1M8EA

Inducible nitric oxide synthase with 7-nitroindazole bound
Total Genus 119
50100150200250300350400020406080100120
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
419
structure length
412
Chain Sequence
QYVRIKNWGSGEILHDTLHHKATSDCLGSIMNPKSLTRGPRDKPTPLEELLPHAIEFINQYYGSFKEAKIEEHLARLEAVTKEIETTGTYQLTLDELIFATKMAWRNAPRCIGRIQWSNLQVFDARNCSTAQEMFQHICRHILYATNNGNIRSAITVFPQRSDGKHDFRLWNSQLIRYAGYQMPDGTIRGDAATLEFTQLCIDLGWKPRYGRFDVLPLVLQADGQDPEVFEIPPDLVLEVTMEHPKYEWFQELGLKWYALPAVANMLLEVGGLEFPACPFNGWYMGTEIGVRDFCDTQRYNILEEVGRRMGLETHTLASLWKDRAVTEINVAVLHSFQKQNVTIMDHHTASESFMKHMQNEYRARGGCPADWIWLVPPVSGSITPVFHQEMLNYVLSPFYYYQIEPWKTHIW
50100150200250300350400400300200100
020406080100Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
TIV1 (83-86)TI1 (84-87)S2 (89-92)EMPTYAH2 (153-170)S7 (271-273)TIV2 (113-116)AH6 (369-378)TI2 (110-113)3H8 (400-402)AH1 (130-146)AH5 (278-287)TIV3 (148-151)3H5 (275-277)AH8 (404-423)AH3 (177-190)S6 (263-265)S4 (237-240)3H3 (197-199)TI5 (208-211)TI3 (191-194)TIV4 (194-197)TI4 (199-202)TVIII1 (200-203)S3 (204-207)3H4 (230-232)AH4 (214-229)O1 (232-234)TVIII2 (257-260)TIV8 (255-258)TIV12 (327-330)TIV5 (244-247)TIV7 (247-250)S5 (252-253)TIV6 (246-249)TI6 (266-269)S8 (300-304)TIV11 (305-308)S9 (311-314)TIV10 (304-307)3H6 (317-319)S12 (345-346)S13 (350-353)S14 (356-358)TIV13 (352-355)TVIII3 (358-361)TI8 (396-399)3H2 (117-119)TIV9 (294-297)S10 (322-324)3H7 (331-336)S11 (339-341)S15 (363-364)AH7 (385-392)TI7 (379-382)TIV15 (381-384)S1 (79-82)3H1 (94-97)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
publication title Conformational Changes in Nitric Oxide Synthases Induced by Chlorzoxazone and Nitroindazoles: Crystallographic and Computational Analyses of Inhibitor Potency
pubmed doi rcsb
molecule keywords inducible Nitric oxide synthase
total genus 119
structure length 412
sequence length 419
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH).
pdb deposition date 2002-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 1m8eA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 1m8eA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 1m8eA03
