4D3IA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 6,6'-((5-(aminomethyl)-1,3-phenylene)bis(ethane-2,1-diyl))bis(4- methylpyridin-2-amine)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
MEEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-Based Design of Bacterial Nitric Oxide Synthase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 124
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2014-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 4d3iA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 4d3iA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 4d3iA03
4UGSA 3N5WA 3NQSA 1ED4A 3NLKA 4UGNA 2HX3A 5G0PA 5ADLA 5FVWA 1M9RA 3DQRA 1LZXA 1M7ZA 4KCHA 1QWCA 1ZZUA 4JSFA 1RS8A 5G65A 4CUMA 3N5SA 4UH2A 3HSOA 3UFVA 4D34A 4UGDA 3JX0A 3N5TA 2G6OA 3NLJA 4UGTA 3NLRA 4CULA 5G6LA 4JSEA 5FJ3A 1K2RA 4JSKA 3SVPA 1FOOA 3JX1A 4K5GA 1DMJA 5FVPA 3NLWA 3E7SB 4UGWA 5G6NA 4CAOA 1M9JA 3N6AA 4IMUA 3N5RA 3JWUA 1DF1A 4LUXA 5NSEA 3NOSA 4UPMA 3NLDA 4JSHA 3NLTA 1DM8A 1DD7A 4KCPA 3N6GA 3N66A 3N5YA 3EAHA 4D3KA 4UGZA 1D0CA 4UGLA 4CTQA 1D1XA 5AD6A 4K5IA 4CX2A 1QW5A 1D0OA 3E65A 2NODA 5AGNA 4D2YA 3N5XA 3E7GA 3EJ8A 5AD4A 4UGGA 1N2NA 4UH4A 3NLIA 5G0NA 3NLGA 2ORSA 4KCLA 4UQRA 4UGEA 3UFQA 4CVGA 4UPNA 2G6HA 4D3VA 4CAQA 1MJTA 5FVQA 3JWVA 5G67A 3N2RA 4D3UA 5FVTA 2HX2A 5G6OA 5G0OA 5G6PA 5ADMA 4D30A 4UPSA 1FOLA 4D1NA 2AN0A 3N61A 2OROA 4D3IA 5G66A 3N62A 1DWVA 4D39A 4KCMA 4C3AA 4CU1B 3E7SA 4V3WA 3RQOA 5G6HA 4GQEA 4JS9A 5ADDA 3EAIA 3N5ZA 1ZZSA 1D1WA 1NODA 3B3OA 4UH9A 4FVZA 4UGFA 4D3AA 4K5HA 3JWSA 1K2SA 2G6MA 4D3NA 5G6CA 4CAPA 1M00A 1I83A 2FC2A 3N68A 5G6GA 4V3YA 2G6KA 3HSNA 3UFWA 3RQJA 4D3MA 4D3JA 1D1YA 5AGOA 2Y37A 4KCSA 5FVRA 4D31A 4LUWA 3EBFA 4D1OA 4UGUA 1P6JA 4IMTA 3JT9A 5ADBA 3E6OA 1NOSA 1M9KA 4UH3A 1D1VA 1M7VA 5AD8A 2G6IA 1P6LA 3JT7A 5FVZA 2NSIA 3JT6A 3NLVA 3NLQA 1K2UA 3RQNA 5G6QA 5ADGA 4UPOA 4CTVA 5AD9A 5AGLA 4LWAA 5ADCA 4IMXA 1NOCA 1DM6A 4UG9A 3NLNA 3E67A 4CU1A 4CAMA 5FW0A 4UGCA 5G68A 1NSEA 4IMSA 4CTZA 4LWBA 4K5FA 4D3BA 3N65A 2G6JA 3N63A 4UPQA 