5G6HA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 7-((3-(methylamino)methyl)phenoxy)methyl)quinolin-2-amine
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
EKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 123
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g6hA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g6hA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g6hA03
1M8EA 3NNYA 3NQSA 4CX2A 1QW6A 3UFTA 4D2ZA 1NSIA 3JWZA 3NLVA 4KCSA 1M8HA 4CTPA 5ADFA 3NM0A 4UH3A 4CTUA 1DMJA 4UGJA 1ZZTA 3NLOA 4D39A 5G6IA 2ORRA 4D38A 3E7SB 4JSFA 4D1PA 4UH4A 3UFSA 4D3TA 5G6MA 1ZZSA 4CFTA 3N67A 4UGIA 4UPMA 2AN2A 1RS9A 4UGNA 3NW2A 4UGAA 4KCRA 5G6FA 4UPRA 4D3IA 1P6HA 3RQNA 3SVQA 5G6CA 5AD9A 1DM7A 3E7IA 1D1YA 1DD7A 2NOSA 3N61A 4UH2A 5G6LA 3UFPA 5AD8A 4D3NA 1FOPA 2ORTA 3E65A 4UGHA 4UH6A 3E7MA 3EAIA 4CX5A 4D3OA 1NOCA 1LZZA 5G6OA 1JWJA 4D36A 1VAFA 1FOJA 5AGKA 1K2TA 3E6NA 4LUWA 3UFQA 4V3WA 4UCHA 2BHJA 2ORPA 4UQRA 5ADKA 4UGVA 1RS7A 1M00A 2G6IA 4KCQA 2FC1A 4KCLA 1ZZRA 3DWJA 5G6JA 4CWWA 5FVQA 3JX1A 3N6DA 3RQJA 4JSEA 4KCNA 4KCPA 3EBDA 2G6NA 5G6EA 1MMVA 5FVRA 4LUXA 3B3OA 3JWVA 4D3JA 3N5TA 3JWUA 3NLNA 4CARA 2ORQA 1R35A 5AD7A 1QW5A 3B3NA 4K5EA 1M9RA 3N65A 2NSEA 4D32A 4UPNA 5ADIA 5AD4A 4D3VA 4UPPA 4UQSA 5G6NA 3JT8A 3E67A 1DF1A 4CTWA 1D1WA 5ADAA 2FLQA 4UGSA 1M9QA 1MMWA 1D0OA 3PNHA 4CAMA 1FOIA 4NOSA 4D37A 5ADLA 4KCOA 4CAOA 5G6AA 3NNZA 4CUMA 1FOLA 3NLPA 3JX4A 5FVZA 3JT5A 3N66A 4CWXA 4CFTB 5ADGA 4UGGA 1VAGA 3N64A 3NLFA 4CU0A 3NODA 4V3VA 1I83A 4UH0A 4V3XA 1M8IA 4CANA 3N5RA 1LZXA 3NLQA 8NSEA 3Q99A 3N6EA 3N5VA 3NLYA 4JSJA 4CU1A 4UPSA 4UG9A 5ADEA 1OM4A 5AGNA 4IMXA 5ADDA 4K5IA 1ZVLA 4CX3A 4JSIA 5G6DA 1DWXA 4IMWA 4KCIA 4UGPA 4KCJA 4JSKA 4D3BA 3N6FA 4UH9A 5FVOA 4D7IA 3JT4A 3JX0A 3NLJA 3JT9A 4D1NA 1P6NA 4UHAA 3EJ8A 3E6LA 4UG5A 4CTYA 3NLZA 5G0NA 5G6BA 4UGEA 4K5GA 4V3UA 4D35A 3B3PA 4UGRA 5AGPA 2HX3A 3N6AA 3N62A 3UFUA 5AD6A 3JWSA 3NLRA 4K5JA 3RQKA 5NSEA 3JTAA 3RQPA 3N5QA 3NLDA 5FVYA 4D3AA 2AMOA 2NSIA 3NOSA 3JX5A 