4CULA

Structure of bovine endothelial nitric oxide synthase heme domain in complex with 6-acetyl-2-amino-7,7-dimethyl-7,8-dihydropteridin-4(3h)-one
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
416
structure length
385
Chain Sequence
GPKFPRVKNWELGSITYDTLCAQSPAEQLLSQARDFINQYYSSIKRSGSQAHEERLQEVEAEVASTGTYHLRESELVFGAKQAWRNAPRCVGRIQWGKLQVFDARDCSSAQEMFTYICNHIKYATNRGNLRSAITVFPQRAPGRGDFRIWNSQLVRYAGYRQQDGSVRGDPANVEITELCIQHGWTPGNGRFDVLPLLLQAPDEAPELFVLPPELVLEVPLEHPTLEWFAALGLRWYALPAVSNMLLEIGGLEFSAAPFSGWYMSTEIGTRNLCDPHRYNILEDVAVMDLDTRTTSSLWKDKAAVEINLAVLHSFQLAKVTIVDHHAATVSFMKHLDNEQKARGGCPADWAWIVPPISGSLTPVFHQEMVNYILSPAFRYQPDPW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Communication between the Zinc and Tetrahydrobiopterin Binding Sites in Nitric Oxide Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE, ENDOTHELIAL
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bos taurus
total genus 127
structure length 385
sequence length 416
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.39: Nitric-oxide synthase (NADPH).
pdb deposition date 2014-03-20
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 4culA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 4culA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 4culA03
4D3NA 1P6NA 4D3VA 4CFTB 3JWSA 3NLOA 4FVYA 3NLJA 4K5HA 4CX1A 4D35A 4D31A 1M8EA 1R35A 3N6BA 4CAPA 1FOLA 4EUXA 1RS8A 3JWUA 3N5VA 4UPQA 2NSEA 7NSEA 4CTYA 5AD7A 3UFOA 4K5DA 4LWBA 5AD5A 3E68A 1M8DA 3E6NA 3N5YA 3N69A 3N60A 1ZZQA 6NSEA 5FVVA 1DF1A 1M8HA 1M9QA 4JSJA 4UGUA 3EAHA 2AMOA 2G6LA 3EBFA 3NLIA 3N64A 5ADKA 1K2TA 4JSFA 5ADEA 5G67A 3N6EA 3UFVA 4KCRA 3PNEA 2ORTA 4UH1A 3NSEA 3N68A 3NLKA 1DMIA 5G6CA 4CX5A 4UH3A 1FOOA 5G66A 2G6OA 4UGKA 4UPOA 5ADDA 4UGSA 4D3AA 4CTVA 4D1PA 3NLPA 4CTRA 5G68A 3NLMA 