2FLQA

Crystal structure of nitric oxide synthase from geobacillus stearothermophilus (atcc 12980) complexed with l-arginine
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
RQHDEQLMTKAEQFIIASYRELGKSEQEIKRRVNEIRWEVEQTGTYRHTYEELSYGAKMAWRHSNRCIGRLFWQSLHVIDAREAVTEEEVFSYLFHHIEVATNGGKIRPTITIFRPNGEVRIWNHQLIRYAGYETEEGIIGDSSSLTFTRACEQLGWKGEKTPFDVLPLVIQVGGQKPVWTPIPKELVLEVPIEHPEFPWFRDLQLKWYAVPIISDMCLEIGGIRYMAAPFNGWYMGTEIGARNFADDYRYNMLPKVASCMGLDTNSNASLWKDKALVELNIAVLYSYKKAGVSIVDHHTAARQFQLFEQQEKAAGRHVTGDWTWLIPPLSPATTHIFHRSYDNTMMLPNFFYQDRPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Nitric Oxide Synthase
publication title Structure and Reactivity of a Thermostable Prokaryotic Nitric-oxide Synthase That Forms a Long-lived Oxy-Heme Complex.
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 104
structure length 359
sequence length 359
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH).
pdb deposition date 2006-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 2flqA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 2flqA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 2flqA03
4D7OA 5ADKA 1P6HA 4K5EA 4UGNA 5FVQA 4V3VA 4UCHA 4KCMA 1I83A 1K2RA 1FOIA 1P6KA 4D3TA 4D3BA 4KCPA 1DM6A 4UGRA 4UH0A 3DQSA 4CTVA 3N5RA 1LZZA 4UGWA 3PNFA 2G6NA 1FOLA 2NSEA 1K2TA 1NOCA 4D1NA 4UGJA 2HX4A 4D3NA 4CTUA 4CX4A 5G6GA 1DWVA 4CU1A 1P6NA 3RQNA 5G6MA 3UFSA 3N63A 5AD7A 4UH7A 3NLXA 3SVQA 4EUXA 1M8DA 5FVYA 5G66A 4K5FA 4KCKA 4KCNA 1K2UA 1NODA 4D7HA 4UGKA 5AGLA 3NLIA 3N6FA 4CU0A 1P6LA 4CX1A 4CFTA 1OM5A 4FVXA 4CDTA 3RQPA 4CTWA 5G0NA 5G65A 2G6MA 5ADAA 4D3UA 4D35A 5FVPA 2NODA 4D7IA 1FOOA 3B3MA 5ADLA 9NSEA 4C3AA 1DD7A 5AD8A 4CAOA 3JWSA 4KCSA 3NLZA 1RS7A 3UFUA 1DMIA 3N5YA 3N6AA 3NNZA 1QWCA 3N67A 1VAGA 4D33A 4UGAA 