5G6QA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 7-(((5-((methylamino)methyl)pyridin-3-yl)oxy)methyl) quinolin-2-amine
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 122
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g6qA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g6qA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g6qA03
4UGNA 4K5EA 3JWWA 5G6KA 1ZVIA 4UGFA 2ORPA 4EUXA 4IMUA 5AGMA 3B3MA 3JX1A 3NNZA 2AN0A 1ZZSA 1M8IA 3NLQA 1NOCA 5NSEA 3N66A 5FVXA 4CTXA 5ADEA 5FVWA 1NSIA 4UGLA 1RS8A 3NODA 3TYMA 5G6PA 3NLEA 2G6NA 1ED4A 5G65A 4CU1B 4K5GA 4UH8A 4UPOA 4UGXA 5G6MA 1DM6A 4UGQA 2OROA 1LZZA 4LUXA 3N6DA 4UH6A 5FVTA 4CFTA 4JS9A 1FOJA 4UGKA 3N65A 4KCPA 5AD7A 1ZZUA 3UFPA 5ADDA 3NLJA 4UPPA 4CX6A 1M7ZA 3UFVA 3N5SA 3NLMA 1DWWA 3B3OA 4D3AA 1FOOA 3E7SB 5G6HA 4CAQA 5ADLA 1M9JA 4K5JA 3E7GA 5ADJA 4IMTA 4UH7A 3UFSA 4CX2A 1FOLA 5AGNA 2Y37A 4UQRA 4LWAA 3HSOA 4CDTA 3DQRA 3JWTA 5AGPA 5ADFA 4KCRA 2G6KA 4FVWA 3EBDA 3NLFA 1QWCA 4CUNA 4CU1A 4K5DA 3NLZA 3E6LA 4D36A 2ORSA 3NLPA 4UG5A 1JWJA 5G6CA 4NSEA 4CVGA 4D1OA 4UGHA 1ZZRA 1K2TA 3N5QA 5G6OA 3N68A 1MMVA 4UG9A 5FVRA 4JSEA 5G6GA 3SVQA 2NODA 5AD8A 4V3WA 1P6KA 3JT8A 5G69A 3E7TA 1VAFA 3N5YA 4CWYA 4UPMA 1M00A 5G0PA 3E6TA 3UFQA 4UGZA 4UGAA 3NM0A 4GQEA 2FLQA 5ADCA 1P6MA 4FVZA 1M9MA 4KCLA 3PNGA 3N5PA 3PNEA 3E7SA 3JWZA 1D1WA 3E7IA 4UGSA 4D7OA 3DWJA 1M9TA 3EJ8A 2G6MA 3N62A 4D37A 2G6JA 3UFOA 5G6EA 4CTQA 4CX1A 5G0OA 4UGJA 4CWWA 9NSEA 4UGVA 4KCSA 5AD5A 4CULA 3DQTA 3DQSA 1M9QA 3NLIA 3NW2A 4KCIA 1DMIA 1NODA 3N5XA 4C39A 4UG6A 4JSHA 4UPRA 5FVUA 5G67A 3JTAA 3JX0A 2ORTA 3N6AA 3RQJA 4JSMA 3SVPA 4V3YA 3NLVA 3Q9AA 2HX2A 3TYOA 4CX4A 4UGWA 4D33A 1P6IA 3JX5A 3RQOA 3JT5A 3EAHA 4JSJA 3NLYA 5G6NA 1QW4A 4D3BA 5ADBA 4KCQA 5G6BA 4KCOA 3HSPA 4D3OA 4D3KA 3N69A 2FC2A 4UGEA 4CTTA 3EBFA 3JWSA 2G6LA 3N64A 4D3MA 5FVOA 4CTYA 3N6GA 2NOSA 4D2ZA 3RQMA 4CTWA 4JSGA 4D39A 2G6HA 3N5RA 2HX4A 1D1YA 3E7MA 1P6LA 4CX3A 4FVYA 4IMSA 3N6FA 6NSEA 1ED5A 1K2UA 4UPTA 3NLDA 4UG7A 5G6AA 