The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
125
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sequence length |
418
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structure length |
407
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Chain Sequence |
RFLKVKNWETDVVLTDTLHLKSTLETGCTEHICMGSIMLPTKDQLFPLAKEFLDQYYSSIKRFGSKAHMDRLEEVNKEIESTSTYQLKDTELIYGAKHAWRNASRCVGRIQWSKLQVFDARDCTTAHGMFNYICNHVKYATNKGNLRSAITIFPQRTDGKHDFRVWNSQLIRYAGYKQPDGSTLGDPANVQFTEICIQQGWKAPRGRFDVLPLLLQANGNDPELFQIPPELVLEVPIRHPKFDWFKDLGLKWYGLPAVSNMLLEIGGLEFSACPFSGWYMGTEIGVRDYCDNSRYNILEEVAKKMDLDMRKTSSLWKDQALVEINIAVLYSFQSDKVTIVDHHSATESFIKHMENEYRCRGGCPADWVWIVPPMSGSITPVFHQEMLNYRLTPSFEYQPDPWNTHVW
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Exploration of the Active Site of Neuronal Nitric Oxide Synthase by the Design and Synthesis of Pyrrolidinomethyl 2-Aminopyridine Derivatives.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Nitric oxide synthase, brain
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| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Rattus norvegicus
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| total genus |
125
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| structure length |
407
|
| sequence length |
418
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| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH). |
| pdb deposition date | 2010-06-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02898 | NO_synthase | Nitric oxide synthase, oxygenase domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 | Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 | Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 | Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CX3 A; 1ZZS A; 4KCS A; 4CU1 B; 4KCQ A; 4CTU A; 3NLM A; 3RQL A; 3PNH A; 4K5K A; 3DWJ A; 3JX1 A; 4CU0 A; 3JWZ A; 4D2Z A; 5AGP A; 5G0O A; 5FVZ A; 3TYN A; 4UGZ A; 3N5Z A; 5AGL A; 3UFT A; 2AMO A; 4IMU A; 5FVX A; 2G6K A; 2FLQ A; 1RS9 A; 4UH0 A; 4C3A A; 4UGD A; 5ADG A; 4JSK A; 4UH4 A; 4JSE A; 1M9R A; 1P6K A; 3EBF A; 1M9K A; 4EUX A; 3N62 A; 4KCL A; 2FC1 A; 3NSE A; 5ADA A; 5G0P A; 5G6A A; 3N5Q A; 3HSN A; 3JX5 A; 4UGS A; 4UH6 A; 5G6G A; 5FVT A; 1ZVL