2G6LA

Structure of rat nnos heme domain (bh2 bound) complexed with no
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
418
structure length
409
Chain Sequence
RFLKVKNWETDVVLTDTLHLKSTLETGCTEHICMGSIMLPVRTKDQLFPLAKEFLDQYYSSIKRFGSKAHMDRLEEVNKEIESTSTYQLKDTELIYGAKHAWRNASRCVGRIQWSKLQVFDARDCTTAHGMFNYICNHVKYATNKGNLRSAITIFPQRTDGKHDFRVWNSQLIRYAGYKQPDGSTLGDPANVQFTEICIQQGWKAPRGRFDVLPLLLQANGNDPELFQIPPELVLEVPIRHPKFDWFKDLGLKWYGLPAVSNMLLEIGGLEFSACPFSGWYMGTEIGVRDYCDNSRYNILEEVAKKMDLDMRKTSSLWKDQALVEINIAVLYSFQSDKVTIVDHHSATESFIKHMENEYRCRGGCPADWVWIVPPMSGSITPVFHQEMLNYRLTPSFEYQPDPWNTHVW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of constitutive nitric oxide synthases with diatomic ligands bound.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Nitric-oxide synthase, brain
total genus 127
structure length 409
sequence length 418
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH).
pdb deposition date 2006-02-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 2g6lA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 2g6lA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 2g6lA03
4CX0A 1RS6A 3UFQA 5AD4A 5AGNA 4UGXA 3N5WA 4CTRA 4UH0A 1QOMA 4JSLA 4D1PA 1LZZA 4IMTA 2ORSA 4IMXA 4UGVA 3N5PA 1ZZTA 3TYOA 3HSNA 3UFWA 4UGPA 3EAIA 4UGSA 4D3OA 5AD8A 2G6IA 3JX2A 3E6OA 4UGQA 1VAGA 3N5TA 3NLRA 4CTZA 4KCQA 3JT3A 3TYLA 5FVVA 3UFOA 3NQSA 4V3XA 5G6JA 3JWTA 1D1XA 4KCJA 4UGUA 3RQJA 3NLHA 3N6DA 3JX0A 4CTQA 3N5XA 5AGLA 4CUNA 4CWZA 4CARA 4FVZA 5FVPA 5FVZA 1M8DA 5G68A 3JX1A 3JWYA 4CAOA 2AMOA 4D3AA 4UHAA 3NLTA 4UH1A 3N5RA 3PNHA 3TYNA 1M00A 4C39A 4CAQA 1RS7A 5G69A 4D2ZA 1M9TA 3N6GA 4D3BA 3N64A 5G6OA 1FOPA 4NSEA 4CWXA 5NSEA 4KCPA 1R35A 3DQSA 3DQRA 4KCLA 4JSJA 4UGAA 5G0NA 4D3VA 4UGHA 3DQTA 1M9MA 4K5FA 4UPNA 3RQMA 4CVGA 