The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
119
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structure length |
119
|
Chain Sequence |
TDQATPNLPSRDFDSTAAFYERLGFGIVFRDAGWMILQRGDLMLEFFAHPGLDPLASWFSCCLRLDDLAEFYRQCKSVGIQETSSGYPRIHAPELQEWGGTMAALVDPDGTLLRLIQNE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of the transposon Tn5-carried bleomycin resistance determinant uncomplexed and complexed with bleomycin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
BLEOMYCIN RESISTANCE DETERMINANT
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| molecule tags |
Antibiotic inhibitor
|
| source organism |
Klebsiella pneumoniae
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| total genus |
28
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| structure length |
119
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| sequence length |
119
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-04-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | 2,3-Dihydroxybiphenyl 1,2-Dioxygenase; domain 1 | 2,3-Dihydroxybiphenyl 1,2-Dioxygenase, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4NAY A; 1Q0C A; 4JH1 A; 2RK9 A; 3VB0 A; 1LQO A; 2A4X A; 1FA8 A; 3HDP A; 4JH9 A; 1JIE A; 3VW9 A; 4IAG A; 1SS4 A; 1DHY A; 1KWC B; 2P7K A; 4Z6S A; 1F1U A; 1XQA A; 4RT5 A; 4Z6P A; 1TSJ A; 4JH6 A; 4MYM A; 2R5V A; 4N04 A; 4Z6V A; 4JH7 A; 1QIN A; 2P7O A; 4NB0 A; 4Z6W A; 1MPY A; 4X2A A; 4GHE A; 3P8A A; 1TG5 A; 3OJK A; 2QH0 A; 1FA6 A; 3HPY A; 4Z6O A; 1F1X A; 5D7Z A; 4JH3 A; 1FA7 A; 1NKI A; 5DFG A; 1T47 A; 4JH2 A; 3PKV A; 3CT8 A; 4JH8 A; 2P7L A; 1LQP A; 1NPB A; 3SK2 A; 5BWG A; 5F6Q A; 3L7T A; 5C4P A; 3ZI1 A; 4MTS A; 1Q0O A; 3G12 A; 5DRH A; 3HNQ A; 2EHZ A; 1QTO A; 1SP9 A; 1U6L A; 2EI0 A; 2I7R A; 2RK0 A; 3KOL A; 3OAJ A; 4GHC A; 1KW3 B; 3HPV A; 3ISQ A; 3E0R A; 3W0T A; 2EI1 A; 2R6U A; 4PV5 A; 3BQX A; 1QIP A; 1HAN A; 1LGT A; 1KMZ A; 1KND A; 2ZI8 A; 4MTR A; 2ZHP A; 3BZA A; 5KEF A; 1NNR A; 3E5D A; 3ZGJ A; 1EIR A; 1F1V A; 3HQ0 A; 4NVS A; 1TFZ A; 4KYH A; 2IG9 A; 4Z6T A; 5C68 A; 3GHJ A; 1EIL A; 3ECJ A; 3EY7 A; 4G6X A; 3OPY B; 1BH5 A; 4Z6L A; 4GHD A; 2P7M A; 3B59 A; 3LM4 A; 3W0U A; 4HUZ A; 4QB5 A; 2RBB A; 1JC4 A; 5DHW A; 4PAV A; 2QNT A; 4GHF A; 4IR0 A; 4Z6N A; 1SQI A; 1JC5 A; 1KW8 B; 4JH4 A; 3OXH A; 5CTO A; 1FA5 A; 4JD1 A; 3ZW5 A; 1XY7 A; 2P7Q A; 1K4N A; 2EI3 A; 4GHH A; 4Z6M A; 1BYL A; 