1ZZQA 1DM8A 2FC2A 1P6IA 3JX3A 4V3YA 1P6JA 3RQMA 4CVGA 4D3UA 3NLMA 3N63A 3UFOA 1ED6A 4UPQA 3NLIA 2NODA 3JT3A 3N5SA 3HSNA 3NLTA 1D1XA 2AN0A 4CTZA 3E68A 5AGMA 1M9JA 3N5XA 1DWVA 4JSMA 5ADCA 1QOMA 4UGYA 5G69A 4CWVA 1K2UA 4IMSA 3TYNA 2G6LA 4UGMA 5G68A 4UH7A 3N2RA 4CTXA 3NLUA 4EUXA 4UH1A 2HX4A 1MJTA 3PNEA 2ORSA 5G65A 3TYMA 9NSEA 2G6HA 4CAPA 5FVTA 3UFVA 6NSEA 4D30A 4D7HA 4UGWA 5FVSA 4CU1B 1P6KA 4C3AA 1ZZUA 4UGZA 3N69A 1P6LA 3NLWA 4NSEA 5FJ2A 3NLHA 5G6QA 3E6OA 4CWZA 3N6GA 4CX6A 3N6CA 3N5WA 4D31A 5G6GA 4CX1A 4K5DA 3DQRA 5AD5A 5G0OA 4UGDA 4FVZA 1M7VA 1QWCA 3N5ZA 5G67A 4UG6A 5FVWA 4C39A 4UGLA 3N60A 3JWYA 2FBZX 4UGTA 4D3MA 4K5KA 4V3ZA 4D1OA 4JSGA 1ZVIA 4FVWA 1DWWA 2G6JA 4D34A 4LWAA 3EAHA 3E7TA 1D1VA 4CTTA 1RS8A 4CX4A 3JWXA 1N2NA 1RS6A 1ED4A 4JS9A 3N5YA 4UGFA 1D0CA 1OM5A 4UGOA 4UGCA 3N6BA 5G66A 2G6MA 5G6HA 1DMKA 3Q9AA 4IMUA 1P6MA 4CX7A 4UGXA 3E7GA 3NSEA 5AGOA 3N5PA 3N68A 4UPTA 1NODA 3E7SA 1Q2OA 4FVYA 3NLGA 2HX2A 4K5FA 4KCKA 5ADNA 3JX2A 3PNFA 4IMTA 5FJ3A 3JT6A 3NLKA 3JWWA 5FW0A 5AGLA 5G6PA 2G6OA 3UFWA 3EBFA 1M9MA 4FVXA 4UPOA 3JX6A 3HSOA 3SVPA 3JWTA 4CDTA 4FW0A 4CULA 3DQSA 4D2YA 3NLEA 4CTVA 1NSEA 4CUNA 5FVUA 5FVPA 1DMIA 1K2RA 3RQOA 5ADJA 1FOOA 4D33A 4UGQA 4LWBA 1ED5A 4JSLA 4UGKA 4D7JA 4UGUA 1K2SA 5ADMA 4CTQA 4D3KA 4JSHA 4UG7A 1M9KA 3DQTA 3TYLA 5ADBA 4CAQA 3E6TA 4UG8A 3RQLA 1NOSA 4D7OA 1QW4A 3FC5A 4CX0A 4K5HA 4KCHA 4UH8A 7NSEA 5G0PA 3HSPA 1M9TA 3PNGA 3TYOA 3NLXA 4UGBA 2G6KA 5FVXA 4GQEA 4KCMA 1M8DA 2OROA 2Y37A 1JWKA 5G6KA 3UFRA 3JT7A 1DM6A 3B3MA 4CWYA 4UH5A 5FVVA 4CTRA 1M7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1M8EA 3NNYA 3NQSA 4CX2A 1QW6A 3UFTA 4D2ZA 1NSIA 3JWZA 3NLVA 4KCSA 1M8HA 4CTPA 5ADFA 3NM0A 4UH3A 4CTUA 1DMJA 4UGJA 1ZZTA 3NLOA 4D39A 5G6IA 2ORRA 4D38A 3E7SB 4JSFA 4D1PA 4UH4A 3UFSA 4D3TA 5G6MA 1ZZSA 4CFTA 3N67A 4UGIA 4UPMA 2AN2A 1RS9A 4UGNA 3NW2A 4UGAA 4KCRA 5G6FA 4UPRA 4D3IA 1P6HA 3RQNA 3SVQA 5G6CA 5AD9A 1DM7A 3E7IA 1D1YA 1DD7A 2NOSA 3N61A 4UH2A 5G6LA 3UFPA 5AD8A 4D3NA 1FOPA 2ORTA 3E65A 