5G69A

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 7-(2-(3-fluorobenzylamino)ethyl)quinolin-2-amine
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 121
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g69A01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g69A02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g69A03
3JWYA 4UGEA 4JSGA 3UFWA 4D3AA 4K5DA 1K2UA 3JX6A 1P6IA 1QW5A 3N5PA 1NSIA 3NOSA 1DWXA 4UH1A 3EBDA 5ADCA 3N65A 4D37A 4GQEA 5AGLA 2FBZX 4UGSA 4D1NA 4V3XA 3RQPA 2ORRA 4KCPA 4KCOA 4CAMA 4FVXA 3RQLA 4CWXA 1FOOA 4CTPA 5ADLA 5FVWA 3E7MA 4UGZA 4CU1B 4UH4A 3JWUA 4CANA 5G66A 4D3OA 1RS6A 4D7IA 4UPSA 3N66A 3E7SB 3JWTA 3TYMA 1QOMA 2G6IA 5FVTA 4UGIA 2G6JA 4JSKA 4D30A 1DWWA 1JWJA 2FLQA 3Q99A 4UPMA 5FVRA 5G6FA 1D1XA 1Q2OA 4CARA 5G68A 3E68A 4UGKA 5G6JA 3N6AA 1DM7A 1OM4A 4K5HA 4UG6A 4UQSA 4KCQA 4UGJA 3NLZA 3JT5A 2G6OA 1K2TA 3N5YA 4CWYA 3NLHA 3RQOA 1RS8A 4UPPA 4D39A 4K5EA 8NSEA 4CTXA 3JT7A 4KCNA 4JSHA 1ZZTA 5AGPA 3N6BA 3JWSA 4UGGA 1JWKA 3SVQA 4UH5A 3UFPA 3B3PA 3N5RA 3N5SA 4UGWA 4CX7A 4D3IA 5G6NA 3JT4A 3PNEA 5G6LA 4D3VA 4CVGA 4JSFA 3UFRA 3FC5A 1K2RA 3NLFA 2HX2A 4JSLA 3UFUA 4K5IA 5ADBA 3NLIA 4UGOA 4UGVA 1MJTA 3N61A 3NW2A 3N67A 4UCHA 3RQJA 1M8DA 3N60A 4IMUA 4UGDA 5G6GA 3N5XA 4IMSA 4D7JA 3PNGA 2FC1A 4CUNA 4UGTA 4CFTB 1P6HA 5G6QA 1M7ZA 4D7OA 3JT9A 5G6AA 3N68A 1M8HA 3JWZA 4V3UA 4V3VA 4IMXA 3NSEA 1DM8A 3RQMA 1NOSA 3N5TA 5AD5A 3JX2A 4UG9A 1RS7A 1NOCA 2HX4A 1FOLA 4K5FA 1ZVLA 4NSEA 4V3ZA 5G0NA 4LUWA 3UFQA 3NLUA 4CTYA 1M9MA 4D3NA 3RQKA 7NSEA 1ED4A 1D1WA 3N6CA 1QW6A 3NQSA 1I83A 1N2NA 1M7VA 4CUMA 5G0OA 4D34A 3N6DA 5FVVA 3N69A 4D38A 2ORSA 3NLEA 4K5GA 5ADEA 1P6JA 3SVPA 2OROA 1M9TA 2G6KA 2G6LA 4FVYA 4V3YA 1ED5A 4CX2A 3N6EA 4D2ZA 1QW4A 1RS9A 4FVWA 5G0PA 3NODA 2NSEA 2ORPA 1D0OA 4UG7A 1ZZUA 3E6TA 1ED6A 3TYOA 3JWVA 1DWVA 4D32A 4UPTA 4D1OA 5G6OA 4CFTA 1ZZQA 5FVUA 1K2SA 3UFOA 3B3OA 1VAGA 4LWBA 3B3MA 5FJ3A 4UPOA 5ADMA 5ADJA 5AD9A 4D35A 5G6MA 5FVYA 1VAFA 4UGPA 1P6LA 3JT6A 5G6HA 4CTRA 