1FRO A; 2ZW5 A; 1NIQ B; 4OPN A; 4JH5 A; 1F9Z A; 3HUH A; 4GYM A; 4MTQ A; 4Z04 A; 1ZSW A; 3PKX A; 1MH6 A; 1EWJ A; 3OJT A; 4HC5 A; 2ZW4 A; 5CJ3 A; 5BWH A; 4NB1 A; 1TWU A; 3GM5 A; 1KLL A; 4LQB A; 1SQD A; 4Z6R A; 1LKD A; 1KMY A; 1R9C A; 3PKW A; 3R6A A; 4Z6U A; 3OJJ A; 1KWB B; 1SP8 A; 3RRI A; 2P7P A; 3ECK A; 1LQK A; 3OA4 A; 5CB9 A; 1XRK A; 2ZW6 A; 3OUM A; 2QQZ A; 4NB2 A; 2ZW7 A; 4Z6Z A; 2WL3 A; 2ZA0 A; 3OUL A; 5D4F A; 1F1R A; 2Q48 A; 2PJS A; 3FCD A; 1KW6 B; 3RMU A; 3EY8 A; 4KYK A; 5C6X A; 3OJN A; 1KNF A; 2P25 A; 3L20 A; 3R4Q A; 5HCW A; 5EC3 A; 3RHE A; 2EI2 A; 2ZYQ A; 4NAZ A; 2WL9 A; 4MTT A; 2C21 A; 4GHG A; 4Z6Q A; 1ECS A; 1JIF A; 2IGA A; 1CJX A; 2A4W A; 1EIQ A; 1KW9 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4NAY A; 1Q0C A; 4JH1 A; 2RK9 A; 3VB0 A; 1LQO A; 1U69 A; 2A4X A; 1FA8 A; 3HDP A; 4JH9 A; 1JIE A; 3VW9 A; 4IAG A; 1SS4 A; 1DHY A; 1KWC B; 2P7K A; 4Z6S A; 1F1U A; 1XQA A; 4RT5 A; 4Z6P A; 1TSJ A; 4JH6 A; 4MYM A; 2R5V A; 4N04 A; 4Z6V A; 4JH7 A; 1QIN A; 2P7O A; 4NB0 A; 4Z6W A; 1MPY A; 4X2A A; 4GHE A; 3P8A A; 1TG5 A; 3OJK A; 2QH0 A; 1FA6 A; 3HPY A; 4Z6O A; 1F1X A; 2APC A; 4JH3 A; 5D7Z A; 1FA7 A; 1NKI A; 5DFG A; 1T47 A; 4JH2 A; 3PKV A; 3CT8 A; 4JH8 A; 1FOA A; 2AM5 A; 2P7L A; 2RJB A; 1LQP A; 1NPB A; 3SK2 A; 5BWG A; 5F6Q A; 3L7T A; 5C4P A; 3ZI1 A; 4MTS A; 1Q0O A; 3G12 A; 5DRH A; 3HNQ A; 2EHZ A; 1QTO A; 1SP9 A; 1U6L A; 2EI0 A; 2I7R A; 2RK0 A; 3KOL A; 3OAJ A; 4GHC A; 1KW3 B; 3HPV A; 3ISQ A; 3E0R A; 3W0T A; 2EI1 A; 2R6U A; 4PV5 A; 3BQX A; 1QIP A; 1HAN A; 1LGT A; 1KMZ A; 1KND A; 2ZI8 A; 4MTR A; 2ZHP A; 3BZA A; 5KEF A; 1NNR A; 3E5D A; 3ZGJ A; 1EIR A; 1F1V A; 3LHO A; 3HQ0 A; 4NVS A; 1TFZ A; 4KYH A; 2IG9 A; 4Z6T A; 5C68 A; 3GHJ A; 1EIL A; 3ECJ A; 3EY7 A; 4G6X A; 3OPY B; 1FO8 A; 1BH5 A; 4Z6L A; 4GHD A; 2P7M A; 3B59 A; 3LM4 A; 3W0U A; 4HUZ A; 1FO9 A; 4QB5 A; 2RBB A; 1JC4 A; 5DHW A; 4PAV A; 2QNT A; 2AM4 A; 4GHF A; 4IR0 A; 4Z6N A; 1SQI A; 1JC5 A; 1KW8 B; 4JH4 A; 3OXH A; 5CTO A; 1FA5 A; 4JD1 A; 3ZW5 A; 1XY7 A; 2P7Q A; 1K4N A; 2EI3 A; 4GHH A; 4Z6M A; 1BYL A; 1FRO A; 2ZW5 A; 3IUZ A; 1NIQ B; 4OPN A; 4JH5 A; 1F9Z A; 3HUH A; 4GYM A; 4MTQ A; 4Z04 A; 1ZSW A; 3OPY A; 3PKX A; 1MH6 A; 1EWJ A; 3OJT A; 4HC5 A; 2ZW4 A; 5CJ3 A; 5BWH A; 4NB1 A; 1TWU A; 3GM5 A; 1KLL A; 4LQB A; 1SQD A; 4Z6R A; 1LKD A; 1KMY A; 1R9C A; 3PKW A; 3R6A A; 4Z6U A; 3OJJ A; 1KWB B; 1SP8 A; 3RRI A; 2P7P A; 3ECK A; 1LQK A; 3OA4 A; 5CB9 