The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
112
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structure length |
112
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Chain Sequence |
MNIGRLRDRITIQTLKQTRDITGEILETWEDGHTLWASVNMVSSKEAISSGAELAIGTVRIWIRYRKDINATSRIKVSTGPLAGRVLNIIGQPLPDAARTRLEILCREGAEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| molecule keywords |
Putative head-tail adaptor
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| publication title |
Solution structure of protein SF1141 from Shigella flexneri 2a
rcsb |
| source organism |
Shigella flexneri
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| total genus |
11
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| structure length |
112
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| sequence length |
112
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-06-11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KCA A; 2KZ4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1HBT H; 4FOU C; 1GHB G; 2ZA5 A; 2W3K A; 2TGA A; 4YES B; 3M36 A; 4AFZ A; 5GIB A; 1L1G A; 3OU0 A; 1HYL A; 4KGA A; 1HPG A; 2VIN A; 3PRO A; 3FAN A; 1RJX B; 2ZU1 A; 1B7X B; 1EP5 A; 2ZDK A; 4XBC A; 1O3D A; 1FAX A; 3A88 A; 3M5M A; 1IQE A; 1K1N A; 2R3U A; 3FP7 E; 4VGC C; 1O33 A; 3RXR A; 3GY5 A; 5JB9 S; 1BBR K; 4OS4 A; 2ZDN A; 2G8T A; 1RRK A; 2SGF E; 3URD A; 2GTB A; 3RC5 A; 5FBE A; 3LPR A; 4Q7X A; 3MU4 A; 4Y7A A; 2P94 A; 1EST A; 5C20 A; 2GMT B; 1AB9 C; 3T27 A; 1TA6 A; 3URC A; 2YMS D; 5GCH F; 2FYQ A; 1MTU A; 3RMN H; 3RP2 A; 1GG6 C; 1AFQ C; 3GY4 A; 5C1X A; 2ZDM A; 5DPA A; 1D6W A; 1O30 A; 3GCH B; 1CVW H; 1DWD H; 1HLT H; 1LO6 A; 2OLG A; 5C0T A; 2FOG A; 1LVB A; 1F92 A; 1W0Y H; 1QY6 A; 4K3J A; 4AYV B; 1ETT H; 1L1J A; 1TNL A; 2R2W U; 4Q4L A; 1HV7 A; 1UVS H; 2CV3 A; 1T8L A; 4X2Y A; 3BEF B; 1P2M A; 3MNB A; 2Z9L A; 1BTY A; 