The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
KEKHVPEMKLSGNHVDIRCGATVMHPATEKHYIGTIRLFGITKEGNVTLELGCQQIWPGLGEPVASFRVCDLEKYKGLLAVAYCNLHGCWENYMEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| molecule keywords |
SUPEROXIDE REDUCTASE
|
| publication title |
Superoxide Reductase from Giardia Intestinalis: Structural Characterization of the First Sor from a Eukaryotic Organism Shows an Iron Centre that is Highly Sensitive to Photoreduction.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Giardia intestinalis
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| total genus |
20
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| structure length |
96
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| sequence length |
96
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| ec nomenclature |
ec
1.15.1.2: Superoxide reductase. |
| pdb deposition date | 2014-11-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01880 | Desulfoferrodox | Desulfoferrodoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Sandwich | Immunoglobulin-like | Immunoglobulin-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4BFF A; 4C4U A; 2HVB A; 2JI3 A; 2AMU A; 4BFK A; 2JI2 A; 1DO6 A; 4BFJ A; 1VZI A; 4C4B A; 1Y07 A; 4BRV A; 4BGL A; 1DQI A; 1DQK A; 3QZB A; 4BV1 A; 1VZH A; 1VZG A; 4BK8 A; 1DFX A; 4D7P A; 2JI1 A; 4BRJ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1E8X A; 3IU3 B; 4WKZ B; 1MOE A; 5CBA A; 2F58 H; 2W65 B; 1A64 A; 1AKJ A; 2APS A; 1NJ9 B; 4GKO A; 3I6K A; 2X7L A; 4AXW B; 3N5A A; 1U8L B; 1OGA A; 5FO7 A; 1DLH B; 4OAW A; 2ATA A; 5KS9 E; 4QRU B; 3NIF E; 4AYG A; 3R7R A; 4PRA B; 3S3S A; 2CO4 A; 1KBG H; 1KMG A; 3CFC H; 1F4W H; 4F33 A; 3FOL B; 4R4F L; 3UTT A; 1MI5 B; 4JFE E; 1QD0 A; 5TK4 A; 3T1F A; 1GHF H; 1OAR H; 1EEZ A; 3BN9 C; 3OKE B; 3P4M B; 3CSG A; 2J1W A; 1CFB A; 3HUJ F; 4PS4 H; 3MRG A; 5AW3 B; 4N6Q A; 5DZP A; 4B9C A; 5I8O L; 2BIH A; 1MFU A; 4G80 B; 5DFV D; 2YMX H; 4TL4 A; 1CXI A; 1Z9S A; 2H0E A; 2IVF C; 1ZLU K; 4PJF B; 4Z3E A; 9PCY A; 4HIJ A; 1E4X L; 4W9K C; 4BKT C; 3IFL H; 3ARR A; 1KIP B; 3O8X A; 1P5U B; 1I85 C; 1RER A; 3MOD H; 3WII L; 2R1X A; 1K72 A; 3GJF K; 3V4L A; 3N55 A; 4Y8A A; 4K3G A; 1E28 A; 3QO1 A; 4LRN L; 1LP9 F; 3VRL E; 5DJA A; 5E2V L; 5IOP B; 5E5M A; 1IM3 D; 2Q86 B; 3RVU C; 3F01 A; 3HS0 C; 1CI5 A; 4NI6 A; 2VLK E; 1ET7 A; 1R3H B; 