The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
125
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structure length |
125
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Chain Sequence |
SWQTYVDTNLVGTGAVTQAAILGLDGNTWATSAGFAVTPAQGQTLASAFNNADPIRASGFDLAGVHYVTLRADDRSIYGKKGSAGVITVKTSKSILVGVYNEKIQPGTAANVVEKLADYLIGQGF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Actin-binding
|
| molecule keywords |
PROFILIN IA
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| publication title |
Three-dimensional solution structure of Acanthamoeba profilin-I.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Acanthamoeba sp.
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| total genus |
11
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| structure length |
125
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| sequence length |
125
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3MS6 A; 3CPT B; 3DAV A; 3LEQ A; 4X1M A; 3T1R A; 1D1J A; 5EVE A; 3T1X A; 2JKF A; 4FUW A; 2JKG A; 3CHW P; 3LGO A; 1A0K A; 4QWO A; 3NEC A; 5FDS A; 1PNE A; 1CJF A; 5EV0 A; 3UB5 P; 1Y4O A; 2V8C A; 1PRQ A; 5FEF A; 1K0K A; 1Z09 A; 4D60 A; 3T12 B; 1HLU P; 3NUL A; 4X1L A; 3T1S A; 3L9K A; 4ESP A; 2PBD P; 2V8F A; 1SKO A; 1VEU A; 2PRF A; 3L7H A; 1J3W A; 5FEG A; 1FIK A; 5EM1 A; 1AWI A; 2HZ5 A; 2E8J A; 2PAV P; 1SKO B; 1VET A; 1VEU B; 2BTF P; 2VK3 A; 1G5U A; 2ZL1 A; 1YPR A; 2ACG A; 1CQA A; 3T1Q B; 4X25 A; 1F2K A; 1PFL A; 4FTX A; 3KYE A; 1CF0 A; 1VET B; 1FIL A; 3CPT A; 2ZL1 B; 2B95 A; 1ACF A; 5EM0 A; 3D9Y A; 1SZV A; 3U4L P; 3MSH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1K55 A; 4OON A; 2VGL S; 3DBA A; 1UGU A; 1UWN X; 2JKF A; 4FUW A; 4GZB A; 4IED A; 1IEM A; 2JKG A; 1C3B A; 3CAX A; 3K3D A; 4LEN A; 3N8R A; 5HD5 A; 1ESI A; 2EWV A; 4YWZ A; 1XA1 A; 3Q82 A; 4HH3 A; 4NEE D; 1IKG A; 3ZCZ A; 4Y0O A; 4MN5 A; 3IX4 A; 2GX5 A; 1LL9 A; 4Y2F A; 2ZQC A; 4R4S A; 4HBU A; 5F68 A; 4KZ9 A; 5G18 A; 3R7W A; 3SS4 A; 4X1L A; 4KUO A; 4E3L A; 4MBF A; 5EEC A; 3IH9 A; 3DWZ A; 5TBM A; 3VE3 