1A61 H; 2Q1J A; 3Q3K A; 5B6O A; 1C5L H; 1L4Z A; 2IJO B; 5EJ1 A; 1O2Y A; 5DP9 A; 1Q3X A; 2J38 A; 1TQ7 B; 1LKB A; 3RXD A; 3STJ A; 4X8U H; 3TJV A; 2A4O A; 1YPJ H; 3LH3 A; 2AER H; 1SQT A; 2VWL A; 1EAW A; 4X2X A; 1ZR0 A; 1FY5 A; 4Y8Y A; 2NU1 E; 4ZAE A; 3LC3 A; 1P2Q A; 4B6E A; 2Z9G A; 3RML H; 1EAU A; 3QTV H; 3E91 A; 1FIZ A; 1O3I A; 3W1E A; 1UO6 A; 1SSX A; 2BDB A; 1P06 A; 1ELB A; 2BDY A; 2TRM A; 2ZFF H; 3D23 A; 1AWH B; 3OSY A; 4FUJ A; 4GAW A; 5ABW A; 4U30 A; 1NFY A; 4O9V A; 4DII H; 1SB1 H; 1IQJ A; 4AYY B; 5K7R A; 3OYP A; 4Y0Y E; 4Q2K A; 3D62 A; 3Q77 A; 4JK6 A; 4Z1M D; 2VGC C; 2NU3 E; 1OP0 A; 2BD5 A; 5CE1 A; 1SLV B; 2KAI A; 3QLP H; 1L1N A; 1QL8 A; 3SHC H; 2CK3 D; 2J98 B; 1ETR H; 5T1V A; 2W5E A; 5EGM A; 2ZQ2 A; 1KXB A; 1GBM A; 3NCL A; 4AFU A; 4LZ1 H; 2JH5 D; 2GZ9 A; 5T6G A; 1VGC C; 1GMD G; 3RXC A; 1RIW B; 9LPR A; 1GDU A; 4ISH H; 5A8Y A; 2FO9 A; 2FOC A; 2O8T A; 1QB1 A; 2NWN A; 4KTC A; 4ZXY H; 1ELE E; 1EXF A; 2ZPR A; 4AOQ A; 1UVP A; 4UON A; 2D8W A; 3SI4 H; 2GCT B; 1BML A; 2IJD 1; 1COW D; 1YBW A; 3KF2 A; 4THN H; 2XC0 A; 1GL0 E; 2V3H H; 1A0H B; 1TGB A; 2AYW A; 3P17 H; 5CHA C; 4ZH8 A; 2QIQ A; 1FX0 B; 1ZHM A; 3MO9 A; 1QBV H; 2Z6B D; 2Q6G A; 2G4U A; 2KCA A; 2ODP A; 2PV9 B; 3M7T A; 3PTN A; 1SLW B; 3Q3X A; 5AHG H; 2VH0 A; 1MBM A; 3DHK H; 3U8T H; 1W10 U; 4JZD H; 2Y5G A; 3A7T A; 5EQR A; 1T32 A; 1DWE H; 1C2D A; 3UFA A; 1OP2 A; 1MKW K; 5C17 A; 4WMF A; 1TNH A; 2GX4 A; 1THP B; 1EZX C; 3T2N A; 1BA8 B; 1O5D H; 4RT1 A; 3DSO A; 4ABH A; 3MI4 A; 2TBS A; 2ZFQ H; 1BTX A; 2BQW B; 2ANK H; 1W2K H; 1ABI H; 3CS7 A; 1EFR D; 2BY6 X; 1GI8 B; 1HAZ B; 2KCP A; 3PMB B; 4CR5 A; 2IOT A; 1VR1 H; 2VB0 A; 2HRV A; 4WXV A; 2FDA A; 4FVB A; 4ZKN U; 1WYK A; 2CHA C; 2ZPS A; 1SOZ A; 3ZVG A; 1NN6 A; 1UCY K; 1OKX A; 1SL3 A; 5G4B A; 1AZ8 A; 3EA8 A; 1T4V H; 2V3O H; 1YYY 1; 2ZGC A; 2FLB H; 4CH2 B; 5DKM A; 1MCV A; 3SV9 A; 6LPR A; 4YTA A; 2WSS D; 3DD2 H; 