The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
130
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structure length |
130
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Chain Sequence |
SWQTYVDDHLLCEIEGNHLSSAAILGQDGSVWAQSSNFPQFKPEEITAIMNDFAEPGSLAPTGLYLGGTKYMVIQGEPGTVIRGKKGPGGVTIKKTNQALIIGIYDEPMTPGQCNMIVEKLGDYLIDTGL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Allergen
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| molecule keywords |
Profilin
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| publication title |
Crystal Structure of Peanut ( Arachis hypogaea ) Allergen Ara h 5.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Arachis hypogaea
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| total genus |
39
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| structure length |
130
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| sequence length |
130
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-04-23 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Beta-Lactamase | Dynein light chain 2a, cytoplasmic |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HLU P; 1VEU B; 5EM1 A; 1D1J A; 1VET B; 5EVE A; 3T12 B; 4X1M A; 3CHW P; 3MS6 A; 4D60 A; 1A0K A; 3D9Y A; 4ESP A; 3CPT B; 1CF0 A; 1ACF A; 3NUL A; 1VEU A; 1CQA A; 1VET A; 1F2K A; 3T1Q B; 3KYE A; 1SZV A; 2ACG A; 4X1L A; 3U4L P; 3CPT A; 2BTF P; 3DAV A; 3LEQ A; 1FIK A; 1K0K A; 1Z09 A; 2V8F A; 3MSH A; 5FDS A; 3NEC A; 5FEF A; 1SKO B; 3T1X A; 1PFL A; 2B95 A; 2E8J A; 1YPR A; 2ZL1 A; 4FTX A; 2V8C A; 4X25 A; 1Y4O A; 1SKO A; 4FUW A; 5EV0 A; 2HZ5 A; 1AWI A; 2PRF A; 3L7H A; 3L9K A; 2ZL1 B; 4QWO A; 1CJF A; 5EM0 A; 1PNE A; 2PBD P; 1PRQ A; 3UB5 P; 1G5U A; 3LGO A; 1J3W A; 2PAV P; 2JKG A; 2JKF A; 5FEG A; 3T1S A; 3T1R A; 1FIL A; 2VK3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GSX A; 4I3J A; 3D72 A; 1H8M A; 2EWW A; 3B47 A; 4CQH A; 3FZC A; 1OTI A; 5F1G A; 2P08 A; 3P7N A; 5G4Z A; 5L09 A; 2ZJ9 A; 1OTA A; 2M7U A; 3AGD A; 4MLL A; 5EPH A; 3CPT A; 3M6B A; 1S67 L; 1YT4 A; 1TS0 A; 2JCH A; 3R4K A; 1N4O A; 5L2F A; 3IBJ A; 3OLO A; 5GLA A; 2XD1 A; 1KE0 A; 1MWU A; 3MXR A; 4GHI A; 4PM9 A; 3UPP A; 4KZ8 A; 1HTZ A; 1K6S A; 2V8F A; 3LI8 A; 1XA1 A; 3IS2 A; 4RVA A; 4EV4 A; 3PHY A; 2Y2M A; 2PR5 A; 4GB7 A; 5GLB A; 2E8J A; 3GQZ A; 2XEP A; 3WRZ A; 4PM7 A; 4NXF A; 1JTD A; 4FSF