The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
152
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sequence length |
446
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structure length |
421
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Chain Sequence |
AVALPRVSGGHDEHGHLEEFRTDPIGLMQRVRDELGDVGTFQLAGKQVVLLSGSHANEFFFRAGDDDLDQAKAYPFMTPIFGLRGEQMKGHAATIEDQVRRMIADWGEAGEIDLLDFFAELTIYTSSACLIGKKFRDQLDGRFAKLYHELERGTDPLAYVDPYLPIESFRRRDEARNGLVALVADIMNGRIANPDRDMLDVLIAVKAETGTPRFSADEITGMFISMMFAGHHTSSGTASWTLIELMRHRDAYAAVIDELDELYGDGRSVSFHALRQIPQLENVLKETLRLHPPLIILMRVAKGEFEVQGHRIHEGDLVAASPAISNRIPEDFPDPHDFVPARYEQPRQEDLLNRWTWIPFGAGRHRCVGAAFAIMQIKAIFSVLLREYEFEMAQPPESYRNDHSKMVVQLAQPAAVRYRRR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Small Molecule Scaffolds for Cyp51 Inhibitors Identified by High Throughput Screening and Defined by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Mycobacterium tuberculosis
|
| molecule keywords |
CYTOCHROME P450 51
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| total genus |
152
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| structure length |
421
|
| sequence length |
446
|
| ec nomenclature |
ec
1.14.14.154: Sterol 14-alpha-demethylase. |
| pdb deposition date | 2006-03-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00067 | p450 | Cytochrome P450 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Cytochrome p450 | Cytochrome P450 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4IQ7 A; 3EKF A; 4C0C A; 2IJ4 A; 3DBG A; 2Y5Z A; 4EJJ A; 1GJM A; 2F9Q A; 2Z3U A; 1Z8Q A; 3NC7 A; 5D40 A; 3S79 A; 1PKF A; 5L1V A; 2HPD A; 3P6T A; 2FDV A; 3DSI A; 1J51 A; 2VZ7 A; 5JQV A; 1YQP A; 4L0F A; 5IK1 A; 1T85 A; 2Q9G A; 4TPO A; 4DUE A; 4L0E A; 1ROM A; 3T3R A; 2RCM A; 3V8D A; 1SMI A; 1MPW A; 3EKB A; 4G1X A; 4G44 A; 3P3O A; 2XN8 A; 2IJ3 A; 5TE8 A; 1H5Z A; 3G5F A; 5LIE A; 2WV2 A; 1W0F A; 2ZWT A; 5E7Y A; 4KTK A; 2BZ9 A; 4KF0 A; 5LI8 A; 3A1L A; 2X7Y A; 1F4T A; 4C9O A; 2QBO A; 2WM5 A; 5KYO A; 4FB2 A; 4IPS A; 2A1O A; 4L40 A; 3E5L A; 3P6P A; 2WH8 A; 3BDZ A; 5JL6 A; 5M0P A; 1FAH A; 4DUB A; 5L1U A; 2J0D A; 2VZM A; 2FEU A; 4EJG A; 3K1O A; 