4UG5A 2ORTA 4KCQA 1ZVIA 3TYNA 4CTXA 3N6DA 4D36A 5AD7A 4FW0A 3Q9AA 4CX7A 4EUXA 5ADEA 5FVXA 3NLXA 4KCIA 3SVQA 3PNEA 2AN2A 1JWJA 4C39A 3NLPA 1K2TA 3JTAA 4NSEA 4D1PA 4CWYA 4JSIA 4K5DA 4D32A 4UPPA 4D33A 4CTPA 4UGAA 4UQSA 4UG7A 4CTUA 5AGMA 1MMVA 4D37A 3EBDA 3TYLA 4UGIA 3NLZA 6NSEA 1ZZRA 1VAFA 4UH5A 3NW2A 1FOIA 1M9TA 3N6EA 4UH8A 5AGPA 1P6IA 3NNYA 5FVSA 1M8HA 2ORQA 4K5KA 3RQMA 4D3OA 3NODA 5ADFA 3E6NA 1RS6A 2NSEA 3DQSA 3JX3A 3JWWA 5G6EA 3N6FA 1M8EA 4D35A 4CFTA 4CX3A 4V3XA 1QOMA 4JSJA 3JWTA 4CWWA 4CX4A 4UGVA 4KCNA 5FVOA 1M8IA 3UFRA 4NOSA 5G69A 4CANA 1P6HA 4KCKA 3JWXA 3JX6A 4KCRA 1OM5A 1QW4A 3JX5A 3DWJA 3JWZA 4UGOA 2ORRA 3TYMA 4K5EA 4UH0A 3E6TA 4UGBA 4D7IA 3DQTA 1QW6A 5G6KA 4UGXA 3JT4A 4CWXA 4K5JA 3UFUA 4D2ZA 3NLEA 1NSIA 2G6NA 1DMIA 1ZZTA 1DMKA 3NM0A 7NSEA 4V3VA 2AMOA 3RQKA 2G6LA 4UCHA 5G6IA 2HX4A 1DM7A 4CTYA 5FVVA 5G6DA 4CWZA 3JX4A 4CARA 1JWKA 1M9QA 3RQPA 4CTWA 4D38A 2ORPA 4CX1A 4KCJA 4D3TA 3N6BA 4KCOA 3UFPA 4FVWA 4CFTB 3NLFA 4UG6A 3UFSA 3E7MA 5G6JA 4JSMA 2FC1A 4CTTA 4CX6A 5AGKA 4CX5A 5FVUA 4V3UA 1M9MA 3UFOA 1P6NA 3E6LA 2FBZX 1ZZQA 3JWYA 1RS9A 4UG8A 4JSGA 3NLMA 5ADKA 4IMWA 3B3PA 4UGYA 1P6KA 5FVYA 4UGMA 2FLQA 3FC5A 3PNFA 3PNGA 5G6MA 5G6FA 3JX2A 3N5VA 4D7JA 4D7HA 5FJ2A 5G6AA 3RQLA 1ED6A 4CUNA 3B3NA 3JT5A 4UGHA 4CTRA 4UGJA 4UGKA 1FOJA 2NOSA 4UGRA 5ADNA 5ADIA 1M8DA 4UGPA 3N69A 4UH1A 1LZZA 4FVXA 4UHAA 1VAGA 4CDTA 4V3ZA 4JSLA 2BHJA 1DWXA 1P6MA 3PNHA 3UFTA 4UGQA 3N5QA 3E7TA 3N5PA 3NLYA 3N64A 3NLHA 3NNZA 4UH7A 9NSEA 1OM4A 3E68A 3HSPA 3E7IA 3Q99A 1ZVLA 4D7OA 3N60A 3JT3A 4CX0A 3N6CA 3B3MA 8NSEA 4UPTA 3NLUA 3JT8A 1FOPA 1MMWA 3NLOA 5ADJA 4CU0A 4CWVA 4UPRA 1RS7A 4FVYA 1Q2OA 1DWWA 1ED5A 1R35A 5G6BA 3NSEA 4UH6A 5ADAA 5AD5A 3N67A 3TYOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UGSA 3N5WA 3NQSA 1ED4A 3NLKA 4UGNA 2HX3A 5G0PA 5ADLA 5FVWA 1M9RA 3DQRA 1LZXA 1M7ZA 4KCHA 1QWCA 1ZZUA 4JSFA 1RS8A 5G65A 4CUMA 3N5SA 4UH2A 3HSOA 3UFVA 4D34A 4UGDA 3JX0A 3N5TA 2G6OA 3NLJA 4UGTA 3NLRA 4CULA 5G6LA 4JSEA 5FJ3A 1K2RA 4JSKA 3SVPA 1FOOA 3JX1A 4K5GA 1DMJA 5FVPA 3NLWA 