A; 1ODV A; 4UQI S; 2JC7 A; 4R0Q A; 2XD5 A; 4LFU A; 1NLY A; 4EBN A; 2L1M A; 4Y13 A; 1E3U D; 3BY8 A; 3JVU A; 4U0X A; 1HTZ A; 3S7P A; 3M2K A; 2JHE A; 2XD1 A; 4KG6 A; 1H8Y A; 1F2K A; 1PI4 A; 1ES3 A; 3TRC A; 5G4Y A; 1SKF A; 3QP2 A; 1PWG A; 3MFD A; 3QP6 A; 1BYW A; 1YAX A; 4XUX A; 1XX2 A; 4BBT A; 4RX2 A; 4ETX A; 5CEC A; 1STZ A; 1IYO A; 3U4L P; 3S4X A; 4WM9 A; 3FG8 A; 5CX7 A; 2Y2P A; 1KDW A; 2H10 A; 1ONG A; 2PU2 A; 3P01 A; 5EVE A; 1LSW A; 4H8R A; 3NDE A; 5FAO A; 2ZQ7 A; 1YLY A; 1W8Q A; 3PXP A; 3ICY A; 4UA7 A; 4Q0I A; 2WKI A; 4WMC A; 1FSW A; 4H6J B; 3HLC A; 4EEU A; 4JGQ A; 1CJF A; 5EOO A; 2NUT C; 4R3B A; 4EW7 A; 3QNC A; 4DDY A; 3UB5 P; 5KMW A; 3IQA A; 3HL9 A; 3SS3 A; 4Y0U A; 1BSG A; 2QMI A; 2J7V A; 3FC7 A; 3OCN A; 5JYP A; 3IWI A; 1IYP A; 3LY3 A; 2PR5 A; 4GDN A; 3LR5 A; 4ZJ1 A; 3SS5 A; 2V0U A; 3WS1 A; 1H0M A; 2XLN A; 5DTS A; 4PPR A; 4IBX A; 3V50 A; 1JWZ A; 1LLB A; 3H7W A; 3T4J A; 3WWX A; 4G3W A; 2PYR A; 2PD8 A; 5EM1 A; 3JVV A; 4FD8 A; 3PR6 A; 1MZU A; 3GMW A; 3UDX A; 2Y2M A; 2H0Y A; 3FWL A; 5F5Y A; 1G5U A; 5TGF A; 2ACG A; 3BFD A; 2ZQ9 A; 3CLO A; 4ZDX A; 5DF9 A; 1K57 A; 5AQ9 A; 2FZ0 A; 4GOG A; 3BEB A; 4ZJ3 A; 1TDL A; 4JGP A; 1VET B; 3TJZ C; 4GS9 A; 3HUO A; 2ZL1 B; 3RXW A; 2G7U A; 5F69 A; 2B95 A; 4WL9 A; 5DVA A; 3UN7 A; 1ZKJ A; 1LL8 A; 2OWJ A; 2OOL A; 3LO7 A; 4PHT A; 3FPV A; 3CPT B; 3PBR A; 4WZ5 A; 3C4O A; 5AJG A; 4JXS A; 2KX6 A; 1D1J A; 3F1P A; 3VOY A; 1BTL A; 3PYP A; 4LRX C; 5HAI A; 2P08 A; 3F1N A; 1LSV A; 1KE4 A; 2MJ6 A; 2V20 A; 4QWO A; 3OPH A; 3MZD A; 1XJ3 A; 1LSX A; 3P09 A; 4S2P A; 3MQO A; 3ZQ5 A; 4BWI A; 5FAT A; 2X71 A; 4EQ1 A; 5FI2 A; 4EEP A; 5HD3 A; 2HDQ A; 2IA2 A; 1IYS A; 3NUL A; 3T4L A; 1EWZ A; 1GA9 A; 4NXE A; 3HBR A; 3ULF A; 5FQM A; 2EX8 A; 5CGX A; 4X55 A; 4GW9 A; 4LGW A; 4YOF A; 5J8X A; 1AWI A; 3B33 A; 2HZ5 A; 3IHA A; 1GHI A; 3HJI A; 3ZG5 A; 3NI9 A; 4EET B; 1FR1 A; 3OBF A; 4OOY A; 4X25 A; 5HPI A; 3G6O A; 3V67 A; 4FTX A; 5HDS A; 3W4Q A; 1QMF A; 3F1O B; 1YM1 A; 4JLF A; 4EES A; 1MKI A; 3SW1 A; 4P6B A; 5HDC A; 2HDR A; 1N9L A; 1K54 C; 4F3L B; 4OPQ A; 1IFQ A; 2HP5 A; 