3TJS A; 2CD8 A; 3TYW A; 3KSW A; 1W0G A; 2C7X A; 2NZ5 A; 5LI6 A; 1LFK A; 1P0X A; 4UQH A; 3WSP A; 4Z5P A; 4UAX A; 3KX3 A; 4CPP A; 5IBG A; 5CP4 A; 1JME A; 4ICT A; 5CJE A; 3DBM A; 1F24 A; 3VTJ A; 3WEC A; 4C28 A; 2WGY A; 4BF4 A; 3ZG3 A; 4DTZ A; 4DVQ A; 4H1N A; 5EM4 A; 1E9X A; 2WUZ A; 1W0E A; 2NNI A; 1GWI A; 1Z11 A; 4APY A; 4DXY A; 3ME6 A; 3WRH A; 2WHW A; 4C9M A; 2FRZ A; 3T3S A; 2XC3 A; 4J14 A; 3A4G A; 1EA1 A; 4Z5Q A; 2H7R A; 4L4F A; 5A1R A; 5A5I A; 4COH A; 1PHF A; 4K9V A; 3UAS A; 3P6N A; 1C8J A; 3CY0 A; 1N97 A; 1OXA A; 4ZF6 A; 1NR6 A; 5JKW A; 3KHM A; 2RFC A; 2PG6 A; 4L77 A; 4TX3 A; 3FWF A; 2QBM A; 4K9X A; 2WX2 A; 4CP4 A; 1CPT A; 1CL6 A; 2CIB A; 4WG2 A; 2DKK A; 4H24 A; 7CPP A; 2NNB A; 2ZQX A; 3TBG A; 2IAG A; 2WIV A; 3DAX A; 3L62 A; 4KTF A; 1N6B A; 3ZBY A; 1IO8 A; 4G3J A; 2IJ2 A; 5HIW A; 3P3X A; 1QMQ A; 3P6R A; 4RM4 A; 2ZAW A; 4D6Z A; 3P6V A; 2XFH A; 3AWM A; 4NKW A; 3CZH A; 5JTD A; 4EGP A; 1EGY A; 1SUO A; 2P85 A; 3QI8 A; 5BV5 A; 1K2O A; 1IZO A; 2JJO A; 5B2V A; 5M0O A; 1NOO A; 5JQ2 A; 4WNT A; 2NNH A; 6CPP A; 3R9C A; 2CI0 A; 3UA5 A; 3R1B A; 1PHG A; 5IT1 A; 5L90 A; 4UVR A; 2UUQ A; 4WQ0 A; 1DZ4 A; 3TK3 A; 5A1P A; 3HF2 A; 4EGM A; 2W0A A; 2QBN A; 2VE3 A; 2ZBY A; 3CXV A; 4HGJ A; 4KTL A; 3WRI A; 4BMM A; 4EGO A; 4WPD A; 1JFB A; 1BU7 A; 1R9O A; 2NZA A; 1O76 A; 3KOH A; 4FXB A; 4DTW A; 3NC3 A; 5L1R A; 4OQS A; 2WM4 A; 4G7G A; 1YRC A; 2RCL A; 3QZ1 A; 3OO3 A; 4TRI A; 4DTY A; 3TIK A; 4ENH A; 1T2B A; 5B2Y A; 5L92 A; 4KPB A; 2ZQJ A; 4L4D A; 1IWK A; 5M0O C; 2FE6 A; 2YCA A; 3AWQ A; 1N4G A; 3T3Q A; 4EJH A; 3FWJ A; 1DZ9 A; 4GGV A; 5IBF A; 3P6S A; 3CXZ A; 2JJN A; 4BY0 A; 4DNJ A; 5DYZ A; 2PG7 A; 4G2G A; 1JFC A; 3L63 A; 4FDH A; 4AW3 A; 4DUA A; 1GED A; 1S1F A; 4XRY A; 1SE6 A; 3R9B A; 3ZSN A; 4C27 A; 3C6G A; 4TPN A; 2LQD A; 1RE9 A; 4XE3 A; 4JWU A; 2X2N A; 2ROM A; 1CMN A; 4JBT A; 3WRJ A; 3GPH A; 5AJR A; 5DQN A; 3ABB A; 4L6G A; 1OG5 A; 2X5W A; 3A51 A; 4L54 A; 1IO9 A; 2W0B A; 4DNZ A; 5L1P A; 5L1W A; 3P6U A; 3BUJ A; 3OL5 A; 1WIY A; 2BVJ A; 4I91 A; 5M0N A; 4KEY A; 4G47 A; 3CV8 A; 4L4A A; 3IBD A; 5L94 A; 4G3R A; 3G5N A; 3N9Y A; 3MDT A; 3LD6 A; 2A1M A; 4L4B A; 1P7R A; 4LHT A; 4WNV A; 5LIV A; 3R1A A; 4TVF A; 1UED A; 4CKA A; 