The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
68
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structure length |
68
|
Chain Sequence |
PFNPFELTNHAVLLVGYGTDSASGMDYWIVKNSWGTGWGENGYFRIRRGTDECAIESIAVAATPIPKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
DIPEPTIDYL PEPTIDASE 1 EXCLUSION DOMAIN CHAIN
|
| publication title |
Cathepsin C Inhibitors: Property Optimization and Identification of a Clinical Candidate.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
8
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| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| chains with identical sequence |
F, I, L
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| ec nomenclature |
ec
3.4.14.1: Dipeptidyl-peptidase I. |
| pdb deposition date | 2013-10-31 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) | Cysteine proteinases. Chain C |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ICF B; 4OEL B; 2DJG C; 2DJF C; 4CDC C; 1MHW C; 1K3B C; 4CDE C; 4CDD C; 4CDF C; 4OEM B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QOJ A; 1AZQ A; 3CME A; 1IL2 A; 2HHH L; 1H9K A; 4CKE A; 2IW3 A; 2K5D A; 4IUN A; 4KMU C; 2WP8 J; 3S2D B; 1SRO A; 5DAU A; 3GTK B; 2F4I A; 3HOW G; 1A2U A; 5JJZ A; 3FEW X; 1H95 A; 1ESR A; 4CJ1 B; 3M7G A; 2QKI C; 2YU9 B; 1L0X B; 1TWF H; 3OMG A; 1A62 A; 5IYC H; 2B2U A; 1XPO A; 5IOD A; 4IJL A; 1MD2 D; 5ELD A; 3G7L A; 3ND8 A; 5IP7 H; 1VQB A; 3PUY A; 3D0F A; 3CC7 A; 3CCQ A; 1TWH H; 1NNX A; 3CD6 A; 5IP9 H; 4A3F B; 2HT1 A; 1Y69 U; 1B50 A; 2IPK D; 1L1O B; 3HOY G; 4NMZ A; 1PMR A; 2F0P A; 4BY7 B; 1AE2 A; 2UU9 Q; 2NVQ B; 4GN4 B; 2L12 A; 4FNF A; 1QCB D; 3ER0 A; 2CFM A; 4ZKC B; 2CH4 A; 4YY3 L; 1DYQ A; 1IYU A; 3GTO H; 4IPC A; 4HSV A; 1CM9 A; 2Q2U A; 1YBY A; 2DNC A; 4G7H C; 2B2W A; 2KVM A; 2MO0 A; 3PF5 A; 3TS2 A; 3DEO A; 4CDD C; 2A68 C; 4CJ0 B; 3K0Y A; 3UDI A; 3I4N G; 3NP8 A; 2NVY B; 3DLL A; 2J0T D; 4OEM B; 1AEX A; 5AJ3 L; 4J15 A; 1Z6H A; 4C3I H; 1AH9 A; 1V1P A; 4HJA A; 3FMC A; 5C4Z A; 1MIU A; 1SNQ A; 1NE3 A; 2D2C C; 4L8J A; 