5G6OA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with two molecules of 7-((4-(dimethylamino)methyl)phenoxy)methyl)quinolin- 2- amine
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 127
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g6oA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g6oA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g6oA03
3UFRA 2NSIA 4CAPA 3NM0A 3NNZA 4CARA 4KCKA 1P6IA 3JT3A 4D3JA 3B3OA 3NOSA 4C39A 4UGIA 1M9KA 1DWVA 1D1WA 1QW4A 4FVZA 3DQTA 4CX7A 1K2TA 4CWYA 1DWXA 3NLEA 5FVZA 4CTYA 4KCPA 3PNHA 4KCQA 1ZVLA 4UH3A 1MMVA 1Q2OA 4IMXA 4CTRA 3EAHA 3NQSA 4V3UA 3EAIA 1RS6A 5FW0A 2HX3A 3NLMA 3RQOA 3N5YA 4UGKA 4UPMA 3N60A 4KCMA 3N6GA 1RS9A 5ADBA 5G65A 3N5PA 4JS9A 1D0OA 3E67A 3E7IA 3HSPA 5ADDA 1ZZUA 3N6EA 4D34A 4D1NA 9NSEA 4D3MA 3NLPA 4C3AA 5ADEA 2G6OA 4CX5A 5AD7A 4JSMA 3PNFA 4D2YA 2NSEA 4UG8A 3N6AA 1ED6A 1FOPA 4CVGA 3N64A 5FVOA 4V3VA 4UGPA 5FVPA 5ADAA 4D7JA 3E6LA 4D3BA 3N69A 1DM6A 1K2SA 5G69A 1FOIA 5FVXA 4UH8A 5AD9A 1M7VA 2ORSA 3N5TA 5G67A 7NSEA 1DD7A 4JSJA 4KCRA 4KCJA 1QOMA 4KCOA 4FVXA 3DQSA 4LUXA 1QW5A 1ZZTA 3JX0A 4UGBA 4K5DA 3JX2A 1M8IA 5ADIA 5G0NA 3NLGA 3JWTA 5G66A 4IMTA 3RQMA 4KCHA 4CUNA 3JX3A 4JSEA 2G6HA 1MJTA 3UFWA 3JX1A 3RQJA 2G6NA 5G6MA 4JSHA 2AMOA 3N5ZA 4UGAA 4CWZA 2ORPA 3E7GA 3N6FA 3NLFA 1M9RA 3E6TA 3RQNA 4UQRA 3EBDA 4KCIA 1JWKA 4CAMA 4NOSA 4UGJA 1ED4A 3JT4A 1FOLA 3N6DA 4LUWA 1NOSA 2G6MA 3RQPA 5FVWA 3JX6A 1OM4A 4D7HA 1DWWA 3N6BA 3NLTA 5G6KA 3JT6A 2ORRA 3EBFA 3NLUA 3NSEA 5G6AA 3N68A 5ADMA 3NODA 3N5SA 4UH0A 4D3NA 3NLRA 4EUXA 4CUMA 4CX0A 1FOOA 3TYNA 4D31A 4CX2A 3N5XA 3JTAA 3JT5A 4UGFA 3N66A 1RS8A 1M7ZA 4V3WA 4V3ZA 5G6HA 4CX3A 3NLJA 4UGLA 1JWJA 4GQEA 4UCHA 4UH1A 3NLNA 4FW0A 4IMUA 4UGGA 1QWCA 4CU0A 4D39A 4D38A 4UGUA 4D2ZA 4K5IA 3NLKA 5G0PA 1NODA 5G6PA 1ZZQA 5AGOA 4D7OA 3NLOA 3TYMA 3UFQA 4UGQA 5FVQA 4UGVA 5AD8A 5AD4A 5G6CA 3JT7A 3NLZA 4UGNA 4UH2A 1K2UA 3N6CA 5AD5A 5G6BA 3JWSA 1NSEA 4UGRA 1NSIA 4LWBA 5FJ2A 1I83A 1M8HA 4CWWA 4D3OA 3DWJA 4LWAA 1N2NA 