The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
129
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sequence length |
458
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structure length |
424
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Chain Sequence |
TIKEMPQPKTFGELKNLPLLNTDKPVQALMKIADELGEIFKFEAPGRVTRYISSQRLVKEACDESRFDKNLWKKARNILLPRLSQQAMKGYHAMMVDIAVQLVQKWERLNSDEHIEVPEDMTRLTLDTIGLCGFNYRINSFYRDQPHPFITSMVRALDEVMNKLQENKRQFQEDIKVMNDLVDKIIADRKASGEQSDDLLTHMLHGKDPETGEPLDDENIRYQIITFLIAGHETTSGLLTFALYFLVKNPHVLQKAAEEAARVLVDPVPSYKQVKQLKYVGMVLNEALRIWPTAPAFSLYAKEDTMLGGEYPLEKGDELMVLIPQLHRDKTVWGDDVEEFRPERFENPSAIPQHAFKPFGNGQRACIGQQFALHEATLVLGMMLKHFDFEDHTNYELDIEETLTLKPKGFVIKAKSKKIPLGGI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Engineered Bacterial Mimics of Human Drug Metabolizing Enzyme CYP2C9
doi rcsb |
| molecule keywords |
Evolved Cytochrome P450 variant (22A3)
|
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Bacillus megaterium
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| total genus |
129
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| structure length |
424
|
| sequence length |
458
|
| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.14.14.1: Unspecific monooxygenase. |
| pdb deposition date | 2011-01-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Cytochrome p450 | Cytochrome P450 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3A51 A; 4KKY X; 2XFH A; 5LI6 A; 3DAN A; 2XBK A; 5JL7 A; 3P3O A; 2W09 A; 1GJM A; 5L1W A; 2GR6 A; 3MZS A; 1WIY A; 1CPT A; 1Z8Q A; 3NC6 A; 4C9N A; 2UUQ A; 5L91 A; 1F25 A; 3TZO A; 1PQ2 A; 2WHF A; 1ULW A; 4TRI A; 5EX6 A; 2YOO A; 3IVY A; 4NZ2 A; 4EJJ A; 4KF2 A; 4HGJ A; 1JFB A; 2WM4 A; 1DZ6 A; 4DO1 A; 4ZFA A; 3WVS A; 5LIV A; 2Y5Z A; 4G47 A; 4J6C A; 2YJN B; 4YZR A; 4APY A; 3EQM A; 1JME A; 3C6G A; 1NR6 A; 1GED A; 4NY4 A; 1YQO A; 1EA1 A; 3K9V A; 3ABA A; 3UA1 A; 1R9O A; 4J14 A; 4BJK A; 2QBO A; 3L4D A; 3P6N A; 1Q5D A; 4J6B A; 2NNH A; 1GEK A; 1IO7 A; 3ABB A; 4L36 A; 5IT1 A; 4IPS A; 5L1O A; 5CWE A; 4CK9 A; 4B7D A; 4KEY A; 1IWJ A; 2CP4 A; 3KX4 A; 3EBS A; 2CIB A; 5D40 A; 4D78 A; 3MVR A; 1GWI