1OM4A

Structure of rat neuronal nos heme domain with l-arginine bound
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
418
structure length
407
Chain Sequence
RFLKVKNWETDVVLTDTLHLKSTLETGCTEHICMGSIMLPTKDQLFPLAKEFLDQYYSSIKRFGSKAHMDRLEEVNKEIESTSTYQLKDTELIYGAKHAWRNASRCVGRIQWSKLQVFDARDCTTAHGMFNYICNHVKYATNKGNLRSAITIFPQRTDGKHDFRVWNSQLIRYAGYKQPDGSTLGDPANVQFTEICIQQGWKAPRGRFDVLPLLLQANGNDPELFQIPPELVLEVPIRHPKFDWFKDLGLKWYGLPAVSNMLLEIGGLEFSACPFSGWYMGTEIGVRDYCDNSRYNILEEVAKKMDLDMRKTSSLWKDQALVEINIAVLYSFQSDKVTIVDHHSATESFIKHMENEYRCRGGCPADWVWIVPPMSGSITPVFHQEMLNYRLTPSFEYQPDPWNTHVW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of Rat Neuronal NOS Heme Domain with L-Arginine Bound
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Nitric-oxide synthase, brain
total genus 127
structure length 407
sequence length 418
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH).
pdb deposition date 2003-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 1om4A01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 1om4A02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 1om4A03
3JT8A 4JSGA 2G6JA 4JSFA 3TYNA 1D0OA 1K2UA 4NSEA 4CX7A 4D3KA 3N6DA 4CU0A 3PNGA 4CULA 3N5SA 1M9MA 3NLPA 5G6PA 4UH2A 3Q9AA 3TYLA 4CTTA 3UFOA 3E7TA 1M8IA 4CWZA 5G6QA 4K5EA 3NODA 5AD7A 1P6KA 1M9KA 3JWYA 5G6LA 1M8DA 3JT7A 3B3NA 4UH5A 1ZZTA 5AGNA 3NSEA 3RQJA 4D38A 2FC2A 1ZZQA 5G6DA 1M7ZA 5G6EA 3N66A 4CX1A 5FVPA 1JWJA 3NLUA 3NM0A 1VAFA 3N5RA 4UGCA 1P6MA 3HSPA 4JSKA 5G0NA 4D2ZA 4CVGA 1OM5A 3E7MA 1OM4A 2G6LA 3N5VA 5FJ2A 4CTXA 2AN2A 5FVXA 2G6HA 3N5TA 5ADNA 3E7GA 5AGOA 3NLZA 4UPRA 1M9QA 3N65A 4UGXA 1RS9A 4D35A 1MJTA 3JX0A 5G6KA 4UGJA 4UGNA 3NLEA 4UHAA 5G66A 3JT4A 4CWYA 4D2YA 2FC1A 4UQRA 2NOSA 4CANA 4D1NA 4D7OA 4KCLA 5G6HA 4UGOA 3UFQA 4CTRA 