2L4N A; 3FDT A; 5G3L D; 4OWW B; 3I4M G; 3UDX A; 3GTQ B; 3K5L A; 1HFN A; 3N52 A; 1YHA A; 5IWA Q; 4QUC A; 4QGU A; 1GUT A; 5IGG A; 2XWJ B; 4A3E B; 3ULJ A; 1YNN C; 4OGQ C; 4WRD A; 1LT3 D; 1E1T A; 2IT1 A; 5ELE A; 3A7A B; 5C4J B; 4YWL A; 1NJI C; 2R6G A; 1PDQ A; 2C35 B; 3S1Q H; 1EWH A; 1TWG B; 5JPM C; 4ZCK A; 1BKB A; 1HTL D; 2HQL A; 1HFG A; 4DV1 Q; 2FIN B; 1CFM A; 5FO8 B; 5ELF A; 1UE5 A; 2ASB A; 3GV3 A; 1VQF A; 3LNN A; 1JIC A; 1SYD A; 4F87 A; 2MO1 A; 4G7Z C; 1L0Y B; 5HY6 A; 2UUB Q; 2QEJ C; 3OIP A; 3KK7 A; 2PMZ E; 2BOS A; 4LFC L; 1BR9 A; 2DNE A; 1JJ2 A; 3TSS A; 1C4Q A; 3NXW A; 2F52 A; 5JPN C; 1W2B A; 1UE6 A; 5DNF A; 1J8I A; 3GDE A; 2R93 G; 4R8N A; 2B63 H; 4PG3 A; 1ET9 A; 3NEL A; 4KN7 C; 2R7D A; 2RDF A; 2H4O A; 1A8V A; 3I7F A; 3U4V A; 1ZYR C; 4DV2 L; 2F03 A; 1LT4 D; 3CQZ B; 2KJX A; 2Q8T A; 1L1O C; 1BVS A; 3TZU A; 3J7A F; 1HZB A; 1UUP A; 4U67 3; 2VQF Q; 3U4Z A; 4RGM A; 1HUN A; 2R7F A; 5HUR A; 1SEB D; 1DM0 B; 2FHT A; 4X62 Q; 5IT9 E; 1CHQ D; 4BBR G; 4X66 Q; 3OSO A; 5GAH C; 1I6H B; 3I4O A; 2KCM A; 1ML0 D; 2ZXO A; 2JA6 H; 4K2L A; 2Y0S B; 3VR6 A; 2Z6K C; 3MZ5 A; 1ZEQ X; 3T4A C; 3DXJ C; 2JP1 A; 3AQQ A; 3KLS A; 1QVF A; 2CWA A; 2JA8 H; 4KI0 A; 2DN8 A; 1IYV A; 2KEE A; 1LT5 D; 1B2T A; 2LS0 1; 2JEA I; 3D6W A; 2DJG C; 2F0H A; 2RHQ B; 2KOL A; 3IRB A; 4DK1 A; 3H0G H; 1MJC A; 1E1O A; 1ZXT A; 4LF7 Q; 1Y1V H; 3PO2 G; 2XRS D; 2CW0 D; 4BBS B; 1KXL A; 3PQI A; 4A3I G; 1E2V A; 4LF9 L; 1BO0 A; 5A35 A; 4IOA A; 2BDN A; 4AYB G; 5M3F B; 4CJ2 C; 5GRO A; 3UDG A; 2D0O A; 4DV5 Q; 3S1R H; 2B2T A; 2HHH Q; 2JA7 B; 1CSQ A; 3CXC A; 1HZA A; 2A69 D; 1EIF A; 1EIY B; 2CKZ B; 4F8M A; 4TVA B; 1KAA A; 3VDY A; 3HP3 A; 2F0Q A; 1GHK A; 4DA2 A; 4DPG A; 4PV1 C; 5IYB H; 1AFP A; 1TY0 A; 1FGB D; 1ET6 A; 1S4Z A; 1ILP A; 1F77 A; 1B70 B; 3MXG A; 1ICF B; 1STA A; 1SFO B; 4OL7 A; 5LMN W; 1S5C D; 2Z0S A; 5G3L F; 4HID A; 1Y1W B; 1O7L A; 2BDO A; 5KYL A; 1N8R C; 1A6X A; 1PH1 A; 1I4P A; 1R9T B; 1N34 Q; 3LX0 A; 4P75 A; 1JOK A; 3NQI A; 2EZV A; 4GS3 A; 4YIJ A; 1Y8O B; 4F88 A; 3CCR A; 3M4O B; 5HGT A; 5HGQ A; 5I6Y A; 4N8F A; 