3E7SB 4UGWA 5G6NA 4CAOA 1M9JA 3N6AA 4IMUA 3N5RA 3JWUA 1DF1A 4LUXA 5NSEA 3NOSA 4UPMA 3NLDA 4JSHA 3NLTA 1DM8A 1DD7A 4KCPA 3N6GA 3N66A 3N5YA 3EAHA 4D3KA 4UGZA 1D0CA 4UGLA 4CTQA 1D1XA 5AD6A 4K5IA 4CX2A 1QW5A 1D0OA 3E65A 2NODA 5AGNA 4D2YA 3N5XA 3E7GA 3EJ8A 5AD4A 4UGGA 1N2NA 4UH4A 3NLIA 5G0NA 3NLGA 2ORSA 4KCLA 4UQRA 4UGEA 3UFQA 4CVGA 4UPNA 2G6HA 4D3VA 4CAQA 1MJTA 5FVQA 3JWVA 5G67A 3N2RA 4D3UA 5FVTA 2HX2A 5G6OA 5G0OA 5G6PA 5ADMA 4D30A 4UPSA 1FOLA 4D1NA 2AN0A 3N61A 2OROA 4D3IA 5G66A 3N62A 1DWVA 4D39A 4KCMA 4C3AA 4CU1B 3E7SA 4V3WA 3RQOA 5G6HA 4GQEA 4JS9A 5ADDA 3EAIA 3N5ZA 1ZZSA 1D1WA 1NODA 3B3OA 4UH9A 4FVZA 4UGFA 4D3AA 4K5HA 3JWSA 1K2SA 2G6MA 4D3NA 5G6CA 4CAPA 1M00A 1I83A 2FC2A 3N68A 5G6GA 4V3YA 2G6KA 3HSNA 3UFWA 3RQJA 4D3MA 4D3JA 1D1YA 5AGOA 2Y37A 4KCSA 5FVRA 4D31A 4LUWA 3EBFA 4D1OA 4UGUA 1P6JA 4IMTA 3JT9A 5ADBA 3E6OA 1NOSA 1M9KA 4UH3A 1D1VA 1M7VA 5AD8A 2G6IA 1P6LA 3JT7A 5FVZA 2NSIA 3JT6A 3NLVA 3NLQA 1K2UA 3RQNA 5G6QA 5ADGA 4UPOA 4CTVA 5AD9A 5AGLA 4LWAA 5ADCA 4IMXA 1NOCA 1DM6A 4UG9A 3NLNA 3E67A 4CU1A 4CAMA 5FW0A 4UGCA 5G68A 1NSEA 4IMSA 4CTZA 4LWBA 4K5FA 4D3BA 3N65A 2G6JA 3N63A 4UPQA 4UG5A 2ORTA 4KCQA 1ZVIA 3TYNA 4CTXA 3N6DA 4D36A 5AD7A 4FW0A 3Q9AA 4CX7A 4EUXA 5ADEA 5FVXA 3NLXA 4KCIA 3SVQA 3PNEA 2AN2A 1JWJA 4C39A 3NLPA 1K2TA 3JTAA 4NSEA 4D1PA 4CWYA 4JSIA 4K5DA 4D32A 4UPPA 4D33A 4CTPA 4UGAA 4UQSA 4UG7A 4CTUA 5AGMA 1MMVA 4D37A 3EBDA 3TYLA 4UGIA 3NLZA 6NSEA 1ZZRA 1VAFA 4UH5A 3NW2A 1FOIA 1M9TA 3N6EA 4UH8A 5AGPA 1P6IA 3NNYA 5FVSA 1M8HA 2ORQA 4K5KA 3RQMA 4D3OA 3NODA 5ADFA 3E6NA 1RS6A 2NSEA 3DQSA 3JX3A 3JWWA 5G6EA 3N6FA 1M8EA 4D35A 4CFTA 4CX3A 4V3XA 1QOMA 4JSJA 3JWTA 4CWWA 4CX4A 4UGVA 4KCNA 5FVOA 1M8IA 3UFRA 4NOSA 5G69A 4CANA 1P6HA 4KCKA 3JWXA 3JX6A 4KCRA 1OM5A 1QW4A 3JX5A 3DWJA 3JWZA 4UGOA 2ORRA 3TYMA 4K5EA 4UH0A 3E6TA 4UGBA 4D7IA 3DQTA 1QW6A 5G6KA 4UGXA 3JT4A 4CWXA 4K5JA 3UFUA 4D2ZA 3NLEA 1NSIA 2G6NA 1DMIA 1ZZTA 1DMKA 3NM0A 7NSEA 4V3VA 2AMOA 3RQKA 2G6LA 4UCHA 5G6IA 2HX4A 1DM7A 4CTYA 5FVVA 5G6DA 4CWZA 3JX4A 4CARA 1JWKA 1M9QA 3RQPA 4CTWA 4D38A 