4D36A 4JSMA 5G6BA 1M7VA 3E68A 4UH2A 4D7IA 5G6AA 5FVQA 4LUWA 3JWYA 3N69A 4JSJA 3E6TA 3N5PA 4CX0A 4CTPA 2AN2A 4GQEA 4D2ZA 5G6QA 4CX3A 3UFRA 4D3JA 4UGDA 5ADFA 3N61A 7NSEA 3RQPA 3PNEA 1N2NA 3NNYA 3TYNA 4CX4A 5FW0A 1NSIA 5G6JA 5G69A 3NLHA 1M9KA 5AD5A 3N2RA 1FOPA 1K2RA 3EAIA 4UPMA 4CTXA 1RS8A 8NSEA 4FW0A 1MMVA 1P6LA 4CWYA 3E7SA 1DF1A 4UG8A 3EBDA 3UFQA 4CTQA 2NOSA 3B3PA 4UG7A 1DMIA 4FVYA 3N6FA 2G6MA 3JT6A 5ADGA 4D2YA 3N60A 5FVYA 3NLWA 3JX6A 1VAFA 4LWAA 4CX5A 4CU1B 5G6MA 4FVWA 4LWBA 4CVGA 4CWXA 5FJ2A 4UGOA 3N5XA 1QW4A 3NLDA 1RS7A 5AD9A 1LZXA 4JSLA 1D1WA 2G6LA 5ADLA 3RQNA 3JT3A 5G0OA 4D33A 3N5YA 4UGMA 1D1XA 2G6JA 5FVRA 4V3YA 5G6CA 3B3OA 6NSEA 4UG9A 5G6IA 2G6OA 3N6BA 1P6MA 3RQLA 1I83A 1ZVIA 1LZZA 3NLZA 4UGUA 4KCMA 1ED4A 2ORRA 4UGYA 4CFTB 1ZZSA 3UFTA 4KCKA 4D3TA 1P6IA 4D3MA 4EUXA 1JWJA 4UGXA 1P6KA 4CAOA 3UFPA 3E6OA 3N5RA 1P6HA 1DWXA 1M8IA 4CX1A 1D0OA 1ZZRA 1M9MA 1OM5A 4UHAA 4CX2A 3RQMA 1MMWA 1DM8A 3JT4A 3N65A 4D37A 4K5EA 1VAGA 3N67A 3NLEA 4D39A 4D3NA 3JWSA 4CTTA 4CWZA 4JS9A 4UPSA 4CTRA 2AN0A 4UGPA 1R35A 4UH4A 4D31A 2G6NA 4KCQA 4D34A 4D38A 4CTZA 4UGJA 1M8DA 4UPPA 2ORSA 1DMJA 2G6IA 4K5HA 3NLTA 4KCLA 4D3IA 4KCNA 5G6FA 4D3AA 5AGOA 3B3NA 4UPTA 3E7TA 3NQSA 4UGSA 5FVXA 5ADJA 3DWJA 1DWVA 4JSIA 3E7GA 4K5FA 4UQRA 4UGGA 4K5DA 3PNGA 5G6EA 3JWUA 2NSIA 4JSGA 5AD4A 3UFUA 4CTVA 4D3BA 4CTUA 3SVQA 1QOMA 3N5WA 4CUNA 1D1YA 3RQJA 3E67A 5ADMA 5ADNA 3JX1A 5G6PA 3NLUA 3PNHA 5AGKA 3NLOA 1M7ZA 3NNZA 4UGLA 4KCPA 4IMSA 1FOIA 4CU1A 3PNFA 4D3OA 5AD8A 1QW5A 3N66A 4KCIA 4C3AA 5ADBA 4IMXA 1QWCA 3UFSA 4UGTA 1ZVLA 4KCJA 5ADIA 5FVZA 1DM7A 1ZZQA 4UGAA 1NODA 5NSEA 1M00A 4UQSA 4CTWA 5G6HA 3NLXA 4D3UA 3NODA 5G0NA 4UGBA 3N6GA 4UGIA 4CAMA 4UGZA 4UGFA 4CUMA 4K5GA 4D35A 3N5VA 5AGLA 5AD6A 4D1NA 1ED6A 5G6OA 4KCHA 2ORPA 3N6DA 5G66A 3DQSA 5FVWA 3UFVA 4V3VA 3JWVA 1M9JA 5AD7A 5G6KA 4CFTA 4K5IA 2FLQA 3JX4A 5FVSA 1NSEA 1DWWA 5FVUA 3NLJA 3JT9A 4NSEA 1NOCA 3NLKA 1DMKA 1NOSA 3NLYA 4D7HA 4V3XA 3TYOA 3EAHA 4CWWA 5ADDA 3TYMA 1Q2OA 2HX4A 2NSEA 1ZZTA 4LUXA 1RS6A 3JX0A 3DQRA 3N68A 3RQKA 3N6EA 1P6JA 4NOSA 3SVPA 4UG5A 1MJTA 4K5KA 4D30A 3N64A 3N5QA 4V3WA 2NODA 3HSOA 1ZZUA 