A; 4ZF8 A; 1GEM A; 5IRV A; 3TK3 A; 2XC3 A; 1JFC A; 2Z3T A; 4I8V A; 1YRD A; 3BEN A; 5CP4 A; 4C0C A; 5IKI A; 2ZBY A; 6CP4 A; 3WRL A; 2FDV A; 4BF4 A; 4C9L A; 2FRZ A; 5LI8 A; 3MDR A; 4C9M A; 5BV5 A; 1Z8P A; 3CY0 A; 2CD8 A; 4HGF A; 4DUA A; 2C6H A; 2L8M A; 4PXH A; 5EM4 A; 2WV2 A; 3G1Q A; 4ENH A; 3P3Z A; 4G2G A; 3P6P A; 2VE3 A; 1C8J A; 3G5H A; 5CJE A; 4DNJ A; 3IBD A; 4UAX A; 4G48 A; 1EGY A; 2ZQX A; 2Q9F A; 2HPD A; 4BY0 A; 6CPP A; 2CI0 A; 4XE3 A; 4C9P A; 2J4S A; 2J0D A; 5FOI A; 1GEI A; 1OG2 A; 3BDZ A; 4UBS A; 2JJN A; 2JJO A; 2X9P A; 2UWH A; 3BUJ A; 3OIA A; 3V8D A; 2ZWT A; 4DUC A; 5DE9 A; 3A4H A; 4Z5Q A; 4E2P A; 1T87 A; 1PHG A; 4L4E A; 1X8V A; 3B4X A; 2RFB A; 5TE8 A; 4EGM A; 3P6V A; 3NC7 A; 3DBM A; 4GQS A; 5JQU A; 5HDI A; 2VZM A; 4EK1 A; 4FIA A; 2H7S A; 4KTJ A; 1DZ8 A; 1LFK A; 3TKT A; 5IBI A; 2ZBX A; 3E5L A; 4RUI A; 5A1P A; 3CV9 A; 1T93 A; 3NA1 A; 3T3Q A; 1FAH A; 3ZG3 A; 4FXB A; 4D6Z A; 5M0P A; 4ICT A; 5D3U A; 4RSN A; 4C9K A; 2D09 A; 4EJH A; 2CA0 A; 2VZ7 A; 4CPP A; 1Z11 A; 4HGI A; 4EJI A; 3P6U A; 2ZAW A; 3P3X A; 2Y5N A; 1LG9 A; 3ZSN A; 1Z10 A; 3NC5 A; 5E78 A; 4DTW A; 3P99 A; 2X7Y A; 3CXX A; 1XQD A; 5B2W A; 3P6T A; 1UE8 A; 4DVQ A; 3QI8 A; 3G93 A; 4ZV8 A; 3TMZ A; 4Z5P A; 3TDA A; 4L4B A; 4J6D A; 3QZ1 A; 2RFC A; 3CXV A; 4KTL A; 4NKV A; 3VM4 A; 3E5J A; 4WNV A; 5L1P A; 2FR7 A; 3FWG A; 4L4G A; 3P6X A; 1YQP A; 3TYW A; 3WSP A; 2X5L A; 3EKF A; 2NNB A; 3DSJ A; 4H23 A; 1E9X A; 3P6Q A; 1PHA A; 3K1O A; 3NV6 A; 4UVR A; 2H7R A; 1AKD A; 4K9V A; 2H7Q A; 4H24 A; 1SE6 A; 3S7S A; 3R1A A; 2WX2 A; 3T3S A; 4GL5 A; 3T3Z A; 3R9B A; 2FDW A; 3DSK A; 3NA0 A; 2Z36 A; 3B98 A; 3KW4 A; 7CPP A; 4YT3 A; 2QBL A; 1F4T A; 1QMQ A; 5IBJ A; 4WNW A; 3L62 A; 1CP4 A; 1PHD A; 3WRM A; 3QM4 A; 4L4A A; 4WPD A; 3QU8 A; 3DGI A; 5L1S A; 1W0G A; 3KHM A; 1JPZ A; 1UED A; 2WH8 A; 2DKK A; 4EJG A; 1N97 A; 3IW1 A; 3A4G A; 3CLI A; 3QOA A; 3CP4 A; 4G44 A; 3SN5 A; 1NOO A; 2BDM A; 3LXI A; 3IW0 A; 4HGH A; 3OFU A; 2NZA A; 5JTD A; 2M56 A; 1PKF A; 4TVF A; 3RUK A; 1N4G A; 1SMJ A; 3VTJ A; 5A5J A; 1P0W A; 3MDT A; 4L4F A; 4UMZ A; 1DZ4 A; 2HI4 A; 2X80 A; 5L1U A; 3NV5 A; 3O1A A; 4C27 A; 5DYP A; 2FDU A; 3WRK A; 4ZDZ A; 3GW9 A; 1PHB A; 4TUV A; 2FER