The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
105
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structure length |
105
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Chain Sequence |
GALPNFIPGLGTLYVDPSTLPEGPFLAYDRAGNLVKVVFMVPLKKLNESHKYVDIGTKTLRALGITRIDHVNMIPSGPHPGVSEPHYHIELVLVSVDQERKVLEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Unknown function
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| molecule keywords |
Hypothetical Protein TTHB210
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| publication title |
Crystal structure of hypothetical protein TTHB210, controlled by the [sigma]E/anti-[sigma]E regulatory system in Thermus thermophilus HB8, reveals a novel homodecamer
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Thermus thermophilus
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| total genus |
21
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| structure length |
105
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| sequence length |
105
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H, I, J
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-08-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VG8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3UOP A; 2FOD A; 5FPY A; 3PM3 A; 3MQK C; 1JWT A; 3UR6 A; 1O30 A; 2Y5F A; 2EEK A; 5DJ7 A; 1S81 A; 1NC6 A; 1ARC A; 2EY4 C; 3CNR A; 4BOH A; 2HAL A; 2A7C A; 2QCY A; 1QJ6 B; 1HAH H; 4B74 A; 3BIV H; 3M61 U; 1TMU H; 1Y3X A; 2P16 A; 3O8D A; 1K28 D; 4CRC A; 2CMY A; 3EA8 A; 3GCT G; 2RA0 A; 2F9U A; 2G4T A; 1WTH D; 1CBW B; 1YPH E; 2GMT C; 5FCR A; 1WTG H; 1K1N A; 2PUQ H; 1AQ7 A; 2V7Q D; 5AVD A; 1A61 H; 1DVA H; 1KXC A; 4ZXY H; 2FOF A; 4YOI A; 3ZVC A; 8GCH F; 5EOK A; 4X0W U; 1O3K A; 2XWB I; 2ASU B; 5EQS A; 1QIX B; 1SPJ A; 1ZSJ A; 3ODF A; 1O2G H; 5C0U A; 1HXE H; 4X1Q U; 3OEH D; 1CHG A; 4FVD A; 1XUG A; 3ZZA A; 2NU1 E; 2FOH A; 1O3L A; 2ZCL P; 1C5L H; 4UDW H; 1T4V H; 1N8O B; 2PKA B; 2JH5 D; 1DAN H; 1UCY E; 1FXY A; 2RG3 A; 1ZTL A; 1J16 A; 1GBH A; 4IMZ A; 3LGY A; 3SZN A; 1IOE A; 1D6W A; 1QJ7 B; 1SGF A; 1OP2 