The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
39
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sequence length |
156
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VALSADIVGMHYRYPDHYEVEREKIREYAVAVQNDDAWYFEEDGAAELGYKGLLAPLTFICVFGYKAQAAFFKHANIATAEAQIVQVDQVLKFEKPIVAGDKLYCDVYVDSVREAHGTQIIVTKNIVTNEEGDLVQETYTTLAGRAGEGFSDG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular basis for the inhibition of beta-hydroxyacyl-ACP dehydratase HadAB complex from Mycobacterium tuberculosis by flavonoid inhibitors.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Lyase/lyase inhibitor
|
| source organism |
Mycobacterium tuberculosis h37rv
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| molecule keywords |
(3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadA
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| total genus |
39
|
| structure length |
153
|
| sequence length |
156
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.59: 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase. |
| pdb deposition date | 2014-10-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF13452 | MaoC_dehydrat_N | N-terminal half of MaoC dehydratase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Thiol Ester Dehydrase; Chain A | Hotdog Thioesterase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AZA A; 4XY5 A; 3R3D A; 1SC0 A; 2OWN A; 3KVI A; 4XY6 A; 1VPM A; 3F1T A; 3SPS A; 4K02 A; 3R36 A; 4A0Y A; 4B0C A; 2OIW A; 2QWZ A; 4RLU A; 4RV2 B; 4B0J A; 1WN3 A; 1LO7 A; 2CY9 A; 3QOO A; 4W78 B; 2HX5 A; 1S5U A; 4B8U A; 4A12 A; 1IQ6 A; 2GLL A; 3KX8 A; 4RLJ A; 4QD9 A; 5SZY A; 2EIS A; 3ESI A; 3CF9 A; 5T02 A; 4AE7 A; 5HWF A; 3F5O A; 4RLT A; 2GVH A; 4QDB A; 3R3A A; 4OOB A; 5EGJ A; 3LW3 A; 1SH8 A; 1ZHG A; 3B7J A; 4NCP A; 1Z54 A; 3E29 A; 2OKI A; 2O6U A; 2W3X A; 3KX7 A; 4K4B A; 3DOY A; 1PN2 A; 2GLP A; 2HBO A; 4I4J A; 3R87 A; 5HMC A; 3KUV A; 3LZ7 A; 3NWZ A; 3D04 A; 4CL6 A; 3BNV A; 3E1E A; 4HZP A; 4RMM A; 2VKZ G; 1VH9 A; 3R34 A; 3P2S A; 2F3X A; 4M20 A; 1LO9 A; 3R37 A; 1Q4U A; 1ZKI A; 4K4A A; 3P2R A; 1MKB A; 3DP3 A; 1TBU A; 