5G6LA

Structure of bacillus subtilis nitric oxide synthase in complex with 7-((4-chloro-3-((methylamino)methyl)phenoxy)methyl) quinolin-2-amine
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EEKEILWNEAKAFIAACYQELGKAAEVKDRLADIKSEIDLTGSYVHTKEELEHGAKMAWRNSNRCIGRLFWNSLNVIDRRDVRTKEEVRDALFHHIETATNNGKIRPTITIFPPEEKGEKQVEIWNHQLIRYAGYESDGERIGDPASCSLTAACEELGWRGERTDFDLLPLIFRMKGDEQPVWYELPRSLVIEVPITHPDIEAFSDLELKWYGVPIISDMKLEVGGIHYNAAPFNGWYMGTEIGARNLADEKRYDKLKKVASVIGIAADYNTDLWKDQALVELNKAVLHSYKKQGVSIVDHHTAASQFKRFEEQAEEAGRKLTGDWTWLIPPISPAATHIFHRSYDNSIVKPNYFYQDKPYE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Targeting Bacterial Nitric Oxide Synthase with Aminoquinoline-Based Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NITRIC OXIDE SYNTHASE OXYGENASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 120
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.14.14.47: Nitric-oxide synthase (flavodoxin).
pdb deposition date 2016-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02898 NO_synthase Nitric oxide synthase, oxygenase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.90.340.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 1 5g6lA01
3.90.440.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Nitric Oxide Synthase;Heme Domain; Chain A, domain 2 Nitric Oxide Synthase;Heme Domain;Chain A domain 2 5g6lA02
3.90.1230.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Bovine Endothelial Nitric Oxide Synthase Heme Domain; Chain: A,domain 3 Nitric Oxide Synthase; Chain A, domain 3 5g6lA03