4UGHA 4UH6A 3E7MA 3EAIA 4CX5A 4D3OA 1NOCA 1LZZA 5G6OA 1JWJA 4D36A 1VAFA 1FOJA 5AGKA 1K2TA 3E6NA 4LUWA 3UFQA 4V3WA 4UCHA 2BHJA 2ORPA 4UQRA 5ADKA 4UGVA 1RS7A 1M00A 2G6IA 4KCQA 2FC1A 4KCLA 1ZZRA 3DWJA 5G6JA 4CWWA 5FVQA 3JX1A 3N6DA 3RQJA 4JSEA 4KCNA 4KCPA 3EBDA 2G6NA 5G6EA 1MMVA 5FVRA 4LUXA 3B3OA 3JWVA 4D3JA 3N5TA 3JWUA 3NLNA 4CARA 2ORQA 1R35A 5AD7A 1QW5A 3B3NA 4K5EA 1M9RA 3N65A 2NSEA 4D32A 4UPNA 5ADIA 5AD4A 4D3VA 4UPPA 4UQSA 5G6NA 3JT8A 3E67A 1DF1A 4CTWA 1D1WA 5ADAA 2FLQA 4UGSA 1M9QA 1MMWA 1D0OA 3PNHA 4CAMA 1FOIA 4NOSA 4D37A 5ADLA 4KCOA 4CAOA 5G6AA 3NNZA 4CUMA 1FOLA 3NLPA 3JX4A 5FVZA 3JT5A 3N66A 4CWXA 4CFTB 5ADGA 4UGGA 1VAGA 3N64A 3NLFA 4CU0A 3NODA 4V3VA 1I83A 4UH0A 4V3XA 1M8IA 4CANA 3N5RA 1LZXA 3NLQA 8NSEA 3Q99A 3N6EA 3N5VA 3NLYA 4JSJA 4CU1A 4UPSA 4UG9A 5ADEA 1OM4A 5AGNA 4IMXA 5ADDA 4K5IA 1ZVLA 4CX3A 4JSIA 5G6DA 1DWXA 4IMWA 4KCIA 4UGPA 4KCJA 4JSKA 4D3BA 3N6FA 4UH9A 5FVOA 4D7IA 3JT4A 3JX0A 3NLJA 3JT9A 4D1NA 1P6NA 4UHAA 3EJ8A 3E6LA 4UG5A 4CTYA 3NLZA 5G0NA 5G6BA 4UGEA 4K5GA 4V3UA 4D35A 3B3PA 4UGRA 5AGPA 2HX3A 3N6AA 3N62A 3UFUA 5AD6A 3JWSA 3NLRA 4K5JA 3RQKA 5NSEA 3JTAA 3RQPA 3N5QA 3NLDA 5FVYA 4D3AA 2AMOA 2NSIA 3NOSA 3JX5A 1ZZQA 1DM8A 2FC2A 1P6IA 3JX3A 4V3YA 1P6JA 3RQMA 4CVGA 4D3UA 3NLMA 3N63A 3UFOA 1ED6A 4UPQA 3NLIA 2NODA 3JT3A 3N5SA 3HSNA 3NLTA 1D1XA 2AN0A 4CTZA 3E68A 5AGMA 1M9JA 3N5XA 1DWVA 4JSMA 5ADCA 1QOMA 4UGYA 5G69A 4CWVA 1K2UA 4IMSA 3TYNA 2G6LA 4UGMA 5G68A 4UH7A 3N2RA 4CTXA 3NLUA 4EUXA 4UH1A 2HX4A 1MJTA 3PNEA 2ORSA 5G65A 3TYMA 9NSEA 2G6HA 4CAPA 5FVTA 3UFVA 6NSEA 4D30A 4D7HA 4UGWA 5FVSA 4CU1B 1P6KA 4C3AA 1ZZUA 4UGZA 3N69A 1P6LA 3NLWA 4NSEA 5FJ2A 3NLHA 5G6QA 3E6OA 4CWZA 3N6GA 4CX6A 3N6CA 3N5WA 4D31A 5G6GA 4CX1A 4K5DA 3DQRA 5AD5A 5G0OA 4UGDA 4FVZA 1M7VA 1QWCA 3N5ZA 5G67A 4UG6A 5FVWA 4C39A 4UGLA 3N60A 3JWYA 2FBZX 4UGTA 4D3MA 4K5KA 4V3ZA 4D1OA 4JSGA 1ZVIA 4FVWA 1DWWA 2G6JA 4D34A 4LWAA 3EAHA 3E7TA 1D1VA 4CTTA 1RS8A 4CX4A 3JWXA 1N2NA 1RS6A 1ED4A 4JS9A 3N5YA 4UGFA 1D0CA 1OM5A 4UGOA 4UGCA 3N6BA 5G66A 