3N5QA 5G6JA 5ADKA 3UFVA 4CULA 4UH9A 5NSEA 4CTUA 5AGKA 3NLDA 4D33A 4K5FA 1ZZSA 3UFTA 3E7SB 5FVUA 4CTXA 4FVYA 4UPTA 3TYOA 1P6MA 1QW6A 1P6KA 4D3UA 3JWXA 4CU1B 3N62A 5AGNA 1DMJA 4UHAA 3N65A 5ADJA 4JSLA 2AN0A 1D0CA 2ORQA 4CX1A 1OM5A 3HSNA 1P6LA 4FVWA 4IMWA 3E7SA 5ADGA 4UH4A 4V3YA 3NLXA 3UFPA 1M00A 5FVVA 4JSGA 4CU1A 3B3NA 4IMSA 4UPRA 5G6LA 2NODA 4CWVA 4UG6A 3JT8A 4UQSA 2Y37A 3PNEA 1VAFA 3NLQA 5G6DA 3NW2A 3RQLA 5G6OA 4UGDA 4UG5A 3N5VA 1M8DA 4D7IA 1D1YA 4CX4A 3HSOA 4D30A 5ADLA 2FC2A 4KCLA 4UH6A 3JWUA 2G6LA 4CX6A 8NSEA 4UG9A 1FOJA 5AD6A 3E68A 1K2RA 3E65A 4CAOA 3FC5A 4KCSA 1ZZRA 6NSEA 4JSKA 5G0OA 3SVPA 4D3VA 4UPPA 4D3AA 4UGTA 4V3XA 3E6NA 5ADNA 4CTTA 1DMIA 4CTQA 3Q9AA 3E7TA 5FVTA 1R35A 5FJ3A 5G6NA 3NLYA 4CTVA 3DQRA 3NLHA 4UGSA 4UGCA 4UPNA 4UGOA 4JSFA 4K5HA 1RS7A 4UGEA 5FVYA 5G6FA 3TYLA 5G6EA 4D1PA 4UPSA 1ED5A 3N5RA 4D37A 1P6JA 2FC1A 2NOSA 4UH7A 3NLIA 4UGMA 5AGPA 5G6IA 5ADFA 1DM8A 4CDTA 4UGZA 4CTZA 3JT9A 1VAGA 3UFUA 4K5GA 4CAQA 4CFTB 3UFOA 4CTPA 1M9QA 4UGXA 4KCNA 1MMWA 1M9MA 5G68A 1M9TA 1LZZA 1M9JA 2FBZX 2HX4A 4UGYA 1D1XA 1DM7A 5AGLA 2OROA 2ORTA 1LZXA 2FLQA 3N5WA 4UG7A 3N61A 3UFSA 3NLVA 1DF1A 4CTWA 1M8EA 4CFTA 4D3TA 4UGWA 3N67A 5FVSA 3B3MA 2BHJA 3JWZA 3JX4A 3SVQA 3RQKA 5ADCA 1ZVIA 4CANA 2G6JA 3B3PA 4K5JA 4NSEA 3NNYA 4CWXA 3JWWA 1DMKA 3NLWA 4UPOA 4UH5A 4UGHA 5G6QA 4D1OA 1NOCA 3N63A 5G6GA 3JWVA 3E7MA 2HX2A 3Q99A 2AN2A 4D3IA 5AGMA 3N2RA 4K5KA 4JSIA 4K5EA 5FVRA 3JWYA 3E6OA 4D32A 3EJ8A 3JX5A 1D1VA 4UPQA 4D3KA 4D36A 1P6HA 3PNGA 4D35A 2G6KA 1P6NA 2G6IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UFRA 2NSIA 4CAPA 3NM0A 3NNZA 4CARA 4KCKA 1P6IA 3JT3A 4D3JA 3B3OA 3NOSA 4C39A 4UGIA 1M9KA 1DWVA 1D1WA 1QW4A 4FVZA 3DQTA 4CX7A 1K2TA 4CWYA 1DWXA 3NLEA 5FVZA 4CTYA 4KCPA 3PNHA 4KCQA 1ZVLA 4UH3A 1MMVA 1Q2OA 4IMXA 4CTRA 3EAHA 3NQSA 4V3UA 3EAIA 1RS6A 5FW0A 2HX3A 3NLMA 3RQOA 3N5YA 4UGKA 4UPMA 3N60A 4KCMA 3N6GA 1RS9A 5ADBA 5G65A 3N5PA 4JS9A 1D0OA 3E67A 3E7IA 3HSPA 5ADDA 1ZZUA 3N6EA 4D34A 4D1NA 9NSEA 4D3MA 3NLPA 