The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
54
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sequence length |
205
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structure length |
205
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Chain Sequence |
NQQKSLTLIVALTTSYGIGRSNSLPWKLKKEISYFKRVTSFVPTFDSFESMNVVLMGRKTWESIPLQFRPLKGRINVVITRNESLDLGNGIHSAKSLDHALELLYRTYGSESSVQINRIFVIGGAQLYKAAMDHPKLDRIMATIIYKDIHCDVFFPLKFRDKEWSSVWKKEKHSDLESWVGTKVPHGKINEDGFDYEFEMWTRDL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
DIHYDROFOLATE REDUCTASE
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| publication title |
Structural studies on bioactive compounds. 30. Crystal structure and molecular modeling studies on the Pneumocystis carinii dihydrofolate reductase cofactor complex with TAB, a highly selective antifolate.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Pneumocystis carinii
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| total genus |
54
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| structure length |
205
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| sequence length |
205
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2004-01-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00186 | DHFR_1 | Dihydrofolate reductase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Dihydrofolate Reductase, subunit A | Dihydrofolate Reductase, subunit A |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3QG2 A; 3NXY A; 4ELH A; 1DRH A; 1RA8 A; 3SAI A; 3NXX A; 3UM5 A; 1IA2 A; 1DR1 A; 4NX7 A; 1BOZ A; 1DYI A; 4PSS A; 4P68 A; 1PD8 A; 1DIU A; 4I13 A; 3TQ9 A; 3SGY A; 4QLE A; 3K45 A; 5U27 A; 1DRB A; 1DYJ A; 1S3V A; 1RG7 A; 4LAE X; 1RX5 A; 3D80 A; 3NRR A; 1RX6 A; 5FDA A; 3SR5 X; 3HBB A; 3SRU X; 4DP3 A; 4P3R A; 3NZB X; 4G95 A; 3DL6 A; 3QLS A; 3TQA A; 3JWK A; 4HA9 A; 3DL5 A; 3FRF X; 4P3Q A; 3EEJ A; 1DG5 A; 1PD9 A; 4KYA A; 3FL9 A; 3I3R A; 4PTJ A; 3EX8 A; 1DYH A; 2ITH A; 1RX9 A; 3LG4 A; 2W9H A; 4HOF A; 4IXF X; 3TQ8 A; 4H98 A; 3QLZ A; 3JWF A; 3IX9 A; 3SQY X; 4PTH A; 4KL9 A; 3K47 A; 5HF2 X; 4HOE A; 1J3K A; 1DAJ A; 2BLC A; 1RF7 