3JT8A 4KCMA 4CTPA 3JT5A 2AN2A 3N5PA 2NOSA 4CARA 3N65A 2ORQA 1DM8A 4D3BA 4K5KA 1DMKA 5G6DA 5ADBA 2G6HA 1ZZTA 3NLWA 5G0OA 4CWWA 4IMWA 4JSKA 1ZZRA 2G6NA 4UH2A 3DQSA 3E6OA 4CU0A 5AGLA 2HX3A 1RS9A 5AGNA 4KCQA 4D3MA 3B3MA 3NLGA 3TYNA 3N2RA 2AN0A 3EBDA 1ZVIA 3DQRA 4JSIA 1D1XA 4D32A 1NOSA 3NLVA 3NODA 2ORSA 1DWXA 4UG5A 3B3OA 1P6JA 5G6IA 3N6CA 5G65A 3JT4A 4UGYA 2G6JA 4D3JA 3UFRA 4UH4A 5ADAA 4CX2A 4CU1B 4UG8A 3N5XA 1K2RA 5G6QA 3E6TA 3UFWA 1M9JA 5G6FA 3HSNA 1D0CA 4V3XA 4D7IA 3RQKA 4D34A 5ADJA 4CDTA 4UH0A 4CAOA 1FOJA 4UGMA 4V3ZA 3N6AA 3JT9A 4CVGA 3JWTA 3SVQA 4UGQA 3JT7A 4JSEA 4KCLA 1P6KA 3B3PA 4K5JA 4KCHA 4V3WA 1NODA 5FVWA 5AD6A 3EAIA 4UGWA 4D3IA 1M9RA 4V3YA 3NNYA 3JX5A 4KCPA 3TYLA 4CFTA 4UH9A 2BHJA 4CWXA 4CTUA 1RS6A 3UFUA 5AD9A 3N6FA 3NLDA 1OM4A 1ED6A 1QW4A 4UGHA 1DWVA 1FOPA 1MMVA 3E7TA 5G6EA 3Q9AA 4UGXA 4CX0A 4K5GA 1NSEA 4KCIA 4CX4A 4UPMA 5FVOA 2G6IA 4D30A 3PNGA 2HX4A 4UPTA 1D0OA 2NSIA 4CX7A 5G0PA 4UGVA 5G6OA 3NLUA 3N5SA 1P6LA 4CX6A 5FVZA 3NQSA 1QW5A 4UH7A 4K5EA 3JT6A 3UFPA 5G6JA 3N61A 5G0NA 1M8IA 3N6DA 1JWKA 4CWVA 3E65A 4CTTA 2G6KA 3NLRA 3E7SB 4UGTA 1DM6A 5AGOA 3NW2A 3HSOA 1RS7A 1N2NA 5G6AA 4D3TA 5FVQA 1DMJA 5G6NA 1Q2OA 2NODA 4IMXA 4UPRA 1D1YA 3N62A 4C39A 4FVZA 2FC2A 5FJ2A 3NLNA 4KCKA 4CWZA 1M9TA 1D1WA 5FVSA 4D38A 3N67A 4IMUA 3NLXA 4CUNA 4UPNA 5ADFA 1K2UA 4UGOA 3Q99A 4UH5A 5ADNA 4UGIA 5G6HA 3N5WA 3NLFA 3NLQA 3JX2A 4D1OA 4UGEA 1LZZA 4UGBA 4UGZA 3N63A 5G6MA 2G6MA 3NNZA 5FJ3A 2FLQA 5G69A 4K5IA 8NSEA 5FVPA 1ZVLA 3E6LA 4KCNA 3E7GA 4CANA 1LZXA 4UHAA 3N5RA 4UG9A 4JSLA 4UQSA 4CTXA 2Y37A 4UGPA 1FOIA 5AGPA 4UG7A 1DWWA 3JWZA 4LUWA 3JWYA 3N66A 4CU1A 4NSEA 5ADIA 1ED4A 4CUMA 3JX3A 3PNFA 3NLYA 4UGLA 3JWVA 4GQEA 3UFQA 1M9KA 4UQRA 1MMWA 4D2ZA 4CX3A 3JT3A 3UFTA 3NLTA 3NLEA 1DD7A 1JWJA 4KCSA 4KCJA 4CTZA 4V3UA 3JX1A 3JWWA 4V3VA 4CTWA 4KCOA 5ADLA 