4UG6A 3RQOA 4CDTA 2AMOA 4CWVA 3NW2A 3JWWA 2G6KA 4CU0A 4CTYA 3JX3A 4D3VA 2FBZX 4IMWA 5G0PA 3JWZA 1M8EA 3NOSA 3JX5A 4KCSA 4CX7A 4UGEA 4UCHA 3E65A 4UH9A 4UPQA 4UPRA 1RS9A 5G65A 1K2TA 4JSKA 2Y37A 5ADEA 3NLQA 5G6GA 1M8HA 4CAPA 2ORTA 3NLPA 3JWXA 4UH3A 4V3ZA 4UH0A 5FVPA 3HSPA 3JTAA 4UPNA 1D1VA 3N5ZA 1P6NA 5G6NA 3E7SB 4UH5A 3E7IA 1OM4A 1M9QA 3E7MA 2FC1A 5FVVA 4UPOA 3Q9AA 5ADKA 5G68A 5G6DA 3NM0A 1FOOA 5AGNA 4K5JA 2ORQA 1ED5A 3N6AA 9NSEA 3Q99A 2HX3A 4CX6A 3NLIA 4UH8A 3N63A 3N5SA 5FVOA 2OROA 3UFOA 1K2SA 4D32A 1JWKA 1D0CA 4V3UA 4UGKA 3JT7A 4D7JA 3B3MA 3EJ8A 5ADAA 4JSEA 4D1PA 2FC2A 4JSFA 5G67A 4CULA 4C39A 4UGHA 2BHJA 1M9RA 5ADCA 4KCOA 3HSNA 4JSHA 4UGWA 3E6NA 3NLNA 5AGPA 5G6LA 4UGQA 3UFWA 3JT8A 4FVZA 4UH6A 3EBFA 5FVTA 4D7OA 4D3KA 3N62A 4IMUA 4D1OA 3NLRA 3NLFA 1QW6A 3DQTA 1DD7A 1K2UA 1FOLA 3JX2A 1FOJA 4UGCA 3N5TA 3N6CA 4CAQA 2G6HA 3FC5A 4UGNA 4CARA 4IMTA 4UH1A 3JT5A 3NLGA 2HX2A 5FJ3A 5AGMA 4FVXA 4KCRA 3NSEA 3NLMA 4UGVA 3NLVA 4UGRA 3TYLA 1M9TA 4UH7A 3E6LA 1DM6A 3JWTA 4CANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4D36A 4JSMA 5G6BA 1M7VA 3E68A 4UH2A 4D7IA 5G6AA 5FVQA 4LUWA 3JWYA 3N69A 4JSJA 3E6TA 3N5PA 4CX0A 4CTPA 2AN2A 4GQEA 4D2ZA 5G6QA 4CX3A 3UFRA 4D3JA 4UGDA 5ADFA 3N61A 7NSEA 3RQPA 3PNEA 1N2NA 3NNYA 3TYNA 4CX4A 5FW0A 1NSIA 5G6JA 5G69A 3NLHA 1M9KA 5AD5A 3N2RA 1FOPA 1K2RA 3EAIA 4UPMA 4CTXA 1RS8A 8NSEA 4FW0A 1MMVA 1P6LA 4CWYA 3E7SA 1DF1A 4UG8A 3EBDA 3UFQA 4CTQA 2NOSA 3B3PA 4UG7A 1DMIA 4FVYA 3N6FA 2G6MA 3JT6A 5ADGA 4D2YA 3N60A 5FVYA 3NLWA 3JX6A 1VAFA 4LWAA 4CX5A 4CU1B 5G6MA 4FVWA 4LWBA 4CVGA 4CWXA 5FJ2A 4UGOA 3N5XA 1QW4A 3NLDA 1RS7A 5AD9A 1LZXA 4JSLA 1D1WA 2G6LA 5ADLA 3RQNA 3JT3A 5G0OA 4D33A 3N5YA 4UGMA 1D1XA 2G6JA 5FVRA 4V3YA 5G6CA 3B3OA 6NSEA 4UG9A 5G6IA 2G6OA 3N6BA 1P6MA 3RQLA 1I83A 1ZVIA 1LZZA 3NLZA 4UGUA 4KCMA 1ED4A 2ORRA 4UGYA 4CFTB 1ZZSA 3UFTA 4KCKA 4D3TA 1P6IA 4D3MA 4EUXA 1JWJA 4UGXA 1P6KA 4CAOA 3UFPA 3E6OA 3N5RA 1P6HA 1DWXA 1M8IA 4CX1A 1D0OA 1ZZRA 1M9MA 1OM5A 4UHAA 4CX2A 3RQMA 1MMWA 1DM8A 3JT4A 3N65A 4D37A 4K5EA 1VAGA 3N67A 3NLEA 4D39A 4D3NA 3JWSA 4CTTA 4CWZA 4JS9A 4UPSA 4CTRA 2AN0A 4UGPA 1R35A 4UH4A 4D31A 2G6NA 4KCQA 4D34A 4D38A 