4V3ZA 3E7GA 2AN2A 4D3JA 3UFPA 4K5IA 2G6NA 1M9KA 1NSIA 4UGJA 5FW0A 4CTUA 3NOSA 5ADNA 4K5EA 8NSEA 4UGNA 5FVRA 4CANA 5FJ2A 4UG6A 3RQNA 5G66A 3E6TA 4UPPA 1K2TA 4CAMA 2NSIA 4CULA 1MMWA 4FVYA 4CTYA 4LUWA 5G6EA 4UH2A 4UH8A 1DF1A 3NLYA 4D34A 1M8EA 4UQRA 1DWWA 1JWKA 5G67A 4D39A 4D7JA 4EUXA 4D3TA 1OM5A 4UPOA 4D3UA 2G6JA 4UGGA 2FBZX 3DWJA 4D2YA 4K5HA 4UPQA 1QWCA 1M7ZA 6NSEA 1MMVA 4D1OA 4UG7A 1M8HA 3JT5A 3N5QA 4KCSA 4D7IA 5G6FA 3E68A 5G6IA 2HX2A 1ZZUA 4UG9A 5AD5A 4FVWA 4UH5A 1FOIA 3N6AA 1DM8A 3JT9A 4UGKA 4D36A 3NLXA 1ZVLA 3NLWA 5FVQA 2BHJA 2ORRA 3NLVA 2G6KA 5FVWA 3EBFA 1QW4A 4JSMA 5ADEA 2NOSA 4UPSA 3B3OA 4UGBA 4CTVA 1DMIA 5AD6A 1D0CA 5ADAA 3N65A 3NLKA 5ADIA 4V3YA 4UPTA 1D1VA 4CX3A 1P6KA 3EAHA 4CU1A 1NODA 3RQPA 3NLIA 2ORTA 3NLEA 4CTWA 2G6HA 4UGYA 3RQKA 5FVYA 1P6MA 4C3AA 4UG8A 4K5KA 1D0OA 1ZVIA 4UGWA 3E6NA 4GQEA 4LWBA 4JSKA 4KCOA 3JWSA 2G6MA 4JSIA 3Q9AA 5FJ3A 3HSOA 4UGLA 1QW5A 1P6IA 5G6AA 4UH9A 3N62A 5G6PA 4CU1B 5ADMA 4UPRA 3NW2A 3NLUA 3HSPA 4UGZA 5FVSA 3NLGA 3JWVA 3NM0A 1FOLA 1NOCA 1ZZSA 4D32A 4D7OA 4D31A 7NSEA 4CX2A 4D33A 3NLOA 4K5GA 4UGIA 2FC2A 4CUMA 4UGRA 4LUXA 4CDTA 2AN0A 4UH6A 3N68A 5AGOA 1M9RA 3N5SA 4FVXA 1ED4A 1DD7A 3N6CA 5ADFA 5AD7A 4CX5A 3B3MA 1OM4A 4CWWA 2FC1A 1ED5A 4D38A 5FVTA 5ADBA 5ADGA 1VAFA 4UGFA 4IMUA 4UGEA 1DWXA 3N6EA 4CAPA 2ORPA 5G6CA 3B3PA 3E65A 4D3NA 3N63A 4JSFA 4CX7A 4FW0A 4D3IA 3N5VA 1D1YA 1FOJA 3JX5A 4KCMA 4CTXA 4V3WA 3SVPA 3JWUA 3EJ8A 5ADDA 3N69A 3NODA 5AGPA 4K5DA 4JSHA 3NLZA 5AD9A 1RS9A 4D7HA 3Q99A 1DM6A 5G6NA 5G6MA 5ADKA 4UG5A 3N60A 3UFUA 3JT4A 4KCKA 2ORQA 4UCHA 1RS8A 1P6HA 1I83A 9NSEA 5FVUA 4LWAA 3NLNA 3N67A 4D30A 1N2NA 3NLPA 3E67A 4CWVA 1M7VA 5G0PA 2HX4A 4UH4A 2NSEA 1P6LA 5G6QA 5G6LA 1DMKA 4UGMA 1MJTA 3PNGA 4NOSA 4CX6A 1NOSA 3E7SA 3N66A 1P6JA 4CFTA 2Y37A 5G6BA 3NNYA 4CTPA 3JX4A 