A; 1NRS H; 5CHA B; 3FAN A; 4K5Z A; 3OYP A; 3MO3 A; 1GBB A; 5DKM A; 2QF3 A; 2YNB A; 2ZGJ A; 1ZSL A; 2O8W A; 4ZRO A; 2A32 A; 3ZVD A; 1JRS A; 1KXD A; 2ZCH P; 2H9E H; 4UFF H; 4I86 A; 1RIW C; 2ODP A; 3T62 A; 1ETR H; 2BDA A; 2BMG B; 1GCD A; 3RLY H; 3A8A A; 1OKX A; 1AVW A; 1E35 B; 1TNJ A; 1Z8I B; 1UTL M; 2AMP A; 2PSY A; 2XXL A; 2ZFQ H; 3PYH A; 1F5K U; 1P12 E; 1S6F A; 1TQ0 B; 3MYW A; 1Y3W A; 4XBB A; 1SGC A; 3H5C B; 4X2W A; 4Z0K A; 1NU9 A; 4I7Y H; 1A0L A; 2W26 A; 1YCP K; 2WPJ S; 1PPH E; 1OWK A; 1GI2 A; 3N7E A; 2VNT A; 3HGN A; 1O3O A; 4MLF B; 3D62 A; 1ZJD A; 4D9Q A; 1MTS A; 2H5D A; 1T8L A; 1O5F H; 3ZV9 A; 3LOX A; 1ZMN A; 3RXV A; 1MTN C; 2P94 A; 5EQR A; 3URC A; 2ZF0 H; 1FY4 A; 5GCH G; 1O2Z A; 1F92 A; 1YPK H; 1NZQ H; 4AB8 A; 2VWO A; 3BTT E; 1F7Z A; 3SI4 H; 5GDS H; 1ELT A; 1BCU H; 1WUN H; 5FPS A; 3GYM A; 1C5N H; 1C1O A; 2HNT C; 1EPT B; 1DWB H; 1UK2 A; 5DPA A; 1BTX A; 1GG6 B; 1BBR H; 4XBD A; 1C5W B; 4CHA C; 1H9I E; 2KM0 A; 3SU2 A; 2XCN A; 4UE7 H; 5KED A; 2V3O H; 3VFE A; 5DO4 H; 2Z3D A; 1P2M A; 2NU4 E; 4BXS A; 2JH6 D; 2BY5 X; 1FNI A; 1O3E A; 2ZTZ A; 2BY7 X; 2BM2 A; 4MG3 A; 1L1G A; 2BVS H; 4A7I B; 2F43 B; 3RLW H; 1EFR D; 2ZPQ A; 2FS9 A; 3ZZ6 A; 2TPI Z; 1W11 U; 3SUD A; 1QY6 A; 1AVX A; 1A5G H; 2PR3 A; 1SGP E; 3PMJ A; 2ZFS A; 3UUZ A; 1EB2 A; 2F9P A; 2KCO A; 1GJ9 B; 1TPP A; 6CHA B; 4H42 U; 5GXP A; 1IQM A; 1BDA A; 2ZHW H; 4UFG H; 1CGJ E; 1E79 D; 3SUG A; 3NWU A; 4U30 A; 1CHO G; 2CV3 A; 1K0H A; 4WH8 A; 2FM2 A; 4MPX A; 3VB3 A; 1HRT H; 3M3T A; 4WXI A; 3LGV A; 1FX0 B; 3ZZC A; 1IHT H; 3SJK A; 1FN6 A; 1O2Y A; 3Q3K A; 5F6M A; 4I8H A; 3BTM E; 3Q77 A; 3SU1 A; 3TJV A; 4LOY H; 1GCT C; 4HZH A; 4JYT A; 3Q3X A; 3SHC H; 3DFJ A; 1AY6 H; 1O39 A; 1EB1 H; 3ZZ8 A; 1TPO A; 3HAT H; 1MH0 A; 2G5N A; 1OS8 A; 3RXC A; 4GLY A; 2J9N A; 2BDI A; 2NU0 E; 1HJA B; 1YBW A; 1JRT A; 3UB0 A; 4K1E A; 1HAO H; 3E0N B; 2BD7 A; 3UR9 A; 2VIP A; 3ATK A; 1Z1I A; 1K21 H; 1SMF E; 1RS0 A; 4F55 A; 5CDF E; 4Y6D A; 2TBS A; 1NRO H; 3I77 A; 3RXM A; 1V2P T; 1EZS C; 3MH6 A; 3EE7 A; 1O38 A; 2V3H H; 2TRM A; 4DVA U; 2ALV A; 2FOM B; 3L6P A; 2W3I A; 2BHG A; 3HPT B; 1ZHM A; 2A2Q H; 3OTP A; 2SGF