3LBB A; 2GLV A; 2GF6 A; 1YLI A; 4FFU A; 5BUX A; 3R3C A; 2F0X A; 4WNB B; 4ORD A; 4K00 A; 3D6L A; 5HZ4 A; 5SZZ A; 4ZRB A; 4H4G A; 3LWG A; 2H4U A; 3DKZ A; 4IEN A; 3QY3 A; 4KEH A; 4RV2 A; 4W78 A; 4GAH A; 4QD8 A; 5EP5 A; 4E3E A; 3AZ9 A; 5T06 A; 3KH8 A; 5HD6 A; 4YBV A; 4RLW B; 5EGK A; 4MZQ A; 2EGJ A; 2HLJ A; 1MKA A; 3CF8 A; 3KVZ A; 4I45 A; 3TEA A; 4A0Z A; 2OKH A; 4K4C A; 1IXL A; 3R35 A; 2F41 A; 3Q62 A; 4HZO A; 3K67 A; 1PSU A; 3P3I A; 3HDU A; 1LO8 A; 2OAF A; 4MTU A; 2XFL A; 3HM0 A; 2O5U A; 2QQ2 A; 3IR3 A; 3B7K A; 3AZB A; 3R3F A; 1YOC A; 4QDA A; 2ESS A; 1Z6B A; 5SZV A; 3LMB A; 3ED0 A; 3DP1 A; 3KUW A; 4A0X A; 5BYU A; 1WLU A; 1Y7U A; 3KW1 A; 2CWZ A; 3HMJ G; 2OV9 A; 4K4D A; 3R32 A; 4K49 A; 5CPG A; 2PRX A; 2FS2 A; 3KG8 A; 5EO4 A; 1SBK A; 3P2Q A; 3E8P A; 3DOZ A; 1BVQ A; 2GLM A; 4WNB A; 4B0B A; 2PIM A; 3R3B A; 5T07 A; 2Q78 A; 2AV9 A; 3OML A; 1Q4S A; 2EGI A; 3KV7 A; 2PZH A; 3DP0 A; 4RLU B; 4ZW0 A; 2C2I A; 3D6X A; 4GAK A; 5SZU A; 4ZRF A; 2FUJ A; 3BJK A; 4HZN A; 2DSL A; 3KHP A; 5F6R A; 1VI8 A; 4RLW A; 5BUW A; 4RLJ B; 1Q4T A; 4MOC A; 4QD7 A; 4ZJB A; 2NUJ A; 2B6E A; 4RLT B; 3LBE A; 1VH5 A; 2BI0 A; 3KVU A; 4B0I A; 3P3F A; 1WLV A; 1WM6 A; 1PN4 A; 2O6B A; 1C8U A; 1T82 A; 2UV8 G; 4AE8 A; 3KV8 A; 5DIO A; 2CYE A; 5KL9 A; 1Q6W A; 3S4K A; 4ZV3 A; 2EGR A; 5BUY A; 3CK1 A; 2B3M A; 1U1Z A; 3GEK A; 4MOB A; 5DM5 A; 5EO2 A; 5HMB A; 1J1Y A; 2O6T A; 5EGL A; 1NJK A; 3WEW A; 1S9C A; 3AZ8 A; 2Q2B A; 2V1O A; 4FQ9 A; 4I83 A; 3EXZ A; 2XEM A; 3DP2 A; 4I82 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3AZA A; 4XY5 A; 3R3D A; 1SC0 A; 2OWN A; 3KVI A; 4XY6 A; 3HRQ A; 1VPM A; 3F1T A; 3SPS A; 4K02 A; 3R36 A; 4A0Y A; 4B0C A; 2OIW A; 2QWZ A; 5BP2 A; 4RLU A; 4RV2 B; 4B0J A; 1WN3 A; 1LO7 A; 2CY9 A; 3QOO A; 4W78 B; 3ZH7 A; 2HX5 A; 2PFC A; 1S5U A; 4B8U A; 2VZ8 A; 4A12 A; 1IQ6 A; 2GLL A; 3KX8 A; 4RLJ A; 4QD9 A; 5SZY A; 2EIS A; 3ESI A; 3CF9 A; 5T02 A; 4AE7 A; 5HWF A; 3F5O A; 4RLT A; 2GVH A; 4QDB A; 3R3A A; 4OOB A; 3FRN A; 5EGJ A; 3KG6 A; 3LW3 A; 1SH8 A; 1ZHG A; 3B7J A; 4NCP A; 1Z54 A; 3E29 A; 2OKI A; 2O6U A; 2W3X A; 3KX7 A; 4K4B A; 3DOY A; 1PN2 A; 2GLP A; 2HBO A; 4I4J A; 3R87 