3EBFA 3FC5A 2G6JA 5G6KA 4V3XA 4CX1A 3RQLA 4GQEA 4JSIA 4CWVA 1VAFA 5AD6A 2FC2A 4UPPA 2FLQA 3NLIA 5G6CA 4D3JA 4UGMA 4UPMA 4KCIA 1ZVIA 4UPSA 4CUMA 4JSEA 3HSPA 4UGAA 5G67A 3UFWA 5G69A 2ORSA 4UGYA 1D0OA 1FOLA 1DM6A 4V3WA 5G6IA 5ADCA 5AGKA 5G6GA 4UGGA 1QW6A 3N5YA 3NLDA 4D36A 1ZZUA 4IMTA 2NSEA 3JWZA 3NM0A 3N6GA 5G68A 4JSLA 4CX7A 1DWXA 2G6NA 3N64A 1ZVLA 4C3AA 1ED5A 3N60A 4UQSA 8NSEA 3NODA 4CX5A 1ZZQA 3B3OA 3N63A 5AGNA 1QWCA 4D3TA 3JX4A 1M9QA 2AN2A 4CAMA 1M7VA 3E6OA 3JT5A 4JSJA 1P6HA 3JX3A 4D38A 3UFOA 4NOSA 4FW0A 3E65A 4UGJA 4K5DA 5FVSA 3E68A 1DD7A 5FVTA 5G6DA 3NLKA 1LZXA 2AMOA 3N5PA 1LZZA 3N6CA 4UPTA 4CTZA 3N6DA 4UH1A 5ADJA 4V3UA 3UFTA 1M8DA 4CARA 1M9RA 1M8HA 4FVYA 4CVGA 2G6LA 5ADEA 3EAIA 5G66A 3TYLA 3E7SA 3UFUA 4K5IA 3N5XA 4D7HA 4KCLA 4CTYA 4UG7A 4CU0A 1QW5A 1D0CA 3UFPA 1DWVA 3N69A 2ORTA 4UCHA 3DWJA 3Q99A 1R35A 4CTPA 5G6AA 4UGTA 1D1YA 4UGWA 5AD5A 5ADNA 4KCKA 3NLTA 4CU1A 4CTWA 3NLEA 3E7GA 5AD8A 4V3YA 4FVWA 2Y37A 4JSKA 3N5SA 4D39A 4UH0A 4UGEA 4D34A 4K5KA 4CTQA 7NSEA 3N61A 3NLVA 4IMWA 5AGLA 4UGDA 3NLRA 1M8EA 1ED6A 2NODA 1VAGA 3PNGA 3N5WA 5G6LA 4IMSA 3NLUA 4UGBA 3N6AA 3JT8A 3JX6A 2FC1A 3B3PA 1DMIA 5FVVA 5ADMA 3E7TA 3JWVA 2BHJA 3JT9A 1P6NA 1P6KA 1NSEA 4IMXA 5AD9A 5ADBA 3JT7A 5G0OA 3NLNA 2G6MA 2G6HA 4KCNA 1OM5A 1M9JA 2OROA 5FJ3A 6NSEA 4D7OA 4CWYA 1M8IA 1RS8A 3B3MA 3N62A 3NLYA 3B3NA 3JX1A 1DWWA 3RQNA 4CULA 3SVPA 2ORPA 4UGOA 4UGXA 4K5FA 4UGCA 3JX0A 3NLMA 3NLHA 4EUXA 3NQSA 5NSEA 5ADLA 4KCQA 1K2RA 1N2NA 3NLFA 4UPOA 4UGZA 3NOSA 1DMKA 1D1WA 4UGRA 3E7IA 4KCPA 4UGQA 4IMUA 3NNYA 5AGOA 4UG6A 2NSIA 3N66A 5FVOA 5AGMA 3E7MA 4KCMA 5AD4A 4UGKA 5FVWA 4FVXA 1D1XA 3N6BA 4CAPA 1NOSA 2FBZX 4D30A 1D1VA 5G6HA 4KCSA 9NSEA 4LUXA 3JWTA 1K2TA 3N5RA 4D7JA 3JT3A 4CX2A 3PNFA 3RQMA 4D1PA 4V3ZA 1DM8A 4UPQA 5G6JA 5ADDA 4UGSA 4CANA 1QW4A 5FVPA 3E6LA 4UG8A 5G6OA 3N5QA 4CX3A 1NSIA 4C39A 4D3UA 4V3VA 4JSFA 1ED4A 5AD7A 1RS7A 4CTVA 4KCRA 4UH4A 3NLZA 5FVQA 3JWWA 4FVZA 4UH6A 2HX3A 1FOIA 3N5ZA 3NLOA 1FOJA 5FVRA 3N2RA 3DQTA 4UQRA 3EAHA 4KCHA 3NLGA 4UGPA 4UGVA 4D3OA 4D32A 3JWSA 3RQPA 5FVUA 1M9MA 4LWAA 4UGNA 3UFSA 4JSMA 5G0PA 3NLJA 1DF1A 1K2UA 5AGPA 3NSEA 4JSHA 5FJ2A 3TYOA 