2BHJA 4K5GA 5G6IA 2FC1A 4UGYA 5G6QA 3RQJA 4K5HA 3JTAA 3N62A 1N2NA 3B3PA 1Q2OA 4UGBA 4D39A 3E7TA 3N5ZA 3JWXA 4KCIA 1ZZSA 1MMVA 3EAIA 4CAPA 3N64A 5G69A 5G0PA 4CX3A 1OM4A 4UQRA 4UG8A 4CTTA 2ORPA 1M9KA 4UH2A 1M9MA 3E7MA 1JWKA 3RQOA 4CTPA 4D36A 3N68A 1LZXA 1M8HA 4UGPA 5G6BA 1M9JA 4JSEA 2FC2A 4CX6A 4D1PA 3JT4A 4UGSA 3E7IA 3NLTA 4CU1B 1P6JA 4UGTA 1DWXA 3JT8A 3JX4A 3PNHA 3N6GA 2ORQA 1D1VA 2OROA 3N61A 4UH5A 4FW0A 3NLRA 3UFPA 4LWBA 4CFTB 4V3UA 4JSHA 4FVWA 4CAMA 4KCHA 1FOJA 4LUWA 4D3JA 4CTRA 1DWWA 1ZZTA 3JX5A 3JWWA 3JWTA 4LWAA 4V3WA 4K5DA 2HX2A 3E6LA 3NLUA 5FW0A 3NNYA 3NM0A 3DWJA 5FVVA 1RS6A 4KCQA 2NOSA 4CTZA 3JWUA 1M7VA 5G6AA 3UFTA 3N5TA 2FBZX 4UGUA 4V3ZA 3JX3A 5G6HA 3NLOA 3N5SA 3N65A 3NLFA 1M9QA 3NLHA 5FVSA 4UG5A 1MJTA 1ED4A 4D38A 5FVTA 4NOSA 5G68A 4IMWA 5ADCA 4UGOA 5G6CA 4UGZA 4D37A 4UGEA 3HSOA 3N5XA 5FVWA 1D1WA 1M9RA 2HX3A 1DF1A 2G6JA 4UPMA 5ADNA 4CULA 4KCOA 3JT3A 3E6TA 3EBFA 3N5PA 4JSKA 4FVYA 3N5QA 4D31A 4CX0A 5ADBA 3NODA 3E68A 1M00A 4JSJA 4UGQA 4JSIA 5G6EA 3TYLA 4CTXA 1QOMA 2Y37A 1RS9A 3NLVA 4NSEA 4D30A 3N66A 3E7SA 3N6CA 4D3IA 4D2ZA 1RS8A 3N6DA 3HSPA 5G6LA 4UGMA 3N69A 3N5WA 4IMUA 4CUMA 3NLQA 3NQSA 4D1OA 4V3YA 2ORRA 3EBDA 1ZZRA 3JT6A 3Q99A 4UH1A 4V3XA 2ORTA 1QW4A 3E65A 1DMJA 5G0OA 4D2YA 4D3AA 5AGOA 4K5JA 4JSFA 3TYMA 2AN2A 4CTQA 3Q9AA 3NSEA 4UPSA 5FVRA 3TYOA 4GQEA 3UFQA 3NLDA 4K5IA 4UPNA 4IMXA 1QW6A 4CWVA 4KCRA 4UPRA 5ADJA 3B3OA 3TYNA 4UGHA 5ADGA 3NW2A 2G6IA 2FLQA 5AGNA 5G6KA 4UG6A 4C39A 1QW5A 4UPQA 4CAQA 1JWJA 5ADFA 1M7ZA 5G6FA 3NLNA 1ZVIA 4UGXA 4IMTA 5FJ3A 4UGDA 7NSEA 1VAFA 1DM8A 3JWVA 3E6OA 5FVZA 4CX5A 4CX7A 3N5VA 3UFVA 3DQRA 1ZVLA 4UPTA 3E6NA 4D3OA 1D1XA 5G6OA 4JSMA 2AMOA 4LUXA 3E7SB 4UPPA 5AGMA 5FJ2A 3UFOA 3NLMA 3NLGA 3B3NA 3UFWA 3UFRA 4KCLA 3DQTA 3HSNA 5G6NA 2G6OA 4CARA 5AD4A 3JT5A 1NSIA 5FVOA 