1QOMA 4D2YA 1M7VA 3JWVA 4UH5A 5AD4A 4CTVA 3FC5A 5FVPA 1RS7A 3B3PA 1M9KA 3E67A 2AMOA 3NLRA 3JT3A 3EAIA 3N61A 1D0CA 4CTRA 3NLKA 5G6DA 4NOSA 5FVVA 1RS9A 5AGOA 5G68A 3E6OA 1ZZQA 4UH9A 4UH3A 4D30A 4D7JA 3N6EA 1K2SA 4UGDA 5FJ2A 5G66A 1D0OA 4UGUA 4D7HA 3NLXA 3HSNA 4KCNA 4KCKA 4UGIA 5G6JA 4CWZA 1M8DA 2G6OA 5G0NA 4CX0A 3N5VA 3UFWA 4IMXA 1D1XA 1DMKA 7NSEA 5G6FA 3E65A 4D7IA 4V3UA 5ADMA 4LUWA 4CWXA 4UG8A 4UGGA 1VAGA 3N5TA 4CTPA 3NNYA 4UGMA 4JSLA 1ZVLA 1DF1A 5AD9A 4UGYA 3JX2A 3PNFA 4K5HA 4D32A 5G6IA 1M8HA 3JT4A 5ADIA 1NSEA 3NLWA 4D3IA 3N6CA 3JX4A 3NOSA 4FW0A 5ADAA 4K5KA 3N60A 4UQSA 4UGPA 5AGKA 4UGOA 1P6JA 4CX7A 1DWXA 4D3JA 5FVZA 4CAPA 1DM7A 5FJ3A 4UPNA 3Q99A 4D38A 4FVXA 5G6LA 1MMWA 4CANA 4D31A 1FOPA 1DWVA 4LWBA 2NSIA 1OM5A 1OM4A 3E68A 3N5ZA 1ZZTA 1N2NA 3JT7A 1ED6A 1LZXA 3TYNA 1K2RA 3E6NA 3PNHA 4JSFA 1NOSA 1DMJA 4UH2A 4UHAA 1D1VA 1I83A 4V3VA 2BHJA 4D35A 3RQPA 4KCMA 2HX3A 3UFTA 1DM8A 4D3UA 3JX3A 2AN2A 4JSIA 1MJTA 3RQKA 4CX5A 4KCJA 3NSEA 4CWVA 4V3XA 4CU0A 4CAOA 4K5FA 3UFRA 4IMWA 5AGLA 2FC1A 4UGTA 3JX6A 2G6IA 3NLNA 4CTUA 3N5WA 3JWYA 3N6BA 4D3VA 4D3TA 1QW6A 4UH4A 2ORQA 4UCHA 5ADGA 4K5IA 4D1NA 1JWKA 4D3NA 3NLUA 3NQSA 3JWXA 4UGBA 3NLGA 3JWUA 4UH1A 1R35A 4CAMA 5AD6A 4V3ZA 4KCHA 5ADNA 1Q2OA 2NSEA 5ADKA 3UFUA 1RS6A 1M9RA 4UGCA 4UPQA 3NLTA 3RQLA 3N2RA 4CTZA 3B3NA 5FVYA 4JSKA 4CFTB 5G6QA 5FW0A 1FOIA 5FVQA 4D34A 4CARA 4D1PA 2FBZX 3TYLA 1P6HA 3JT9A 3NLOA 2ORRA 3RQNA 3N63A 1DD7A 3N67A 1QW5A 3NLHA 4UGRA 3JT6A 8NSEA 1P6NA 5FVSA 4CUMA 4UPSA 4UH0A 1M8EA 4C3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UGNA 4K5EA 3JWWA 5G6KA 1ZVIA 4UGFA 2ORPA 4EUXA 4IMUA 5AGMA 3B3MA 3JX1A 3NNZA 2AN0A 1ZZSA 1M8IA 3NLQA 1NOCA 5NSEA 3N66A 5FVXA 4CTXA 5ADEA 5FVWA 1NSIA 4UGLA 1RS8A 3NODA 3TYMA 5G6PA 3NLEA 2G6NA 1ED4A 5G65A 4CU1B 4K5GA 4UH8A 4UPOA 4UGXA 5G6MA 1DM6A 4UGQA 2OROA 1LZZA 4LUXA 3N6DA 4UH6A 5FVTA 4CFTA 4JS9A 1FOJA 4UGKA 3N65A 4KCPA 5AD7A 1ZZUA 3UFPA 5ADDA 3NLJA 4UPPA 4CX6A 1M7ZA 3UFVA 3N5SA 3NLMA 1DWWA 3B3OA 4D3AA 1FOOA 3E7SB 