4R4R A; 1P0Z A; 1PWC A; 3C2W A; 1PWD A; 3NOP C; 3H9W A; 2W3G A; 1GA0 A; 3T50 A; 4OQI A; 5EVL A; 2FFY A; 1MY8 A; 3HUN A; 2PYP A; 3LIA A; 3LGO A; 4LV1 A; 1DJA A; 4HI4 A; 2HDS A; 2BAS A; 4I38 A; 2GJ3 A; 3SH9 A; 4BD1 A; 2V9A A; 2QJ7 A; 4E3J A; 1XGJ A; 3LEZ A; 4E3O A; 3DTI A; 4LLO B; 4N1H A; 4CQH A; 1E3U A; 4N92 A; 2XGN A; 1XJ4 A; 3BWL A; 3VP2 A; 1MWT A; 2O0Y A; 1K25 A; 3KSH A; 1YQS A; 2I72 A; 3ITB A; 4JXW A; 4HEF A; 3BM6 A; 5CRF A; 5DTK A; 3RXX A; 1OTI A; 4DE1 A; 3K2N A; 5FSR A; 4MMN A; 2PRF A; 4XUZ A; 4MN7 A; 3GVB A; 3ZHH A; 4OPR A; 4YIN A; 5D3O A; 1FCO A; 3O88 A; 1LI0 A; 1LL5 A; 1SKO B; 3C5A A; 4KEN B; 4S2O A; 2P9V A; 2EFU A; 2OWH A; 5DF7 A; 5FDH A; 4BJP A; 1BUL A; 3MKF A; 1OT6 A; 1EI5 A; 1H3Q A; 3E4Q A; 1S1Y A; 2W1T A; 3QP5 A; 4S2L A; 4S2I A; 4IUK A; 3FKW A; 2YKH A; 5E2H A; 1NJ4 A; 1HD8 A; 5A90 A; 1DRM A; 4X69 A; 3LIB A; 5J4E A; 1KVL A; 3MS6 A; 5HL1 A; 3T4T A; 4LCM A; 2H28 A; 4E6W A; 2HPB A; 3UE3 A; 2W27 A; 4KZ6 A; 5L8M A; 4IVI A; 2J3T D; 3W2Z A; 4WBG A; 1V9Y A; 1FCM A; 4K0X A; 2EX9 A; 3UB7 A; 4OKP A; 4HP9 A; 2PHY A; 2Y91 A; 3A0R A; 2HV1 A; 4KZ7 A; 1CK3 A; 1P97 A; 2V1Z A; 4JGR A; 2XH9 A; 3WS2 A; 3N4I A; 1L0G A; 3NHQ A; 5A93 A; 5AQA A; 3UB9 A; 4WUJ A; 2D01 A; 4ZRR A; 5LBR A; 2XRO A; 4D60 A; 4HP4 A; 4KQO A; 2PBD P; 4IUH A; 3BQA A; 1TS6 A; 4CLC D; 1K4F A; 4YNR A; 5IU1 A; 1ZTU A; 4HH2 A; 3LCE A; 1KE3 A; 5DJU A; 3H82 A; 3WS0 A; 3QNB A; 3MF0 A; 3UE6 A; 4JXV A; 2B5R A; 4ZBE A; 4BBU A; 3LR0 A; 4DF6 A; 2VK3 A; 4QY6 A; 4AFI A; 4KQR A; 1H5X A; 1KE0 A; 3C38 A; 2ZC6 B; 1ZHH B; 1YMX A; 2RCX A; 4C6Y A; 2L4R A; 1ZG4 A; 3KYE A; 2WZX A; 2XFT A; 3HLD A; 5AQB A; 3G30 A; 4GHI B; 2ZC7 A; 4N9L A; 3N6I A; 4EUV A; 3EWK A; 4R23 A; 5E2G A; 2M1C A; 2VKS A; 1NZU A; 3AGD A; 2Y59 A; 4MDZ A; 2W3H A; 5FAQ A; 2ZQD A; 5HAQ A; 3SOI A; 4KG5 A; 4B93 A; 2Y2N A; 3T1X A; 4E04 A; 1IEL A; 4JXG A; 2Y79 A; 2LB5 A; 3E2K A; 3CHW P; 1YLT A; 3TE8 A; 2Y2I A; 1WYC A; 2J80 A; 3MMH A; 1PNE A; 5CHJ A; 2E8I A; 4LV3 A; 3PHY A; 1S0W A; 5M18 A; 2ZM8 A; 4FH4 A; 1KGF A; 4B9O A; 4Z9Q A; 1OTA A; 2UV0 E; 3KX0 X; 4MCW A; 4C3Q