A; 1XRK A; 2ZW6 A; 3OUM A; 2QQZ A; 4NB2 A; 2ZW7 A; 4Z6Z A; 2WL3 A; 2ZA0 A; 2AM3 A; 3OUL A; 5D4F A; 1F1R A; 2Q48 A; 2PJS A; 3FCD A; 1KW6 B; 3RMU A; 3EY8 A; 4KYK A; 5C6X A; 3OJN A; 1KNF A; 2P25 A; 3L20 A; 3R4Q A; 5HCW A; 5EC3 A; 3RHE A; 2EI2 A; 2ZYQ A; 4NAZ A; 2WL9 A; 4MTT A; 2C21 A; 4GHG A; 4Z6Q A; 1ECS A; 1JIF A; 2IGA A; 1CJX A; 2A4W A; 1EIQ A; 1KW9 B; #chains in the Genus database with same CATH homology 4NAY A; 1Q0C A; 4JH1 A; 2RK9 A; 3VB0 A; 1LQO A; 2A4X A; 1FA8 A; 3HDP A; 4JH9 A; 1JIE A; 3VW9 A; 4IAG A; 1SS4 A; 1DHY A; 1KWC B; 2P7K A; 4Z6S A; 1F1U A; 1XQA A; 4RT5 A; 4Z6P A; 1TSJ A; 4JH6 A; 4MYM A; 2R5V A; 4N04 A; 4Z6V A; 4JH7 A; 1QIN A; 2P7O A; 4NB0 A; 4Z6W A; 1MPY A; 4X2A A; 4GHE A; 3P8A A; 1TG5 A; 3OJK A; 2QH0 A; 1FA6 A; 3HPY A; 4Z6O A; 1F1X A; 5D7Z A; 4JH3 A; 1FA7 A; 1NKI A; 5DFG A; 1T47 A; 4JH2 A; 3PKV A; 3CT8 A; 4JH8 A; 2P7L A; 1LQP A; 1NPB A; 3SK2 A; 5BWG A; 5F6Q A; 3L7T A; 5C4P A; 3ZI1 A; 4MTS A; 1Q0O A; 3G12 A; 5DRH A; 3HNQ A; 2EHZ A; 1QTO A; 1SP9 A; 1U6L A; 2EI0 A; 2I7R A; 2RK0 A; 3KOL A; 3OAJ A; 4GHC A; 1KW3 B; 3HPV A; 3ISQ A; 3E0R A; 3W0T A; 2EI1 A; 2R6U A; 4PV5 A; 3BQX A; 1QIP A; 1HAN A; 1LGT A; 1KMZ A; 1KND A; 2ZI8 A; 4MTR A; 2ZHP A; 3BZA A; 5KEF A; 1NNR A; 3E5D A; 3ZGJ A; 1EIR A; 1F1V A; 3HQ0 A; 4NVS A; 1TFZ A; 4KYH A; 2IG9 A; 4Z6T A; 5C68 A; 3GHJ A; 1EIL A; 3ECJ A; 3EY7 A; 4G6X A; 3OPY B; 1BH5 A; 4Z6L A; 4GHD A; 2P7M A; 3B59 A; 3LM4 A; 3W0U A; 4HUZ A; 4QB5 A; 2RBB A; 1JC4 A; 5DHW A; 4PAV A; 2QNT A; 4GHF A; 4IR0 A; 4Z6N A; 1SQI A; 1JC5 A; 1KW8 B; 4JH4 A; 3OXH A; 5CTO A; 1FA5 A; 4JD1 A; 3ZW5 A; 1XY7 A; 2P7Q A; 1K4N A; 2EI3 A; 4GHH A; 4Z6M A; 1BYL A; 1FRO A; 2ZW5 A; 1NIQ B; 4OPN A; 4JH5 A; 1F9Z A; 3HUH A; 4GYM A; 4MTQ A; 4Z04 A; 1ZSW A; 3PKX A; 1MH6 A; 1EWJ A; 3OJT A; 4HC5 A; 2ZW4 A; 5CJ3 A; 5BWH A; 4NB1 A; 1TWU A; 3GM5 A; 1KLL A; 4LQB A; 1SQD A; 4Z6R A; 1LKD A; 1KMY A; 1R9C A; 3PKW A; 3R6A A; 4Z6U A; 3OJJ A; 1KWB B; 1SP8 A; 3RRI A; 2P7P A; 3ECK A; 1LQK A; 3OA4 A; 5CB9 A; 1XRK A; 2ZW6 A; 3OUM A; 2QQZ A; 4NB2 A; 2ZW7 A; 4Z6Z A; 2WL3 A; 2ZA0 A; 3OUL A; 5D4F A; 1F1R A; 2Q48 A; 2PJS A; 3FCD A; 1KW6 B; 3RMU A; 3EY8 A; 4KYK A; 5C6X A; 3OJN A; 1KNF A; 2P25 A; 3L20 A; 3R4Q A; 5HCW A; 5EC3 A; 3RHE A; 2EI2 A; 2ZYQ A; 4NAZ A; 2WL9 A; 4MTT A; 2C21 A; 4GHG A; 4Z6Q A; 1ECS A; 1JIF A; 2IGA A; 1CJX A; 2A4W A; 1EIQ A; 1KW9 B;
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