5G6HA 4CAQA 5ADLA 1M9JA 4K5JA 3E7GA 5ADJA 4IMTA 4UH7A 3UFSA 4CX2A 1FOLA 5AGNA 2Y37A 4UQRA 4LWAA 3HSOA 4CDTA 3DQRA 3JWTA 5AGPA 5ADFA 4KCRA 2G6KA 4FVWA 3EBDA 3NLFA 1QWCA 4CUNA 4CU1A 4K5DA 3NLZA 3E6LA 4D36A 2ORSA 3NLPA 4UG5A 1JWJA 5G6CA 4NSEA 4CVGA 4D1OA 4UGHA 1ZZRA 1K2TA 3N5QA 5G6OA 3N68A 1MMVA 4UG9A 5FVRA 4JSEA 5G6GA 3SVQA 2NODA 5AD8A 4V3WA 1P6KA 3JT8A 5G69A 3E7TA 1VAFA 3N5YA 4CWYA 4UPMA 1M00A 5G0PA 3E6TA 3UFQA 4UGZA 4UGAA 3NM0A 4GQEA 2FLQA 5ADCA 1P6MA 4FVZA 1M9MA 4KCLA 3PNGA 3N5PA 3PNEA 3E7SA 3JWZA 1D1WA 3E7IA 4UGSA 4D7OA 3DWJA 1M9TA 3EJ8A 2G6MA 3N62A 4D37A 2G6JA 3UFOA 5G6EA 4CTQA 4CX1A 5G0OA 4UGJA 4CWWA 9NSEA 4UGVA 4KCSA 5AD5A 4CULA 3DQTA 3DQSA 1M9QA 3NLIA 3NW2A 4KCIA 1DMIA 1NODA 3N5XA 4C39A 4UG6A 4JSHA 4UPRA 5FVUA 5G67A 3JTAA 3JX0A 2ORTA 3N6AA 3RQJA 4JSMA 3SVPA 4V3YA 3NLVA 3Q9AA 2HX2A 3TYOA 4CX4A 4UGWA 4D33A 1P6IA 3JX5A 3RQOA 3JT5A 3EAHA 4JSJA 3NLYA 5G6NA 1QW4A 4D3BA 5ADBA 4KCQA 5G6BA 4KCOA 3HSPA 4D3OA 4D3KA 3N69A 2FC2A 4UGEA 4CTTA 3EBFA 3JWSA 2G6LA 3N64A 4D3MA 5FVOA 4CTYA 3N6GA 2NOSA 4D2ZA 3RQMA 4CTWA 4JSGA 4D39A 2G6HA 3N5RA 2HX4A 1D1YA 3E7MA 1P6LA 4CX3A 4FVYA 4IMSA 3N6FA 6NSEA 1ED5A 1K2UA 4UPTA 3NLDA 4UG7A 5G6AA 1QOMA 4D2YA 1M7VA 3JWVA 4UH5A 5AD4A 4CTVA 3FC5A 5FVPA 1RS7A 3B3PA 1M9KA 3E67A 2AMOA 3NLRA 3JT3A 3EAIA 3N61A 1D0CA 4CTRA 3NLKA 5G6DA 4NOSA 5FVVA 1RS9A 5AGOA 5G68A 3E6OA 1ZZQA 4UH9A 4UH3A 4D30A 4D7JA 3N6EA 1K2SA 4UGDA 5FJ2A 5G66A 1D0OA 4UGUA 4D7HA 3NLXA 3HSNA 4KCNA 4KCKA 4UGIA 5G6JA 4CWZA 1M8DA 2G6OA 5G0NA 4CX0A 3N5VA 3UFWA 4IMXA 1D1XA 1DMKA 7NSEA 5G6FA 3E65A 4D7IA 4V3UA 5ADMA 4LUWA 4CWXA 4UG8A 4UGGA 1VAGA 3N5TA 4CTPA 3NNYA 4UGMA 4JSLA 1ZVLA 1DF1A 5AD9A 4UGYA 3JX2A 3PNFA 4K5HA 4D32A 5G6IA 1M8HA 3JT4A 5ADIA 1NSEA 3NLWA 4D3IA 3N6CA 3JX4A 3NOSA 4FW0A 5ADAA 4K5KA 3N60A 4UQSA 4UGPA 5AGKA 4UGOA 1P6JA 4CX7A 1DWXA 4D3JA 5FVZA 4CAPA 1DM7A 5FJ3A 4UPNA 3Q99A 4D38A 4FVXA 5G6LA 1MMWA 4CANA 4D31A 1FOPA 1DWVA 4LWBA 2NSIA 1OM5A 1OM4A 3E68A 3N5ZA 1ZZTA 1N2NA 3JT7A 1ED6A 1LZXA 3TYNA 1K2RA 