2ORRA 3NLZA 5AGKA 4UGNA 4CAMA 4UPPA 4IMTA 1M00A 4JSMA 4CWYA 3PNHA 5NSEA 3RQJA 3JX6A 5G6KA 3UFSA 4JSGA 5G6PA 1P6MA 2FBZX 4NOSA 1NSIA 2FC1A 4UGFA 3E67A 1VAGA 9NSEA 5FVUA 4UGRA 4UGAA 1M7VA 3JX4A 4K5FA 3JTAA 3N5ZA 4CAQA 4UPSA 4UGDA 3HSPA 5G6LA 4UH8A 4D7OA 4FW0A 1ED5A 3RQNA 2OROA 3N5TA 4LWAA 1QOMA 3N6GA 4D33A 5AD4A 4D3OA 4D36A 3EJ8A 3RQPA 1DM7A 1NOCA 1QWCA 3RQLA 3JWXA 5FVRA 1D1VA 3NM0A 4UGJA 3DWJA 1P6IA 3B3NA 3FC5A 5FVXA 4UGCA 4D3UA 3N5QA 3E7SA 3TYOA 1M9MA 4D7HA 5ADCA 5G6BA 1OM5A 4LUXA 3NLHA 4D2YA 4UG6A 4CTQA 1VAFA 4D1NA 4D3KA 5AGMA 1I83A 4FVWA 5ADMA 1QW6A 3NOSA 5AD8A 5ADGA 4C3AA 4D39A 4D37A 3DQTA 3TYMA 1K2SA 4UH6A 4FVXA 2ORPA 4IMSA 1ZZUA 1ZZSA 3E7IA 3RQMA 5G6GA 3RQOA 3SVPA 5FW0A 4CULA 1M7ZA 4UCHA 4JS9A 4UGGA 1MJTA 3JX0A 2HX2A 5FVTA 4D7JA 5FVYA 4JSHA 3E7MA 1P6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4D3NA 1P6NA 4D3VA 4CFTB 3JWSA 3NLOA 4FVYA 3NLJA 4K5HA 4CX1A 4D35A 4D31A 1M8EA 1R35A 3N6BA 4CAPA 1FOLA 4EUXA 1RS8A 3JWUA 3N5VA 4UPQA 2NSEA 7NSEA 4CTYA 5AD7A 3UFOA 4K5DA 4LWBA 5AD5A 3E68A 1M8DA 3E6NA 3N5YA 3N69A 3N60A 1ZZQA 6NSEA 5FVVA 1DF1A 1M8HA 1M9QA 4JSJA 4UGUA 3EAHA 2AMOA 2G6LA 3EBFA 3NLIA 3N64A 5ADKA 1K2TA 4JSFA 5ADEA 5G67A 3N6EA 3UFVA 4KCRA 3PNEA 2ORTA 4UH1A 3NSEA 3N68A 3NLKA 1DMIA 5G6CA 4CX5A 4UH3A 1FOOA 5G66A 2G6OA 4UGKA 4UPOA 5ADDA 4UGSA 4D3AA 4CTVA 4D1PA 3NLPA 4CTRA 5G68A 3NLMA 3JT8A 4KCMA 4CTPA 3JT5A 2AN2A 3N5PA 2NOSA 4CARA 3N65A 2ORQA 1DM8A 4D3BA 4K5KA 1DMKA 5G6DA 5ADBA 2G6HA 1ZZTA 3NLWA 5G0OA 4CWWA 4IMWA 4JSKA 1ZZRA 2G6NA 4UH2A 3DQSA 3E6OA 4CU0A 5AGLA 2HX3A 1RS9A 5AGNA 4KCQA 4D3MA 3B3MA 3NLGA 3TYNA 3N2RA 2AN0A 3EBDA 1ZVIA 3DQRA 4JSIA 1D1XA 4D32A 1NOSA 3NLVA 3NODA 2ORSA 1DWXA 4UG5A 3B3OA 1P6JA 5G6IA 3N6CA 5G65A 3JT4A 4UGYA 2G6JA 4D3JA 3UFRA 4UH4A 5ADAA 4CX2A 4CU1B 4UG8A 3N5XA 1K2RA 5G6QA 3E6TA 3UFWA 1M9JA 