A; 4DN0 A; 1YLP A; 5HWT A; 4DE0 A; 1BLC A; 3D72 A; 5GHX A; 3LR4 A; 5EVI D; 4EWF A; 3RH8 B; 1ALQ A; 5EVI C; 3IF6 C; 4ZAM A; 3G34 A; 5HDD A; 4BQM A; 1K38 A; 3LYX A; 4F3L A; 4PM7 A; 3OLO A; 5EVI B; 3IF6 B; 2BG1 A; 2OAP 1; 1P9R A; 4HJ3 A; 2GNX A; 2JKT I; 4MLL A; 2QZ6 A; 4XT2 B; 2M7U A; 4CLC E; 5U47 A; 3MQQ A; 1ERM A; 4KZA A; 3DTE A; 1ES2 A; 4JF6 A; 2G2U A; 4ZTK A; 4OLD A; 1WA9 A; 5E2E A; 3BFC A; 4S2N C; 2Y55 A; 3NY4 A; 4NKP A; 4OOM A; 1JWV A; 4EBL A; 1NZO A; 5MC7 A; 4JKT A; 3M6H A; 3ZYT A; 5M19 A; 2QWS A; 1XPB A; 3R4K A; 4X68 A; 5L2F A; 1W8Y A; 4GB7 A; 4MN6 A; 1BLP A; 2VV6 A; 3KYQ A; 2H5S A; 4I3I A; 2LB9 A; 5CTN A; 1QME A; 3ZG9 B; 2J9O A; 4KQD A; 1OT9 A; 5CHM A; 3SH7 A; 3RFB A; 1XP4 A; 4KUK A; 1Y4O A; 4GLQ A; 2XSS A; 3HLF A; 3PBO A; 1MPL A; 4S2J A; 2KDK A; 1GHM A; 3ZFZ A; 1CI8 A; 5GLA A; 1K6S A; 3ZNY A; 1YLZ A; 5TFQ A; 3C8C A; 1VEU A; 2VA0 A; 5DFY A; 1HZO A; 4C75 A; 4LRY C; 4O01 A; 3ITA A; 4ZJ2 A; 2OAQ 1; 4Q8I A; 2UWX A; 2WAD A; 1NYM A; 2J8Y A; 3QP4 A; 3TSG A; 5KSH A; 2C6W B; 1KGE A; 2BTF P; 3MJQ A; 3KSF A; 2K7S A; 5F1F A; 4N1X A; 5FAP A; 2Y2O A; 5EUA A; 5FQ9 A; 3CUE C; 1JNU A; 3LIC A; 3Q7V A; 5K5B A; 1BUE A; 3E0Y A; 4YFM A; 4QD4 A; 5FI7 A; 4UQI M; 1E4D A; 5CTM A; 1M40 A; 3E2L A; 3IXH A; 5KZH A; 4Q0H A; 4I3A A; 5I94 A; 3T1R A; 2WAE A; 1O7E A; 2Z6D A; 2WGV A; 2W0N A; 4BMW A; 3N7W A; 2PDR A; 3GDI A; 3LI9 A; 2EXB A; 4CLC A; 2VEA A; 5F1G A; 4L0L A; 5FDS A; 4Y0T A; 4PM5 A; 5HX9 A; 5M1A A; 5JYO A; 5A92 A; 1XXM A; 4KZ4 A; 4WZ4 A; 2HJE A; 4HBT A; 3W4P A; 4BLM A; 5DKK A; 3V3R A; 2X02 A; 4Q0J A; 1W63 Q; 4WN5 A; 5EOE A; 3U2A A; 3QP8 A; 1ESU A; 2IWC A; 2WGW A; 2HJ9 C; 1DP6 A; 3ISG A; 1N9B A; 3IS2 A; 1XFQ A; 2AVX A; 4ARZ B; 1ES5 A; 3HLW A; 5DKL A; 3BY9 A; 4DKI A; 4HHD A; 2A24 B; 3NOU C; 1G6O A; 4NK3 A; 1N9O A; 2ZMF A; 4ID4 A; 3IBR A; 3BJN A; 3VSK A; 1T1B A; 4PKY G; 5L09 A; 1YT4 A; 2KOI A; 4OQ0 A; 5EE8 A; 4HNB A; 2P74 A; 1PI5 A; 3VFF A; 1KDS A; 3HLG A; 3VOZ A; 4NXF A; 2ZJ9 A; 2JKR M; 4HIA A; 4GD8 A; 3OZH A; 4P6Z S; 2A3U A; 4CJN A; 1ONH A; 2ZC3 B; 2HF6 A; 2PR6 A; 2Y2L A; 3HLE A; 