The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
130
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structure length |
130
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Chain Sequence |
SWQTYVDDHLLCEIEGNHLSSAAILGQDGSVWAQSSNFPQFKPEEITAIMNDFAEPGSLAPTGLYLGGTKYMVIQGEPGTVIRGKKGPGGVTIKKTNQALIIGIYDEPMTPGQCNMIVEKLGDYLIDTGL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
|
| molecule keywords |
Profilin
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| publication title |
Crystal Structure of Peanut ( Arachis hypogaea ) Allergen Ara h 5.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Arachis hypogaea
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| total genus |
39
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| structure length |
130
|
| sequence length |
130
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-04-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5FEG A; 1PRQ A; 3LGO A; 3LEQ A; 3U4L P; 3NEC A; 2ZL1 A; 3MSH A; 5EVE A; 4QWO A; 3T1Q B; 1SZV A; 5EM0 A; 2PBD P; 2V8F A; 2ZL1 B; 1D1J A; 1SKO A; 1CQA A; 1J3W A; 3UB5 P; 4FTX A; 1SKO B; 1VEU B; 3T1S A; 1PFL A; 2V8C A; 2VK3 A; 1FIL A; 3T1R A; 1A0K A; 1CF0 A; 1G5U A; 2PAV P; 2BTF P; 3MS6 A; 3T12 B; 1VET A; 2B95 A; 1PNE A; 3DAV A; 1VET B; 5EV0 A; 4ESP A; 4X25 A; 5EM1 A; 4D60 A; 1Z09 A; 2PRF A; 3KYE A; 2JKG A; 5FEF A; 1HLU P; 1ACF A; 3NUL A; 5FDS A; 3CPT A; 4X1L A; 1FIK A; 1K0K A; 2E8J A; 3CPT B; 1F2K A; 2ACG A; 1Y4O A; 3T1X A; 1CJF A; 3L7H A; 3D9Y A; 3L9K A; 4X1M A; 1AWI A; 1VEU A; 2HZ5 A; 4FUW A; 2JKF A; 1YPR A; 3CHW P; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ES4 A; 2QYB A; 1ERQ A; 3B42 A; 2WZX A; 3MZD A; 4JPM A; 1KGF A; 1LL9 A; 2OWJ A; 1AXB A; 3N8S A; 4JXS A; 3DTM A; 4NET A; 2K31 A; 4HI4 A; 1LHY A; 3H82 A; 4KQO A; 1DJA A; 1MPL A; 2P9V B; 4E3I A; 2ZD8 A; 1BLC A; 1PWC A; 3G2Z A; 4KZ9 A; 2V0W A; 5DF8 A; 1LL5 A; 3UMD A; 5FDH A; 3MQ0 A; 3W2Z A; 3M2J A; 3DTK A; 2J3T C; 3I7J A; 1YKD A; 3QP4 A; 3UE1 A; 4G3K A; 4UA7 A; 5L8M A; 1OTI A; 4K0X A; 3ITB A; 5JYP A; 2X71 A; 4LV1 A; 5FI2 A; 1NRF A; 2W3G A; 3DAV A; 1VET B; 2J7V A; 3C5A A; 2HDR A; 3VP2 A; 4JGR A; 3A3J A; 2EX9 A; 1GSW A; 2H10 A; 3K3D A; 3NOU C; 3ISG A; 4OKP A; 4KZ7 A; 4S2N C; 4JKT A; 4HHD A; 2G2W A; 4BL3 A; 2DNS A; 5AQ9 A; 4Q0I A; 