4KCHA 4JS9A 1QW6A 4D37A 4UQSA 4UPMA 5ADLA 4CX1A 2G6LA 3EBDA 3UFVA 3N6BA 3NLMA 4D35A 2NODA 3E6LA 3JWWA 3N5ZA 4UGOA 1FOOA 3RQOA 3NLQA 3E7SB 4KCRA 5G6HA 5ADJA 1LZXA 5AGKA 4CFTB 3SVQA 2OROA 2G6OA 3E7MA 3NLJA 1D1WA 4D1NA 3JTAA 4UH3A 1DWVA 2FLQA 1JWJA 1NSEA 3NSEA 3E7IA 1K2UA 1DMJA 1P6NA 1ZZQA 4IMWA 4UGTA 3UFRA 3E7TA 5G6DA 1K2SA 1M9JA 4CWYA 3JT7A 3JT6A 4D3KA 3N2RA 3PNFA 4V3VA 4V3UA 3JX3A 3JWZA 5FVOA 4CU0A 5G6KA 3N61A 1M8IA 3JWXA 5AGMA 4UH7A 3TYMA 3B3NA 4KCNA 4UGDA 1M9QA 5FVXA 3NLFA 5G65A 1DM7A 5G0OA 3N5YA 1Q2OA 3JX6A 3PNEA 5ADCA 3NLDA 4JSGA 3RQLA 3UFSA 4K5JA 1K2RA 3NNZA 4JSEA 4UGCA 1ZZRA 4CX4A 4CTTA 3N6FA 5G6GA 3JT8A 3UFTA 1ED6A 3FC5A 4IMSA 4KCIA 4D3MA 2HX3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CX0A 1RS6A 3UFQA 5AD4A 5AGNA 4UGXA 3N5WA 4CTRA 4UH0A 1QOMA 4JSLA 4D1PA 1LZZA 4IMTA 2ORSA 4IMXA 4UGVA 3N5PA 1ZZTA 3TYOA 3HSNA 3UFWA 4UGPA 3EAIA 4UGSA 4D3OA 5AD8A 2G6IA 3JX2A 3E6OA 4UGQA 1VAGA 3N5TA 3NLRA 4CTZA 4KCQA 3JT3A 3TYLA 5FVVA 3UFOA 3NQSA 4V3XA 5G6JA 3JWTA 1D1XA 4KCJA 4UGUA 3RQJA 3NLHA 3N6DA 3JX0A 4CTQA 3N5XA 5AGLA 4CUNA 4CWZA 4CARA 4FVZA 5FVPA 5FVZA 1M8DA 5G68A 3JX1A 3JWYA 4CAOA 2AMOA 4D3AA 4UHAA 3NLTA 4UH1A 3N5RA 3PNHA 3TYNA 1M00A 4C39A 4CAQA 1RS7A 5G69A 4D2ZA 1M9TA 3N6GA 4D3BA 3N64A 5G6OA 1FOPA 4NSEA 4CWXA 5NSEA 4KCPA 1R35A 3DQSA 3DQRA 4KCLA 4JSJA 4UGAA 5G0NA 4D3VA 4UGHA 3DQTA 1M9MA 4K5FA 4UPNA 3RQMA 4CVGA 4V3ZA 3E7GA 2AN2A 4D3JA 3UFPA 4K5IA 2G6NA 1M9KA 1NSIA 4UGJA 5FW0A 4CTUA 3NOSA 5ADNA 4K5EA 8NSEA 4UGNA 5FVRA 4CANA 5FJ2A 4UG6A 3RQNA 5G66A 3E6TA 4UPPA 1K2TA 4CAMA 2NSIA 4CULA 1MMWA 4FVYA 4CTYA 4LUWA 5G6EA 4UH2A 4UH8A 1DF1A 3NLYA 4D34A 1M8EA 4UQRA 1DWWA 1JWKA 5G67A 4D39A 4D7JA 4EUXA 4D3TA 1OM5A 4UPOA 4D3UA 2G6JA 4UGGA 2FBZX 3DWJA 4D2YA 4K5HA 4UPQA 1QWCA 1M7ZA 6NSEA 1MMVA 4D1OA 4UG7A 