2G6KA 3E7SB 3NLNA 3UFUA 4CUMA 5ADBA 1NSEA 1ED4A 4IMSA 3NNYA 3NLIA 3EBDA 3N6GA 5G6NA 1DWXA 4UGZA 4UGBA 1M9TA 3JT3A 3N6AA 4UG5A 4FVXA 4D3TA 3UFSA 4UG9A 3JX5A 4CX0A 1M8HA 4CWXA 4D7IA 3UFVA 5G6IA 1K2RA 4UGKA 1DD7A 1NSIA 2AN0A 3DQTA 1D0CA 3NNZA 4C3AA 4D34A 1ZZSA 1LZXA 3E6LA 4CFTB 5G6MA 4K5IA 1LZZA 3NLDA 3NLVA 1VAGA 3E7SA 3EJ8A 4CTQA 4UH8A 1MMVA 4KCIA 3B3PA 5ADEA 3DQSA 4UGYA 4UPNA 5AD8A 1RS7A 4UGIA 1QWCA 4KCPA 5ADCA 4CTPA 6NSEA 1ZZRA 1JWKA 4D32A 3TYOA 3JWVA 3E6OA 2AMOA 4UGDA 5G68A 5G6BA 4CX2A 2ORSA 1QOMA 4NOSA 3E68A 1DM8A 3NLXA 5FW0A 4D3OA 2G6IA 5G6FA 3N5WA 2G6OA 5FVUA 3B3OA 4CFTA 1DMJA 4CDTA 1D1WA 3N60A 4UPTA 3N61A 3FC5A 4CTZA 1M9JA 3JX1A 4D1PA 3JWZA 4UGRA 3B3MA 4D31A 5ADKA 1N2NA 1D1VA 3N62A 4K5KA 4LUWA 4CTVA 4LUXA 4FVZA 5ADDA 5ADJA 2OROA 4D36A 1P6HA 1ED6A 4UGUA 5AGLA 3RQLA 4JSJA 3EBFA 5NSEA 3UFTA 2G6NA 4GQEA 2NSIA 4D3AA 5FVVA 4UGEA 1QW4A 1DM6A 9NSEA 4UGHA 4IMTA 2HX2A 3JWWA 5G69A 3UFRA 5G65A 4CTUA 4JSHA 1FOJA 1ED5A 1R35A 4FW0A 4LWBA 4CU1B 3JX2A 4V3XA 1RS6A 3N6EA 1M7VA 3N6CA 3N6BA 4CAQA 5ADIA 5FVQA 5FVRA 5AGPA 4KCRA 4UGAA 1D1YA 3PNHA 1FOOA 4FVWA 4CAOA 4UQSA 4D3UA 5ADFA 1K2TA 4UH0A 4D7JA 3TYMA 1QW5A 2HX3A 4KCHA 4LWAA 1NODA 4K5JA 3Q99A 3N69A 1P6LA 3NLRA 5ADMA 4KCOA 4UGLA 4UGVA 4CU1A 4V3VA 4CAPA 1DM7A 3NLGA 4UPMA 4UPPA 4K5HA 4UH7A 1P6JA 3NLWA 4UGPA 4KCNA 4UG7A 3HSNA 4UH9A 4UG6A 5ADGA 2G6MA 4D7HA 1M8EA 3PNEA 3RQNA 1ZVLA 3N5PA 3HSOA 4UGTA 3UFWA 4JSIA 3JWUA 3PNFA 3N5XA 1FOLA 4JSMA 3JWSA 4JSEA 3RQMA 4D39A 4KCKA 4CX6A 3E6TA 3NLKA 4UGWA 4UGFA 4UH1A 5G6GA 5G6CA 3E67A 4CTWA 4D37A 4C39A 4UGMA 1Q2OA 3RQOA 4CX4A 4D3BA 3N5ZA 4D3VA 3NLHA 3RQPA 4JS9A 2ORPA 3N5YA 2BHJA 3EAHA 5FVSA 3NLMA 3JWXA 1ZVIA 3N63A 3JX4A 4D1OA 1FOPA 4IMUA 4JSLA 3JT5A 4K5DA 3N67A 3N2RA 3DWJA 1ZZUA 4V3UA 3JX3A 3N5QA 1QW6A 3NLFA 2ORTA 5FVOA 