5G6FA 3HSNA 1D0CA 4V3XA 4D7IA 3RQKA 4D34A 5ADJA 4CDTA 4UH0A 4CAOA 1FOJA 4UGMA 4V3ZA 3N6AA 3JT9A 4CVGA 3JWTA 3SVQA 4UGQA 3JT7A 4JSEA 4KCLA 1P6KA 3B3PA 4K5JA 4KCHA 4V3WA 1NODA 5FVWA 5AD6A 3EAIA 4UGWA 4D3IA 1M9RA 4V3YA 3NNYA 3JX5A 4KCPA 3TYLA 4CFTA 4UH9A 2BHJA 4CWXA 4CTUA 1RS6A 3UFUA 5AD9A 3N6FA 3NLDA 1OM4A 1ED6A 1QW4A 4UGHA 1DWVA 1FOPA 1MMVA 3E7TA 5G6EA 3Q9AA 4UGXA 4CX0A 4K5GA 1NSEA 4KCIA 4CX4A 4UPMA 5FVOA 2G6IA 4D30A 3PNGA 2HX4A 4UPTA 1D0OA 2NSIA 4CX7A 5G0PA 4UGVA 5G6OA 3NLUA 3N5SA 1P6LA 4CX6A 5FVZA 3NQSA 1QW5A 4UH7A 4K5EA 3JT6A 3UFPA 5G6JA 3N61A 5G0NA 1M8IA 3N6DA 1JWKA 4CWVA 3E65A 4CTTA 2G6KA 3NLRA 3E7SB 4UGTA 1DM6A 5AGOA 3NW2A 3HSOA 1RS7A 1N2NA 5G6AA 4D3TA 5FVQA 1DMJA 5G6NA 1Q2OA 2NODA 4IMXA 4UPRA 1D1YA 3N62A 4C39A 4FVZA 2FC2A 5FJ2A 3NLNA 4KCKA 4CWZA 1M9TA 1D1WA 5FVSA 4D38A 3N67A 4IMUA 3NLXA 4CUNA 4UPNA 5ADFA 1K2UA 4UGOA 3Q99A 4UH5A 5ADNA 4UGIA 5G6HA 3N5WA 3NLFA 3NLQA 3JX2A 4D1OA 4UGEA 1LZZA 4UGBA 4UGZA 3N63A 5G6MA 2G6MA 3NNZA 5FJ3A 2FLQA 5G69A 4K5IA 8NSEA 5FVPA 1ZVLA 3E6LA 4KCNA 3E7GA 4CANA 1LZXA 4UHAA 3N5RA 4UG9A 4JSLA 4UQSA 4CTXA 2Y37A 4UGPA 1FOIA 5AGPA 4UG7A 1DWWA 3JWZA 4LUWA 3JWYA 3N66A 4CU1A 4NSEA 5ADIA 1ED4A 4CUMA 3JX3A 3PNFA 3NLYA 4UGLA 3JWVA 4GQEA 3UFQA 1M9KA 4UQRA 1MMWA 4D2ZA 4CX3A 3JT3A 3UFTA 3NLTA 3NLEA 1DD7A 1JWJA 4KCSA 4KCJA 4CTZA 4V3UA 3JX1A 3JWWA 4V3VA 4CTWA 4KCOA 5ADLA 2ORRA 3NLZA 5AGKA 4UGNA 4CAMA 4UPPA 4IMTA 1M00A 4JSMA 4CWYA 3PNHA 5NSEA 3RQJA 3JX6A 5G6KA 3UFSA 4JSGA 5G6PA 1P6MA 2FBZX 4NOSA 1NSIA 2FC1A 4UGFA 3E67A 1VAGA 9NSEA 5FVUA 4UGRA 4UGAA 1M7VA 3JX4A 4K5FA 3JTAA 3N5ZA 4CAQA 4UPSA 4UGDA 3HSPA 5G6LA 4UH8A 4D7OA 4FW0A 1ED5A 3RQNA 2OROA 3N5TA 4LWAA 1QOMA 3N6GA 4D33A 5AD4A 4D3OA 4D36A 3EJ8A 3RQPA 1DM7A 1NOCA 1QWCA 3RQLA 3JWXA 5FVRA 1D1VA 3NM0A 4UGJA 3DWJA 1P6IA 3B3NA 3FC5A 5FVXA 4UGCA 4D3UA 3N5QA 