4D3MA 3HSNA 4UG8A 1M8IA 4IMTA 3UFSA 3UFVA 5AGMA 1M8EA 3NLVA 3NM0A 3Q9AA 4CU1A 1FOJA 2AN0A 3E67A 3E6LA 4UGBA 4K5KA 1FOPA 3E7SA 5G6KA 5G6DA 2HX3A 4FVZA 1M9JA 4KCRA 4KCHA 3HSPA 2FC2A 3E7GA 4D36A 3B3NA 3NLDA 5AGOA 3E6OA 4LWAA 4CX1A 2AN2A 3N5QA 5AGNA 4LUXA 4UGFA 5G69A 4UGUA 3NLWA 5FJ2A 4D31A 4D2YA 4JSMA 3N5ZA 1D1VA 2ORQA 5ADAA 3EAHA 3N5WA 1MMVA 1DF1A 6NSEA 4JSJA 4CX4A 1DD7A 1OM5A 5FVZA 5AD6A 1LZXA 4KCKA 5FVSA 3JX1A 4CWVA 4CX3A 2Y37A 5G6BA 3TYNA 4KCSA 3NLXA 1M00A 4JSIA 4CDTA 4D3TA 4D3UA 4D3JA 3E65A 4KCJA 4UG5A 5ADFA 3JX5A 5AD7A 1DMJA 4UGRA 5G6IA 3N5VA 4NOSA 4UGNA 5G67A 4UH2A 1MMWA 4UH6A 4K5JA 3HSOA 2G6NA 5FVXA 1R35A 1NODA 3JWXA 1QWCA 3NLJA 4UPQA 4JS9A 3NLNA 3JT8A 4D1PA 1D1YA 2NOSA 3NLGA 5AD4A 5FVPA 4D3BA 1ZZSA 3RQNA 3N63A 3E7IA 5NSEA 4CAPA 5FVOA 4UH7A 4CTUA 5ADNA 4UH8A 4CU0A 4JSEA 4UPRA 1DMIA 5FVQA 3NLPA 4UH9A 3DQSA 4CX0A 5G65A 3N6GA 1P6MA 2BHJA 5ADGA 4CX6A 4UHAA 2G6MA 4UGHA 3EJ8A 4CTQA 4CX5A 3JTAA 2G6HA 4EUXA 3EBFA 4UGMA 4UH3A 4KCMA 5AD8A 4UQRA 1M9RA 1P6NA 2NSIA 1DM6A 4C39A 3NLMA 4UGQA 4CAQA 3NLOA 3E6NA 4FW0A 3EAIA 1DMKA 4D33A 3JX4A 5ADIA 3E7TA 4KCLA 4UGAA 5AGKA 1D0CA 2AMOA 1FOIA 3NNZA 3TYLA 5G6CA 3JWWA 3NNYA 3DQRA 1M9QA 3DWJA 3N6FA 3N2RA 1P6KA 4UGYA 4UH0A 1ZZRA 4CTVA 2NODA 3PNHA 4KCIA 3JX0A 4CULA 4CTWA 3NLYA 3PNFA 2ORTA 4CTTA 1NSEA 1M9KA 3JX3A 3N64A 3N62A 4V3WA 3NLTA 4D3KA 1ZVIA 5G6EA 3UFTA 4C3AA 4CTZA 4UGLA 3NLQA 1LZZA 5G6PA 3JT3A 4CWWA 4IMWA 3NLKA 3DQTA 3NLRA 5ADDA 9NSEA 5FW0A 4CWZA 5ADKA 4UPNA 4UGXA 4UGCA 4D7HA 4CAOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JWYA 4UGEA 4JSGA 3UFWA 4D3AA 4K5DA 1K2UA 3JX6A 1P6IA 1QW5A 3N5PA 1NSIA 3NOSA 1DWXA 4UH1A 3EBDA 5ADCA 3N65A 4D37A 4GQEA 5AGLA 2FBZX 4UGSA 4D1NA 4V3XA 3RQPA 2ORRA 4KCPA 4KCOA 4CAMA 4FVXA 3RQLA 4CWXA 1FOOA 4CTPA 5ADLA 5FVWA 3E7MA 4UGZA 4CU1B 4UH4A 3JWUA 4CANA 5G66A 4D3OA 1RS6A 4D7IA 4UPSA 3N66A 3E7SB 3JWTA 3TYMA 1QOMA 2G6IA 5FVTA 4UGIA 2G6JA 4JSKA 4D30A 1DWWA 1JWJA 2FLQA 3Q99A 4UPMA 5FVRA 5G6FA 1D1XA 1Q2OA 4CARA 5G68A 3E68A 