1ZZSA 2G6IA 3N6FA 4NSEA 4CTUA 3E6TA 1DMJA 5FVYA 4CUNA 4D33A 1FOPA 4CFTA 3NLXA 4LWBA 4K5EA 1NODA 1M9KA 2AN0A 5FW0A 4UHAA 3NLQA 1I83A 4D3KA 3E7SB 1MJTA 3RQOA 4D37A 4D7IA 1RS9A 1RS6A 5G65A 4D2ZA 4K5JA 1NOCA 3E67A 4UG9A 2HX4A 5ADAA 4CWZA 4UH2A 4CX4A 5G6BA 3JT4A 3PNHA 3TYNA 3NLPA 4D1NA 5G6NA 1M7ZA 3DQSA 4CAOA 3TYMA 5G6FA 4CU1B 4D3AA 4UH7A 4UPNA 1ZZRA 5ADKA 4CWWA 4UH9A 3UFVA 3JX2A 3N68A 4D3MA 4CDTA 4D31A 3N5VA 2G6OA 4CWXA 3N65A 4D3NA 4LUWA 3NLWA 1QOMA 4UPRA 1JWKA 3UFRA 3JWYA 5FVZA 3HSNA 4CTRA 3JT6A 5ADFA 3HSOA 1P6MA 1DM7A 3NW2A 3DQRA 4K5HA 1JWJA 4UH5A 2HX2A 4D2YA 5G6PA 4UGUA 3JWXA 4CX6A 2ORQA 5G6QA 4UGLA 1K2SA 3JX5A 1Q2OA 4KCOA 4CFTB 1OM4A 3UFQA 1P6LA 3EJ8A 4JS9A 4D35A 4CTTA 1MMVA 3SVQA 3E6NA 4UGIA 4UG5A 1P6JA 4D3IA 4UH3A 5G6EA 1FOOA 4D3VA 2G6KA 3Q9AA 2ORRA 5G6MA 3RQJA 4CTXA 3N5TA 3NNZA 3N6EA 5ADGA 4JSGA 4UH8A 3EBDA 3N67A 4D1OA 4D3BA 4CX0A 4CAQA 3JWUA 5ADIA 1P6IA 1ZZTA 4UGHA 4K5GA 1MMWA 1M9TA 3JTAA 2NOSA 1M00A 4KCJA 3RQKA 4UGFA 5G0NA 3PNEA 5FVXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EBFA 3FC5A 2G6JA 5G6KA 4V3XA 4CX1A 3RQLA 4GQEA 4JSIA 4CWVA 1VAFA 5AD6A 2FC2A 4UPPA 2FLQA 3NLIA 5G6CA 4D3JA 4UGMA 4UPMA 4KCIA 1ZVIA 4UPSA 4CUMA 4JSEA 3HSPA 4UGAA 5G67A 3UFWA 5G69A 2ORSA 4UGYA 1D0OA 1FOLA 1DM6A 4V3WA 5G6IA 5ADCA 5AGKA 5G6GA 4UGGA 1QW6A 3N5YA 3NLDA 4D36A 1ZZUA 4IMTA 2NSEA 3JWZA 3NM0A 3N6GA 5G68A 4JSLA 4CX7A 1DWXA 2G6NA 3N64A 1ZVLA 4C3AA 1ED5A 3N60A 4UQSA 8NSEA 3NODA 4CX5A 1ZZQA 3B3OA 3N63A 5AGNA 1QWCA 4D3TA 3JX4A 1M9QA 2AN2A 4CAMA 1M7VA 3E6OA 3JT5A 4JSJA 1P6HA 3JX3A 4D38A 3UFOA 4NOSA 4FW0A 3E65A 4UGJA 4K5DA 5FVSA 3E68A 1DD7A 5FVTA 5G6DA 3NLKA 1LZXA 2AMOA 3N5PA 1LZZA 3N6CA 4UPTA 4CTZA 3N6DA 4UH1A 5ADJA 4V3UA 3UFTA 1M8DA 4CARA 1M9RA 1M8HA 4FVYA 4CVGA 2G6LA 5ADEA 3EAIA 5G66A 3TYLA 3E7SA 3UFUA 4K5IA 3N5XA 4D7HA 4KCLA 4CTYA 4UG7A 4CU0A 1QW5A 1D0CA 3UFPA 1DWVA 3N69A 2ORTA 