4FVYA 3NLYA 4V3YA 3RQKA 4UPSA 3JT6A 2Y37A 3JWTA 3N64A 3JTAA 4KCMA 1FOIA 5AGKA 2ORRA 3N68A 4KCJA 3EAIA 4V3WA 3NOSA 3N6FA 4K5GA 2FLQA 4KCQA 4KCSA 1DF1A 2FBZX 1I83A 4V3ZA 1MMWA 4CWWA 4IMWA 4UPOA 3E6NA 4K5FA 5AD4A 4UH4A 4UH6A 2NODA 4D3NA 1DMIA 4CX5A 4CAMA 3NW2A 2NSEA 3NQSA 3SVPA 3SVQA 4CX3A 3NLQA 4UGQA 4D3JA 5FVWA 4D3MA 5FVYA 5AD6A 4IMXA 1M00A 4CTYA 4CUNA 5ADLA 3UFPA 1DMKA 5AD9A 3JT9A 4EUXA 1P6NA 4CARA 2ORQA 1M9RA 4UH3A 3NLOA 4D30A 5AD5A 1K2SA 3DQRA 4UCHA 5FVTA 4UGGA 1DWWA 5G0OA 1RS8A 5FVZA 1NOSA 8NSEA 3NLTA 4UPQA 3E65A 5G6OA 5G67A 1DWVA 3JX6A 1P6IA 5G0PA 5ADAA 3NLJA 1NOCA 4D3IA 5G6JA 5AGMA 2HX4A 5G6AA 7NSEA 4UGSA 1D1XA 4CWVA 4UG8A 4D33A 3E7IA 5FJ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JT8A 4JSGA 2G6JA 4JSFA 3TYNA 1D0OA 1K2UA 4NSEA 4CX7A 4D3KA 3N6DA 4CU0A 3PNGA 4CULA 3N5SA 1M9MA 3NLPA 5G6PA 4UH2A 3Q9AA 3TYLA 4CTTA 3UFOA 3E7TA 1M8IA 4CWZA 5G6QA 4K5EA 3NODA 5AD7A 1P6KA 1M9KA 3JWYA 5G6LA 1M8DA 3JT7A 3B3NA 4UH5A 1ZZTA 5AGNA 3NSEA 3RQJA 4D38A 2FC2A 1ZZQA 5G6DA 1M7ZA 5G6EA 3N66A 4CX1A 5FVPA 1JWJA 3NLUA 3NM0A 1VAFA 3N5RA 4UGCA 1P6MA 3HSPA 4JSKA 5G0NA 4D2ZA 4CVGA 1OM5A 3E7MA 1OM4A 2G6LA 3N5VA 5FJ2A 4CTXA 2AN2A 5FVXA 2G6HA 3N5TA 5ADNA 3E7GA 5AGOA 3NLZA 4UPRA 1M9QA 3N65A 4UGXA 1RS9A 4D35A 1MJTA 3JX0A 5G6KA 4UGJA 4UGNA 3NLEA 4UHAA 5G66A 3JT4A 4CWYA 4D2YA 2FC1A 4UQRA 2NOSA 4CANA 4D1NA 4D7OA 4KCLA 5G6HA 4UGOA 3UFQA 4CTRA 2G6KA 3E7SB 3NLNA 3UFUA 4CUMA 5ADBA 1NSEA 1ED4A 4IMSA 3NNYA 3NLIA 3EBDA 3N6GA 5G6NA 1DWXA 4UGZA 4UGBA 1M9TA 3JT3A 3N6AA 4UG5A 4FVXA 4D3TA 3UFSA 4UG9A 3JX5A 4CX0A 1M8HA 4CWXA 4D7IA 3UFVA 5G6IA 1K2RA 4UGKA 1DD7A 1NSIA 2AN0A 3DQTA 1D0CA 3NNZA 4C3AA 4D34A 1ZZSA 1LZXA 3E6LA 4CFTB 5G6MA 4K5IA 1LZZA 3NLDA 3NLVA 1VAGA 3E7SA 3EJ8A 4CTQA 4UH8A 1MMVA 4KCIA 3B3PA 5ADEA 3DQSA 4UGYA 4UPNA 