1DMKA

Bovine endothelial nitric oxide synthase heme domain complexed with 4-amino-6-phenyl-tetrahydropteridine
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
416
structure length
416
Chain Sequence
GPKFPRVKNWELGSITYDTLCAQSQQDGPCTPRRCLGSLVLPRKLQTRPSPGPPPAEQLLSQARDFINQYYSSIKRSGSQAHEERLQEVEAEVASTGTYHLRESELVFGAKQAWRNAPRCVGRIQWGKLQVFDARDCSSAQEMFTYICNHIKYATNRGNLRSAITVFPQRAPGRGDFRIWNSQLVRYAGYRQQDGSVRGDPANVEITELCIQHGWTPGNGRFDVLPLLLQAPDEAPELFVLPPELVLEVPLEHPTLEWFAALGLRWYALPAVSNMLLEIGGLEFSAAPFSGWYMSTEIGTRNLCDPHRYNILEDVAVCMDLDTRTTSSLWKDKAAVEINLAVLHSFQLAKVTIVDHHAATVSFMKHLDNEQKARGGCPADWAWIVPPISGSLTPVFHQEMVNYILSPAFRYQPDPW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for pterin antagonism in nitric-oxide synthase. Development of novel 4-oxo-pteridine antagonists of (6R)-5,6,7,8-tetrahydrobiopterin
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bos taurus
total genus 133
structure length 416
sequence length 416
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH).
pdb deposition date 1999-12-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 1dmkA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 1dmkA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 1dmkA03
4LUWA 3N5TA 4IMXA 3NSEA 4KCLA 4FVZA 2NSIA 3N5XA 5FVQA 3TYLA 4UG5A 1M9KA 5G66A 4KCPA 5G6IA 5G6FA 5ADCA 3NW2A 2BHJA 3E6NA 3N66A 3EAHA 3N6BA 3RQOA 1P6NA 5FVOA 3N5RA 4KCMA 5FW0A 5G6JA 3NLUA 5AD9A 5G6BA 4KCKA 4CX1A 2AMOA 4CFTA 4CX4A 1Q2OA 1RS6A 4IMSA 3JX4A 4UH3A 4D32A 5G6NA 4CFTB 4CTRA 1P6JA 4CUNA 3JWTA 5AD4A 4V3ZA 3NLFA 4CANA 1ZVIA 4CWVA 3TYNA 3EAIA 4UH2A 5AGNA 3PNFA 1DM8A 4D3OA 7NSEA 3N6EA 1LZXA 4JSJA 4UPNA 3JX1A 5G65A 3N5SA 5ADAA 1ZZUA 1M9QA 4K5GA 3UFOA 3UFSA 4C39A 4JSEA 4D3VA 5G6AA 3N6GA 1M8EA 3NLRA 1M8HA 3JX5A 1LZZA 5G6GA 3N60A 3NLIA 