2G6MA 5G6HA 1DMKA 3Q9AA 4IMUA 1P6MA 4CX7A 4UGXA 3E7GA 3NSEA 5AGOA 3N5PA 3N68A 4UPTA 1NODA 3E7SA 1Q2OA 4FVYA 3NLGA 2HX2A 4K5FA 4KCKA 5ADNA 3JX2A 3PNFA 4IMTA 5FJ3A 3JT6A 3NLKA 3JWWA 5FW0A 5AGLA 5G6PA 2G6OA 3UFWA 3EBFA 1M9MA 4FVXA 4UPOA 3JX6A 3HSOA 3SVPA 3JWTA 4CDTA 4FW0A 4CULA 3DQSA 4D2YA 3NLEA 4CTVA 1NSEA 4CUNA 5FVUA 5FVPA 1DMIA 1K2RA 3RQOA 5ADJA 1FOOA 4D33A 4UGQA 4LWBA 1ED5A 4JSLA 4UGKA 4D7JA 4UGUA 1K2SA 5ADMA 4CTQA 4D3KA 4JSHA 4UG7A 1M9KA 3DQTA 3TYLA 5ADBA 4CAQA 3E6TA 4UG8A 3RQLA 1NOSA 4D7OA 1QW4A 3FC5A 4CX0A 4K5HA 4KCHA 4UH8A 7NSEA 5G0PA 3HSPA 1M9TA 3PNGA 3TYOA 3NLXA 4UGBA 2G6KA 5FVXA 4GQEA 4KCMA 1M8DA 2OROA 2Y37A 1JWKA 5G6KA 3UFRA 3JT7A 1DM6A 3B3MA 4CWYA 4UH5A 5FVVA 4CTRA 1M7ZA
chains in the Genus database with same CATH topology
1M8EA 3NNYA 3NQSA 4CX2A 1QW6A 3UFTA 4D2ZA 1NSIA 3JWZA 3NLVA 4KCSA 1M8HA 4CTPA 5ADFA 3NM0A 4UH3A 4CTUA 1DMJA 4UGJA 1ZZTA 3NLOA 4D39A 5G6IA 2ORRA 4D38A 3E7SB 4JSFA 4D1PA 4UH4A 3UFSA 4D3TA 5G6MA 1ZZSA 4CFTA 3N67A 4UGIA 4UPMA 2AN2A 1RS9A 4UGNA 3NW2A 4UGAA 4KCRA 5G6FA 4UPRA 4D3IA 1P6HA 3RQNA 3SVQA 5G6CA 5AD9A 1DM7A 3E7IA 1D1YA 1DD7A 2NOSA 3N61A 4UH2A 5G6LA 3UFPA 5AD8A 4D3NA 1FOPA 2ORTA 3E65A 4UGHA 4UH6A 3E7MA 3EAIA 4CX5A 4D3OA 1NOCA 1LZZA 5G6OA 1JWJA 4D36A 1VAFA 1FOJA 5AGKA 1K2TA 3E6NA 4LUWA 3UFQA 4V3WA 4UCHA 2BHJA 2ORPA 4UQRA 5ADKA 4UGVA 1RS7A 1M00A 2G6IA 4KCQA 2FC1A 4KCLA 1ZZRA 3DWJA 5G6JA 4CWWA 5FVQA 3JX1A 3N6DA 3RQJA 4JSEA 4KCNA 4KCPA 3EBDA 2G6NA 5G6EA 1MMVA 5FVRA 4LUXA 3B3OA 3JWVA 4D3JA 3N5TA 3JWUA 3NLNA 4CARA 2ORQA 1R35A 5AD7A 1QW5A 3B3NA 4K5EA 1M9RA 3N65A 2NSEA 4D32A 4UPNA 5ADIA 5AD4A 4D3VA 4UPPA 4UQSA 5G6NA 3JT8A 3E67A 1DF1A 4CTWA 1D1WA 5ADAA 2FLQA 4UGSA 1M9QA 1MMWA 1D0OA 3PNHA 4CAMA 1FOIA 4NOSA 4D37A 5ADLA 4KCOA 4CAOA 5G6AA 3NNZA 4CUMA 1FOLA 3NLPA 3JX4A 5FVZA 3JT5A 3N66A 4CWXA 4CFTB 5ADGA 4UGGA 1VAGA 3N64A 3NLFA 4CU0A 3NODA 4V3VA 1I83A 4UH0A 4V3XA 1M8IA 4CANA 3N5RA 1LZXA 3NLQA 8NSEA 3Q99A 3N6EA 3N5VA 3NLYA 4JSJA 4CU1A 4UPSA 4UG9A 5ADEA 1OM4A 5AGNA 4IMXA 5ADDA 