E; 1JIM A; 1FJS A; 1W12 U; 1GVK B; 2KAI A; 1GDN A; 1O2N A; 1O2U A; 1W13 U; 2RDE A; 5FX6 A; 3P8O A; 1ACB E; 5CHB A; 4AGK A; 4D9R A; 1ORF A; 1D6R A; 5JBA S; 3ZYE A; 1DXW A; 1LCY A; 5LGO A; 4DW2 U; 1OYT H; 2D2D A; 1SQA A; 2PTN A; 1ZJK A; 2ZTY A; 3E91 A; 3RXA A; 5E0J A; 1A1R A; 3C27 B; 2HRV A; 1G2L A; 2RA3 A; 8GCH G; 4TT3 D; 1XKB C; 1MCV A; 1QZ8 A; 1THR H; 3RU4 T; 1XVO A; 1XM1 A; 4J1Y A; 1WOF A; 5HYO A; 2V6N A; 1DS2 E; 3E0P B; 3S9B A; 3DUX H; 2A5I A; 5I46 H; 3HGP A; 3FP6 E; 1AB9 B; 1TA6 A; 2XWA A; 3K65 B; 1VGC C; 9EST A; 2CXV A; 1HAX B; 1YC0 A; 1AE8 H; 3SNB A; 2NU3 E; 1AFQ C; 3LDX H; 1KLT A; 1TRM A; 2VGC B; 1CA8 B; 1O3I A; 2BDG A; 4FET A; 3PMA B; 1FLE E; 4GAW A; 4X8V H; 4F48 B; 1VR1 H; 3JZ2 B; 5AFZ H; 2FLR H; 2WYJ A; 2Q6D A; 4SGB E; 2QC2 A; 1BJU A; 1JOU B; 1O3P B; 2Z7F E; 2DE8 A; 3M35 A; 1P57 B; 3BIU H; 1L4D A; 1OPH B; 2ANY A; 2ZPS A; 2G00 A; 5C1Y A; 3ZVG A; 1TOC B; 3SYJ A; 3VG8 A; 5CMX H; 2EST E; 1DPO A; 1XUH A; 1EJA A; 1SKY E; 1COW D; 2H9H A; 1GVZ A; 2CF8 H; 2YMS B; 5T6F A; 5K7R A; 3O8R A; 3E6P H; 1CA0 C; 4JCN A; 2HPQ H; 4Z1M D; 1K22 H; 2PW8 H; 2BYA X; 2FPZ A; 2DUC A; 2GT8 A; 2WPH S; 3TLO A; 3MU5 A; 1GJ6 A; 1PYT C; 3SJ9 A; 1GI9 B; 1PFX C; 4ZKO U; 3UNQ A; 2VVU A; 1NU7 B; 1P2Q A; 3P17 H; 1B7X B; 2IPH A; 4MNY A; 1V2L T; 4NFE A; 4X2Y A; 5HMA A; 3PWC A; 3ZZ5 A; 3KQB A; 1CE5 A; 3WWF A; 2QV1 A; 2HOB A; 2FIR H; 1EQ9 A; 2FI4 E; 2D26 C; 4A1X A; 2OXS A; 3P92 A; 2D1J A; 3UNS A; 3EDX B; 2TIO A; 1GJD B; 3O8B A; 4FUG A; 5L30 H; 2Q6F A; 1SG8 B; 3U1I B; 3A87 A; 3UNR A; 2XYA A; 2ZFT A; 3TH3 H; 1ZPZ A; 1BMN H; 1G9I E; 1RIW B; 1SLW B; 1UTM A; 1FIW A; 3LC3 A; 1MKX H; 1HDT H; 2XOK D; 1LHD H; 2OUA A; 1GI1 A; 1BHX F; 2QYI A; 1ARB A; 3SND A; 3FZZ A; 1OWI A; 2A4R A; 2QA9 E; 2Y81 A; 1HB0 B; 1GDQ A; 1B0F A; 2R9P A; 1SGE E; 3QTO H; 1TAW A; 5A8X A; 5HM9 A; 2QN5 T; 1LQE A; 5KGO A; 3RMM H; 5EIY A; 1Q3X A; 1MD7 A; 3GY8 A; 4FUH A; 2YOL A; 3M5L A; 2AFQ B; 1SB1 H; 3QK1 A; 4X8T H; 4WME A; 3SNC A; 4AFZ A; 2BZ6 H; 2JKH A; 4K2Y A; 3UY9 A; 3BTH E; 1B0E A; 3E3T A; 1PJP A; 1VCW A; 3BG4 C; 1ZHP A; 1OP8 A; 1GMH F; 2OC8 A; 3ATM A; 1ZGI A; 1Z71 A; 3FO8 D; 4H6S