3MVR A; 3TKT A; 4RRT A; 4CK8 A; 4G46 A; 4NKV A; 4B7S A; 2A1N A; 2ZUJ A; 4KPA A; 3TMZ A; 4D78 A; 3RWL A; 2J4S A; 4RQL A; 2ZAX A; 2QBL A; 4C9K A; 1UYU A; 2GQX A; 1PHD A; 5GXG A; 4TT5 A; 2WI9 A; 4E2P A; 4EP6 A; 5CPP A; 4CK9 A; 2Q6N A; 5DE9 A; 1ZO4 A; 4WPZ A; 3MDM A; 1CMJ A; 5HH3 A; 3JUS A; 4C9P A; 4DO1 A; 2W09 A; 4NKZ A; 5IBI A; 2L8M A; 5JQU A; 1PQ2 A; 3P3L A; 2CA0 A; 4FMX A; 4ZF8 A; 1JIN A; 3P6M A; 3QU8 A; 4RUI A; 1OG2 A; 3QM4 A; 2RCH A; 4NKY A; 4L36 A; 4XRZ A; 3SWZ A; 1IWJ A; 2H7S A; 4YZR A; 2GR6 A; 1Q5E A; 4L49 A; 2WIY A; 1EUP A; 4GL5 A; 1JIP A; 3OFU A; 4G45 A; 3QOA A; 5JKV A; 1LG9 A; 1ODO A; 5LI7 A; 2YOO A; 1YQO A; 3IW2 A; 4H6O A; 5E9Z A; 5IRQ A; 3A50 A; 4DU2 A; 8CPP A; 3M4V A; 4C9N A; 3DL9 A; 3G1Q A; 3EL3 A; 4J6D A; 4MGJ A; 4G48 A; 3KX5 A; 1GEI A; 4O4P A; 3WRK A; 4JX1 A; 2Z3T A; 2PG5 A; 3A4H A; 5CWE A; 1F26 A; 4C9L A; 3CP4 A; 4DUC A; 2HI4 A; 5L1Q A; 3MDR A; 4KF2 A; 4I3Q A; 1BVY A; 2BMH A; 3UA1 A; 3VM4 A; 3B6H A; 3LXH A; 2ZWU A; 2X9P A; 2M56 A; 4NY4 A; 3P99 A; 4EJI A; 3CLI A; 4ZFB A; 1DZ6 A; 2WHF A; 2IJ7 A; 4R21 A; 3TDA A; 4ZFA A; 2FDY A; 4TUV A; 4HGH A; 3ABA A; 3G5H A; 1PHE A; 4EK1 A; 1GEK A; 4BJK A; 2VKU A; 1YRD A; 3VNO A; 4UMZ A; 2YJN B; 5L1S A; 1PO5 A; 2FDU A; 2XBK A; 3ZKP A; 3DGI A; 3PM0 A; 3B98 A; 3JUV A; 2ZBZ A; 3MZS A; 4J6C A; 1X8V A; 2Z97 A; 3ZPI A; 5IKI A; 1IO7 A; 3B4X A; 4D7D A; 5IRV A; 5IUZ A; 1P2Y A; 3S7S A; 4HGG A; 3NA0 A; 4FYZ A; 5FOI A; 4L4E A; 3MDV A; 3E4E A; 2FDW A; 3L4D A; 4KEW A; 1P0V A; 1JIO A; 2NNJ A; 2JJP A; 3IW1 A; 3P3Z A; 5JL7 A; 3IW0 A; 1JPZ A; 3NXU A; 3PSX A; 4IQ9 A; 5IBH A; 4L4C A; 3LXI A; 3KX4 A; 3FWG A; 3VOO A; 1T88 A; 2C6H A; 5IBE A; 2X5L A; 1UE8 A; 1XQD A; 1TQN A; 3CXX A; 3A4Z A; 3EKD A; 4RSN A; 4K9W A; 3OFT A; 2FER A; 1U13 A; 2FR7 A; 5A5J A; 4JWS A; 3AWP A; 3P6X A; 5JL9 A; 2H7Q A; 4D75 A; 1DT6 A; 2UVN A; 3NPL A; 4ZV8 A; 3GW9 A; 3WRL A; 3DAN A; 3DAM A; 1GEM A; 1PHB A; 3OIA A; 4Y8W A; 3K9V A; 6CP4 A; 1ULW A; 3NV6 A; 2D09 A; 1F4U A; 1T87 A; 2V0M A; 1N40 A; 3VRM A; 3CXY A; 3CBD A; 4UBS A; 2ZUI A; 4L4G A; 4I4H A; 4ZDZ A; 5B2U A; 3EQM A; 4JLT A; 1Z8P A; 5D3U A; 3T3Z A; 1GEB A; 2X80 A; 3P6W A; 3IVY A; 4I8V A; 4J6B A; 1ZOA A; 4PWV A; 2YGX A; 1Z8O A; 1DZ8 A; 