1M8HA 3JT5A 3N5QA 4KCSA 4D7IA 5G6FA 3E68A 5G6IA 2HX2A 1ZZUA 4UG9A 5AD5A 4FVWA 4UH5A 1FOIA 3N6AA 1DM8A 3JT9A 4UGKA 4D36A 3NLXA 1ZVLA 3NLWA 5FVQA 2BHJA 2ORRA 3NLVA 2G6KA 5FVWA 3EBFA 1QW4A 4JSMA 5ADEA 2NOSA 4UPSA 3B3OA 4UGBA 4CTVA 1DMIA 5AD6A 1D0CA 5ADAA 3N65A 3NLKA 5ADIA 4V3YA 4UPTA 1D1VA 4CX3A 1P6KA 3EAHA 4CU1A 1NODA 3RQPA 3NLIA 2ORTA 3NLEA 4CTWA 2G6HA 4UGYA 3RQKA 5FVYA 1P6MA 4C3AA 4UG8A 4K5KA 1D0OA 1ZVIA 4UGWA 3E6NA 4GQEA 4LWBA 4JSKA 4KCOA 3JWSA 2G6MA 4JSIA 3Q9AA 5FJ3A 3HSOA 4UGLA 1QW5A 1P6IA 5G6AA 4UH9A 3N62A 5G6PA 4CU1B 5ADMA 4UPRA 3NW2A 3NLUA 3HSPA 4UGZA 5FVSA 3NLGA 3JWVA 3NM0A 1FOLA 1NOCA 1ZZSA 4D32A 4D7OA 4D31A 7NSEA 4CX2A 4D33A 3NLOA 4K5GA 4UGIA 2FC2A 4CUMA 4UGRA 4LUXA 4CDTA 2AN0A 4UH6A 3N68A 5AGOA 1M9RA 3N5SA 4FVXA 1ED4A 1DD7A 3N6CA 5ADFA 5AD7A 4CX5A 3B3MA 1OM4A 4CWWA 2FC1A 1ED5A 4D38A 5FVTA 5ADBA 5ADGA 1VAFA 4UGFA 4IMUA 4UGEA 1DWXA 3N6EA 4CAPA 2ORPA 5G6CA 3B3PA 3E65A 4D3NA 3N63A 4JSFA 4CX7A 4FW0A 4D3IA 3N5VA 1D1YA 1FOJA 3JX5A 4KCMA 4CTXA 4V3WA 3SVPA 3JWUA 3EJ8A 5ADDA 3N69A 3NODA 5AGPA 4K5DA 4JSHA 3NLZA 5AD9A 1RS9A 4D7HA 3Q99A 1DM6A 5G6NA 5G6MA 5ADKA 4UG5A 3N60A 3UFUA 3JT4A 4KCKA 2ORQA 4UCHA 1RS8A 1P6HA 1I83A 9NSEA 5FVUA 4LWAA 3NLNA 3N67A 4D30A 1N2NA 3NLPA 3E67A 4CWVA 1M7VA 5G0PA 2HX4A 4UH4A 2NSEA 1P6LA 5G6QA 5G6LA 1DMKA 4UGMA 1MJTA 3PNGA 4NOSA 4CX6A 1NOSA 3E7SA 3N66A 1P6JA 4CFTA 2Y37A 5G6BA 3NNYA 4CTPA 3JX4A 4KCHA 4JS9A 1QW6A 4D37A 4UQSA 4UPMA 5ADLA 4CX1A 2G6LA 3EBDA 3UFVA 3N6BA 3NLMA 4D35A 2NODA 3E6LA 3JWWA 3N5ZA 4UGOA 1FOOA 3RQOA 3NLQA 3E7SB 4KCRA 5G6HA 5ADJA 1LZXA 5AGKA 4CFTB 3SVQA 2OROA 2G6OA 3E7MA 3NLJA 1D1WA 4D1NA 3JTAA 4UH3A 1DWVA 2FLQA 1JWJA 1NSEA 3NSEA 3E7IA 1K2UA 1DMJA 1P6NA 1ZZQA 4IMWA 4UGTA 3UFRA 3E7TA 5G6DA 1K2SA 1M9JA 4CWYA 3JT7A 3JT6A 4D3KA 3N2RA 3PNFA 4V3VA 4V3UA 3JX3A 