A; 3E6O A; 1RS8 A; 5G65 A; 5G6I A; 3N6B A; 5FVU A; 4C39 A; 3RQN A; 4JSM A; 1ZZU A; 1QWC A; 4IMS A; 3Q99 A; 5ADL A; 3JT9 A; 4D38 A; 1NOC A; 1M00 A; 3N63 A; 2G6M A; 3E6L A; 3N5R A; 3NOD A; 5FJ2 A; 3NLE A; 5G6K A; 5G6C A; 3N66 A; 3RQM A; 1FOL A; 3NLX A; 1K2U A; 2ORT A; 1DM6 A; 3NLV A; 4UPS A; 5AD6 A; 1QOM A; 2ORR A; 4V3V A; 2AN2 A; 2BHJ A; 3JT4 A; 4CTR A; 4CWY A; 3N61 A; 4UGR A; 3PNF A; 5G6L A; 3NLF A; 4UPR A; 3NLO A; 5G67 A; 5FJ3 A; 2ORP A; 1M8H A; 2AN0 A; 2G6H A; 2G6J A; 5AD9 A; 3RQP A; 5G0N A; 5FVQ A; 4CX5 A; 1VAG A; 9NSE A; 5G6J A; 4D3N A; 4D34 A; 5AD8 A; 1DM7 A; 4FVW A; 4D7O A; 4CUN A; 2NOD A; 2G6L A; 5G68 A; 4NSE A; 4UGF A; 4UG6 A; 2ORS A; 3JX2 A; 4UGT A; 4UGC A; 3UFR A; 1LZZ A; 1ZVI A; 4CUM A; 1M8D A; 1D1Y A; 4D33 A; 4CAQ A; 4K5J A; 3NLY A; 4D1P A; 4LWB A; 4UGK A; 1MMV A; 1OM4 A; 4UPQ A; 3N2R A; 4CWZ A; 4UPT A; 1M9T A; 4D32 A; 1M9M A; 3NOS A; 4V3X A; 4CTP A; 2NSI A; 4JS9 A; 1ZZT A; 3RQO A; 3E7S A; 1FOJ A; 1LZX A; 1DWW A; 5G6O A; 4CWX A; 3UFU A; 4UGU A; 4D3O A; 4FW0 A; 4D7I A; 4CTW A; 4K5E A; 4GQE A; 5ADK A; 4UGN A; 3JT8 A; 1RS6 A; 3N6D A; 3NNY A; 1JWJ A; 4UGG A; 3N64 A; 4UGJ A; 3NLG A; 4KCP A; 1FOP A; 1D0C A; 4CWW A; 1P6L A; 3PNG A; 5G6H A; 3SVQ A; 4KCR A; 4JSJ A; 1K2R A; 1K2T A; 3N5W A; 1P6H A; 3JTA A; 4IMT A; 4UH3 A; 2FC2 A; 4CTX A; 4CTQ A; 3NLI A; 4CAP A; 5FVR A; 2G6I A; 3E6N A; 3DQR A; 5ADD A; 4UPO A; 1RS7 A; 3NLN A; 4UG7 A; 4CAM A; 1NOS A; 3NNZ A; 5FVO A; 5FVY A; 4UQR A; 1DF1 A; 4UH1 A; 3DQS A; 1I83 A; 1R35 A; 4CVG A; 3N65 A; 4UH7 A; 1VAF A; 1DM8 A; 3PNE A; 3N5T A; 4D35 A; 4LUW A; 4FVX A; 4CU1 A; 3NLT A; 1P6I A; 4V3Z A; 1ED6 A; 3EAH A; 3EAI A; 3N6G A; 3FC5 A; 1ZZR A; 5ADJ A; 4UGA A; 4CFT A; 3NLW A; 5AGM A; 3JT5 A; 3E65 A; 1DD7 A; 1NSE A; 2ORO A; 3JX0 A; 4CX7 A; 1D0O A; 1DMJ A; 3E7I A; 4UHA A; 4UH5 A; 1M7V A; 3N69 A; 1DMK A; 1QW5 A; 4K5D A; 4D3I A; 3NLD A; 3NLJ A; 4UGM A; 4D3B A; 3B3N A; 5G6Q A; 4JSG A; 4KCM A; 4D36 A; 4UGY A; 3N5X A; 4UGW A; 4UG5 A; 5FW0 A; 4CAR A; 3E68 A; 4JSI A; 4CDT A; 1OM5 A; 4K5H A; 4CUL A; 5G6P A; 3B3P A; 4UPM A; 4NOS A; 5G6B A; 3E6T A; 5G6D A; 7NSE A; 3E7G A; 1ED5 A; 4CX2 A; 5ADE A; 3HSP A; 3EBD A; 4V3W A; 3JT7 A; 3JWU A; 3N6E A; 3EJ8 A; 3E67 A; 4D3M A; 4UGP A; 4V3Y A; 1D1V A; 1FOO A; 5ADI A; 3JWV A; 3TYM A; 1QW6 