B; 1YGC H; 4A92 A; 5LH8 A; 4GPG A; 3RXI A; 2ANK H; 3GOV B; 1TAB E; 1U6Q A; 1LDT T; 2KCP A; 1T8O A; 1JIR A; 1NM6 A; 3BTK E; 1RJX B; 1C2J A; 1EAT A; 1SHH B; 3PB1 E; 3GY5 A; 2OBO A; 3S7K B; 1O2Q A; 1UHB A; 2JJ2 D; 1EST A; 1RD3 B; 4X6P A; 1C5O H; 2K8I A; 2NU2 E; 1AGJ A; 4BNR A; 1XKA C; 2A5K A; 2FYR A; 5JB8 S; 5LPF A; 3F2H A; 4HGC A; 1YLD A; 1TX8 A; 3RC4 A; 3F9H A; 1YPH C; 3UQO A; 2VIN A; 1SQT A; 5FX5 A; 3ZVB A; 2YMS D; 1P3C A; 4WWY A; 2FTL E; 2WYG A; 1NRN H; 3ENS B; 1K1I A; 5DK1 A; 1FN8 A; 2OC7 A; 1SGI B; 1E1R D; 1CSO E; 5AHG H; 2BX3 A; 2AHM E; 3E90 B; 1ABJ H; 3KQC A; 4RKJ B; 1PQ5 A; 5IDK A; 3NKK A; 1GBE A; 2GKV E; 2A7H A; 2TGT A; 2CHA B; 1NRR H; 2J2U A; 3F6U H; 1FY5 A; 2FXR A; 2RCE A; 3A82 A; 5PTP A; 3SV9 A; 3P6Z B; 2BXU H; 1C5Z B; 1THS H; 1W0Y H; 1YCP M; 3OU0 A; 3SOR A; 4D76 A; 1LPZ B; 3BEU A; 3LGU A; 4OS1 A; 5ETX A; 3KYG A; 2J92 A; 2ULL A; 4BAN B; 2DE9 A; 2GCH F; 2B5T B; 3TU7 H; 1C1Q A; 3WY8 A; 3OAA D; 2GDD A; 2LNC A; 1QFK H; 2F9V A; 4CR9 A; 2K1Q A; 5JBC S; 3S69 A; 2HVY B; 2BDH A; 2J97 A; 3ZVF A; 4MPV A; 1C5Y B; 1PQA A; 1AFE H; 3PTB A; 2Z9G A; 2BQW B; 3GYL B; 3LT3 A; 3NRL A; 3SV7 A; 3LH1 A; 2PTC E; 3RM0 H; 1J17 T; 2Z9K A; 1FAK H; 2QAA A; 1BRB E; 4VGC C; 3UAI C; 1DDJ A; 1QRX A; 3KYF A; 1FZZ A; 1T8M A; 4DT7 B; 1G3C A; 3KQD A; 4NIY A; 3TGI E; 1O2R A; 4INK A; 4Q80 A; 2VBC A; 2JDI D; 3BTQ E; 3MO6 A; 1DWD H; 4OM9 A; 1G36 A; 1HLT H; 2G51 A; 3FOA A; 2P8O C; 4KP0 A; 2AMD A; 2FX6 A; 1BA8 B; 1QB9 A; 3DSO A; 2O8T A; 2TGD A; 1O36 A; 3TJO A; 4INH A; 3BG8 A; 3PLK A; 4FU8 A; 1GHZ A; 4QT8 C; 1A0J A; 1FAX A; 2Y82 A; 1NFU A; 3ELA H; 2OK5 A; 1ZHR A; 3ATI A; 3NCL A; 3PRO A; 4CR5 A; 5A0A E; 2Z9I A; 2FTM A; 3TJU A; 5K0H A; 2O9Q A; 3FN8 A; 3S9A A; 3SGB E; 1KXA A; 5F8Z A; 2KX4 A; 3GIC B; 1SR5 C; 1Z6J H; 2A4G A; 1ANC A; 3NPS A; 5EGM A; 3N99 A; 3VGC B; 1DWC H; 1EZQ A; 1BTZ A; 1P06 A; 2XBY A; 3E1X B; 4ABJ A; 2GCT B; 1A2C H; 4B2C A; 2RFK C; 2G8T A; 2J34 A; 2PHB A; 1C5T A; 4E06 H; 1C2F A; 3SZE A; 1XVM A; 2R2W U; 1VCP A; 4FXG H; 2BLV A; 1FY8 E; 2ZG0 H; 5AFY H; 5TJX A; 1K1O A; 4AFQ A; 1QRW A; 4MPW A; 1KDQ A; 1DFP A; 3ZVA A; 4DCD A; 1F5L A; 1MAY A; 