4UCHA 3DWJA 3Q99A 1R35A 4CTPA 5G6AA 4UGTA 1D1YA 4UGWA 5AD5A 5ADNA 4KCKA 3NLTA 4CU1A 4CTWA 3NLEA 3E7GA 5AD8A 4V3YA 4FVWA 2Y37A 4JSKA 3N5SA 4D39A 4UH0A 4UGEA 4D34A 4K5KA 4CTQA 7NSEA 3N61A 3NLVA 4IMWA 5AGLA 4UGDA 3NLRA 1M8EA 1ED6A 2NODA 1VAGA 3PNGA 3N5WA 5G6LA 4IMSA 3NLUA 4UGBA 3N6AA 3JT8A 3JX6A 2FC1A 3B3PA 1DMIA 5FVVA 5ADMA 3E7TA 3JWVA 2BHJA 3JT9A 1P6NA 1P6KA 1NSEA 4IMXA 5AD9A 5ADBA 3JT7A 5G0OA 3NLNA 2G6MA 2G6HA 4KCNA 1OM5A 1M9JA 2OROA 5FJ3A 6NSEA 4D7OA 4CWYA 1M8IA 1RS8A 3B3MA 3N62A 3NLYA 3B3NA 3JX1A 1DWWA 3RQNA 4CULA 3SVPA 2ORPA 4UGOA 4UGXA 4K5FA 4UGCA 3JX0A 3NLMA 3NLHA 4EUXA 3NQSA 5NSEA 5ADLA 4KCQA 1K2RA 1N2NA 3NLFA 4UPOA 4UGZA 3NOSA 1DMKA 1D1WA 4UGRA 3E7IA 4KCPA 4UGQA 4IMUA 3NNYA 5AGOA 4UG6A 2NSIA 3N66A 5FVOA 5AGMA 3E7MA 4KCMA 5AD4A 4UGKA 5FVWA 4FVXA 1D1XA 3N6BA 4CAPA 1NOSA 2FBZX 4D30A 1D1VA 5G6HA 4KCSA 9NSEA 4LUXA 3JWTA 1K2TA 3N5RA 4D7JA 3JT3A 4CX2A 3PNFA 3RQMA 4D1PA 4V3ZA 1DM8A 4UPQA 5G6JA 5ADDA 4UGSA 4CANA 1QW4A 5FVPA 3E6LA 4UG8A 5G6OA 3N5QA 4CX3A 1NSIA 4C39A 4D3UA 4V3VA 4JSFA 1ED4A 5AD7A 1RS7A 4CTVA 4KCRA 4UH4A 3NLZA 5FVQA 3JWWA 4FVZA 4UH6A 2HX3A 1FOIA 3N5ZA 3NLOA 1FOJA 5FVRA 3N2RA 3DQTA 4UQRA 3EAHA 4KCHA 3NLGA 4UGPA 4UGVA 4D3OA 4D32A 3JWSA 3RQPA 5FVUA 1M9MA 4LWAA 4UGNA 3UFSA 4JSMA 5G0PA 3NLJA 1DF1A 1K2UA 5AGPA 3NSEA 4JSHA 5FJ2A 3TYOA 1ZZSA 2G6IA 3N6FA 4NSEA 4CTUA 3E6TA 1DMJA 5FVYA 4CUNA 4D33A 1FOPA 4CFTA 3NLXA 4LWBA 4K5EA 1NODA 1M9KA 2AN0A 5FW0A 4UHAA 3NLQA 1I83A 4D3KA 3E7SB 1MJTA 3RQOA 4D37A 4D7IA 1RS9A 1RS6A 5G65A 4D2ZA 4K5JA 1NOCA 3E67A 4UG9A 2HX4A 5ADAA 4CWZA 4UH2A 4CX4A 5G6BA 3JT4A 3PNHA 3TYNA 3NLPA 4D1NA 5G6NA 1M7ZA 3DQSA 4CAOA 3TYMA 5G6FA 4CU1B 4D3AA 4UH7A 4UPNA 1ZZRA 5ADKA 4CWWA 4UH9A 3UFVA 3JX2A 3N68A 4D3MA 4CDTA 4D31A 3N5VA 2G6OA 4CWXA 3N65A 4D3NA 4LUWA 3NLWA 1QOMA 4UPRA 1JWKA 3UFRA 3JWYA 5FVZA 3HSNA 4CTRA 3JT6A 5ADFA 3HSOA 1P6MA 1DM7A 3NW2A 3DQRA 