3E6NA 3PNHA 4JSFA 1NOSA 1DMJA 4UH2A 4UHAA 1D1VA 1I83A 4V3VA 2BHJA 4D35A 3RQPA 4KCMA 2HX3A 3UFTA 1DM8A 4D3UA 3JX3A 2AN2A 4JSIA 1MJTA 3RQKA 4CX5A 4KCJA 3NSEA 4CWVA 4V3XA 4CU0A 4CAOA 4K5FA 3UFRA 4IMWA 5AGLA 2FC1A 4UGTA 3JX6A 2G6IA 3NLNA 4CTUA 3N5WA 3JWYA 3N6BA 4D3VA 4D3TA 1QW6A 4UH4A 2ORQA 4UCHA 5ADGA 4K5IA 4D1NA 1JWKA 4D3NA 3NLUA 3NQSA 3JWXA 4UGBA 3NLGA 3JWUA 4UH1A 1R35A 4CAMA 5AD6A 4V3ZA 4KCHA 5ADNA 1Q2OA 2NSEA 5ADKA 3UFUA 1RS6A 1M9RA 4UGCA 4UPQA 3NLTA 3RQLA 3N2RA 4CTZA 3B3NA 5FVYA 4JSKA 4CFTB 5G6QA 5FW0A 1FOIA 5FVQA 4D34A 4CARA 4D1PA 2FBZX 3TYLA 1P6HA 3JT9A 3NLOA 2ORRA 3RQNA 3N63A 1DD7A 3N67A 1QW5A 3NLHA 4UGRA 3JT6A 8NSEA 1P6NA 5FVSA 4CUMA 4UPSA 4UH0A 1M8EA 4C3AA
chains in the Genus database with same CATH topology
4UGNA 4K5EA 3JWWA 5G6KA 1ZVIA 4UGFA 2ORPA 4EUXA 4IMUA 5AGMA 3B3MA 3JX1A 3NNZA 2AN0A 1ZZSA 1M8IA 3NLQA 1NOCA 5NSEA 3N66A 5FVXA 4CTXA 5ADEA 5FVWA 1NSIA 4UGLA 1RS8A 3NODA 3TYMA 5G6PA 3NLEA 2G6NA 1ED4A 5G65A 4CU1B 4K5GA 4UH8A 4UPOA 4UGXA 5G6MA 1DM6A 4UGQA 2OROA 1LZZA 4LUXA 3N6DA 4UH6A 5FVTA 4CFTA 4JS9A 1FOJA 4UGKA 3N65A 4KCPA 5AD7A 1ZZUA 3UFPA 5ADDA 3NLJA 4UPPA 4CX6A 1M7ZA 3UFVA 3N5SA 3NLMA 1DWWA 3B3OA 4D3AA 1FOOA 3E7SB 5G6HA 4CAQA 5ADLA 1M9JA 4K5JA 3E7GA 5ADJA 4IMTA 4UH7A 3UFSA 4CX2A 1FOLA 5AGNA 2Y37A 4UQRA 4LWAA 3HSOA 4CDTA 3DQRA 3JWTA 5AGPA 5ADFA 4KCRA 2G6KA 4FVWA 3EBDA 3NLFA 1QWCA 4CUNA 4CU1A 4K5DA 3NLZA 3E6LA 4D36A 2ORSA 3NLPA 4UG5A 1JWJA 5G6CA 4NSEA 4CVGA 4D1OA 4UGHA 1ZZRA 1K2TA 3N5QA 5G6OA 3N68A 1MMVA 4UG9A 5FVRA 4JSEA 5G6GA 3SVQA 2NODA 5AD8A 4V3WA 1P6KA 3JT8A 5G69A 3E7TA 1VAFA 3N5YA 4CWYA 4UPMA 1M00A 5G0PA 3E6TA 3UFQA 4UGZA 4UGAA 3NM0A 4GQEA 2FLQA 5ADCA 1P6MA 4FVZA 1M9MA 4KCLA 3PNGA 3N5PA 3PNEA 3E7SA 3JWZA 1D1WA 3E7IA 4UGSA 4D7OA 3DWJA 1M9TA 3EJ8A 2G6MA 3N62A 4D37A 2G6JA 3UFOA 5G6EA 4CTQA 4CX1A 5G0OA 4UGJA 4CWWA 9NSEA 4UGVA 4KCSA 5AD5A 4CULA 3DQTA 3DQSA 1M9QA 3NLIA 3NW2A 4KCIA 1DMIA 1NODA 3N5XA 4C39A 4UG6A 4JSHA 4UPRA 5FVUA 5G67A 3JTAA 3JX0A 2ORTA 3N6AA 3RQJA 4JSMA 3SVPA 