5AD8A 1RS7A 4UGIA 1QWCA 4KCPA 5ADCA 4CTPA 6NSEA 1ZZRA 1JWKA 4D32A 3TYOA 3JWVA 3E6OA 2AMOA 4UGDA 5G68A 5G6BA 4CX2A 2ORSA 1QOMA 4NOSA 3E68A 1DM8A 3NLXA 5FW0A 4D3OA 2G6IA 5G6FA 3N5WA 2G6OA 5FVUA 3B3OA 4CFTA 1DMJA 4CDTA 1D1WA 3N60A 4UPTA 3N61A 3FC5A 4CTZA 1M9JA 3JX1A 4D1PA 3JWZA 4UGRA 3B3MA 4D31A 5ADKA 1N2NA 1D1VA 3N62A 4K5KA 4LUWA 4CTVA 4LUXA 4FVZA 5ADDA 5ADJA 2OROA 4D36A 1P6HA 1ED6A 4UGUA 5AGLA 3RQLA 4JSJA 3EBFA 5NSEA 3UFTA 2G6NA 4GQEA 2NSIA 4D3AA 5FVVA 4UGEA 1QW4A 1DM6A 9NSEA 4UGHA 4IMTA 2HX2A 3JWWA 5G69A 3UFRA 5G65A 4CTUA 4JSHA 1FOJA 1ED5A 1R35A 4FW0A 4LWBA 4CU1B 3JX2A 4V3XA 1RS6A 3N6EA 1M7VA 3N6CA 3N6BA 4CAQA 5ADIA 5FVQA 5FVRA 5AGPA 4KCRA 4UGAA 1D1YA 3PNHA 1FOOA 4FVWA 4CAOA 4UQSA 4D3UA 5ADFA 1K2TA 4UH0A 4D7JA 3TYMA 1QW5A 2HX3A 4KCHA 4LWAA 1NODA 4K5JA 3Q99A 3N69A 1P6LA 3NLRA 5ADMA 4KCOA 4UGLA 4UGVA 4CU1A 4V3VA 4CAPA 1DM7A 3NLGA 4UPMA 4UPPA 4K5HA 4UH7A 1P6JA 3NLWA 4UGPA 4KCNA 4UG7A 3HSNA 4UH9A 4UG6A 5ADGA 2G6MA 4D7HA 1M8EA 3PNEA 3RQNA 1ZVLA 3N5PA 3HSOA 4UGTA 3UFWA 4JSIA 3JWUA 3PNFA 3N5XA 1FOLA 4JSMA 3JWSA 4JSEA 3RQMA 4D39A 4KCKA 4CX6A 3E6TA 3NLKA 4UGWA 4UGFA 4UH1A 5G6GA 5G6CA 3E67A 4CTWA 4D37A 4C39A 4UGMA 1Q2OA 3RQOA 4CX4A 4D3BA 3N5ZA 4D3VA 3NLHA 3RQPA 4JS9A 2ORPA 3N5YA 2BHJA 3EAHA 5FVSA 3NLMA 3JWXA 1ZVIA 3N63A 3JX4A 4D1OA 1FOPA 4IMUA 4JSLA 3JT5A 4K5DA 3N67A 3N2RA 3DWJA 1ZZUA 4V3UA 3JX3A 3N5QA 1QW6A 3NLFA 2ORTA 5FVOA 4FVYA 3NLYA 4V3YA 3RQKA 4UPSA 3JT6A 2Y37A 3JWTA 3N64A 3JTAA 4KCMA 1FOIA 5AGKA 2ORRA 3N68A 4KCJA 3EAIA 4V3WA 3NOSA 3N6FA 4K5GA 2FLQA 4KCQA 4KCSA 1DF1A 2FBZX 1I83A 4V3ZA 1MMWA 4CWWA 4IMWA 4UPOA 3E6NA 4K5FA 5AD4A 4UH4A 4UH6A 2NODA 4D3NA 1DMIA 4CX5A 4CAMA 3NW2A 2NSEA 3NQSA 3SVPA 3SVQA 4CX3A 3NLQA 4UGQA 4D3JA 5FVWA 4D3MA 5FVYA 5AD6A 4IMXA 1M00A 4CTYA 4CUNA 5ADLA 3UFPA 1DMKA 5AD9A 3JT9A 