A; 5L07 A; 5HZH A; 4BMW A; 1CEG A; 5GHX A; 3MFX A; 4LFU A; 2Y8H A; 5E2G A; 3U2A A; 1DP6 A; 2YKH A; 4ZBE A; 1Y28 A; 4RX3 A; 3EEA A; 2VV8 A; 4FD8 A; 3VOY A; 3VSL A; 4HY8 A; 4JKT A; 3LI9 A; 3RTY A; 2KDK A; 2O9A A; 2W0N A; 4L9G A; 4HHD A; 5EVI A; 4BJP A; 1HVB A; 3B42 A; 4DE3 A; 3I7J A; 1IYP A; 2OSU A; 5CEC A; 2XA7 M; 3G6O A; 1VET B; 3S22 A; 1G68 A; 2RCX A; 3N4I A; 2PYP A; 4EBL A; 3IF6 B; 2HDU A; 5HX9 A; 3LR4 A; 1W8Y A; 3WWX A; 4OPZ A; 4HBT A; 1OTE A; 4E3N A; 2Y59 A; 2JKT M; 2ZMA A; 1S6R A; 1E4D A; 4LCL A; 4JPM A; 3ITB A; 5JYP A; 4BL3 A; 4S2M A; 4QPR A; 2J8Y A; 5GLD A; 3UO9 A; 2J3T D; 4KQD A; 5GHZ A; 3PBT A; 4MN6 A; 3N7W A; 3EGD C; 1GA9 A; 2H0T A; 5BOH A; 3BWL A; 1GA0 A; 2ZQC A; 1MXO A; 2AVX A; 2HDQ A; 3Q7V A; 2J7V A; 3MR0 A; 1ONG A; 2P04 A; 3ZHH A; 1S4R A; 4X55 A; 1PI4 A; 4OVD A; 1ZHH B; 2MJ6 A; 3ZVW A; 2W1T B; 2GDN A; 3ZG7 B; 4DN0 A; 3C7V A; 5FQM A; 5DFY A; 1ESU A; 1K55 C; 1YM1 A; 2W3G A; 4XUX A; 4C75 A; 2WKR A; 5M18 A; 1H8Z A; 3NDE A; 3HLD A; 2VGJ A; 4LV0 A; 2Q9N A; 1WA9 A; 2Y2K A; 2IWD A; 3WS4 A; 3WRT A; 3MMH A; 3E0Y A; 4HH2 A; 1M6K A; 1S1Y A; 3LYX A; 3WS2 A; 1TS8 A; 3HLF A; 1G6O A; 3NDG A; 1GSV A; 4IHQ A; 1YSP A; 4R3J A; 1H5X A; 2PHY A; 4Y0T A; 4DXB A; 2ZM2 A; 5EVE A; 3CHW P; 3PBO A; 1MC0 A; 3B3X A; 4Y2F A; 1K4E A; 5FAP A; 3NUL A; 5TGF A; 1XJ3 A; 4RA7 A; 1IEM A; 2VX8 A; 2L0W A; 1ALQ A; 4GS9 B; 3NJA A; 4O0P A; 4WZ5 A; 2ZOI A; 4KG5 A; 1KGG A; 2M7V A; 4R0Q A; 2A24 B; 1U60 A; 2LB5 A; 1OPX A; 5DKL A; 4WM9 A; 2ZC7 A; 3E4P A; 3FG8 A; 1GHI A; 4R1G A; 5HWT A; 2V2F F; 3UME A; 1YMX A; 2JKT I; 1H8Y A; 5AVF A; 4I5S A; 4JF6 A; 4LGW A; 2Y79 A; 3MF0 A; 3LUQ A; 1T19 A; 4R6L A; 2Y2G A; 3ICY A; 2NUT C; 2W3H A; 2JC7 A; 3DTK A; 4UA6 A; 4UQI S; 4H6J A; 1I2W A; 1X0O A; 1VM1 A; 3UE1 A; 2GNX A; 2ZMV A; 4HOI A; 4Y0O A; 1S1Z A; 1V9Y A; 2ZL1 B; 2L1M A; 3LIB A; 3DWK A; 5E2E A; 4Y5F A; 3Q07 A; 3SZT A; 2IA2 A; 5FAQ A; 2G2W A; 4I3A A; 3G35 A; 4DE1 A; 3UN7 A; 4I38 A; 1W79 A; 2D01 A; 4KZA A; 1J3W A; 2Y2H A; 2ZC5 B; 1LSV A; 4MBF A; 4EBP A; 2XSS A; 3Q81 A; 4B4Z A; 5CHU A; 3T1R A; 4JF4 A; 4CLC C; 4X1M A; 1XXM A; 3MS6 A; 3OBF A; 2A2L A; 4DMZ A; 4KQO A; 3H7W A; 3O87 A; 4UA9 A; 1BLS A; 1EI5 A; 2QPN A; 4X53 A; 1I2S A; 2JKR M; 3KYE A; 2ACG A; 5L10 A; 3E2K A; 4HH3 A; 3UB9 A; 4OP5 A; 3G30 A; 1PWC A; 1OME A; 4MN7 A; 3H82 A; 4EWF A; 5LBR A; 2JHE A; 2WUQ A; 3RXX A; 3PBQ A; 1I5Q A; 4UHU A; 4IED A; 4JBF A; 