3JWZA 5FVOA 4CU0A 5G6KA 3N61A 1M8IA 3JWXA 5AGMA 4UH7A 3TYMA 3B3NA 4KCNA 4UGDA 1M9QA 5FVXA 3NLFA 5G65A 1DM7A 5G0OA 3N5YA 1Q2OA 3JX6A 3PNEA 5ADCA 3NLDA 4JSGA 3RQLA 3UFSA 4K5JA 1K2RA 3NNZA 4JSEA 4UGCA 1ZZRA 4CX4A 4CTTA 3N6FA 5G6GA 3JT8A 3UFTA 1ED6A 3FC5A 4IMSA 4KCIA 4D3MA 2HX3A
chains in the Genus database with same CATH topology
4CX0A 1RS6A 3UFQA 5AD4A 5AGNA 4UGXA 3N5WA 4CTRA 4UH0A 1QOMA 4JSLA 4D1PA 1LZZA 4IMTA 2ORSA 4IMXA 4UGVA 3N5PA 1ZZTA 3TYOA 3HSNA 3UFWA 4UGPA 3EAIA 4UGSA 4D3OA 5AD8A 2G6IA 3JX2A 3E6OA 4UGQA 1VAGA 3N5TA 3NLRA 4CTZA 4KCQA 3JT3A 3TYLA 5FVVA 3UFOA 3NQSA 4V3XA 5G6JA 3JWTA 1D1XA 4KCJA 4UGUA 3RQJA 3NLHA 3N6DA 3JX0A 4CTQA 3N5XA 5AGLA 4CUNA 4CWZA 4CARA 4FVZA 5FVPA 5FVZA 1M8DA 5G68A 3JX1A 3JWYA 4CAOA 2AMOA 4D3AA 4UHAA 3NLTA 4UH1A 3N5RA 3PNHA 3TYNA 1M00A 4C39A 4CAQA 1RS7A 5G69A 4D2ZA 1M9TA 3N6GA 4D3BA 3N64A 5G6OA 1FOPA 4NSEA 4CWXA 5NSEA 4KCPA 1R35A 3DQSA 3DQRA 4KCLA 4JSJA 4UGAA 5G0NA 4D3VA 4UGHA 3DQTA 1M9MA 4K5FA 4UPNA 3RQMA 4CVGA 4V3ZA 3E7GA 2AN2A 4D3JA 3UFPA 4K5IA 2G6NA 1M9KA 1NSIA 4UGJA 5FW0A 4CTUA 3NOSA 5ADNA 4K5EA 8NSEA 4UGNA 5FVRA 4CANA 5FJ2A 4UG6A 3RQNA 5G66A 3E6TA 4UPPA 1K2TA 4CAMA 2NSIA 4CULA 1MMWA 4FVYA 4CTYA 4LUWA 5G6EA 4UH2A 4UH8A 1DF1A 3NLYA 4D34A 1M8EA 4UQRA 1DWWA 1JWKA 5G67A 4D39A 4D7JA 4EUXA 4D3TA 1OM5A 4UPOA 4D3UA 2G6JA 4UGGA 2FBZX 3DWJA 4D2YA 4K5HA 4UPQA 1QWCA 1M7ZA 6NSEA 1MMVA 4D1OA 4UG7A 1M8HA 3JT5A 3N5QA 4KCSA 4D7IA 5G6FA 3E68A 5G6IA 2HX2A 1ZZUA 4UG9A 5AD5A 4FVWA 4UH5A 1FOIA 3N6AA 1DM8A 3JT9A 4UGKA 4D36A 3NLXA 1ZVLA 3NLWA 5FVQA 2BHJA 2ORRA 3NLVA 2G6KA 5FVWA 3EBFA 1QW4A 4JSMA 5ADEA 2NOSA 4UPSA 3B3OA 4UGBA 4CTVA 1DMIA 5AD6A 1D0CA 5ADAA 3N65A 3NLKA 5ADIA 4V3YA 4UPTA 1D1VA 4CX3A 1P6KA 3EAHA 4CU1A 1NODA 3RQPA 3NLIA 2ORTA 3NLEA 4CTWA 2G6HA 4UGYA 3RQKA 5FVYA 1P6MA 4C3AA 