A; 1K2S A; 5G69 A; 6NSE A; 4JSF A; 4UGB A; 1FOI A; 3SVP A; 4CX1 A; 3NM0 A; 1ED4 A; 4D3J A; 4K5G A; 4CTY A; 4CTZ A; 5G66 A; 5NSE A; 2HX3 A; 5AGK A; 4D7J A; 3NLR A; 4KCH A; 4UGI A; 1M8I A; 3JT6 A; 1DWX A; 1NOD A; 5AGN A; 4CAO A; 4D3A A; 4D2Y A; 3N68 A; 3N5P A; 4UGO A; 3HSO A; 1M9J A; 4CFT B; 1ZZQ A; 2NSE A; 3JX6 A; 4UGH A; 2HX4 A; 4UGE A; 4D3U A; 4UCH A; 5AD7 A; 4FVY A; 5FVW A; 1MMW A; 3UFW A; 5AD5 A; 3N5V A; 1NSI A; 5AGO A; 3NW2 A; 3N60 A; 4KCO A; 5G6F A; 2G6N A; 4CX0 A; 8NSE A; 3TYL A; 4KCN A; 1QW4 A; 4K5I A; 5G6E A; 3NLP A; 1P6M A; 1Q2O A; 4D31 A; 4UG9 A; 5FVP A; 3Q9A A; 4KCI A; 2NOS A; 4V3U A; 3N6F A; 3UFQ A; 1M8E A; 4UH2 A; 4D37 A; 3UFS A; 5G6N A; 4UGQ A; 2ORQ A; 4D30 A; 4D3K A; 3NLK A; 2FBZ X; 4KCK A; 4IMX A; 4D3T A; 2HX2 A; 4KCJ A; 4UGL A; 1MJT A; 4UH9 A; 3JT3 A; 4D3V A; 3UFV A; 4CAN A; 3RQK A; 4IMW A; 4UGX A; 3NLQ A; 4JSL A; 1M9Q A; 4UH8 A; 4CX6 A; 4UGV A; 3E7S B; 5ADM A; 3E7T A; 3RQJ A; 3B3O A; 1M7Z A; 4JSH A; 5ADN A; 1D1W A; 5G6M A; 3JX3 A; 5ADB A; 3JWS A; 3E7M A; 3N6A A; 1D1X A; 1P6N A; 3JWT A; 3DQT A; 3UFP A; 4D1N A; 3JX4 A; 4CWV A; 5FVS A; 1JWK A; 5ADC A; 3NLH A; 3N5Y A; 4UG8 A; 4LWA A; 4CX4 A; 4D7H A; 4CTV A; 4LUX A; 4UQS A; 3TYO A; 3N67 A; 5ADF A; 3JWX A; 4K5F A; 5FVV A; 1P6J A; 3JWY A; 1DWV A; 4FVZ A; 3NQS A; 3UFO A; 3NLZ A; 3N6C A; 3NLU A; 4D1O A; 3JWW A; 5AD4 A; 4UPN A; 4UPP A; 4D39 A; 1DMI A; 3N5S A; 4CTT A; 1N2N A; 2G6O A; 3B3M A; 2Y37 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4CX3 A; 1ZZS A; 4KCS A; 4CU1 B; 4KCQ A; 4CTU A; 3NLM A; 3RQL A; 3PNH A; 4K5K A; 3DWJ A; 3JX1 A; 4CU0 A; 3JWZ A; 4D2Z A; 5AGP A; 5G0O A; 5FVZ A; 3TYN A; 4UGZ A; 3N5Z A; 5AGL A; 3UFT A; 2AMO A; 4IMU A; 5FVX A; 2G6K A; 2FLQ A; 1RS9 A; 4UH0 A; 4C3A A; 4UGD A; 5ADG A; 4JSK A; 4UH4 A; 4JSE A; 1M9R A; 1P6K A; 3EBF A; 1M9K A; 4EUX A; 3N62 A; 4KCL A; 2FC1 A; 3NSE A; 5ADA A; 5G0P A; 5G6A A; 3N5Q A; 3HSN A; 3JX5 A; 4UGS A; 4UH6 A; 5G6G A; 5FVT A; 1ZVL A; 3E6O A; 1RS8 A; 5G65 A; 5G6I A; 3N6B A; 5FVU A; 4C39 A; 3RQN A; 4JSM A; 1ZZU A; 1QWC A; 4IMS A; 3Q99 A; 5ADL A; 3JT9 A; 4D38 A; 1NOC A; 1M00 A; 3N63 A; 2G6M A; 3E6L A; 3N5R A; 3NOD A; 5FJ2 A; 3NLE A; 5G6K A; 5G6C A; 3N66 A; 3RQM A; 1FOL A; 3NLX A; 1K2U A; 2ORT A; 1DM6 A; 3NLV A; 4UPS A; 5AD6 A; 1QOM A; 2ORR