4UPPA 4D3IA 3JT6A 4JSKA 3HSPA 4KCRA 4UGNA 4UGMA 1FOIA 3N5ZA 3UFRA 4UPTA 2G6NA 1M8IA 3TYMA 3NLJA 4D35A 3N2RA 4D1NA 1DD7A 3N6AA 1I83A 4LUXA 4IMUA 3RQPA 1DWWA 4JSHA 1M00A 5ADNA 1NOSA 1K2TA 4KCIA 2G6MA 4D3TA 5AD7A 3N62A 4UGLA 4UGFA 3N64A 3E7TA 4CX0A 2NODA 4CULA 1DM6A 1NSEA 1MMWA 4KCSA 1VAGA 1D0OA 4CAQA 1D1VA 3NLEA 4D30A 4IMTA 4UH9A 5G68A 5G69A 4CUMA 5ADFA 1P6LA 5AD6A 1DMIA 5ADDA 1ZZQA 2HX3A 3Q99A 4UPRA 1JWKA 2NOSA 4FVXA 8NSEA 3N5YA 3NQSA 4CARA 1M9RA 3JX0A 3NLQA 1OM5A 4FW0A 3N63A 2G6HA 5FJ3A 4V3YA 4K5FA 1M9TA 3JT4A 1DM7A 5FVPA 4CAMA 4K5JA 1M9JA 4UGXA 5G6KA 3RQMA 2ORSA 4CX7A 4NOSA 1M7VA 4D1OA 3PNHA 5ADIA 1P6MA 1QWCA 2ORPA 4UPOA 5AGMA 4C3AA 4D33A 1K2RA 4D38A 4UH8A 3NLMA 4IMWA 3N67A 3JWUA 5ADKA 5G6OA 4UGBA 4CWZA 3JX2A 4UGVA 3N6CA 5ADBA 1FOLA 1N2NA 3NLYA 1RS8A 4UH0A 3N5VA 3NLDA 1FOOA 4K5HA 2OROA 3DQTA 3NLZA 4UQSA 5ADLA 5G6QA 4UH7A 5FVVA 3RQNA 6NSEA 2G6JA 4CWXA 3E67A 1P6IA 5NSEA 1RS9A 4UGKA 4UGUA 5G6LA 3NLNA 3Q9AA 4UG6A 3NNZA 4UH1A 2FC2A 3JX3A 4V3WA 1K2SA 4UGEA 4UGWA 4KCOA 4KCQA 4UGIA 1NOCA 3N5PA 3JWYA 3RQLA 5FVUA 4LWBA 4D3AA 1DF1A 3UFUA 1ED6A 4UPQA 3PNGA 4CX3A 3NLKA 1ZZRA 4UGYA 3E6OA 3E68A 3EBFA 4KCHA 4D3UA 3EBDA 4CVGA 5FJ2A 5G6EA 4JSIA 4JSLA 4D7OA 3B3OA 3N65A 3UFWA 1DWVA 3N68A 4FVWA 3NLHA 3UFQA 3NLPA 1P6HA 2HX4A 5ADMA 4CTYA 4K5KA 4CTVA 2AN0A 4CTUA 4UH6A 5G0NA 1ZVLA 2Y37A 3TYOA 1D0CA 3E7MA 4D39A 3DQSA 5ADGA 4D3BA 3JWZA 4D2YA 5AGOA 3N6DA 1M9MA 3DQRA 4D36A 3JT5A 3NLOA 3E7SB 3NLXA 4D2ZA 4CU1B 3N61A 4CTQA 1M8DA 1MJTA 1D1XA 5AGLA 4D3JA 3E7IA 3JTAA 5AD5A 5G6MA 2AN2A 3RQKA 3JX6A 4UGTA 4D31A 3N69A 2FBZX 3NLTA 4UGAA 3N5WA 3JWWA 5G67A 4D34A 3E6LA 3B3PA 1QOMA 2FLQA 4D37A 4UPSA 2G6OA 3FC5A 4UGZA 4JSGA 4UG9A 4CAPA 4UGOA 1RS7A 9NSEA 3N6FA 4FVYA 5ADEA 4UCHA 2G6LA 3NLVA 1ZZTA 5AGPA 2G6IA 5FVTA 4CX5A 3RQJA 4JS9A 3NM0A 4D7HA 5G6CA 4K5DA 