A; 2D0K A; 3F8Z A; 1DYR A; 4G3M A; 3DAT A; 1LUD A; 1RX1 A; 1U71 A; 1KMV A; 2W3B A; 6DFR A; 3DFR A; 3NZ9 X; 4FGH A; 5HQY A; 1S3U A; 1DF7 A; 4DDR A; 3F0Q X; 3EEK A; 5JA3 A; 2W3A A; 4ECK A; 5CCC A; 1S3W A; 3L3R A; 1RD7 A; 4XT8 A; 4KEB A; 3VCO A; 4QJZ D; 4Q6A A; 4CD2 A; 1LY4 A; 1VJ3 A; 3FY8 X; 5DFR A; 2GD9 A; 4Q0D A; 1RX3 A; 1M79 A; 3SRS X; 3NZC X; 3FRE X; 2FZH A; 3TQB A; 3NXO A; 1RA2 A; 3Q1H A; 4KJJ A; 4XRB A; 3IRO A; 1IA3 A; 5HSU A; 2DRC A; 3FQ0 A; 4KJK A; 1IA1 A; 3EIG A; 4KFJ A; 3S3V A; 1D1G A; 4X5H A; 3GHW A; 3UM8 A; 1DR7 A; 3F0S X; 3JWM A; 1RB2 A; 3D84 X; 4M6J A; 4RGC A; 4ELE A; 1U70 A; 4EIL A; 3FS6 A; 3OAF A; 2CIG A; 5EAJ A; 3SA1 A; 2W9S A; 4GH8 A; 3FRB X; 4KNE A; 4M7U A; 4EIG A; 3IA4 A; 1DR3 A; 3QL3 A; 3FQC A; 4FHB A; 2DHF A; 1MVT A; 1QZF A; 3F91 A; 1PDB A; 1YHO A; 2L28 A; 2W9T A; 2H2Q A; 4EJ1 A; 1DDR A; 2D5N A; 2OIP A; 4KAK A; 3GI2 A; 3QGT A; 3JW3 A; 1RX8 A; 3FYW X; 3I8A X; 4I1N A; 1IA4 A; 3F0U X; 1JOL A; 1CZ3 A; 3NZ6 X; 3FQO A; 4PDJ A; 4ELB A; 4NX6 A; 4FGG A; 4IXG X; 1HFP A; 2ANQ A; 1LY3 A; 1DHI A; 4HA7 A; 2HXV A; 1HFR A; 2LF1 A; 1RX4 A; 4KD7 A; 2ZZA A; 5DXV A; 5HT5 A; 2W3M A; 3GHV A; 5HVE A; 1M78 A; 3E0B A; 1SEJ A; 4M2X A; 3SRR X; 4M6K A; 1RX7 A; 1M7A A; 4XEC X; 4XT6 A; 1DLS A; 2O7P A; 2HQP A; 5HVB A; 1HFQ A; 4KLX A; 4DFR A; 1RA3 A; 3NXV A; 3S7A A; 3NTZ A; 4KM0 A; 4X5J A; 4QHV A; 4HOG A; 1DHF A; 2B3Z A; 3FQV A; 2KGK A; 3OCH A; 2HM9 A; 2CD2 A; 1MVS A; 1ZDR A; 3FYV X; 2W9G A; 3DG8 A; 3DAU A; 4KY8 A; 3ZPC A; 3IA5 A; 4H97 A; 3CLB A; 1TDR A; 4QLG A; 3ROA A; 2FZI A; 3F0V X; 3QYL A; 3QLY A; 3CSE A; 1DG7 A; 3JTW A; 4PSY A; 4H95 A; 1DR5 A; 1DR2 A; 3SRW X; 1AI9 A; 3IRN A; 3GHC A; 3JVX A; 3FY9 X; 2ANO A; 3F8Y A; 1RA9 A; 2C2S A; 1AOE A; 2W3W A; 5ECX A; 3IRM A; 3FQZ A; 1JUV A; 3UM6 A; 1RB3 A; 3K2H A; 3FRD X; 3INV A; 1KLK A; 3NZD A; 3NXR A; 3RG9 A; 3S9U A; 5HPB A; 2XW7 A; 4KM2 A; 1DHJ A; 3SRQ X; 1RH3 A; 4P66 A; 4OR7 A; 3ZPG A; 4ELF A; 1DRA A; 3FQF A; 3N0H A; 3KJR A; 1RC4 A; 4Q67 A; 1DDS A; 7DFR A; 1DG8 A; 4OSG A; 3QLX A; 1E26 A; 3SH2 A; 4X5F A; 1RE7 A; 5HI6 A; 2G6V A; 3FRA X; 1J3J A; 2QK8 A; 2OBC A; 4KBN A; 2AZN A; 3KJS A; 3R33 A; 3JW5 A; 5HF0 X; 5U26 A; 2BL9 A; 3NXT