A; 5HMC A; 3KUV A; 3LZ7 A; 3NWZ A; 3D04 A; 3BBJ A; 4CL6 A; 3BNV A; 3E1E A; 4HZP A; 4RMM A; 2VKZ G; 1VH9 A; 3R34 A; 3P2S A; 2F3X A; 4M20 A; 1LO9 A; 3R37 A; 1Q4U A; 1ZKI A; 4K4A A; 3ZH6 A; 3P2R A; 1MKB A; 3DP3 A; 1TBU A; 3LBB A; 2GLV A; 2GF6 A; 1YLI A; 4FFU A; 5BUX A; 3EL6 A; 3R3C A; 2F0X A; 4WNB B; 4ORD A; 4K00 A; 3D6L A; 5HZ4 A; 3CJY A; 4ZRB A; 5SZZ A; 4H4G A; 3HRR A; 3LWG A; 2H4U A; 3DKZ A; 4IEN A; 3QY3 A; 4KEH A; 4RV2 A; 4W78 A; 4GAH A; 4QD8 A; 5EP5 A; 4E3E A; 3AZ9 A; 5T06 A; 3KH8 A; 5HD6 A; 4YBV A; 4RLW B; 5EGK A; 4R4U A; 3ZH5 A; 5BP3 A; 4MZQ A; 2EGJ A; 2HLJ A; 1MKA A; 3CF8 A; 3KVZ A; 4I45 A; 3TEA A; 4A0Z A; 2OKH A; 4K4C A; 1IXL A; 3R35 A; 2F41 A; 3Q62 A; 4HZO A; 3K67 A; 2QQP A; 1PSU A; 3P3I A; 3HDU A; 1LO8 A; 2OAF A; 4MTU A; 2XFL A; 3HM0 A; 2O5U A; 2QQ2 A; 3B18 A; 3IR3 A; 4OOC A; 5KKU A; 3B7K A; 3AZB A; 3R3F A; 1YOC A; 4QDA A; 4QFW A; 2ESS A; 1Z6B A; 5SZV A; 3LMB A; 3ED0 A; 3DP1 A; 3KUW A; 4A0X A; 5BYU A; 1WLU A; 1Y7U A; 3KW1 A; 2CWZ A; 3HMJ G; 2OV9 A; 4K4D A; 3R32 A; 4R9Z A; 4K49 A; 5CPG A; 5E1V A; 2VZ9 A; 2PRX A; 2FS2 A; 3KG8 A; 5EO4 A; 1SBK A; 3P2Q A; 4U3V A; 3E8P A; 1OHF A; 3DOZ A; 1BVQ A; 2GLM A; 3KG7 A; 4WNB A; 3RD7 A; 4LN9 A; 2PIM A; 4B0B A; 3R3B A; 5T07 A; 2Q78 A; 2AV9 A; 3OML A; 1Q4S A; 2EGI A; 3KV7 A; 2PZH A; 3DP0 A; 4RLU B; 4ZW0 A; 3ZH7 B; 2C2I A; 3D6X A; 4GAK A; 5SZU A; 4ZRF A; 2FUJ A; 3BJK A; 4HZN A; 2DSL A; 3KHP A; 5F6R A; 1VI8 A; 4RLW A; 5BUW A; 4RLJ B; 1Q4T A; 4MOC A; 4QD7 A; 4ZJB A; 2NUJ A; 2B6E A; 4RLT B; 3LBE A; 1VH5 A; 2BI0 A; 3KVU A; 4B0I A; 3P3F A; 1WLV A; 1WM6 A; 1PN4 A; 2O6B A; 3S6P A; 1C8U A; 1T82 A; 2UV8 G; 4AE8 A; 3KV8 A; 3KG9 A; 5DIO A; 2CYE A; 5KL9 A; 1Q6W A; 3S4K A; 4ZV3 A; 2EGR A; 5BUY A; 3CK1 A; 2B3M A; 1U1Z A; 3GEK A; 4MOB A; 5DM5 A; 5EO2 A; 3RQB A; 5HMB A; 3U0A A; 1J1Y A; 2O6T A; 5EGL A; 1NJK A; 4KC5 A; 3WEW A; 1S9C A; 3AZ8 A; 2Q2B A; 2V1O A; 4FQ9 A; 4I83 A; 3EXZ A; 2XEM A; 3DP2 A; 4I82 A; #chains in the Genus database with same CATH homology 3AZA A; 4XY5 A; 3R3D A; 1SC0 A; 2OWN A; 3KVI A; 4XY6 A; 1VPM A; 3F1T A; 3SPS A; 4K02 A; 3R36 A; 4A0Y A; 4B0C A; 2OIW A; 2QWZ A; 4RLU A; 4RV2 B; 4B0J