3B3NA 4CTTA 3JWVA 4UHAA 5FVYA 2ORTA 5FVZA 4UGSA 3SVPA 2NSEA 4KCNA 1QW5A 5FVXA 4D3MA 3UFTA 4D7IA 1DMKA 2FC1A 5G6DA 1K2UA 3NLWA 5FVSA 1QW6A 3E6TA 4UH4A 1JWJA 1FOJA 4CX2A 1OM4A 4KCJA 4D3KA 4K5IA 2ORQA 4UGCA 5G6HA 1QW4A 5G0PA 4JSMA 3UFVA 3E7GA 4JSFA 1ZZSA 2HX2A 3HSOA 1NODA 1P6KA 4UQRA 5AD8A 3JWXA 3NOSA 3JWSA 4LWAA 1D1YA 4UG8A 4V3VA 3JT9A 5ADJA 4UGQA 1NSIA 1ED4A 5AGKA 4D3NA 5G0OA 3HSNA 3PNEA 4NSEA 5FVRA 4D7JA 1R35A 4UGRA 1DMJA 3B3MA 1M7ZA 3JT3A 4CAOA 4CU0A 1MMVA 3E65A 3JT7A 4UH5A 3E7SA 5G6PA 4CTWA 3JT8A 4V3XA 4CU1A 1ED5A 2ORRA 4CWWA 3DWJA 4CWYA 4CDTA 3NODA 4UGHA 4UG7A 1FOPA 2G6KA 1DWXA 4GQEA 4CX6A 3SVQA 1VAFA 4UGGA 4CTXA 4UGJA 4UGPA 5FVWA 3UFPA 4D1PA 3N5QA 4UPMA 3EJ8A 4UGDA 1D1WA 4K5EA 3NNYA 4CTPA 4EUXA 4V3UA 4CTZA 3NLGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LUWA 3N5TA 4IMXA 3NSEA 4KCLA 4FVZA 2NSIA 3N5XA 5FVQA 3TYLA 4UG5A 1M9KA 5G66A 4KCPA 5G6IA 5G6FA 5ADCA 3NW2A 2BHJA 3E6NA 3N66A 3EAHA 3N6BA 3RQOA 1P6NA 5FVOA 3N5RA 4KCMA 5FW0A 5G6JA 3NLUA 5AD9A 5G6BA 4KCKA 4CX1A 2AMOA 4CFTA 4CX4A 1Q2OA 1RS6A 4IMSA 3JX4A 4UH3A 4D32A 5G6NA 4CFTB 4CTRA 1P6JA 4CUNA 3JWTA 5AD4A 4V3ZA 3NLFA 4CANA 1ZVIA 4CWVA 3TYNA 3EAIA 4UH2A 5AGNA 3PNFA 1DM8A 4D3OA 7NSEA 3N6EA 1LZXA 4JSJA 4UPNA 3JX1A 5G65A 3N5SA 5ADAA 1ZZUA 1M9QA 4K5GA 3UFOA 3UFSA 4C39A 4JSEA 4D3VA 5G6AA 3N6GA 1M8EA 3NLRA 1M8HA 3JX5A 1LZZA 5G6GA 3N60A 3NLIA 4UPPA 4D3IA 3JT6A 4JSKA 3HSPA 4KCRA 4UGNA 4UGMA 1FOIA 3N5ZA 3UFRA 4UPTA 2G6NA 1M8IA 3TYMA 3NLJA 4D35A 3N2RA 4D1NA 1DD7A 3N6AA 1I83A 4LUXA 4IMUA 3RQPA 1DWWA 4JSHA 1M00A 5ADNA 1NOSA 1K2TA 4KCIA 2G6MA 4D3TA 5AD7A 3N62A 4UGLA 4UGFA 3N64A 3E7TA 4CX0A 2NODA 4CULA 1DM6A 1NSEA 1MMWA 4KCSA 1VAGA 1D0OA 4CAQA 1D1VA 3NLEA 4D30A 4IMTA 4UH9A 5G68A 5G69A 4CUMA 5ADFA 1P6LA 5AD6A 1DMIA 5ADDA 1ZZQA 2HX3A 3Q99A 4UPRA 1JWKA 2NOSA 4FVXA 