4D3JA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 6,6'-(2,2'-(5-amino-1,3-phenylene)bis(ethane-2,1-diyl))bis(4- methylpyridin-2-amine)
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
publication title Structure-Based Design of Bacterial Nitric Oxide Synthase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 122
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2014-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 4d3jA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 4d3jA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 4d3jA03
5FVZA 3N5XA 1RS7A 4KCPA 4JSKA 1D0CA 3EBDA 4UGOA 1P6NA 4D1NA 4CAPA 3E7GA 5G6IA 3NLHA 1P6JA 3DWJA 1JWKA 4NOSA 4UH3A 4UGYA 4KCIA 1P6MA 4IMWA 3N60A 5G0PA 3JWUA 4FW0A 4V3WA 1M8HA 1K2SA 3NLKA 4CX2A 1QOMA 1D1XA 1ZZSA 5ADKA 3NLPA 1D0OA 1DM8A 4KCKA 4K5FA 3RQLA 1D1WA 3NLZA 5FVUA 2ORPA 4UGDA 3N62A 3TYNA 3JWZA 2AMOA 4KCNA 4LWAA 4CX0A 3N6CA 1LZXA 2G6HA 1OM4A 5G6CA 4D36A 4CX5A 3NLFA 4UGBA 1FOJA 3JWWA 4K5IA 1LZZA 4FVWA 4CAMA 4D2ZA 4UGLA 3UFQA 1I83A 3UFOA 9NSEA 3JWVA 4K5GA 4UH5A 3N6EA 4CWXA 4UPSA 4D3BA 1ZZTA 4CTWA 1ED5A 5ADDA 2FC2A 4UGPA 5ADAA 1DM7A 3DQSA 3B3OA 2G6IA 4CU1B 4FVXA 5AD4A 5ADFA 3NODA 4UH6A 3NNZA 4UGKA 4D3IA 4D7OA 4UH2A 4D3MA 1ZZRA 3NLYA 4UGCA 3JT9A 4CTRA 3JT3A 4D7HA 5AD9A 4UGIA 1MJTA 5FW0A 1P6IA 3E6TA 3E7IA 4K5KA 4IMTA 5FVPA 5FVWA 6NSEA 1NSIA 4D3KA 1K2TA 4D1PA 1K2UA 1P6KA 1D1VA 2FC1A 3RQKA 3TYOA 2ORTA 4UG5A 3Q9AA 5AGLA 3EAIA 4UGHA 3N6GA 4KCSA 3N5YA 5G6LA 2NSIA 4NSEA 5G6GA 4CWYA 4UCHA 4CARA 3JT8A 5AD6A 4D3OA 1DMJA 4KCJA 1M9TA 1OM5A 5ADMA 3E7SA 4KCOA 4UGWA 2BHJA 3EJ8A 3N6FA 4JSLA 2HX4A 4KCLA 4D3JA 4UGZA 3NLJA 4CWWA 4CX1A 4K5EA 1MMWA 1M9KA 5FVRA 3JWSA 1QWCA 3HSPA 3UFUA 1M9MA 4CWVA 3NLWA 2OROA 5G6DA 4CWZA 4CX4A 4CAQA 4K5HA 1NOSA 3N6DA 1D1YA 5AGKA 1QW6A 3RQJA 4UQSA 5G6EA 4K5DA 4CAOA 1N2NA 3JX0A 1NOCA 4CULA 4UGSA 5AGNA 3RQPA 4CX6A 4EUXA 1RS6A 4D3TA 1NODA 3N61A 2NOSA 4KCHA 4D3UA 3EAHA 3JX1A 4UGAA 4UG9A 2G6OA 1VAGA 3JWTA 5G65A 3N6AA 3JT4A 3NLXA 1FOOA 4UPNA 4UGJA 3NLNA 4JSMA 3E7TA 