2THF B; 3AK5 A; 1BJV A; 1HCG A; 2ZTX A; 1ETS H; 1HNE E; 1ZRK A; 1O5D H; 5DGJ A; 1AD8 H; 4Y0Y E; 1GMD F; 2PSX A; 4WY3 A; 3SOS A; 4ABI A; 1E1Q D; 2UUK B; 3QZR A; 5GWZ A; 4NA9 H; 1V2N T; 3DD2 H; 4AG1 A; 4DUR A; 2HLC A; 1LQD B; 1EAU A; 1O2X A; 1D3Q B; 1SI5 H; 1V2M T; 2GVF A; 1BIO A; 2VU8 E; 2KCY A; 1GBF A; 5GIB A; 3MH5 A; 3NUM A; 3UFA A; 1RXP A; 4KTC A; 4ABE A; 3C1K A; 5DP7 A; 4MQA A; 1CT4 E; 1GHY H; 1T31 A; 2UWL A; 2F3C E; 3TGK E; 4WF8 A; 4D7G A; 3LU9 B; 3PRD A; 1YPL H; 2PGQ B; 1PPF E; 4ISN A; 1MTU A; 2FDA A; 1L1N A; 2C90 B; 1GDU A; 3BTE E; 3MI4 A; 3QGJ A; 1GBD A; 5E2P A; 1D3P B; 1O2L A; 4IBL H; 4E05 H; 1HAV A; 3U98 H; 2Z6B D; 5JB9 S; 5EXM A; 2WUB A; 4BAO B; 3PRB A; 2GZ8 A; 4RT1 A; 2PKS B; 1GBT A; 1SHY A; 2BB4 A; 2ZU5 A; 2QE7 D; 1O3N A; 1QL7 A; 4TYD A; 1OWH A; 2O8M A; 1LVY A; 1GHX H; 1KXF A; 4AG2 A; 3KEE A; 2QXG A; 1YLC A; 2FO9 A; 1SGR E; 4IMQ A; 1GMH G; 2Y5H A; 3F1S B; 5SGA E; 2ZZU H; 1VJA U; 3M5N A; 1GJ8 B; 3L3T A; 2AS9 A; 1CT0 E; 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3H09 A; 4JK6 A; 3BTF E; 2UWP A; 1ELF A; 2H1U A; 3KID U; 3U28 C; 5JBT A; 2OC1 A; 2ZDA H; 1W0J D; 4IS5 A; 3P8F A; 2XW9 A; 1O3J A; 1TA2 A; 2A45 B; 2C8Y B; 3TH2 H; 1C5V A; 1C5M D; 3A86 A; 3MH4 A; 1NRP H; 2A31 A; 2WHX A; 1O2H A; 1YY3 A; 4A1V A; 2VIV A; 1H8I H; 3BSQ A; 3A81 A; 1RTL A; 4FUC A; 1NPM A; 1YKT A; 1ZML A; 2ZGB H; 1C5X B; 1Z8R A; 2B9L A; 2A7J A; 3MU8 A; 3U8R H; 1UCY H; 3BV9 B; 4CBO A; 3MU4 A; 4MNV A; 1C1S A; 1TRY A; 3D65 E; 4ASH A; 1P04 A; 1C1R A; 2OCV B; 4YZU A; 1KMH B; 2A0Q B; 1DLK B; 3SO3 A; 1W3C A; 2GTB A; 1HAZ B; 1V2U T; 2ZFR H; 5E8E H; 2B0F A; 4FU7 A; 4NSY A; 1G3D A; 1ELC A; 3M3S A; 4DY7 B; 1GGD C; 1P02 A; 1ZYO A; 3B9F H; 4K1S A; 1O3B A; 3RXK A; 3S7H B; 4VGC B; 5JYI A; 2J38 A; 2WV9 A; 1HAP H; 1JMO H; 1TFX A; 2VWM A; 3GCH C; 3SUE A; 3RMN H; 1AZ8 A; 4JZF H; 1O2J A; 1O0D H; 3URE A; 4NIV A; 4TPI Z; 1P9U A; 3SHA H; 1LHC H; 1QJ1 B; 2BDB A; 3W95 A; 3K2U A; 1P2N A; 1IQN A; 4YLU A; 1Q31 A; 1GMD G; 2J5U A; 5EQQ A; 1MZA A; 3BEF B; 1UTP A; 1A0H B; 2FP7 B; 1KXE A; 4MDS A; 3RXG A; 1PPB H; 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