1ED5A 4UG7A 2G6KA 4IMSA 2AN0A 5FVUA 4UPOA 3JT7A 1DMKA 3JT9A 4UH4A 4UHAA 4UQSA 1M9TA 4UGCA 4D7JA 5G6PA 1ZZQA 4JS9A 4D34A 3E67A 5ADIA 4FVZA 4D3MA 4CWXA 3RQLA 4UGVA 3JX6A 2ORSA 3NOSA 1NSEA 4K5KA 5AD6A 4CX2A 3JX2A 8NSEA 4D3VA 5FVXA 5G6JA 4UH3A 4UH9A 5AD5A 4CVGA 3EJ8A 3JWYA 3NLWA 1K2SA 4JSGA 1R35A 3JX0A 3RQMA 5ADDA 3N60A 3PNGA 3SVPA 2G6HA 3NLYA 3JWZA 3NLEA 4D3KA 4UGGA 1M8EA 3NLKA 3FC5A 3PNEA 4KCJA 4UH6A 4CWWA 1MMWA 2G6LA 5G6DA 3NLJA 4CUNA 6NSEA 3N6BA 4UGLA 4D32A 4UGIA 5G67A 1DM7A 2NSIA 4JSLA 3EAHA 1NOSA 1ZZUA 1D0CA 4UH8A 4CWYA 1FOPA 3RQKA 1M8IA 1D0OA 3N2RA 5NSEA 5ADEA 5AGPA 3JX1A 5ADMA 4UGFA 1P6IA 4CANA 4UG9A 1D1YA 5AD9A 3N6EA 3NLPA 4CTYA 4CWZA 1P6MA 1ED6A 5AGKA 3E7GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4D7OA 5ADKA 1P6HA 4K5EA 4UGNA 5FVQA 4V3VA 4UCHA 4KCMA 1I83A 1K2RA 1FOIA 1P6KA 4D3TA 4D3BA 4KCPA 1DM6A 4UGRA 4UH0A 3DQSA 4CTVA 3N5RA 1LZZA 4UGWA 3PNFA 2G6NA 1FOLA 2NSEA 1K2TA 1NOCA 4D1NA 4UGJA 2HX4A 4D3NA 4CTUA 4CX4A 5G6GA 1DWVA 4CU1A 1P6NA 3RQNA 5G6MA 3UFSA 3N63A 5AD7A 4UH7A 3NLXA 3SVQA 4EUXA 1M8DA 5FVYA 5G66A 4K5FA 4KCKA 4KCNA 1K2UA 1NODA 4D7HA 4UGKA 5AGLA 3NLIA 3N6FA 4CU0A 1P6LA 4CX1A 4CFTA 1OM5A 4FVXA 4CDTA 3RQPA 4CTWA 5G0NA 5G65A 2G6MA 5ADAA 4D3UA 4D35A 5FVPA 2NODA 4D7IA 1FOOA 3B3MA 5ADLA 9NSEA 4C3AA 1DD7A 5AD8A 4CAOA 3JWSA 4KCSA 3NLZA 1RS7A 3UFUA 1DMIA 3N5YA 3N6AA 3NNZA 1QWCA 3N67A 1VAGA 4D33A 4UGAA 2BHJA 4K5GA 5G6IA 2FC1A 4UGYA 5G6QA 3RQJA 4K5HA 3JTAA 3N62A 1N2NA 3B3PA 1Q2OA 4UGBA 4D39A 3E7TA 3N5ZA 3JWXA 4KCIA 1ZZSA 1MMVA 3EAIA 4CAPA 3N64A 5G69A 5G0PA 4CX3A 1OM4A 4UQRA 4UG8A 4CTTA 2ORPA 1M9KA 4UH2A 1M9MA 3E7MA 1JWKA 3RQOA 4CTPA 4D36A 3N68A 1LZXA 1M8HA 4UGPA 5G6BA 1M9JA 4JSEA 2FC2A 4CX6A 4D1PA 3JT4A 4UGSA 3E7IA 3NLTA 4CU1B 1P6JA 4UGTA 1DWXA 3JT8A 3JX4A 3PNHA 3N6GA 2ORQA 1D1VA 2OROA 