3NJD A; 3MOY A; 4MI2 A; 1YG6 A; 3BEZ A; 4HDT A; 4JCT A; 1UYV A; 2W3P A; 3IB9 A; 4JJT A; 3OT6 A; 4OMR A; 1EF8 A; 3R9T A; 2WTB A; 2J5I B; 4FB8 A; 5C90 A; 1FC7 A; 5JBW A; 1YG8 A; 4K3W A; 2Q34 A; 2ZL2 A; 2J5G A; 3KTG A; 4ZDF A; 3DJA A; 4I52 A; 4J2U A; 4L6W A; 1NZY B; 4LK5 A; 4NEK A; 1Q51 A; 5FUS A; 2X58 A; 3TRR A; 1WZ8 A; 1RJM A; 3KTH A; 3HLN 1; 4ELS A; 1XNY A; 2IEX A; 1HNU A; 2VSU C; 3V5I A; 3KTJ A; 4JFC A; 2CBY A; 2ZL3 A; 3QXI A; 4QFE A; 2EJ5 A; 4Q0G A; 4ELW A; 3GF7 A; 3OC7 A; 2DUB A; 5DTW A; 2J5I I; 2ZQR A; 1XNV A; 3MFM A; 5INI A; 3H0J A; 3STA A; 1VRG A; 2UZF A; 4HNK A; 3LAO A; 3ZWA A; 2VSU F; 3ST9 A; 5G1S A; 2PG8 A; 3MT6 A; 3IAV A; 5DU4 A; 5DZK A; 4EML A; 2J5I A; 3ISA A; 5DKP A; 5KDR A; 3LKE A; 2A81 A; 1DCI A; 4JVT A; 1UYR A; 3QRE A; 5G1R A; 3Q1T A; 3H81 A; 3G64 A; 1PJH A; 1NZY A; 5CTC A; 1OD2 A; 4K2N A; 1WDL A; 2PBP A; 3R9S A; 3V5E A; 3DOR A; 4OLQ A; 3H0S A; 2VSS F; 4IZD A; 3HE2 A; 3T8A A; 1UIY A; 5G1Q A; 2BZR A; 2VX2 A; 4ZDC A; 5E0S A; 3L3S A; 2FZS A; 3I47 A; 5DTP A; 1HNO A; 4GHN A; 3P85 A; 3HRX A; 3JU1 A; 3N6R B; 1ON9 A; 5KDR B; 4B3I A; 1Y7O A; 4IZC A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