3E7SA 3TYOA 1M9MA 4D7HA 5ADCA 5G6BA 1OM5A 4LUXA 3NLHA 4D2YA 4UG6A 4CTQA 1VAFA 4D1NA 4D3KA 5AGMA 1I83A 4FVWA 5ADMA 1QW6A 3NOSA 5AD8A 5ADGA 4C3AA 4D39A 4D37A 3DQTA 3TYMA 1K2SA 4UH6A 4FVXA 2ORPA 4IMSA 1ZZUA 1ZZSA 3E7IA 3RQMA 5G6GA 3RQOA 3SVPA 5FW0A 4CULA 1M7ZA 4UCHA 4JS9A 4UGGA 1MJTA 3JX0A 2HX2A 5FVTA 4D7JA 5FVYA 4JSHA 3E7MA 1P6HA
chains in the Genus database with same CATH topology
4D3NA 1P6NA 4D3VA 4CFTB 3JWSA 3NLOA 4FVYA 3NLJA 4K5HA 4CX1A 4D35A 4D31A 1M8EA 1R35A 3N6BA 4CAPA 1FOLA 4EUXA 1RS8A 3JWUA 3N5VA 4UPQA 2NSEA 7NSEA 4CTYA 5AD7A 3UFOA 4K5DA 4LWBA 5AD5A 3E68A 1M8DA 3E6NA 3N5YA 3N69A 3N60A 1ZZQA 6NSEA 5FVVA 1DF1A 1M8HA 1M9QA 4JSJA 4UGUA 3EAHA 2AMOA 2G6LA 3EBFA 3NLIA 3N64A 5ADKA 1K2TA 4JSFA 5ADEA 5G67A 3N6EA 3UFVA 4KCRA 3PNEA 2ORTA 4UH1A 3NSEA 3N68A 3NLKA 1DMIA 5G6CA 4CX5A 4UH3A 1FOOA 5G66A 2G6OA 4UGKA 4UPOA 5ADDA 4UGSA 4D3AA 4CTVA 4D1PA 3NLPA 4CTRA 5G68A 3NLMA 3JT8A 4KCMA 4CTPA 3JT5A 2AN2A 3N5PA 2NOSA 4CARA 3N65A 2ORQA 1DM8A 4D3BA 4K5KA 1DMKA 5G6DA 5ADBA 2G6HA 1ZZTA 3NLWA 5G0OA 4CWWA 4IMWA 4JSKA 1ZZRA 2G6NA 4UH2A 3DQSA 3E6OA 4CU0A 5AGLA 2HX3A 1RS9A 5AGNA 4KCQA 4D3MA 3B3MA 3NLGA 3TYNA 3N2RA 2AN0A 3EBDA 1ZVIA 3DQRA 4JSIA 1D1XA 4D32A 1NOSA 3NLVA 3NODA 2ORSA 1DWXA 4UG5A 3B3OA 1P6JA 5G6IA 3N6CA 5G65A 3JT4A 4UGYA 2G6JA 4D3JA 3UFRA 4UH4A 5ADAA 4CX2A 4CU1B 4UG8A 3N5XA 1K2RA 5G6QA 3E6TA 3UFWA 1M9JA 5G6FA 3HSNA 1D0CA 4V3XA 4D7IA 3RQKA 4D34A 5ADJA 4CDTA 4UH0A 4CAOA 1FOJA 4UGMA 4V3ZA 3N6AA 3JT9A 4CVGA 3JWTA 3SVQA 4UGQA 3JT7A 4JSEA 4KCLA 1P6KA 3B3PA 4K5JA 4KCHA 4V3WA 1NODA 5FVWA 5AD6A 3EAIA 4UGWA 4D3IA 1M9RA 4V3YA 3NNYA 3JX5A 4KCPA 3TYLA 4CFTA 4UH9A 2BHJA 4CWXA 4CTUA 1RS6A 3UFUA 5AD9A 3N6FA 3NLDA 1OM4A 1ED6A 1QW4A 4UGHA 1DWVA 1FOPA 1MMVA 3E7TA 5G6EA 3Q9AA 4UGXA 4CX0A 4K5GA 1NSEA 4KCIA 4CX4A 4UPMA 5FVOA 2G6IA 4D30A 3PNGA 2HX4A 4UPTA 