3N61A 4UH5A 4FW0A 3NLRA 3UFPA 4LWBA 4CFTB 4V3UA 4JSHA 4FVWA 4CAMA 4KCHA 1FOJA 4LUWA 4D3JA 4CTRA 1DWWA 1ZZTA 3JX5A 3JWWA 3JWTA 4LWAA 4V3WA 4K5DA 2HX2A 3E6LA 3NLUA 5FW0A 3NNYA 3NM0A 3DWJA 5FVVA 1RS6A 4KCQA 2NOSA 4CTZA 3JWUA 1M7VA 5G6AA 3UFTA 3N5TA 2FBZX 4UGUA 4V3ZA 3JX3A 5G6HA 3NLOA 3N5SA 3N65A 3NLFA 1M9QA 3NLHA 5FVSA 4UG5A 1MJTA 1ED4A 4D38A 5FVTA 4NOSA 5G68A 4IMWA 5ADCA 4UGOA 5G6CA 4UGZA 4D37A 4UGEA 3HSOA 3N5XA 5FVWA 1D1WA 1M9RA 2HX3A 1DF1A 2G6JA 4UPMA 5ADNA 4CULA 4KCOA 3JT3A 3E6TA 3EBFA 3N5PA 4JSKA 4FVYA 3N5QA 4D31A 4CX0A 5ADBA 3NODA 3E68A 1M00A 4JSJA 4UGQA 4JSIA 5G6EA 3TYLA 4CTXA 1QOMA 2Y37A 1RS9A 3NLVA 4NSEA 4D30A 3N66A 3E7SA 3N6CA 4D3IA 4D2ZA 1RS8A 3N6DA 3HSPA 5G6LA 4UGMA 3N69A 3N5WA 4IMUA 4CUMA 3NLQA 3NQSA 4D1OA 4V3YA 2ORRA 3EBDA 1ZZRA 3JT6A 3Q99A 4UH1A 4V3XA 2ORTA 1QW4A 3E65A 1DMJA 5G0OA 4D2YA 4D3AA 5AGOA 4K5JA 4JSFA 3TYMA 2AN2A 4CTQA 3Q9AA 3NSEA 4UPSA 5FVRA 3TYOA 4GQEA 3UFQA 3NLDA 4K5IA 4UPNA 4IMXA 1QW6A 4CWVA 4KCRA 4UPRA 5ADJA 3B3OA 3TYNA 4UGHA 5ADGA 3NW2A 2G6IA 2FLQA 5AGNA 5G6KA 4UG6A 4C39A 1QW5A 4UPQA 4CAQA 1JWJA 5ADFA 1M7ZA 5G6FA 3NLNA 1ZVIA 4UGXA 4IMTA 5FJ3A 4UGDA 7NSEA 1VAFA 1DM8A 3JWVA 3E6OA 5FVZA 4CX5A 4CX7A 3N5VA 3UFVA 3DQRA 1ZVLA 4UPTA 3E6NA 4D3OA 1D1XA 5G6OA 4JSMA 2AMOA 4LUXA 3E7SB 4UPPA 5AGMA 5FJ2A 3UFOA 3NLMA 3NLGA 3B3NA 3UFWA 3UFRA 4KCLA 3DQTA 3HSNA 5G6NA 2G6OA 4CARA 5AD4A 3JT5A 1NSIA 5FVOA 1ED5A 4UG7A 2G6KA 4IMSA 2AN0A 5FVUA 4UPOA 3JT7A 1DMKA 3JT9A 4UH4A 4UHAA 4UQSA 1M9TA 4UGCA 4D7JA 5G6PA 1ZZQA 4JS9A 4D34A 3E67A 5ADIA 4FVZA 4D3MA 4CWXA 3RQLA 4UGVA 3JX6A 2ORSA 3NOSA 1NSEA 4K5KA 5AD6A 4CX2A 3JX2A 8NSEA 4D3VA 5FVXA 5G6JA 4UH3A 4UH9A 5AD5A 4CVGA 3EJ8A 3JWYA 3NLWA 1K2SA 4JSGA 1R35A 3JX0A 3RQMA 5ADDA 3N60A 3PNGA 3SVPA 2G6HA 3NLYA 3JWZA 3NLEA 4D3KA 4UGGA 1M8EA 3NLKA 3FC5A 3PNEA 