A; 4V3V A; 2AN2 A; 2BHJ A; 3JT4 A; 4CTR A; 4CWY A; 3N61 A; 4UGR A; 3PNF A; 5G6L A; 3NLF A; 4UPR A; 3NLO A; 5G67 A; 5FJ3 A; 2ORP A; 1M8H A; 2AN0 A; 2G6H A; 2G6J A; 5AD9 A; 3RQP A; 5G0N A; 5FVQ A; 4CX5 A; 1VAG A; 9NSE A; 5G6J A; 4D3N A; 4D34 A; 5AD8 A; 1DM7 A; 4FVW A; 4D7O A; 4CUN A; 2NOD A; 2G6L A; 5G68 A; 4NSE A; 4UGF A; 4UG6 A; 2ORS A; 3JX2 A; 4UGT A; 4UGC A; 3UFR A; 1LZZ A; 1ZVI A; 4CUM A; 1M8D A; 1D1Y A; 4D33 A; 4CAQ A; 4K5J A; 3NLY A; 4D1P A; 4LWB A; 4UGK A; 1MMV A; 1OM4 A; 4UPQ A; 3N2R A; 4CWZ A; 4UPT A; 1M9T A; 4D32 A; 1M9M A; 3NOS A; 4V3X A; 4CTP A; 2NSI A; 4JS9 A; 1ZZT A; 3RQO A; 3E7S A; 1FOJ A; 1LZX A; 1DWW A; 5G6O A; 4CWX A; 3UFU A; 4UGU A; 4D3O A; 4FW0 A; 4D7I A; 4CTW A; 4K5E A; 4GQE A; 5ADK A; 4UGN A; 3JT8 A; 1RS6 A; 3N6D A; 3NNY A; 1JWJ A; 4UGG A; 3N64 A; 4UGJ A; 3NLG A; 4KCP A; 1FOP A; 1D0C A; 4CWW A; 1P6L A; 3PNG A; 5G6H A; 3SVQ A; 4KCR A; 4JSJ A; 1K2R A; 1K2T A; 3N5W A; 1P6H A; 3JTA A; 4IMT A; 4UH3 A; 2FC2 A; 4CTX A; 4CTQ A; 3NLI A; 4CAP A; 5FVR A; 2G6I A; 3E6N A; 3DQR A; 5ADD A; 4UPO A; 1RS7 A; 3NLN A; 4UG7 A; 4CAM A; 1NOS A; 3NNZ A; 5FVO A; 5FVY A; 4UQR A; 1DF1 A; 4UH1 A; 3DQS A; 1I83 A; 1R35 A; 4CVG A; 3N65 A; 4UH7 A; 1VAF A; 1DM8 A; 3PNE A; 3N5T A; 4D35 A; 4LUW A; 4FVX A; 4CU1 A; 3NLT A; 1P6I A; 4V3Z A; 1ED6 A; 3EAH A; 3EAI A; 3N6G A; 3FC5 A; 1ZZR A; 5ADJ A; 4UGA A; 4CFT A; 3NLW A; 5AGM A; 3JT5 A; 3E65 A; 1DD7 A; 1NSE A; 2ORO A; 3JX0 A; 4CX7 A; 1D0O A; 1DMJ A; 3E7I A; 4UHA A; 4UH5 A; 1M7V A; 3N69 A; 1DMK A; 1QW5 A; 4K5D A; 4D3I A; 3NLD A; 3NLJ A; 4UGM A; 4D3B A; 3B3N A; 5G6Q A; 4JSG A; 4KCM A; 4D36 A; 4UGY A; 3N5X A; 4UGW A; 4UG5 A; 5FW0 A; 4CAR A; 3E68 A; 4JSI A; 4CDT A; 1OM5 A; 4K5H A; 4CUL A; 5G6P A; 3B3P A; 4UPM A; 4NOS A; 5G6B A; 3E6T A; 5G6D A; 7NSE A; 3E7G A; 1ED5 A; 4CX2 A; 5ADE A; 3HSP A; 3EBD A; 4V3W A; 3JT7 A; 3JWU A; 3N6E A; 3EJ8 A; 3E67 A; 4D3M A; 4UGP A; 4V3Y A; 1D1V A; 1FOO A; 5ADI A; 3JWV A; 3TYM A; 1QW6 A; 1K2S A; 5G69 A; 6NSE A; 4JSF A; 4UGB A; 1FOI A; 3SVP A; 4CX1 A; 3NM0 A; 1ED4 A; 4D3J A; 4K5G A; 4CTY A; 4CTZ A; 5G66 A; 5NSE A; 2HX3 A; 5AGK A; 4D7J A; 3NLR A; 4KCH A; 4UGI A; 1M8I A; 3JT6 A; 1DWX A; 1NOD A; 5AGN A; 4CAO A; 4D3A A; 4D2Y A; 3N68 A; 3N5P A; 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