1NPM A; 2ZU5 A; 3UB0 A; 2B7D H; 1N8O C; 1O37 A; 4K2Y A; 1O38 A; 1C5Z B; 2LNC A; 3TPI Z; 2BX4 A; 2Z7F E; 1S84 A; 3PLP A; 4Y7B A; 3GDU A; 3ZZ3 A; 2HVX A; 3OE7 D; 1T31 A; 4JCN A; 2M5T A; 4A1X A; 2RCE A; 1HXF H; 2QXJ A; 1QFK H; 4MNY A; 1E37 B; 2BY9 X; 4NZL A; 1YCP H; 3SZE A; 2J4I A; 4NFE A; 1Y3V A; 2B5T B; 5DGJ A; 1SGN E; 3SUE A; 1XUJ A; 4Y6D A; 1F0T A; 3KQD A; 1FIW A; 4YXW D; 1F5R A; 3MWI U; 1GBD A; 4YOG A; 5A0B A; 3FAO A; 1GJ9 B; 1ZGI A; 3SNA A; 5DO4 H; 2FOM B; 3PWB A; 2I6S A; 2RG3 A; 4ISN A; 3SNB A; 4GUX A; 1QA7 A; 4H4F A; 1MKX H; 1O2W A; 3DT0 H; 2JET B; 1QJ1 B; 5C2Z A; 1LVM A; 1Z1I A; 1EB1 H; 1UTP A; 1SQA A; 5FL7 D; 1AUJ A; 1TMU H; 4O03 A; 3RXB A; 4ZHL U; 2HNT C; 1ZSK A; 1K1P A; 3U8R H; 4IS5 A; 1XVM A; 1NS3 A; 1N6Y A; 1O0D H; 1UCY H; 5EIY A; 1Z8G A; 1P2I A; 3LT3 A; 4ZKR U; 1BHX F; 3EDX B; 1G32 B; 1CHO F; 1MTN B; 1CT0 E; 1F5L A; 1GBE A; 4ABI A; 3SV8 A; 1GHX H; 2F9B H; 1FQ3 A; 2WPL S; 2BD3 A; 3B23 B; 2F91 A; 1A0J A; 1ZML A; 1O3K A; 2GVF A; 1DLE A; 3N7D A; 1UVT H; 2BDH A; 1FUJ A; 1BBR E; 3NK8 A; 4Y10 E; 3ZZC A; 1AVW A; 4B2B A; 5A0A E; 1V2P T; 1AY6 H; 4X8S H; 3LDX H; 2ZO3 H; 1J14 A; 1D4P B; 1O5F H; 2PUQ H; 1WQS A; 2SGP E; 2BB4 A; 3BTQ E; 4NZQ A; 1SGY E; 3ZV9 A; 4GHT A; 2R0K A; 1P2J A; 2ZHQ H; 2ZPQ A; 4NA7 A; 4O3U A; 3QTO H; 1JRS A; 2TGP Z; 4O97 A; 3ZV8 A; 3RDZ A; 1QRW A; 3UR9 A; 1ANE A; 1TGS Z; 1GBL A; 3MH5 A; 5EST E; 4ABB A; 3S7H B; 1SQO A; 4DG4 A; 2O9Q A; 1C1O A; 2CMY A; 1G30 B; 4E05 H; 2ZI2 H; 2VWN A; 3PV4 A; 1YPL H; 1QQ4 A; 1PYT C; 3LC5 A; 1CGJ E; 5JDU B; 4CHA C; 1UTO A; 5HM2 A; 4JZF H; 2A7J A; 1OX1 A; 1BTH H; 1GL1 A; 2BZ6 H; 2LP6 A; 3NXP A; 1E0F D; 2WPI S; 2WYJ A; 1O3O A; 1TOM H; 2PKS B; 1ELF A; 3GCO A; 3KCG H; 1HCG A; 1AFE H; 1C1Q A; 3BTF E; 1HAG E; 4XE4 A; 1QHR B; 3UPE A; 4X8V H; 5JBB S; 1SGF A; 3E1X B; 2O8L A; 2QF0 A; 1W8B H; 1UVU H; 3BG8 A; 3SOS A; 4OS5 A; 4Q63 A; 1BTZ A; 1TGC A; 5HM9 A; 