A; 4HGG A; 5LIE A; 4H6O A; 3KSW A; 4NKZ A; 4PWV A; 1S1F A; 2Q9G A; 4KEW A; 5CPP A; 5E7Y A; 5LI7 A; 3FWF A; 5EDT A; 4XRZ A; 4L0E A; 4OQS A; 4C9O A; 2A1O A; 2RCH A; 4WNT A; 2NZ5 A; 1IZO A; 3N9Z A; 4R21 A; 4EP6 A; 4NKY A; 1T85 A; 4G46 A; 1PHE A; 4WG2 A; 5E0E A; 3CXY A; 4G3R A; 4KPB A; 4K9X A; 2X5W A; 3R1B A; 3JUS A; 3L63 A; 4Y8W A; 5JL6 A; 4DU2 A; 1SMI A; 1TQN A; 3CV8 A; 5L1T A; 3AWQ A; 1EHF A; 4DUF A; 4EGN A; 2QBN A; 2YGX A; 3KX5 A; 4KQ8 A; 3E4E A; 5DYZ A; 4DUE A; 2A1N A; 2CPP A; 2Y98 A; 5B2U A; 4EGO A; 3EL3 A; 3A4Z A; 3G5N A; 4OQR A; 3ZG2 A; 4C28 A; 4H1N A; 4L4C A; 3CBD A; 1F26 A; 4I4H A; 4MGJ A; 1ODO A; 5L1Q A; 4BMM A; 4ZF6 A; 1ROM A; 3DAX A; 3OFT A; 2P85 A; 2Q6N A; 2Z3U A; 1ZO4 A; 4L6G A; 3B99 A; 1BU7 A; 3A50 A; 1P0V A; 3NC3 A; 2RCM A; 4L4D A; 2ZWU A; 3FWI A; 5HIW A; 1P0X A; 3DSI A; 4ZGX A; 4IQ9 A; 4ZFB A; 3GPH A; 4G7G A; 1N6B A; 3IW2 A; 4DNZ A; 3PSX A; 3OO3 A; 2WM5 A; 4DTY A; 1RF9 A; 2Z97 A; 1YRC A; 4WQ0 A; 2IJ4 A; 3K9Y A; 4G3J A; 1FAG A; 3HF2 A; 5JL9 A; 4LHT A; 3EKD A; 3KOH A; 3UAS A; 2RCL A; 3E5K A; 1U13 A; 5IBD A; 4FYZ A; 5AJR A; 5IBF A; 3ZKP A; 5IBE A; 1OG5 A; 3AWP A; 5M0O C; 4R20 A; 5E9Z A; 4JWS A; 2C7X A; 4JWU A; 4NKW A; 2PG7 A; 3ZBY A; 2BMH A; 3P3L A; 3WRI A; 3S79 A; 2WHW A; 4FDH A; 2IJ5 A; 4KF0 A; 2XN8 A; 5B2Y A; 4G1X A; 4IQ7 A; 1JIN A; 1OXA A; 2WIY A; 3P6S A; 5L94 A; 2PG6 A; 2UVN A; 4L40 A; 4L0F A; 2YCA A; 1ZO9 A; 5L1V A; 3OL5 A; 2BZ9 A; 2ZBZ A; 2FEU A; 3CPP A; 1EUP A; 1O76 A; 2QBM A; 3T3R A; 5M0O A; 3MDV A; 2WIO A; 3NXU A; 4L49 A; 4FB2 A; 5IRQ A; 3P6M A; 5B2X A; 4IPW A; 1MPW A; 1T2B A; 5E58 A; 1K2O A; 1P7R A; 1LWL A; 2NNJ A; 4I3Q A; 4XRY A; 4RRT A; 4L77 A; 1CMJ A; 1JIO A; 1PHF A; 2A1M A; 3VOO A; 3P6O A; 3LD6 A; 3VNO A; 3ZK5 A; 2VKU A; 2WUZ A; 3DL9 A; 3FWJ A; 5L92 A; 3CXZ A; 2ZAX A; 2IAG A; 1W0E A; 1Z8O A; 2FDY A; 2J1M A; 3W9C A; 1J51 A; 5IK1 A; 2FE6 A; 2LQD A; 3G5F A; 3P6R A; 2ZUH A; 3TBG A; 4D75 A; 3EKB A; 4AW3 A; 3RWL A; 3CY1 A; 3ZPI A; 4RM4 A; 3A1L A; 1Q5E A; 4B7S A; 3WEC A; 2XKR A; 5IUT A; 2IJ2 A; 4TPN A; 3DAM A; 4DUD A; 1T86 A; 3CZH A; 1UYU A; 1DZ9 A; 1PO5 A; 3ME6 A; 3BE0 A; 3MGX A; 4CKA A; 5HH3 A; 1EHE A; 4JX1 A; 5A1R A; 1IO8 A; 5L1R A; 2VE4 A; 4KTF