5CTN A; 1IFQ A; 1XA7 A; 2INW A; 3DBA A; 3PYP A; 3TSG A; 4M3K A; 2CC1 A; 4EER A; 3OCN A; 4BBV A; 4BD1 A; 1WYB A; 1HZO A; 5JYO A; 2VLG A; 1P9W A; 1WA9 A; 3Q81 A; 4G3W A; 1KGG A; 2VKS A; 3LI8 A; 4I3I A; 5DTS A; 3DW0 A; 2P04 A; 2GX5 A; 3HLG A; 4U0X A; 3GV9 A; 5TFQ A; 1BLH A; 4UA6 A; 1NZO A; 1DRM A; 1FSW A; 4X68 A; 1F5M A; 4BBT A; 2MJ6 A; 2FZ0 A; 2P9V A; 1GA0 A; 1SZV A; 4LRY C; 2Y2M A; 4EEU A; 2EWW A; 3VE4 A; 3N8R A; 1CQA A; 3NOT C; 5E2H A; 1G28 A; 2A24 B; 3WS1 A; 2Y59 A; 4MBF A; 3ZNY A; 2GJ3 A; 5DFX A; 1JWZ A; 4X55 A; 1N9L A; 4Z1W A; 3NOP C; 4MN5 A; 4P6Z M; 1VET A; 2XD5 A; 4EV4 A; 5HAI A; 2B95 A; 4GOG A; 1T19 A; 1K54 A; 5HD3 A; 4HES A; 4LV2 A; 1DJB A; 3SS5 A; 4ESP A; 5GHY A; 4S2I A; 2JKG A; 3NDG A; 3LFV A; 4NG2 A; 2AVX A; 2JC7 A; 4MLL A; 3NI9 A; 3D72 A; 2PU2 A; 2NUT C; 2OSU A; 1L3L A; 4BEN A; 1JTG A; 2YKF A; 4PAU A; 1GHM A; 1IEM A; 3MQO A; 4OH0 A; 2QJ7 A; 3UB7 A; 4XT2 B; 4Y5F A; 4WZ4 A; 5DTK A; 3IS2 B; 5DJT A; 1YLT A; 2HJ9 C; 2KOI A; 4H8R A; 4OLG A; 1OTA A; 4PKY A; 2HZ5 A; 2WAF A; 4IUH A; 3KO6 A; 4IHQ A; 2QWS A; 3BQA A; 3TOI A; 3A3E A; 3KX0 X; 1P0Z A; 3OPH A; 5F68 A; 3BFG A; 2DCF A; 3IWO A; 3QHY A; 4KZ3 A; 2A24 A; 4Y17 A; 2Z2M B; 5EM0 A; 1GSV A; 2L1M A; 4Y2F A; 1JWV A; 4WEL A; 1RGZ A; 5FI6 A; 4CQH A; 5HD5 A; 3FYZ A; 3T1S A; 5AQB A; 2VV7 A; 4DMZ A; 4R23 A; 4BD0 A; 1OJ5 A; 4Q0J A; 2B18 A; 5E43 A; 4BL2 A; 2LB9 A; 3BFE A; 4OQG A; 4MMN A; 5EEC A; 3N4I A; 3FWL A; 3MF0 A; 1K38 A; 2Y79 A; 1MBL A; 4C6Y A; 1YSQ A; 2E8I A; 4HNB A; 5LBR A; 4D60 A; 4QU3 A; 3DTI A; 1PI5 A; 2W3E A; 3ZDJ A; 4PM5 A; 4ARZ B; 4PKY G; 3TRC A; 1LT0 A; 2V1B A; 2EXA A; 4XT2 A; 2XQZ A; 3V50 A; 5KMW A; 2WKE A; 3PHY A; 3T4K A; 4R3B A; 3BY8 A; 1CJF A; 3IHB A; 5CRF A; 3M6B A; 1EWZ A; 1DP8 A; 5GLD A; 3E0Y A; 1SCW A; 4N1X A; 3K2N A; 5HWW A; 4UEY A; 3O86 A; 5A92 A; 4X56 A; 2UWX A; 3BFD A; 3GDI A; 1LL8 A; 1FOF A; 3IF5 A; 3OOV A; 3IF6 A; 3A3F A; 5GLC A; 3B47 A; 4U3T A; 4MEZ A; 4S2N A; 2Y2G A; 1K6R A; 2PYR A; 3ZVW A; 1L0E A; 5F82 A; 4O7D A; 2PBD P; 1PW8 A; 4YFM A; 3P7N A; 2XH9 A; 5CER A; 2XDM A; 1T1A A; 4OPR A; 3LYX A; 2DRW A; 2LB5 A; 2V8C A; 2PT7 A; 4HY8 A; 3P01 A; 1RP5 A; 1YLY A; 1D06 A; 1CI8 A; 1L0F A; 3UDX A; 1ONH A; 4KG5 A; 1ONG A; 1YMS A; 2OAP 1; 3FKV A; 1YT4 A; 4QJG A; 3LR5 A; 1UWP X; 1T1B A; 1YLP A; 4EET B; 3Q1F A; 1ZKJ A; 3NDE A; 4P6B A; 