1S5B D; 3CPW A; 3G48 A; 2Z1C A; 3PO3 G; 4K5X A; 4C3J H; 3S2H B; 4A3F G; 2XIW A; 1MHW C; 3SVM A; 4BY7 G; 2JJQ A; 1B3A A; 4LUZ A; 2PNH A; 4NDX A; 4UAI A; 4E6I A; 5FLX c; 4FO2 A; 1SNP A; 1U5K A; 2VZA A; 2B2W C; 4KTA A; 5COY A; 3J81 E; 1E22 A; 1A3T A; 3A55 A; 1LTB D; 1HJP A; 4LUO A; 4R4I A; 4AYB E; 5C4H A; 1D5Z C; 4KY5 A; 1PH7 A; 1CZW A; 3H3V C; 2E5L L; 1K8O A; 1N33 L; 4V19 0; 5FKA C; 1OXX K; 3VA5 A; 1LTG D; 1AZP A; 2ENB A; 1STE A; 3HZX A; 5C4X H; 3TRE A; 5FOB B; 5C0X H; 2LXJ A; 4DR1 L; 4HCS A; 2IY5 B; 1O78 A; 1DOL A; 4QIW B; 3MWY W; 4OX9 L; 3M3Y B; 3RMH A; 4DR7 Q; 2K5W A; 1D6E C; 1D8L A; 1O7Z A; 1ENA A; 3U9O A; 2UUA L; 3S17 H; 5ELC A; 2ZJP A; 1YIT A; 2F3W A; 4G4K A; 5BN4 A; 1H9S A; 1V1Q A; 2QEX A; 1ICW A; 1RF2 D; 1E2W A; 4QJF A; 3S16 H; 1WFQ A; 1IHZ A; 3EBE A; 3J7Z C; 4A3E G; 4A75 A; 1PTO H; 3A54 A; 1IBM L; 2P5Z X; 1YHB A; 2HIX A; 2YV5 A; 4NKL A; 4LFC Q; 2VXW A; 3KDF A; 3HOW H; 1V8Q A; 1EYC A; 1IKM A; 3MXN B; 5FLX L; 1HPC A; 4IUP A; 4IO9 A; 3GTG H; 1PH8 A; 1K9M C; 3SHL A; 1STG A; 3PSI A; 2NTS A; 4JBW A; 2NYZ D; 1XPU A; 1VQH A; 4XQQ A; 1EUJ A; 4HJ8 A; 1X55 A; 2AQ2 B; 2BA1 A; 4KY7 A; 5FO9 B; 1VQG A; 3HOY H; 3K58 A; 4RH6 A; 1WTO A; 4KKT A; 3JAM E; 3K7A B; 4DR2 L; 1PH5 A; 1LTI D; 4BWG B; 3BYT B; 2M00 A; 3STB D; 1JMC A; 3PUV A; 3NPP A; 2EYP A; 5E4X A; 3CCJ A; 3PIP A; 1CZG A; 1JWM D; 2D9U A; 2X69 A; 3QG1 A; 3PMF A; 5M5Y H; 3BZK A; 4IZ8 A; 2E75 C; 3HOV G; 1ENF A; 2MQH A; 1QUQ B; 1YNX A; 4JI5 L; 3I4N H; 1G6P A; 2RDH A; 2UXD Q; 4EVO A; 1NAP A; 1PFS A; 4MZ9 A; 1G2S A; 1V43 A; 3SR1 A; 1BCP D; 3QR8 A; 1FNU A; 1VS0 A; 4RCO A; 3VYU A; 3GTL H; 4OIJ A; 1U0L A; 2Y0S G; 3CHB D; 4R9W A; 3VR3 A; 2PZW A; 3HS0 C; 1HQM C; 3NBI A; 4RHS A; 5M5W H; 3CP0 A; 5KYI A; 1DOM A; 2XVS A; 1FNV A; 1FR3 A; 3H15 A; 4EQ5 A; 4IFD G; 4WJ3 M; 1EFI D; 1A3V A; 4RWS C; 3K81 C; 4GN5 A; 5CMD A; 1A0I A; 4A3C H; 4YHH L; 1TS2 A; 5KNB A; 2NN6 G; 4BBS G; 2UXB Q; 3CU7 A; 3T16 A; 4XT3 B; 5D65 A; 1SXT A; 2I5L X; 1H9S B; 3HKZ G; 3C3L A; 3URY A; 2R92 B; 3E9H A; 5E1F A; 1HA5 A; 4A3J B; 2KHS A; 1HUM A; 2E74 C; 3EJI