2Y2L A; 2B95 A; 4R3B A; 1WYC A; 1YPR A; 5HD5 A; 2GX5 A; 2XR0 A; 3ZCZ A; 3VE4 A; 3QHY A; 4FUW A; 2V20 A; 1YLW A; 5EV0 A; 1O7E A; 3MKF A; 1XX2 A; 4HP4 A; 4R3A A; 2X01 A; 1YLJ A; 1G6A A; 5EM0 A; 1W8Q A; 3IBR A; 4E3K A; 4Q0H A; 2PBD P; 4IUH A; 5TR7 A; 1PZP A; 3DWZ A; 3BQA A; 2OV5 A; 1FOF A; 5TBM B; 1N9O A; 4XXR A; 2QMI A; 1Q2P A; 3EWK A; 2O9C A; 1NZU A; 4PHT A; 3TRC A; 4H8R A; 2ZQ7 A; 1MWS A; 4G3V A; 4BEN A; 5DVA A; 1F5M A; 1RP5 A; 2HDS A; 1JWZ A; 3BQ8 A; 2VV6 A; 2Y2O A; 2Y2N A; 1DP9 A; 1WYB A; 2I72 A; 3VP2 A; 1IOU A; 3DTE A; 5HFO A; 4ZRR A; 1LHY A; 3BEB A; 2ZOH A; 3A0V A; 2J3W A; 4EES A; 1K4F A; 3WS0 A; 2EX6 A; 3DAV A; 2Z6C A; 3NHQ A; 1STZ A; 5EFW A; 2EFX A; 4NK3 A; 3NC8 A; 1H3Q A; 4JGP A; 3MSH A; 1YSQ A; 2JKR I; 2KOI A; 3RJU A; 4LPZ A; 3C7U A; 4I39 A; 2ZBB A; 4IJG A; 5HWV A; 4MEZ A; 4OOY A; 1DJB A; 1JNU A; 4U0X A; 1D06 A; 3SOI A; 4MCW A; 4DKI A; 3BJN A; 2P74 A; 2R78 A; 4CLC E; 3VP1 A; 3PAE A; 5DF7 A; 1XGJ A; 1ZKJ A; 1MKI A; 2V1Z A; 3LR5 A; 3VE3 A; 4OQ0 A; 4U0T A; 5DTK A; 3A3D A; 2VGK A; 2PYR A; 4JXS A; 3P98 A; 3HCY A; 3KX0 X; 5IHV A; 4F94 A; 4OPY A; 2QYB A; 3BY8 A; 3M2K A; 1N9N A; 1Y54 A; 3UE3 A; 4S2O A; 3UB5 P; 3VV4 A; 5I94 A; 1XP4 A; 5AQ9 A; 4UEY A; 4HP9 A; 3IXD A; 3PBN A; 4HQA A; 4WBG A; 1ES4 A; 1LSX A; 4B4X A; 5CTN A; 5FQK A; 5EM1 A; 1D1J A; 4D60 A; 3T4J A; 3TE8 A; 3IQA A; 5DF9 A; 3HUM A; 1L3L A; 5EOE A; 1S4S A; 3V5M A; 4MNR A; 2XD5 A; 3CG5 A; 3GEC A; 4ARZ B; 1LI0 A; 4XT2 B; 4WYY A; 4WZ4 A; 1IYQ A; 4ZJ2 A; 3MJQ A; 2UWX A; 2QJ5 A; 4OP8 A; 2EXA A; 3E2L A; 4N1X A; 1K38 A; 1W63 M; 3FWL A; 3GMW A; 1BUL A; 5A92 A; 3OCL A; 2WGW A; 3VP0 A; 4E6X A; 1T18 A; 2Y2J A; 1YAX A; 2VGL S; 3OPP A; 1T1C A; 3VFF A; 5CGX A; 2P9V A; 1SKO B; 3E4O A; 5KZH A; 3KSG A; 2FFF B; 3NY4 A; 3TJZ C; 4G3W A; 3LY3 A; 5EOO A; 4FTX A; 4KZB A; 4NG2 A; 2DNS A; 1CI8 A; 3E4Q A; 4L0L A; 1AWI A; 4CLC B; 4B93 A; 4UQI M; 4ETZ A; 3S1Y A; 3GSG A; 4Q8I A; 3FV7 A; 1NLY A; 2ZMF A; 2W3E A; 1ZG4 A; 5HAP A; 2UV0 E; 3LIC A; 3MXQ A; 3TW8 A; 3CWF A; 1SDE A; 3B33 A; 4D2O A; 5EUA A; 4DE2 A; 2PU4 A; 5E2F A; 3T4O A; 4CLC D; 2ZC6 B; 4S2N C; 3QP8 A; 2V0W A; 1PRQ A; 2Q0O A; 3VP4 A; 1H0M A; 4Y7P A; 3CUE C; 1FCO A; 4IBX A; 3SH9 A; 5FA7 A; 2M1C A; 5DF8 A; 3G2Z A; 2K31 A; 2HGV A; 3F1P A; 3LEZ A; 1VB6 A; 3VSK A; 3RH8 B; 3QP6 A; 3DTM A; 5CHM A; 2Z2M B; 3CPT B; 3RFB A; 1CF0 A; 2R9W A; 5HD3 A; 1ES5 A; 4CPK A; 4NEE D; 3QP4 A; 