4C3AA 5ADEA 2G6OA 4CX5A 5AD7A 4JSMA 3PNFA 4D2YA 2NSEA 4UG8A 3N6AA 1ED6A 1FOPA 4CVGA 3N64A 5FVOA 4V3VA 4UGPA 5FVPA 5ADAA 4D7JA 3E6LA 4D3BA 3N69A 1DM6A 1K2SA 5G69A 1FOIA 5FVXA 4UH8A 5AD9A 1M7VA 2ORSA 3N5TA 5G67A 7NSEA 1DD7A 4JSJA 4KCRA 4KCJA 1QOMA 4KCOA 4FVXA 3DQSA 4LUXA 1QW5A 1ZZTA 3JX0A 4UGBA 4K5DA 3JX2A 1M8IA 5ADIA 5G0NA 3NLGA 3JWTA 5G66A 4IMTA 3RQMA 4KCHA 4CUNA 3JX3A 4JSEA 2G6HA 1MJTA 3UFWA 3JX1A 3RQJA 2G6NA 5G6MA 4JSHA 2AMOA 3N5ZA 4UGAA 4CWZA 2ORPA 3E7GA 3N6FA 3NLFA 1M9RA 3E6TA 3RQNA 4UQRA 3EBDA 4KCIA 1JWKA 4CAMA 4NOSA 4UGJA 1ED4A 3JT4A 1FOLA 3N6DA 4LUWA 1NOSA 2G6MA 3RQPA 5FVWA 3JX6A 1OM4A 4D7HA 1DWWA 3N6BA 3NLTA 5G6KA 3JT6A 2ORRA 3EBFA 3NLUA 3NSEA 5G6AA 3N68A 5ADMA 3NODA 3N5SA 4UH0A 4D3NA 3NLRA 4EUXA 4CUMA 4CX0A 1FOOA 3TYNA 4D31A 4CX2A 3N5XA 3JTAA 3JT5A 4UGFA 3N66A 1RS8A 1M7ZA 4V3WA 4V3ZA 5G6HA 4CX3A 3NLJA 4UGLA 1JWJA 4GQEA 4UCHA 4UH1A 3NLNA 4FW0A 4IMUA 4UGGA 1QWCA 4CU0A 4D39A 4D38A 4UGUA 4D2ZA 4K5IA 3NLKA 5G0PA 1NODA 5G6PA 1ZZQA 5AGOA 4D7OA 3NLOA 3TYMA 3UFQA 4UGQA 5FVQA 4UGVA 5AD8A 5AD4A 5G6CA 3JT7A 3NLZA 4UGNA 4UH2A 1K2UA 3N6CA 5AD5A 5G6BA 3JWSA 1NSEA 4UGRA 1NSIA 4LWBA 5FJ2A 1I83A 1M8HA 4CWWA 4D3OA 3DWJA 4LWAA 1N2NA 3N5QA 5G6JA 5ADKA 3UFVA 4CULA 4UH9A 5NSEA 4CTUA 5AGKA 3NLDA 4D33A 4K5FA 1ZZSA 3UFTA 3E7SB 5FVUA 4CTXA 4FVYA 4UPTA 3TYOA 1P6MA 1QW6A 1P6KA 4D3UA 3JWXA 4CU1B 3N62A 5AGNA 1DMJA 4UHAA 3N65A 5ADJA 4JSLA 2AN0A 1D0CA 2ORQA 4CX1A 1OM5A 3HSNA 1P6LA 4FVWA 4IMWA 3E7SA 5ADGA 4UH4A 4V3YA 3NLXA 3UFPA 1M00A 5FVVA 4JSGA 4CU1A 3B3NA 4IMSA 4UPRA 5G6LA 2NODA 4CWVA 4UG6A 3JT8A 4UQSA 2Y37A 3PNEA 1VAFA 3NLQA 5G6DA 3NW2A 3RQLA 5G6OA 4UGDA 4UG5A 3N5VA 1M8DA 4D7IA 1D1YA 4CX4A 3HSOA 4D30A 5ADLA 2FC2A 4KCLA 4UH6A 3JWUA 2G6LA 4CX6A 8NSEA 4UG9A 1FOJA 5AD6A 3E68A 1K2RA 3E65A 4CAOA 3FC5A 4KCSA 1ZZRA 6NSEA 4JSKA 5G0OA 3SVPA 4D3VA 4UPPA 4D3AA 4UGTA 4V3XA 3E6NA 5ADNA 4CTTA 1DMIA 4CTQA 3Q9AA 3E7TA 5FVTA 1R35A 5FJ3A 5G6NA 3NLYA 4CTVA 3DQRA 3NLHA 4UGSA 4UGCA 4UPNA 4UGOA 4JSFA 4K5HA 1RS7A 4UGEA 5FVYA 5G6FA 