2ZQ9 A; 2IWB A; 3VOL A; 4U0T A; 2WKP A; 2M1C A; 5EVI D; 3E4O A; 4KQR A; 4P0M A; 3F1O B; 3H7W B; 4S2M A; 4ARZ A; 3RJU A; 1TDL A; 2A2L A; 1N9B A; 2HV1 A; 3IX3 A; 1LSX A; 4JF6 A; 3BRM A; 1NLZ A; 3KYQ A; 2CMN A; 3MR0 A; 3WS2 A; 4S2J A; 5CGW A; 2P7J A; 3P09 A; 4FD8 A; 5FQQ A; 3OBF A; 5G4Z A; 2UV0 E; 1RCJ A; 2W3F A; 2VGJ A; 5FI7 A; 1OTD A; 3UPN A; 2JKT M; 1AWI A; 4HJ6 A; 2KDK A; 5HAQ A; 3UE0 A; 3HUN A; 5EOO A; 4FCF A; 4WL9 A; 3ZG7 B; 2FH5 A; 1HD8 A; 2XA7 M; 3HRE A; 1XFQ A; 3V67 A; 3OC2 A; 1BUE A; 1XKZ A; 3BEB A; 5CEB A; 2K7S A; 2OAQ 1; 3LID A; 5HZH A; 5AQA A; 5A90 A; 3BFC A; 3CMZ A; 3W8K A; 5F6A A; 4OOL A; 1XA1 A; 4N9L A; 4GDN A; 4ZBE A; 1BYW A; 4WMC D; 2WKR A; 1K54 C; 3CUE A; 1ES2 A; 4Z9Q A; 3HLB A; 3SS4 A; 2I72 A; 4GW9 A; 4HOI A; 5I94 A; 4BMW A; 3F1O A; 3H7W A; 5EPH A; 1GHI A; 1XFN A; 4BLM A; 4PMA A; 1K57 A; 4R0Q A; 3NHQ A; 1YLW A; 3S1Y A; 2PRF A; 2IA2 A; 4KZ8 A; 3RH8 B; 5FQJ A; 5HPF A; 4KQQ A; 4X1L A; 5G4Y A; 3BEC A; 1STZ A; 2XF3 A; 3C8C A; 2XGN A; 4Y0O A; 3OPP A; 2Z6D A; 2C6W B; 1IYO A; 3VP3 A; 4LCM A; 1IKI A; 4QY6 A; 1CEF A; 3CIT A; 3S7P A; 4I5S A; 4MBK A; 3KSH A; 1XX2 A; 4MBH A; 3VFF A; 2V2F F; 3BQ8 A; 3MBZ A; 4WN5 A; 1PZO A; 2JE5 A; 3Q82 A; 2G2U A; 5HAP A; 2VV6 A; 5HFO A; 4NEE D; 4DJ2 A; 4N92 A; 2ZBB A; 4KG2 A; 1GSX A; 3LIC A; 3WRZ A; 1BLP A; 5TR7 A; 3U2A A; 4LPZ A; 4GD6 A; 3NEC A; 1JVJ A; 4MDZ A; 3VMA A; 4CPK A; 1OT6 A; 3F1N B; 4DF6 A; 2ZL1 B; 2A3U A; 4HBU A; 2ZMV A; 2BLS A; 4R70 A; 3G6O A; 2JKR I; 4C75 A; 4F3L B; 2JN7 A; 3A3I A; 2W3H A; 1OME A; 3LEZ A; 2WUQ A; 2Y2L A; 4EBL A; 2IWD A; 4LRZ E; 4PM9 A; 3HLC A; 1G5U A; 3LR0 A; 4JF5 A; 5FAO A; 5G18 A; 2VZW A; 2K2N A; 3O88 A; 4BWI A; 5L10 A; 3LY3 A; 3EEH A; 4R4R A; 1H8Y A; 2A49 A; 1KDW A; 3QP6 A; 5IHV A; 3MZE A; 3QP8 A; 3HJK A; 1IYQ A; 2ZC3 B; 1HLU P; 3KYZ A; 3JYI A; 3W4O A; 5A8B A; 2JKR M; 3C30 A; 2I9V A; 5TJJ A; 5CGX A; 2VGL S; 3C4O A; 1NYY A; 3T4O A; 3OPR A; 4DDS A; 4DE3 A; 2ZQ7 A; 3N7W A; 3GMW A; 2W0N A; 4XUZ A; 2WKH A; 3WS0 A; 1FR6 A; 1ESU A; 4E3L A; 1NLY A; 3SH8 A; 2QHK A; 3EGX C; 3IF6 C; 1H5X A; 3T4T A; 4K08 A; 3VP0 A; 3NBL A; 4HP4 A; 3HL9 A; 3KSI A; 3UN7 A; 1KGE A; 5F83 A; 5F1F A; 4Y7P A; 3IX8 A; 3F1N A; 3G32 A; 2ZL1 A; 3MSH A; 1G6O A; 3PBQ A; 1G68 A; 4GS9 B; 3AGF A; 4F3L A; 5L2F A; 1ZG4 A; 4R4S A; 3ZVT A; 4OQH A; 4IUK A; 2O99 A; 3UO9 A; 