4X1L A; 3W2Z A; 4KUK A; 4GHI B; 2BTF P; 3N8R A; 2J9O A; 3CIT A; 5DFX A; 3LIF A; 5FQ9 A; 3IS2 B; 5I5L A; 4E3L A; 4EER A; 4DJ2 A; 5EE8 A; 4WMC D; 1NWZ A; 4K0W A; 4HIA A; 1J9M A; 4IVK A; 4KZ4 A; 4R4S A; 3UDF A; 4WUJ A; 3IX3 A; 4BBU A; 3BLS A; 1L0G A; 3GR2 A; 4HES A; 1FSY A; 1K56 D; 2WKQ A; 2OWJ A; 4LRZ E; 1MKM A; 4MMN A; 3F1N A; 5HAR A; 2PRF A; 3HVF A; 3HL9 A; 5C5K A; 1C3B A; 3HLB A; 1TD5 A; 3C4P A; 4MBH A; 3PBS A; 5JYO A; 2HJE A; 2WGI A; 3WS1 A; 4ID4 A; 3NBL A; 4UA7 A; 4M3K A; 3LCE A; 3OPR A; 3UNW A; 2OOL A; 4BBT A; 5CGS A; 4E3I A; 2PT7 A; 3BFC A; 1ERQ A; 3MQQ A; 3JVV A; 1YMS A; 3T4Q A; 4JXG A; 1A0K A; 3D9Y A; 3N8L A; 1DJA A; 1PW1 A; 3F1O A; 4C3Q A; 1VEU A; 2Y55 A; 3JPU A; 3T1Q B; 2A24 A; 4R4R A; 2QZ6 A; 1YQS A; 5HDS A; 4S2I A; 3V3R A; 5HPI A; 4LV1 A; 1ES3 A; 4EXO A; 3A3I A; 3LIA A; 4JF5 A; 1TEM A; 1QMF A; 1E25 A; 4ETX A; 1SKF A; 3KSH A; 3UDI A; 4CJN A; 3Q7V B; 4K08 A; 3KYZ A; 3ZNT A; 5J4E A; 4EW7 A; 5DKK A; 2EA9 A; 2OAP 1; 3D3O A; 5FDS A; 4S2L A; 2B18 A; 5EEC A; 5HAI A; 4LLO B; 5IT5 A; 1V9Z A; 4JGR A; 2ZL1 A; 3G31 A; 4GN2 A; 2V8C A; 4QB8 A; 2Y2I A; 3V39 A; 3GDI A; 1Z6F A; 1MPL A; 5A91 A; 1NLZ A; 1KGF A; 2WKI A; 3SS5 A; 1BSG A; 4ME4 A; 4GD8 A; 4WLA A; 1IKG A; 4OQI A; 4K91 A; 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3ZG0 A; 2L4R A; 1RGY A; 2Q9M A; 3A3F A; 1SZV A; 1BT5 A; 4KUO A; 1OTD A; 2XDM A; 2J3T C; 2E8I A; 3HLC A; 4KZ3 A; 3K3C A; 2GJ3 A; 3FPV A; 3ZQ5 A; 5KMW A; 3NIA A; 3W4Q A; 4GCZ A; 4EUZ A; 1TDG A; 4DRT A; 4X69 A; 1OJ5 A; 1XJ2 A; 3BLM A; 4JLF A; 1VHM A; 2HP9 A; 5EVI C; 4QU3 A; 3SH8 A; 1PFL A; 3W8K A; 1OJG A; 4X25 A; 3HUO A; 4YFM A; 2QHK A; 1PIO A; 4S2K A; 3G4P A; 2HPB A; 1N9B A; 3MZF A; 4I3I A; 4QY5 A; 4OQG A; 4X56 A; 4II7 A; 1FR6 A; 4HI4 A; 4JXV A; 5HDC A; 2DCF A; 4P85 A; 3MZD A; 1VQQ A; 5F5Y A; 3M6H A; 1G5U A; 4RQ9 A; 1EWZ A; 2YKF A; 2W3D A; 3MBZ A; 3ZG9 B; 3BFF A; 3K2N A; 2HF6 A; 1FIL A; 2QWS A; 1SDN A; 4NKP A; 2Y91 A; 2PU2 A; 3CMZ A; 1GSW A; 2A3U A; 2FZ0 A; 3ZNY A; 4X68 A; 3LID A; 3ZVT A; 2JN7 A; 5G18 A; 2K2N A; 4WL9 A; 5AVE A; 2PR6 A; 1L0E A; 1CQA A; 3Q1F A; 1XJ4 A; 3MFD A; 5CER A; 4GW9 A; 3U4L P; 1K57 A; 1JWV A; 4JGQ A; 4Z1W A; 3UB8 A; 2ZQD A; 3O3V A; 3T4T A; 2WK0 A; 1FIK A; 1K0K A; 3MKE A; 2H5S A; 1FR1 A; 1DRM A; 3HLW A; 3DBA A; 1NY0 A; 3NEC A; 3UE0 A; 1ONH A; 5A93 A; 4CLC A; 1E3U D; 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