3K9Y A; 2VN0 A; 3TZO A; 1ZO9 A; 2WIO A; 3ZG2 A; 2RFB A; 2D0E A; 1EHG A; 3BE0 A; 3B99 A; 1T86 A; 2Q9F A; 3CPP A; 4KQ8 A; 3P6Q A; 1LWL A; 4FIA A; 4WQJ A; 5EDT A; 5IBJ A; 5IBD A; 2J1M A; 4PXH A; 4EGN A; 1SMJ A; 1RF9 A; 1FAG A; 2ZBX A; 3RUK A; 4GL7 A; 3E5K A; 4IPW A; 2XKR A; 5L1T A; 1IWI A; 5E78 A; 3G93 A; 5EX6 A; 3FWI A; 4H23 A; 5E58 A; 4NZ2 A; 4KKY X; 3LC4 A; 3CY1 A; 3WVS A; 1F25 A; 1GEJ A; 3NA1 A; 5L91 A; 2ZUH A; 3O1A A; 2BDM A; 1AKD A; 4I4G A; 1PHC A; 3N9Z A; 4HGF A; 4OQR A; 4R20 A; 4ZGX A; 5B2X A; 3NC6 A; 5IUT A; 5E0E A; 3EBS A; 1Q5D A; 3E5J A; 4K9U A; 4WNU A; 2VE4 A; 3P6O A; 2Y46 A; 3BEN A; 3DSJ A; 3L61 A; 2Z36 A; 2UWH A; 3W9C A; 4KTJ A; 4YT3 A; 4GQS A; 4DUD A; 5L1O A; 1EHF A; 4DUF A; 4NKX A; 3MGX A; 4R1Z A; 1EHE A; 3ZK5 A; 3CV9 A; 4HGI A; 3DSK A; 3KW4 A; 1PHA A; 4WNW A; 3NC5 A; 2CPP A; 2CP4 A; 1Z10 A; 5DYP A; 2IJ5 A; 3WRM A; 1T93 A; 2Y5N A; 3NV5 A; 5HDI A; 1LGF A; 2Y98 A; 5B2W A; 4B7D A; 4K9T A; 3SN5 A; 4MM0 A; 1P0W A; 1CP4 A; 3E6I A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4IQ7 A; 3EKF A; 4C0C A; 2IJ4 A; 3DBG A; 2Y5Z A; 4EJJ A; 1GJM A; 2F9Q A; 2Z3U A; 1Z8Q A; 3NC7 A; 5D40 A; 3S79 A; 1PKF A; 5L1V A; 2HPD A; 3P6T A; 2FDV A; 3DSI A; 1J51 A; 2VZ7 A; 5JQV A; 1YQP A; 3EJB B; 4L0F A; 5IK1 A; 1T85 A; 2Q9G A; 4TPO A; 4DUE A; 4L0E A; 1ROM A; 3T3R A; 2RCM A; 3V8D A; 1SMI A; 1MPW A; 3EKB A; 4G1X A; 4G44 A; 3P3O A; 2XN8 A; 2IJ3 A; 5TE8 A; 1H5Z A; 3G5F A; 5LIE A; 2WV2 A; 1W0F A; 2ZWT A; 5E7Y A; 4KTK A; 2BZ9 A; 4KF0 A; 5LI8 A; 3A1L A; 2X7Y A; 1F4T A; 4C9O A; 2QBO A; 2WM5 A; 5KYO A; 4FB2 A; 4IPS A; 2A1O A; 4L40 A; 3E5L A; 3P6P A; 2WH8 A; 3BDZ A; 5JL6 A; 5M0P A; 1FAH A; 4DUB A; 5L1U A; 2J0D A; 2VZM A; 2FEU A; 4EJG A; 3K1O A; 3TJS A; 2CD8 A; 3TYW A; 3KSW A; 1W0G A; 2C7X A; 2NZ5 A; 5LI6 A; 1LFK A; 1P0X A; 4UQH A; 3WSP A; 4Z5P A; 4UAX A; 3KX3 A; 4CPP A; 5IBG A; 5CP4 A; 1JME A; 4ICT A; 5CJE A; 3DBM A; 1F24 A; 3VTJ A; 3WEC A; 4C28 A; 2WGY A; 4BF4 A; 3ZG3 A; 4DTZ A; 4DVQ A; 4H1N A; 5EM4 A; 1E9X A; 2WUZ A; 1W0E A; 2NNI A; 1GWI A; 1Z11 A; 4APY A; 4DXY A; 3ME6 A; 3WRH A; 2WHW A; 4C9M A; 2FRZ A; 3T3S A; 2XC3 A; 4J14 A; 3A4G A; 1EA1 A; 4Z5Q A; 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