A; 3M09 A; 1S3Y A; 1DIS A; 5ECC A; 4H96 A; 2INQ A; 3QLW A; 1DR6 A; 4M7V A; 3CD2 A; 2BLA A; 3KGY A; 2W3V A; 4LAH X; 2P4G A; 3DRC A; 5HQZ A; 3QLR A; 3QYO A; 4XT5 A; 1AO8 A; 3EEM A; 4XT7 A; 4QLF A; 4EIZ A; 1KMS A; 3RO9 A; 3SA2 A; 5JG0 X; 3CL9 A; 2FZJ A; 4KJL A; 2JYB A; 3DGA A; 1RA1 A; 5CC9 A; 4X5I A; 3F0B X; 3KY8 A; 3JSU A; 1DRE A; 1DLR A; 1BZF A; 1CD2 A; 3KFY A; 3M08 A; 4IXE D; 3QFX A; 1DRF A; 1RX2 A; 8DFR A; 1DR4 A; 1JOM A; 1U72 A; 3NZA X; 4QJC A; 3F0X X; 1J3I A; 4DPH A; 4LAG X; 2BLB A; 4KY4 A; 3GYF A; 5HUI A; 4TU5 X; 5HT4 A; 5HSR A; 5E8Q A; 4Q0E A; 3HJ3 A; 4PST A; 3FL8 A; 4X5G A; 1OHJ A; 3K74 A; 3JWC A; 3NU0 A; 1VDR A; 4XE6 X; 1OHK A; 4LEK X; 4DPD A; 2C2T A; 4M6L A; 4ELG A; 4QI9 A; 4XT4 A; 3EEL A; 3TD8 A; 3QL0 A; 4G8Z X; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QG2 A; 3NXY A; 4ELH A; 1DRH A; 1RA8 A; 3SAI A; 3NXX A; 3UM5 A; 1IA2 A; 1DR1 A; 4NX7 A; 1BOZ A; 1DYI A; 4PSS A; 4P68 A; 1PD8 A; 1DIU A; 4I13 A; 3TQ9 A; 3SGY A; 4QLE A; 3K45 A; 5U27 A; 1DRB A; 1DYJ A; 1S3V A; 1RG7 A; 4LAE X; 1RX5 A; 3D80 A; 3NRR A; 1RX6 A; 5FDA A; 3SR5 X; 3HBB A; 3SRU X; 4DP3 A; 4P3R A; 3NZB X; 4G95 A; 3DL6 A; 3QLS A; 3TQA A; 3JWK A; 4HA9 A; 3DL5 A; 3FRF X; 4P3Q A; 3EEJ A; 1DG5 A; 1PD9 A; 4KYA A; 3FL9 A; 3I3R A; 4PTJ A; 3EX8 A; 1DYH A; 2ITH A; 1RX9 A; 3LG4 A; 2W9H A; 4HOF A; 4IXF X; 3TQ8 A; 4H98 A; 3QLZ A; 3JWF A; 3IX9 A; 3SQY X; 4PTH A; 4KL9 A; 3K47 A; 5HF2 X; 4HOE A; 1J3K A; 1DAJ A; 2BLC A; 1RF7 A; 2D0K A; 3F8Z A; 1DYR A; 4G3M A; 3DAT A; 1LUD A; 1RX1 A; 1U71 A; 1KMV A; 2W3B A; 6DFR A; 3DFR A; 3NZ9 X; 4FGH A; 5HQY A; 1S3U A; 1DF7 A; 4DDR A; 3F0Q X; 3EEK A; 5JA3 A; 2W3A A; 4ECK A; 5CCC A; 1S3W A; 3L3R A; 1RD7 A; 4XT8 A; 4KEB A; 3VCO A; 4QJZ D; 4Q6A A; 4CD2 A; 1LY4 A; 1VJ3 A; 3FY8 X; 5DFR A; 2GD9 A; 4Q0D A; 1RX3 A; 1M79 A; 3SRS X; 3NZC X; 3FRE X; 2FZH A; 3TQB A; 3NXO A; 1RA2 A; 3Q1H A; 4KJJ A; 4XRB A; 3IRO A; 1IA3 A; 5HSU A; 2DRC A; 3FQ0 A; 4KJK A; 1IA1 A; 3EIG A; 4KFJ A; 3S3V A; 1D1G A; 4X5H A; 3GHW A; 3UM8 A; 1DR7 A; 3F0S X; 3JWM A; 1RB2 A; 3D84 X; 4M6J A; 4RGC A; 4ELE A; 1U70 A; 4EIL A; 3FS6 A; 3OAF A; 2CIG A; 5EAJ A; 3SA1 A; 2W9S A; 4GH8 A; 3FRB X; 4KNE A; 4M7U A; 4EIG A; 