4KCJA 4UH6A 4CWWA 1MMWA 2G6LA 5G6DA 3NLJA 4CUNA 6NSEA 3N6BA 4UGLA 4D32A 4UGIA 5G67A 1DM7A 2NSIA 4JSLA 3EAHA 1NOSA 1ZZUA 1D0CA 4UH8A 4CWYA 1FOPA 3RQKA 1M8IA 1D0OA 3N2RA 5NSEA 5ADEA 5AGPA 3JX1A 5ADMA 4UGFA 1P6IA 4CANA 4UG9A 1D1YA 5AD9A 3N6EA 3NLPA 4CTYA 4CWZA 1P6MA 1ED6A 5AGKA 3E7GA
chains in the Genus database with same CATH topology
4D7OA 5ADKA 1P6HA 4K5EA 4UGNA 5FVQA 4V3VA 4UCHA 4KCMA 1I83A 1K2RA 1FOIA 1P6KA 4D3TA 4D3BA 4KCPA 1DM6A 4UGRA 4UH0A 3DQSA 4CTVA 3N5RA 1LZZA 4UGWA 3PNFA 2G6NA 1FOLA 2NSEA 1K2TA 1NOCA 4D1NA 4UGJA 2HX4A 4D3NA 4CTUA 4CX4A 5G6GA 1DWVA 4CU1A 1P6NA 3RQNA 5G6MA 3UFSA 3N63A 5AD7A 4UH7A 3NLXA 3SVQA 4EUXA 1M8DA 5FVYA 5G66A 4K5FA 4KCKA 4KCNA 1K2UA 1NODA 4D7HA 4UGKA 5AGLA 3NLIA 3N6FA 4CU0A 1P6LA 4CX1A 4CFTA 1OM5A 4FVXA 4CDTA 3RQPA 4CTWA 5G0NA 5G65A 2G6MA 5ADAA 4D3UA 4D35A 5FVPA 2NODA 4D7IA 1FOOA 3B3MA 5ADLA 9NSEA 4C3AA 1DD7A 5AD8A 4CAOA 3JWSA 4KCSA 3NLZA 1RS7A 3UFUA 1DMIA 3N5YA 3N6AA 3NNZA 1QWCA 3N67A 1VAGA 4D33A 4UGAA 2BHJA 4K5GA 5G6IA 2FC1A 4UGYA 5G6QA 3RQJA 4K5HA 3JTAA 3N62A 1N2NA 3B3PA 1Q2OA 4UGBA 4D39A 3E7TA 3N5ZA 3JWXA 4KCIA 1ZZSA 1MMVA 3EAIA 4CAPA 3N64A 5G69A 5G0PA 4CX3A 1OM4A 4UQRA 4UG8A 4CTTA 2ORPA 1M9KA 4UH2A 1M9MA 3E7MA 1JWKA 3RQOA 4CTPA 4D36A 3N68A 1LZXA 1M8HA 4UGPA 5G6BA 1M9JA 4JSEA 2FC2A 4CX6A 4D1PA 3JT4A 4UGSA 3E7IA 3NLTA 4CU1B 1P6JA 4UGTA 1DWXA 3JT8A 3JX4A 3PNHA 3N6GA 2ORQA 1D1VA 2OROA 3N61A 4UH5A 4FW0A 3NLRA 3UFPA 4LWBA 4CFTB 4V3UA 4JSHA 4FVWA 4CAMA 4KCHA 1FOJA 4LUWA 4D3JA 4CTRA 1DWWA 1ZZTA 3JX5A 3JWWA 3JWTA 4LWAA 4V3WA 4K5DA 2HX2A 3E6LA 3NLUA 5FW0A 3NNYA 3NM0A 3DWJA 5FVVA 1RS6A 4KCQA 2NOSA 4CTZA 3JWUA 1M7VA 5G6AA 3UFTA 3N5TA 2FBZX 4UGUA 4V3ZA 3JX3A 5G6HA 3NLOA 3N5SA 3N65A 3NLFA 1M9QA 3NLHA 5FVSA 4UG5A 1MJTA 1ED4A 4D38A 5FVTA 4NOSA 5G68A 4IMWA 5ADCA 4UGOA 5G6CA 