4CTZA 4UGJA 1M8DA 4UPPA 2ORSA 1DMJA 2G6IA 4K5HA 3NLTA 4KCLA 4D3IA 4KCNA 5G6FA 4D3AA 5AGOA 3B3NA 4UPTA 3E7TA 3NQSA 4UGSA 5FVXA 5ADJA 3DWJA 1DWVA 4JSIA 3E7GA 4K5FA 4UQRA 4UGGA 4K5DA 3PNGA 5G6EA 3JWUA 2NSIA 4JSGA 5AD4A 3UFUA 4CTVA 4D3BA 4CTUA 3SVQA 1QOMA 3N5WA 4CUNA 1D1YA 3RQJA 3E67A 5ADMA 5ADNA 3JX1A 5G6PA 3NLUA 3PNHA 5AGKA 3NLOA 1M7ZA 3NNZA 4UGLA 4KCPA 4IMSA 1FOIA 4CU1A 3PNFA 4D3OA 5AD8A 1QW5A 3N66A 4KCIA 4C3AA 5ADBA 4IMXA 1QWCA 3UFSA 4UGTA 1ZVLA 4KCJA 5ADIA 5FVZA 1DM7A 1ZZQA 4UGAA 1NODA 5NSEA 1M00A 4UQSA 4CTWA 5G6HA 3NLXA 4D3UA 3NODA 5G0NA 4UGBA 3N6GA 4UGIA 4CAMA 4UGZA 4UGFA 4CUMA 4K5GA 4D35A 3N5VA 5AGLA 5AD6A 4D1NA 1ED6A 5G6OA 4KCHA 2ORPA 3N6DA 5G66A 3DQSA 5FVWA 3UFVA 4V3VA 3JWVA 1M9JA 5AD7A 5G6KA 4CFTA 4K5IA 2FLQA 3JX4A 5FVSA 1NSEA 1DWWA 5FVUA 3NLJA 3JT9A 4NSEA 1NOCA 3NLKA 1DMKA 1NOSA 3NLYA 4D7HA 4V3XA 3TYOA 3EAHA 4CWWA 5ADDA 3TYMA 1Q2OA 2HX4A 2NSEA 1ZZTA 4LUXA 1RS6A 3JX0A 3DQRA 3N68A 3RQKA 3N6EA 1P6JA 4NOSA 3SVPA 4UG5A 1MJTA 4K5KA 4D30A 3N64A 3N5QA 4V3WA 2NODA 3HSOA 1ZZUA 4UG6A 3RQOA 4CDTA 2AMOA 4CWVA 3NW2A 3JWWA 2G6KA 4CU0A 4CTYA 3JX3A 4D3VA 2FBZX 4IMWA 5G0PA 3JWZA 1M8EA 3NOSA 3JX5A 4KCSA 4CX7A 4UGEA 4UCHA 3E65A 4UH9A 4UPQA 4UPRA 1RS9A 5G65A 1K2TA 4JSKA 2Y37A 5ADEA 3NLQA 5G6GA 1M8HA 4CAPA 2ORTA 3NLPA 3JWXA 4UH3A 4V3ZA 4UH0A 5FVPA 3HSPA 3JTAA 4UPNA 1D1VA 3N5ZA 1P6NA 5G6NA 3E7SB 4UH5A 3E7IA 1OM4A 1M9QA 3E7MA 2FC1A 5FVVA 4UPOA 3Q9AA 5ADKA 5G68A 5G6DA 3NM0A 1FOOA 5AGNA 4K5JA 2ORQA 1ED5A 3N6AA 9NSEA 3Q99A 2HX3A 4CX6A 3NLIA 4UH8A 3N63A 3N5SA 5FVOA 2OROA 3UFOA 1K2SA 4D32A 1JWKA 1D0CA 4V3UA 4UGKA 3JT7A 4D7JA 3B3MA 3EJ8A 5ADAA 4JSEA 4D1PA 2FC2A 4JSFA 5G67A 4CULA 4C39A 4UGHA 2BHJA 1M9RA 5ADCA 4KCOA 3HSNA 4JSHA 4UGWA 3E6NA 3NLNA 5AGPA 5G6LA 4UGQA 3UFWA 3JT8A 4FVZA 4UH6A 3EBFA 5FVTA 4D7OA 4D3KA 3N62A 4IMUA 4D1OA 3NLRA 3NLFA 1QW6A 3DQTA 1DD7A 1K2UA 1FOLA 3JX2A 1FOJA 4UGCA 3N5TA 3N6CA 4CAQA 2G6HA 3FC5A 4UGNA 4CARA 4IMTA 4UH1A 3JT5A 3NLGA 2HX2A 5FJ3A 5AGMA 4FVXA 4KCRA 3NSEA 3NLMA 4UGVA 3NLVA 4UGRA 3TYLA 1M9TA 4UH7A 3E6LA 1DM6A 3JWTA 4CANA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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