3TYLA 5G6EA 4D1PA 4UPSA 1ED5A 3N5RA 4D37A 1P6JA 2FC1A 2NOSA 4UH7A 3NLIA 4UGMA 5AGPA 5G6IA 5ADFA 1DM8A 4CDTA 4UGZA 4CTZA 3JT9A 1VAGA 3UFUA 4K5GA 4CAQA 4CFTB 3UFOA 4CTPA 1M9QA 4UGXA 4KCNA 1MMWA 1M9MA 5G68A 1M9TA 1LZZA 1M9JA 2FBZX 2HX4A 4UGYA 1D1XA 1DM7A 5AGLA 2OROA 2ORTA 1LZXA 2FLQA 3N5WA 4UG7A 3N61A 3UFSA 3NLVA 1DF1A 4CTWA 1M8EA 4CFTA 4D3TA 4UGWA 3N67A 5FVSA 3B3MA 2BHJA 3JWZA 3JX4A 3SVQA 3RQKA 5ADCA 1ZVIA 4CANA 2G6JA 3B3PA 4K5JA 4NSEA 3NNYA 4CWXA 3JWWA 1DMKA 3NLWA 4UPOA 4UH5A 4UGHA 5G6QA 4D1OA 1NOCA 3N63A 5G6GA 3JWVA 3E7MA 2HX2A 3Q99A 2AN2A 4D3IA 5AGMA 3N2RA 4K5KA 4JSIA 4K5EA 5FVRA 3JWYA 3E6OA 4D32A 3EJ8A 3JX5A 1D1VA 4UPQA 4D3KA 4D36A 1P6HA 3PNGA 4D35A 2G6KA 1P6NA 2G6IA
chains in the Genus database with same CATH topology
3UFRA 2NSIA 4CAPA 3NM0A 3NNZA 4CARA 4KCKA 1P6IA 3JT3A 4D3JA 3B3OA 3NOSA 4C39A 4UGIA 1M9KA 1DWVA 1D1WA 1QW4A 4FVZA 3DQTA 4CX7A 1K2TA 4CWYA 1DWXA 3NLEA 5FVZA 4CTYA 4KCPA 3PNHA 4KCQA 1ZVLA 4UH3A 1MMVA 1Q2OA 4IMXA 4CTRA 3EAHA 3NQSA 4V3UA 3EAIA 1RS6A 5FW0A 2HX3A 3NLMA 3RQOA 3N5YA 4UGKA 4UPMA 3N60A 4KCMA 3N6GA 1RS9A 5ADBA 5G65A 3N5PA 4JS9A 1D0OA 3E67A 3E7IA 3HSPA 5ADDA 1ZZUA 3N6EA 4D34A 4D1NA 9NSEA 4D3MA 3NLPA 4C3AA 5ADEA 2G6OA 4CX5A 5AD7A 4JSMA 3PNFA 4D2YA 2NSEA 4UG8A 3N6AA 1ED6A 1FOPA 4CVGA 3N64A 5FVOA 4V3VA 4UGPA 5FVPA 5ADAA 4D7JA 3E6LA 4D3BA 3N69A 1DM6A 1K2SA 5G69A 1FOIA 5FVXA 4UH8A 5AD9A 1M7VA 2ORSA 3N5TA 5G67A 7NSEA 1DD7A 4JSJA 4KCRA 4KCJA 1QOMA 4KCOA 4FVXA 3DQSA 4LUXA 1QW5A 1ZZTA 3JX0A 4UGBA 4K5DA 3JX2A 1M8IA 5ADIA 5G0NA 3NLGA 3JWTA 5G66A 4IMTA 3RQMA 4KCHA 4CUNA 3JX3A 4JSEA 2G6HA 1MJTA 3UFWA 3JX1A 3RQJA 2G6NA 5G6MA 4JSHA 2AMOA 3N5ZA 4UGAA 4CWZA 2ORPA 3E7GA 3N6FA 3NLFA 1M9RA 3E6TA 3RQNA 4UQRA 3EBDA 4KCIA 1JWKA 4CAMA 4NOSA 4UGJA 1ED4A 3JT4A 1FOLA 3N6DA 4LUWA 1NOSA 2G6MA 3RQPA 5FVWA 3JX6A 1OM4A 4D7HA 1DWWA 3N6BA 3NLTA 5G6KA 3JT6A 2ORRA 3EBFA 3NLUA 3NSEA 5G6AA 3N68A 5ADMA 3NODA 3N5SA 4UH0A 4D3NA 3NLRA 4EUXA 4CUMA 4CX0A 1FOOA 3TYNA 4D31A 4CX2A 3N5XA 3JTAA 3JT5A 4UGFA 3N66A 