8NSEA 3N5YA 3NQSA 4CARA 1M9RA 3JX0A 3NLQA 1OM5A 4FW0A 3N63A 2G6HA 5FJ3A 4V3YA 4K5FA 1M9TA 3JT4A 1DM7A 5FVPA 4CAMA 4K5JA 1M9JA 4UGXA 5G6KA 3RQMA 2ORSA 4CX7A 4NOSA 1M7VA 4D1OA 3PNHA 5ADIA 1P6MA 1QWCA 2ORPA 4UPOA 5AGMA 4C3AA 4D33A 1K2RA 4D38A 4UH8A 3NLMA 4IMWA 3N67A 3JWUA 5ADKA 5G6OA 4UGBA 4CWZA 3JX2A 4UGVA 3N6CA 5ADBA 1FOLA 1N2NA 3NLYA 1RS8A 4UH0A 3N5VA 3NLDA 1FOOA 4K5HA 2OROA 3DQTA 3NLZA 4UQSA 5ADLA 5G6QA 4UH7A 5FVVA 3RQNA 6NSEA 2G6JA 4CWXA 3E67A 1P6IA 5NSEA 1RS9A 4UGKA 4UGUA 5G6LA 3NLNA 3Q9AA 4UG6A 3NNZA 4UH1A 2FC2A 3JX3A 4V3WA 1K2SA 4UGEA 4UGWA 4KCOA 4KCQA 4UGIA 1NOCA 3N5PA 3JWYA 3RQLA 5FVUA 4LWBA 4D3AA 1DF1A 3UFUA 1ED6A 4UPQA 3PNGA 4CX3A 3NLKA 1ZZRA 4UGYA 3E6OA 3E68A 3EBFA 4KCHA 4D3UA 3EBDA 4CVGA 5FJ2A 5G6EA 4JSIA 4JSLA 4D7OA 3B3OA 3N65A 3UFWA 1DWVA 3N68A 4FVWA 3NLHA 3UFQA 3NLPA 1P6HA 2HX4A 5ADMA 4CTYA 4K5KA 4CTVA 2AN0A 4CTUA 4UH6A 5G0NA 1ZVLA 2Y37A 3TYOA 1D0CA 3E7MA 4D39A 3DQSA 5ADGA 4D3BA 3JWZA 4D2YA 5AGOA 3N6DA 1M9MA 3DQRA 4D36A 3JT5A 3NLOA 3E7SB 3NLXA 4D2ZA 4CU1B 3N61A 4CTQA 1M8DA 1MJTA 1D1XA 5AGLA 4D3JA 3E7IA 3JTAA 5AD5A 5G6MA 2AN2A 3RQKA 3JX6A 4UGTA 4D31A 3N69A 2FBZX 3NLTA 4UGAA 3N5WA 3JWWA 5G67A 4D34A 3E6LA 3B3PA 1QOMA 2FLQA 4D37A 4UPSA 2G6OA 3FC5A 4UGZA 4JSGA 4UG9A 4CAPA 4UGOA 1RS7A 9NSEA 3N6FA 4FVYA 5ADEA 4UCHA 2G6LA 3NLVA 1ZZTA 5AGPA 2G6IA 5FVTA 4CX5A 3RQJA 4JS9A 3NM0A 4D7HA 5G6CA 4K5DA 3B3NA 4CTTA 3JWVA 4UHAA 5FVYA 2ORTA 5FVZA 4UGSA 3SVPA 2NSEA 4KCNA 1QW5A 5FVXA 4D3MA 3UFTA 4D7IA 1DMKA 2FC1A 5G6DA 1K2UA 3NLWA 5FVSA 1QW6A 3E6TA 4UH4A 1JWJA 1FOJA 4CX2A 1OM4A 4KCJA 4D3KA 4K5IA 2ORQA 4UGCA 5G6HA 1QW4A 5G0PA 4JSMA 3UFVA 3E7GA 4JSFA 1ZZSA 2HX2A 3HSOA 1NODA 1P6KA 4UQRA 5AD8A 3JWXA 3NOSA 3JWSA 4LWAA 1D1YA 4UG8A 4V3VA 3JT9A 5ADJA 4UGQA 1NSIA 1ED4A 5AGKA 4D3NA 5G0OA 3HSNA 3PNEA 4NSEA 5FVRA 4D7JA 1R35A 