2ORPA 4CX1A 4KCJA 4D3TA 3N6BA 4KCOA 3UFPA 4FVWA 4CFTB 3NLFA 4UG6A 3UFSA 3E7MA 5G6JA 4JSMA 2FC1A 4CTTA 4CX6A 5AGKA 4CX5A 5FVUA 4V3UA 1M9MA 3UFOA 1P6NA 3E6LA 2FBZX 1ZZQA 3JWYA 1RS9A 4UG8A 4JSGA 3NLMA 5ADKA 4IMWA 3B3PA 4UGYA 1P6KA 5FVYA 4UGMA 2FLQA 3FC5A 3PNFA 3PNGA 5G6MA 5G6FA 3JX2A 3N5VA 4D7JA 4D7HA 5FJ2A 5G6AA 3RQLA 1ED6A 4CUNA 3B3NA 3JT5A 4UGHA 4CTRA 4UGJA 4UGKA 1FOJA 2NOSA 4UGRA 5ADNA 5ADIA 1M8DA 4UGPA 3N69A 4UH1A 1LZZA 4FVXA 4UHAA 1VAGA 4CDTA 4V3ZA 4JSLA 2BHJA 1DWXA 1P6MA 3PNHA 3UFTA 4UGQA 3N5QA 3E7TA 3N5PA 3NLYA 3N64A 3NLHA 3NNZA 4UH7A 9NSEA 1OM4A 3E68A 3HSPA 3E7IA 3Q99A 1ZVLA 4D7OA 3N60A 3JT3A 4CX0A 3N6CA 3B3MA 8NSEA 4UPTA 3NLUA 3JT8A 1FOPA 1MMWA 3NLOA 5ADJA 4CU0A 4CWVA 4UPRA 1RS7A 4FVYA 1Q2OA 1DWWA 1ED5A 1R35A 5G6BA 3NSEA 4UH6A 5ADAA 5AD5A 3N67A 3TYOA
chains in the Genus database with same CATH topology
4UGSA 3N5WA 3NQSA 1ED4A 3NLKA 4UGNA 2HX3A 5G0PA 5ADLA 5FVWA 1M9RA 3DQRA 1LZXA 1M7ZA 4KCHA 1QWCA 1ZZUA 4JSFA 1RS8A 5G65A 4CUMA 3N5SA 4UH2A 3HSOA 3UFVA 4D34A 4UGDA 3JX0A 3N5TA 2G6OA 3NLJA 4UGTA 3NLRA 4CULA 5G6LA 4JSEA 5FJ3A 1K2RA 4JSKA 3SVPA 1FOOA 3JX1A 4K5GA 1DMJA 5FVPA 3NLWA 3E7SB 4UGWA 5G6NA 4CAOA 1M9JA 3N6AA 4IMUA 3N5RA 3JWUA 1DF1A 4LUXA 5NSEA 3NOSA 4UPMA 3NLDA 4JSHA 3NLTA 1DM8A 1DD7A 4KCPA 3N6GA 3N66A 3N5YA 3EAHA 4D3KA 4UGZA 1D0CA 4UGLA 4CTQA 1D1XA 5AD6A 4K5IA 4CX2A 1QW5A 1D0OA 3E65A 2NODA 5AGNA 4D2YA 3N5XA 3E7GA 3EJ8A 5AD4A 4UGGA 1N2NA 4UH4A 3NLIA 5G0NA 3NLGA 2ORSA 4KCLA 4UQRA 4UGEA 3UFQA 4CVGA 4UPNA 2G6HA 4D3VA 4CAQA 1MJTA 5FVQA 3JWVA 5G67A 3N2RA 4D3UA 5FVTA 2HX2A 5G6OA 5G0OA 5G6PA 5ADMA 4D30A 4UPSA 1FOLA 4D1NA 2AN0A 3N61A 2OROA 4D3IA 5G66A 3N62A 1DWVA 4D39A 4KCMA 4C3AA 4CU1B 3E7SA 4V3WA 3RQOA 5G6HA 4GQEA 4JS9A 5ADDA 3EAIA 3N5ZA 1ZZSA 1D1WA 1NODA 3B3OA 4UH9A 4FVZA 4UGFA 4D3AA 4K5HA 3JWSA 1K2SA 2G6MA 4D3NA 5G6CA 4CAPA 1M00A 1I83A 2FC2A 3N68A 5G6GA 4V3YA 2G6KA 3HSNA 3UFWA 3RQJA 4D3MA 4D3JA 1D1YA 5AGOA 2Y37A 4KCSA 5FVRA 4D31A 4LUWA 3EBFA 4D1OA 4UGUA 1P6JA 4IMTA 3JT9A 5ADBA 3E6OA 1NOSA 1M9KA 4UH3A 1D1VA 1M7VA 5AD8A 2G6IA 1P6LA 