4FFY A; 3STZ B; 3MLZ H; 1P4B L; 4P2R E; 1JK9 A; 4RAV B; 4B53 A; 1Z9L A; 3MBE B; 1NBV H; 1CTO A; 4RGN E; 2BIN A; 3G9V A; 5J5E A; 3BZF B; 3BSG A; 5ESV B; 4N3T A; 4TUO A; 3RB5 A; 1MJJ A; 1IND H; 4K8R L; 1WP6 A; 4F7P B; 2ENJ A; 5DHV H; 4KPH L; 5DJC A; 4OCW H; 3NES A; 2PXY A; 5C0B D; 5GS1 C; 3RWD A; 2HTL D; 4WSJ A; 4XCE B; 4ZOA A; 1CG9 A; 2CII B; 1H5B A; 2G9H B; 1TJI L; 4X5X B; 3W9E A; 4FLH A; 4JN2 A; 2GFB A; 3UGU A; 4LL9 A; 3WN5 A; 3S8G B; 1SBB A; 2EXY D; 3DRO B; 2OTU A; 3MME B; 3DC0 A; 2ATP B; 4M5Y H; 4YSQ A; 1EHL L; 1NAM B; 5AOM A; 2R2E B; 3RRQ A; 4Y19 B; 3PIQ B; 2WTR A; 1E4W H; 3KH3 A; 2Y07 H; 2DQF B; 4YHL L; 4PIR F; 1MW0 A; 1FNA A; 1V54 B; 4XN9 A; 3RX8 A; 4K9E C; 2NY2 C; 4QHM B; 2AV7 B; 5DD3 L; 2ROY A; 4OLZ H; 1YY9 C; 4PJE F; 4MX7 B; 4V1D E; 2B1O A; 2H8P B; 3SBR A; 1V3J A; 1NEZ B; 1T5K A; 1J5D A; 4GSR A; 4P06 A; 4WFG E; 3G5W A; 5AZ2 L; 4XO9 A; 4GKZ A; 5FOJ A; 5JOR B; 1BOY A; 1P5V B; 5KBN C; 5C7X L; 2QMJ A; 4NJA H; 3QWR A; 5DEG B; 4HET A; 2O5N A; 1KLU A; 2R56 H; 5EIV A; 5KS9 A; 4M6O L; 4UQA A; 2HFE B; 4XP5 H; 3NZS A; 3GHB H; 2H2P C; 4LBE A; 4IOF C; 4O02 A; 2ALW A; 4L8C A; 3BJ9 1; 1DBA L; 4JZJ A; 3SDC B; 1AI1 L; 4JFE A; 4PRI E; 3EGD B; 5D72 L; 1OIO A; 3FN3 A; 5HVG B; 5G4N A; 4BFR A; 2HB0 A; 2JKT M; 1O0V A; 1AAJ A; 3SQB A; 4WI6 A; 4ZW5 A; 1YC7 A; 3FO9 B; 5JPM A; 1COB A; 5A6M A; 3T2N L; 3DUU B; 5EU3 B; 3MA9 L; 1E5U I; 2WWK T; 3BYT A; 3L3I B; 2N3J A; 3K0W A; 4OUU B; 1NL0 L; 4JCM A; 4ZDH A; 3KPM B; 1EUU A; 3ZPD A; 5I1C H; 4B50 A; 3QUK A; 8CGT A; 2AS5 M; 3OKO A; 4FFV C; 3FTZ A; 4N5U A; 3TV8 A; 1Q9W A; 4O9H H; 5T3Z L; 2DKU A; 1FGV L; 3ARD B; 4KZD H; 3RUG E; 2VIR B; 5DJX B; 4ZMX A; 1WO2 A; 4D2N A; 1UA6 H; 2BP8 B; 1PW3 A; 2VXU H; 1V27 A; 4AEH L; 5D6C A; 1SOS A; 5JPN A; 1E67 A; 4LLW B; 2VLK A; 3ZX1 A; 4P2R A; 3IGA B; 1A4J B; 1KC5 H; 3QNF A; 4K5P A; 5T3X D; 3NTC H; 5FFG A; 4PJ5 E; 4DER A; 4PRH E; 5IEK B; 3MLS H; 4H0L C; 4Z3J A; 4UDT B; 3UDW C; 4MNG E; 3HI6 L; 3N50 A; 1XTM A; 1EQW A; 4PJI F; 4ABU A; 1OCW H; 3BAE H; 5DC9 B; 4JFY A; 1YLB B; 5FYL L; 2X6V A; 1IGJ B; 1XF4 B; 1UG9 A; 3GPE A; 5DHY B; 5HDB B; 3T3P E; 4HOZ A; 2EVG A; 5KZC B; 1JGE B; 4HJT A; 2WCG A; 1NLD L; 3D2U A; 3QDJ A; 1G0D A; 1ERN A; 1TLK A; 4RFN C; 4U33 A; 5LWY L; 1WE5 A; 4DEU A; 4UTC A; 4PUB L; 1FO0 H; 3ECW A; 4B6Z A; 5ETU B; 4Z77 A; 1O5D T; 1RJC A; 4TLT A; 1NUG A; 4Y4F D; 5BJT B; 2CM5 A; 2F54 D; 5FM5 M; 3QA3 