4UGZA 4D37A 4UGEA 3HSOA 3N5XA 5FVWA 1D1WA 1M9RA 2HX3A 1DF1A 2G6JA 4UPMA 5ADNA 4CULA 4KCOA 3JT3A 3E6TA 3EBFA 3N5PA 4JSKA 4FVYA 3N5QA 4D31A 4CX0A 5ADBA 3NODA 3E68A 1M00A 4JSJA 4UGQA 4JSIA 5G6EA 3TYLA 4CTXA 1QOMA 2Y37A 1RS9A 3NLVA 4NSEA 4D30A 3N66A 3E7SA 3N6CA 4D3IA 4D2ZA 1RS8A 3N6DA 3HSPA 5G6LA 4UGMA 3N69A 3N5WA 4IMUA 4CUMA 3NLQA 3NQSA 4D1OA 4V3YA 2ORRA 3EBDA 1ZZRA 3JT6A 3Q99A 4UH1A 4V3XA 2ORTA 1QW4A 3E65A 1DMJA 5G0OA 4D2YA 4D3AA 5AGOA 4K5JA 4JSFA 3TYMA 2AN2A 4CTQA 3Q9AA 3NSEA 4UPSA 5FVRA 3TYOA 4GQEA 3UFQA 3NLDA 4K5IA 4UPNA 4IMXA 1QW6A 4CWVA 4KCRA 4UPRA 5ADJA 3B3OA 3TYNA 4UGHA 5ADGA 3NW2A 2G6IA 2FLQA 5AGNA 5G6KA 4UG6A 4C39A 1QW5A 4UPQA 4CAQA 1JWJA 5ADFA 1M7ZA 5G6FA 3NLNA 1ZVIA 4UGXA 4IMTA 5FJ3A 4UGDA 7NSEA 1VAFA 1DM8A 3JWVA 3E6OA 5FVZA 4CX5A 4CX7A 3N5VA 3UFVA 3DQRA 1ZVLA 4UPTA 3E6NA 4D3OA 1D1XA 5G6OA 4JSMA 2AMOA 4LUXA 3E7SB 4UPPA 5AGMA 5FJ2A 3UFOA 3NLMA 3NLGA 3B3NA 3UFWA 3UFRA 4KCLA 3DQTA 3HSNA 5G6NA 2G6OA 4CARA 5AD4A 3JT5A 1NSIA 5FVOA 1ED5A 4UG7A 2G6KA 4IMSA 2AN0A 5FVUA 4UPOA 3JT7A 1DMKA 3JT9A 4UH4A 4UHAA 4UQSA 1M9TA 4UGCA 4D7JA 5G6PA 1ZZQA 4JS9A 4D34A 3E67A 5ADIA 4FVZA 4D3MA 4CWXA 3RQLA 4UGVA 3JX6A 2ORSA 3NOSA 1NSEA 4K5KA 5AD6A 4CX2A 3JX2A 8NSEA 4D3VA 5FVXA 5G6JA 4UH3A 4UH9A 5AD5A 4CVGA 3EJ8A 3JWYA 3NLWA 1K2SA 4JSGA 1R35A 3JX0A 3RQMA 5ADDA 3N60A 3PNGA 3SVPA 2G6HA 3NLYA 3JWZA 3NLEA 4D3KA 4UGGA 1M8EA 3NLKA 3FC5A 3PNEA 4KCJA 4UH6A 4CWWA 1MMWA 2G6LA 5G6DA 3NLJA 4CUNA 6NSEA 3N6BA 4UGLA 4D32A 4UGIA 5G67A 1DM7A 2NSIA 4JSLA 3EAHA 1NOSA 1ZZUA 1D0CA 4UH8A 4CWYA 1FOPA 3RQKA 1M8IA 1D0OA 3N2RA 5NSEA 5ADEA 5AGPA 3JX1A 5ADMA 4UGFA 1P6IA 4CANA 4UG9A 1D1YA 5AD9A 3N6EA 3NLPA 4CTYA 4CWZA 1P6MA 1ED6A 5AGKA 3E7GA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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