A; 3OMC A; 2JA7 G; 1I50 B; 5EKK A; 1HNZ Q; 2ZM6 L; 4DR5 L; 3C2P A; 1SJE D; 3MA2 B; 5CV5 A; 1VQN A; 3EFX D; 1G91 A; 4NXM L; 1NCV A; 3GO5 A; 4QL5 A; 1VQ7 A; 4LFA Q; 1D1K A; 1Q1B A; 1PRT B; 2QF7 A; 3MAQ A; 2LKV A; 2F1M A; 2R93 H; 3TME A; 1XYI A; 1STH A; 4YCW A; 1TKW B; 1AW7 A; 1R4Q B; 4DV4 L; 2EY1 A; 3CC2 A; 5CC4 A; 1RCV D; 3M4Q A; 1Y1W G; 3AU7 A; 2LXK A; 1JE4 A; 1GUW A; 3BU2 A; 5AFW A; 5M5X H; 1QOH A; 2BCO A; 2XN9 C; 1MJE A; 3HOU B; 2YTY A; 2DY7 A; 3KOJ A; 2E2H H; 2JK8 A; 1I3Q H; 4OO1 I; 4C2M B; 5IGE A; 1PXU A; 1STB A; 4B9X A; 4BBR H; 2Y0S E; 2K14 A; 3H3V I; 1TT2 A; 4O1N A; 2ALY B; 1KD1 C; 3S1M B; 5E7N A; 1K8A C; 2K5H A; 2EY6 A; 1QZG A; 3F2C A; 4QMG A; 1HZC A; 1JJC B; 5C3W A; 3F2B A; 2E5L Q; 5BR8 L; 1C7Y A; 2F0W A; 3R2T A; 4R8I A; 3K57 A; 2UUC L; 1N33 Q; 4JV5 Q; 5IGB A; 1K28 A; 1B9M A; 1VQ5 A; 3J81 j; 4YCV A; 2NVX B; 4C56 C; 3PO2 H; 3S14 H; 3V05 A; 2BH2 A; 3HKZ E; 4GLX A; 1HQR D; 5EKI A; 5JJL A; 1KRS A; 2KBN A; 3U9S A; 1A15 A; 1AP0 A; 2SDF A; 4R4Q A; 1LAB A; 1G29 1; 4Q0F A; 4LWC A; 2JA5 H; 2AUJ D; 2LY7 A; 1E2Z A; 4NW2 A; 2N78 A; 1BBX C; 3TN2 A; 4X3U A; 2F0O A; 3GTP H; 2PI2 E; 4A3B H; 3T1Y L; 2XTI A; 3BS1 A; 3UI2 A; 4U68 A; 4IUT A; 1PH2 A; 1YHQ A; 2ZXP A; 3ONA B; 4DAV A; 2GVB A; 1SSO A; 3A5Z B; 3OHX C; 4KJO A; 4HIO A; 2L1B A; 1XNR L; 4ZQ3 A; 5K36 G; 3QJY A; 4KHZ A; 1WTW A; 3N6R A; 3Q0A A; 1EZ6 A; 3NBH A; 5KND A; 1C48 A; 1SND A; 3MEF A; 2EY5 A; 4A76 A; 4OXP A; 2ZT9 C; 3G4S A; 5ELO A; 3W5O A; 2SNM A; 2Q8I B; 1B4O A; 2EE1 A; 1PRT C; 1Q12 A; 4JBM A; 1EEF D; 4GNX B; 4DR2 Q; 1EYD A; 1M8A A; 2K6A A; 4JI2 Q; 3T1H Q; 4HJ5 A; 3MTS A; 3PO3 H; 5KIX A; 4JG2 A; 4K5V A; 4RGT A; 1YJN A; 3L7Z C; 4B3R L; 2AQ1 B; 5CV7 A; 4A3F H; 3CAM A; 2KQ3 A; 1U4L A; 3SDZ A; 4JI5 Q; 1XMO L; 5LL6 S; 2NVQ H; 4EGV A; 1EQQ A; 2R7Z B; 1K8G A; 3AMU A; 1V9P A; 3K8A A; 1EQT A; 4ID6 A; 1YNJ D; 2B2V C; 5COR A; 2VNU D; 4DK0 A; 1Z9F A; 4OON A; 3NSW A; 3WOF A; 3TP5 A; 1EY8 A; 3GTJ B; 1HZ9 A; 1WTQ A; 1EOT A; 1VDZ A; 2JE6 I; 2UXC Q; 1HXY D; 1GHJ A; 1PYS B; 1SJH D; 3DEP A; 4EX5 A; 3BVG A; 1EOV A; 5D3D