1NZQ H; 3P8N A; 2AIP A; 1G37 A; 2PKA B; 1GJB B; 5T3H A; 4ZCN A; 1DY9 A; 1TMT H; 2QV1 A; 4FUE A; 2J34 A; 2H9T H; 1JOU B; 3I78 A; 1TBQ H; 4J1Y A; 2GKV E; 3T5F H; 2P8O B; 5EOD A; 1H8D H; 2BDC A; 2W6J D; 4CH8 B; 1O2N A; 1GHB F; 3H5C B; 1XKB C; 1EOJ A; 3OTJ E; 1S6F A; 2UWO A; 3EE0 B; 2HOB A; 2ZFP H; 3SOR A; 3SND A; 4K5Z A; 2OD3 B; 1DOJ A; 1IHT H; 1SI5 H; 4BAN B; 1THS H; 1QRZ A; 1BRA A; 1NRS H; 1SGP E; 4K69 A; 3R3G B; 2OC1 A; 3NZI A; 2F3C E; 3M5L A; 1SHH B; 1D3T B; 4ASH A; 4YZU A; 2JIZ D; 2BD9 A; 1PJP A; 1GI9 B; 2FOH A; 1Y3X A; 2J92 A; 1C5R A; 1T8N A; 1O2T A; 3PMJ A; 3AW1 A; 3AAS A; 1ZHP A; 3OY5 U; 1BZX E; 3RXA A; 2GZ7 A; 1LPG B; 3D49 H; 4DY7 B; 2XWB I; 2P95 A; 1A3B H; 2QXH A; 1A0L A; 1K28 D; 3RXM A; 1EJA A; 1C1P A; 1ELA A; 1PPG E; 4DT7 B; 6CHA B; 2TGD A; 1EB2 A; 2Y81 A; 1VKY A; 3PMH B; 1C5T A; 1S6H A; 3AAU A; 4DOQ A; 1FXY A; 1K1O A; 4GHQ A; 1AE5 A; 1AHT H; 1ZPB A; 1E36 B; 2RA3 A; 1BHX B; 1TFX A; 4B73 A; 4AZ2 B; 2HGT H; 4CR9 A; 2HWL B; 1V6D A; 3QUM P; 1GBF A; 3LIW A; 2R3Y A; 2BYA X; 2HPQ H; 2FZZ A; 2ZHW H; 4WF8 A; 1O36 A; 1TPS A; 3ENS B; 4Y71 A; 1SR5 C; 1YLD A; 3TK5 A; 2NU0 E; 2Z3E A; 3F9H A; 3QWC H; 1S83 A; 3K65 B; 2B0F A; 1F2S E; 3HK6 B; 4MLF B; 4AB8 A; 4YLQ H; 3ZYE A; 1G3E A; 4MDS A; 3OFN D; 3HKI B; 5HGG A; 3OX7 U; 3VGC C; 4CRA A; 3BF6 H; 4IGD A; 1C2I A; 5AF9 H; 1RTL A; 1Y5A T; 3B9F H; 2AFQ B; 4DW2 U; 2BD8 A; 1EAI A; 3Q76 A; 1ABJ H; 3R0F A; 3SO3 A; 1O2R A; 1UCY E; 1FY8 E; 3E16 B; 4OS1 A; 5FBI A; 1DY8 A; 4YOJ A; 1ACB E; 2PKA A; 5E0J A; 3O8D A; 4BXW A; 1MU8 B; 2PUX B; 3SW2 B; 2P16 A; 2VIW A; 2A32 A; 2ZIQ H; 3K6Y A; 4Q80 A; 3U1I B; 4B76 A; 2ODQ A; 2ZGX H; 1C5O H; 1J9C H; 1LHC H; 3DUX H; 2BTC E; 1IQK A; 3N99 A; 4E06 H; 2BZA A; 2QA9 E; 4HI3 A; 3T25 A; 5EJL A; 1DSU A; 5KED A; 3PYH A; 2SGA A; 5AFZ H; 1TGT A; 2AGE X; 5E0G A; 4XBB A; 1T4U H; 1GMD F; 2ZG0 H; 4UFD H; 2SNW A; 3PB1 E; 3O8C A; 4KP0 A; 1V2U T; 