A; 1WN3 A; 1LO7 A; 2CY9 A; 3QOO A; 4W78 B; 2HX5 A; 1S5U A; 4B8U A; 4A12 A; 1IQ6 A; 2GLL A; 3KX8 A; 4RLJ A; 4QD9 A; 5SZY A; 2EIS A; 3ESI A; 3CF9 A; 5T02 A; 4AE7 A; 5HWF A; 3F5O A; 4RLT A; 2GVH A; 4QDB A; 3R3A A; 4OOB A; 5EGJ A; 3LW3 A; 1SH8 A; 1ZHG A; 3B7J A; 4NCP A; 1Z54 A; 3E29 A; 2OKI A; 2O6U A; 2W3X A; 3KX7 A; 4K4B A; 3DOY A; 1PN2 A; 2GLP A; 2HBO A; 4I4J A; 3R87 A; 5HMC A; 3KUV A; 3LZ7 A; 3NWZ A; 3D04 A; 4CL6 A; 3BNV A; 3E1E A; 4HZP A; 4RMM A; 2VKZ G; 1VH9 A; 3R34 A; 3P2S A; 2F3X A; 4M20 A; 1LO9 A; 3R37 A; 1Q4U A; 1ZKI A; 4K4A A; 3P2R A; 1MKB A; 3DP3 A; 1TBU A; 3LBB A; 2GLV A; 2GF6 A; 1YLI A; 4FFU A; 5BUX A; 3R3C A; 2F0X A; 4WNB B; 4ORD A; 4K00 A; 3D6L A; 5HZ4 A; 5SZZ A; 4ZRB A; 4H4G A; 3LWG A; 2H4U A; 3DKZ A; 4IEN A; 3QY3 A; 4KEH A; 4RV2 A; 4W78 A; 4GAH A; 4QD8 A; 5EP5 A; 4E3E A; 3AZ9 A; 5T06 A; 3KH8 A; 5HD6 A; 4YBV A; 4RLW B; 5EGK A; 4MZQ A; 2EGJ A; 2HLJ A; 1MKA A; 3CF8 A; 3KVZ A; 4I45 A; 3TEA A; 4A0Z A; 2OKH A; 4K4C A; 1IXL A; 3R35 A; 2F41 A; 3Q62 A; 4HZO A; 3K67 A; 1PSU A; 3P3I A; 3HDU A; 1LO8 A; 2OAF A; 4MTU A; 2XFL A; 3HM0 A; 2O5U A; 2QQ2 A; 3IR3 A; 3B7K A; 3AZB A; 3R3F A; 1YOC A; 4QDA A; 2ESS A; 1Z6B A; 5SZV A; 3LMB A; 3ED0 A; 3DP1 A; 3KUW A; 4A0X A; 5BYU A; 1WLU A; 1Y7U A; 3KW1 A; 2CWZ A; 3HMJ G; 2OV9 A; 4K4D A; 3R32 A; 4K49 A; 5CPG A; 2PRX A; 2FS2 A; 3KG8 A; 5EO4 A; 1SBK A; 3P2Q A; 3E8P A; 3DOZ A; 1BVQ A; 2GLM A; 4WNB A; 4B0B A; 2PIM A; 3R3B A; 5T07 A; 2Q78 A; 2AV9 A; 3OML A; 1Q4S A; 2EGI A; 3KV7 A; 2PZH A; 3DP0 A; 4RLU B; 4ZW0 A; 2C2I A; 3D6X A; 4GAK A; 5SZU A; 4ZRF A; 2FUJ A; 3BJK A; 4HZN A; 2DSL A; 3KHP A; 5F6R A; 1VI8 A; 4RLW A; 5BUW A; 4RLJ B; 1Q4T A; 4MOC A; 4QD7 A; 4ZJB A; 2NUJ A; 2B6E A; 4RLT B; 3LBE A; 1VH5 A; 2BI0 A; 3KVU A; 4B0I A; 3P3F A; 1WLV A; 1WM6 A; 1PN4 A; 2O6B A; 1C8U A; 1T82 A; 2UV8 G; 4AE8 A; 3KV8 A; 5DIO A; 2CYE A; 5KL9 A; 1Q6W A; 3S4K A; 4ZV3 A; 2EGR A; 5BUY A; 3CK1 A; 2B3M A; 1U1Z A; 3GEK A; 4MOB A; 5DM5 A; 5EO2 A; 5HMB A; 1J1Y A; 2O6T A; 5EGL A; 1NJK A; 3WEW A; 1S9C A; 3AZ8 A; 2Q2B A; 2V1O A; 4FQ9 A; 4I83 A; 3EXZ A; 2XEM A; 3DP2 A; 4I82 A;
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