A; 3IAY A; 4HIK A; 4HTH A; 2NBF A; 1JOR A; 4QIW E; 3G6J B; 4HMI A; 3CPF A; 3D6C A; 4AH6 A; 5F2D A; 1WCM B; 1B1Z A; 3F1Z A; 1KC8 C; 1I94 L; 5EJW A; 4DF7 A; 5E4W C; 1EEI D; 1VQJ A; 5IGD A; 4GOP C; 4K8I A; 1WI5 A; 1Q46 A; 1S40 A; 1TWC H; 4LF6 L; 1II3 A; 4QUF A; 4UP9 A; 2ZTD A; 4A3K B; 4DKA C; 3BDO A; 2OXP A; 4Z9C B; 2EIF A; 5IOC A; 1N36 L; 2K01 A; 1VMC A; 5KRU A; 3NHH A; 5C4J H; 4DR5 Q; 3SEB A; 1PH9 A; 4K0K Q; 1I4Q A; 2O4X A; 3HOZ G; 1TWG H; 5EPK A; 3GP7 A; 3P7J A; 4A3G B; 1GM5 A; 2EDG A; 2R92 G; 1O80 A; 3NBH B; 3SGI A; 1TQO A; 5T1G A; 4JC0 A; 1E24 A; 1KIX A; 5C5L A; 2A6E C; 1LUZ A; 4ABN A; 3DM3 A; 3Q23 A; 3LGJ A; 4ALP A; 4XQN A; 1EYG A; 4DAM A; 4GNX C; 1HNW L; 3I91 A; 1X9N A; 2PCF B; 1IBL Q; 1SYE A; 1IKL A; 2ZXR A; 5H1S E; 3TDQ A; 4R4C A; 3G6E A; 1EWI A; 3BDL A; 4JPB W; 2VQE L; 4RCN A; 4HJ9 A; 2OTJ A; 4DV0 Q; 4DAP A; 3R2I A; 1PA6 A; 1X3E A; 2RQX A; 5D3I B; 4LMQ D; 1X6O A; 1CKN B; 3CQZ H; 4X65 Q; 3PV0 A; 3V96 A; 3HOV H; 1KDC A; 3GTM H; 1CQV A; 1F9Q A; 4L5Q A; 3HOU G; 1GUG A; 4GKJ Q; 4HJ7 A; 4JYA L; 4YWK A; 4FXK C; 4L5R C; 4HIM A; 1I6H H; 3D31 A; 2EYH A; 1EYA A; 5EAY A; 1GUN A; 3OOC A; 4DU9 A; 1TWA B; 4IFD H; 1WOC A; 1WVL A; 1SBB B; 3RZD B; 4LF8 L; 1SE4 A; 2L0C A; 5J22 A; 3K59 A; 3VR2 A; 3A5U A; 1W3S A; 2EOT A; 2BE5 D; 2C9O A; 2M9V A; 1J5E Q; 2NN6 H; 1GKH A; 1SYG A; 2E2D C; 3NWS A; 4H13 C; 4BBS H; 2RBM A; 2V1C C; 4DN4 M; 3V2T A; 3NQT A; 1SYF A; 1TWF B; 4HSP A; 5IE8 A; 1XNR Q; 4UHV A; 4WFN 3; 3WDN A; 4BS9 A; 3ERS X; 3PF4 A; 2JA7 H; 4NXN L; 4TQU S; 1EQR A; 3CRK C; 1OXS C; 2DJF C; 2GVA A; 4ZLT F; 4IOC A; 4IJH A; 3Q24 A; 1E7Z A; 1KRT A; 2IHE A; 2OWO A; 3RZO B; 1CHP D; 2E2J H; 4QF4 A; 4MTN A; 2A8V A; 3MFY A; 1XWE A; 4N9P A; 2QA4 A; 4JI3 L; 1DOK A; 4DR4 L; 4JOI C; 2RDG A; 3A8K E; 4UY8 C; 3TP6 A; 1TXY A; 1LO5 D; 2KEN A; 2IJ0 A; 4DR6 L; 1JOO A; 3KF8 A; 4N8X 1; 5LMN Q; 1SFO H; 1SNM A; 4XYQ A; 4ZUJ A; 1WTR A; 3C46 A; 3K5M A; 4GKK Q; 1R9T H; 3AB9 A; 1I5F A; 1M90 C; 4JI8 L; 5M9O A; 2F0I A; 4P71 A; 5E3F A; 4C3I B; 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