5AD8A 4JSEA 4D34A 4IMUA 3Q99A 5NSEA 4C3AA 5FVOA 4CU1A 1MMVA 4D33A 2NSEA 3JX5A 3N2RA 4UPMA 5G69A 5G6KA 3E7MA 5G6BA 2NODA 5AD7A 4LUXA 3E6OA 5G6QA 4UH0A 4UH7A 3PNEA 1JWJA 3N69A 1K2RA 1ZVIA 4UGUA 4CUNA 3N67A 3E6NA 5ADNA 3NLIA 5G6AA 4KCQA 3SVQA 1ED4A 3NLQA 3N65A 4D7JA 3NQSA 5G0OA 2G6NA 4V3VA 4D2YA 5G68A 4CX3A 3JTAA 3UFWA 4CTQA 8NSEA 4UPPA 5AGOA 4V3ZA 1FOIA 3NLUA 4KCRA 1DWXA 3E65A 3N5RA 2AN0A 4UPOA 1M00A 4D1OA 4K5JA 4GQEA 3EBFA 4CVGA 4UPRA 3DQRA 3JX2A 3NLDA 5G66A 4D39A 2HX2A 4UGVA 5FVXA 3PNHA 3JT6A 4UGGA 1M8EA 4CANA 4UGEA 4UH8A 5FVVA 4CX7A 4CU0A 5AD5A 4D32A 1QW5A 4UQRA 2G6MA 5G6MA 4JSGA 4CTZA 4D37A 4LWBA 3B3MA 1M8DA 3FC5A 3NOSA 4CFTB 4UHAA 3E67A 1DMKA 3NLTA 4UGRA 5G6PA 5G0NA 1ZVLA 3N6BA 4UG6A 3N5QA 4JS9A 4UH4A 4D38A 1M9RA 1R35A 1ED6A 3RQOA 5ADCA 1QW4A 3PNGA 3NNYA 4FVYA 1M7VA 3B3PA 4CTUA 3UFSA 4UG7A 3UFTA 4UGNA 3NLEA 4IMSA 2G6KA 2Y37A 5G6NA 1P6LA 3E6LA 3TYLA 3N64A 4UH1A 4CTTA 5ADJA 3PNFA 5ADBA 3B3NA 3N66A 3JT7A 5AGMA 3UFRA 1P6HA 3NLVA 4CTVA 3N68A 1M9JA 3SVPA 2G6JA 5G67A 5ADLA 2G6LA 4JSFA 4JSIA 4V3YA 4V3XA 1M9QA 4UGXA 3UFVA 4UGFA 4UPQA 3JX3A 5FVQA 3NM0A 4D31A 2HX3A 3NLMA 5ADEA 5FVSA 4UH9A 4CTYA 3JWYA 3DQTA 2ORRA 3HSOA 5FVYA 2AN2A 2ORSA 3NSEA 4CTPA 4IMXA 3N63A 1ZZUA 3NLRA 1DWVA 7NSEA 4UGMA 3NW2A 4D7IA 4KCMA 3JT5A 1FOLA 1DF1A 4D35A 3NLGA 5AGPA 4UGTA 4JSJA 3RQNA 5G6FA 1NSEA 5ADGA 1DD7A 3N5TA 4D3VA 4C39A 5G6HA 1VAFA 4JSHA 4LUWA 3JX6A 3JWXA 3N5PA 1DWWA 3JX4A 4FVZA 3TYMA 3NLOA 4V3UA 3RQMA 5FVTA 4D3NA 4CUMA 1RS8A 3E68A 4CDTA 4CTXA 5ADIA 4D30A 1DM6A 3N5ZA 5G6JA 1ZZQA 2FBZX 1RS9A 1Q2OA 3N5SA 2FLQA 4UG8A 4UGQA 5G6OA 1DMIA 1FOPA 2ORQA 1M7ZA 4CFTA 4D3AA 4UPTA 3N5WA 3E7SB 3N5VA 5FJ2A 3UFPA 1M8IA 5FJ3A 3HSNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FVZA 3N5XA 1RS7A 4KCPA 4JSKA 1D0CA 3EBDA 4UGOA 1P6NA 4D1NA 4CAPA 3E7GA 5G6IA 3NLHA 1P6JA 3DWJA 1JWKA 4NOSA 4UH3A 4UGYA 4KCIA 1P6MA 4IMWA 3N60A 5G0PA 3JWUA 4FW0A 4V3WA 1M8HA 1K2SA 3NLKA 4CX2A 1QOMA 1D1XA 1ZZSA 5ADKA 3NLPA 1D0OA 1DM8A 4KCKA 4K5FA 3RQLA 1D1WA 3NLZA 5FVUA 2ORPA 4UGDA 3N62A 3TYNA 