4EUXA 1P6NA 4CARA 2ORQA 1M9RA 4UH3A 3NLOA 4D30A 5AD5A 1K2SA 3DQRA 4UCHA 5FVTA 4UGGA 1DWWA 5G0OA 1RS8A 5FVZA 1NOSA 8NSEA 3NLTA 4UPQA 3E65A 5G6OA 5G67A 1DWVA 3JX6A 1P6IA 5G0PA 5ADAA 3NLJA 1NOCA 4D3IA 5G6JA 5AGMA 2HX4A 5G6AA 7NSEA 4UGSA 1D1XA 4CWVA 4UG8A 4D33A 3E7IA 5FJ3A
chains in the Genus database with same CATH topology
3JT8A 4JSGA 2G6JA 4JSFA 3TYNA 1D0OA 1K2UA 4NSEA 4CX7A 4D3KA 3N6DA 4CU0A 3PNGA 4CULA 3N5SA 1M9MA 3NLPA 5G6PA 4UH2A 3Q9AA 3TYLA 4CTTA 3UFOA 3E7TA 1M8IA 4CWZA 5G6QA 4K5EA 3NODA 5AD7A 1P6KA 1M9KA 3JWYA 5G6LA 1M8DA 3JT7A 3B3NA 4UH5A 1ZZTA 5AGNA 3NSEA 3RQJA 4D38A 2FC2A 1ZZQA 5G6DA 1M7ZA 5G6EA 3N66A 4CX1A 5FVPA 1JWJA 3NLUA 3NM0A 1VAFA 3N5RA 4UGCA 1P6MA 3HSPA 4JSKA 5G0NA 4D2ZA 4CVGA 1OM5A 3E7MA 1OM4A 2G6LA 3N5VA 5FJ2A 4CTXA 2AN2A 5FVXA 2G6HA 3N5TA 5ADNA 3E7GA 5AGOA 3NLZA 4UPRA 1M9QA 3N65A 4UGXA 1RS9A 4D35A 1MJTA 3JX0A 5G6KA 4UGJA 4UGNA 3NLEA 4UHAA 5G66A 3JT4A 4CWYA 4D2YA 2FC1A 4UQRA 2NOSA 4CANA 4D1NA 4D7OA 4KCLA 5G6HA 4UGOA 3UFQA 4CTRA 2G6KA 3E7SB 3NLNA 3UFUA 4CUMA 5ADBA 1NSEA 1ED4A 4IMSA 3NNYA 3NLIA 3EBDA 3N6GA 5G6NA 1DWXA 4UGZA 4UGBA 1M9TA 3JT3A 3N6AA 4UG5A 4FVXA 4D3TA 3UFSA 4UG9A 3JX5A 4CX0A 1M8HA 4CWXA 4D7IA 3UFVA 5G6IA 1K2RA 4UGKA 1DD7A 1NSIA 2AN0A 3DQTA 1D0CA 3NNZA 4C3AA 4D34A 1ZZSA 1LZXA 3E6LA 4CFTB 5G6MA 4K5IA 1LZZA 3NLDA 3NLVA 1VAGA 3E7SA 3EJ8A 4CTQA 4UH8A 1MMVA 4KCIA 3B3PA 5ADEA 3DQSA 4UGYA 4UPNA 5AD8A 1RS7A 4UGIA 1QWCA 4KCPA 5ADCA 4CTPA 6NSEA 1ZZRA 1JWKA 4D32A 3TYOA 3JWVA 3E6OA 2AMOA 4UGDA 5G68A 5G6BA 4CX2A 2ORSA 1QOMA 4NOSA 3E68A 1DM8A 3NLXA 5FW0A 4D3OA 2G6IA 5G6FA 3N5WA 2G6OA 5FVUA 3B3OA 4CFTA 1DMJA 4CDTA 1D1WA 3N60A 4UPTA 3N61A 3FC5A 4CTZA 1M9JA 3JX1A 4D1PA 3JWZA 4UGRA 3B3MA 4D31A 5ADKA 1N2NA 1D1VA 3N62A 4K5KA 4LUWA 4CTVA 4LUXA 4FVZA 5ADDA 5ADJA 2OROA 4D36A 1P6HA 