3A83 A; 1A46 H; 4MQA A; 4YLU A; 1BRC E; 2VIQ A; 3UWJ H; 4GCH G; 1AND A; 1GHY H; 2BM2 A; 3SN8 A; 1EKB B; 2UUF B; 1QTF A; 3DFJ A; 2J2U A; 1H9L B; 1SLU B; 3SQH E; 1A3E H; 1WV7 H; 2OQU A; 3ZZB A; 3LH1 A; 5KGO A; 1MTW A; 1TMB H; 1S81 A; 3VB6 A; 1FY1 A; 1C1V H; 3UWI A; 1V2N T; 3FP6 E; 1QIX B; 1VJA U; 2KFW A; 1Z6E A; 1KYN A; 1P2O A; 2VWM A; 1L4D A; 3LGI A; 4Y0Z E; 2A45 B; 1HAO H; 1O2H A; 1GMH G; 1Z71 A; 2ZDA H; 2A1D B; 1P04 A; 4B2C A; 1HAP H; 1P9S A; 3EGK H; 1H8E D; 1IQF A; 4X6N A; 3A89 A; 1T8M A; 1G9I E; 2EQN A; 2H9H A; 3MH7 A; 4X1N U; 3RUO A; 4DVA U; 3RM0 H; 3UY9 A; 1A5H A; 2ZQ1 A; 3UQO A; 3AVZ A; 4NWL A; 4OS2 A; 1NY2 2; 1NU9 A; 1LQE A; 1TB6 H; 1S85 A; 3QGN B; 5A0C A; 2ZU3 A; 4TPI Z; 2QF3 A; 1U6Q A; 2ZNK H; 1J15 A; 2KAI B; 2K1Q A; 2ILN A; 1UTQ A; 4U2W A; 1LHE H; 1UW7 A; 2ZFT A; 2BDG A; 3V12 A; 1P2N A; 3BG4 C; 3SU5 A; 1O3B A; 2OQ5 A; 1PPC E; 3KQE A; 3KYF A; 1VCW A; 5FCK A; 4RSP A; 1YPH C; 1YP9 A; 1QL9 A; 3G01 A; 1EQ9 A; 3PO1 B; 3BTG E; 2J5U A; 3A80 A; 2FYR A; 1TRN A; 3E90 B; 5I46 H; 1CT4 E; 1IQG A; 5JPM H; 5F03 A; 3BV9 B; 4Z0K A; 3TLO A; 1K22 H; 2WPK S; 3P8O A; 1GVZ A; 3MFJ A; 1G3B A; 3U28 C; 1C2L A; 1BRU P; 1ESB A; 1B0F A; 2FEQ H; 4X1P U; 2PSX A; 1RD3 B; 4XDE A; 3SI3 H; 4AGK A; 1PQA A; 4ACA A; 4R8T B; 1BOQ A; 1C2J A; 1H9I E; 3LOX A; 1KDQ B; 1GHA G; 4MPX A; 1A5I A; 1ELV A; 2Q6D A; 1BTP A; 3TJO A; 1SQR A; 3L33 A; 1FNI A; 3A7Z A; 4CBN A; 4DJZ B; 1NFU A; 1WUN H; 3KYG A; 3ZIA D; 2GCH G; 1UK2 A; 2GZ8 A; 1PPF E; 1O5A B; 6EST A; 1ZZZ A; 2H5C A; 3M7U A; 1TPA E; 2GD4 B; 1MAY A; 3ZZ4 A; 1TAW A; 1EP6 A; 4J2Y B; 2GT8 A; 4ABF A; 1HAI H; 3F6U H; 1SFI A; 2XBV A; 2XC5 A; 2FOD A; 4H42 U; 1SGT A; 2F9V A; 3AK5 A; 2C8Y B; 1HNE E; 1GHW H; 1YLN A; 1ZJD A; 3F2F A; 2XOK D; 3LJJ A; 3VB5 A; 1QUR H; 3M3V A; 5FHT A; 1QCP A; 2XRC A; 2Z9I A; 2W7S A; 5SGA E; 1H4W A; 2R2M B; 2D26 C; 2VVU A; 3ODD A; 3GDS A; 1FJS A; 3C1K A; 3FVF