1D0OA 2NSIA 4CX7A 5G0PA 4UGVA 5G6OA 3NLUA 3N5SA 1P6LA 4CX6A 5FVZA 3NQSA 1QW5A 4UH7A 4K5EA 3JT6A 3UFPA 5G6JA 3N61A 5G0NA 1M8IA 3N6DA 1JWKA 4CWVA 3E65A 4CTTA 2G6KA 3NLRA 3E7SB 4UGTA 1DM6A 5AGOA 3NW2A 3HSOA 1RS7A 1N2NA 5G6AA 4D3TA 5FVQA 1DMJA 5G6NA 1Q2OA 2NODA 4IMXA 4UPRA 1D1YA 3N62A 4C39A 4FVZA 2FC2A 5FJ2A 3NLNA 4KCKA 4CWZA 1M9TA 1D1WA 5FVSA 4D38A 3N67A 4IMUA 3NLXA 4CUNA 4UPNA 5ADFA 1K2UA 4UGOA 3Q99A 4UH5A 5ADNA 4UGIA 5G6HA 3N5WA 3NLFA 3NLQA 3JX2A 4D1OA 4UGEA 1LZZA 4UGBA 4UGZA 3N63A 5G6MA 2G6MA 3NNZA 5FJ3A 2FLQA 5G69A 4K5IA 8NSEA 5FVPA 1ZVLA 3E6LA 4KCNA 3E7GA 4CANA 1LZXA 4UHAA 3N5RA 4UG9A 4JSLA 4UQSA 4CTXA 2Y37A 4UGPA 1FOIA 5AGPA 4UG7A 1DWWA 3JWZA 4LUWA 3JWYA 3N66A 4CU1A 4NSEA 5ADIA 1ED4A 4CUMA 3JX3A 3PNFA 3NLYA 4UGLA 3JWVA 4GQEA 3UFQA 1M9KA 4UQRA 1MMWA 4D2ZA 4CX3A 3JT3A 3UFTA 3NLTA 3NLEA 1DD7A 1JWJA 4KCSA 4KCJA 4CTZA 4V3UA 3JX1A 3JWWA 4V3VA 4CTWA 4KCOA 5ADLA 2ORRA 3NLZA 5AGKA 4UGNA 4CAMA 4UPPA 4IMTA 1M00A 4JSMA 4CWYA 3PNHA 5NSEA 3RQJA 3JX6A 5G6KA 3UFSA 4JSGA 5G6PA 1P6MA 2FBZX 4NOSA 1NSIA 2FC1A 4UGFA 3E67A 1VAGA 9NSEA 5FVUA 4UGRA 4UGAA 1M7VA 3JX4A 4K5FA 3JTAA 3N5ZA 4CAQA 4UPSA 4UGDA 3HSPA 5G6LA 4UH8A 4D7OA 4FW0A 1ED5A 3RQNA 2OROA 3N5TA 4LWAA 1QOMA 3N6GA 4D33A 5AD4A 4D3OA 4D36A 3EJ8A 3RQPA 1DM7A 1NOCA 1QWCA 3RQLA 3JWXA 5FVRA 1D1VA 3NM0A 4UGJA 3DWJA 1P6IA 3B3NA 3FC5A 5FVXA 4UGCA 4D3UA 3N5QA 3E7SA 3TYOA 1M9MA 4D7HA 5ADCA 5G6BA 1OM5A 4LUXA 3NLHA 4D2YA 4UG6A 4CTQA 1VAFA 4D1NA 4D3KA 5AGMA 1I83A 4FVWA 5ADMA 1QW6A 3NOSA 5AD8A 5ADGA 4C3AA 4D39A 4D37A 3DQTA 3TYMA 1K2SA 4UH6A 4FVXA 2ORPA 4IMSA 1ZZUA 1ZZSA 3E7IA 3RQMA 5G6GA 3RQOA 3SVPA 5FW0A 4CULA 1M7ZA 4UCHA 4JS9A 4UGGA 1MJTA 3JX0A 2HX2A 5FVTA 4D7JA 5FVYA 4JSHA 3E7MA 1P6HA
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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