A; 1HCZ A; 4WDI B; 2DQH L; 2NZI A; 4IGB C; 1ACY H; 3FPX A; 3LKS B; 5HHP A; 3QCT H; 1EAO A; 1WC7 B; 2WXP A; 3KNB A; 2RTT A; 4V1D A; 1KGJ A; 1QI5 A; 3TPU B; 4IEF B; 1XB3 A; 4BCX A; 1KIU B; 2OCC B; 1WG3 A; 2AQ2 A; 2CK2 A; 5I76 A; 5B1J C; 3VMO A; 4S1D C; 2OM5 A; 1CUO A; 5AWN H; 1CD0 A; 4P2Q E; 5IQ7 L; 1W6W A; 1NID A; 4PG2 A; 1HN1 A; 3K5S A; 5FLU A; 3DSN B; 2FTA A; 2O6P A; 3JUZ A; 4UNU A; 2NY6 C; 3BMW A; 1D2P A; 4FFZ A; 3VYN A; 2A74 C; 4F7M B; 5JOE A; 1HX0 A; 2ESV B; 2G4G A; 1L7I H; 2Z8S A; 3O45 B; 4PRI A; 1A6A A; 5C08 B; 5C0R H; 3ECB A; 2HT3 D; 1HES A; 1TU2 A; 4FL4 C; 4NFD A; 3CSB A; 4KI1 A; 2VXQ H; 1VIW A; 1B6D A; 4L0Z A; 3OGO E; 4FZ8 L; 2MCM A; 1FE8 H; 2F08 A; 4XN1 A; 4FQX D; 4PY7 A; 1TVD A; 4W1T A; 5D7K E; 3FQ4 A; 4DT2 A; 2CRM A; 4KTE L; 4MJI D; 1G0X A; 4NQD E; 5FF6 B; 3IPF A; 1NOL A; 4OU3 A; 1MFA H; 4J23 A; 4GRW F; 5KJ7 E; 2WW8 A; 4BH8 A; 3U2I A; 1WLH A; 4TUL L; 3UBX B; 3P11 L; 5LNG A; 1EEY B; 4XWG H; 3RL2 A; 3RUG A; 5BRP A; 4DFH A; 2AEP L; 5GRJ L; 1K85 A; 4U1S A; 3S2C A; 1KTC A; 1OD9 A; 5C0C B; 3POH A; 2JJU A; 3R18 A; 5A2I H; 3O6F D; 1D7F A; 4IRZ L; 1G9N C; 5EOR L; 3V5K B; 3QIU B; 5I18 H; 4RGO L; 4GKS B; 3KYO A; 1I85 A; 1CL7 H; 4RWY L; 5F93 C; 1A7N H; 5DJ2 B; 3RU8 H; 2OQJ B; 4TV3 A; 1MKF A; 3LKN A; 3ZKQ D; 1LO3 H; 2K9U A; 2Q7Y A; 1MCL A; 3HS0 A; 3EJJ X; 4PRH A; 3VXS E; 3EIF A; 4ZAK C; 1CDC A; 3EBA A; 4Y4H C; 4MNG A; 2FVN A; 1HSB A; 2XG4 A; 4PJX F; 1XT5 A; 3V4P H; 5AD0 A; 1YEI L; 3ZKX C; 2P5W D; 4M1D H; 3E3Q C; 4OD2 A; 4WKX A; 3BEV A; 3ZYJ A; 4ELM F; 1PEW A; 2D3V A; 4OJY A; 5ITB H; 4ZK8 A; 2CMR L; 3VFU A; 4JY6 B; 5K9J L; 5IFA L; 3T09 A; 2OMW A; 1N2R B; 4XVJ L; 5GS1 A; 5SX5 K; 3U7Y L; 3D69 A; 5JXA L; 1BSI A; 2EDW A; 4YAQ A; 4FLQ A; 1JD7 A; 2D7N A; 3P9M A; 1WH0 A; 2UZX B; 2VER N; 1N5A A; 3WO4 B; 5IFH H; 3BLB A; 5JZ7 C; 1YDP B; 3A67 H; 1RZG B; 1K4D A; 2FBR A; 2FZ3 A; 1HQR B; 4NRX A; 1PU0 A; 4F2M E; 3BP7 A; 1HL5 A; 2FO8 A; 2V9U A; 5CM1 A; 4WIQ A; 1DQM H; 3EJT A; 1AGC A; 4JJH A; 4ZML A; 3EJY C; 1OB1 B; 4ABW A; 4CVX B; 5FUZ H; 1THA A; 1DVY A; 3BVV A; 4HUK B; 4YSP A; 5IWL C; 5DVO A; 2F68 X; 3Q5T A; 1E6O L; 3FBK A; 4HT1 L; 4XPG H; 5EEV A; 2Z8R A; 4ALA H; 4LHU A; 3WXV H; 5AOJ A; 3KR3 H; 1AFV L; 2IV9 A; 3JZY A; 5IVN A; 4ZW3 A; 3C6E A; 4OF3 A; 2DLF H; 4DEP B; 1S7X B; 4UBD C; 3W37 A; 2VAA A; 1P84 J; 1VF5 C; 4P4R A; 2VZO A; 4XNX L; 2R4S H; 3UP6 A; 5IJD C; 2VDL L; 4GAF B; 