3JWZA 2AMOA 4KCNA 4LWAA 4CX0A 3N6CA 1LZXA 2G6HA 1OM4A 5G6CA 4D36A 4CX5A 3NLFA 4UGBA 1FOJA 3JWWA 4K5IA 1LZZA 4FVWA 4CAMA 4D2ZA 4UGLA 3UFQA 1I83A 3UFOA 9NSEA 3JWVA 4K5GA 4UH5A 3N6EA 4CWXA 4UPSA 4D3BA 1ZZTA 4CTWA 1ED5A 5ADDA 2FC2A 4UGPA 5ADAA 1DM7A 3DQSA 3B3OA 2G6IA 4CU1B 4FVXA 5AD4A 5ADFA 3NODA 4UH6A 3NNZA 4UGKA 4D3IA 4D7OA 4UH2A 4D3MA 1ZZRA 3NLYA 4UGCA 3JT9A 4CTRA 3JT3A 4D7HA 5AD9A 4UGIA 1MJTA 5FW0A 1P6IA 3E6TA 3E7IA 4K5KA 4IMTA 5FVPA 5FVWA 6NSEA 1NSIA 4D3KA 1K2TA 4D1PA 1K2UA 1P6KA 1D1VA 2FC1A 3RQKA 3TYOA 2ORTA 4UG5A 3Q9AA 5AGLA 3EAIA 4UGHA 3N6GA 4KCSA 3N5YA 5G6LA 2NSIA 4NSEA 5G6GA 4CWYA 4UCHA 4CARA 3JT8A 5AD6A 4D3OA 1DMJA 4KCJA 1M9TA 1OM5A 5ADMA 3E7SA 4KCOA 4UGWA 2BHJA 3EJ8A 3N6FA 4JSLA 2HX4A 4KCLA 4D3JA 4UGZA 3NLJA 4CWWA 4CX1A 4K5EA 1MMWA 1M9KA 5FVRA 3JWSA 1QWCA 3HSPA 3UFUA 1M9MA 4CWVA 3NLWA 2OROA 5G6DA 4CWZA 4CX4A 4CAQA 4K5HA 1NOSA 3N6DA 1D1YA 5AGKA 1QW6A 3RQJA 4UQSA 5G6EA 4K5DA 4CAOA 1N2NA 3JX0A 1NOCA 4CULA 4UGSA 5AGNA 3RQPA 4CX6A 4EUXA 1RS6A 4D3TA 1NODA 3N61A 2NOSA 4KCHA 4D3UA 3EAHA 3JX1A 4UGAA 4UG9A 2G6OA 1VAGA 3JWTA 5G65A 3N6AA 3JT4A 3NLXA 1FOOA 4UPNA 4UGJA 3NLNA 4JSMA 3E7TA 5AD8A 4JSEA 4D34A 4IMUA 3Q99A 5NSEA 4C3AA 5FVOA 4CU1A 1MMVA 4D33A 2NSEA 3JX5A 3N2RA 4UPMA 5G69A 5G6KA 3E7MA 5G6BA 2NODA 5AD7A 4LUXA 3E6OA 5G6QA 4UH0A 4UH7A 3PNEA 1JWJA 3N69A 1K2RA 1ZVIA 4UGUA 4CUNA 3N67A 3E6NA 5ADNA 3NLIA 5G6AA 4KCQA 3SVQA 1ED4A 3NLQA 3N65A 4D7JA 3NQSA 5G0OA 2G6NA 4V3VA 4D2YA 5G68A 4CX3A 3JTAA 3UFWA 4CTQA 8NSEA 4UPPA 5AGOA 4V3ZA 1FOIA 3NLUA 4KCRA 1DWXA 3E65A 3N5RA 2AN0A 4UPOA 1M00A 4D1OA 4K5JA 4GQEA 3EBFA 4CVGA 4UPRA 3DQRA 3JX2A 3NLDA 5G66A 4D39A 2HX2A 4UGVA 5FVXA 3PNHA 3JT6A 4UGGA 1M8EA 4CANA 4UGEA 4UH8A 5FVVA 4CX7A 4CU0A 5AD5A 4D32A 1QW5A 4UQRA 2G6MA 5G6MA 4JSGA 4CTZA 4D37A 4LWBA 3B3MA 1M8DA 3FC5A 3NOSA 4CFTB 4UHAA 3E67A 1DMKA 3NLTA 4UGRA 5G6PA 5G0NA 1ZVLA 3N6BA 4UG6A 3N5QA 4JS9A 4UH4A 4D38A 1M9RA 1R35A 1ED6A 3RQOA 5ADCA 1QW4A 3PNGA 3NNYA 4FVYA 1M7VA 3B3PA 4CTUA 3UFSA 4UG7A 3UFTA 4UGNA 3NLEA 4IMSA 2G6KA 2Y37A 5G6NA 1P6LA 3E6LA 