4UGRA 1DMJA 3B3MA 1M7ZA 3JT3A 4CAOA 4CU0A 1MMVA 3E65A 3JT7A 4UH5A 3E7SA 5G6PA 4CTWA 3JT8A 4V3XA 4CU1A 1ED5A 2ORRA 4CWWA 3DWJA 4CWYA 4CDTA 3NODA 4UGHA 4UG7A 1FOPA 2G6KA 1DWXA 4GQEA 4CX6A 3SVQA 1VAFA 4UGGA 4CTXA 4UGJA 4UGPA 5FVWA 3UFPA 4D1PA 3N5QA 4UPMA 3EJ8A 4UGDA 1D1WA 4K5EA 3NNYA 4CTPA 4EUXA 4V3UA 4CTZA 3NLGA
chains in the Genus database with same CATH topology
4LUWA 3N5TA 4IMXA 3NSEA 4KCLA 4FVZA 2NSIA 3N5XA 5FVQA 3TYLA 4UG5A 1M9KA 5G66A 4KCPA 5G6IA 5G6FA 5ADCA 3NW2A 2BHJA 3E6NA 3N66A 3EAHA 3N6BA 3RQOA 1P6NA 5FVOA 3N5RA 4KCMA 5FW0A 5G6JA 3NLUA 5AD9A 5G6BA 4KCKA 4CX1A 2AMOA 4CFTA 4CX4A 1Q2OA 1RS6A 4IMSA 3JX4A 4UH3A 4D32A 5G6NA 4CFTB 4CTRA 1P6JA 4CUNA 3JWTA 5AD4A 4V3ZA 3NLFA 4CANA 1ZVIA 4CWVA 3TYNA 3EAIA 4UH2A 5AGNA 3PNFA 1DM8A 4D3OA 7NSEA 3N6EA 1LZXA 4JSJA 4UPNA 3JX1A 5G65A 3N5SA 5ADAA 1ZZUA 1M9QA 4K5GA 3UFOA 3UFSA 4C39A 4JSEA 4D3VA 5G6AA 3N6GA 1M8EA 3NLRA 1M8HA 3JX5A 1LZZA 5G6GA 3N60A 3NLIA 4UPPA 4D3IA 3JT6A 4JSKA 3HSPA 4KCRA 4UGNA 4UGMA 1FOIA 3N5ZA 3UFRA 4UPTA 2G6NA 1M8IA 3TYMA 3NLJA 4D35A 3N2RA 4D1NA 1DD7A 3N6AA 1I83A 4LUXA 4IMUA 3RQPA 1DWWA 4JSHA 1M00A 5ADNA 1NOSA 1K2TA 4KCIA 2G6MA 4D3TA 5AD7A 3N62A 4UGLA 4UGFA 3N64A 3E7TA 4CX0A 2NODA 4CULA 1DM6A 1NSEA 1MMWA 4KCSA 1VAGA 1D0OA 4CAQA 1D1VA 3NLEA 4D30A 4IMTA 4UH9A 5G68A 5G69A 4CUMA 5ADFA 1P6LA 5AD6A 1DMIA 5ADDA 1ZZQA 2HX3A 3Q99A 4UPRA 1JWKA 2NOSA 4FVXA 8NSEA 3N5YA 3NQSA 4CARA 1M9RA 3JX0A 3NLQA 1OM5A 4FW0A 3N63A 2G6HA 5FJ3A 4V3YA 4K5FA 1M9TA 3JT4A 1DM7A 5FVPA 4CAMA 4K5JA 1M9JA 4UGXA 5G6KA 3RQMA 2ORSA 4CX7A 4NOSA 1M7VA 4D1OA 3PNHA 5ADIA 1P6MA 1QWCA 2ORPA 4UPOA 5AGMA 4C3AA 4D33A 1K2RA 4D38A 4UH8A 3NLMA 4IMWA 3N67A 3JWUA 5ADKA 5G6OA 4UGBA 4CWZA 3JX2A 4UGVA 3N6CA 5ADBA 1FOLA 1N2NA 3NLYA 1RS8A 4UH0A 3N5VA 3NLDA 1FOOA 4K5HA 2OROA 3DQTA 3NLZA 4UQSA 5ADLA 5G6QA 4UH7A 