1RS8A 1M7ZA 4V3WA 4V3ZA 5G6HA 4CX3A 3NLJA 4UGLA 1JWJA 4GQEA 4UCHA 4UH1A 3NLNA 4FW0A 4IMUA 4UGGA 1QWCA 4CU0A 4D39A 4D38A 4UGUA 4D2ZA 4K5IA 3NLKA 5G0PA 1NODA 5G6PA 1ZZQA 5AGOA 4D7OA 3NLOA 3TYMA 3UFQA 4UGQA 5FVQA 4UGVA 5AD8A 5AD4A 5G6CA 3JT7A 3NLZA 4UGNA 4UH2A 1K2UA 3N6CA 5AD5A 5G6BA 3JWSA 1NSEA 4UGRA 1NSIA 4LWBA 5FJ2A 1I83A 1M8HA 4CWWA 4D3OA 3DWJA 4LWAA 1N2NA 3N5QA 5G6JA 5ADKA 3UFVA 4CULA 4UH9A 5NSEA 4CTUA 5AGKA 3NLDA 4D33A 4K5FA 1ZZSA 3UFTA 3E7SB 5FVUA 4CTXA 4FVYA 4UPTA 3TYOA 1P6MA 1QW6A 1P6KA 4D3UA 3JWXA 4CU1B 3N62A 5AGNA 1DMJA 4UHAA 3N65A 5ADJA 4JSLA 2AN0A 1D0CA 2ORQA 4CX1A 1OM5A 3HSNA 1P6LA 4FVWA 4IMWA 3E7SA 5ADGA 4UH4A 4V3YA 3NLXA 3UFPA 1M00A 5FVVA 4JSGA 4CU1A 3B3NA 4IMSA 4UPRA 5G6LA 2NODA 4CWVA 4UG6A 3JT8A 4UQSA 2Y37A 3PNEA 1VAFA 3NLQA 5G6DA 3NW2A 3RQLA 5G6OA 4UGDA 4UG5A 3N5VA 1M8DA 4D7IA 1D1YA 4CX4A 3HSOA 4D30A 5ADLA 2FC2A 4KCLA 4UH6A 3JWUA 2G6LA 4CX6A 8NSEA 4UG9A 1FOJA 5AD6A 3E68A 1K2RA 3E65A 4CAOA 3FC5A 4KCSA 1ZZRA 6NSEA 4JSKA 5G0OA 3SVPA 4D3VA 4UPPA 4D3AA 4UGTA 4V3XA 3E6NA 5ADNA 4CTTA 1DMIA 4CTQA 3Q9AA 3E7TA 5FVTA 1R35A 5FJ3A 5G6NA 3NLYA 4CTVA 3DQRA 3NLHA 4UGSA 4UGCA 4UPNA 4UGOA 4JSFA 4K5HA 1RS7A 4UGEA 5FVYA 5G6FA 3TYLA 5G6EA 4D1PA 4UPSA 1ED5A 3N5RA 4D37A 1P6JA 2FC1A 2NOSA 4UH7A 3NLIA 4UGMA 5AGPA 5G6IA 5ADFA 1DM8A 4CDTA 4UGZA 4CTZA 3JT9A 1VAGA 3UFUA 4K5GA 4CAQA 4CFTB 3UFOA 4CTPA 1M9QA 4UGXA 4KCNA 1MMWA 1M9MA 5G68A 1M9TA 1LZZA 1M9JA 2FBZX 2HX4A 4UGYA 1D1XA 1DM7A 5AGLA 2OROA 2ORTA 1LZXA 2FLQA 3N5WA 4UG7A 3N61A 3UFSA 3NLVA 1DF1A 4CTWA 1M8EA 4CFTA 4D3TA 4UGWA 3N67A 5FVSA 3B3MA 2BHJA 3JWZA 3JX4A 3SVQA 3RQKA 5ADCA 1ZVIA 4CANA 2G6JA 3B3PA 4K5JA 4NSEA 3NNYA 4CWXA 3JWWA 1DMKA 3NLWA 4UPOA 4UH5A 4UGHA 5G6QA 4D1OA 1NOCA 3N63A 5G6GA 3JWVA 3E7MA 2HX2A 3Q99A 2AN2A 4D3IA 5AGMA 3N2RA 4K5KA 4JSIA 4K5EA 5FVRA 3JWYA 3E6OA 4D32A 3EJ8A 3JX5A 1D1VA 4UPQA 4D3KA 4D36A 1P6HA 3PNGA 4D35A 2G6KA 1P6NA 2G6IA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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