3IA4 A; 1DR3 A; 3QL3 A; 3FQC A; 4FHB A; 2DHF A; 1MVT A; 1QZF A; 3F91 A; 1PDB A; 1YHO A; 2L28 A; 2W9T A; 2H2Q A; 4EJ1 A; 1DDR A; 2D5N A; 2OIP A; 4KAK A; 3GI2 A; 3QGT A; 3JW3 A; 1RX8 A; 3FYW X; 3I8A X; 4I1N A; 1IA4 A; 3F0U X; 1JOL A; 1CZ3 A; 3NZ6 X; 3FQO A; 4PDJ A; 4ELB A; 4NX6 A; 4FGG A; 4IXG X; 1HFP A; 2ANQ A; 1LY3 A; 1DHI A; 4HA7 A; 2HXV A; 1HFR A; 2LF1 A; 1RX4 A; 4KD7 A; 2ZZA A; 5DXV A; 5HT5 A; 2W3M A; 3GHV A; 5HVE A; 1M78 A; 3E0B A; 1SEJ A; 4M2X A; 3SRR X; 4M6K A; 1RX7 A; 1M7A A; 4XEC X; 4XT6 A; 1DLS A; 2O7P A; 2HQP A; 5HVB A; 1HFQ A; 4KLX A; 4DFR A; 1RA3 A; 3NXV A; 3S7A A; 3NTZ A; 4KM0 A; 4X5J A; 4QHV A; 4HOG A; 1DHF A; 2B3Z A; 3FQV A; 2KGK A; 3OCH A; 2HM9 A; 2CD2 A; 1MVS A; 1ZDR A; 3FYV X; 2W9G A; 3DG8 A; 3DAU A; 4KY8 A; 3ZPC A; 3IA5 A; 4H97 A; 3CLB A; 1TDR A; 4QLG A; 3ROA A; 2FZI A; 3F0V X; 3QYL A; 3QLY A; 3CSE A; 1DG7 A; 3JTW A; 4PSY A; 4H95 A; 1DR5 A; 1DR2 A; 3SRW X; 1AI9 A; 3IRN A; 3GHC A; 3JVX A; 3FY9 X; 2ANO A; 3F8Y A; 1RA9 A; 2C2S A; 1AOE A; 2W3W A; 5ECX A; 3IRM A; 3FQZ A; 1JUV A; 3UM6 A; 1RB3 A; 3K2H A; 3FRD X; 3INV A; 1KLK A; 3NZD A; 3NXR A; 3RG9 A; 3S9U A; 5HPB A; 2XW7 A; 4KM2 A; 1DHJ A; 3SRQ X; 1RH3 A; 4P66 A; 4OR7 A; 3ZPG A; 4ELF A; 1DRA A; 3FQF A; 3N0H A; 3KJR A; 1RC4 A; 4Q67 A; 1DDS A; 7DFR A; 1DG8 A; 4OSG A; 3QLX A; 1E26 A; 3SH2 A; 4X5F A; 1RE7 A; 5HI6 A; 2G6V A; 3FRA X; 1J3J A; 2QK8 A; 2OBC A; 4KBN A; 2AZN A; 3KJS A; 3R33 A; 3JW5 A; 5HF0 X; 5U26 A; 2BL9 A; 3NXT A; 3M09 A; 1S3Y A; 1DIS A; 5ECC A; 4H96 A; 2INQ A; 3QLW A; 1DR6 A; 4M7V A; 3CD2 A; 2BLA A; 3KGY A; 2W3V A; 4LAH X; 2P4G A; 3DRC A; 5HQZ A; 3QLR A; 3QYO A; 4XT5 A; 1AO8 A; 3EEM A; 4XT7 A; 4QLF A; 4EIZ A; 1KMS A; 3RO9 A; 3SA2 A; 5JG0 X; 3CL9 A; 2FZJ A; 4KJL A; 2JYB A; 3DGA A; 1RA1 A; 5CC9 A; 4X5I A; 3F0B X; 3KY8 A; 3JSU A; 1DRE A; 1DLR A; 1BZF A; 1CD2 A; 3KFY A; 3M08 A; 4IXE D; 3QFX A; 1DRF A; 1RX2 A; 8DFR A; 1DR4 A; 1JOM A; 1U72 A; 3NZA X; 4QJC A; 3F0X X; 1J3I A; 4DPH A; 4LAG X; 2BLB A; 4KY4 A; 3GYF A; 5HUI A; 4TU5 X; 5HT4 A; 5HSR A; 5E8Q A; 4Q0E A; 3HJ3 A; 4PST A; 3FL8 A; 4X5G A; 1OHJ A; 3K74 A; 3JWC A; 3NU0 A; 1VDR A; 4XE6 X; 1OHK A; 4LEK X; 4DPD A; 2C2T A; 4M6L A; 4ELG A; 4QI9 A; 