3TYLA 3N64A 4UH1A 4CTTA 5ADJA 3PNFA 5ADBA 3B3NA 3N66A 3JT7A 5AGMA 3UFRA 1P6HA 3NLVA 4CTVA 3N68A 1M9JA 3SVPA 2G6JA 5G67A 5ADLA 2G6LA 4JSFA 4JSIA 4V3YA 4V3XA 1M9QA 4UGXA 3UFVA 4UGFA 4UPQA 3JX3A 5FVQA 3NM0A 4D31A 2HX3A 3NLMA 5ADEA 5FVSA 4UH9A 4CTYA 3JWYA 3DQTA 2ORRA 3HSOA 5FVYA 2AN2A 2ORSA 3NSEA 4CTPA 4IMXA 3N63A 1ZZUA 3NLRA 1DWVA 7NSEA 4UGMA 3NW2A 4D7IA 4KCMA 3JT5A 1FOLA 1DF1A 4D35A 3NLGA 5AGPA 4UGTA 4JSJA 3RQNA 5G6FA 1NSEA 5ADGA 1DD7A 3N5TA 4D3VA 4C39A 5G6HA 1VAFA 4JSHA 4LUWA 3JX6A 3JWXA 3N5PA 1DWWA 3JX4A 4FVZA 3TYMA 3NLOA 4V3UA 3RQMA 5FVTA 4D3NA 4CUMA 1RS8A 3E68A 4CDTA 4CTXA 5ADIA 4D30A 1DM6A 3N5ZA 5G6JA 1ZZQA 2FBZX 1RS9A 1Q2OA 3N5SA 2FLQA 4UG8A 4UGQA 5G6OA 1DMIA 1FOPA 2ORQA 1M7ZA 4CFTA 4D3AA 4UPTA 3N5WA 3E7SB 3N5VA 5FJ2A 3UFPA 1M8IA 5FJ3A 3HSNA
chains in the Genus database with same CATH topology
5FVZA 3N5XA 1RS7A 4KCPA 4JSKA 1D0CA 3EBDA 4UGOA 1P6NA 4D1NA 4CAPA 3E7GA 5G6IA 3NLHA 1P6JA 3DWJA 1JWKA 4NOSA 4UH3A 4UGYA 4KCIA 1P6MA 4IMWA 3N60A 5G0PA 3JWUA 4FW0A 4V3WA 1M8HA 1K2SA 3NLKA 4CX2A 1QOMA 1D1XA 1ZZSA 5ADKA 3NLPA 1D0OA 1DM8A 4KCKA 4K5FA 3RQLA 1D1WA 3NLZA 5FVUA 2ORPA 4UGDA 3N62A 3TYNA 3JWZA 2AMOA 4KCNA 4LWAA 4CX0A 3N6CA 1LZXA 2G6HA 1OM4A 5G6CA 4D36A 4CX5A 3NLFA 4UGBA 1FOJA 3JWWA 4K5IA 1LZZA 4FVWA 4CAMA 4D2ZA 4UGLA 3UFQA 1I83A 3UFOA 9NSEA 3JWVA 4K5GA 4UH5A 3N6EA 4CWXA 4UPSA 4D3BA 1ZZTA 4CTWA 1ED5A 5ADDA 2FC2A 4UGPA 5ADAA 1DM7A 3DQSA 3B3OA 2G6IA 4CU1B 4FVXA 5AD4A 5ADFA 3NODA 4UH6A 3NNZA 4UGKA 4D3IA 4D7OA 4UH2A 4D3MA 1ZZRA 3NLYA 4UGCA 3JT9A 4CTRA 3JT3A 4D7HA 5AD9A 4UGIA 1MJTA 5FW0A 1P6IA 3E6TA 3E7IA 4K5KA 4IMTA 5FVPA 5FVWA 6NSEA 1NSIA 4D3KA 1K2TA 4D1PA 1K2UA 1P6KA 1D1VA 2FC1A 3RQKA 3TYOA 2ORTA 4UG5A 3Q9AA 5AGLA 3EAIA 4UGHA 3N6GA 4KCSA 3N5YA 5G6LA 2NSIA 4NSEA 5G6GA 4CWYA 4UCHA 4CARA 3JT8A 5AD6A 4D3OA 1DMJA 4KCJA 1M9TA 1OM5A 5ADMA 3E7SA 4KCOA 4UGWA 2BHJA 3EJ8A 3N6FA 4JSLA 2HX4A 4KCLA 4D3JA 4UGZA 3NLJA 4CWWA 4CX1A 4K5EA 1MMWA 1M9KA 5FVRA 3JWSA 1QWCA 3HSPA 3UFUA 1M9MA 4CWVA 3NLWA 2OROA 5G6DA 4CWZA 4CX4A 4CAQA 4K5HA 1NOSA 3N6DA 1D1YA 