2Z2L B; 3GTC A; 1PZO A; 1K55 C; 4PKY A; 4O8G A; 5FL3 A; 1L0D A; 3O5Y A; 4M4X A; 2VGK A; 3V39 A; 2ZQ8 A; 4OPZ A; 3W4O A; 1RGZ A; 3C4P A; 5HPF A; 4XT2 A; 3JYI A; 3KO6 A; 4B88 A; 1TDG A; 4O0P A; 3S1Y A; 5IS1 A; 3LID A; 4HOI A; 5GL9 A; 1K6R A; 4DRT A; 5BOH A; 4WEJ A; 1T1A A; 1VB6 A; 4UHU A; 2HDU A; 5HSQ A; 4HJ4 A; 1LI9 A; 5HWV A; 2EX2 A; 4L9G A; 2L0W A; 4X6T A; 3D4F A; 4OP8 A; 2DRW A; 2W3D A; 3S7O A; 1PIO A; 2O99 A; 4KZ3 A; 3VSL A; 3LY4 A; 5A91 A; 3VE4 A; 1DJC A; 2K31 A; 3R7W B; 3T4S A; 3IWQ A; 2ZM0 A; 5J7E A; 4IVK A; 5TBM B; 1S66 L; 3FYZ A; 4OP5 A; 4QJG A; 3VP3 A; 4NG2 A; 2WUQ A; 3UE1 A; 3CMZ A; 4PMA A; 3UNW A; 5J3W A; 2B18 A; 2VX8 A; 1FOF A; 4WLA A; 2WKE A; 2WYX A; 1L0E A; 5A8B A; 5F6A A; 2VLG A; 3UB6 A; 4BL2 A; 3G4P A; 2HP9 A; 1TEM A; 1U60 A; 3OPL A; 1JVJ A; 3M2J A; 3FZC A; 3B47 A; 1S4S A; 1I2S A; 3Q7Z A; 4H6J A; 5GLC A; 1WYB A; 4GDB A; 1OTE A; 1DP8 A; 3NOT C; 3ZVW A; 2XA7 S; 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2CMN A; 3MBZ A; 4JPM A; 2HP6 A; 3VP1 A; 4QY5 A; 3F1O A; 4S2K A; 3BLM A; 5L10 A; 1F5M A; 2PAV P; 5CXW A; 1V9Z A; 1OME A; 3E4P A; 4G3K A; 3GRJ A; 2Y2H A; 4PM8 A; 1F98 A; 3OPR A; 5E2F A; 1NRJ A; 1GSV A; 4EUZ A; 3C7U A; 5EFW A; 2R78 A; 2QPN A; 3DWK A; 5HW3 A; 1KVM A; 1NY0 A; 1K54 A; 3CJM A; 1MWS A; 1WE4 A; 3PBN A; 3JPU A; 1UWP X; 5I5L A; 5EM0 A; 3BYD A; 1W5D A; 4KG2 A; 4E3M A; 2OLU A; 4DJ2 A; 2GDN A; 4I39 A; 3G31 A; 3PBS A; 5FQK A; 2O9B A; 5IHV A; 2XR0 A; 1YSP A; 5AVE A; 1VHM A; 4EER A; 4IHQ A; 3A0S A; 3LIF A; 1G68 A; 2Y2K A; 2KLI A; 2EA9 A; 1TD5 A; 1KGG A; 2Z2M B; 2M7V A; 4E3K A; 2H0T A; 1TS0 A; 3WRT A; 3LUQ A; 3EGD C; 3RTY A; 4BL3 A; 3UPO A; 4EBP A; 4OVD A; 1K0K A; 4D2O A; 1YKD A; 3T12 B; 4PAU A; 1HLU P; 5HAR A; 4ESP A; 3ZG0 A; 3CZD A; 3G2Z A; 3P98 A; 1SKO A; 2DNS A; 3OC2 A; 3TW8 A; 2XF3 A; 4ME4 A; 2EWW A; 4KZ8 A; 5CER A; 4B4Z A; 1J3W A; 5DFX A; 3T4O A; 4UEY A; 4UAA A; 2VGL M; 2Q0O A; 4R3J A; 5GHY A; 4U0T A; 5FI6 A; 1PYY A; 1CQA A; 2JBF A; 1Q2Q A; 3DTK A; 3IF5 A; 4R3A A; 2PU4 A; 3IXB A; 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