5FVVA 3RQNA 6NSEA 2G6JA 4CWXA 3E67A 1P6IA 5NSEA 1RS9A 4UGKA 4UGUA 5G6LA 3NLNA 3Q9AA 4UG6A 3NNZA 4UH1A 2FC2A 3JX3A 4V3WA 1K2SA 4UGEA 4UGWA 4KCOA 4KCQA 4UGIA 1NOCA 3N5PA 3JWYA 3RQLA 5FVUA 4LWBA 4D3AA 1DF1A 3UFUA 1ED6A 4UPQA 3PNGA 4CX3A 3NLKA 1ZZRA 4UGYA 3E6OA 3E68A 3EBFA 4KCHA 4D3UA 3EBDA 4CVGA 5FJ2A 5G6EA 4JSIA 4JSLA 4D7OA 3B3OA 3N65A 3UFWA 1DWVA 3N68A 4FVWA 3NLHA 3UFQA 3NLPA 1P6HA 2HX4A 5ADMA 4CTYA 4K5KA 4CTVA 2AN0A 4CTUA 4UH6A 5G0NA 1ZVLA 2Y37A 3TYOA 1D0CA 3E7MA 4D39A 3DQSA 5ADGA 4D3BA 3JWZA 4D2YA 5AGOA 3N6DA 1M9MA 3DQRA 4D36A 3JT5A 3NLOA 3E7SB 3NLXA 4D2ZA 4CU1B 3N61A 4CTQA 1M8DA 1MJTA 1D1XA 5AGLA 4D3JA 3E7IA 3JTAA 5AD5A 5G6MA 2AN2A 3RQKA 3JX6A 4UGTA 4D31A 3N69A 2FBZX 3NLTA 4UGAA 3N5WA 3JWWA 5G67A 4D34A 3E6LA 3B3PA 1QOMA 2FLQA 4D37A 4UPSA 2G6OA 3FC5A 4UGZA 4JSGA 4UG9A 4CAPA 4UGOA 1RS7A 9NSEA 3N6FA 4FVYA 5ADEA 4UCHA 2G6LA 3NLVA 1ZZTA 5AGPA 2G6IA 5FVTA 4CX5A 3RQJA 4JS9A 3NM0A 4D7HA 5G6CA 4K5DA 3B3NA 4CTTA 3JWVA 4UHAA 5FVYA 2ORTA 5FVZA 4UGSA 3SVPA 2NSEA 4KCNA 1QW5A 5FVXA 4D3MA 3UFTA 4D7IA 1DMKA 2FC1A 5G6DA 1K2UA 3NLWA 5FVSA 1QW6A 3E6TA 4UH4A 1JWJA 1FOJA 4CX2A 1OM4A 4KCJA 4D3KA 4K5IA 2ORQA 4UGCA 5G6HA 1QW4A 5G0PA 4JSMA 3UFVA 3E7GA 4JSFA 1ZZSA 2HX2A 3HSOA 1NODA 1P6KA 4UQRA 5AD8A 3JWXA 3NOSA 3JWSA 4LWAA 1D1YA 4UG8A 4V3VA 3JT9A 5ADJA 4UGQA 1NSIA 1ED4A 5AGKA 4D3NA 5G0OA 3HSNA 3PNEA 4NSEA 5FVRA 4D7JA 1R35A 4UGRA 1DMJA 3B3MA 1M7ZA 3JT3A 4CAOA 4CU0A 1MMVA 3E65A 3JT7A 4UH5A 3E7SA 5G6PA 4CTWA 3JT8A 4V3XA 4CU1A 1ED5A 2ORRA 4CWWA 3DWJA 4CWYA 4CDTA 3NODA 4UGHA 4UG7A 1FOPA 2G6KA 1DWXA 4GQEA 4CX6A 3SVQA 1VAFA 4UGGA 4CTXA 4UGJA 4UGPA 5FVWA 3UFPA 4D1PA 3N5QA 4UPMA 3EJ8A 4UGDA 1D1WA 4K5EA 3NNYA 4CTPA 4EUXA 4V3UA 4CTZA 3NLGA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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