4UGKA 5G6JA 3N6AA 1DM7A 1OM4A 4K5HA 4UG6A 4UQSA 4KCQA 4UGJA 3NLZA 3JT5A 2G6OA 1K2TA 3N5YA 4CWYA 3NLHA 3RQOA 1RS8A 4UPPA 4D39A 4K5EA 8NSEA 4CTXA 3JT7A 4KCNA 4JSHA 1ZZTA 5AGPA 3N6BA 3JWSA 4UGGA 1JWKA 3SVQA 4UH5A 3UFPA 3B3PA 3N5RA 3N5SA 4UGWA 4CX7A 4D3IA 5G6NA 3JT4A 3PNEA 5G6LA 4D3VA 4CVGA 4JSFA 3UFRA 3FC5A 1K2RA 3NLFA 2HX2A 4JSLA 3UFUA 4K5IA 5ADBA 3NLIA 4UGOA 4UGVA 1MJTA 3N61A 3NW2A 3N67A 4UCHA 3RQJA 1M8DA 3N60A 4IMUA 4UGDA 5G6GA 3N5XA 4IMSA 4D7JA 3PNGA 2FC1A 4CUNA 4UGTA 4CFTB 1P6HA 5G6QA 1M7ZA 4D7OA 3JT9A 5G6AA 3N68A 1M8HA 3JWZA 4V3UA 4V3VA 4IMXA 3NSEA 1DM8A 3RQMA 1NOSA 3N5TA 5AD5A 3JX2A 4UG9A 1RS7A 1NOCA 2HX4A 1FOLA 4K5FA 1ZVLA 4NSEA 4V3ZA 5G0NA 4LUWA 3UFQA 3NLUA 4CTYA 1M9MA 4D3NA 3RQKA 7NSEA 1ED4A 1D1WA 3N6CA 1QW6A 3NQSA 1I83A 1N2NA 1M7VA 4CUMA 5G0OA 4D34A 3N6DA 5FVVA 3N69A 4D38A 2ORSA 3NLEA 4K5GA 5ADEA 1P6JA 3SVPA 2OROA 1M9TA 2G6KA 2G6LA 4FVYA 4V3YA 1ED5A 4CX2A 3N6EA 4D2ZA 1QW4A 1RS9A 4FVWA 5G0PA 3NODA 2NSEA 2ORPA 1D0OA 4UG7A 1ZZUA 3E6TA 1ED6A 3TYOA 3JWVA 1DWVA 4D32A 4UPTA 4D1OA 5G6OA 4CFTA 1ZZQA 5FVUA 1K2SA 3UFOA 3B3OA 1VAGA 4LWBA 3B3MA 5FJ3A 4UPOA 5ADMA 5ADJA 5AD9A 4D35A 5G6MA 5FVYA 1VAFA 4UGPA 1P6LA 3JT6A 5G6HA 4CTRA 4D3MA 3HSNA 4UG8A 1M8IA 4IMTA 3UFSA 3UFVA 5AGMA 1M8EA 3NLVA 3NM0A 3Q9AA 4CU1A 1FOJA 2AN0A 3E67A 3E6LA 4UGBA 4K5KA 1FOPA 3E7SA 5G6KA 5G6DA 2HX3A 4FVZA 1M9JA 4KCRA 4KCHA 3HSPA 2FC2A 3E7GA 4D36A 3B3NA 3NLDA 5AGOA 3E6OA 4LWAA 4CX1A 2AN2A 3N5QA 5AGNA 4LUXA 4UGFA 5G69A 4UGUA 3NLWA 5FJ2A 4D31A 4D2YA 4JSMA 3N5ZA 1D1VA 2ORQA 5ADAA 3EAHA 3N5WA 1MMVA 1DF1A 6NSEA 4JSJA 4CX4A 1DD7A 1OM5A 5FVZA 5AD6A 1LZXA 4KCKA 5FVSA 3JX1A 4CWVA 4CX3A 2Y37A 5G6BA 3TYNA 4KCSA 3NLXA 1M00A 4JSIA 4CDTA 4D3TA 4D3UA 4D3JA 3E65A 4KCJA 4UG5A 5ADFA 3JX5A 5AD7A 1DMJA 4UGRA 5G6IA 3N5VA 4NOSA 4UGNA 5G67A 4UH2A 1MMWA 4UH6A 4K5JA 3HSOA 2G6NA 5FVXA 1R35A 1NODA 3JWXA 1QWCA 3NLJA 4UPQA 4JS9A 3NLNA 3JT8A 4D1PA 1D1YA 2NOSA 3NLGA 5AD4A 5FVPA 4D3BA 1ZZSA 3RQNA 3N63A 3E7IA 5NSEA 4CAPA 5FVOA 4UH7A 4CTUA 5ADNA 4UH8A 