4K5HA 1JWJA 4UH5A 2HX2A 4D2YA 5G6PA 4UGUA 3JWXA 4CX6A 2ORQA 5G6QA 4UGLA 1K2SA 3JX5A 1Q2OA 4KCOA 4CFTB 1OM4A 3UFQA 1P6LA 3EJ8A 4JS9A 4D35A 4CTTA 1MMVA 3SVQA 3E6NA 4UGIA 4UG5A 1P6JA 4D3IA 4UH3A 5G6EA 1FOOA 4D3VA 2G6KA 3Q9AA 2ORRA 5G6MA 3RQJA 4CTXA 3N5TA 3NNZA 3N6EA 5ADGA 4JSGA 4UH8A 3EBDA 3N67A 4D1OA 4D3BA 4CX0A 4CAQA 3JWUA 5ADIA 1P6IA 1ZZTA 4UGHA 4K5GA 1MMWA 1M9TA 3JTAA 2NOSA 1M00A 4KCJA 3RQKA 4UGFA 5G0NA 3PNEA 5FVXA
chains in the Genus database with same CATH topology
3EBFA 3FC5A 2G6JA 5G6KA 4V3XA 4CX1A 3RQLA 4GQEA 4JSIA 4CWVA 1VAFA 5AD6A 2FC2A 4UPPA 2FLQA 3NLIA 5G6CA 4D3JA 4UGMA 4UPMA 4KCIA 1ZVIA 4UPSA 4CUMA 4JSEA 3HSPA 4UGAA 5G67A 3UFWA 5G69A 2ORSA 4UGYA 1D0OA 1FOLA 1DM6A 4V3WA 5G6IA 5ADCA 5AGKA 5G6GA 4UGGA 1QW6A 3N5YA 3NLDA 4D36A 1ZZUA 4IMTA 2NSEA 3JWZA 3NM0A 3N6GA 5G68A 4JSLA 4CX7A 1DWXA 2G6NA 3N64A 1ZVLA 4C3AA 1ED5A 3N60A 4UQSA 8NSEA 3NODA 4CX5A 1ZZQA 3B3OA 3N63A 5AGNA 1QWCA 4D3TA 3JX4A 1M9QA 2AN2A 4CAMA 1M7VA 3E6OA 3JT5A 4JSJA 1P6HA 3JX3A 4D38A 3UFOA 4NOSA 4FW0A 3E65A 4UGJA 4K5DA 5FVSA 3E68A 1DD7A 5FVTA 5G6DA 3NLKA 1LZXA 2AMOA 3N5PA 1LZZA 3N6CA 4UPTA 4CTZA 3N6DA 4UH1A 5ADJA 4V3UA 3UFTA 1M8DA 4CARA 1M9RA 1M8HA 4FVYA 4CVGA 2G6LA 5ADEA 3EAIA 5G66A 3TYLA 3E7SA 3UFUA 4K5IA 3N5XA 4D7HA 4KCLA 4CTYA 4UG7A 4CU0A 1QW5A 1D0CA 3UFPA 1DWVA 3N69A 2ORTA 4UCHA 3DWJA 3Q99A 1R35A 4CTPA 5G6AA 4UGTA 1D1YA 4UGWA 5AD5A 5ADNA 4KCKA 3NLTA 4CU1A 4CTWA 3NLEA 3E7GA 5AD8A 4V3YA 4FVWA 2Y37A 4JSKA 3N5SA 4D39A 4UH0A 4UGEA 4D34A 4K5KA 4CTQA 7NSEA 3N61A 3NLVA 4IMWA 5AGLA 4UGDA 3NLRA 1M8EA 1ED6A 2NODA 1VAGA 3PNGA 3N5WA 5G6LA 4IMSA 3NLUA 4UGBA 3N6AA 3JT8A 3JX6A 2FC1A 3B3PA 1DMIA 5FVVA 5ADMA 3E7TA 3JWVA 2BHJA 3JT9A 1P6NA 1P6KA 1NSEA 4IMXA 5AD9A 5ADBA 3JT7A 5G0OA 3NLNA 2G6MA 2G6HA 4KCNA 1OM5A 1M9JA 2OROA 5FJ3A 6NSEA 4D7OA 4CWYA 1M8IA 1RS8A 3B3MA 3N62A 3NLYA 3B3NA 3JX1A 1DWWA 3RQNA 4CULA 3SVPA 