1ED6A 4UGUA 5AGLA 3RQLA 4JSJA 3EBFA 5NSEA 3UFTA 2G6NA 4GQEA 2NSIA 4D3AA 5FVVA 4UGEA 1QW4A 1DM6A 9NSEA 4UGHA 4IMTA 2HX2A 3JWWA 5G69A 3UFRA 5G65A 4CTUA 4JSHA 1FOJA 1ED5A 1R35A 4FW0A 4LWBA 4CU1B 3JX2A 4V3XA 1RS6A 3N6EA 1M7VA 3N6CA 3N6BA 4CAQA 5ADIA 5FVQA 5FVRA 5AGPA 4KCRA 4UGAA 1D1YA 3PNHA 1FOOA 4FVWA 4CAOA 4UQSA 4D3UA 5ADFA 1K2TA 4UH0A 4D7JA 3TYMA 1QW5A 2HX3A 4KCHA 4LWAA 1NODA 4K5JA 3Q99A 3N69A 1P6LA 3NLRA 5ADMA 4KCOA 4UGLA 4UGVA 4CU1A 4V3VA 4CAPA 1DM7A 3NLGA 4UPMA 4UPPA 4K5HA 4UH7A 1P6JA 3NLWA 4UGPA 4KCNA 4UG7A 3HSNA 4UH9A 4UG6A 5ADGA 2G6MA 4D7HA 1M8EA 3PNEA 3RQNA 1ZVLA 3N5PA 3HSOA 4UGTA 3UFWA 4JSIA 3JWUA 3PNFA 3N5XA 1FOLA 4JSMA 3JWSA 4JSEA 3RQMA 4D39A 4KCKA 4CX6A 3E6TA 3NLKA 4UGWA 4UGFA 4UH1A 5G6GA 5G6CA 3E67A 4CTWA 4D37A 4C39A 4UGMA 1Q2OA 3RQOA 4CX4A 4D3BA 3N5ZA 4D3VA 3NLHA 3RQPA 4JS9A 2ORPA 3N5YA 2BHJA 3EAHA 5FVSA 3NLMA 3JWXA 1ZVIA 3N63A 3JX4A 4D1OA 1FOPA 4IMUA 4JSLA 3JT5A 4K5DA 3N67A 3N2RA 3DWJA 1ZZUA 4V3UA 3JX3A 3N5QA 1QW6A 3NLFA 2ORTA 5FVOA 4FVYA 3NLYA 4V3YA 3RQKA 4UPSA 3JT6A 2Y37A 3JWTA 3N64A 3JTAA 4KCMA 1FOIA 5AGKA 2ORRA 3N68A 4KCJA 3EAIA 4V3WA 3NOSA 3N6FA 4K5GA 2FLQA 4KCQA 4KCSA 1DF1A 2FBZX 1I83A 4V3ZA 1MMWA 4CWWA 4IMWA 4UPOA 3E6NA 4K5FA 5AD4A 4UH4A 4UH6A 2NODA 4D3NA 1DMIA 4CX5A 4CAMA 3NW2A 2NSEA 3NQSA 3SVPA 3SVQA 4CX3A 3NLQA 4UGQA 4D3JA 5FVWA 4D3MA 5FVYA 5AD6A 4IMXA 1M00A 4CTYA 4CUNA 5ADLA 3UFPA 1DMKA 5AD9A 3JT9A 4EUXA 1P6NA 4CARA 2ORQA 1M9RA 4UH3A 3NLOA 4D30A 5AD5A 1K2SA 3DQRA 4UCHA 5FVTA 4UGGA 1DWWA 5G0OA 1RS8A 5FVZA 1NOSA 8NSEA 3NLTA 4UPQA 3E65A 5G6OA 5G67A 1DWVA 3JX6A 1P6IA 5G0PA 5ADAA 3NLJA 1NOCA 4D3IA 5G6JA 5AGMA 2HX4A 5G6AA 7NSEA 4UGSA 1D1XA 4CWVA 4UG8A 4D33A 3E7IA 5FJ3A
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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