4CU0A 4JSEA 4UPRA 1DMIA 5FVQA 3NLPA 4UH9A 3DQSA 4CX0A 5G65A 3N6GA 1P6MA 2BHJA 5ADGA 4CX6A 4UHAA 2G6MA 4UGHA 3EJ8A 4CTQA 4CX5A 3JTAA 2G6HA 4EUXA 3EBFA 4UGMA 4UH3A 4KCMA 5AD8A 4UQRA 1M9RA 1P6NA 2NSIA 1DM6A 4C39A 3NLMA 4UGQA 4CAQA 3NLOA 3E6NA 4FW0A 3EAIA 1DMKA 4D33A 3JX4A 5ADIA 3E7TA 4KCLA 4UGAA 5AGKA 1D0CA 2AMOA 1FOIA 3NNZA 3TYLA 5G6CA 3JWWA 3NNYA 3DQRA 1M9QA 3DWJA 3N6FA 3N2RA 1P6KA 4UGYA 4UH0A 1ZZRA 4CTVA 2NODA 3PNHA 4KCIA 3JX0A 4CULA 4CTWA 3NLYA 3PNFA 2ORTA 4CTTA 1NSEA 1M9KA 3JX3A 3N64A 3N62A 4V3WA 3NLTA 4D3KA 1ZVIA 5G6EA 3UFTA 4C3AA 4CTZA 4UGLA 3NLQA 1LZZA 5G6PA 3JT3A 4CWWA 4IMWA 3NLKA 3DQTA 3NLRA 5ADDA 9NSEA 5FW0A 4CWZA 5ADKA 4UPNA 4UGXA 4UGCA 4D7HA 4CAOA
chains in the Genus database with same CATH topology
3JWYA 4UGEA 4JSGA 3UFWA 4D3AA 4K5DA 1K2UA 3JX6A 1P6IA 1QW5A 3N5PA 1NSIA 3NOSA 1DWXA 4UH1A 3EBDA 5ADCA 3N65A 4D37A 4GQEA 5AGLA 2FBZX 4UGSA 4D1NA 4V3XA 3RQPA 2ORRA 4KCPA 4KCOA 4CAMA 4FVXA 3RQLA 4CWXA 1FOOA 4CTPA 5ADLA 5FVWA 3E7MA 4UGZA 4CU1B 4UH4A 3JWUA 4CANA 5G66A 4D3OA 1RS6A 4D7IA 4UPSA 3N66A 3E7SB 3JWTA 3TYMA 1QOMA 2G6IA 5FVTA 4UGIA 2G6JA 4JSKA 4D30A 1DWWA 1JWJA 2FLQA 3Q99A 4UPMA 5FVRA 5G6FA 1D1XA 1Q2OA 4CARA 5G68A 3E68A 4UGKA 5G6JA 3N6AA 1DM7A 1OM4A 4K5HA 4UG6A 4UQSA 4KCQA 4UGJA 3NLZA 3JT5A 2G6OA 1K2TA 3N5YA 4CWYA 3NLHA 3RQOA 1RS8A 4UPPA 4D39A 4K5EA 8NSEA 4CTXA 3JT7A 4KCNA 4JSHA 1ZZTA 5AGPA 3N6BA 3JWSA 4UGGA 1JWKA 3SVQA 4UH5A 3UFPA 3B3PA 3N5RA 3N5SA 4UGWA 4CX7A 4D3IA 5G6NA 3JT4A 3PNEA 5G6LA 4D3VA 4CVGA 4JSFA 3UFRA 3FC5A 1K2RA 3NLFA 2HX2A 4JSLA 3UFUA 4K5IA 5ADBA 3NLIA 4UGOA 4UGVA 1MJTA 3N61A 3NW2A 3N67A 4UCHA 3RQJA 1M8DA 3N60A 4IMUA 4UGDA 5G6GA 3N5XA 4IMSA 4D7JA 3PNGA 2FC1A 4CUNA 4UGTA 4CFTB 1P6HA 5G6QA 1M7ZA 4D7OA 3JT9A 5G6AA 3N68A 1M8HA 3JWZA 4V3UA 4V3VA 4IMXA 3NSEA 1DM8A 3RQMA 1NOSA 3N5TA 5AD5A 3JX2A 4UG9A 1RS7A 1NOCA 2HX4A 1FOLA 4K5FA 1ZVLA 4NSEA 4V3ZA 5G0NA 4LUWA 3UFQA 3NLUA 4CTYA 1M9MA 4D3NA 3RQKA 7NSEA 1ED4A 1D1WA 3N6CA 1QW6A 3NQSA 1I83A 1N2NA 1M7VA 4CUMA 5G0OA 4D34A 3N6DA 