4QRS B; 1G9M L; 4HJ0 D; 3EGS B; 2OX5 B; 3REW A; 3RIA F; 1DLF L; 3KGS A; 3T77 A; 1Q0Y L; 1N18 A; 3RNQ B; 2GEE A; 3UMT A; 4PB0 L; 1FO0 B; 1PZS A; 5DVN A; 2WLJ A; 4DF9 A; 3VSU A; 4DUX A; 4LNR B; 3MLT A; 4TNG A; 3BRG C; 2XTJ D; 1NMC C; 4BM7 A; 2EKS A; 2ZOK A; 3C2A H; 4IHO A; 3ULU C; 2B39 A; 5F9W B; 1GYW A; 4IOI B; 4K5M A; 3LMJ L; 3QIW C; 5H35 B; 3C75 A; 3T04 D; 1L3W A; 1XGU B; 4PJB B; 3L4U A; 5AW9 B; 1N4X H; 4XPA L; 1TCM A; 4IBU A; 5E2W H; 5B3N A; 2HH0 L; 3BLP X; 4KNQ A; 4WWI D; 5KSB F; 1OW0 C; 5IF0 A; 1MPA H; 4LCV A; 2ROX A; 2R7E B; 4ZTO H; 4N2E A; 3SE9 H; 5KJR L; 5J11 C; 4JO4 H; 4I0P C; 3APD A; 1K6Q H; 1IGC L; 5FO9 A; 1U42 A; 3QUZ B; 2ZSV A; 5GGU A; 3OKM A; 2VO8 A; 2YPV L; 4P23 B; 4NKO A; 3V0J A; 5MP6 L; 5EU7 C; 3QW9 A; 5KAQ G; 1PD0 A; 1SEB B; 1ZT1 B; 5IOK A; 3TBS A; 4RMT A; 4U3S A; 4P2Y A; 5LQB L; 4P48 A; 4LFH G; 3AG3 B; 4R5X A; 4KRP C; 5TFS L; 4MZR A; 3BPL B; 4ZFF B; 1GY2 A; 5B38 G; 1JN6 A; 2YAM A; 3CMG A; 4K3E L; 3RL1 B; 4N8V A; 4UNI A; 4PI0 A; 5IQ9 B; 1OXY A; 1AXS A; 2QTE A; 1VKX B; 2FAU A; 1OQO A; 1I3G H; 3E3Q E; 5I1E H; 1JV5 A; 3CX5 J; 2X89 A; 2BFV H; 4RAU A; 2YPK B; 4FAB H; 5HYJ E; 1HXM A; 3ARG D; 2J5L C; 3V9F A; 1MHP L; 1QBB A; 3L3D A; 3V7A G; 2HVK A; 4KV5 F; 4P9H H; 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2VDQ H; 3NJL A; 1FFT B; 3UOA B; 3FU3 A; 1T2Q H; 4A7Q A; 1X5Y A; 5KBL A; 1NSN H; 5KVG H; 4KH9 A; 3UJT L; 3LPG A; 2LLG A; 3HAE G; 1AGF A; 4UT7 L; 4Z7U B; 5FWR A; 3ZDY F; 3WKN A; 4XBP B; 2ZYH A; 1MWA H; 4O58 L; 3SZK C; 3FQU B; 4GQ9 L; 4PY8 I; 1WIP A; 2YXF A; 2FED C; 3FPY A; 4AYF A; 2X4N A; 1AG6 A; 4ZTP H; 1R5W A; 1SYV B; 4LLD B; 1TTC A; 1J8H D; 4JFX B; 2NR6 C; 3ULU E; 4ADI A; 3OTT A; 1J5I A; 3IU4 H; 3GMR B; 2WZ0 A; 1CDH A; 3GJF A; 2MPV A; 2BWQ A; 4F8P A; 4NO2 B; 4PJ6 A; 3TU6 A; 4L3A A; 4A2D A; 2VZ1 A; 1JUF A; 5G5D B; 1ZHK B; 4AQE B; 3TBT B; 1G7H A; 3LKR B; 4DVB B; 4X8C A; 1NC2 D; 3AB0 B; 1DSW A; 4H20 H; 3L95 A; 3JV0 A; 1T2J A; 4DP2 X; 3LRM A; 4UQ9 A; 2F6A A; 3QDA A; 5FB8 A; 2L3B A; 4MA3 B; 3L3H A; 2AEO A; 3ZHF A; 1Q9K B; 1YMM B; 4L8S C; 5CEY A; 3POC A; 3TZV B; 1DVQ A; 3PWJ A; 1EHK B; 4G3Y H; 4ZAK A; 4K0O A; 2WVV B; 1C8Q A; 4Y4H A; 3SBW C; 4LLA A; 3VFW B; 3WS3 A; 2XV6 B; 4J3O D; 4OM1 H; 4TS6 A; 5KWY C; 4WAF A; 4RZC B; 5HYJ A; 4X9F A; 1DQT A; 1S78 D; 3QNZ B; 2L0D A; 5FC9 A; 1FZK B; 3T4A B; 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