4XT4 A; 3EEL A; 3TD8 A; 3QL0 A; 4G8Z X; #chains in the Genus database with same CATH homology 3QG2 A; 3NXY A; 4ELH A; 1DRH A; 1RA8 A; 3SAI A; 3NXX A; 3UM5 A; 1IA2 A; 1DR1 A; 4NX7 A; 1BOZ A; 1DYI A; 4PSS A; 4P68 A; 1PD8 A; 1DIU A; 4I13 A; 3TQ9 A; 3SGY A; 4QLE A; 3K45 A; 5U27 A; 1DRB A; 1DYJ A; 1S3V A; 1RG7 A; 4LAE X; 1RX5 A; 3D80 A; 3NRR A; 1RX6 A; 5FDA A; 3SR5 X; 3HBB A; 3SRU X; 4DP3 A; 4P3R A; 3NZB X; 4G95 A; 3DL6 A; 3QLS A; 3TQA A; 3JWK A; 4HA9 A; 3DL5 A; 3FRF X; 4P3Q A; 3EEJ A; 1DG5 A; 1PD9 A; 4KYA A; 3FL9 A; 3I3R A; 4PTJ A; 3EX8 A; 1DYH A; 2ITH A; 1RX9 A; 3LG4 A; 2W9H A; 4HOF A; 4IXF X; 3TQ8 A; 4H98 A; 3QLZ A; 3JWF A; 3IX9 A; 3SQY X; 4PTH A; 4KL9 A; 3K47 A; 5HF2 X; 4HOE A; 1J3K A; 1DAJ A; 2BLC A; 1RF7 A; 2D0K A; 3F8Z A; 1DYR A; 4G3M A; 3DAT A; 1LUD A; 1RX1 A; 1U71 A; 1KMV A; 2W3B A; 6DFR A; 3DFR A; 3NZ9 X; 4FGH A; 5HQY A; 1S3U A; 1DF7 A; 4DDR A; 3F0Q X; 3EEK A; 5JA3 A; 2W3A A; 4ECK A; 5CCC A; 1S3W A; 3L3R A; 1RD7 A; 4XT8 A; 4KEB A; 3VCO A; 4QJZ D; 4Q6A A; 4CD2 A; 1LY4 A; 1VJ3 A; 3FY8 X; 5DFR A; 2GD9 A; 4Q0D A; 1RX3 A; 1M79 A; 3SRS X; 3NZC X; 3FRE X; 2FZH A; 3TQB A; 3NXO A; 1RA2 A; 3Q1H A; 4KJJ A; 4XRB A; 3IRO A; 1IA3 A; 5HSU A; 2DRC A; 3FQ0 A; 4KJK A; 1IA1 A; 3EIG A; 4KFJ A; 3S3V A; 1D1G A; 4X5H A; 3GHW A; 3UM8 A; 1DR7 A; 3F0S X; 3JWM A; 1RB2 A; 3D84 X; 4M6J A; 4RGC A; 4ELE A; 1U70 A; 4EIL A; 3FS6 A; 3OAF A; 2CIG A; 5EAJ A; 3SA1 A; 2W9S A; 4GH8 A; 3FRB X; 4KNE A; 4M7U A; 4EIG A; 3IA4 A; 1DR3 A; 3QL3 A; 3FQC A; 4FHB A; 2DHF A; 1MVT A; 1QZF A; 3F91 A; 1PDB A; 1YHO A; 2L28 A; 2W9T A; 2H2Q A; 4EJ1 A; 1DDR A; 2D5N A; 2OIP A; 4KAK A; 3GI2 A; 3QGT A; 3JW3 A; 1RX8 A; 3FYW X; 3I8A X; 4I1N A; 1IA4 A; 3F0U X; 1JOL A; 1CZ3 A; 3NZ6 X; 3FQO A; 4PDJ A; 4ELB A; 4NX6 A; 4FGG A; 4IXG X; 1HFP A; 2ANQ A; 1LY3 A; 1DHI A; 4HA7 A; 2HXV A; 1HFR A; 2LF1 A; 1RX4 A; 4KD7 A; 2ZZA A; 5DXV A; 5HT5 A; 2W3M A; 3GHV A; 5HVE A; 1M78 A; 3E0B A; 1SEJ A; 4M2X A; 3SRR X; 4M6K A; 1RX7 A; 1M7A A; 4XEC X; 4XT6 A; 1DLS A; 2O7P A; 2HQP A; 5HVB A; 1HFQ A; 4KLX A; 4DFR A; 1RA3 A; 3NXV A; 3S7A A; 3NTZ A; 4KM0 A; 4X5J A; 4QHV A; 4HOG A; 1DHF A; 2B3Z A; 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