4K5IA 1ZVLA 4CX3A 4JSIA 5G6DA 1DWXA 4IMWA 4KCIA 4UGPA 4KCJA 4JSKA 4D3BA 3N6FA 4UH9A 5FVOA 4D7IA 3JT4A 3JX0A 3NLJA 3JT9A 4D1NA 1P6NA 4UHAA 3EJ8A 3E6LA 4UG5A 4CTYA 3NLZA 5G0NA 5G6BA 4UGEA 4K5GA 4V3UA 4D35A 3B3PA 4UGRA 5AGPA 2HX3A 3N6AA 3N62A 3UFUA 5AD6A 3JWSA 3NLRA 4K5JA 3RQKA 5NSEA 3JTAA 3RQPA 3N5QA 3NLDA 5FVYA 4D3AA 2AMOA 2NSIA 3NOSA 3JX5A 1ZZQA 1DM8A 2FC2A 1P6IA 3JX3A 4V3YA 1P6JA 3RQMA 4CVGA 4D3UA 3NLMA 3N63A 3UFOA 1ED6A 4UPQA 3NLIA 2NODA 3JT3A 3N5SA 3HSNA 3NLTA 1D1XA 2AN0A 4CTZA 3E68A 5AGMA 1M9JA 3N5XA 1DWVA 4JSMA 5ADCA 1QOMA 4UGYA 5G69A 4CWVA 1K2UA 4IMSA 3TYNA 2G6LA 4UGMA 5G68A 4UH7A 3N2RA 4CTXA 3NLUA 4EUXA 4UH1A 2HX4A 1MJTA 3PNEA 2ORSA 5G65A 3TYMA 9NSEA 2G6HA 4CAPA 5FVTA 3UFVA 6NSEA 4D30A 4D7HA 4UGWA 5FVSA 4CU1B 1P6KA 4C3AA 1ZZUA 4UGZA 3N69A 1P6LA 3NLWA 4NSEA 5FJ2A 3NLHA 5G6QA 3E6OA 4CWZA 3N6GA 4CX6A 3N6CA 3N5WA 4D31A 5G6GA 4CX1A 4K5DA 3DQRA 5AD5A 5G0OA 4UGDA 4FVZA 1M7VA 1QWCA 3N5ZA 5G67A 4UG6A 5FVWA 4C39A 4UGLA 3N60A 3JWYA 2FBZX 4UGTA 4D3MA 4K5KA 4V3ZA 4D1OA 4JSGA 1ZVIA 4FVWA 1DWWA 2G6JA 4D34A 4LWAA 3EAHA 3E7TA 1D1VA 4CTTA 1RS8A 4CX4A 3JWXA 1N2NA 1RS6A 1ED4A 4JS9A 3N5YA 4UGFA 1D0CA 1OM5A 4UGOA 4UGCA 3N6BA 5G66A 2G6MA 5G6HA 1DMKA 3Q9AA 4IMUA 1P6MA 4CX7A 4UGXA 3E7GA 3NSEA 5AGOA 3N5PA 3N68A 4UPTA 1NODA 3E7SA 1Q2OA 4FVYA 3NLGA 2HX2A 4K5FA 4KCKA 5ADNA 3JX2A 3PNFA 4IMTA 5FJ3A 3JT6A 3NLKA 3JWWA 5FW0A 5AGLA 5G6PA 2G6OA 3UFWA 3EBFA 1M9MA 4FVXA 4UPOA 3JX6A 3HSOA 3SVPA 3JWTA 4CDTA 4FW0A 4CULA 3DQSA 4D2YA 3NLEA 4CTVA 1NSEA 4CUNA 5FVUA 5FVPA 1DMIA 1K2RA 3RQOA 5ADJA 1FOOA 4D33A 4UGQA 4LWBA 1ED5A 4JSLA 4UGKA 4D7JA 4UGUA 1K2SA 5ADMA 4CTQA 4D3KA 4JSHA 4UG7A 1M9KA 3DQTA 3TYLA 5ADBA 4CAQA 3E6TA 4UG8A 3RQLA 1NOSA 4D7OA 1QW4A 3FC5A 4CX0A 4K5HA 4KCHA 4UH8A 7NSEA 5G0PA 3HSPA 1M9TA 3PNGA 3TYOA 3NLXA 4UGBA 2G6KA 5FVXA 4GQEA 4KCMA 1M8DA 2OROA 2Y37A 1JWKA 5G6KA 3UFRA 3JT7A 1DM6A 3B3MA 4CWYA 4UH5A 5FVVA 4CTRA 1M7ZA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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