5FVVA 3N69A 4D38A 2ORSA 3NLEA 4K5GA 5ADEA 1P6JA 3SVPA 2OROA 1M9TA 2G6KA 2G6LA 4FVYA 4V3YA 1ED5A 4CX2A 3N6EA 4D2ZA 1QW4A 1RS9A 4FVWA 5G0PA 3NODA 2NSEA 2ORPA 1D0OA 4UG7A 1ZZUA 3E6TA 1ED6A 3TYOA 3JWVA 1DWVA 4D32A 4UPTA 4D1OA 5G6OA 4CFTA 1ZZQA 5FVUA 1K2SA 3UFOA 3B3OA 1VAGA 4LWBA 3B3MA 5FJ3A 4UPOA 5ADMA 5ADJA 5AD9A 4D35A 5G6MA 5FVYA 1VAFA 4UGPA 1P6LA 3JT6A 5G6HA 4CTRA 4D3MA 3HSNA 4UG8A 1M8IA 4IMTA 3UFSA 3UFVA 5AGMA 1M8EA 3NLVA 3NM0A 3Q9AA 4CU1A 1FOJA 2AN0A 3E67A 3E6LA 4UGBA 4K5KA 1FOPA 3E7SA 5G6KA 5G6DA 2HX3A 4FVZA 1M9JA 4KCRA 4KCHA 3HSPA 2FC2A 3E7GA 4D36A 3B3NA 3NLDA 5AGOA 3E6OA 4LWAA 4CX1A 2AN2A 3N5QA 5AGNA 4LUXA 4UGFA 5G69A 4UGUA 3NLWA 5FJ2A 4D31A 4D2YA 4JSMA 3N5ZA 1D1VA 2ORQA 5ADAA 3EAHA 3N5WA 1MMVA 1DF1A 6NSEA 4JSJA 4CX4A 1DD7A 1OM5A 5FVZA 5AD6A 1LZXA 4KCKA 5FVSA 3JX1A 4CWVA 4CX3A 2Y37A 5G6BA 3TYNA 4KCSA 3NLXA 1M00A 4JSIA 4CDTA 4D3TA 4D3UA 4D3JA 3E65A 4KCJA 4UG5A 5ADFA 3JX5A 5AD7A 1DMJA 4UGRA 5G6IA 3N5VA 4NOSA 4UGNA 5G67A 4UH2A 1MMWA 4UH6A 4K5JA 3HSOA 2G6NA 5FVXA 1R35A 1NODA 3JWXA 1QWCA 3NLJA 4UPQA 4JS9A 3NLNA 3JT8A 4D1PA 1D1YA 2NOSA 3NLGA 5AD4A 5FVPA 4D3BA 1ZZSA 3RQNA 3N63A 3E7IA 5NSEA 4CAPA 5FVOA 4UH7A 4CTUA 5ADNA 4UH8A 4CU0A 4JSEA 4UPRA 1DMIA 5FVQA 3NLPA 4UH9A 3DQSA 4CX0A 5G65A 3N6GA 1P6MA 2BHJA 5ADGA 4CX6A 4UHAA 2G6MA 4UGHA 3EJ8A 4CTQA 4CX5A 3JTAA 2G6HA 4EUXA 3EBFA 4UGMA 4UH3A 4KCMA 5AD8A 4UQRA 1M9RA 1P6NA 2NSIA 1DM6A 4C39A 3NLMA 4UGQA 4CAQA 3NLOA 3E6NA 4FW0A 3EAIA 1DMKA 4D33A 3JX4A 5ADIA 3E7TA 4KCLA 4UGAA 5AGKA 1D0CA 2AMOA 1FOIA 3NNZA 3TYLA 5G6CA 3JWWA 3NNYA 3DQRA 1M9QA 3DWJA 3N6FA 3N2RA 1P6KA 4UGYA 4UH0A 1ZZRA 4CTVA 2NODA 3PNHA 4KCIA 3JX0A 4CULA 4CTWA 3NLYA 3PNFA 2ORTA 4CTTA 1NSEA 1M9KA 3JX3A 3N64A 3N62A 4V3WA 3NLTA 4D3KA 1ZVIA 5G6EA 3UFTA 4C3AA 4CTZA 4UGLA 3NLQA 1LZZA 5G6PA 3JT3A 4CWWA 4IMWA 3NLKA 3DQTA 3NLRA 5ADDA 9NSEA 5FW0A 4CWZA 5ADKA 4UPNA 4UGXA 4UGCA 4D7HA 4CAOA
chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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