B; 1NFX A; 4CRC A; 4OM9 A; 5C1Y A; 3QN7 A; 2KCO A; 2BOK A; 1SGI B; 1TA2 A; 5H4I B; 1LHD H; 2G5V A; 2VH6 A; 1CU1 A; 1XKA C; 2IN2 A; 2FIR H; 2FLR H; 2GMT C; 2WHX A; 2YNA A; 1G3C A; 1ZLR A; 4JZ1 A; 1BBR H; 3RXG A; 1EPT C; 3U8O H; 1CHG A; 2UUK B; 4O3T A; 3GCH C; 1O3M A; 1QBN A; 3S0N A; 1DWB H; 3ATK A; 1V2V T; 1UTK A; 1EAT A; 2HLD D; 4YO9 A; 4A1T A; 2UWP A; 3HKJ B; 3P8F A; 4Y11 E; 3F9G A; 1BRB E; 1O2I A; 2ZTZ A; 1HAH H; 1GJD B; 2A31 A; 2XCF A; 4BTI B; 1H8I H; 2ZCH P; 3SU6 A; 1X7A C; 1HJA B; 1NRO H; 3WW7 A; 1HB0 B; 2ZEB A; 1O2L A; 3JZ1 B; 2A5K A; 1C5S A; 3ELA H; 2WPH S; 1O3G A; 1BMM H; 3SBK A; 1TX8 A; 4AG2 A; 1QNJ A; 3ZZ5 A; 3RXL A; 1UVO A; 3KN2 A; 1JXP A; 1E79 D; 3BEU A; 1V2W T; 5GXP A; 1PFX C; 4P02 A; 1XUI A; 2WZQ A; 4WVP E; 3SV7 A; 1WBG B; 2ZP0 H; 8KME 2; 2ZC9 H; 5EU8 A; 1MUE B; 3P95 A; 1TNG A; 3T62 A; 4BTT B; 4WH6 A; 1A1R A; 2JH6 D; 3BTK E; 1GCT B; 1W14 U; 1N1L A; 4MNV A; 3SJ8 A; 2CF8 H; 4X2W A; 1EZQ A; 4K8Y A; 2G00 A; 1CA0 B; 1KDQ A; 1C5Q A; 1GBC A; 3UNS A; 1EX3 A; 3MNS A; 2OC8 A; 2XTT B; 1C9T A; 2PHB A; 3F0O A; 3SUD A; 3VB7 A; 2GP9 B; 1GCD A; 4BAK B; 2CGA A; 2XNI A; 2Z3D A; 1AMH A; 2ASU B; 4FU7 A; 2EI8 A; 4DCD A; 1DDJ A; 5LPR A; 4FUC A; 3QO6 A; 1AKS B; 3BTW E; 3DSP A; 4RKO B; 4GPG A; 1MH0 A; 1CGH A; 3H7T A; 8LPR A; 2A4G A; 3NWU A; 4CRD A; 1RIW C; 2FTM A; 4I8G A; 1GVK B; 1P9U A; 4X1R U; 1INC A; 4Y79 A; 1V2S T; 3RXJ A; 1MBQ A; 3BTE E; 5FPY A; 2ALP A; 2QAA A; 3DSG A; 1O34 A; 4ABD A; 1TNK A; 1HRT H; 1C1N A; 4NIW A; 5LPE A; 3V0X A; 3VXF H; 2GCT C; 3N7E A; 1LKA A; 1SFQ B; 2ODY B; 1V2T T; 5EG4 A; 1C4Y 2; 1EZU C; 3U1J B; 4ABG A; 2I6Q A; 3IIT A; 3RXE A; 2Y82 A; 1GJ7 B; 1FON A; 1QA0 A; 4LK4 A; 3QX5 H; 3SJ9 A; 1O2Z A; 3E6P H; 1WCZ A; 4ISO A; 2VIO A; 4JYU H; 2H9E H; 5I25 A; 1QL7 A; 2LPR A; 1OOK B; 5F6M A; 3SU1 A; 3SQE E; 2BDA A; 3RXT A; 1MD8 A; 2ZKS A; 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