4UG8A 4K5KA 1D0OA 1ZVIA 4UGWA 3E6NA 4GQEA 4LWBA 4JSKA 4KCOA 3JWSA 2G6MA 4JSIA 3Q9AA 5FJ3A 3HSOA 4UGLA 1QW5A 1P6IA 5G6AA 4UH9A 3N62A 5G6PA 4CU1B 5ADMA 4UPRA 3NW2A 3NLUA 3HSPA 4UGZA 5FVSA 3NLGA 3JWVA 3NM0A 1FOLA 1NOCA 1ZZSA 4D32A 4D7OA 4D31A 7NSEA 4CX2A 4D33A 3NLOA 4K5GA 4UGIA 2FC2A 4CUMA 4UGRA 4LUXA 4CDTA 2AN0A 4UH6A 3N68A 5AGOA 1M9RA 3N5SA 4FVXA 1ED4A 1DD7A 3N6CA 5ADFA 5AD7A 4CX5A 3B3MA 1OM4A 4CWWA 2FC1A 1ED5A 4D38A 5FVTA 5ADBA 5ADGA 1VAFA 4UGFA 4IMUA 4UGEA 1DWXA 3N6EA 4CAPA 2ORPA 5G6CA 3B3PA 3E65A 4D3NA 3N63A 4JSFA 4CX7A 4FW0A 4D3IA 3N5VA 1D1YA 1FOJA 3JX5A 4KCMA 4CTXA 4V3WA 3SVPA 3JWUA 3EJ8A 5ADDA 3N69A 3NODA 5AGPA 4K5DA 4JSHA 3NLZA 5AD9A 1RS9A 4D7HA 3Q99A 1DM6A 5G6NA 5G6MA 5ADKA 4UG5A 3N60A 3UFUA 3JT4A 4KCKA 2ORQA 4UCHA 1RS8A 1P6HA 1I83A 9NSEA 5FVUA 4LWAA 3NLNA 3N67A 4D30A 1N2NA 3NLPA 3E67A 4CWVA 1M7VA 5G0PA 2HX4A 4UH4A 2NSEA 1P6LA 5G6QA 5G6LA 1DMKA 4UGMA 1MJTA 3PNGA 4NOSA 4CX6A 1NOSA 3E7SA 3N66A 1P6JA 4CFTA 2Y37A 5G6BA 3NNYA 4CTPA 3JX4A 4KCHA 4JS9A 1QW6A 4D37A 4UQSA 4UPMA 5ADLA 4CX1A 2G6LA 3EBDA 3UFVA 3N6BA 3NLMA 4D35A 2NODA 3E6LA 3JWWA 3N5ZA 4UGOA 1FOOA 3RQOA 3NLQA 3E7SB 4KCRA 5G6HA 5ADJA 1LZXA 5AGKA 4CFTB 3SVQA 2OROA 2G6OA 3E7MA 3NLJA 1D1WA 4D1NA 3JTAA 4UH3A 1DWVA 2FLQA 1JWJA 1NSEA 3NSEA 3E7IA 1K2UA 1DMJA 1P6NA 1ZZQA 4IMWA 4UGTA 3UFRA 3E7TA 5G6DA 1K2SA 1M9JA 4CWYA 3JT7A 3JT6A 4D3KA 3N2RA 3PNFA 4V3VA 4V3UA 3JX3A 3JWZA 5FVOA 4CU0A 5G6KA 3N61A 1M8IA 3JWXA 5AGMA 4UH7A 3TYMA 3B3NA 4KCNA 4UGDA 1M9QA 5FVXA 3NLFA 5G65A 1DM7A 5G0OA 3N5YA 1Q2OA 3JX6A 3PNEA 5ADCA 3NLDA 4JSGA 3RQLA 3UFSA 4K5JA 1K2RA 3NNZA 4JSEA 4UGCA 1ZZRA 4CX4A 4CTTA 3N6FA 5G6GA 3JT8A 3UFTA 1ED6A 3FC5A 4IMSA 4KCIA 4D3MA 2HX3A
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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