4V3YA 3NLVA 3Q9AA 2HX2A 3TYOA 4CX4A 4UGWA 4D33A 1P6IA 3JX5A 3RQOA 3JT5A 3EAHA 4JSJA 3NLYA 5G6NA 1QW4A 4D3BA 5ADBA 4KCQA 5G6BA 4KCOA 3HSPA 4D3OA 4D3KA 3N69A 2FC2A 4UGEA 4CTTA 3EBFA 3JWSA 2G6LA 3N64A 4D3MA 5FVOA 4CTYA 3N6GA 2NOSA 4D2ZA 3RQMA 4CTWA 4JSGA 4D39A 2G6HA 3N5RA 2HX4A 1D1YA 3E7MA 1P6LA 4CX3A 4FVYA 4IMSA 3N6FA 6NSEA 1ED5A 1K2UA 4UPTA 3NLDA 4UG7A 5G6AA 1QOMA 4D2YA 1M7VA 3JWVA 4UH5A 5AD4A 4CTVA 3FC5A 5FVPA 1RS7A 3B3PA 1M9KA 3E67A 2AMOA 3NLRA 3JT3A 3EAIA 3N61A 1D0CA 4CTRA 3NLKA 5G6DA 4NOSA 5FVVA 1RS9A 5AGOA 5G68A 3E6OA 1ZZQA 4UH9A 4UH3A 4D30A 4D7JA 3N6EA 1K2SA 4UGDA 5FJ2A 5G66A 1D0OA 4UGUA 4D7HA 3NLXA 3HSNA 4KCNA 4KCKA 4UGIA 5G6JA 4CWZA 1M8DA 2G6OA 5G0NA 4CX0A 3N5VA 3UFWA 4IMXA 1D1XA 1DMKA 7NSEA 5G6FA 3E65A 4D7IA 4V3UA 5ADMA 4LUWA 4CWXA 4UG8A 4UGGA 1VAGA 3N5TA 4CTPA 3NNYA 4UGMA 4JSLA 1ZVLA 1DF1A 5AD9A 4UGYA 3JX2A 3PNFA 4K5HA 4D32A 5G6IA 1M8HA 3JT4A 5ADIA 1NSEA 3NLWA 4D3IA 3N6CA 3JX4A 3NOSA 4FW0A 5ADAA 4K5KA 3N60A 4UQSA 4UGPA 5AGKA 4UGOA 1P6JA 4CX7A 1DWXA 4D3JA 5FVZA 4CAPA 1DM7A 5FJ3A 4UPNA 3Q99A 4D38A 4FVXA 5G6LA 1MMWA 4CANA 4D31A 1FOPA 1DWVA 4LWBA 2NSIA 1OM5A 1OM4A 3E68A 3N5ZA 1ZZTA 1N2NA 3JT7A 1ED6A 1LZXA 3TYNA 1K2RA 3E6NA 3PNHA 4JSFA 1NOSA 1DMJA 4UH2A 4UHAA 1D1VA 1I83A 4V3VA 2BHJA 4D35A 3RQPA 4KCMA 2HX3A 3UFTA 1DM8A 4D3UA 3JX3A 2AN2A 4JSIA 1MJTA 3RQKA 4CX5A 4KCJA 3NSEA 4CWVA 4V3XA 4CU0A 4CAOA 4K5FA 3UFRA 4IMWA 5AGLA 2FC1A 4UGTA 3JX6A 2G6IA 3NLNA 4CTUA 3N5WA 3JWYA 3N6BA 4D3VA 4D3TA 1QW6A 4UH4A 2ORQA 4UCHA 5ADGA 4K5IA 4D1NA 1JWKA 4D3NA 3NLUA 3NQSA 3JWXA 4UGBA 3NLGA 3JWUA 4UH1A 1R35A 4CAMA 5AD6A 4V3ZA 4KCHA 5ADNA 1Q2OA 2NSEA 5ADKA 3UFUA 1RS6A 1M9RA 4UGCA 4UPQA 3NLTA 3RQLA 3N2RA 4CTZA 3B3NA 5FVYA 4JSKA 4CFTB 5G6QA 5FW0A 1FOIA 5FVQA 4D34A 4CARA 4D1PA 2FBZX 3TYLA 1P6HA 3JT9A 3NLOA 2ORRA 3RQNA 3N63A 1DD7A 3N67A 1QW5A 3NLHA 4UGRA 3JT6A 8NSEA 1P6NA 5FVSA 4CUMA 4UPSA 4UH0A 1M8EA 4C3AA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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