4QHC A; 3HCY A; 1FCO A; 1I2W A; 3ZG5 A; 5EUA A; 4M4X A; 4ZDX A; 3T50 A; 3E2K A; 2B5R A; 2Q9N A; 3IH9 A; 2O9B A; 4YIN A; 5AVE A; 1BUL A; 1MWT A; 4RYE A; 3T12 B; 4S2K A; 1LSW A; 4PM6 A; 3BWL A; 1ESI A; 2L4R A; 2M7U A; 4GNU A; 4E3J A; 3HUO A; 3SS3 A; 1VB6 A; 3KYE A; 1V9Z A; 2HP6 A; 4KZA A; 2XSS A; 1QME A; 4DRT A; 1BLS A; 5CHJ A; 4MNR A; 4OPQ A; 2VV8 A; 3QP5 A; 1W8Y A; 1U60 A; 5HWV A; 1SDN A; 3UE3 A; 3IXD A; 3IXH A; 5FAS A; 4HH2 A; 3SOI A; 2OWH A; 2Y8H A; 4DE0 A; 2Y2O A; 1FCM A; 4HJ3 A; 1XJ2 A; 5J3W A; 4ZAM A; 2ZC7 A; 4OPY A; 4IVK A; 3C7V A; 1PWD A; 3LGO A; 4GS9 A; 4II7 A; 4RX3 A; 3ZG8 B; 3M2K A; 2XFT A; 3T1Q B; 2BG1 A; 3UME A; 3LIF A; 1MWS A; 2ZC6 B; 1H3Q A; 3NIA A; 2FFY A; 2ZM8 A; 3HLF A; 2XK1 A; 2R9X A; 1KVL A; 3CLO A; 3R4K A; 5CHU A; 3FZC A; 1FIL A; 3CUE C; 1ES3 A; 3LR3 A; 3PBR A; 3UY6 A; 3DWK A; 3IF6 B; 1FCN A; 4CLC B; 1K57 C; 1PNE A; 1LI0 A; 2PR5 A; 1KOU A; 3WS5 A; 1VHM A; 3SZT A; 3TE8 A; 1GA9 A; 1E25 A; 2ZLY A; 4O0P A; 3PBN A; 2VA0 A; 3GSG A; 4HH3 A; 2ZM2 A; 2PDR A; 3LIB A; 1PYY A; 2NUP C; 4C3Q A; 3BY9 A; 2E8J A; 1K4E A; 2VJW A; 1MKM A; 3V39 A; 4OQ0 A; 5FQM A; 4WF0 A; 4CLC D; 5FSR A; 3UB9 A; 4UHU A; 1XJ4 A; 5GHX A; 1KE0 A; 4GKU A; 3G30 A; 1VEU A; 4JGO A; 5FAT A; 4KZ4 A; 4PPR A; 2J3W A; 3JVV A; 3RXX A; 3CHW P; 4KQD A; 3OZH A; 4JF4 A; 5AJG A; 2J9P A; 2OLV A; 2C5W B; 4RA7 A; 3JPU A; 4XUX A; 3UPO A; 4Q8I A; 3BLM A; 3IXB A; 4EBP A; 1BTL A; 3DWZ A; 3IQA A; 1NWZ A; 2QJ5 A; 2OOL A; 3MQQ A; 4JXV A; 1PI4 A; 4GLQ A; 3UB5 P; 3KSF A; 2V9A A; 4MCW A; 4LV0 A; 3CG5 A; 3RXW A; 2X02 A; 4NKP A; 1JWP A; 1D7E A; 4CLC A; 2XD1 A; 2BTF P; 2WK0 A; 3Q7V B; 5EVI B; 5HL6 A; 4JGQ A; 3MKF A; 4P85 A; 3MFX A; 4ETX A; 2XA7 S; 5E2F A; 5EFW A; 4S2P A; 2ZQA A; 4D2O A; 4JGP A; 3VV4 A; 3WWX A; 3OPL A; 3SH9 A; 1FSY A; 4EWF A; 5HW3 A; 3MKE A; 4HJ4 A; 3BYD A; 4LRX C; 2HJE A; 2HGV A; 5IS1 A; 2WGI A; 4HP9 A; 2JKT I; 3FG8 A; 1ES5 A; 1LI9 A; 2XLN A; 2ZMA A; 3IHA A; 1O7E A; 3D9Y A; 3PXP A; 5HPI A; 3EEA A; 1PZP A; 1OTB A; 4QD4 A; 2GDN A; 3SH7 A; 2M7V A; 5FQI A; 4DE2 A; 1YPR A; 5FEG A; 1UWN X; 2PR6 A; 1OTE A; 3U4L P; 2KLI A; 1L0G A; 1TS0 A; 5L07 A; 2Y2K A; 3MFD A; 4FSF A; 3VSL A; 1MY8 A; 3HVF A; 4UQI S; 5FA7 A; 2XFS A; 4LCL A; 5HDC A; 2ZOI A; 3G31 A; 1TS6 A; 5IT5 A; 5A91 A; 1NY0 A; 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