5AGKA 1QW6A 3RQJA 4UQSA 5G6EA 4K5DA 4CAOA 1N2NA 3JX0A 1NOCA 4CULA 4UGSA 5AGNA 3RQPA 4CX6A 4EUXA 1RS6A 4D3TA 1NODA 3N61A 2NOSA 4KCHA 4D3UA 3EAHA 3JX1A 4UGAA 4UG9A 2G6OA 1VAGA 3JWTA 5G65A 3N6AA 3JT4A 3NLXA 1FOOA 4UPNA 4UGJA 3NLNA 4JSMA 3E7TA 5AD8A 4JSEA 4D34A 4IMUA 3Q99A 5NSEA 4C3AA 5FVOA 4CU1A 1MMVA 4D33A 2NSEA 3JX5A 3N2RA 4UPMA 5G69A 5G6KA 3E7MA 5G6BA 2NODA 5AD7A 4LUXA 3E6OA 5G6QA 4UH0A 4UH7A 3PNEA 1JWJA 3N69A 1K2RA 1ZVIA 4UGUA 4CUNA 3N67A 3E6NA 5ADNA 3NLIA 5G6AA 4KCQA 3SVQA 1ED4A 3NLQA 3N65A 4D7JA 3NQSA 5G0OA 2G6NA 4V3VA 4D2YA 5G68A 4CX3A 3JTAA 3UFWA 4CTQA 8NSEA 4UPPA 5AGOA 4V3ZA 1FOIA 3NLUA 4KCRA 1DWXA 3E65A 3N5RA 2AN0A 4UPOA 1M00A 4D1OA 4K5JA 4GQEA 3EBFA 4CVGA 4UPRA 3DQRA 3JX2A 3NLDA 5G66A 4D39A 2HX2A 4UGVA 5FVXA 3PNHA 3JT6A 4UGGA 1M8EA 4CANA 4UGEA 4UH8A 5FVVA 4CX7A 4CU0A 5AD5A 4D32A 1QW5A 4UQRA 2G6MA 5G6MA 4JSGA 4CTZA 4D37A 4LWBA 3B3MA 1M8DA 3FC5A 3NOSA 4CFTB 4UHAA 3E67A 1DMKA 3NLTA 4UGRA 5G6PA 5G0NA 1ZVLA 3N6BA 4UG6A 3N5QA 4JS9A 4UH4A 4D38A 1M9RA 1R35A 1ED6A 3RQOA 5ADCA 1QW4A 3PNGA 3NNYA 4FVYA 1M7VA 3B3PA 4CTUA 3UFSA 4UG7A 3UFTA 4UGNA 3NLEA 4IMSA 2G6KA 2Y37A 5G6NA 1P6LA 3E6LA 3TYLA 3N64A 4UH1A 4CTTA 5ADJA 3PNFA 5ADBA 3B3NA 3N66A 3JT7A 5AGMA 3UFRA 1P6HA 3NLVA 4CTVA 3N68A 1M9JA 3SVPA 2G6JA 5G67A 5ADLA 2G6LA 4JSFA 4JSIA 4V3YA 4V3XA 1M9QA 4UGXA 3UFVA 4UGFA 4UPQA 3JX3A 5FVQA 3NM0A 4D31A 2HX3A 3NLMA 5ADEA 5FVSA 4UH9A 4CTYA 3JWYA 3DQTA 2ORRA 3HSOA 5FVYA 2AN2A 2ORSA 3NSEA 4CTPA 4IMXA 3N63A 1ZZUA 3NLRA 1DWVA 7NSEA 4UGMA 3NW2A 4D7IA 4KCMA 3JT5A 1FOLA 1DF1A 4D35A 3NLGA 5AGPA 4UGTA 4JSJA 3RQNA 5G6FA 1NSEA 5ADGA 1DD7A 3N5TA 4D3VA 4C39A 5G6HA 1VAFA 4JSHA 4LUWA 3JX6A 3JWXA 3N5PA 1DWWA 3JX4A 4FVZA 3TYMA 3NLOA 4V3UA 3RQMA 5FVTA 4D3NA 4CUMA 1RS8A 3E68A 4CDTA 4CTXA 5ADIA 4D30A 1DM6A 3N5ZA 5G6JA 1ZZQA 2FBZX 1RS9A 1Q2OA 3N5SA 2FLQA 4UG8A 4UGQA 5G6OA 1DMIA 1FOPA 2ORQA 1M7ZA 4CFTA 4D3AA 4UPTA 3N5WA 3E7SB 3N5VA 5FJ2A 3UFPA 1M8IA 5FJ3A 3HSNA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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