A; 2ZQJ A; 1GEJ A; 5IBH A; 5JKW A; 1CMN A; 3E6I A; 2W0B A; 2X2N A; 1JIP A; 2PG5 A; 1EHG A; 3KX3 A; 3LXH A; 1IWK A; 2W0A A; 3P6W A; 2JJP A; 4TT5 A; 3SWZ A; 4GL7 A; 1LGF A; 3N9Y A; 4L54 A; 3LC4 A; 4TX3 A; 4MM0 A; 2GQX A; 4K9U A; 1BVY A; 5DQN A; 1IO9 A; 1F24 A; 4WPZ A; 2ZUJ A; 5IUZ A; 2D0E A; 1DT6 A; 3TJS A; 3TIK A; 2IJ3 A; 3WRH A; 4K9W A; 4CK8 A; 2WIV A; 4I91 A; 4WNU A; 4JBT A; 4I4G A; 3R9C A; 2WGY A; 3UA5 A; 1N40 A; 4JLT A; 1CL6 A; 3L61 A; 4COH A; 4G45 A; 2V0M A; 4DUB A; 4KPA A; 4R1Z A; 1PHC A; 2NNI A; 2WI9 A; 5M0N A; 1GEB A; 1IWI A; 2BVJ A; 8CPP A; 4CP4 A; 5B2V A; 2IJ7 A; 2ZUI A; 1SUO A; 2ROM A; 3DBG A; 1RE9 A; 4RQL A; 4TPO A; 5L90 A; 5JKV A; 3NPL A; 1ZOA A; 4DXY A; 2VN0 A; 1W0F A; 4K9T A; 1H5Z A; 3PM0 A; 4O4P A; 5KYO A; 3VRM A; 1P2Y A; 3MDM A; 5JQ2 A; 4FMX A; 3JUV A; 5GXG A; 1F4U A; 5IBG A; 3B6H A; 5A5I A; 4UQH A; 4DTZ A; 5JQV A; 3WRJ A; 4GGV A; 2Y46 A; 3AWM A; 4NKX A; 4KTK A; 4WQJ A; 3M4V A; 4D7D A; 2F9Q A; 4EGP A; 1T88 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A51 A; 4KKY X; 2XFH A; 5LI6 A; 3DAN A; 2XBK A; 5JL7 A; 3P3O A; 2W09 A; 1GJM A; 5L1W A; 2GR6 A; 3MZS A; 1WIY A; 1CPT A; 1Z8Q A; 3NC6 A; 4C9N A; 2UUQ A; 5L91 A; 1F25 A; 3TZO A; 1PQ2 A; 2WHF A; 1ULW A; 4TRI A; 5EX6 A; 2YOO A; 3IVY A; 4NZ2 A; 4EJJ A; 4KF2 A; 4HGJ A; 1JFB A; 2WM4 A; 1DZ6 A; 4DO1 A; 4ZFA A; 3WVS A; 5LIV A; 2Y5Z A; 4G47 A; 4J6C A; 2YJN B; 4YZR A; 4APY A; 3EQM A; 1JME A; 3C6G A; 1NR6 A; 1GED A; 4NY4 A; 1YQO A; 1EA1 A; 3K9V A; 3ABA A; 3UA1 A; 1R9O A; 4J14 A; 4BJK A; 2QBO A; 3L4D A; 3P6N A; 1Q5D A; 4J6B A; 2NNH A; 1GEK A; 1IO7 A; 3ABB A; 4L36 A; 5IT1 A; 4IPS A; 5L1O A; 5CWE A; 4CK9 A; 4B7D A; 4KEY A; 1IWJ A; 2CP4 A; 3KX4 A; 3EBS A; 2CIB A; 5D40 A; 4D78 A; 3MVR A; 1GWI A; 4ZF8 A; 1GEM A; 5IRV A; 3TK3 A; 2XC3 A; 1JFC A; 2Z3T A; 4I8V A; 1YRD A; 3BEN A; 5CP4 A; 4C0C A; 5IKI A; 2ZBY A; 6CP4 A; 3WRL A; 2FDV A; 4BF4 A; 4C9L A; 2FRZ A; 5LI8 A; 3MDR A; 4C9M A; 5BV5 A; 1Z8P A; 3CY0 A; 2CD8 A; 4HGF A; 4DUA A; 2C6H A; 2L8M A; 4PXH A; 5EM4 A; 2WV2 A; 3G1Q A; 4ENH A; 3P3Z A; 4G2G A; 3P6P A; 2VE3 A; 1C8J A; 3G5H A; 5CJE A; 4DNJ A; 3IBD A; 4UAX A; 4G48 A; 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