3JT7A 5FVZA 2NSIA 3JT6A 3NLVA 3NLQA 1K2UA 3RQNA 5G6QA 5ADGA 4UPOA 4CTVA 5AD9A 5AGLA 4LWAA 5ADCA 4IMXA 1NOCA 1DM6A 4UG9A 3NLNA 3E67A 4CU1A 4CAMA 5FW0A 4UGCA 5G68A 1NSEA 4IMSA 4CTZA 4LWBA 4K5FA 4D3BA 3N65A 2G6JA 3N63A 4UPQA 4UG5A 2ORTA 4KCQA 1ZVIA 3TYNA 4CTXA 3N6DA 4D36A 5AD7A 4FW0A 3Q9AA 4CX7A 4EUXA 5ADEA 5FVXA 3NLXA 4KCIA 3SVQA 3PNEA 2AN2A 1JWJA 4C39A 3NLPA 1K2TA 3JTAA 4NSEA 4D1PA 4CWYA 4JSIA 4K5DA 4D32A 4UPPA 4D33A 4CTPA 4UGAA 4UQSA 4UG7A 4CTUA 5AGMA 1MMVA 4D37A 3EBDA 3TYLA 4UGIA 3NLZA 6NSEA 1ZZRA 1VAFA 4UH5A 3NW2A 1FOIA 1M9TA 3N6EA 4UH8A 5AGPA 1P6IA 3NNYA 5FVSA 1M8HA 2ORQA 4K5KA 3RQMA 4D3OA 3NODA 5ADFA 3E6NA 1RS6A 2NSEA 3DQSA 3JX3A 3JWWA 5G6EA 3N6FA 1M8EA 4D35A 4CFTA 4CX3A 4V3XA 1QOMA 4JSJA 3JWTA 4CWWA 4CX4A 4UGVA 4KCNA 5FVOA 1M8IA 3UFRA 4NOSA 5G69A 4CANA 1P6HA 4KCKA 3JWXA 3JX6A 4KCRA 1OM5A 1QW4A 3JX5A 3DWJA 3JWZA 4UGOA 2ORRA 3TYMA 4K5EA 4UH0A 3E6TA 4UGBA 4D7IA 3DQTA 1QW6A 5G6KA 4UGXA 3JT4A 4CWXA 4K5JA 3UFUA 4D2ZA 3NLEA 1NSIA 2G6NA 1DMIA 1ZZTA 1DMKA 3NM0A 7NSEA 4V3VA 2AMOA 3RQKA 2G6LA 4UCHA 5G6IA 2HX4A 1DM7A 4CTYA 5FVVA 5G6DA 4CWZA 3JX4A 4CARA 1JWKA 1M9QA 3RQPA 4CTWA 4D38A 2ORPA 4CX1A 4KCJA 4D3TA 3N6BA 4KCOA 3UFPA 4FVWA 4CFTB 3NLFA 4UG6A 3UFSA 3E7MA 5G6JA 4JSMA 2FC1A 4CTTA 4CX6A 5AGKA 4CX5A 5FVUA 4V3UA 1M9MA 3UFOA 1P6NA 3E6LA 2FBZX 1ZZQA 3JWYA 1RS9A 4UG8A 4JSGA 3NLMA 5ADKA 4IMWA 3B3PA 4UGYA 1P6KA 5FVYA 4UGMA 2FLQA 3FC5A 3PNFA 3PNGA 5G6MA 5G6FA 3JX2A 3N5VA 4D7JA 4D7HA 5FJ2A 5G6AA 3RQLA 1ED6A 4CUNA 3B3NA 3JT5A 4UGHA 4CTRA 4UGJA 4UGKA 1FOJA 2NOSA 4UGRA 5ADNA 5ADIA 1M8DA 4UGPA 3N69A 4UH1A 1LZZA 4FVXA 4UHAA 1VAGA 4CDTA 4V3ZA 4JSLA 2BHJA 1DWXA 1P6MA 3PNHA 3UFTA 4UGQA 3N5QA 3E7TA 3N5PA 3NLYA 3N64A 3NLHA 3NNZA 4UH7A 9NSEA 1OM4A 3E68A 3HSPA 3E7IA 3Q99A 1ZVLA 4D7OA 3N60A 3JT3A 4CX0A 3N6CA 3B3MA 8NSEA 4UPTA 3NLUA 3JT8A 1FOPA 1MMWA 3NLOA 5ADJA 4CU0A 4CWVA 4UPRA 1RS7A 4FVYA 1Q2OA 1DWWA 1ED5A 1R35A 5G6BA 3NSEA 4UH6A 5ADAA 5AD5A 3N67A 3TYOA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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