2ORPA 4UGOA 4UGXA 4K5FA 4UGCA 3JX0A 3NLMA 3NLHA 4EUXA 3NQSA 5NSEA 5ADLA 4KCQA 1K2RA 1N2NA 3NLFA 4UPOA 4UGZA 3NOSA 1DMKA 1D1WA 4UGRA 3E7IA 4KCPA 4UGQA 4IMUA 3NNYA 5AGOA 4UG6A 2NSIA 3N66A 5FVOA 5AGMA 3E7MA 4KCMA 5AD4A 4UGKA 5FVWA 4FVXA 1D1XA 3N6BA 4CAPA 1NOSA 2FBZX 4D30A 1D1VA 5G6HA 4KCSA 9NSEA 4LUXA 3JWTA 1K2TA 3N5RA 4D7JA 3JT3A 4CX2A 3PNFA 3RQMA 4D1PA 4V3ZA 1DM8A 4UPQA 5G6JA 5ADDA 4UGSA 4CANA 1QW4A 5FVPA 3E6LA 4UG8A 5G6OA 3N5QA 4CX3A 1NSIA 4C39A 4D3UA 4V3VA 4JSFA 1ED4A 5AD7A 1RS7A 4CTVA 4KCRA 4UH4A 3NLZA 5FVQA 3JWWA 4FVZA 4UH6A 2HX3A 1FOIA 3N5ZA 3NLOA 1FOJA 5FVRA 3N2RA 3DQTA 4UQRA 3EAHA 4KCHA 3NLGA 4UGPA 4UGVA 4D3OA 4D32A 3JWSA 3RQPA 5FVUA 1M9MA 4LWAA 4UGNA 3UFSA 4JSMA 5G0PA 3NLJA 1DF1A 1K2UA 5AGPA 3NSEA 4JSHA 5FJ2A 3TYOA 1ZZSA 2G6IA 3N6FA 4NSEA 4CTUA 3E6TA 1DMJA 5FVYA 4CUNA 4D33A 1FOPA 4CFTA 3NLXA 4LWBA 4K5EA 1NODA 1M9KA 2AN0A 5FW0A 4UHAA 3NLQA 1I83A 4D3KA 3E7SB 1MJTA 3RQOA 4D37A 4D7IA 1RS9A 1RS6A 5G65A 4D2ZA 4K5JA 1NOCA 3E67A 4UG9A 2HX4A 5ADAA 4CWZA 4UH2A 4CX4A 5G6BA 3JT4A 3PNHA 3TYNA 3NLPA 4D1NA 5G6NA 1M7ZA 3DQSA 4CAOA 3TYMA 5G6FA 4CU1B 4D3AA 4UH7A 4UPNA 1ZZRA 5ADKA 4CWWA 4UH9A 3UFVA 3JX2A 3N68A 4D3MA 4CDTA 4D31A 3N5VA 2G6OA 4CWXA 3N65A 4D3NA 4LUWA 3NLWA 1QOMA 4UPRA 1JWKA 3UFRA 3JWYA 5FVZA 3HSNA 4CTRA 3JT6A 5ADFA 3HSOA 1P6MA 1DM7A 3NW2A 3DQRA 4K5HA 1JWJA 4UH5A 2HX2A 4D2YA 5G6PA 4UGUA 3JWXA 4CX6A 2ORQA 5G6QA 4UGLA 1K2SA 3JX5A 1Q2OA 4KCOA 4CFTB 1OM4A 3UFQA 1P6LA 3EJ8A 4JS9A 4D35A 4CTTA 1MMVA 3SVQA 3E6NA 4UGIA 4UG5A 1P6JA 4D3IA 4UH3A 5G6EA 1FOOA 4D3VA 2G6KA 3Q9AA 2ORRA 5G6MA 3RQJA 4CTXA 3N5TA 3NNZA 3N6EA 5ADGA 4JSGA 4UH8A 3EBDA 3N67A 4D1OA 4D3BA 4CX0A 4CAQA 3JWUA 5ADIA 1P6IA 1ZZTA 4UGHA 4K5GA 1MMWA 1M9TA 3JTAA 2NOSA 1M00A 4KCJA 3RQKA 4UGFA 5G0NA 3PNEA 5FVXA
chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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